Corrected treatment of signals with multiple banches

Border between central and intermediate TOF modules: correction

Correction of TOF strip positioning in a SM

New plots concerning RAWS for the DQM shifter (D. Elia)

printout removed

add histograms for pi0 analysis, both clusters in same module

Added more pt histos

Update of the HLT SPD vertexer:

- the quality is improved
- histograms are removed from the component
- extra steering parameters added

The algorithm was tested on 1000 pp mc with a displaced ( 0.2, 0.2, 0.0 ) vertex.
The resolutions are:  X (-10 um mean, 260 um sigma ) Y ( 1um mean, 250 um sigma), Z ( 2 um mean, 170 um sigma )
The speed is 3500 Hz.

M    ITS/AliHLTITSVertexerSPDComponent.h
M    ITS/AliHLTITSVertexerSPDComponent.cxx

Update macro, many more plots (D. Caffarri)

correct also the eta position in A side

Adding the QA plots for real data

Adding AliMUONQAIndices in base

Updated list of classes

Adding svn properties to libMUONmpgraphics.pkg

Updating READMEeve.txt
(Bogdan)

Flag to read only events of type 7

Assigns GRPRecoParam to the Global QADatamaker

Version including the PWG3 muon train.

Fixed bug in the validity range determination.

Add possibility to set bad map channel from file, add example file with map of bad channels for first runs

Change default param settings in class and change default event species from kDefault to kLowMult in ocdb macro and file

Increasing tower index in phi should correspond to increasing phi angle value, this was not happening on C side, corrected here

bugfix: setting the monitoring event command in the EventDoneData only for the triggered events
bug https://savannah.cern.ch/bugs/?60082

Added the possibility to prefix run numbers with a string. Can be used in correlation with run numbers or ranges:
plugin->SetRunPrefix("000");
plugin->SetRunRange(103313, 103350);
Useful for processing reconstructed data.
A fix was added w.r.t to the previous commit

bugfix: using correct kAliHLTVoidDataSpec istead of 0x0 for initialization of data block specification
bug https://savannah.cern.ch/bugs/?60082

From Pawel Debski.

More / better geometries and VizDBs.

Add saving pictures in high resolution (people had problems with it),
saving/loading DataSelection macros and VizDB macros.

Min Et changed for DA

change ranges of some QA histograms

prepare PID LQ ref maker for production
- new class to exchange PID info between tasks (AliTRDpidInfo)
- new exchange data container between checkPID and PIDrefMaker - prepare
  to avoid writing to debug tree (at least for LQ)

adjustments for new PID ref maker LQ

bugfix: propagating parameters correctly to the sub-functions

 adding explicite trigger domain entries for blocks to be
 included in 'domainHLTOUT' in order to avoid wildcards in
 the definition of domain entries

Make OCDB Entry
call of sub  macros.
Marian

In EVE macros:
Adding keywords for Doxygen (in order to get macros linked in
MUON documentation)

Added the possibility to prefix run numbers with a string. Can be used in correlation with run numbers or ranges:
plugin->SetRunPrefix("000");
plugin->SetRunRange(103313, 103350);
Useful for processing reconstructed data.

adding functionality for emulation of TRD clusters and tracks (Theo)

New script added tpcCalibTrain.sh
Minor changes
Ana Marian

code cleanup: remove unused data in HLTTRDTracklet (clusters indexes) (Theo)

change bits according to TObject (Theo)

adding macro for generation of HLT StreamerInfo from raw data payload

Some hick-up with common blocks solved.

ClassDef set to 1

nasty bug fix

correction for a potential problem, says Cvetan

bugfix in the generation of the readout filter blocklist, domain entries of data type id 'any' had been skipped
https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?60082
https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?60083

Technical fix: index out of arrays boundary. Should be checked carefully, the ifx is just a protection and not a rela fix to the problem.

Update QA Calorimeter class with calorimeter correlation plots, add madros

Correct bug in non initialization of amp and time in loops

remove some histos

consider the case on no MC data

added protection

Update task for ITS tracking check and new macro for plots

Corrected SVN Id keayword

A better binning for the new histogramms.

Adding a few more histogramms.

In trigger:
When getting the value of switches in the local board use the proper AliMpLocalBoard enum value rather than the hard-wired number.
(Diego)

Fix for wrong definition of QA detectors list. The parsing of ALL -XXX is done within AliReconstruction code, so it is not need there. To be ported to the release.

In muon-related macros in EVE:
Adding keywords for Doxygen (in order to get macros linked in
MUON documentation)

Adding muon related macros in EVE in documentation

In READMEeve.txt:
Adding instructions for using new EVE event display
(Philippe P.)

Removing the obsolete AliProtonCorrectionTask

Improve trigger track determination: use geometry instead of default z position of chambers.
(Diego)

Remove loading of PWG4 libs (not needed anymore)

update for AliTRDcalibDB::GetNumberOfTimeBinsDCS()

Loading libMinuit

Adding STANDALONE_BC run type.

Updating amanda server for the test setup: using now aldcsamanda.

Add missing includes for macros that get compiled, too.

Add includes missing after cleanup in root.

A couple of major and minor bugs fixed in the SchemaEvolutionComponent
- resolved increasing memory problem, duplicate objects had been added for every event
- argument scan for '-fxs' corrected
- skip classes with version 0 (not designated for storage)
- generating output file with correct run no

Typo corrected

new performance plot for K and p contamination

fix bug in stand alone tracker - ncl/track = 0

update PropagateTo method to PropagateToBxByBz

convert PropagateTo calls to PropagateToBxByBz - need to investigate differences seen in impact parameter about 10% of the time

Fix for possible memory leak

Call TClonesArray::Delete. Removed delete and create of TClonesArray's at every event

remove LASER runs treatment from preprocessor: we need to prepare new procedure for amplitude calibration

fblanco and dsilverm: add methods for finding hot and noisy towers in DA

fblanco and dsilverm: add methods for finding hot and noisy towers in DA

Changes to monitor recpoints with AMORE: setting the event number via AliITSQADataMakerRec::SetEventNumber. (Melinda)

M      CalibTimeVdrift.C   - using smoothing of kalman filters
M      CalibCosmic.C       - more QA plots
M      CalibTimeGain.C     - adding example tp store the data in local OCDB
M      CalibLaserVscan.C   - adding example to create reference tree
M      submitcalib.sh      - removed obsolete script

Adding OCDB configuration for different calibration use cases
(Marian)

Settings for pp data taking foreseen for Dec,3-rd 2009 (Andrea and Francesco)

PerformanceStrange task: V0 multiplicity in terminate and AddTask macro (H.Ricaud)

M      CalibFileMerger.C       - write calibration components one by one
M      RunAliTPCCalibKrTask.C  - edding more examples in commented code
M      AliXRDPROOFtoolkit.cxx  - bug fix
M      filterESD.C             - do not check friends
M      CalibrateTPC.C          - force CloseSE to be used

M      submitMerging.sh       - Using groups for jobs submitting
M      filterRecLog.sh        - print fixes
M      README                 - submitting using lsf groups example
M      resubmitMissing.sh     - using quotes in order to use custom batch command
M      makeCalibTree.sh       - adding halloWorld call
M      startGUItime.C         - temporay disable the loading of reference data
M      guiTime                - calling guiAlias.C
M      runTrainBatch.sh       - use script to merge result

Adding different steps in the container for the analysis

Possible fix for bug 59991 (F. Prino). Added TObjArray::Delete at the end of the track finding procedure

Bug fix concerning multiple found tracks (F. Prino)

move global variables as static variables in relevant functions to prevent conflict between macros

Bug fix by Sylwester

Fox for memory leaks (Matevz)

In vmctest:
Adding gun test which can be run with G3, G4.

Added new signature for method FetchClusters, to be used for data monitoring with AMORE (M. Masera)

save number of clusters/tracklet in debug stream

From Adam K.: Add buttons and output file handling for event characterization.

updates by Ben for object list analyser

Re-import from release requested by Chiara Oppedisano

Fixing bug #57328