ANALYSIS/AliAnalysisManager.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17 // Author: Andrei Gheata, 31/05/2006
  18
  19 //==============================================================================
  20 //   AliAnalysysManager - Manager analysis class. Allows creation of several
  21 // analysis tasks and data containers storing their input/output. Allows
  22 // connecting/chaining tasks via shared data containers. Serializes the current
  23 // event for all tasks depending only on initial input data.
  24 //==============================================================================
  25 //
  26 //==============================================================================
  27
  28 #include <Riostream.h>
  29
  30 #include <TClass.h>
  31 #include <TFile.h>
  32 #include <TMethodCall.h>
  33 #include <TChain.h>
  34 #include <TSystem.h>
  35 #include <TROOT.h>
  36
  37 #include "AliAnalysisTask.h"
  38 #include "AliAnalysisDataContainer.h"
  39 #include "AliAnalysisDataSlot.h"
  40 #include "AliAnalysisManager.h"
  41
  42 ClassImp(AliAnalysisManager)
  43
  44 AliAnalysisManager *AliAnalysisManager::fgAnalysisManager = NULL;
  45
  46 //______________________________________________________________________________
  47 AliAnalysisManager::AliAnalysisManager()
  48                    :TNamed(),
  49                     fTree(NULL),
  50                     fCurrentEntry(-1),
  51                     fMode(kLocalAnalysis),
  52                     fInitOK(kFALSE),
  53                     fTasks(NULL),
  54                     fTopTasks(NULL),
  55                     fZombies(NULL),
  56                     fContainers(NULL),
  57                     fInputs(NULL),
  58                     fOutputs(NULL)
  59 {
  60 // Dummy constructor.
  61    fgAnalysisManager = this;
  62    SetEventLoop(kTRUE);
  63 }
  64
  65 //______________________________________________________________________________
  66 AliAnalysisManager::AliAnalysisManager(const char *name, const char *title)
  67                    :TNamed(name,title),
  68                     fTree(NULL),
  69                     fCurrentEntry(-1),
  70                     fMode(kLocalAnalysis),
  71                     fInitOK(kFALSE),
  72                     fDebug(0),
  73                     fTasks(NULL),
  74                     fTopTasks(NULL),
  75                     fZombies(NULL),
  76                     fContainers(NULL),
  77                     fInputs(NULL),
  78                     fOutputs(NULL)
  79 {
  80 // Default constructor.
  81    fgAnalysisManager = this;
  82    fTasks      = new TObjArray();
  83    fTopTasks   = new TObjArray();
  84    fZombies    = new TObjArray();
  85    fContainers = new TObjArray();
  86    fInputs     = new TObjArray();
  87    fOutputs    = new TObjArray();
  88    SetEventLoop(kTRUE);
  89 }
  90
  91 //______________________________________________________________________________
  92 AliAnalysisManager::AliAnalysisManager(const AliAnalysisManager& other)
  93                    :TNamed(other),
  94                     fTree(NULL),
  95                     fCurrentEntry(-1),
  96                     fMode(other.fMode),
  97                     fInitOK(other.fInitOK),
  98                     fDebug(other.fDebug),
  99                     fTasks(NULL),
 100                     fTopTasks(NULL),
 101                     fZombies(NULL),
 102                     fContainers(NULL),
 103                     fInputs(NULL),
 104                     fOutputs(NULL)
 105 {
 106 // Copy constructor.
 107    fTasks      = new TObjArray(*other.fTasks);
 108    fTopTasks   = new TObjArray(*other.fTopTasks);
 109    fZombies    = new TObjArray(*other.fZombies);
 110    fContainers = new TObjArray(*other.fContainers);
 111    fInputs     = new TObjArray(*other.fInputs);
 112    fOutputs    = new TObjArray(*other.fOutputs);
 113    fgAnalysisManager = this;
 114 }
 115
 116 //______________________________________________________________________________
 117 AliAnalysisManager& AliAnalysisManager::operator=(const AliAnalysisManager& other)
 118 {
 119 // Assignment
 120    if (&other != this) {
 121       TNamed::operator=(other);
 122       fTree       = NULL;
 123       fCurrentEntry = -1;
 124       fMode       = other.fMode;
 125       fInitOK     = other.fInitOK;
 126       fDebug      = other.fDebug;
 127       fTasks      = new TObjArray(*other.fTasks);
 128       fTopTasks   = new TObjArray(*other.fTopTasks);
 129       fZombies    = new TObjArray(*other.fZombies);
 130       fContainers = new TObjArray(*other.fContainers);
 131       fInputs     = new TObjArray(*other.fInputs);
 132       fOutputs    = new TObjArray(*other.fOutputs);
 133       fgAnalysisManager = this;
 134    }
 135    return *this;
 136 }
 137
 138 //______________________________________________________________________________
 139 AliAnalysisManager::~AliAnalysisManager()
 140 {
 141 // Destructor.
 142    if (fTasks) {fTasks->Delete(); delete fTasks;}
 143    if (fTopTasks) delete fTopTasks;
 144    if (fZombies) delete fZombies;
 145    if (fContainers) {fContainers->Delete(); delete fContainers;}
 146    if (fInputs) delete fInputs;
 147    if (fOutputs) delete fOutputs;
 148    if (fgAnalysisManager==this) fgAnalysisManager = NULL;
 149 }
 150
 151 //______________________________________________________________________________
 152 Int_t AliAnalysisManager::GetEntry(Long64_t entry, Int_t getall)
 153 {
 154 // Read one entry of the tree or a whole branch.
 155    if (fDebug > 1) {
 156       cout << "== AliAnalysisManager::GetEntry()" << endl;
 157    }
 158    fCurrentEntry = entry;
 159    return fTree ? fTree->GetTree()->GetEntry(entry, getall) : 0;
 160 }
 161
 162 //______________________________________________________________________________
 163 void AliAnalysisManager::Init(TTree *tree)
 164 {
 165   // The Init() function is called when the selector needs to initialize
 166   // a new tree or chain. Typically here the branch addresses of the tree
 167   // will be set. It is normaly not necessary to make changes to the
 168   // generated code, but the routine can be extended by the user if needed.
 169   // Init() will be called many times when running with PROOF.
 170    if (!tree) return;
 171    if (fDebug > 1) {
 172       printf("->AliAnalysisManager::Init(%s)\n", tree->GetName());
 173    }
 174    if (!fInitOK) InitAnalysis();
 175    if (!fInitOK) return;
 176    fTree = tree;
 177    AliAnalysisDataContainer *top = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
 178    if (!top) {
 179       cout<<"Error: No top input container !" <<endl;
 180       return;
 181    }
 182    top->SetData(tree);
 183    if (fDebug > 1) {
 184       printf("<-AliAnalysisManager::Init(%s)\n", tree->GetName());
 185    }
 186 }
 187
 188 //______________________________________________________________________________
 189 void AliAnalysisManager::Begin(TTree *tree)
 190 {
 191   // The Begin() function is called at the start of the query.
 192   // When running with PROOF Begin() is only called on the client.
 193   // The tree argument is deprecated (on PROOF 0 is passed).
 194    if (fDebug > 1) {
 195       cout << "AliAnalysisManager::Begin()" << endl;
 196    }
 197    Init(tree);
 198 }
 199
 200 //______________________________________________________________________________
 201 void AliAnalysisManager::SlaveBegin(TTree *tree)
 202 {
 203   // The SlaveBegin() function is called after the Begin() function.
 204   // When running with PROOF SlaveBegin() is called on each slave server.
 205   // The tree argument is deprecated (on PROOF 0 is passed).
 206    if (fDebug > 1) {
 207       cout << "->AliAnalysisManager::SlaveBegin()" << endl;
 208    }
 209
 210    TIter next(fTasks);
 211    AliAnalysisTask *task;
 212    // Call CreateOutputObjects for all tasks
 213    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
 214       TDirectory *curdir = gDirectory;
 215       task->CreateOutputObjects();
 216       if (curdir) curdir->cd();
 217    }
 218    if (fMode == kLocalAnalysis) Init(tree);
 219    if (fDebug > 1) {
 220       cout << "<-AliAnalysisManager::SlaveBegin()" << endl;
 221    }
 222 }
 223
 224 //______________________________________________________________________________
 225 Bool_t AliAnalysisManager::Notify()
 226 {
 227    // The Notify() function is called when a new file is opened. This
 228    // can be either for a new TTree in a TChain or when when a new TTree
 229    // is started when using PROOF. It is normaly not necessary to make changes
 230    // to the generated code, but the routine can be extended by the
 231    // user if needed. The return value is currently not used.
 232    if (fTree) {
 233       TFile *curfile = fTree->GetCurrentFile();
 234       if (curfile && fDebug>1) printf("AliAnalysisManager::Notify() file: %s\n", curfile->GetName());
 235       TIter next(fTasks);
 236       AliAnalysisTask *task;
 237       // Call Notify for all tasks
 238       while ((task=(AliAnalysisTask*)next()))
 239          task->Notify();
 240    }
 241    return kTRUE;
 242 }
 243
 244 //______________________________________________________________________________
 245 Bool_t AliAnalysisManager::Process(Long64_t entry)
 246 {
 247   // The Process() function is called for each entry in the tree (or possibly
 248   // keyed object in the case of PROOF) to be processed. The entry argument
 249   // specifies which entry in the currently loaded tree is to be processed.
 250   // It can be passed to either TTree::GetEntry() or TBranch::GetEntry()
 251   // to read either all or the required parts of the data. When processing
 252   // keyed objects with PROOF, the object is already loaded and is available
 253   // via the fObject pointer.
 254   //
 255   // This function should contain the "body" of the analysis. It can contain
 256   // simple or elaborate selection criteria, run algorithms on the data
 257   // of the event and typically fill histograms.
 258
 259   // WARNING when a selector is used with a TChain, you must use
 260   //  the pointer to the current TTree to call GetEntry(entry).
 261   //  The entry is always the local entry number in the current tree.
 262   //  Assuming that fChain is the pointer to the TChain being processed,
 263   //  use fChain->GetTree()->GetEntry(entry).
 264    if (fDebug > 1) {
 265       cout << "->AliAnalysisManager::Process()" << endl;
 266    }
 267    GetEntry(entry);
 268    ExecAnalysis();
 269    if (fDebug > 1) {
 270       cout << "<-AliAnalysisManager::Process()" << endl;
 271    }
 272    return kTRUE;
 273 }
 274
 275 //______________________________________________________________________________
 276 void AliAnalysisManager::PackOutput(TList *target)
 277 {
 278   // Pack all output data containers in the output list. Called at SlaveTerminate
 279   // stage in PROOF case for each slave.
 280    if (fDebug > 1) {
 281       cout << "->AliAnalysisManager::PackOutput()" << endl;
 282    }
 283    if (!target) {
 284       Error("PackOutput", "No target. Aborting.");
 285       return;
 286    }
 287
 288    if (fMode == kProofAnalysis) {
 289       TIter next(fOutputs);
 290       AliAnalysisDataContainer *output;
 291       while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
 292          if (fDebug > 1) printf("   Packing container %s...\n", output->GetName());
 293          if (output->GetData()) target->Add(output->ExportData());
 294       }
 295    }
 296    if (fDebug > 1) {
 297       printf("<-AliAnalysisManager::PackOutput: output list contains %d containers\n", target->GetSize());
 298    }
 299 }
 300
 301 //______________________________________________________________________________
 302 void AliAnalysisManager::ImportWrappers(TList *source)
 303 {
 304 // Import data in output containers from wrappers coming in source.
 305    if (fDebug > 1) {
 306       cout << "->AliAnalysisManager::ImportWrappers()" << endl;
 307    }
 308    TIter next(fOutputs);
 309    AliAnalysisDataContainer *cont;
 310    AliAnalysisDataWrapper   *wrap;
 311    Int_t icont = 0;
 312    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
 313       wrap = (AliAnalysisDataWrapper*)source->FindObject(cont->GetName());
 314       if (!wrap && fDebug>1) {
 315          printf("(WW) ImportWrappers: container %s not found in analysis output !\n", cont->GetName());
 316          continue;
 317       }
 318       icont++;
 319       if (fDebug > 1) printf("   Importing data for container %s\n", wrap->GetName());
 320       if (cont->GetFileName()) printf("    -> %s\n", cont->GetFileName());
 321       cont->ImportData(wrap);
 322    }
 323    if (fDebug > 1) {
 324       cout << "<-AliAnalysisManager::ImportWrappers(): "<< icont << " containers imported" << endl;
 325    }
 326 }
 327
 328 //______________________________________________________________________________
 329 void AliAnalysisManager::UnpackOutput(TList *source)
 330 {
 331   // Called by AliAnalysisSelector::Terminate. Output containers should
 332   // be in source in the same order as in fOutputs.
 333    if (fDebug > 1) {
 334       cout << "->AliAnalysisManager::UnpackOutput()" << endl;
 335    }
 336    if (!source) {
 337       Error("UnpackOutput", "No target. Aborting.");
 338       return;
 339    }
 340    if (fDebug > 1) {
 341       printf("   Source list contains %d containers\n", source->GetSize());
 342    }
 343
 344    if (fMode == kProofAnalysis) ImportWrappers(source);
 345
 346    TIter next(fOutputs);
 347    AliAnalysisDataContainer *output;
 348    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
 349       if (!output->GetData()) continue;
 350       // Check if there are client tasks that run post event loop
 351       if (output->HasConsumers()) {
 352          // Disable event loop semaphore
 353          output->SetPostEventLoop(kTRUE);
 354          TObjArray *list = output->GetConsumers();
 355          Int_t ncons = list->GetEntriesFast();
 356          for (Int_t i=0; i<ncons; i++) {
 357             AliAnalysisTask *task = (AliAnalysisTask*)list->At(i);
 358             task->CheckNotify(kTRUE);
 359             // If task is active, execute it
 360             if (task->IsPostEventLoop() && task->IsActive()) {
 361                if (fDebug > 1) {
 362                   cout << "== Executing post event loop task " << task->GetName() << endl;
 363                }
 364                task->ExecuteTask();
 365             }
 366          }
 367       }
 368       // Check if the output need to be written to a file.
 369       const char *filename = output->GetFileName();
 370       if (!filename || !strlen(filename)) continue;
 371       TFile *file = (TFile*)gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
 372       if (file) file->cd();
 373       else      file = new TFile(filename, "RECREATE");
 374       if (file->IsZombie()) continue;
 375       // Reparent data to this file
 376       TMethodCall callEnv;
 377       if (output->GetData()->IsA())
 378          callEnv.InitWithPrototype(output->GetData()->IsA(), "SetDirectory", "TDirectory*");
 379       if (callEnv.IsValid()) {
 380          callEnv.SetParam((Long_t) file);
 381          callEnv.Execute(output->GetData());
 382       }
 383       output->GetData()->Write();
 384    }
 385    if (fDebug > 1) {
 386       cout << "<-AliAnalysisManager::UnpackOutput()" << endl;
 387    }
 388 }
 389
 390 //______________________________________________________________________________
 391 void AliAnalysisManager::Terminate()
 392 {
 393   // The Terminate() function is the last function to be called during
 394   // a query. It always runs on the client, it can be used to present
 395   // the results graphically.
 396    if (fDebug > 1) {
 397       cout << "->AliAnalysisManager::Terminate()" << endl;
 398    }
 399    AliAnalysisTask *task;
 400    TIter next(fTasks);
 401    // Call Terminate() for tasks
 402    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) task->Terminate();
 403    if (fDebug > 1) {
 404       cout << "<-AliAnalysisManager::Terminate()" << endl;
 405    }
 406 }
 407
 408 //______________________________________________________________________________
 409 void AliAnalysisManager::AddTask(AliAnalysisTask *task)
 410 {
 411 // Adds a user task to the global list of tasks.
 412    task->SetActive(kFALSE);
 413    fTasks->Add(task);
 414 }
 415
 416 //______________________________________________________________________________
 417 AliAnalysisTask *AliAnalysisManager::GetTask(const char *name) const
 418 {
 419 // Retreive task by name.
 420    if (!fTasks) return NULL;
 421    return (AliAnalysisTask*)fTasks->FindObject(name);
 422 }
 423
 424 //______________________________________________________________________________
 425 AliAnalysisDataContainer *AliAnalysisManager::CreateContainer(const char *name,
 426                                 TClass *datatype, EAliAnalysisContType type, const char *filename)
 427 {
 428 // Create a data container of a certain type. Types can be:
 429 //   kExchangeContainer  = 0, used to exchange date between tasks
 430 //   kInputContainer   = 1, used to store input data
 431 //   kOutputContainer  = 2, used for posting results
 432    if (fContainers->FindObject(name)) {
 433       Error("CreateContainer","A container named %s already defined !\n",name);
 434       return NULL;
 435    }
 436    AliAnalysisDataContainer *cont = new AliAnalysisDataContainer(name, datatype);
 437    fContainers->Add(cont);
 438    switch (type) {
 439       case kInputContainer:
 440          fInputs->Add(cont);
 441          break;
 442       case kOutputContainer:
 443          fOutputs->Add(cont);
 444          if (filename && strlen(filename)) cont->SetFileName(filename);
 445          break;
 446       case kExchangeContainer:
 447          break;
 448    }
 449    return cont;
 450 }
 451
 452 //______________________________________________________________________________
 453 Bool_t AliAnalysisManager::ConnectInput(AliAnalysisTask *task, Int_t islot,
 454                                         AliAnalysisDataContainer *cont)
 455 {
 456 // Connect input of an existing task to a data container.
 457    if (!fTasks->FindObject(task)) {
 458       AddTask(task);
 459       Warning("ConnectInput", "Task %s not registered. Now owned by analysis manager", task->GetName());
 460    }
 461    Bool_t connected = task->ConnectInput(islot, cont);
 462    return connected;
 463 }
 464
 465 //______________________________________________________________________________
 466 Bool_t AliAnalysisManager::ConnectOutput(AliAnalysisTask *task, Int_t islot,
 467                                         AliAnalysisDataContainer *cont)
 468 {
 469 // Connect output of an existing task to a data container.
 470    if (!fTasks->FindObject(task)) {
 471       AddTask(task);
 472       Warning("ConnectOutput", "Task %s not registered. Now owned by analysis manager", task->GetName());
 473    }
 474    Bool_t connected = task->ConnectOutput(islot, cont);
 475    return connected;
 476 }
 477
 478 //______________________________________________________________________________
 479 void AliAnalysisManager::CleanContainers()
 480 {
 481 // Clean data from all containers that have already finished all client tasks.
 482    TIter next(fContainers);
 483    AliAnalysisDataContainer *cont;
 484    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer *)next())) {
 485       if (cont->IsOwnedData() &&
 486           cont->IsDataReady() &&
 487           cont->ClientsExecuted()) cont->DeleteData();
 488    }
 489 }
 490
 491 //______________________________________________________________________________
 492 Bool_t AliAnalysisManager::InitAnalysis()
 493 {
 494 // Initialization of analysis chain of tasks. Should be called after all tasks
 495 // and data containers are properly connected
 496    // Check for input/output containers
 497    fInitOK = kFALSE;
 498    // Check for top tasks (depending only on input data containers)
 499    if (!fTasks->First()) {
 500       Error("InitAnalysis", "Analysis has no tasks !");
 501       return kFALSE;
 502    }
 503    TIter next(fTasks);
 504    AliAnalysisTask *task;
 505    AliAnalysisDataContainer *cont;
 506    Int_t ntop = 0;
 507    Int_t nzombies = 0;
 508    Bool_t iszombie = kFALSE;
 509    Bool_t istop = kTRUE;
 510    Int_t i;
 511    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
 512       istop = kTRUE;
 513       iszombie = kFALSE;
 514       Int_t ninputs = task->GetNinputs();
 515       for (i=0; i<ninputs; i++) {
 516          cont = task->GetInputSlot(i)->GetContainer();
 517          if (!cont) {
 518             if (!iszombie) {
 519                task->SetZombie();
 520                fZombies->Add(task);
 521                nzombies++;
 522                iszombie = kTRUE;
 523             }
 524             Error("InitAnalysis", "Input slot %d of task %s has no container connected ! Declared zombie...",
 525                   i, task->GetName());
 526          }
 527          if (iszombie) continue;
 528          // Check if cont is an input container
 529          if (istop && !fInputs->FindObject(cont)) istop=kFALSE;
 530          // Connect to parent task
 531       }
 532       if (istop) {
 533          ntop++;
 534          fTopTasks->Add(task);
 535       }
 536    }
 537    if (!ntop) {
 538       Error("InitAnalysis", "No top task defined. At least one task should be connected only to input containers");
 539       return kFALSE;
 540    }
 541    // Check now if there are orphan tasks
 542    for (i=0; i<ntop; i++) {
 543       task = (AliAnalysisTask*)fTopTasks->At(i);
 544       task->SetUsed();
 545    }
 546    Int_t norphans = 0;
 547    next.Reset();
 548    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
 549       if (!task->IsUsed()) {
 550          norphans++;
 551          Warning("InitAnalysis", "Task %s is orphan", task->GetName());
 552       }
 553    }
 554    // Check the task hierarchy (no parent task should depend on data provided
 555    // by a daughter task)
 556    for (i=0; i<ntop; i++) {
 557       task = (AliAnalysisTask*)fTopTasks->At(i);
 558       if (task->CheckCircularDeps()) {
 559          Error("InitAnalysis", "Found illegal circular dependencies between following tasks:");
 560          PrintStatus("dep");
 561          return kFALSE;
 562       }
 563    }
 564    // Check that all containers feeding post-event loop tasks are in the outputs list
 565    TIter nextcont(fContainers); // loop over all containers
 566    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)nextcont())) {
 567       if (!cont->IsPostEventLoop() && !fOutputs->FindObject(cont)) {
 568          if (cont->HasConsumers()) {
 569          // Check if one of the consumers is post event loop
 570             TIter nextconsumer(cont->GetConsumers());
 571             while ((task=(AliAnalysisTask*)nextconsumer())) {
 572                if (task->IsPostEventLoop()) {
 573                   fOutputs->Add(cont);
 574                   break;
 575                }
 576             }
 577          }
 578       }
 579    }
 580    fInitOK = kTRUE;
 581    return kTRUE;
 582 }
 583
 584 //______________________________________________________________________________
 585 void AliAnalysisManager::PrintStatus(Option_t *option) const
 586 {
 587 // Print task hierarchy.
 588    TIter next(fTopTasks);
 589    AliAnalysisTask *task;
 590    while ((task=(AliAnalysisTask*)next()))
 591       task->PrintTask(option);
 592 }
 593
 594 //______________________________________________________________________________
 595 void AliAnalysisManager::ResetAnalysis()
 596 {
 597 // Reset all execution flags and clean containers.
 598    CleanContainers();
 599 }
 600
 601 //______________________________________________________________________________
 602 void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, TTree *tree)
 603 {
 604 // Start analysis for this manager. Analysis task can be: LOCAL, PROOF or GRID.
 605    if (!fInitOK) {
 606       Error("StartAnalysis","Analysis manager was not initialized !");
 607       return;
 608    }
 609    if (fDebug>1) {
 610       cout << "StartAnalysis: " << GetName() << endl;
 611    }
 612    TString anaType = type;
 613    anaType.ToLower();
 614    fMode = kLocalAnalysis;
 615    if (tree) {
 616       if (anaType.Contains("proof"))     fMode = kProofAnalysis;
 617       else if (anaType.Contains("grid")) fMode = kGridAnalysis;
 618    }
 619    if (fMode == kGridAnalysis) {
 620       Warning("StartAnalysis", "GRID analysis mode not implemented. Running local.");
 621       fMode = kLocalAnalysis;
 622    }
 623    char line[128];
 624    SetEventLoop(kFALSE);
 625    // Disable all branches if requested and set event loop mode
 626    if (tree) {
 627       if (TestBit(kDisableBranches)) {
 628          printf("Disabling all branches...\n");
 629 //         tree->SetBranchStatus("*",0); // not yet working
 630       }
 631       SetEventLoop(kTRUE);
 632    }
 633
 634    TChain *chain = dynamic_cast<TChain*>(tree);
 635
 636    // Initialize locally all tasks
 637    TIter next(fTasks);
 638    AliAnalysisTask *task;
 639    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
 640       task->LocalInit();
 641    }
 642
 643    switch (fMode) {
 644       case kLocalAnalysis:
 645          if (!tree) {
 646             TIter next(fTasks);
 647             AliAnalysisTask *task;
 648             // Call CreateOutputObjects for all tasks
 649             while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
 650                TDirectory *curdir = gDirectory;
 651                task->CreateOutputObjects();
 652                if (curdir) curdir->cd();
 653             }
 654             ExecAnalysis();
 655             Terminate();
 656             return;
 657          }
 658          // Run tree-based analysis via AliAnalysisSelector
 659          gROOT->ProcessLine(".L $ALICE_ROOT/ANALYSIS/AliAnalysisSelector.cxx+");
 660          cout << "===== RUNNING LOCAL ANALYSIS " << GetName() << " ON TREE " << tree->GetName() << endl;
 661          sprintf(line, "AliAnalysisSelector *selector = new AliAnalysisSelector((AliAnalysisManager*)0x%lx);",(ULong_t)this);
 662          gROOT->ProcessLine(line);
 663          sprintf(line, "((TTree*)0x%lx)->Process(selector);",(ULong_t)tree);
 664          gROOT->ProcessLine(line);
 665          break;
 666       case kProofAnalysis:
 667          if (!gROOT->GetListOfProofs() || !gROOT->GetListOfProofs()->GetEntries()) {
 668             printf("StartAnalysis: no PROOF!!!\n");
 669             return;
 670          }
 671          sprintf(line, "gProof->AddInput((TObject*)0x%lx);", (ULong_t)this);
 672          gROOT->ProcessLine(line);
 673          if (chain) {
 674             chain->SetProof();
 675             cout << "===== RUNNING PROOF ANALYSIS " << GetName() << " ON CHAIN " << chain->GetName() << endl;
 676             chain->Process(gSystem->ExpandPathName("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/AliAnalysisSelector.cxx+"));
 677          } else {
 678             printf("StartAnalysis: no chain\n");
 679             return;
 680          }
 681          break;
 682       case kGridAnalysis:
 683          Warning("StartAnalysis", "GRID analysis mode not implemented. Running local.");
 684    }
 685 }
 686
 687 //______________________________________________________________________________
 688 void AliAnalysisManager::ExecAnalysis(Option_t *option)
 689 {
 690 // Execute analysis.
 691    if (!fInitOK) {
 692      Error("ExecAnalysis", "Analysis manager was not initialized !");
 693       return;
 694    }
 695    AliAnalysisTask *task;
 696    // Check if the top tree is active.
 697    if (fTree) {
 698       if (fDebug>1) {
 699          printf("AliAnalysisManager::ExecAnalysis\n");
 700       }
 701       TIter next(fTasks);
 702    // De-activate all tasks
 703       while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) task->SetActive(kFALSE);
 704       AliAnalysisDataContainer *cont = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
 705       if (!cont) {
 706               Error("ExecAnalysis","Cannot execute analysis in TSelector mode without at least one top container");
 707          return;
 708       }
 709       cont->SetData(fTree); // This will notify all consumers
 710       TIter next1(cont->GetConsumers());
 711       while ((task=(AliAnalysisTask*)next1())) {
 712 //         task->SetActive(kTRUE);
 713          if (fDebug >1) {
 714             cout << "    Executing task " << task->GetName() << endl;
 715          }
 716          task->ExecuteTask(option);
 717       }
 718       return;
 719    }
 720    // The event loop is not controlled by TSelector
 721    TIter next2(fTopTasks);
 722    while ((task=(AliAnalysisTask*)next2())) {
 723       task->SetActive(kTRUE);
 724       if (fDebug > 1) {
 725          cout << "    Executing task " << task->GetName() << endl;
 726       }
 727       task->ExecuteTask(option);
 728    }
 729 }
 730
 731 //______________________________________________________________________________
 732 void AliAnalysisManager::FinishAnalysis()
 733 {
 734 // Finish analysis.
 735 }