add Muon trigger efficiency map task (D. Stocco)

Redundant print removed

- savannah #58643: Notify run change in analysis task
- savannah #57751  Provide interface in AliAnalysisTaskSE to retrieve list of histograms

Initialize all pointers in ctor.

Use bright color-set by default -- request by Jurgen.

Settings for Pythia6 with Tune D6T added.

Treatment of default recoparameters is corrected.

Access to TRD/Calib/DCS for number of time bins and filter type

Small fixes

Added AliTender::AddSupply(AliTenderSupply *supply). Fixed destructor.

update sys. uncertainty estimate

updated plotting macros

- fixing compilation warnings

Changed to new output format for the trains and added extra protection for the cases when one do not have MC information.

New task for ITS tracking check

New task for ITS tracking check

Remove access to ESDfriends

Fixes to the raw-data reco. 1. Possibility to select the max adc search window. 2. Possibility to sum up the total charge from neighbour charge. 3. Removal of direct access to the GRP. Using AliRunInfo instead. 4. Removal of MIP/2 cut on adc charge. Instead using N sigma pedestal cut. 1,2 and 4 can be steered with value stored in the reco-param.

Accounted different btw. online and offline module numbering

- added necessary histograms for the drift velocity calibration (Dag)
- implemented the "inverse" calibration on the seeds and the new way of accessing the magnetic field in HLT components
- cleanup of misplaced function calls

Macro to check laser values from DA

Improving documentation and macros.
Fixing up svn Id log tags.
Removing obsolete files.

--- Access to bad channel map implemented in reconstruction chain.
-A first method to calculate the distance from a cluster to closest bad channel implemented.
Output kept in AliESDCaloClusters::GetDistanceToBadChannel
-Ideal map (no dead channels) committed to OCDB/EMCAL/Calib/Pedestals
Example macro to create a bad channel map to be put in OCDB is in EMCAL/macros/PedestalDB

Initializations of arrays

C0HWU TRD trigger added to the list of cosmic triggers. Agreed with Federico A.

Removing warning related to the output connections to the analysis manager and  in order to allow AODs as input (Roberta)

TRD supply for tender (A. Bercuci)

Fixing warnings (Diego)

Introducing new Status - OCDBError in case the OCDB is not
accessible.

Renamed output file to Vertex.Performance.root

* visscan_init.C
  Load kine_tracks.C, primary_vertex.C and esd_tracks.C in compiled mode.

  Disable esd_spd_tracklets() by default -- it crashes on older data
  as it seems that AliMultiplicity got changed in non
  backward-compatible way.

* kine_tracks.C
* primary_vertex.C
  Support running in compiled mode.

* esd_tracks.C
  Support running in compiled mode again.

kPyMbDefault back to what it was.

Move MultiView.C into EveBase class AliEveMultiView.

Comment-out Paint() also in the header file.

filter like-sign V0s and min number of cluster selection (H.Ricaud)

Fixing (?) the HV display

Changes required in QA for the amoreQAshifter agent; change units of titles from MeV to GeV; Change range of ESD histograms

Updated macro

change library set needed to run the task

Bug fix for https://savannah.cern.ch/bugs/?58205, output data block types and extra documentation.

update coordinate transformation from chamber coordinates to global
coordinates for digits

Added setter for SDD AM sampling

reverted a Fatal to Error to not block the trunk (savannah 58547)

Fixing memory leak (Rossella)

switched from treating all layers independently to a gegenral
training for all layers. A first look at the performance shows that it
seems to be ok (AlexW)

updated plotting macros

Write output in folders of the common output file

putting back the old definition of Run
int Run(Int_t iNofEvents=1, int bStop=1)
because there have been problems on mac with the 64 bit variable and its default variable in the extended argument list
int Run(Int_t iNofEvents=1, int bStop=1, AliHLTUInt64_t trgMask=0);

The old function now forwards to the new function with 0 for the trigger mask. The function is defined without default arguments.

halloWorld.sh                     - print the system information
submitCalib.sh submitCalibJob.sh  - submit jobs described in the workspace

makeWorkspace.sh                  - warning removal
filterCorrupted.sh                - job submission only for non empty lists

(Marian)

New task for primary vertex analysis

Increasing class versions.

SPD trackelts were too thick.

fixing a memory leak

* esd_tracks.C
  Add function esd_tracks_by_anal_cuts(). It takes cuts created by
  PWG0/CreateStandardCuts.C and puts tracks into two categories:
  accepted / rejected.
  Remove global g_esd_tracks_by_category_container -- no longer used
  for track counting.

* visscan_init.C
  Add AliEveMacro for esd_tracks_by_anal_cuts().

* alieve_main.cxx
  Use projectable-compound selection mode.
  Unmap main EVE window before entering TEveManager::Terminate().

* anyscan_init.C
  Removed obsolete macro.

Adding a simple checker to the FMD as well as rearranging the raw histos

adding terminate function

Taking into account the time information of the hit in the digitization
- done in AliMUONSDigitizerV2, still to be done in AliMUONDigitizerV3.
(Mercedes)

added verbosity in a Fatal call

Comments for Doxygen

Remove obsolete macro

Update of V0A geometry provided by Lizardo

Setting also MC info to CF manager

ignoring runs with start == endtime

* AliEveTrack
  Rename ImportClusters() to ImportClustersFromLabel().

* AliEveTrackCounter
  Also save all three primary vertices.

* make_scan_results.C
  Processes also primary vertices.
  Delete objects read from file.

* MultiView.C
  Add function SetDepth() that sets current-depth of both projection
  managers.

* visscan_init.C
  Set projection z-depth to -10 before importing geometry, then set it
  back to 0.

* clusters_from_index.C
  Project clusters if gMultiView is defined.
  Increase marker size to 2cm.
  Remove solaris cint hack.

using one single par file for all aliroot versions

Update in the task setting (Mariella)

Update in the analysis code (Mariella)

Update in the analysis code (Mariella)

Update in the analysis code (Mariella)

Update in the analysis code (Mariella)

removed obsolete setters

Add RawFitterv3 based on FastFitting algorithm

Raw fitter based on FastFitting algorithm

Updates from Mikolaj, requested by TPC

Connection to tree in Notify() seems to be safer.

Histograms fills by the current run data only; nothing is reading from the previous.

Update and addition of LS analysis (Renu, Giacomo, Francesco)

New file to configure TOF preprocessor for NOISE runs:
Threshold now set to 1000.

1) Cut on min. amplitude (>10 ADC) in High and Low gain introduced;
2) Time range reduced.

Fix for the Savannah bug #58478 (A. Dainese)

making InitESD public

Taking into account that only 1 or 2 values may be present for the
DPs --> storing only the information available.

rename file

rename file

bugfix: skip file name prefix if concatenating events
https://savannah.cern.ch/bugs/?58454

fix for using phi weights

Updated ideal OCDB entry for DCS part

Updated ideal OCDB entry for DCS part

added new spectrum task including FF and with using PWG4 unfolding, just THNsparse to be plugged into corrfw or AliUnfolding

added new spectrum task including FF and with using PWG4 unfolding, just THNsparse to be plugged into corrfw or AliUnfolding

major changes to the ppr plotting macros

Fixing bug related to incorrect unloading of shared library and class code.
This is related to:
https://savannah.cern.ch/bugs/?58083
https://savannah.cern.ch/bugs/?58247
In actual fact this is a workaround for the bug/feature/limitation (whatever you want to call it) in ROOT/CINT that removes more libraries than just the one that was
requested to be removed. The problem has been solved by adding more protection to prevent the segfault, printing of appropriate warnings and cleaning up HLT components in
the correct order to prevent the problem in the first place.

Defining 5 output slots in the constructor (Matthieu)

New PHOS mapping is uploaded:
modifications are in FEE card position within RCU.

Bug fix - Not visible withour gcc
(Jens Wiechula)

- first sketch of friend tracks implementation in the HLT-TPC calibration class for the drift velocity

Modifying processing of Pressure sensors:
- if (fit || graph) --> ok
- else --> error
(following discussion with Haavard - see bug 58331)

Resolved problems with merging
2 classes missing in previous commit
(Marian)

Adding alarms and graphical representation of alarms
(Jens)
AliTPCcalibDB.cxx.diff Add loading of dataQA, adopt creation of GUI tree
AliTPCcalibDB.h.diff Add loading of dataQA, adopt creation of GUI tree
AliTPCcalibDButil.cxx.diff Add loading of reference data, creation of reference GUI tree
AliTPCcalibDButil.h.diff Add loading of reference data, creation of reference GUI tree
AliTPCCalibViewerGUI.h.diff Add getters to handle custom draw strings
AliTPCCalibViewerGUItime.cxx.diff Add getters to handle custom draw stings. Code cleanup.
AliTPCCalibViewerGUItime.h.diff Adopt gui tree / reference tree creation / loading
AliTPCMonitor.cxx.diff For root raw files add possibility to navigate to a certain event in the file
libTPCbase.pkg.diff Add AliTPCCalibQAChecker, AliTPCCalibViewerGUIAlarms
TPCbaseLinkDef.h.diff Add AliTPCCalibQAChecker, AliTPCCalibViewerGUIAlarms
AliTPCCalibQAChecker.cxx New class for calib data checking, mostly based on tree draw, but also histograms, graphs, numbers
AliTPCCalibQAChecker.h New class for calib data checking, mostly based on tree draw, but also histograms, graphs, numbers
AliTPCCalibViewerGUIAlarms.cxx New class. GUI interface for calibration alarms. Will be used in AMORE and offline.
AliTPCCalibViewerGUIAlarms.h New class. GUI interface for calibration alarms. Will be used in AMORE and offline.

bugfix: moving call to AliTPCcalibDB::SetExBField to DoInit() It was not executed any more, causing a seg fault in the ExB correction