Modifications to the examples following the latest developments.

Revised version of raw data v1 (bug fix and coding vios)

Added the arrays of 1st manu in bus for stations 1 and 2
(Christian)

- Added new functions:
  - SetManu() which fills the bus patches with manus
    (this function is called in the constructor).
  - GetBusPatchId(Int_t detElemId, Int_t manuId)
- In ReadDDLs(): now reading also the first manu arrays for station 1 and 2
(Christian)

replace ANALYSIS_NEW by ANALYSIS

Typo

coding conventions

The multidimensional array holding celle energies for
was removed.

Changes needed due to changes in AliHLTPHOSValidCellDataStruct.h
and AliHLTPHOSRcuCellEnergyDataStruct.h

Chnages was necessary in this class beacause the format
of  AliHLTPHOSRcuCellEnergy struct was changed.

Minor changes.

The component now inherits from AliHLTFileWriter instead
of from the AliHLTPHOSFileWriter. The data is written
to file with the DumpData finction of the AliHLTFileWriter class
instead of with the WriteFile function of the AliHLTPHOSFileWriter class

New definitions

Commented out the Writefile function as it will be replaced by the
DumpData function of the AliHLTFileWriter. This class might be obsolete
in the near future.

Energy and Timing variables was added rather than using the
entries in the AliHLTPHOSValidDataStruct as refernce to
a multidiminsional array. In most cases this will lead higher
performance of the processing unless the occupancy is very high

the file was wrong

Changes required in order to cope with the new version of ITSVertexerZ. The HLT vertexer functionality remains the same, i.e. it still uses histograms in order to fit the vertex.

Do not initialize static object using other static object: the order of creation is undefined

Use (1-x)(1+x)

In SetDataContainer(): do not reset raw clusters as it breaks the correct
functioning of the combined reconstruction
(Sasha)

13-feb-2007 NvE IceRawTWR.cxx updated to ensure padding zeros in gps time word.
                Also old "F2K" comments corrected into "TWR raw" in IceRawTWR.cxx
                and IceRawTWR.h.

Removal of some debug prints

- Start from existing geometry (gGeoManager or geometry.root file)
- Get zero alignment data directly from the transformer
  (there is no need to use misaligner)
- Removed generating MUON specific geometry data (as this is done
  in MUONGenerateGeometryData.C macro)
- Added copyrigt, CVS Id

- Start from existing geometry (gGeoManager or geometry.root file)
- Removed generating MUON specific geometry data (as this is done
  in MUONGenerateGeometryData.C macro)
- Added copyrigt, CVS Id

Removed generation of alignment data, now
done by other macros compliant to general framework.

ITS geometry loaded via ITS loader and not from gAlice

Moved getters and setters of Shuttle's main OCDB/Reference, local
OCDB/Reference, temp and log folders to AliShuttleInterface

Shuttle getters and setters of main/local OCDB/Reference storages, temp and log
folders moved to AliShuttleInterface

New version of DATE event header

Shuttle getters and setters for main OCDB/Reference, local OCDB/Reference, temp
and log folders moved to AliShuttleInterface

Raw2SDigits() implemented

bug fixed

Adding TestShuttle temp and log folder's getter and setter

Updated names of the environment variables (no dollar sign). Gaussian distribution in case of TPC (Raffaele)

method GetCellXY is added

method Order is removed

new definitions

Check md5sum of retrieved FXS file inside "retry loop"; clean temp folder after
run is processed.

Matrices to go from local RS of alignable volumes to Tracking Reference system (V2 system) - L. Gaudichet

Adding out-of-time ADC in digits and raw data

Adding return statement

Removed the initialiazation statement fFilename.assign(256,0)  wich is intended
to initialize the string fFilename in the
DoInit function of the AliHLTPHOSFileWriterComponent class as
it is not needed as long as the string is properly initialized in the
meber initialization list.
Also the statement fFilename.assign(256,0) is not understud by some compilers.

Bug fix: When moving from C style pointer based strings to the C++ string
class the memebr initialization list was not updated accordingly.
The member fDirectory and fFilename was initialized to zero wich
is fine for a C pointerbased string but when used to initialize a string
with the statement fDirctory(0) it is intepret as an attemt to initialize
a string object with a C character string starting at 0.
The error cuase a runtime error of aliroot, but is now fixed.

parity bit is introduced

method Ranmar is removed

carries cluster info in clustering class

Bug fix

incresed the LOG_BUFFER_SIZE from 100 to 512 bytes

examople of macro to do a correlation analysis

VertexerZ updated: no histograms for Z finding, new definition of errors

B?\008New version from Gustavo

Merged with changes from Panos

Simplified decalibration procedure, just say to the CBD where is the file

forgot to remove #include statement for file that was removed from cvs (AliHLTPHOSFileWriterDescriptorStruct.h)

Calibration data member fCalibData initialized in Init() calling to the AliEMCALLoader::CalibData() method, pedestals and gains always data recovered from CDB

New calibration data member with AliEMCALCalibData instance. Initialized in Init() calling to the AliEMCALLoader::CalibData() method, pedestals and gains always data recovered from CDB

added new files

CalibData() method returns AliEMCALCaliData instance filled with CDB calibration data

cosmetic changes

1st half supermodule was considered as a full supermodule

added copyright note

 = opreator and copy constructor made private

Coding convention & removal of some obsolete code

Added copyright notice

Abstract class to implement som functions common to all FileWriters.
The pure virtual function WriteFile must be implemnted in a derived class.

file moved to EMCAL/ShuttleInput

Reference calibration histogram file, one histogram per channel with accumulated amplitudes. This is a version for shuttle testing, moved from EMCAL/data to EMCAL/ShuttleInput

Correct the name of the storage directory from EMCAL/Calib/Gains_and_Pedestals to EMCAL/Calib/Data

HLT component to write data to files. The directory where to write the files
has to be specified as component argumet with the -directory <directory> option.
At least one data type has to be specified as component argumet with the
-datatype <datatype>. Any number of valid datatype can be specified.
Example of usage.

-componentargs "-directory /home/perthi/HLT/phos/data/  -datatype gkCellEnergyDataType  -datatype gkDDLPackedRawDataType"

The command abowe will write both celle energies and untouched raw RCU data to separate files in the
directory /home/perthi/HLT/phos/data/. Currently one file will be written per event.

Correct to agree with ALICE numbering scheme, change name of storage directory from EMCAL/Gains_and_Pedestals to EMCAL/Data

Class to write cell/crystal energies to file on a dedicated celle energies data format.

Class to write raw RCU data blocks directly to files untouched by the HLT

Class to write phos cell/crysta energies to files on a dedicated
celle energy data format.

Structure to hold header information for dat that should be written to file.

Bug fix:
1) The path to the peakfinder vector is now taken programatically from
the environment variable ALICE_ROOT, and  PF_VECTOR_DIR constant given in
AliHLTPHOSCommonDefs.h. The name of the file is constructed from the constants
 PF_DEFAULT_N_SAMPLE, PF_DEFAULT_STARTINDEX, DEFAULT_TAU,  DEFAULT_FS also
defined in ALIHLTPHOSCommonDefs.h .
The default PF vector found this way can be overiiden by the user (programtically).

2) Error messages are writen to the HLT
log file of the component rather than to stdout.

New definitions

Removing use of gAlice from reconstruction:
use AliRunLoader to get event number
(Sasha)

Removing use of gAlice from reconstruction;
the MUONSegmentation is now created via MUONSegFactory in
MUONReconstructor and passed to AliMUONEventRecoCombi and
AliMUONDetElement objects.

Reflecting DCS numbering change (Laurent)

Adding some shuttle log messages (Laurent)

Properly center primary-vertex error-box.

look for AliAnalysisSelector in ./ANALYSIS/ rather than in $ALICE_ROOT/ANALYSIS to avoid cint error

Add AliAnalysisSelector in ANALYSIS package

Fixing the call to the ctor of AliAnalysisManager

more work on coding conventions and effC++

Small change by MinJung: < instead of <=

The folder which should be used to store the guid files is added as an option to the alimdc API. In case that the option is empty, the guid files will be stored in the same folder as raw-data files.

- treating the closing of the popup window properly
- add an iterator (Next button) for DetElemId
- add more infos while drawing (pad size & motif size)
(Christian)

coding conventions

eff c++ warnings

corrected error in .include

Removing extra ; from the flow code

Updated version of the mutiplicity reconstruction with tracklets (Massimo)

changing binning
tf1 can be provided that is used as input distribution to test the method
enabling only needed branches in selector

added debug option

Minor cosmetic changes on the GUI

Implementation of DCS FXS interface. Common design of all FXS interface methods.

Implementation of DCS FXS interface. Common design of all FXS interface methods .

all code in the constructors commented out, It will be readded later
after some more testing.

Bug fix, path to peakfinder vectors was hardcoded into the code for debugging purphoses
but was not removed when the code was commited. the error message reads

AliHLTPHOSRawAnalyzerPeakFinderComponent, ERROR: could not  open PF vector file

and can be ignored unless one uses the PeakFinderComponent within the HLT framework.
The vectors can also be set with the SetAVector and SetTVector int AliHLTRawAnalyzerPeakFinder class.
The error message is commented out in the current version.