C++11 fix (Raffaele)

Coverity fixes (M. Krzewicki)

Added diffractive tagging also to main task, for completeness

(previously only in the specific cross-check task)

---David

fix printout

added new data member for max clusters/track

from Carlos PErez:
fixes for coverity, new QA and fix on event rejection

change histogram bining (G.Luparello)

adding getters and some infos

From Jiri:
QA class for the EMCal jet trigger patch info.
Included is also a small improvement of the patch object (additional geometry coordinate,
function to return cell indices of the cells inside the patch, fixed ADC count integration).

Added charge to the clusters tree

Add KK configs

D* systematics in pPb (G.Luparello)

enable QA running for pPb on the lego train

Add histograms and enlarge the Ntracklets range to 400 for pPb data analysis

For pPb analysis, enlarge the range of the Ntracklets in the container up to 400 (from 100) and possibly use Ntracklets weights

Add possibility to use weights on the number of Ntracklets

Ds systematics for pPb (GM.Innocenti)

D+ Raa vs Npart systematics (R.Bala, E.Bruna)

From Redmer:
I've been working on estimating the flow contribution to background in jets.
At the moment, this analysis works in the following steps:

1) get rho (from the available classes)
2) get estimate v2 and v3 e-by-e
3) subtract the background of a jet and store this subtracted background
using the function jet->PtSub() which stores the subtracted jet pt as a
member of the AliEmcalJet
4) (and this is done by classes in the flow package) do a flow analysis
on the background-subtracted jets

There are two issues here
1) if multiple tasks in one train call PtSub(), the outcome of the analyses will be nonsensical
2) continuing from point 1: i can only call PtSub() once for every jet, so i cannot attach multiple
rho estimates and flow analyses to one jetfinder routine.

To solve all these issues, i propose to add a small derived class which provides
- besides a 'global' rho (fixed in the event) - also a local estimate of rho.

Add RadialDistancekK

recoparam tuned for tdr5 setup

D0 pPb systematics (A.Festanti) + fix for pPb (ZCdV)

Add methods for 2011 data (D.Caffarri)

- fix compiler warnings

check variables initialization

Update systematic class for pPb case

From Salvatore
- AliAnalysisTaskRhoBase: cosmetics
- PYTHIA info histograms moved from AliJetResponseMaker to base class AliAnalysisTaskEmcal (disabled by default, use SetIsPythia() to enable)

upadte from Markus

Added wrapper volumes to CDR setup

fix

polishing (G.Luparello)

updates

fix on cut object class (A.Grelli)

default to a cluster in SPD layer 1 or 2 instead of first layer

Update of macros

const correctness of the interaction map (L.Aphecetche)

Enable usage of pt weights when a weight function is set

Changed histo binning for better merging; added a few control histos for MC checks.

---David

Add momentum correction workaround

fix on add task (J.Wilkinson)

change flow-track-cut paramater name (M.Krzewicki)

discard events with Ntrk <= 0

Add extra analysis macros/scripts

Add option for variable bin size

changed bin width

Small data block AliHLTTPCDataCompressionDescriptor with general description of the compressed data is introduced,
to keep backward compatibility for the cluster merger.
At the moment the descriptor only says if the clusters should be merged  during  unpacking, or they were already merged in the HLT,

Added SetSpecialOutput for debugging output if needed.

- input of cluster compression component is changed to AliHLTTPCRawCluster format;
- cluster merger is disabled in ClusterAccessHLTOUT, clusters are now merged in the HLT before the compression
- HLT data flow is changed correspondingly

reading of parameters from OCDB object temporary disabled

full functionality from AliHLTTPCHWCFSpacePointContainer copied to AliHLTTPCRawSpacePointContainer

bug fixes

added jet trigger patch maker

Code to match jet patch trigger to jets (from Jiri Kral)
More info at https://indico.cern.ch/conferenceDisplay.py?confId=255775

pileup rejection added  M. Knichel

from Redmer

- HWClusterDecoder component converts HW clusters to AliHLTTPCRawCluster format and merges HW clusters at branch borders.
- ClusterTransformationComponent transforms the raw clusters to XYZ coordinates. It will replace HWClusterTransformationComponent.

avoiding narrowing conversions in initialization lists

from Redmer Bertens:
removed implementation of Terminate due to merging problems in LEGO
framework

Reference X is an argument

Additional fixes

Jochen

adding return for non-void function

OCDB RecoParam files modified accordingly to the deletion of AliHMPIDRecoParamV1 class. Now only one file containing AliHMPIDRecoParam object

Class AliHMPIDRecoParamV1 introduced (29-11-2009) as a copy of AliHMPIDRecoParam class to solve problem occured in v4-17-Rev-18 eliminated, AliHMPIDTracker and AliHMPIDReconstructor classes changed accordingly (previous commit)

minors

Update Netparticle: 1) QA class added  2) cuts for AOD in Efficiency calculation fixed  3) Phi cuts enhanced  4) Distribution class  5) Fik calculation made faster  6) ESDs/AOD usage streamlined  7) in 3 parts all, TPC only and TPC+TOF  8) w/ and w/o phi cuts  9) smaller unifying fixes all over

-fix for pair cut qa

apply 100 ns shift only from run 130850 - Marie Germain

Added missing destructor

remove two new classes from compilation

Made wrapper volumes of AliITSUv0 configurable from Config.C.
AliITSUGeomTGeo will automatically detect wrappers and acount in the
geom interface.
Moved old CreateITSU.C CreateITSU_cdr.C
New CreateITSU.C corresponds to trd5 drawing of Corrado (outet 4 layers
- for radii only)

- change error message to debug message for TRD tracklets

-reduce size of pairarray in HF

Implementing the wrapper volumes (Mario)

-add cut qa class
-protection for missing V0 branch (nanoAODs)

Add new tasks for Lc analysis with upgrade (Chiara, Rossella)

Add new tasks for Lc analysis with upgrade (Chiara, Rossella)

kaon femtoscopy train for pPb

typo: double changed to Double (Laurent)

delete moved to correct place

from Redmer Bertens:
fix a potential problem with includes

From Jochen: patch generalizing TRD trigger analysis to AliVEvent and AliVTrdTrack

goes with previous commit from June 14th (general updates...) (Laurent)

Update of M. Nicassio

AliTPC: New code to use RAW TPC/Calib/Correction. Possibility to use ExB correction only (old code, for backward compatibility) or RAW TPC/Calib/Correction (new code) by reading parameters from RecoParam (retrieved using AliTPCcalibDB).
AliTPCcalibDB: RecoParam and corresponding getter added

Destructor

Option for kine only simulation added.
Rudiger Haake

changes in the PID of protons + new config for the proton femtoscopy train

changes in AddTask pPb

changes in AddTask pPb

-update michael

from Carlos Perez:
updates

Search data pattern can now contain the directory to be appended to the base
data directory + run number. This should be separated with a blanc from the
actual search path, like: "pass2 AliESDs.root" which will generate:
   find -x collection /grid/data/dir/%run%/pass2 AliESDs.root
Added possibility to specify a user defined tree name using SetTreeName()

Fix for coverity warning 21784. (Misha Veldhoen <Misha.Veldhoen@cern.ch>)

1) additional interface methods for AliAnalysisTaskjetFlow 2) extra histograms to save dpt-tpc, -vzeroa, -vzeroc in one pass over the data 3) added flag to reduce memory (ram and storage) if necessary
 (Redmer)

changed centrality method

Mass limits on calculation of average pt

Updated macros and DCA cut for Sigma* analysis (M.Venaruzzo)

Protection against events with trigger mask =0

from Marta:
 - delta-pT task picks up automatically the number of centrality bins specified + histos for partial exclusion in pA analysis
 - AliAnalysisTaskEmcalJet+__AliAnalysisTaskEmcalJetDev+__AliJetContainer: adjust jet acceptance based on run number in case of 2012 and 2013 data (new SM not active/masked)

new SM not activate/masked (from Marta)

Possible set of pt weight flag as macro parameter (R.Bala)