Moving the old macros to new directory

Adding performance macros (Jacek)

Removing old Macros directory
(Marian)

added a few setters

Replaced pointer by object data member

corrected mistake in string

 a few mods how to do the randome numbers

Files for compiling PWG2/EVCHAR directory

Fix for the PROOF case

events based on the fly in memory and analysis for quick chekcs

Fixed initialization of AOD file in proof case. Handling delta AOD's supported.

Fixed initialization of AOD output file.

- More dimensions added.
- Flexible design.

Commenting out debug printouts

Commenting out debug printouts

simplified pair cuts : pair cut settings now have to be called via the
individual pointers to neg. and pos. track cuts

Do CE processing for LASER and PHYSICS run
Produce error code on failure only for LASER runs

Macro for SPD multiplicity analysis (Domenico, Mariella)

Macro for SPD multiplicity analysis (Domenico, Mariella)

Fix of a compilation problem

SPD multiplicity analysis (Domenico, Mariella)

Added storing of jet references for background mode == 0 (Davide)

Added possibility to use par files for base libraries. More comments added.

Updating g4menu.C macro for changes in STEER;
calling gAlice->GetMCApp()->Init(); instead of
gAlice->Init(), which is no more available.
(I. Hrivnacova)

Fix in copy constructor, added draw functionality (Chiara)

New test macro for HF mass fitter (Chiara)

Removed old analysis macros (replaced by AddTask... macros)

Use AddTaskXXX macros for analysis

Adding some further mother volumes to speed-up the overlap checking and particle transport (M. van Leeuwen)

Add class for BkgLikeSign analysis

In trigger classes:
- The trivial change is the initialisation of the global input masks
  to 0xFFFFFFFF
- The change to unify the format of the global trigger output word
  with the one written in the raw data:
  shifting the  first six bits of the global trigger by 1 bit and
  leaving the first bit (LSB) to have the value 0 or 1, which tells which
  of the single low/high pt bit is sent to the CTP, since this one takes only
  5 bits from the MUON trigger.
- Reverse change which was done once for the inversion of the bits in
  the global input words. Tests with the latest cosmic runs, showed that
  it is not necessary to invert the global inputs before applying the masks.
  It seems it was a misunderstanding, but I will let the code doing
  the inversion as it is, only not doing the inversion finally.
(Bogdan)

Bug removal
Adding additional functionality - example to create the
spline fit

Many correction of incorrect usage of delete [] operator. Fix in the initial array size producing a crash  (A.Gheata).

Adding "robust" fit slices for THNSparse
(Marian, Alexander)
Fitting region specified by user in the temrs of quantiles

Missing protection added. (A.Gheata)

Added info for streaming

Proper filling of the EMCAL and PHOS clusters in the tags (ESD+AOD) (Panos)

Added some methods in AliTOFGeometry class, updated the AliTOFGeometry::IsInsideThePad method and consequently updated the AliTOFtracker class

Savannah item #47411: implemented n-sigma getters in the AliTOFpidESD class (Y.Belikov)

Style changes

Changed the way to retrive the T0 information (A.Maevskaya)

Added more checks at s/digitization level (to keep bug#47098 under control)

Added PWG3/vertexingHF task and PWG4/Gamma jet finder (Mihaela)

Header file corresponding to 32066

Typo

Complete path for LoadLibraries.C

Delete macro CreateStandardAODfromESD.C

Possibility to create AOD+AODVertexingHF in the same train, starting from ESD (A. Gheata)

Possibility to create AOD+AODVertexingHF in the same train, starting from ESD (A. Gheata)

Fixes to memory leaks. New option for gauss fits (F. Prino)

Charge info in Fast Point set to KeV. Removing unused classes (F. Prino)

New tracklet and vertex selection in 3D (F. Prino)

Correctly retrieve the number of events per run during event generation.

Fix to Savannah bug 49014 (A. Mastroserio)

Added support for creating both standard AOD and several deltaAOD's in the same
ESD-based analysis. Producing a deltaAOD using AliAODHandler::SetNonStandardAOD()
in an analysis on input AOD is still possible. To use the new feature:
- use a standard AOD handler (no call to SetNonStandardAOD)
- in the AliAnalysisTaskSE-derived task, call AddAODBranch(cname, addobj, fname)
where the newly added fname is the file name where the branch(es) is(are) to be
written.

Added AliAnalysisTaskSE::IsStandardAOD() to check from the user code if the AOD
handler is configured for standard AOD or not. Check first via AODEvent() if there
is any AOD handler at all.

Added support for creating both standard AOD and several deltaAOD's in the same
ESD-based analysis. Producing a deltaAOD using AliAODHandler::SetNonStandardAOD()
in an analysis on input AOD is still possible. To use the new feature:
- use a standard AOD handler (no call to SetNonStandardAOD)
- in the AliAnalysisTaskSE-derived task, call AddAODBranch(cname, addobj, fname)
where the newly added fname is the file name where the branch(es) is(are) to be
written.

Added AliAnalysisTaskSE::IsStandardAOD() to check from the user code if the AOD
handler is configured for standard AOD or not. Check first via AODEvent() if there
is any AOD handler at all.

modify "Add" macro names accordingly

follow up on name change of QA tasks

follow up on name change of TRD tasks

- prepare train for merging with TPC.
- rename some of the tasks

Corrected Glitch filter.
In case the digits was removed the label corresponding to non existing digits
used, before label for noise used

(Marian)

Updated list of files (cmake)

full monitor of track in TRD region

Go back to working dir if par compilation fails, this helps debugging (AndreaR)

Glitch filter added. For a time being by default.

use a seperate config file to set the cuts and options for the flow analysis

Go back to working dir if par compilation fails, this helps debugging (AndreaR)

small bug fix

Changes required by adding of perfomrance tasks (Jacek)

Adding perfomrance tasks (Jacek)

bug fix

Fix in ITS FastRecPoints tree filling (F. Prino)

For the first event the number of events is set 1.
Fixes Savannah 49536

From Antonin:

Update the detailed views for the "V0" to do proper 2D projection
onto the bending plane view.

update resolution task with a full characterization of the track entering
the TRD from below

In AliMUONClusterInfo:
- Added new data members and methods
- Added the possibility get info from clusters not attached to a track (recPoints)
- Updated macro MUONClusterInfo.C
(Philippe P., Javier)

fix ordering of tasks

Fix bug in the macro to create FastRecPoints from Hits

Moved the random geration to the macro

Jet Jet Production 3 p_T hard bins

change aliroot version

Macro computing VZERO efficiencies

Adding class AliVZEROMisAligner

Adding class AliVZEROMisAligner

Adding class AliVZEROMisAligner

Merging of the three alignment macros into one

Merging of the three alignment macros into one

Updates (Leticia)
- corrected boosts
- corrected glauber

Added new filter cuts and MC particle filter. Muon filter activated by default as in CreateAODfromESD.
Macros AddTaskGammaHadronCorr.C and AddTaskPi0.C replaced with PWG4/macros/AddTaskPartCorr.C (M.Gheata)

Added like-sign 3Prong

From Antonin:

Cascade visualisation upgrade (V0 daughter display, inv mass
selection, detailed views).

update

update

added methods to simulate fluctuations in multiplicity and flow

Some fixes to output structure tp avoid crashes on CAF

the filter needs the OutputContainer, not the exchange

The cluster index "0" was used to indicate that a track has no cluster
on a given layer. But there is a cluster with index "0" (the first cluster
of the event).Now using "-1" instead of "0".

A Dainese

Added the include to cstdlib in several places to avoid compilation problems with abort(); Added to some printfs "\n" when necessary; Example configuration file to execute AliAnaChargedParticles.

In reconstruction classes:
- Improve track candidate selection by taking into account the resolution
  on the track parameters.
- Add a flag into RecoParam to switch between track selection on their
  slope or on their impact parameter at vertex (default).
- UPdate REcoParam in OCDB
- Take into account the chamber/cluster resolution when defining
  the "fixed" area to quickly look for new cluster to be attached to the track.
- AliMUONDigitCalibrator: Do not use digit saturation information from
  calibration file when using the calibration option NOGAIN.
(Philippe P.)

misalignment from Tomek