Correct warnings

1. Update to AliESDtrack
- Adding "golden TPC cut" on chi2 between tpc only track constrained
  to the vertex and the global track. The code is an adapted version
  from the implemention provided by the RAA group (Jacek et al).
- The calculated chi2 value is cached to avoid the computing-intensive
  operation several times in train running.
- New function that returns the number of crossed rows and caches it
  (suggestion by Jens W).

2. AliESDtrackCuts has been optimized
- Golden cut added. Therefore the prototype of AcceptTrack needed to
  be changed (backward compatible). One needs to pass the event as well
  when the new cut is to be used.
- CPU intensive cuts are only evaluated when other cuts have
  passed (Nsigma, golden TPC cut).
  NOTE: Control histograms are only filled for those quantities when the other cuts have passed

In case of short runs - take the output file from online DB and not from local folder (suggested by Sylvain).

- changes by Markus Koehler

- histogram ranges for high pT and new varible (TPC found/findlable clusters) added
M    TPC/AliPerformanceDEdx.h
M    TPC/AliPerformanceDEdx.cxx

- histogram ranges for high pT:
M    TPC/AliPerformanceTPC.cxx
M    TPC/AliPerformanceEff.cxx
M    TPC/AliPerformanceDCA.cxx
M    TPC/AliPerformanceMatch.cxx
M    TPC/AliPerformanceMC.cxx
M    TPC/AliPerformanceRes.cxx

using TObjString::String instead of GetString to get directly to reference to TString object and avoid temporary instance in return; takes account for changes in the bookeeping of TString objects in root v5-30

using TObjString::String instead of GetString to get directly to reference to TString object and avoid temporary instance in return; takes account for changes in the bookeeping of TString objects in root v5-30

Add setter for physics selection swicth

Add physics selection in IsEventSelected (Zaida)

Fix for memory leak, read histo ranges from config file (F.Bellini)

Added histograms for dEdx and timing (Ruben)

Protection against negative or null xE

more strong write OCDB protection

 correct fill T0 triggers for all run periods

Pass0 task for any period

coverty fix + dE/dx parameterization dependent on eta

Update tracking syst unc for pp 2010

Fix Coverity warnings

Added histograms for dEdx and timing (Ruben)

Macro and default object for the new Pb-Pb entry.

Coverity Fix (M. Verweij)

fix coverity

The preprocessor is updated in order to store the equalization parameters obtained by the new pb-pb DA.

Move verbose to debug (Javier)

AliITSVertexerZ: disable pileup search with PbPb (F.Prino)

New algorithm for high multiplicity events (trace algorithm besides the existing downscale one)

Add more shower shape long axis histograms for different weights, comment the ones for short axis
QA: add histograms related to energy around cell, for exotic cells studies
Electron: Shower shape weight histograms initialized twice, now corrected

1) More robust invariant mass fit
2) Improved graphical presentation

Add cell rejection based on energy in sorrounding cells, 4 cells in corners with common side, a la CMS, if too low energy, and not noisy by time cut, reject cell before clusterizing, candidate of spike/exotic cell

Move parts of code in UserExec to independendt methods, to improve readability.
Order methods in source code in alphabetical order.

Coverity fix

First fix for the exb calibration.

DQM histograms fixed

DA output for test shuttle.

include also negative pT for the jet spectrum

memory leak https://savannah.cern.ch/bugs/?87435 fixed

reverting 52148, cleanup must be moved to base class

fixing memory leak https://savannah.cern.ch/bugs/?87435

correcting minor compilation warning

Bug fix (Julian)

Add Kinematics reader

Change one info msg

Remove SetNumberOfEventsPerFile which is a priori no longer needed

Do not apply the bunch offset, this is dealt with in the time recalibration map provided for the different passes/periods

Improved graphical presentation

update to monitor macros

Added more functions and fixed blast wave

pid updates

- Removed small bug (otherwise chargeVector was not filled for normal data)
- Added Additional track cuts (for further systematic studies)
- Consistency between ESD and AOD analysis

memory leak

Updated DA config file + syntax error fix.

Adding a parameter with the min number of phys event required + additional printout about the events stat.

Improved check on PostData, fix of fix to mgr->GetRunFromPath

SDDRP - removed cdb->SetRun, initialize CDB clib objects at the first call of UserExec rather than UserCreateOutputObjects. ITStracking, ImpParRes - added PostData in UserCreateOutputObjects. SPD - no need to load geometry since in the train it is already done by AliTaskCDBconnect (protected via fTest)

Fix for savannah bug report 87728 (Laurent) + fix invalid read found with valgrind (Peter)

Improved version of AliAnalysisManager::GetRunFromAlienPath

setting the histogram file name for the TPC compression monitoring chains

adding publishing of histograms, by default all histograms are sent as separate objects; option '-publishing-mode off/separate/list/array' to switch publishing off or publish everything in a TList/TObjArray; removed the default histogram file name, so nothing is stored in local files unless the option '-histogram-file' is used to configure that feature

adding more monitoring histograms, correcting axis labels (Alberica)

Adding a flag for the shuffling + kinematic cuts for the MC analysis

adding further optimized compression format with additional 15% compression ratio in normal compression mode; correcting rounding errors in track model compression to make it lossless with respect to normal mode

Protection against divission by 0

In vmctest/*/g4Config.C:
Adding the physics selection in the TGeant4 title, so that
it can be retrievable in a user application.

Updating responsible list.

Added lambdas to PID histos

Adding possibility to use PID, + routine updates

Adding additional variable
Import for the debugging of derived functions

Updating + memory leak fix

use cosmics in gain calibration (A. Kalweit)

removing a deprecated consistency check which would cause conficts after introducing more HLT links in AliDAQ in r52071

moving iteration of parameter ids to separate function for better consistency with the calling code, fully backward compatible

Bug fix.
M. Weber

Updated DA config following the commit the DA source file.

Multi-vertexerTracks with clusterization + steering options in GRPRecoParam

more coverity fixes (M. Verweij)

coverity fix (M. Verweij)

Fixed warnings [-Wunused-but-set-variable] from GCC 4.6 -
switching to that will sure cause a lot of people to get
their SVN commit rights revoked :-)

bug 87732: memory leak fixed

Fixed warnings [-Wunused-but-set-variable] from GCC 4.6 -
switching to that will sure cause a lot of people to get
their SVN commit rights revoked :-)

Since the trigger bits are not available in the V0 raw-data header, we replace the trigger selection by a cut on the minimum number of TDC flags present.

revert calculation of Material Budget to previous version (TRD=Si) until
TOF bug 86673 is solved

Update (Andrea)

Remove the factor p/pt from the decaylengthXY calculation (Andrea)

Adding the trigger charge and bits to the ESD and AOD. They will be needed by phys sel, EMCAL analysis and any trigger related studies in pb-pb.

Correct index when filling amplitude histograms, L1 amplitude histograms for gamma and jet L1 added

Correct method combining conversion photons and calorimeter clusters, now fill also shower shape and weight histograms for the clusters under neutral meson peak

protection added

Update needed for the new ocdb SPDSparseDead (Annalisa)

Changed message for the DQM shifter - Reactivated check on uidrec=20.  (Melinda)

Adding the trigger charge and bits to the reco chain. Bumping the qa datamaker class version (because of previous commit). Next is to add these 3 new numbers to the V0 esd and aod.

Removed AliPHOSDigitDecalibrate: Digit decalibration now done in simulation

Removed AliPHOSDigitDecalibrate: Digit decalibration now done in simulation

Adding methods to calculate the number of trigger flags on each side and fill the V0 trigger bits which should be contained in the raw-data header.

Adding the centrality-trigger charge sums. Adding also the corresponding histogram in the qa datamaker. Changing also some qa histo ranges in order to cope with the HI data. More commits to come.

Fix for #86577: AliReconstruction::SlaveTerminate instantiate ALL Reconstructors

Compact TH1F fraction histograms into a single TH2F, coverity fix, cosmetics, add Terminate method

Coverity fixes

Protection added (Levente)

Fix for #87692: Patch request for new HLT links

Preventative fix for ROOT v5-30, which dropped string reference counting.

fix against 0 chi2 (M. Verweij)

empty task to estimate base line of memory and cpu for train testing