Update (Andrea)

Remove the factor p/pt from the decaylengthXY calculation (Andrea)

Adding the trigger charge and bits to the ESD and AOD. They will be needed by phys sel, EMCAL analysis and any trigger related studies in pb-pb.

Correct index when filling amplitude histograms, L1 amplitude histograms for gamma and jet L1 added

Correct method combining conversion photons and calorimeter clusters, now fill also shower shape and weight histograms for the clusters under neutral meson peak

protection added

Update needed for the new ocdb SPDSparseDead (Annalisa)

Changed message for the DQM shifter - Reactivated check on uidrec=20.  (Melinda)

Adding the trigger charge and bits to the reco chain. Bumping the qa datamaker class version (because of previous commit). Next is to add these 3 new numbers to the V0 esd and aod.

Removed AliPHOSDigitDecalibrate: Digit decalibration now done in simulation

Removed AliPHOSDigitDecalibrate: Digit decalibration now done in simulation

Adding methods to calculate the number of trigger flags on each side and fill the V0 trigger bits which should be contained in the raw-data header.

Adding the centrality-trigger charge sums. Adding also the corresponding histogram in the qa datamaker. Changing also some qa histo ranges in order to cope with the HI data. More commits to come.

Fix for #86577: AliReconstruction::SlaveTerminate instantiate ALL Reconstructors

Compact TH1F fraction histograms into a single TH2F, coverity fix, cosmetics, add Terminate method

Coverity fixes

Protection added (Levente)

Fix for #87692: Patch request for new HLT links

Preventative fix for ROOT v5-30, which dropped string reference counting.

fix against 0 chi2 (M. Verweij)

empty task to estimate base line of memory and cpu for train testing

Changes needed for new HLT output DDLs.

Update for the status code related to the task #23161

Change of module numbers for display purposes

Fix for #76933: Fix access operator

TrackQA: included QA for golden chi2 + chi2 between global and global constrained track
Spectra: Added NClustersIter1 to the correction framework container. Only 6 bins in Ncls (0 70 80 90 100 120) to minimize memory usage. Efficiency can now be easily calculated for different cut values (M. Verweij)

Updated LambdaC analysis task: 1) Use AliPIDResponse instead of AliAODpidUtil x PID infos, 2)PID contamination histos: changed filling schema, 3) added 2 TList of histos (x multiplicity and priors studies) (Annalisa)

Add approximate estimation of the trigger pt-cut as a function of the run number (Diego)

Complete the set of correction steps, available for ESD and AODs. Histos which are not needed anymore were removed.

Code clean-up (Massimo)

Fix for #79704: G__exception in LHC10h pass 2

MCEventHandler derives from InputEventHandler
M. Vala

propagating patches from the online system

- initialization of AliTPCcalibDB
  patch https://savannah.cern.ch/patch/?5039#comment3
  bug https://savannah.cern.ch/bugs/?86155

- eliminating debug messages and correcting data oigin
  patch https://savannah.cern.ch/patch/?5039#comment4

Modifications required for marking that the 'Original Data Present' bit should be set in the CDH.

Fixes for #86279 Improper usage of TClonesArrays in MUON

speedup of track model compression by another factor 2

First implementation of EMCAL trigger QA from Nicola Arbor

Fix for the naming of DA's

Chambers occupancy stored in the ESDs, it has been packed with the reconstructed Cherenkov angle value. All the parts of code affected by the change have been accordingly modified

Fix for #87488 Commit + port request. New methods in AliStrLine

Disable use of HLT one pad clusters for tracking

Configuration file for the new pb-pb DA.

Bug fix.

changing default configuration to -deflater-mode 2 -mode 1

adding protection for invalid array index

added Print functions

correcting thresholds for cluster verification; typo in error message fixed

re-defining the TPC-compression chain to send also the HW clusters for easy qa in the reconstruction via an HLTOUT handler; drafting the handler

speeding up the loop over track clusters; masking a false error message

add macro to set HLTUsage

Global re-calibration added, Nonlinearity _on_ by default

Pass min E cut to unfolding class

Update the output file only in case minimum number of physics events is reached. Otherwise the results accumulated from previous runs.

Adding liblzma.a

Fixing coverity defects: 17612, 17611

Decalibration restored (was erroneously deleted in a previous commit).

SentNSysInfo propagated to the generated test

improved handleing of HLT input

In case of unfolding, the splitted energy of the shared cells must not be lower than threshold used in normal cells, in such case, do not split the cell and put it in cluster with more energy, from Adam

In case of recalibrating all cells, check not only the energy recalibration flag but also the time recalibration flag

Add possibility to apply non-linearity to cells

Pass the name of the MC model (Geant3, Geant4, Fluka), and title (G4 Physics list) to the geometry to set accordingly the sampling fraction. First approximate values for the sampling fraction in G4 based on recent grid G4 simulations

Fix number of events in Add method

Coverity fixes in QA and Pi0EbE
Pi0EbE: Add time per selected cluster and ncells per selected cluster histogram, remove diff time vs asymmetry histogram; Simplify code filling shower shape histograms, move to method
Electron: Add time histogram

Updates (Michael Weber)

removing unused code to correct compilation warning

adding histogram to monitor the number of failed cluster verifications; bugfix: correcting the sigmaY/Z^2 histograms by taking pad width and time pitch into account

better assignment of remaining clusters to tracks; minor bugfix in the calculation of the compression ratio: in verification mode the cluster id blocks had been wrongly taken into account

sorting the raw trackpoints in the array to be better consistent with loop over padrows, the unordered sequence caused in rare circumstances decoding errors due to misidentification of trackpoint ids with rows; adding fatal error message if pad or time of an associate cluster exceeds the range for the compressed format

recover the SM number, removed by mistake

Add histograms to study shower shape changes when modifying weight parameter for selected electrons or decay photons

Major refactoring of the class, many parts of the code moved to different methods, to make the code more readable
Methods to study logaritmic weight added

Reader: Add possibility to recalculate TOF of clusters after recalibration; CaloUtils: Add access methods to set eta-phi cuts for EMCAL track matching

forgotten lines in the member initialization list (thanks to Cvetan for noticing)

Fixes for the FMD train

Correction of additional compilation errors from the first compilation trial.

Correction of compilation errors from the first compilation trial.

Initial version of channel equalization DA for Pb-Pb data.

Macros to process the output of the PWG1 QA train for PHOS

added macro to read online readout information

update to TOF cpass0 task: provide monitoring information

update to macro to read online histos

update to macro to check active channels

added method to draw correlation graphs

Added analysis task for effiency studies (original by Veronica Canoa Roman). Now, different track types can be tested (global, TPC, ITS). It can be used to study nuclei and anti-nuclei transport, too.

Install scripts when ALIROOT does not point to sources

Make sure PWG2/FORWARD/analysis2 is in the macro path

bugfix: flags and running mode for HLTOUTComponent to run only one chain and write both digits and raw data with selected hltout-mode option

Using the AliHLTTPCDataCompressionDecoder in the offline cluster access through
a container class for TClonesArrays of AliTPCclusterMI.

The access interface AliHLTTPCClusterAccessHLTOUT::Execute propagates the
following return values in the optional 3rd parameter:
 * - >=0 success, number of clusters
 * - -ENODATA  no data in HLTOUT
 * - -EINVAL   invalid parameter/argument
 * - -ENOMEM   memory allocation failed
 * - -EACCESS  no access to HLTOUT
 * - -NODEV    internal error, can not get AliHLTSystem
 * - -ENOBUFS  internal error, can not get cluster array

AliHLTTPCDataCompressionComponent now forwards the cluster MC labels unchanged
since the mapping is done in the decoding.

Correcting the calculation of the compression factor, which was affected by the
additional cluster id data blocks.

Fixing mail configuration for DQM system.

add trigger monitor plot (infoGen)
fix range for monitoring Dpt/pt (resolution)

Selecting the offline V0s only.

enable keyword substitution

bugfix: corrected calculation of slice and partition from track point Id

adding const to function declaration

using AliCDBConnect task in test train of TRD

fix constantness definition for all compilers

remove unused data member fTimeList

bugfix

sort digits and track match updates