Taking into account the time information of the hit in the digitization
- done in AliMUONSDigitizerV2, still to be done in AliMUONDigitizerV3.
(Mercedes)

added verbosity in a Fatal call

Comments for Doxygen

Remove obsolete macro

Update of V0A geometry provided by Lizardo

Setting also MC info to CF manager

ignoring runs with start == endtime

* AliEveTrack
  Rename ImportClusters() to ImportClustersFromLabel().

* AliEveTrackCounter
  Also save all three primary vertices.

* make_scan_results.C
  Processes also primary vertices.
  Delete objects read from file.

* MultiView.C
  Add function SetDepth() that sets current-depth of both projection
  managers.

* visscan_init.C
  Set projection z-depth to -10 before importing geometry, then set it
  back to 0.

* clusters_from_index.C
  Project clusters if gMultiView is defined.
  Increase marker size to 2cm.
  Remove solaris cint hack.

using one single par file for all aliroot versions

Update in the task setting (Mariella)

Update in the analysis code (Mariella)

Update in the analysis code (Mariella)

Update in the analysis code (Mariella)

Update in the analysis code (Mariella)

removed obsolete setters

Add RawFitterv3 based on FastFitting algorithm

Raw fitter based on FastFitting algorithm

Updates from Mikolaj, requested by TPC

Connection to tree in Notify() seems to be safer.

Histograms fills by the current run data only; nothing is reading from the previous.

Update and addition of LS analysis (Renu, Giacomo, Francesco)

New file to configure TOF preprocessor for NOISE runs:
Threshold now set to 1000.

1) Cut on min. amplitude (>10 ADC) in High and Low gain introduced;
2) Time range reduced.

Fix for the Savannah bug #58478 (A. Dainese)

making InitESD public

Taking into account that only 1 or 2 values may be present for the
DPs --> storing only the information available.

rename file

rename file

bugfix: skip file name prefix if concatenating events
https://savannah.cern.ch/bugs/?58454

fix for using phi weights

Updated ideal OCDB entry for DCS part

Updated ideal OCDB entry for DCS part

added new spectrum task including FF and with using PWG4 unfolding, just THNsparse to be plugged into corrfw or AliUnfolding

added new spectrum task including FF and with using PWG4 unfolding, just THNsparse to be plugged into corrfw or AliUnfolding

major changes to the ppr plotting macros

Fixing bug related to incorrect unloading of shared library and class code.
This is related to:
https://savannah.cern.ch/bugs/?58083
https://savannah.cern.ch/bugs/?58247
In actual fact this is a workaround for the bug/feature/limitation (whatever you want to call it) in ROOT/CINT that removes more libraries than just the one that was
requested to be removed. The problem has been solved by adding more protection to prevent the segfault, printing of appropriate warnings and cleaning up HLT components in
the correct order to prevent the problem in the first place.

Defining 5 output slots in the constructor (Matthieu)

New PHOS mapping is uploaded:
modifications are in FEE card position within RCU.

Bug fix - Not visible withour gcc
(Jens Wiechula)

- first sketch of friend tracks implementation in the HLT-TPC calibration class for the drift velocity

Modifying processing of Pressure sensors:
- if (fit || graph) --> ok
- else --> error
(following discussion with Haavard - see bug 58331)

Resolved problems with merging
2 classes missing in previous commit
(Marian)

Adding alarms and graphical representation of alarms
(Jens)
AliTPCcalibDB.cxx.diff Add loading of dataQA, adopt creation of GUI tree
AliTPCcalibDB.h.diff Add loading of dataQA, adopt creation of GUI tree
AliTPCcalibDButil.cxx.diff Add loading of reference data, creation of reference GUI tree
AliTPCcalibDButil.h.diff Add loading of reference data, creation of reference GUI tree
AliTPCCalibViewerGUI.h.diff Add getters to handle custom draw strings
AliTPCCalibViewerGUItime.cxx.diff Add getters to handle custom draw stings. Code cleanup.
AliTPCCalibViewerGUItime.h.diff Adopt gui tree / reference tree creation / loading
AliTPCMonitor.cxx.diff For root raw files add possibility to navigate to a certain event in the file
libTPCbase.pkg.diff Add AliTPCCalibQAChecker, AliTPCCalibViewerGUIAlarms
TPCbaseLinkDef.h.diff Add AliTPCCalibQAChecker, AliTPCCalibViewerGUIAlarms
AliTPCCalibQAChecker.cxx New class for calib data checking, mostly based on tree draw, but also histograms, graphs, numbers
AliTPCCalibQAChecker.h New class for calib data checking, mostly based on tree draw, but also histograms, graphs, numbers
AliTPCCalibViewerGUIAlarms.cxx New class. GUI interface for calibration alarms. Will be used in AMORE and offline.
AliTPCCalibViewerGUIAlarms.h New class. GUI interface for calibration alarms. Will be used in AMORE and offline.

bugfix: moving call to AliTPCcalibDB::SetExBField to DoInit() It was not executed any more, causing a seg fault in the ExB correction

bugfix: wrong result convention was used in r36516

bugfix: wrong mask was used for trigger pattern in CDH[6]

disable the CTP trigger pattern in the HLT simulation as this
needs some more work to be included in the trigger framework currently under development

allow names with the '-' character in items. This is a temporary solution like in r35411.
It has beendeactivated in r36097, but it turns out to be necessary again for the correct
evaluation of the trigger menu until the final concept is in place
See https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?58205

adding libAliHLTGlobal to unit test

adding the libPHOSUtils dependency for the libAliHLTGlobal

the track angle is checked before rotation a track, in order to avoid AliError() message from AliExternalTrackParam::Rotate()

bugfix: using correct detector string for the setup of the AliHLTCaloMapper class

eliminating further private copy of AliMagF and cleaning the header file includes where not neede anymore

bug fix: reconstruction crash when the output buffer size exceed

apply alignment to the geometry in TRD Clustizer and Tracker (Theo)

removing the generation of the local solenoidBz OCDB entry
removing default entry

removing all code regarding the solenoidBz OCDB entry formerly used
to propagate the field value from DCS to the components in the online
system. The framework now initializes the global AliMagF instance,
which is used by the components fot the field setup

remove option to pushback every n events (Theodor)

adding documentation of the field conventions
using the AliGRPManager again for verbose output
changing the default polarities (corresponding to positive fields):
  l3: positive -> 0
  dp: negative -> 1

too much memory was allocated for temp. arrays

- realistic input multiplier
- cosmetics

- vectors removed from the ITSTracker class, to avoid a continuous increase of the booked memory
- cleanup

compilation warning fixed

Corrected documentation explaing the polarities conventions. NO code change

adding common functionality for the magnetic field to the component interface

Bug fix in copy constructor and assignement operator (Matthias + me)

Add missing newline at the end

release a temporary memory at each event, to avoid continious memory increase

change an estimate of the output size

Protection against gMinuit deletion by third party added

bug fix: access to deleted pointer

do not use the AliGRPManager until bug
https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?58403 is fixed

adding macro to create a GRP entry for various field settings
usage:
    aliroot -b -q -l $ALICE_ROOT/HLT/exa/makeGRPObject.C'("default", "$PWD")'
    aliroot -b -q -l $ALICE_ROOT/HLT/exa/makeGRPObject.C'("off", "$PWD")'
    aliroot -b -q -l $ALICE_ROOT/HLT/exa/makeGRPObject.C'("l3=12000", "$PWD")'
    aliroot -b -q -l $ALICE_ROOT/HLT/exa/makeGRPObject.C # for help

Updated filtering of the Goofie mesurements
Usage of the filtering for the moment in the CalibEnv -
for the moment just for visualization
(Marian)

new performance classes (Simone Schuchmann)

reading the CTP configuration in the initialization of the HLT reconstruction and
passing the trigger mask via the AliHLTTrigData structure to the components

files moved to TPC folder

correcting HLT logging: the pointers of the objects are only printed in debug mode

move all TPC related classes

inserting the correct trigger mask into the CDH of inserted empty data blocks

adding method to retrieve trigger mask from RawReader

added a protection against detector not definining the default event specie

change the name of a few histograms (adding hglobal)

Almost final version of scanning tools.

* AliEveEventManager
  Emit new signal NewEventDataLoaded() after the event-data is
  connected but before the macros are executed.

* AliEveTrackCounter
  Connect to AliEveEventManager::NewEventDataLoaded() to do the reset.
  Introduce 'Bool_t fAcitve' -- now that track and tracklet label is
  misused to store scanning results it is better that track-counting
  is not enabled by default.

* AliEveTrackCounterEditor
  Add Activate / Deactivate buttons and handlers.
  Remove histogram plotting code -- now in show_scan_results.C

* visscan_init.C
  Remove code for registration of tracks/tracklets to
  track-counter. This is now done in esd_tracks / esd_spd_tracklets.

* make_scan_results.C
  Create the scan-result tree from individual objects stored during
  scanning.

* show_scan_results.C
  Create canvases and plot basic stuff from the scan-result tree.

* esd_spd_tracklets.C
  Put tracklets into two containers -- Good/Bad.
  Register the tracklets to track-counter if it is active.

* esd_tracks.C
  In esd_tracks_by_category() register the containers to track-counter
  if it is active.

added the option to save or not the QA data objects

Fixing behaviour wrt DCS DPs related to pressure sensors:

- if the fit is there --> ok
- no fit, but run lasting less than 60 s (according to AliDCSSensorArray) and TGraph there for the
sensor --> ok
- in any other case, don't increase the count of the DCS DPs --> making GRP fail

Changing also kFitFraction from 0.7 to -1 (Haavard), but it will not have much effect with all the other changes...

Fixing printing bug.

update configuration analysis macros with last updates in the frame

An artifactual debug streamer removed ( there was a segmentation fault after a call of the streamer destructor )

folders to keep the wagons output in the common analysis file defined, do not clear cluster/track lists+

a macro with TPC,ITS, ITSSPD vertex, global vertex and v0's

extra check for the output size is added

- default cuts are tuned
- cosmetic

- bug fix: only TPC tracks were used in the vertex finder, now ITSin parameters are used when they are present.
- some cosmetic

- There was impossible to set solenoidBz value  from the configuration string. Now parameters from the configuartion string are set after the OCDB parameters.
- The order of filling of ESD tracks is changed: TPC, TPCOut, ITSOut, ITS.
  The ITSin parameters are stored in the ESDtrack itself, therefore they are lost when the UpdateParameters(..) is called next time.
  To keep the ITSin parameters in the ESD, one should set these parameters last.

Adding counter for TOKEN_LOST errors in AliMUONRawStreamTrackerHP.
Adding symmetric methods to AliMUONRawStreamTriggerHP, as found in AliMUONRawStreamTrackerHP for counting errors for whole events.

(Artur)

Cluster indices are published via AliKalmanTrack::GetClusterIndex()

remove mechanism to avoid dependencies on PHOS and EMCAL Utils

Release the error of DAQ FXS for physics run also

Common output file implemented in AddTaskUnicor.C