uncertainties back in, incase of weights still behaving funny

typo in comment

Some unuseful print commented

New class derived from AliMisAligner (Raffaele)

ptharmax added.

Removed compilation warnings

With Cesar.

Create arrows as TEveArrow elements so that it is easier to manipulate
track and jet objects independently.

improved plotting options

upgraded the version number

Update for new AliQAManager (Yves)

Update for new AliQAManager (Yves)

Replace QADataMakerSteer by QAManager deriving from CDBManager

Replace QADataMakerSteer by QAManager deriving from CDBManager

Replace QADataMakerSteer by QAManager deriving from CDBManager

Replace QADataMakerSteer by QAManager deriving from CDBManager

Replace QADataMakerSteer by QAManager deriving from CDBManager

Replace QADataMakerSteer by QAManager deriving from CDBManager

a few more checks

break when there is no input file for second run

break when second run file for LYZ is not available

overloaded WriteHistograms

* EveBase/AliEveTrack
---------------------
New class, sub-class of TEveTrack.
All macro-calling functions were removed from TEveTrack and moved into
this class (as they were ALICE specific anyway):
   void ImportHits();
   void ImportClusters();
   void ImportClustersFromIndex();
   void ImportKine();
   void ImportKineWithArgs(.....);
   void PrintKineStack();

This will allow to:
1. simplify initialization;
2. make it easier to extend the functionality.

All changes in other files are replacements of TEveTrack with
AliEveTrack.

* macros/anyscan_init.C
-----------------------
Add a deprecation warning.

Better values for the constants defining the numerical precision.

Printing a warning, if the Rotate(...) function fails.

weights for GFC (preliminary)

synchronized with ppbench

added new location of QAref

POI's and RP's for LeeYang Zeroes eventplane

Populating QA reference data (Yves)

Base class (AliMisaligner); each detector will provide its derived class,
AliDETMisaligner, substituting the macros MakeDET<Zero,Res,Full>MisAlignment.C

AliZDCMisaligner and others will soon be committed and can be used as examples.

This will allow to have a common set of methods to produce alignment objects
without repeating several things as it is done presently in the detectors' macros.

New macro (MakeAlignmentObjs.C) for producing simulated alignment objects
for all detectors or a subset of them, for the three misalignment scenarios
(ideal, residual, full). When all detectors have substituted their macros
MakeDET<Zero,Res,Full>MisAlignment.C into the derived class AliDETMisAligner,
this macro will substitute the three current macros MakeAllDETs<Zero,Res,Full>MisAlignment.

Base class (AliMisaligner); each detector will provide its derived class,
AliDETMisaligner, substituting the macros MakeDET<Zero,Res,Full>MisAlignment.C

AliZDCMisaligner and others will soon be committed and can be used as examples.

This will allow to have a common set of methods to produce alignment objects
without repeating several things as it is done presently in the detectors' macros.

New macro (MakeAlignmentObjs.C) for producing simulated alignment objects
for all detectors or a subset of them, for the three misalignment scenarios
(ideal, residual, full). When all detectors have substituted their macros
MakeDET<Zero,Res,Full>MisAlignment.C into the derived class AliDETMisAligner,
this macro will substitute the three current macros MakeAllDETs<Zero,Res,Full>MisAlignment.

Fix bug in pileup tagging (F. Prino)

preparations for weights in generating function cumulants

New directories for storing of QA reference data (requested by Yves)

prepare moving to 8 dEdx slices per chamber in ESD by default
improve enumeration names

Fix in the indices of tracks associated with CaloClusters.

Adding more comments (Javier)

- Add the possibility to set different noise in bending and non-bending plane
- Add the possibility to remove a given fraction of manus
(Philippe Pillot)

Move temporary histograms to the list of saved histograms for merging (Philippe Pillot)

new NN PID DB after reconstruction update (AlexW)

Changed vacuum density to avoid problems with fluka.

new plot for number of tracklets/track depending on momentum and
particle species (Markus)

Batch analysis on the grid without the tags enabled

better defaults

forgot .root

protection against divide by zero

POI's and RPs in LeeYangZeroes

In MUONTRKda.cxx:
Removing setting of an environment variable which is not used anymore
(Guillaume)

Complete the previous commit (Rossella)

added the option to use functions as weights

In trigger:
Main changes:
- Fix bug in AliMUONRawWriter::WriteTriggerDDL for filling the regional header
with local output in the raw data produced by the simulations
- AliMUONGlobalTriggerBoard apply bit inversion (according to the hardware
documentation) from the regional output to the global input, in order to have
the correct application of the global input masks
Also:
- AliMUONGlobalTriggerBoard change/correct the name of the MaskGlobalInput()
function
(Bogdan V.)

modified macro to enable running in three modes: mLocal mLocalPAR and mLocalSource

weights correctly implemented for FQD

correct for the reconstruction of raw

correct for the reconstruction of raw

In mapping:
Adding AliMpFastSegmentation class, missing in previous commit (r31109)

In mapping/macros:
Make testExistingPads.C, testExistingPads2.C macros working again
and added AliMpFastSegmentation in test.

In mapping:
- One more change to optimize timing performances of the mapping:
  adding a new AliMpFastSegmentation class to speed up the (Has)PadByIndices
  and PadByLocation methods.
- Fix in AliMpSectorSegmentation::Position() - do not return sector
  position as it has a different meaning
(Laurent)

Fix for error: comma at end of enumerator list

last modification of the task before going into production
  - exclude kink daughters from efficiency plot
  - exclude ITS stand alone tracks
  - large definition of the TRDin flag

1)AliAODParticleCorrelation.h: Data member fIsolation changed from float to bool
2)AliCaloTrackMCReader: Possibility to keep the pi0 instead of the photon decay, in case of overlapping in calorimeters
3)AliAnaPi0EbE: In case of shower shape selection of pi0, it was selecting clusters id as photon not pi0. Added init method to check if calorimeter information is read.

New class for computing corrections as a function of several variables (Chiara)

D0->Kpipipi analysis included (Rossella)

Bug fix

Set a specific storage to keep having the FMD background and energy distribution objects in FMD/Correction. This solution works fine but is to be replaced by whatever system core offline invents to import objects from outside in the analysis

Bug fix in GetArb8. Code cleanup. (M. van Leeuwen)

Changes needed to accommodate FMD in its due position without generating overlaps. The reported problem on malformed TGeoXtru volumes defined in these classes is not yet fixed (M. Sitta)

pi0 decay switched on by default.

Disable kink extraction, TEveRecKink is being updated in ROOT trunk.

With Cesar: plot phi from 0->2pi. First step towards using TEveArrow for jet and track representation.

Load stack of particles from a TObjArray (Y. Schutz)

using weights for Q cumulants 2nd order

- add output graphs for efficiency
- update train to cope with running only ESD task (fast check)

New macro to keep track of timing performances of the segmentation methods (Laurent)

the original was modified by fca so no need for a separate one for trunk anymore

Error codes for histogram booking taken with getters, no longer hard coded (D. Elia)

method same name as macro

Added the new class

Completion of previous checkin

First steps toward separate Task to fill the flow event

new task to check TRD tracking performances at ESD-MC (only) level.
  - No friend information is used
  - analysis based on ESD reconstruction bit map

Consolidating method name (Laurent)

A modification was recently introduced in ANALYSIS trunk that automatically creates input and output containers when connecting and input/output event handlers to the analysis manager. Users using the trunk should not create these containers themselves like:

cin = mgr->CreateContainer("cInput", TChain::Class(), AliAnalysisManager::kInputContainer);
mgr->ConnectInput(myTask, 0, cin);

But rather:

mgr->ConnectInput(myTask, 0, mgr->GetCommonInputContainer());

The same applies for the common output AOD container. The reason for this is that user tasks will be able to connect to an analysis manager and data containers created in a different steering macro (train).

- Adding new methods to AliMpVSegmentation which can speed up things here
  and there:
    HasPadByIndices,
    HasPadByLocation,
    GetNofElectronicsCards,
    Position,
    HasMotifPosition
    MotifPosition,
- Change AliMpMotifType implementation to speed up the search by location.
(Laurent)

- Common input/output containers are retrieved from the manager

Updated event embedding test suite (Adam)

- Common input/output containers are retrieved from the manager

In MUONTRKda:
Send .ped and .par file data to the AMORE database if AMORE is installed.
Methods WritePedHeader, WritePedData, WriteGainHeader and WriteGainData
have been added.
(Guillaume)

New way to set input and output containers for AliAnalysisManager

Bug fix in the AliTPCReconstructor.

The ExB field map is not correctly initialized in Reconstruction

The bug was introduced moving the  TGeoGlobalMagField implementation.
The field was not correctly set in the AliTPCReconstructor

Marian

In AliMUONQADataMakerRec:
 - Added scaler time in QA and plot hit rates instead of integrated
   number of hits
In AliMUONRawWriter:
 - Fix bug in (dummy) scaler event generation during raw data writing
   in simulations
(Diego)

Correcting coding violations.
(Artur)

Conserve the container axis ranges in Projection

Changes to obey code conventions

tempory macro to work in trunk with new methods to connect to input container

Temporary FMD analysis calib parameters

Using the correct prototype for SetQA method

Fix some coding convention violations.

Read Altro configuration from DCS FXS

Remove old digits data structures