options to set markers etc.

Fixed the vertex calculation to use the right sign

Fix to Jan Fiete's bug report

Corrected dipole segmentation bug introduced during AliMagFCheb->AliMagWrapCheb conversion.

small fix

new equations for differntail flow

reorganized a bit

Additional protection (macosx with gfortran)

Bug fix: enlarged array size, corrected initialization (linuxia64gcc)

clean up so code is less verbose for each event

Updated to new argument system, added the functionality to find out the number of files to analyze automatically.

overloaded write method

macro and flowevent maker to run part of the code in root

Set of protections and bug fixes

Updated geometry

Code cleanup in AliITSDetTypeRec and vertexers + minor bug fix in AliITSVertexer3D (F. Prino)

TEveJetCone moved to root/eve (piggyback on sync with ROOT trunk).

Add a Reset funcion

Make the JF similar to PYCELL, increase fiducial region

Adding extra options to the hit reconstructor component to better control recovery from data corruption and skipping of data words with detected parity errors.
Fixing logging messages in AliHLTMUONTriggerReconstructor.

file needed for TestFast.C

AliRsnMCInfo:
- added a datamember to store MC first point of track (for MC DCA)
- added all setters/getters related to this
- added a method to "shift" this point by the amount
  of a reference point (primary vertex)

AliRsnDaughter:
- in method "PhiDeg" and "ThetaDeg" call their radiants counterparts
  (they are inline so the compilation will be the same, but is more readable)
- add user-friendly methods to set the "kink" index accordingly
- explicitly added and "Adopt" for a TParticle object, used also for AliMCParticle

AliRsnEvent:
- added the MonteCarlo primary vertex and getters/setters for it
- added a method to correct trach DCA's for primary vertex which will be possible only from here

AliRsnCut:
- added track cut on MC impact parameter
- added track cut on kink daughter/mother
- corrected typo in cut on transverse momentum MC
- added event cut on Vz primary vertex
- added a method to know if the analyzed pair is made of the same tracks (e.g.: pi+pi+ k+k+ etc)
- added a method to know if the object is being used for mixing
- removed all methods which refer to event buffer and event matching search
- removed management of event mixing which is moved to analysis task

AliRsnPair:
- removed option "kTruePairs" (replaced with true pairs cut)
- removed "mixNum" value in constructor (mixing is managed at level of AnalysisTask object)
- removed unused "Init" method
- changed arguments of "ProcessPair" method to two AliRsnEvent (event buffer is not here any longer)
- removed "mixing cut" and everything referring to it

AliRsnReader:
- moved conversion methods from source to AliRsnDaughter here
- added an AliESDtrackCuts data-member for primary cuts (optionally used) and getters/setters for it

AliRsnAnalysisSE:
- added management of event mixing at the level of this object

AliRsnFunction:
- removed weighted filling of histograms
- added possibility to create bins for many variables (separately)

Bug fix (A. Maire)

analysis mode to start the analysis with analysis frame is not -grid- but -local- now

Remove class AliAnaCaloTriggerMC, not needed

1)Terminate() method implemented in the frame. Simple examples on what to do with it put in AliAnaExample and AliAnaPi0
2)New class AliMCAnalysisUtils, extracted method CheckOrigin from AliCaloPID, added some other MC generator utilities
3)Event number can be accessed in the analysis classes with method GetEventNumber
4)AliAnaCaloTrigger derives now from AliAnalysisTaskSE, MC additional information done in AliAnaCaloTriggerMC moved here

Including appropriate header

Corrected the vertex finding for the hits and primaries

Remove dependcies on obsolete data structures

Adding extra protection code to prevent seg-faults when processing online data. (Indra)
Added option to RunChain.C to use the raw reader publisher component rather than just a plain file publisher.

Fixing correctly previous problem

Fix to GetVertex

same modifications as in ppbench

allow to set the number of events throub an env variable

allow to set the number of events throub an env variable

allow to set the number of events throub an env variable

updrated the class version (forgot to do so after changing the QA data members)

updates of the PID reference data calibration (Alex W)
  - training with a pretrained network
  - steering macros

Updated to be in accord with AliFMDInput

Updated to be in accord with AliFMDInput

committed the wrong file previously

creates recraw if not exist

Need to include virtual class

fixed bugs with underflows

Compilation breaking fixing (Artur)

From Ivana: update for cahnges in MUON.

In mapping:
Introduced new methods in AliMpSegmentation class for access
to AliMpSector, AliMpSlat and AliMpTrigger objects,
and replaced code where these objects are accessed via
unsafe casting AliMpVSegmentation with use of these new functions.
(Ivana, Laurent)

added protection in case the QA object list is not initialized

added protection in case the QA object list is not initialized

Clean up

Clean up

Clean up

Clean up

Clean up

enabled QA

Reco parameters were adjusted to make consistent a reconstruction
of simulated digits and simulated raw data

improved the style histograms

Adding the Q dependent resolution picture (Marian)

Fix according to new entry in DAQ logbook.

Adding the possibility to run the analysis in eta-pT or y-pT (better for the corrections)

fixed a memory leak

New Analysis task for association of kine and ESD tracks a la RecoCheck (Artur)

further updates Q cumulants

Update of raw data simulation by WooJin

Cleaning up files, added documentation. Added ntuple for v0s.

Adding the resolution picures (Marian)

Jens changes - common base class for the Raw data calibration

AliTPCCalibCE.cxx.diff          Include usage of base class, add possibility to set peak integration range for COG determination
AliTPCCalibCE.h.diff            Include usage of base class, add possibility to set peak integration range for COG determination
AliTPCCalibPedestal.cxx.diff    Include usage of base class
AliTPCCalibPedestal.h.diff      Include usage of base class
AliTPCCalibPulser.cxx.diff      Include usage of base class, add possibility to set peak integration range for COG determination
AliTPCCalibPulser.h.diff        Include usage of base class, add possibility to set peak integration range for COG determination
AliTPCCalibRawBase.cxx          Base class for raw data processing, to be used in the basic calibration components
AliTPCCalibRawBase.h            Base class for raw data processing, to be used in the basic calibration components
AliTPCcalibLaser.cxx.diff       Added common IROC/OROC linear fit model, added rotation of associated track the laser track ref. frame
libTPCbase.pkg.diff             Added raw data calibration base class
TPCbaseLinkDef.h.diff           Added raw data calibration base class

Adding the description of real data (Marian)

bug fixes Q cumulants for overlapping selections

New EMC ideal calibration with all gains=0.005
and macro to create EMC calibration around 0.005.

If a setof track parameters is created outside the beam pipe, it is transformed to the local coordinate system of the TPC sector that contains the point of creation (A. Bercuci, A. Dainese).

remove dependence on the AliTRDReconstructor from the PID related code
(Markus, Alex)

revome redundant variables

remove dependence on the AliTRDReconstructor from the PID related code
(Markus, Alex)

Calibrate Digits before putting to CaloCells

Produce sample with given amp, delegate ADC2GeV conversion to OCDB

Digits::E measured in ADC counts now

Digits::E measured in ADC counts now

Explicit ALTRO offset subtraction removed

ADC2GeV calibration moved to Clusterizer

Bug fix. Distance from detector to vertex now calculated correctly

Updated surveyed TPC laser tracks (Jens)

pass ESD AOD or whatever to the macro

added more plotting options

Fix size of array declaration, as pointed out by Andrei

use the minimum error point on the tracklet (x ref) also for inward track fit

adding a getter of the QA object from tag file

Restored working AliZDCReconstructor class

Fix coding rule violations

Bugfix, comparison of string -sorted was not correct.

temporary disable unit test of AliRawReaderHLT due to problems with loading libHLTrec.so from the AliRAWHLTManager (dues not occur in AliRoot)

A temporary numerical fix (A. Dainese)

Support collar at FMD2 position.

updated histos for monte carlo info

No more relevant

No more relevant

Bug fix. Filling in chamber ID and detection element ID information correctly for reconstructed hit objects.

changes in AliTRDdigitsManager
- important correction in the destructor
- TObjArrays may contain only one entry if raw data is reconstructed. faster!
- cleaned up code

changes in AliTRDclusterizer
- important correction concering signals[7] in CreateCluster
- some corrections of the padStatus handeling in IsMaximum
- make use of changes in digitsManager
- cleaned up code of IsMaximum
- preparation of the code for upcoming SIMD implementation

changes in AliTRDReconstructor
- make use of changes in digitsManager

Correction to find clusters in high detector occupancy (central Hijing) is introduced.

Adding class for space point (unlinear correction)