Method: TObjString::GetString() replaced with TObjString::String() in GetFile method (due to some changes in ROOT, the previous does not work anymore -
thanks to Matthias for the advice!)

Updating macros

Added protection against wrongly formed cloning list

Update for the QA task (Raphael).

Adding missing include file

Selecting only PHYSICS ev. and updating fitting range

- new gain calibb
- alternative exb methode: being saved as OCDB object in TRD/Calib/ChamberExBAlt

- adjusting binning of pad histograms to make single pad cluster contribution and 0.5 offset visible
- added pad histogram for hwcf data
- implementing cluster mapping without cluster id data blocks to produce the delta plots
- some corrections of histogram labels

OCDB object for the PHOS trigger parameters and a test suite (H.Qvigstad)

Added the possibility to select tracks on pDCA, chi2, pT and MC label. Added the possibility to study the efficiency versus pT, y and muon charge (Philippe P.)

Disconnect trigger recalculation due to inconsistency with OCDB content (no STU object in raw OCDB)

Fix includes (Diego)

Behavior change : for mcMode=1 we keep all the kinematics, whether or not there's something in the spectrometer. Bug fix : insure the Ncontributor field of the copied vertices are correctly transported to the filtered aod (Laurent)

o updates from Pietro and Giacomo

further cleanup histograms

Change the method to recalibrate and check status of the cells, remove commented code

cleanup of a few histograms

Correct DCA propagation

this is a relatively large commit to use BPTX clock-phase measurements in
TOF
calibration.

**********************************
AliTOFRunParams calibration object
**********************************
added a new bool data member. if set, the parameters stored in the
object have
been obtained using the BPTX, therefore calibration must use BPTX.
if not set, parameters have been obtained without BPTX and calibration
must go
without BPTX.

*****************************
AliTOFcalib calibration class
*****************************
added reading of BPTX LHCClockPhase OCDB entry.
BPTX measurement is used to calibrate TOF data only if AliTOFRunParams
object
has the flag set (i.e. the params were obtained using BPTX as well) or
if BPTX
use is forced by user (default is not use).
backward compatibility of calibration will be ensured.

****************************
AliTOFPreprocessor (SHUTTLE)
****************************
ProcessT0Fill function modified. Online T0-fill will be computed and
OCDB
updated only if not using BPTX measurement in TOF calibration.
Therefore, as a
new default AliTOFRunParams entry will be put in the OCDB with use BPTX
flag
set, we don't expect to compute and update OCDB with online T0-fill
anymore
after that.

****************************
AliTOFAnalysisTaskCalibPass0
****************************
TOF C-Pass0 calibration code updated to use the BPTX as well and produce
objects with correct flags. C-Pass0 will now compute the residual shift
wrt. BPTX measurement.

Update SPD Diamond DA (with configuration file - A. Mastroserio)

Bug with histogram name for mixed-event invariant mass is fixed

Data needed to simulate centrality dependent production of quarkonia & HF-hadrons in Pb-Pb
and p-Pb collisions.

Smbat Grigoryan <Smbat.Grigoryan@cern.ch>

Modified classes AliGenMUONlib,
AliGenMUONCocktailpp and AliGenCorrHF which allow to simulate
centrality dependent production of quarkonia & HF-hadrons in Pb-Pb
and p-Pb collisions.

Smbat Grigoryan <Smbat.Grigoryan@cern.ch>

Adding the possibility to exclude the decay products of resonances when analyzing MC

New binning for default histograms. Updated defaults (checked on PbPb run 137161)

LoadCDB will query detector/Trigger apart from detector/Calib (Cvetan)

Add new histograms, correct trigger name

class restored.

Bug fix for realistic simulations w/ raw OCDB

Avoid warnings

First commit of PHOS OADB
Dmitri Peressounko <Dmitri.Peressounko@cern.ch>

Updated PHOS Supply
Dmitri Peressounko <Dmitri.Peressounko@cern.ch>

Macros to handle OADB files

Empty default constructor

Update
J. Wiechula

Method to retrieve HMPID pid signal added.
Jen Wiechula

changes from gsi svn

fix coding violation RC11

Coding rule violations.

Coding rule violation corrected

Obsolete code removed

Coding rule violations corrected

Move the filling of the Ecross per cell histogram before the cut on Ecross is applied

- support raw data version 0xd (MEB)
- evaluate CRC falgs from GTU
- improve for readout order checking
- tracklet sorting available in rawstream
- labelling of raw GTU tracks in ESDs

adding optional messages for number of extracted clusters; no functional change

returning the number of clusters extracted from the block and added an optional info message steered vis verbosity member; no functional change

correcting a typo in the error message for invalid RCU trailer and including some more information

Packed occupancy together with the Cerenkov angle (Giacomo)

o updates (Giacomo, Pietro)

- implement copy constructor and assignment operator for AliTRDtrackGTU

Missing submission to rev 52361

Missing submission to rev 52361

Including the acceptance parameteriazation to be used while analyzing MC (generator level)

Missing submission to rev 52361

TObjArray is replaced by TList

Output is added

AliTRDdigitizer.cxx -> For the new name of the Nodata status in AliTRDCalChamberStatus

AliTRDcalibDB.cxx .h -> For the function related to the new status in AliTRDCalChamberStatus + the exb object with a protection against 100. I plan namely to put a default object with 100, which will indicate that the look up table as to be used. In AliTRDcalibDB, it takes the loop up take when the mean value is above 70...

AliTRDCalibChamberStatus.cxx .h -> calibration with tracks for chamber status of half chamber also

Cal/AliTRDCalChamberStatus.h .cxx -> change of definition of status, keeping the back compatibility.

AliTRDCalibTask.cxx .h -> Run the chamber status calibration + propagate the version and subersion number of the exb object used in the reconstruction

AliTRDCalibraFillHisto.cxx .h -> due to the new name of the status

AliTRDCaibraFit.cxx  -> some printf less

Restored compilation and functionallity (Ruben)

Remove decay photon tagging since it is done in AliAnaPi0EbE, add MC histogras for Eta decays

Data are not reset when method WriteVertices is called. Added debug histograms

adding centrality vs multiplicity correlation histogram

move method to get mother VCluster of a AODPWG4Particle to the base class to be used everywhere

New  clasess for cosmic reconstruction
(Xianguo)

AliTPCCosmicUtils.(.h,.cxx)       - toolkit with set of static function  used for
                                  - the cosmic track fit and for the visualization

AliTPCCCosmiTrackfit(.h,.cxx)     - track fit class (to be used in the user analysis task or in the cosmic tracker)

AliESDCosmicTrack(.h,.cxx)        - cosmic track class + snapshot of track at different extrapolation points

AliCosmicTracker.h                - The tracker for the refitting of the cosmic tracks, to be invoked during the
                                  - standard reconstruction in the AliTPCtrackerMI after the RefitInward

Modification of the AliESDEvent will be needed+
Adding the TClonesArray of AliESDCosmicTrack + all types of geterrs, setters, destructors and constructors

Fixing linkdef

Fixing CMake files

Obsolete files removed.

Getter for HMPID signal added.
Jens Wiechula <Jens.Wiechula@cern.ch>

Update
A. Toia

Fixed https://savannah.cern.ch/bugs/?88157

Recover recalibration and bad channels map from OADB when needed (Marcel, Deepa, Rongrong)

IMPORTANT Changing default 2009 and 2010 track cuts
Two cuts added:
chi2/cluster ITS < 36
chi2 of constrained TPC vs global track < 36

See discussion at:
https://indico.cern.ch/conferenceDisplay.py?confId=156171

fix in CopyLocalDataSet

protect against missing debug projection on radial direction

Moved to macros

Add a task to a train

Add correlatio matrix for tracklet case

Fixing mem. leak (thanks to Ruben)

Add parameter in AddTask macro.

Add parameter in AddTask macro. Add correlation matrix for events with reconstructed vertex

update resolution task for full monitoring of residuals at TRD entrance
extended/use AliTRDeventCuts (class by Markus) to steer event cuts
added bunch cross selection in AliTRDeventCuts
improve merging

bugfix 88038: inconsistent handling of reference counters in library manager

bugfix: calculation of the equipment size is different whether data cames from HLTOUT or directly from the parent raw reader. This only concerns a special reconstruction mode where raw data is read from HLT links, e.g. TPC AltroChannelSelection

update of histograms; using TH*D to avoid saturation (Alberica)

removing hardcoded selection of 10 HLT DDL links, which triggered now a bug causing partial readout of HLTOUT after increasing the number of HLT links from 10 to 28 in AliDAQ (bug #88138)

Initialize the array of test results before providing it to detector-specific Check

Apparently DAQ changed raw-data filenames conventions. Technical fix, should go also the release.

Bug #88017: Adding the equalization factors to AOD/VEvent.

Bad channels and recalibration factors.
Gustavo Conesa

Updates for EMCAL

AliAnalysisTaskFastEmbedding:
- add event selection
- new random selection of extra AODs and events, taking into account the number of events in AODs
- additional mc information (pt hard, x-section, etc.)

AliAnalysisTaskJetResponseV2:
- add trigger exclude mask (e.g. jets with track pT > 100 GeV)
- add pt hard bin
- keep negative jet pT (after background subtraction)

new histograms depending on fired L1 trigger

increasing track depth to 50k

Changes for #88113 Request to add new TPC-PID information to AliESDtrack and a new class to ESD

correct macro

Fixing memory leak (delete[] fImage)

Fix for #77321: request to store friends for TRD-triggered events

Modified cut on one of the decay daughter angles (Gian Michele)

Checks on the return value of AliExternalTrackParam::Rotate() added

dE/dx versus eta corrections

Added protection on radius of secondary vertex to avoid track propagation trhough beam pipe