Changed default values of cuts

Corrected typos plus other changes needed to run it from alirec.cern.ch.

Added entry in OCDB for gamma conversion trigger

Trigger for gamma conversions. test macros are added soon.

Changed histogram output name.

update for the new location of TRD performance train

use performance train from PWG1

remove performance train from TRD directory. The new location is
PWG1/TRD

New directory for the VMC tests (Ivana, Eva)

Kenneth: New macro to test the vertexer component.

Prototype of the QA analysis mini-train. It uses AliAnalysisTaskCosmic from PWG1/cosmic folder (developed by Andreas)

Changed svn:ignore

update add macros for the PWG1 location

- Method to calculate the track length is added to the AliHLTGlobalBarrelTrack
- Merged TPC tracks are not propagated to the TPC inner radius, but stays at the innermost cluster, in order to get the right track length

Fixes in reconstruction:

1) Define in a single place (AliMUONTrack) the algorithm to be used to associate 2 tracks by comparing the position of their clusters. Update all the classes/macro using that algorithm to find the simulated track corresponding to a given reconstructed one:

AliMUONTrack:
- Change the function IsValid(...) to be able to check the reconstructibility of the track depending on the tracking algorithm
- Change the name of the function CompatibleTrack to FindCompatibleCluster that is actually what the function does
- New function Match(...) to associate, or not, 2 tracks by comparing the position of their clusters (can be used to assign MC labels to reconstructed tracks).

AliMUONRecoCheck:
- Check the track reconstructibility according to given informations about the tracking algorithm (those info can be extracted from RecoParam).
- New function FindCompatibleTrack(...) to find in the given store a track that match the given track. Matching is done by using MC labels or by comparing clusters' position.

All other classes/macros/tasks:
- use these new functionnalities

2) Additional correction:

DecodeRecoCocktail.C:
- correct the algorithm to make it working even if there are ghost tracks
- avoid accessing OCDB when not needed

MUONRecoCheck.C:
- new histograms/graphs to study the momentum resolution as a function of the momentum
- new histograms/graphs to study the cluster resolution at each chamber
- avoid loading magnetic field when not needed

AliMUONTrackLight:
- correct constructor
- avoid using magnetic field when not needed

(Philippe P.)

AliTPCcalibDB.cxx  - Calculate the distance to the closest measurement
AliTPCcalibDButil.h AliTPCcalibDButil.cxx  - graph filtering functions
                                           - calculation of drift velocity CE
CalibMacros/CalibEnv.C                     - dump all drift velocity option

Marian

Adding AliTPCComparisonPID class
(Marian)

Removed obsolete TSelector based class
(Marian)

Warning removal (Marian)

Do not print debug information

Adding Process of the TRD-TPC matching
(Marian)

Adding visualization of the tree aliases
(Jens, Marian)

Warning removal - Shadowed parameters
(Marian)

Running on proof and fitting psiprime resonance (Roberta)

Update AddTaskPartCorr to use MC Kine in analysis is requested, also to print configuration settings; moved some prints to debug

galice.root is not needed

short description of the package from Naomi's presentation

Fixing a compilation warning

Putting the default rec.C for online reco/viz into svn instead of using the one from test/cosmic.

Make the exploded transformations on-demand only

Use the right order of parameters for WriteRejectList and WriteOccupancyMap

add "friendiness" to macro creation wizzard (Ben & Alex)

GPU compilateion update

Fixed naming for different cone size, added new AOD cut (16), added fastkt option

GetOutputData() now used in AliAnalysisTaskUnicor::Terminate (thanks
Mihaela).
Using integers in AliUnicorHN::Fill was leading to trouble (thanks
Matevz, via his valgrind output), now all double.
Two track cuts modified, a monitoring histogram added.
Trigger phi was being overwritten in AliUnicorAnalHighpt, fixed.
Merge method added in AliUnicorAnal so one can run on proof.
Some antiviolence (with respect to coding rules) measures taken.

cleanup

- a patch to be able to load the CUDA library at runtime and only when available.
- cleanup

directory to hold commo tools for flow analysis (e.g. mc glauber)

Changed names of output files

New reconstruction parameters for all event species:
Default, Cosmic, lowMult, highMult

With Magali: improve handling of static data members with frame and palette data.

Fixing bug in AliHLTRunSummary and AliHLTEventSummary, need to have version number in CalssDef non-zero to propagate the objects through an HLT chain properly.
Fixing bug in AliHLTGlobalTriggerComponent to generate correctly trigger menu evaluation logic for trailing operators.
Fixing AliHLTGlobalTriggerWrapper to catch CINT errors correctly.
Fixing bug removing registrations in AliHLTConfiguration.
Adding more documentation.

GPU framework update from David Rohr

Fix needed to correct compilation warning

output data type was not properly set

Make copy of temperature array before adding to CE array

protection for module number against crash in QAMaker

Suppressed setting the Bfield to NULL in the post-reconstruction cleanup.

Atlas Tune MC09 added.

* AliEveEMCALSModule
  - Remove palette management that was cut-n-pasted from TPC code and
    was not used in EMCAL code at all.
  - Comment out manual destruction of (shared!) reference counted objects.
    This needs to be improved further as static objects seem to be used
    in a wrong way.

* AliEveEMCALData
  - Reduce debug output, set debug to 0 by default.
  - Do not delete AliEMCAL object - it is deleted by run-loader.

ESD friend is deleted together with ESD tree - do not deleti it directly in Close().

From Magali: small modifications.

Build reco and log dir if needed

missing file

Adding config for acr caf

activating initialization of Streamer Info from the OCDB

Reverting previous change

move production scripts out of test

move production scripts out of test

segmentation fault in daq machine is fixed

Obsolete macros

Obsolete macros

Obsolete macros

Obsolete macros

correct initialization warnings (fca)

updae of the GPU framework

Use of .so libs instead than .dylib

Bug fix.

The ratio filled in the opposite way - Max and Tot exchanged.

(Marian)

data transport between the tracker and the merger is optimized

one more change (from P.Ganoti pganoti@phys.uoa.gr)

mrst pdfs restored.

- Signature if CompVtx changed
- direct comparison of floatwith 0. corrected.
Romita Rossella

TOF/AliTOFDigitMap.h -- make enum {kMaxDigitsPerPad = 10 }; public as this constant also needs to be known in EVE. EVE/EveDet/AliEveTOFDigitsInfo.cxx -- use kMaxDigitsPerPad instead of hard-coded value 3 (which was wrong after a change to 10 in liTOFDigitMap) (Matevz)

Fixing doxygen warnings

change of a range of a histogram

Updating doc

change a default cut

Pi0 histogram range changed

Pi0 finder added

hard-coded cuts are moved to the parameter set

final plotting macros

Add protection for missing pressure sensors

changes related to PWG1 train and small cleaning (A. Bercuci)

vertex finder moved from GlobalESDConverter to a separate component GlobalVertexer
It has to be called after the ESD converter
The component produces primary vertex histograms

fix compilation

fix BxByBz - testing

better ESD performance plot

fix compilation mismatches in the new framework

Process kPyMbAtlasTuneMC09 added

Fix in LoadCTPTimeParamsCDB() (Plamen)

QA for shifters revisited - Custom object removed

Changed logging level

Init event before deleting it !

Add example of how to assign lines to a module.

Oups. We probably do not want the memory leak checks part of the production version

Fixing a serious memory leak

Limited printout

Extended the set of deltaAOD jets and added general SISCONE config

copy TRD performance train to PWG1

Release the error coming from HLT