Removing -Wno-long-double and adding -single_module to the compilation options (macosx)

package file and LinkDef adapted to new added class

New class for customizing PID weights in ESD reading

Added tutorials

New version of MUONTRKda:
Besides the usual "raw data" reading (on line), DA  is now able to read
a collection of "root data" files (off line)
(Jean-Luc)

bug fix - added missing links to classes

Overlap corrected

Module dependent SDD Time Zero in AliITSresponseSDD, needed for proper reconstruction of real data (F. Prino)

added qcumulants to macro and removed old macros

From Christoph: Follw up to a change in the TRD digits structures.

Introduce new digits structures by Hermes with ZS in digitzer stage

All known overlaps removed (M. Sitta)

Adding interface for Run info
Old data strored as TMap (Marian)

improve tracklet-MC matching diagnostics

fix for the cumulants to use cuts from the CORRFW

New version which dumps into a list instead of a TObjArray

changed return type of StoreAlignObjToFile methods

including AliSurveyToAlignObjs class in .pkg and LinkDef files

modification of style in the reference histograms- task ready for
production

Added a new component (AliHLTTPCHWCFDataReverterComponent) which reads the data, sorts it, and revert the 40 bit word data.
Moved around the functions of the AliHLTTPCClusterFinder so the ones belonging to the ClusterFinderDecoder is at the top of the files, and the ClusterFinderPacked functions on the bottom.
Also changed from fMaxQ to fQMax in the AliHLTSpacePointData.h so that we only have one name convention for max charge of a cluster. This led to changes in KryptonClusterfinder, *Cluster*, Noise map, TrackHistoComponent.
In AliHLTAltroEncoder; added the functionality to revert 40 bit words.

fix missing initialization of reconstructor for tracks in HLT (Kostya)

Possibility to apply an event selection based on a logical function of the trigger classes. The syntax is ?Trigger=<function>, where function is a logical expression of the trigger classes identified by their names (as in the trigger config in OCDB). In case the trigger config is unavailable, one can still use the method by replacing the trigger classes names by [i], where i is the index of the trigger class in the trigger pattern word.

Do not read the CTP raw data payload in case CTP is not among the active detectors

Possibility to apply an event selection based on a logical function of the trigger classes. The syntax is ?Trigger=<function>, where function is a logical expression of the trigger classes identified by their names (as in the trigger config in OCDB). In case the trigger config is unavailable, one can still use the method by replacing the trigger classes names by [i], where i is the index of the trigger class in the trigger pattern word.

cleanup print statements

fix wrong container interogation

cleanup empty lines and updated Cmake file

added new function to dictionary

new methods and possiility to run all methods in same run

Macro to calculate tracking performance for cosmic runs (Marian)

Fix for out-of-source builds

Adding missing file

the compiler did not like what was there before

removed the gcc4.3 warnings

Improved version of the SPD services:
- the cable length is properly taken into account with respect to the SPD cone
length (i.e. the extender end lies at the cone's border as can be seens in
the photos)
- the cables and tubes are now parallel to the cone (they used to be, then
they were slightly inclined to solve a previous overlap)
- the cables and tubes are now quite in contact (actually very very near)
to the cone surface

Mario Sitta

Histogram numbering offset and total number of histograms as a function of the task (Melinda Siciliano)

Temporary fix to avoid the interference with previous instance of the fitter

base class for conversion of formatted survey files into array of alignment objects

Adding protection in case of not existring temperature map
- Function return 0
(Marian)

AliRsnCut:
- added possibility to cut on ETA for tracks and pairs

AliRsnPairParticle:
- corrected functions for ETA
- corrected bug on function for ANGLE

AliRsnDaughter:
- corrected function fo ETA

A TBits object is used instead of an array of booleans (D. Elia)

No need to link with a library that may not be there -- ditto

No need to link with a library that may not be there

Updating doc (Philippe P.)

Adding kinematic cuts for MC

- AliITSRawStreamSPDErrorLog.cxx, .h
some updates by Henrik basically for using the class in SPDmood

- AliITSRawStreamSPD.cxx, .h
same as above + my addition of the method GetOfflineChipKeyFromOnline()
(SPD chip numbering 0-1199, same definition used in the PlaneEff framework)

- AliITSClusterFinderV2SPD.cxx
it now uses GetOfflineChipKeyFromOnline() to compute the chip key
when filling the FastOr bit map

- AliITSDetTypeRec.cxx, .h
added the SPDFastOr part in GetCalibrationSPD() method

- AliITSFastOrCalibrationSPD.cxx, .h
new class to store in the OCDB the map of FastOrConfigured chips as a
TBits

D. Elia

move output param from track info to esd info

Scripts to run the FMD analysis

Bug fix (Tomasz)

Replace cast to Int_t by TMath::Nint function (Bogdan)

Correct placement of patch panels (M. Sitta)

Removed obsolete raw cluster classes

Changes to be able to access reference data files via Alien, in a similar way as previously with locally stored files (H. Tydesjo)

New version where the number of events is kept in a histogram for merging purposes

Fixing compiler warnings

Correction

Correction

Corrections and update according to the new AliMathBase::TruncatedGaus function

Added treatment of TPC only

New Lors2MarsVect function corrected.

Fix for cmake

Header file that was missing

Protection against invalid particle object

fixed warnings

Updating for cmake

Adapted to changes of RSN package

Code:
 - few improvements done
 - new feature: analysis configuration through external macro passed to analysisTask object

Macros:
 - utility macro to set up analysis to different environments
 - tutorials to learn step by step to use the package

File removed

Fixes of warnings, new features and upgrades

No more Isajet

Correction for cmake

new plots for the PID tasks (ESD PID monitor and threshold) (AlexB AlexW)

More on char constness

Removed empty loop

Check for primary vertex type

Restoring the old name for the priamry vertex reconsructed usibg tracks.

Addition of gaussian truncated at different left and right distances (useful for misalignment)

Files moved to GammaConv directory

Gamma conversion analysis moved to its own subdirectory from PartCorr

Gamma conversion analysis moved to its own subdirectory from PartCorr

Gamma conversion analysis moved to its own subdirectory from PartCorr

Gamma conversion analysis moved to its own subdirectory from PartCorr

More on char* constantness

More on char* constantness

More on char* constantness

More on char* constantness

More on char* constantness

More on char* constantness

Fixes for Pythia

Main changes:
- in MUONTRGda:
- disable decoder warnings
- transfer all configuration files to the File Exchange Server for the very
  first run (when MtgLastCurrent.dat file does not exist)
- allow the DA to change a mask only in the sequence 1->0 but not the reverse
- separate arguments for both thresholds, pedestal and calibration
Also:
- update the READMEmtrda file
(B. Vulpescu)

Correct character constantness

Fix from for producing a dataset via the alien plugin. Redirecting the alien 'find' command to a file via TGrid::Command() does not always work. The file is now produced locally and copied to alien.
(M. Gheata)

registration of AliHLTTPCTrackHistoComponent and AliHLTTPCTrackDumpComponent from TPC agent, deleting global objects (Gaute)

- Remove "connected tracks" (i.e. track sharing at least 1 cluster in station 3,
  4 or 5) at the end of the tracking. This allow to remove almost all the fake
  tracks without affecting the good ones.
- New option in RecoParam (RemoveConnectedTracksInSt12(..)) to extend the
  definition of "connected tracks" to the ones sharing at least 1 cluster in any
  station (including station 1 and 2).
- In AliMUONRecoCheck, build the cluster IDs of the simulated tracks by using
  the Detection Element ID stored into the TrackRef. It is used to check the
  compatibility between TrackRef and reconstructed clusters instead of using
  their z position.
- Change the method AliMUONTrack::CompatibleTrack() to also return the number of
  reconstructed clusters. It gives more information to check the compatibility
   between simulated and reconstructed tracks.

(Philippe P.)

New class for AOD<->MC association

New class for AOD<->MC association

Use TRef functionality to get daughters

Macro to create std AOD + MC

Fixes in the copy constructor and assignment operator (Andrea)

Fix mismatched new/delete