Correct conversion from Int_t to UShort_t

Changes for report #68133: Filtering of ESDFriends at reconstruction level. The default fraction is fixed at 4%

-mavoid creation-deletion of TClonesArray per event

added detector acceptance effect in AliFlowEventSimple + removed AliFlowEventSimpleMaker dependence from the runFlowAnalysis.C macro

Bug fixed when creating AliCDBGridParam and the cache folder is not set.
Related to bug #68721.

Added protection against missing ESD pointer

Tender now derives from AliAnalysisTaskSE to be able to use the SelectCollisionCandidates functionality.

Methods to verify the if the tracklet/single cluster is used by ESD track.

Modified trackleting: AliMultiplicity stores info if the clusters
used by the tracklets or "singles" are used in tracks.
The trackleting step is moved from the vertexer to the end of
reconstruction loop.

changing smoothing sigma for AliRelAlegnerKalman
(marian)

correct memory leak in digitizer, put protection in AliEMCALDigit dtor

Last files needed for centrality reconstruction @ 1.38+1.38 A TeV

1. SetDefaultOutputs(kTRUE) used by default. This will automatically archive the analysis outputs. In this case, calling SetOutputFiles and SetOutputArchive is now forbidden and will produce a fatal error. To use arbitrary output files and archives, one has to manually reset the SetDefaultOutputs flag.
2. Specific SE's are not allowed anymore via the plugin.
3. To specify the number of replicas for the output archives, one should use SetNumberOfReplicas(n) where the default is 2 and the maximum allowed is 4.
4. stdout and stderr files are not registered in the catalog in case a job enters in DONE state.

AliCollisionNormalization:
 - Adding member for energy and pointer to stat histogram (all events)
 - Some more printout in ComputeNint
 - Using energy in GetRelativeFractions

AliCollisionNormalizationTask:
 - Using the bin0 callback
 - Explicitely setting ntracklet = 0 in MC if the event is not selected

runProofNormalization.C:
 - Changes to run on the new CAF

plots (DDL data size and DDL occupancy) scaling corrected

use OpenFile for TTree saving (suggested by Andrei)
use AliESDInputHandlerRP for linking the data in private train steering
macro

there have been some changes in the on-line tracklet and GTU track
implementation which require adaptations also of the visualization
code (Jochen)

Added event-level selection (Chiara)

Updates for TPC TenderSupply (Jens)

Add protection against an AliWarning appearing when getting the track status in AliITStrackeMI::RefitAt

GPU tracker update

- return pad centre for z-position (before pad edge)
- additional methods to provide ROB/MCM position for real tracklets

fill the refmult

Possibility to copy the number of the TPC clusters from an AOD track to an ESD track (A. Dainese)

- adapt tracklet reading for tracklets from simulation or real data
- output to tree (instead of branch)

 adding spectra tasks for R = 0.7

Adding some histograms for jet shape

Update of the GPU tracker

Introduction of summable digit class. The implementation of SDigitization and RAW2SDigits will follow.

added calibrate esd flag

Increase class version, forgotten in the previous commit.

Update by Jochen concerning HC header treatment, including:
- error output generated in error functions with debug level
  (configurable at compile time)
- set error flags to steer further reading (run-time configurable for
  every error type)

Finally removal of the last left-over from the previous implementation of the vzero digit.

Adding a bit that specifies if the online (beam-beam,beam-gas) flags are filled (correctly) in the ESD. To be used in AliTriggerAnalysis in the replay of the online trigger.

Added eta cut and minTPCcls for single tracks

Coding rules (Rossella)

- fix bug https://savannah.cern.ch/bugs/?68562
- fix bug in filling cluster charge histogram

Warning corrected

fix pointer allocation suggested by Andrei

changes for JETCorrel from Paul

Return supermodule number from eta and phi, taking into account the number of supermodules of the selected geometry

added option to create flow event from SPD tracklets

Gap between paderow used for seeding as parameter in AliTPCRecoParam

(Marian)

Some theoretical consideration:

The track seeding efficiency depends on the cluster finder efficiency - ceff.
ceff is dEdx dependent, in mean is about 0.8 for MIP is about 0.75
The probability to find a seed=
pseed = ceff^3
Probability to find a track in nseedings
ptrack = (1-(1-pseed)^nseeding)

nseedin = npadrows/gap.
Until now we were seeding in outer sectors with gap 6 and 10 pad-rows (r dependent).

For tracks crossing the full TPC the track finding efficiency is
( you can draw it using TF1 f1("f1","(1-(1-0.75**3)**((160.-64.)/x))",1,10))
99.5% once the gap 10 pad rows is used.

For short tracks = kink decays e.g 30 cm from the end of TPC it is about 65% for gap 10 pad-rows, 85% for 5 gap 5 and 95% for gap 3 pad-rows.
(see function
TF1 f1("f1","(1-(1-0.75**3)**((20.)/x))",1,10))

- AliITSv11GeometrySPD.h : changed signature of method CreateConeModule

- AliITSv11GeometrySPD.cxx : mods in CreateConeModule to prolong cooling tubes where they were missing and to add freon
inside tubes; CreateCones has been modfied to add new volumes

- AliITSv11GeometrySupport.cxx : mods in SDDCone to add cables inside the holes of the SDD cone;
  mods in SPDCableTraysSideA and SPDCableTraysSideC to add HV cbles in the trays and freon in the cooling tubes

- AliITSv11Hybrid.cxx : mods in CreateMaterials to define gaseous Freon and the average material for SPD HV cables.

Mario Sitta

Fix warnings

Protection + correction for dimensioning of pointer data members

Wrong path was stored inside of the AliCDBEntry
This was probably the reason why it enters to wrong directory

(Marian)

Produce fatal also when wrong currents configuration is requested

AliMagF will produce AliFatal instead of AliError if loading of field fails

- speed up T0 average calculation significantly
- remove unused data member

fix for bug #66294

Fixing coding conventions (const arguments in functions)
(Ivana)

Cuts updated.

Added macro for analysing output of AliAnalysisTaskHardSoft

Reduced RAW histograms and revisited DQM histograms (A. MAstroserio)

Protection added (Giacomo)

Correctly reset the total number of events (for Amore)

Bug fix with matrix inversion in SetProductionVertex(); sign of GetDistanceToVertexXY() fixed; GetDecayLengthXY() and GetErrDecayLengthXY() methods added (S. Gorbunov)

method to mark RP and POI's

Additional separate histograms for hard and soft events

Fix for report #66086 Remove gstpar calls and put parameters in galice.cuts --HMPID

- speed up HLT tracking by moving ReimanFit to MakeTrack
- remove some unnecessary code

- speed up HLT tracking by moving ReimanFit to MakeTrack
- remove some unnecessary code

option to also calculate generating function cumulants versus multiplicity

Bug fixes (Sadhana)

updates on TOF software:

- added new TOF raw data decoder (enhanced decoder)
- enhanced decoder enabled as default in reconstruction
- TOF raw data policy updated
- all calibration code in AliTOFcalib class
- updates on TOF-T0 classes
- DA for physics runs split for physics and calib events
- DA-physics computes readout+decode efficiency
- PreProcessor put readout+decode efficiency in OCDB
- readout-info object added (Reference)
- changed online T0-fill measurement in PreProcessor
- added online resolution measurement in PreProcessor
- added ResponseParams class and file for TExp correction

Major fixes in the digits and raw-data reco. Now both are equivalent. To be propagated to the release. The trigger inputs bit mask is filled in the friend only in case of raw data. Will be fixed when we switch to the new trigger framework. It is not clear now where to put this data.

added reference mult

Added task for hard/soft event comparison (basic version)

Bug fixes (Chiara)

Histogram range changed

Create summary postrcript file
(Marian)

Added possibility to recalibrate CaloClusters during the analysis

Changed default initialization values of fTrackDz / Dx to -999

From Sergey : Fill DCA of TPC tracks in ESD

Problem in merging of the time component

Check the presence of TOF histogram

Marian

possibility to use track vertex

Added primary vertex as a branch in spTree +  start using GetEventSpecie()

Cleaned usage of TClonesArrays in the loader
In the AliEMCALRecParam::Print, cosmetic changes.
Macro AliEMCALSetRecParam.C, update with last parameters for real data reconstruction

Adding total dNdetadphi including SPD inner layer analysis

Call of ReadIntensityInfoCDB was missing in the Begin

check pointer and print info

Change concerning the determination of the innermost layer in RefitAt (A. Dainese)

Adding unit test for AliHLTReadoutList

cleanup of GFC cumulants (some well deserved attention)

- added possibility to set centrality cuts from the commandline

Fix in simrun.C macro; there was a { lost in prevoius commit.

- added comments

- added different sorting algorithms for the digits
- pre-defined compare functions for sorting by energy and by position
- also possible to set the compare function to anything you like

- cleaned up some unnecessary code
- added some comments

- fixing compilation warning

Add process command which kills neutrinos in order to reduce simulation time

Adding comments; in Config.C added a variable g4libsMacro to make easier to
customize the path to g4libs.C macro

Default OCDB object for report #68539 (Ruben)

Correct ran function.

Added macros for production using Geant4. 3 different physics lists can be used: QGSP_BERT_EMV, CHISP and QGSP_BERT_CHIPS. All 3 PL can be used combined with optical processes, too. sim.C and rec.C can be used for local testing. Check simrun.C for the usage.

Major fixes to the raw-data simulation. The ADC samples and signal width are added to the raw-data stream. The trigger flags are stored in the digits tree user-info and then propagated to the raw data and esd. The digit class is updated by removal of unneeded members. Some code clean-up as well. We need one more step before in the reconstructor in order to declare raw-data and digits sim/reco are completely equivalent. This step is to move the code from ConvertDigits to Reconstruct method.

AliITSRecoParam & AliITStrackerMI:
new cut variables introduced for PlaneEff evaluation

AliITSPlaneEffS*D:
rebinning of the control histograms

  Giuseppe Bruno

Use the same truncation in the reconstruction and also
in calibration
(Alexander)

updates in MeanTh scan analysis and new method added to display hitmaps (A. Mastroserio)

c
c     Version 1.382
c     Nuclear distribution for deuteron is taken as the Hulthen wave
c     function as provided by Brian Cole (Columbia)
c
c