handle the MC data by the decoder instead of the cluster container, full support for merged clusters

implementing association of cluster MC labels and cluster ids to the unpacked clusters (code copied in large parts from AliHLTTPCClusterAccessHLTOUT::AliTPCclusterMIContainer and going to be obsolete there)

adding method for setting MC label, according to extension of AliHLTTPCDataCompressionDecoder interface

adding dummy method for extended interface of the AliHLTTPCDataCompressionDecoder

changing argument type to pointer to better fit the implementation in the decoder; code can be further optimized later to avoid small overhead by empty default MC data member in the reconstruction of real data

create the histogram of cluster time difference when combining clusters and not the other options

Isolation: Correct the setting of histogram titles
Hadron correlation: Associated pt bins incorrectly assigned as trigger pt bins, add associated pt large range pt cut and minimum trigger pt cut
macro, updated with these changes on hadron and trigger thresholds plus other stuff

New reference run for SPD

Updates and fixes for QAPlotter

Fixes for #89479: change in AliPIDResponse and AliPIDCombined (STEERBase). F.Noferini

changing central value for ZDC cut, based on the output of the physics selection QA

Macro 1

QA: Fixes for PHOS: Enable study of exotic clusters, fix filling of grid of cells, calculate the E cross
Photon: Protection for cluster pointer non existence (happens for delta AODs)

Coverity fixes

open default time cut in AliAnaPhoton, specially the minimum time from -1 ns to -10000 ns, modify example macro to set the cut for PHOS

o AliTRDTenderSupply: updates from Markus Fasel
o AliESDv0KineCuts: updates from Linus Feldkamp
  - initialise KF event internally
o AliAnalysisTaskPIDqa: updates from Michael Weber
  - provide lists of identified particles from V0 decays

Coverity fixes

Added a feature test macro for sa_restorer field

Fix Coverity

Removing obsolete AliITSv11Hybrid class

Fix Coverity

Fix Coverity

Updates

Correct treatment of negative values (Giacomo)

L1phase shift corrected

remove bad and exotic channels by default, if file name specified, fill it with TList and not directory

coverty

Input lists for comparison separate for the
OFFLIEN and HLT events

adding more comments

Fix Coverity

* Fix unix signals defects 18441 and 18442 reported by Coverity
* Fix some lines with incorrect indendation

D+ update

D+ update

Fix Coverity

Fix Coverity

Fix Coverity

Fix Coverity

Fix Coverity

Fix Coverity

Changes for #89427: Porting modification for material budget issues to the Release: replacing obsolete geometry AliITSv11Hybrid

Use matched track cluster rejection defined in AliCaloPID

coverity fix

monitoring histos for new trigger

Updating conv correlation classes

fixing rule violations

Fixing coding rule violations

Removing files that had been added to soon. Non in build system.

Coverity fixes

Send to FXS before sending to Amore

Update to allow check per chamber

Changes to be in sync with what we have in the OCDB

bug fix for outer sectors, extra interface

macro for cluster merger efficiency

1. AliRDHFCutsLctopKpi:
  -- added switch to choose between combined PID and nsigma PID, standard cuts and KF cuts
  -- modified the IsSelectedCombinedPID: possibility to set a probability threshold or to use the maximum probability criterion
2. AliAnalysisTaskSELambdac:
  -- added the normalization counter
  -- added histos for the various resonant and non resonant channel
3. makeTFile4CutsLctopKpi.C :
   -- added the possibility to set the priors and use the combined PID
   -- added the possibility to use KF cuts instead of standard ones

(Rossella, Magnus)

Adding macro to compare the tracks recunstructed with
OFFLINE and HLT cluster finder

removing event_stat.root as RegisteExtraFile, needs to be specified with plugin->SetTerminateFile

Use cloning of AliESDtrack to ExternalTrackParam rather than AliESDtrack

Pyquen large angle radiation
Leticia Cunqueiro

- Apply trigger algorithm to MC tracks when defining a triggerable track (for performance studies)
(Diego)

Add new central and semicentral triggers (Cynthia)

bug #89470: add entry to OADB: PIDdefaultPriors
Pietro Antonioli

Updated bad channel map.
Gustavo Conesa

Fix to pointer name wrt previous commit

Fix for coverity

Re-enable trigger calculation removing STU OCDB access. Improve simulation (L0 time + time sum including rollback). Clean-up

bugfix: output of one extra cluster when the last rawcluster was accepted by the clustermerger

assignment operator update typo - fix from Jochen K - thanks!

treatment of MC labels added

Updates for EMCal

attempt to address remaining coverity issues - all involving assignment operators. Now just rely on using copy ctor for these operators - for simplicity and to avoid code duplication

Coverity

Using both central and semi-central classes for kCentral and kSemiCentral also for the new classes.

New task for analysis of jet core (L. Cunqueiro)

o TPC tender updates:
  better control of gain corrections
  remove obsolte PID code which is in the PIDResponse now
o Adapt AddTask to allow the PIDResponse task before the tender

add line at end of file to avoid compilation warning

coverity from Dmitri

Changes for #89357 commit in STEER and port to release T0 AO

Fixes for #89368: QA final merging crashes REV-14 (Ionut)

Changes for #89334 AOD Calorimeters: store distance to matched tracks to clusters in AODs, port to trunk and release

Add function suggested by Uwe

New tags supported by AliAnalysisTaskCfg: \n   #Module.OutputFile file.root matching AliAnalysisTaskCfg::Set/GetOutputFileName() (desired output file name)\n   #Module.TerminateFile file.root matching AliAnalysisTaskCfg::Set/GetTerminateFileName() (custom file written by the task in Terminate)

now mag field and geo manager configuration done in analysis tasks

Reduce number of histograms in QA, added option to load geometry file

Coverity

1) Add initialization of magnetic field in case of track matching recalculation, for AOD and ESD
2) Rule checker coding violations

Add positility to import geometry.root at Init

Add positility to import geometry.root at Init

CaloUtils: Add include to TGeoMatrix
Reader: Add positility to import geometry.root at Init

including <algorithm>

Changes for #89354 commit in STEER and port to Release AliESDTZERO with fixed const

returning the handler in its own type and not its baseclass

coverity and RuleChecker viol fixes

Updated macro (Micahael Weber)

cluster merging algorithm added

Changing order of T0 selections (Alla)

Additional fix for #88417: Request to commit/port fixes to ANALYSIS/AliFileMerger.{h,cxx} (Ruben)

Coverity

Introducing a flag to use V0AND instead of NSD1 for NSD events - turned off by default

Coverity

Coding conventions