modifications to run in centrality and multilicity bins (M.Knichel and J.Gronefeld)

An updated version of FastTool (Stefan, Giuseppe)

Refined the tuning of the TOF tail parameterization for analysis (in particular for MC).
  Francesco Noferini
bug #101129: tuning of TOF tail for analysis

add correlation of event BC and trigger BC, differenciate bad clusters with main cell bad and not, add related histograms

small update to jet cuts (in eta) to accommodate running on semi-good
tpc runs (Redmer)

Propagate second argument of SetFriendChainName to the generated train macro

Fix for empty library name in SetFriendChainName

reverting changes commited by mistake

added subdir for upgrade code

store additional info in the diagnostics tree

Fix in RefitTrack: in inward refit innermost cluster was skept

Added extra filling of debugging TTree object for cross-checking centrality information.

---David

from marta

Test Task for pPb debugging: completely clean version, floating point acquisition. Tested to not break anything; added "pPb" suffix.

---David

new EMCal tasks for PA analysis

-update HFhelper for newly merged arrays
-new nsigma electron var (raw nsigma)
-update for AOD filtering (new pid and its selection)

1) Fixed typo. 2) Added DCA histograms. (Misha Veldhoen <Misha.Veldhoen@cern.ch>)

fixed small bug in V0Reader for AOD creation

from Carlos Perez:
new features

changes from fzhou

add a check properly the bad/exotic cluster in the corresponding array, add few histograms for events tagged as bad and exotic, cosmetics in event counter histograms

checked in Astrids Task to EMCALTasks

update of final macro

from Redmer Bertens:
small patch to correct mistake in calling a setter in addtask

Separated AddTasks for pp, PbPb, pPb & added root file for reweighting spectra

changed QA histograms (Christoph Mayer <Christoph.Mayer@cern.ch>)

Conversion Task able to run on AOD's, added different trigger selection, implemented reweighting of pi0 for PbPb

Fixed TOF cut implementation

from ruediger

bug fixes to establish consistent
TProfile histo axis ranges, change in the strangeness decay daughters
scaling for the pt sum histograms. (O. Busch)

Code Cleanup for real data extraction. Removed deprecated options.

jet framework from Marta/Salvatore

jet framework from Marta/Salvatore

jet framework from Marta/Salvatore

From Marta
- AliAnalysisTaskRhoBase.h: getters for the name of rho and rho_scaled
- AddTaskRhoSparse.C: do not attach wagon if is already there. Like we also do for the jet finders
- TriggerQA: AddTask, cxx and h files: changed configuration and some names for easier running on lego train

Beam crossing angle and divergence (Chiara)

new version of trigger patch-cluster matching more detailed histograms

from Redmer Bertens:

reduced memory and cpu load by only initializing and filling flow events
and cuts which are necessary for a specific task configuration

Eta correction for pPb analysis

Enabled TOF cut for pPb add task.

Signed-off-by: Henrik Qvigstad <henrik.qvigstad@cern.ch>

Fixed integer to float conversion, fixed bug in centrality merge.

author: Paul Batzing <pbatzing@cern.ch>
Signed-off-by: Henrik Qvigstad <henrik.qvigstad@cern.ch>

change order in parameter setting (DC, ZCdV)

consistently figure out track cuts (from Ruediger)

consistently figure out track cuts (from Ruediger)

consistently figure out track cuts (from Ruediger)

Adding nuclei analysis.

Protection against null digits array and manager in dtor - H. Beck

modified

reverting commits 62863 62890: is not a functionality we believe in

added internal trigger selection

add optional localOCDBaccessConfig.C similar to cpass1 (for testing purposes)

Check returned vertex bin for not-null

Always recompile sub-classes - will fail otherwise, because an attempt to load the the previously loaded train class will made

Make sure we set the over- and underflow bins for acceptance

Set some default values

Copy underflow to overflow bin for acceptance

Small fixes

Fix to properly calculate the phi acceptance from the
histograms for the diagnostics output.

Fix to store phi acceptance in overflow bin.

Use `#include <...>' instead of `#include "..."' for
installed headers.  Could break PAR file generation.

Added AliBasedNdeta::Sum to linkdef.
Removed header files listed in source variable of the
package file - it is wrong, and it breaks PAR file
generation.

Added AllWideTOF PID

changed default pass of addmacro to 1

Defined enum for event selection.

added dump of files not found.

cleanup

Reversed order.

Added possibility to declare list of libraries needed to read friends info, extending AliAnalysisAlien::SetFriendChainName(friendname, libnames). Lib names should be blank separated

macro for lego train + small io bugfix

Applying data driven corrections

partially adding 500 MeV cluster cut off cross check

Changing to centrality dependent corrections

Changing from multiplicity to centrality dependent corrections

Fixing event selection

Changing multiplicity dependent cuts to centrality dependent cuts

Adding 500 MeV cross check, changing multiplicity dependent cuts to centrality dependent cuts, adding missing cluster acceptance cut, fixing a compiler error

fix warnings

from Marta

fix in the performance tree output

Adding the material-budget systematic uncertainties

New FD correction function (Luke)

updated task from Markus

Improved numerical stability
Filimon Roukoutakis <Filimon.Roukoutakis@cern.ch>

Updated macro for K* in pA analysis

changes from fzhou

updated

changes from fzhou

DiHadronPID: Added task for calculating efficiencies. (Misha Veldhoen <Misha.Veldhoen@cern.ch>)

-some more doc

coverity fixes in LRC (Igor Altsybeev <Igor.Altsybeev@cern.ch>)

-increase class def

-add v0 finder selection
-aod v0 are no longer accessed via the list of vertices
-protection against LS v0s

Whoops - accidently removed the PMD tasks from the dictionary generation in the LinkDef.  Added back in.  Hmm... Perhaps the PMD and ZDC tasks should really move to separate library(ies) to not mess things up too much.

Removed safety back-up

Mega commit of many changes to PWGLFforward
===========================================

This should probably all be ported to the release

- PWGLF/CMakelibPWGLFforward2.pkg
  PWGLF/PWGLFforward2LinkDef.h
   Addition of some new classes and scripts

- PWGLF/FORWARD/analysis2/scripts/SummaryAODDrawer.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/scripts/SummaryDrawer.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/DrawAODSummary.C
Various fixes for drawing and increased functionality of
base class to draw other things

- PWGLF/FORWARD/analysis2/trains/MakeAODTrain.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/trains/MakeFMDELossTrain.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/trains/MakeMCCorrTrain.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/corrs/CorrDrawer.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/corrs/CorrExtractor.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/corrs/DrawCorrAcc.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/corrs/DrawCorrELoss.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/corrs/DrawCorrSecMap.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/corrs/ExtractAcceptance.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/corrs/ExtractELoss.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/corrs/ExtractMCCorr.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/CentralAODConfig.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/ForwardAODConfig.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDCorrector.cxx
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDMCCorrector.cxx
Updates to use new OADB structure and updated corrections
   manager (see more below)

- PWGLF/FORWARD/analysis2/corrs/ForwardOADBGui.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/corrs/MigrateOADB.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliOADBForward.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliOADBForward.cxx
Migration of PWGLF/PWGLF/FORWARD/corrections to
        OADB/PWGLF/FORWARD/CORRECTIONS.  Corrections are now stored in
   a TTree (one tree per correction) and indexed using the run
   number, collision system, center of mass energy, L3 field, and
   simulation and satellite flag.  The class AliOADBForward
   provides an interface to that structure for both reading and
writing.

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliCorrectionManagerBase.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliCorrectionManagerBase.cxx
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliCentralCorrectionManager.cxx
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliCentralCorrectionManager.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliForwardCorrectionManager.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliForwardCorrectionManager.cxx
   New base class for correction managers.  Uses the new OADB
   structure. The central corrections are new handled by separate
   singleton rather than embedded class, to make the code more
   stream-lined.  Correction managers register possible
   corrections using services of the base class, and then reads
   in the requested corrections based on the run number,
   collision system, center of mass energy, L3 field, and
   simulation and satellite flags. Each registered correction
   decides how to be addressed, and the base class ensures this
   addressing

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AddTaskCentralMult.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AddTaskForwardMult.C
Fixes for new OADB structure and correction managers.  Note,
we should hardly ever force a correction set now, since we can
load based on the run number.  Still useful for tests, so
won't remove it just yet

- PWGLF/FORWARD/analysis2/tests/RingBits.C
  PWGLF/FORWARD/analysis2/tests/TestFCM.C
Some new tests

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliCentralMultiplicityTask.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliCentralMultiplicityTask.cxx
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliCentralMCMultiplicityTask.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliCentralMCMultiplicityTask.cxx
Use new singleton correction manager.  Add flag to turn on
   additional diagnostics.

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliForwardMultiplicityBase.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliForwardMultiplicityBase.cxx
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliForwardMultiplicityTask.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliForwardMultiplicityTask.cxx
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliForwardMCMultiplicityTask.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliForwardMCMultiplicityTask.cxx
Moved a lot of functionality into base class.  Cleaned up
   additional diagnostics introduced by Marek - duplicate and
   broke structure of the code.  When loading the energy loss
   fits, make sure we cache where to find the good fits.  Added
   option to store one histogram per ring per event on the output
   AOD tree.

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliBasedNdetaTask.cxx
Code clean-up, and remove some stuff introduced by Marek which
breaks the code

- PWGLF/FORWARD/analysis2/gridAnalysis.sh
   General fixes and fixes for new OADB correction storage.

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliForwardMCCorrectionsTask.cxx
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliCentralMCCorrectionsTask.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliPoissonCalculator.cxx
   Some clean-up

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDMultCuts.cxx
   Minor fixes

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliAODForwardMult.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliAODForwardMult.cxx
   Add satellite information

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliForwardUtil.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliForwardUtil.cxx
   Set more realistic upper limits on sigma in Delta fits -
crucial, or too many fits will fail.  Added member function to
re-initialize bins of a histogram.

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliForwardQATask.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliForwardQATask.cxx
   Fix for satellite usage.  Cache valid bins from Delta fits.

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDEnergyFitter.cxx
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDEnergyFitterTask.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDEnergyFitterTask.cxx
Task does not load correction manager (not needed).  Better
   peak finding.

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliDisplacedVertexSelection.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliDisplacedVertexSelection.cxx
Added some diagnostics

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDCorrAcceptance.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDCorrAcceptance.cxx
Code to draw correction.  Disabled.  moved to CorrDrawer.C

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDCorrELossFit.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDCorrELossFit.cxx
Updates to drawing code.  Also added caching of good bins.

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDEventInspector.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDEventInspector.cxx
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDMCEventInspector.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDMCEventInspector.cxx
Fixed coding conventions. Added cache of run number.  Added
   additional diagnostics histograms.  Satellite analysis is not
diagonal to normal - will flag output as satellite instead.

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDSharingFilter.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDSharingFilter.cxx
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDMCSharingFilter.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDMCSharingFilter.cxx
Removed non-simple merging method (not used).  Removed useless
        diagnostics histograms.  Added option to consider kInvalidMult
        signals as zero (0) signals.  This is needed for data
    reconstructed with AliROOT prior to v4-19-Rev-09.  Before that
revision, zero-signal strips are flagged as kInvalidMult.
    This was introduced by someone who (wrongly) tried to optimize
storage.  See also comments in ForwardAODConfig.C.  Expanded
ELoss histograms to record number of kInvalidMult.

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDDensityCalculator.cxx
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDDensityCalculator.h
   Added flag for minimum quality of fits (should be no less then
8). Removed some useless diagnostics histograms.

- PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDHistCollector.h
  PWGLF/FORWARD/analysis2/AliFMDHistCollector.cxx
   Introduced new embedded class for vertex bin information.
Added option to create summed per-vertex, per-ring histograms
of dN/deta.  Note, this can be misused to create a 1-step
analysis of the forward data and should be avoided.  Also add
possibility to create a set of 3D histograms of summed
per-centrality, per-ring histograms.  This, again should be
avoided.

- PWGLF/FORWARD/trains/ParUtilities.C
  PWGLF/FORWARD/trains/TestAuxPAR.C
Add possibility to build PAR of auxiliary files

- PWGLF/FORWARD/trains/Helper.C
Do not always rebuild

- PWGLF/FORWARD/trains/ProofHelper.C
Implement some missing -Weffc++ functions.  Add possibility to
build PAR of auxiliary files

- PWGLF/FORWARD/trains/GridHelper.C
  PWGLF/FORWARD/trains/GridTerminate.C
Allow more flexible spec of TTL
(<days>d<hours>h<minutes>m<seconds>s), and AcLic the Terminate
macro.  Also make it possible to do the final merge and
   terminate on the client (local) machine.

- PWGLF/FORWARD/trains/GridWatch.C
   Refresh token every 6th hour, and fix up batch mode

- PWGLF/FORWARD/trains/AvailableSoftware.C
Allow extra flags for automatic selection to only take
releases, analysis tags, or any of the two.

- PWGLF/FORWARD/trains/TrainSetup.C
Documentation comments and do not always rebuild

- OADB/PWGLF/FORWARD/CORRECTIONS/data/fmd_corrections.root
  OADB/PWGLF/FORWARD/CORRECTIONS/data/spd_corrections.root
Added databases used by PWGLF/FORWARD analysis.

Some changes to make it possible to run the DA's
on local files and get all 3 sub-detectors.

Minor Bugfix

Taking care of the warning by coverity

Fix compilation warning

coverity