More coding rule conformance

Updated configuration files for HMP, MCH and TRD

Updated code

Adding comparison  (Marian)

some coding convention fixies (Marian)

AliESDComparisonMI - extended comparison macro for reconstruction and
analysis development (Marian)

Adding new internal dimuon HLT data structures for the Manso tracker and dHLT trigger decision.
AliHLTMUONMansoTracksBlockStruct contains tracks partially reconstructed by the Manso tracker.
AliHLTMUONMansoCandidatesBlockStruct is used for debugging and contains track candidates considered by the tracker.
AliHLTMUONSinglesDecisionBlockStruct contains trigger decisions about single tracks.
AliHLTMUONPairsDecisionBlockStruct contains trigger decisions about pairs of tracks.

Cleaning up HLT/MUON.
Removing deprecated files, old prototype code and files which should either never have been added to AliRoot in the first place.

This file should not be here.

Adding light weight helper classes for reading and writing the internal dHLT data blocks.

Fixing comment.

Adding internal HLT data blocks for debugging information from the trigger chambers.

Changing data type for ID. Used wrong data type.

Added method CreateTracker to allow track matching during the filling of ESDs

z misalignmet bug is fixed

... and removed a potential memory leak

Fixed LoadClusters

Fixed IsInEMCAL function to handle angles > 180 degrees

Adding more checking and some bit packing routines.

Fixing data type constants.

Moving some methods to .cxx file.

Moving the dimuon HLT specific data types file. \(Still need to delete the one in src\/\)

Adding definitions of internal data blocks for trigger information.

Splitting the file and simplifying the internal data structure.
The HLT component can just generate 2 types of debug data blocks with simple internal structures.

New documenation

New documentation

Removed debugg messages

Adding PWG1

Adding PWG1

First version of some classes for comparison and performance studies (Marian)

Correction to the initialization of LUTs (Raffaele)

Include of TMath moved from .cxx to .h

New initial parameter values in FindMatch, and other minor changes

Correct missing - sign in z rotation

New clusterizer parameters for improved response in HI environment

Add Raw2SDigits by Andreas

Coding convention: RS1 violation -> suppression

Error messages stored in the global raw-reader error log (Cvetan, Chiara)

New PID reference distribtutions by Alexandru

Clean up database files

Some more coding conventions

adding selector for high multiplicity trigger study

Excluding AliAnalisysGoodies from the compilation if Root is compiled without XML support

Correct comment

Replace fabs

Merging differences if v1.2 and 1.3

Coding convensions satisfied (T.Pocheptsov)

Decalibration is added to SDigits2Digits and Hits2Digits

Save the volume ID of alignable volume in AliTRDcluster

Since AliRoot has a system for building documentation this is not necessary.

Adding header files common to dimuon HLT.
AliHLTMUONRecHitsBlockStruct.h contains the reconstructed hit structure generated by the hit reconstruction component. It is now a 3D point which is
required if we are to have any kind of p_T resolution.
AliHLTMUONRecHitsDebugBlockStruct.* contain the structure definitions of the data block for debugging information from the hit rec component.
AliHLTMUONConstants.* contain some useful constants like data type definitions.
AliHLTMUONUtils.* at the moment just contains a routine to check integrity of AliHLTMUONRecHitsDebugBlockStruct data blocks.

a bit cleaner code

now without galice.root

Get rid of compiler warning

namespace added for constants

Reconstruction QA by Sylwester

Hgeom is no longer neede as functionality in v2

Coding conventions

Using raw-data error log class in order to store data decoding errors.

Adapt pkg files to the new flat directory structure

Making the directory structure of AliFemtoUser flat. All files go into one common directory

Making the directory structure of AliFemto flat. All files go into one common directory

Pad size less then cell size + ideal geom in v2

Using raw-data error log class in order to store data decoding errors.

Using raw-data error log class in order to store data decoding errors.

New html documentation

Coding conventions

Bug fix. The equippment ID was not given to alirawreader

Use VMC id's rather than TGeo id's

Moving the alignment-related static methods from AliAlignObj to the new geometry steering class AliGeomManager (macro from Raffaele). AliSimulation and AliReconstruction are using now the new AliGeomManager steering class in order to initialize the misaligned geometry. The unused AliAlignObj methods are removed (Raffaele).

Moving the alignment-related static methods from AliAlignObj to the new geometry steering class AliGeomManager (macro from Raffaele)

Compilation warning

First version of the SPD online calibration detector algorithm (Henrik)

New class which is used by the SPD online detector algorithm (Henrik)

Fixes in order to be able to read properly the SPD calibration header (Henrik)

Possibility to set max probable Pt (tracking without Magnetic field) (Yuri)

Moving all Gsatt calls in Init: needed by G4 (Andrei)

Moving all Gstpar calls in Init: needed by G4 (Andrei)

Minor

Removed call to DefineOpticalProperties from CreateMaterials since this is called by the framework: needed by G4 (Andrei)

Updated version of the Geant4 configuration (Andrei)

Access to the PYTHIA include files (Christian)

Include TParticle.h (Christian)

Protect instants of common blocks (Christian)

Do not include TMinuit.h

Initialize fNPDGcodes to 0 to prevent sigsegv (Christian)

Protect instantation of common blocks to when we compile the library only (Christian)

Remove not needed include of TMinuit.h (Christian)

Use pure TVirtualFitter interface instead of TMinuit as it prevents users from choosing other fitters (Christian)

Check for existence of fVertexer before trying to use it (Christian)

Add ROOT plug-in path to library path to link against libRGL (Christian)

Include cassert (Christian)

Use root-config to  check for existence of XML  extension library, and
define  `WITHXML'.   This  symbol  was never  defined  when  compiling
aliengui, so it would always fail to do anything real.
Christian

Removed debugg message in constructor

Bug fix

Fixes for G4 (Thanks Andrea).

Not-implemented methods should be defined as private

New geometry steering class. Replaces and consolidates all the basic geometry-related functionality that was partially implemented in AliAlignObj. To be used in the detectors code instead of explicit calls to TGeoManager (Raffaele)

Add some scripts

Add the Pressure sensore maping information  (Haavard)