Small changes and fixes (Carmelo)

Removing man-in-the-middle class
AliHLTPHOSRcuProcessor

Making the DoDeInit function non virtual
temporarily untill its implemented in all derived classes.

Removing redundant class
AliHLTPHOSProcessor and replcing it with
AliHLTCaloProcessor which provides exactly the
same functionality.

Removing obsolete class
AliHLTPHOSProcessor from build system.
Use AliHLTCaloProcessor instead which provides
exactly the same functionality.

Removing obsolete class from build system

PeakFinder update - from Per Thomas

Removing man-in-the-middle class
AliHLTCaloRcuProcessor

M      AliTPCcalibAlign.cxx              - filtering the debug output
M      AliTPCcalibCalib.cxx              - speed up refitting - longer steps
M      AliTPCcalibCosmic.cxx             - filtering debug output
M      AliTPCcalibTime.cxx               - index out of range fix
M      AliTPCCorrection.cxx              - track extepolation to vertex
M      AliTPCPreprocessorOffline.cxx     - updated example
M      AliTPCTracklet.cxx                - fix 1/pt for track segement fitting.

Marian

M      AliTPCkalmanAlign.cxx      - class to process the results of alignment - using kalman filter approach
M      AliTPCkalmanAlign.h
M      TPCcalibLinkDef.h          - using the new AliTPCkalmanAlign
M      libTPCcalib.pkg            -

marian

Removal of dead code

Defining constants static
and initialize them in the header file
on order to be able to use thme when initializing arrays in
other classes.

Using AliHLTCAloConstants insted of
      AliHLTCaloConstant.h

Added method

New class for DStar->D0pi cuts (Alessandro)

Remove files committed by mistake

Addition of Lc->V0+bachelor analysis (Zaida)

Addition of Lc->V0+bachelor analysis (Zaida)

Added method IsInFiducialAcceptance (Chiara Z)

The sigma cut used for noise generation can now be easily changed

Fixing a warning

Changed default OCDB from 2009 to 2010

Correcting a message

Updating comments

updated TPC cuts

- Add information in the trigger chamber efficiency object in order to take into account correlation between bending and non bending plane efficiency.
- Clean-up the OCDB object by removing accessory methods for efficiency calculation/display.
- Create new class (AliMUONTriggerChamberEfficiency) to handle the efficiency map stored in OCDB.
(Diego)

Fix for bug #67104 solving the following problems:

- Proper loading of reference tables and solving of a mapping problem (related to bug 66306 where the array now have the size as before but the mapping has changed to start from 0)
- TRD out from combined PID since we have only reference tables for electrons and pions
- Gain normalization factors to match the dEdx in simulation and real data to the gain values in the reference data coming from the testbeam

Markus

macros that use RAW mapping classes for translating between FEE/electronics indices and geometrical tower info

One step back.

Fix for report #66820 Request - remove Error message in AliESDtrack::GetTRDmomentum

M      AliTPCcalibDB.h          - GetDistortion not inline function
M      AliTPCcalibDB.cxx        - Bug fix - proper path to the OCDB entry
M      AliTPCCorrection.h       - MakeDistortionMap out of residual histograms
M      AliTPCCorrection.cxx
M      AliTPCGGVoltError.cxx    - Init transformation in Init and Update function

Marian.

protection against NULL pointer

Fix compilation problem in linux (Diego)

bug fix and small changed in the macros

new macro to run TPC MC performance

Added HLT/rec to enable use of AliHLTReconstructor object

-added AliHLTReconstructor object to online display macro

Store information to calculate the correlation between the bending and non-bending plane (Diego)

Protection against the zero magnetic field and cleanup in the corresponding component of fulltracker. If only MUON_TRK or MUON_TRG is only present do not attempt tracking, only send empty output blocks. (Indra)

Fix for report #66245: Verbose output from ITS

correcting log message argument after variable type change

first working version of the DCSPublisher
- event buffers for vertex coordinates added
- mean and rms calculation added
- dim services added to server

registration of AliHLTGlobalDCSPublisherComponent added

- start DIS serving added to server loop
- DIS update called on AliHLTDimService::Update
- service name prepended by server name

Add a merge function for the offline calibration train (Raphaelle)

removed RooFit usage (+ small change in the DebugTree class)

- adding protection for calibration events

remove from digits array those channels with bad timing or which only produced Low Gain

Test for equality was completely wrong !

check for channels with bad pedestal RMS values (noisy)

move geometry initialization pointers from Init to CreateOutputObjects

Update and Init function of correction
Parameters are taken form the OCDB

AliTPCcalibDB.cxx              - copy paste error
AliTPCCorrection.h             - adding fT1, and fT2 as a data member to enable Update
AliTPCExBBShape.h              - Set fT1 and fT2
AliTPCExBConical.h             - Set fT1 and fT2
AliTPCExBTwist.h               - Set fT1 and fT2
AliTPCGGVoltError.h            - Set fT1 and fT2
AliTPCCorrection.cxx           - Set fT1 and fT2
AliTPCExBBShape.cxx            - Update and Init function
AliTPCExBConical.cxx           - Update and Init function
AliTPCExBTwist.cxx             - Update and Init function
AliTPCGGVoltError.cxx          - Update and Init function

Bug fix in like-sign refs

Change in Notify needed for CAF datasets.

Undefined variable problem corrected.
(M. van Leeuwen)

- fixed check on empty HLTesdTree

M      AliTPCCorrection.h     - Update also input parameters - not const
M      AliTPCcalibCalib.cxx   - Use PropagateBxByBy
M      AliTPCcalibDB.cxx      - read the correction entry form the OCDB
M      AliTPCcalibTime.cxx    - Use PropagateBxByBz
                              - Use only TRD tracks with refit flag
                              - Smaller outlyer removal deepnes in history (median calc)
M      AliTPCCorrection.cxx   - Adding MakeTrackDistortionTree - used for global minimization
M      AliTPCExBConical.cxx   - Sign

Marian

- added check for the existence of HLT tracks in the HLTesdTree and printout of the event in case the event is empty
- switched off warning for missing AliESDfriend file

Decoding for the ADC and ADD TDCs introduced in raw data streaming

Possibility to update track parameters with the parameters taken from another track (M. Ivanov)

Bug Fix: Forgot to call the initialization of
EMCAL/PHOS specific values of common parameters in the constructor.

Uncommented code that was commented
out by mistake.

Cosmetics

Making  AliHLTCaloConstants abstract ( as it ought to be )
by introducing the abstract function
InitConstants().

Reindtroduction of constant class
AliHLTCaloConstants  which was deleted
by mistake. ( The intention was to delete only AliHLTCaloConstant )

Removal of obsolete file from build system

Removal of obsolete file

Decomissioning of obsolete file
AliHLTPHOSConstants

Adding test of the track update with another track
(Marian)

a few extra histograms

adding dummy functions for GetNumberOfTracklets() and GetTrackletIndex(Int_t) as required by AliKalmanTrack

Refactoring: of constants classes:
1) Moved the declaration of all varaibales to
the Calo basclass.
2) Removed Abstractness from Getter functions
that should not be declared abstract.

Refactoring of constants handling classes.
1) Moved some constants that is the for PHOS and
EMCAL up to the Calo baseclass.
2) Removed redudnant Getter functions.
3) Moved the declarations of variables common to  PHOS and EMCAL
up to the Calo baseclass.

Added protections to avoid divisions by zero (Savannah bug 66775

Removal of unused constants

Removing unused constants

Removing obsolete file
AliHLTCaloConstant from build system

Updates for new track cuts (Marta)

Correct crash with test plugin, other minor stuff (Renzhuo)

Suppressed compilation warming

cure for compilation warnings from recent QA commits

Updated version of the rawStream with the option to dump MCM raw data
and accumulating some statistics.
Slight change of the tracklet output (rawData/clusterizer).

Looser default cuts for the V0 and the cascade finders

update task to read results from AnalysisResults.root file

Removed obsolete class HLT/EMCAL/AliHLTEMCALConstants.h

 Cosmetics

Cosmetics

Cosmetcis

Refactoring:  rempved the usage of AliHLTEMCALConstant
from  AliHLTEMCALGeometry

Usage of new constant classes

Refactoring of constants usage. Some parameters common to
PHOS / EMCAL was moved to the CALO directpry.
In particluar. 1 ) Max number of ALTRO samples, 2 ) Max number of
ALTRO presamples, 3 ) Number of gains (2), 4) Max bin value ( 1023 since it is a 10 bit ADC ).

Removing obsolete  file  AliHLTCaloConst.h  from build system

Change in AliACORDEReconstructor: now the labels go from 0 - 59

correction for detector effects for three particle correlations used to calculate CP violation

new coding for ITS services side C (M. Sitta)

- adding code for the generation of initial GRP entry
- updating the GRP entry only if there was a change in the currents or polarities
- keeping the other information from the GRP object and meta data of the entry

Error in y setters corrected

Deleting the obsolete ReadESDfriend.C macro

- added implementation of GetOCDBObjectDescription

preparations for glauber inclusion