modification be Michael Knichel

Fix for a coverity warning

Include new sets of pt & y distributions for:
pp at 7, 2.76 and 1.9 TeV
PbPb at 2.76 TeV.
Smbat Grigoryan <Smbat.Grigoryan@cern.ch>

coverity fix

coverity fix

init in ctor - avoiding compilation warning

changing low pt cut

New histograms to study the correlated loss of efficiency (Lizardo)

Fixing warnings (Sang-Un)

major dielectron update (included also the data and plotting macros for paper)

Including new DPs for local simulation, and Shuttle nightly tests, according to bug https://savannah.cern.ch/bugs/?52151:

LHC_Particle_Type_B1
LHC_Particle_Type_B2
LHC__Active_Injection_Scheme

In AliMUONTracker:
Add a special case to use the vertex from ESD, even if the number of contributors is < 1, when it is taken from the simulation (using AliITSVertexerFast)
(Livio, Philippe P.)

Fix from rev. 40001, avoids partons boosted by PYROBO endlessly:

Brute force initialisation of V(,) array at the beginning of each event
solves floating point exception (big number in V(4)).
Probably a MSTU(33) = 1 at the right position would do the same job.

- new clesses added
A    PWG0/dNdPt/AliPtResolAnalysis.cxx
A    PWG0/dNdPt/AliPtResolAnalysisPbPb.cxx
A    PWG0/dNdPt/AliPtResolAnalysis.h
A    PWG0/dNdPt/AliPtResolAnalysisPbPb.h
M    PWG0/CMakelibPWG0dep.pkg
M    PWG0/PWG0depLinkDef.h

-- modifications by M.Knichel
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPt.h
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPtHelper.h
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPtAnalysis.h
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPtAnalysisPbPb.h
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPtHelper.cxx
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPt.cxx
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPtAnalysis.cxx
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPtAnalysisPbPb.cxx

First Physics Group analysis class.

An example how to use the class is also provided, including a macro.

New version of rulechecker

improved handling of aods, added beginning of mc info

add protection in reader against missing output event when the non standard cluster array is requested; remove debug prints from AliAnaPhoton

add protection in reader against missing output event when the non standard cluster array is requested; remove debug prints from AliAnaPhoton

Turning off MC histograms for pure data

adding some functions

Changing range of PbPb histograms and fixing minor bug in filling of electron dEdx plots

Changing PYTHIA scales to Perugia-0

Macro for combined spectra (Marek)

fix for run 146857 (LHC11a) where an -ALL trigger was used accidently

- fix the the V0 centrality plot for Pb+Pb runs

- included the vertex z coordinate in the list of cuts in the constructor

- introduction of array of data structures for holding the sets of cuts
- predefined cuts included
- cuts are printed every time the drawing method is called
- reduction of passed arguments in most methods

Added template script to draw final pp dN/deta
Updated train-setup to allow for pass post fix
Updated DrawdNdeta.C with a few things.

Forgotten debug statement

Indicate whether pool is full the first time. Only shrink pook if pool size will stay above limit when adding new event and removing first.

adding centr comparison study

added switch for event slection in cluster task, updated plot notand JetSpectrum Histograms

Fixes to track selection for embedding in cluster task (Bastian), Do no select events in the cluster task (switch added default no selection), adding delta pT histograms to the background subtraction

- bugfix for drift length: m instead of cm (Benjamin)

- add support for SM header version 0xc
- read tracking and trigger headers
- read GTU trailer
- decode GTU tracks
- preparations for tracks to ESDs
- improve debug features
- some cleaning

 Axis names added

 better rusults with beam with high background

fix  for Savannah bug #81846

optimizations after profiling
event mixing optional
fixed species dependent efficiencies for esd analysis

add new time cut, time histograms

Rejection of centrality outliers in AOD049 (Giacomo)

Tracking procedure updated, it is based now on AliTrackerBase method. The parameters of the constrained track to the MIP point in HMPID are used for Cherenkov angle reconstruction. Debug stream level defined in AliHMPIDReconstructor

protection against wrong esd track labels

New Analysis task for upsilon anlaysis (Sang-un)

Update errors for D0 PbPb

Fix for savannah entry #81839

Added some extra scripts.
Updated SimpledNdeta
Updated ELoss vs Poisson
Updated OtherData to be more robust flexible
Updated Run.sh so one can explicitly specify
  what to compare to using the -O option. The
  option -J is gone.  Options -A and -a allow
  one to specify alternate script path and
  excutable (e.g., root instead of aliroot).
Small fixes in AliBasedNdetaTask
Updated DrawdNdeta.C to allow for systematic
errors and final small corrections - e.g.,
  cluster/tracklet ratio, remove outers, ...
  Now also uses a bit mask of options.

coverity bug 15108

secure code fixes

protection for division by 0

output file name configurable

Coverity fix, report 10667

Fixed copy constructor (Constantin)

moving AliHLTComponentBenchmark to HLTbase

adding forward declaration

Update (Chiara)

Update (Gicaomo)

Coverity (Francesco)

Added more severe checks if emcal matrizes are there

Coverity (Jens)

Using an explicit initialization (Savannah #81796)

loop till last cluster in the loop when recalibrating

fixed trailing character

changing the output format to thnsparse, only for all centralities running

Add delta area to THnSparse for delta pT output

Clean-up

Clean-up

Clean-up

fixing typo

Update LHC11a: 14 runs, good on RCT 3 May

Moving aod cleanup to earlier point to prevent reuse of same particle

coverity fixes
fill triggered step also in dphi corr task

Adding valgrind suppression file for AliRoot

Bug fix + introduction of a monitoring histo useful for ZDCvsZEM centrality selection calibration with VZERO.

Update of the TRD PID Response:

- New reference distributions covering a momentum range from 1 to 10 GeV/c with an additional step at 1.5GeV/c. The reference in the OCDB up to now are going up to 6 GeV/c in integer momentum steps. With the change we increase the pt reach for the TRD up to 10GeV/c.

- The container type has changed: Before the references were stored in a TObjArray and associated to momentum steps and species  via the name. Momentum steps were hardcoded in the PID Response, adapted to the old TRD PID code. With the new references having a different momentum binning we have seen that this is difficult to handle. A new class AliTRDPIDReference stores the reference objects together with the reference object container. The new container can handle references for all TRD PID methods.

- To keep backward compatibility the OCDB object contains the TObjArray containing the old reference objects and the reference container with the new references. In the code currently implemented the Load function checks the name of the TObject, and if it is not valid it will be neglected. In the new code we explicitly expect the new container, and all objects of a different type will be ignored. So backward compatibility is not an issue. One file in the TRD code is affected by the change, which has to be updated the same time  commit is done.

- The TRD tender was also adapted to the change and the configuration was updated.

Concerning the OCDB entry since the TRD PID Response is now used in the reconstruction to calculate the TRD PID Probabilities we were concerned that we would cause problems there if we provide only the corresponding object for the new code while the reconstruction is still running with the old code. For this since the current OCDB entry stores the reference object in a simple TObjArray, we considered to be compatible with both versions of the code we add the new object to the old references. Since in the old code references which are not compatible with the name convention for the old objects are rejected, and in the new code we require the reference object to be of the new type, both versions should work with the new code.

Markus

Updating AOD filter

Changes from GSi train
commit c5f5bb886bbf65d4e5f0e1f9316fda9e45767033
Merge: bcb41fa 13ac6e6
Author: Svein Lindal <svein.lindal@gmail.com>
Date:   Mon May 2 13:58:32 2011 +0200

    Changing mass cuts for pi0 eta

commit bcb41fa3518e31a40a235be84f41c9a3101dc17a
Author: Svein Lindal <svein.lindal@gmail.com>
Date:   Mon May 2 13:50:28 2011 +0200

    cosmetics

commit 75e4540e56edb19654bb0c5f1485dc183ac6511c
Author: Svein Lindal <svein.lindal@gmail.com>
Date:   Mon May 2 13:38:36 2011 +0200

    Merging in changes from GSI train

commit 13ac6e62e9ad23a1365ec5ca4d47ac15d41a5123
Author: Svein Lindal <svein.lindal@gmail.com>
Date:   Mon May 2 13:31:00 2011 +0200

    changing eta pi0 mass cutsx

coverity 15108, the code needs further revision since the loop does not make sense anymore

corrected bug introduced in r49225: cleanup in DoDeinit, was never called due to early return statement

get rotating angle of the local coordinate system

create 2D projections of space points, adding interface method to retrieve phi of the local coordinate system

coverty fixes + QA

Fix for #81567: fix in SetTOFResponse method (AliESDpid)

Coverity fixes: two minor resource leaks

Coverity 11288

Coverity fix

Coverity 14190

coverity

Coverity 11375

Coverity 14106

Coverity 16620

coverity

ignore HLTOUT if option 'run-online-config' is found (Lars)

Parsing of online configuration (Lars)
- improved error handling
- handling of RORC option -hwcoproc and replacement of TPC CF, generic solution under investigation
- deactivating configuration handler during parsing and postponing registration to successful parsing

adding option 'run-online-config' to run from configuration stored in OCDB HLT/Calib/OnlineConfig (Lars)

schedule registration of configuration if handler is inactive, and register when activated again (Lars)

Changing range on PbPb histograms

code cleaning and addition Michael Knichel and Jacek Otwinowski

helper function to read track data block from file and fill into TClonesArray