ANALYSIS/macros/AnalysisTrainNew.C

   1 //===================== ANALYSIS TRAIN =========================================
   2 // To use: copy this macro to your work directory, modify the global part to match
   3 // your needs, then run root.
   4 //    root[0] .L AnalysisTrain.C
   5 // Grid full mode as below (other modes: test, offline, submit, terminate)
   6 //    root[1] AnalysisTrainNew("grid", "full")
   7 // CAF mode (requires root v5-23-02 + aliroot v4-16-Rev08)
   8 //    root[2] AnalysisTrainNew("proof")
   9 // Local mode requires AliESds.root or AliAOD.root in ./data directory
  10 //    root[3] AnalysisTrainNew("local")
  11 // In proof and grid modes, a token is needed and sourcing the produced environment file.
  12 //
  13 // If 'saveTrain' flag is set, the train will generate a directory name and run
  14 // in this directory. A configuration file 'ConfigTrain.C' will be generated.
  15 // One can replay at any time the train via:
  16 //    root[1] AnalysisTrainNew(ana_mode, plugin_mode, "train_default_<date>/ConfigTrain.C")
  17
  18 //==================   TRAIN NAME   ============================================
  19 TString     train_name         = "TR020_LHC10b1ESD"; // *CHANGE ME* (no blancs or special characters)
  20 TString     job_tag            = "TR020: ESD+MC -> AODMC + delta AOD"; // *CHANGE ME*
  21 //==============================================================================
  22
  23 // ### Settings that make sense in PROOF only
  24 //==============================================================================
  25 TString     proof_cluster      = "alicecaf.cern.ch";
  26 Bool_t      useAFPAR           = kFALSE;  // use AF special par file
  27 TString     AFversion          = "AF-v4-17";
  28 // Change CAF dataset here
  29 TString     proof_dataset      = "/COMMON/COMMON/LHC09a4_run8100X#/esdTree";
  30 TString     proof_outdir       = "";
  31
  32 // ### Settings that make sense when using the Alien plugin
  33 //==============================================================================
  34 Int_t       runOnData          = 0;       // Set to 1 if processing real data
  35 Int_t       iCollision         = 0;       // 0=pp, 1=Pb-Pb
  36 Bool_t      usePLUGIN          = kTRUE;   // do not change
  37 Bool_t      useProductionMode  = kTRUE;   // use the plugin in production mode
  38 // Usage of par files ONLY in grid mode and ONLY if the code is not available
  39 // in the deployed AliRoot versions. Par file search path: local dir, if not there $ALICE_ROOT.
  40 // To refresh par files, remove the ones in the workdir, then do "make <target.par>" in
  41 // AliRoot.
  42 Bool_t      usePAR             = kFALSE;  // use par files for extra libs
  43 Bool_t      useCPAR            = kFALSE;  // use par files for common libs
  44 TString     root_version       = "v5-26-00b-2";  // *CHANGE ME IF MORE RECENT IN GRID*
  45 TString     aliroot_version    = "v4-19-09-AN";  // *CHANGE ME IF MORE RECENT IN GRID*
  46 // Change production base directory here
  47 TString     alien_datadir      = " /alice/sim/LHC10b1";
  48 // AliEn output directory. If blank will become output_<train_name>
  49 TString     alien_outdir       = "/alice/sim/LHC10b1/AOD1";
  50 // TString     alien_outdir       = "";
  51 // Output folder to write delta AOD's. Considered if not null.
  52 TString     outputSingleFolder = "";
  53 //TString     outputSingleFolder = "deltas";
  54 // Number of files merged in a chunk
  55 Int_t       maxMergeFiles      = 20;
  56 // Files that should not be merged
  57 TString     mergeExclude       = "AliAOD.root AliAOD.VertexingHF.root AliAOD.Jets.root deltaAODPartCorr.root AliAOD.Muons.root resonances.root forward.root";
  58 // Make replicas on the storages below
  59 TString     outputStorages      = "disk=4";
  60 // Number of runs per master job
  61 Int_t       nRunsPerMaster     = 10;
  62 // Maximum number of files per job (gives size of AOD)
  63 Int_t       nFilesPerJob       = 100;
  64 // Int_t       nFilesPerJob       = 1; (AOD->delta AOD production case)
  65 // Set the run range
  66 Int_t       run_range[2]       =  {114786, 114949};  // LHC09a7   *CHANGE ME*
  67 // ### Settings that make sense only for local analysis
  68 //==============================================================================
  69 // Change local xml dataset for local interactive analysis
  70 TString     local_xmldataset   = "";
  71
  72 // ### Other flags to steer the analysis
  73 //==============================================================================
  74 Bool_t      usePhysicsSelection = kTRUE; // use physics selection
  75 Bool_t      useMergeViaJDL      = kTRUE;  // merge via JDL
  76 Bool_t      useFastReadOption   = kFALSE;  // use xrootd tweaks
  77 Bool_t      useOverwriteMode    = kTRUE;  // overwrite existing collections
  78 Bool_t      useDATE             = kFALSE; // use date in train name
  79 Bool_t      useDBG              = kTRUE;  // activate debugging
  80 Bool_t      useMC               = kTRUE;  // use MC info
  81 Bool_t      useTAGS             = kTRUE;  // use ESD tags for selection
  82 Bool_t      useKFILTER          = kTRUE;  // use Kinematics filter
  83 Bool_t      useTR               = kTRUE;  // use track references
  84 Bool_t      useCORRFW           = kFALSE; // do not change
  85 Bool_t      useAODTAGS          = kFALSE; // use AOD tags
  86 Bool_t      saveTrain           = kTRUE;  // save train configuration as:
  87 Bool_t      saveCanvases        = kTRUE;  // save canvases created in Terminate
  88 Bool_t      saveProofToAlien    = kFALSE; // save proof outputs in AliEn
  89
  90 // ### Analysis modules to be included. Some may not be yet fully implemented.
  91 //==============================================================================
  92 Int_t       iAODanalysis       = 0;      // Analysis on input AOD's
  93 Int_t       iAODhandler        = 1;      // Analysis produces an AOD or dAOD's
  94 Int_t       iESDfilter         = 1;      // ESD to AOD filter (barrel + muon tracks)
  95 Int_t       iMUONcopyAOD       = 1;      // Task that copies only muon events in a separate AOD (PWG3)
  96 Int_t       iJETAN             = 1;      // Jet analysis (PWG4)
  97 Int_t       iJETANdelta        = 1;      // Jet delta AODs
  98 Int_t       iPWG4partcorr      = 1;      // Gamma-hadron correlations task (PWG4)
  99 Int_t       iPWG4gammaconv     = 0;      // Gamma conversion analysis (PWG4)
 100 Int_t       iPWG4omega3pi      = 0;      // Omega to 3 pi analysis (PWG4)
 101 Int_t       iPWG3vertexing     = 1;      // Vertexing HF task (PWG3)
 102 Int_t       iPWG3hfe           = 0;      // Electrons analysis (PWG3)
 103 Int_t       iPWG3d2h           = 0;      // D0->2 hadrons (PWG3)
 104 Int_t        iPWG3d0mass       = 1;      // D0 mass (PWG3D2H)
 105 Int_t        iPWG3d0massLS     = 1;      // D0 mass LS (PWG3D2H)
 106 Int_t        iPWG3dplus        = 1;      // D+ analysis (PWG3D2H)
 107 Int_t        iPWG3LSd0         = 1;      // LS D0 analysis (PWG3D2H)
 108 Int_t        iPWG3LSjpsi       = 1;      // LS J/Psi analysis (PWG3D2H)
 109 Int_t        iPWG3CFd0         = 1;      // CF D0 analysis (PWG3D2H)
 110 Int_t        iPWG3promptd0     = 1;      // prompt D0 analysis (PWG3D2H)
 111 Int_t       iPWG3MuonTrain     = 1;      // Muon analysis train
 112 Int_t       iPWG2femto         = 0;      // Femtoscopy task (PWG2)
 113 Int_t       iPWG2spectra       = 0;      // Spectra tasks (PWG2
 114 Int_t        iPWG2protons      = 1;         // Proton-antiproton analysis
 115 Int_t        iPWG2checkcascade = 1;         // Check cascades task
 116 Int_t        iPWG2perfcascade  = 1;         // Check performance cascade
 117 Int_t        iPWG2checkv0      = 1;         // Check V0 task
 118 Int_t        iPWG2strange      = 1;         // Strangeness task
 119 Int_t        iPWG2central      = 1;         // Anisothropy in central collisions
 120 Int_t       iPWG2flow          = 0;      // Flow analysis tasks (PWG2)
 121 Int_t       iPWG2res           = 0;      // Resonances task (PWG2)
 122 Int_t        iPWG2rsneff       = 0;      // Resonances efficiency
 123 Int_t       iPWG2kink          = 0;      // Kink analysis tasks (PWG2)
 124 Int_t        iPWG2kinkESDMC    = 1;         // Kink ESD-MC comparison (PWG2)
 125 Int_t        iPWG2kinkLSKstar  = 1;      // Kink like-sign K* (PWG2)
 126 Int_t        iPWG2kinkLSL1520  = 1;      // Kink like-sign L1520 (PWG2)
 127 Int_t        iPWG2kinkLSPhi    = 1;      // Kink like-sign Phi (PWG2)
 128 Int_t        iPWG2kinkKstarESD = 1;      // Kink Kstar ESD (PWG2)
 129 Int_t        iPWG2kinkKstarMC  = 1;      // Kink Kstar MC (PWG2)
 130 Int_t        iPWG2kinkL1520ESD = 1;      // Kink L1520 ESD (PWG2)
 131 Int_t        iPWG2kinkL1520MC  = 1;      // Kink L1520 MC (PWG2)
 132 Int_t        iPWG2kinkPhiESD   = 1;      // Kink resonances Phi ESD (PWG2)
 133 Int_t        iPWG2kinkPhiMC    = 1;      // Kink resonances Phi MC (PWG2)
 134 Int_t       iPWG2evchar        = 0;      // Event characteristics (PWG2)
 135 Int_t       iPWG2unicor        = 0;      // Unicor analysis (PWG2)
 136 Int_t       iPWG2forward       = 0;      // FMD analysis (PWG2)
 137
 138 // ### Configuration macros used for each module
 139 //==============================================================================
 140 TString     configPWG2femto    = "$ALICE_ROOT/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/Train/Train3/ConfigFemtoAnalysis.C";
 141 //TString     configPWG3d2h      = "$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/ConfigVertexingHF_highmult.C";
 142 //TString     configPWG3d2h      = "$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/ConfigVertexingHF.C";
 143 TString     configPWG3d2h      = "$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/ConfigVertexingHF_pp2009.C";
 144 // Temporaries.
 145 TString anaPars = "";
 146 TString anaLibs = "";
 147 // Function signatures
 148 class AliAnalysisAlien;
 149
 150 //______________________________________________________________________________
 151 void AnalysisTrainNew(const char *analysis_mode="grid",
 152                       const char *plugin_mode="full",
 153                       const char *config_file="")
 154 {
 155 // Main analysis train macro. If a configuration file is provided, all parameters
 156 // are taken from there but may be altered by CheckModuleFlags.
 157    if (strlen(config_file) && !LoadConfig(config_file)) return;
 158    TString smode(analysis_mode);
 159    smode.ToUpper();
 160    // Check compatibility of selected modules
 161    CheckModuleFlags(smode);
 162    if (saveTrain)              WriteConfig();
 163
 164    printf("==================================================================\n");
 165    printf("===========    RUNNING ANALYSIS TRAIN %s IN %s MODE   ==========\n", train_name.Data(),smode.Data());
 166    printf("==================================================================\n");
 167    printf("=  Configuring analysis train for:                               =\n");
 168    if (iAODanalysis) printf("=  AOD analysis                                                  =\n");
 169    else              printf("=  ESD analysis                                                  =\n");
 170    if (iESDfilter)   printf("=  ESD filter                                                    =\n");
 171    if (iMUONcopyAOD) printf("=  MUON copy AOD                                                 =\n");
 172    if (iJETAN)       printf("=  Jet analysis                                                  =\n");
 173    if (iJETANdelta)  printf("=     Jet delta AODs                                             =\n");
 174    if (iPWG2spectra) {
 175       printf("=  PWG2 SPECTRA tasks :                                          =\n");
 176       if (iPWG2protons)      printf("=     PWG2 proton-antiproton                                     =\n");
 177       if (iPWG2checkcascade) printf("=     PWG2 check cascades                                        =\n");
 178       if (iPWG2perfcascade)  printf("=     PWG2 performance cascades                                  =\n");
 179       if (iPWG2checkv0)      printf("=     PWG2 check V0                                              =\n");
 180       if (iPWG2strange)      printf("=     PWG2 strangeness                                           =\n");
 181       if (iPWG2central)      printf("=     PWG2 central                                               =\n");
 182    }
 183    if (iPWG2femto) {
 184       printf("=  PWG2 femtoscopy                                               =\n");
 185       printf("   +++ configured by: %s\n", configPWG2femto.Data());
 186    }
 187    if (iPWG2flow)    printf("=  PWG2 flow                                                     =\n");
 188    if (iPWG2res)     printf("=  PWG2 resonances                                               =\n");
 189       if (iPWG2rsneff)    printf("=     PWG2 resonances efficiency                                    =\n");
 190    if (iPWG2kink) {
 191       printf("=  PWG2 kink analysis tasks:                                     =\n");
 192       if (iPWG2kinkESDMC)    printf("=     PWG2 ESD-MC kinks                                          =\n");
 193       if (iPWG2kinkLSKstar)  printf("=     PWG2 kink like-sign analysis K*                            =\n");
 194       if (iPWG2kinkLSL1520)  printf("=     PWG2 kink like-sign analysis L1520                         =\n");
 195       if (iPWG2kinkLSPhi)    printf("=     PWG2 kink like-sign analysis Phi                           =\n");
 196       if (iPWG2kinkKstarESD) printf("=     PWG2 kink Kstar ESD analysis                               =\n");
 197       if (iPWG2kinkKstarMC)  printf("=     PWG2 kink Kstar MC analysis                                =\n");
 198       if (iPWG2kinkL1520ESD) printf("=     PWG2 kink L1520 ESD analysis                               =\n");
 199       if (iPWG2kinkL1520MC)  printf("=     PWG2 kink L1520 MC analysis                                =\n");
 200       if (iPWG2kinkPhiESD) printf("=     PWG2 kink Phi ESD analysis                                 =\n");
 201       if (iPWG2kinkPhiMC)  printf("=     PWG2 kink Phi MC analysis                                  =\n");
 202   }
 203    if (iPWG2evchar)    printf("=  PWG2 event characteristics                                    =\n");
 204    if (iPWG2unicor)    printf("=  PWG2 Unicor analysis                                          =\n");
 205    if (iPWG2forward)   printf("=  PWG2 forward: sharing, density, bkg. correction, dNdEta       =\n");
 206    if (iPWG3vertexing) printf("=  PWG3 vertexing                                                =\n");
 207    if (iPWG3hfe)       printf("=  PWG3 electrons                                                =\n");
 208    if (iPWG3d2h) {
 209       printf("=  PWG3 D0->2 hadrons tasks                                      =\n");
 210       printf("   +++ configured by: %s\n", configPWG3d2h.Data());
 211       if (iPWG3d0mass)       printf("=     PWG3 D0 mass                                               =\n");
 212       if (iPWG3d0massLS)     printf("=     PWG3 D0 mass LS                                            =\n");
 213       if (iPWG3dplus)        printf("=     PWG3 D+ analysis                                           =\n");
 214       if (iPWG3LSd0)         printf("=     PWG3 LS D0                                                 =\n");
 215       if (iPWG3LSjpsi)       printf("=     PWG3 LS J/Psi                                              =\n");
 216       if (iPWG3CFd0)         printf("=     PWG3 CF D0                                                 =\n");
 217       if (iPWG3promptd0)     printf("=     PWG3 prompt D0                                             =\n");
 218    }
 219    if (iPWG3MuonTrain) printf("=  PWG3 muon train                                               =\n");
 220    if (iPWG4partcorr)  printf("=  PWG4 gamma-hadron, pi0 and gamma-jet correlations             =\n");
 221    if (iPWG4gammaconv) printf("=  PWG4 gamma conversion                                         =\n");
 222    if (iPWG4omega3pi)  printf("=  PWG4 omega to 3 pions                                         =\n");
 223    printf("==================================================================\n");
 224    printf(":: use physics selection: %d\n", (UInt_t)usePhysicsSelection);
 225    printf(":: use xrootd tweaks:     %d\n", (UInt_t)useFastReadOption);
 226    printf(":: use overwrite xml    : %d\n", (UInt_t)useOverwriteMode);
 227    printf(":: use merge via JDL:     %d\n", (UInt_t)useMergeViaJDL);
 228    printf(":: use MC truth:          %d\n", (UInt_t)useMC);
 229    printf(":: use KINE filter:       %d\n", (UInt_t)useKFILTER);
 230    printf(":: use track references:  %d\n", (UInt_t)useTR);
 231    printf(":: use tags:              %d\n", (UInt_t)useTAGS);
 232    printf(":: use AOD tags:          %d\n", (UInt_t)useAODTAGS);
 233    printf(":: use debugging:         %d\n", (UInt_t)useDBG);
 234    printf(":: use PAR files:         %d\n", (UInt_t)usePAR);
 235    printf(":: use AliEn plugin:      %d\n", (UInt_t)usePLUGIN);
 236
 237    //==========================================================================
 238    // Connect to back-end system
 239    if (!Connect(smode)) {
 240       ::Error("AnalysisTrain", "Could not connect to %s back-end", analysis_mode);
 241       return;
 242    }
 243
 244    // Load common libraries and set include path
 245    if (!LoadCommonLibraries(smode)) {
 246       ::Error("AnalysisTrain", "Could not load common libraries");
 247       return;
 248    }
 249
 250    // Make the analysis manager and connect event handlers
 251    AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("Analysis Train", "Production train");
 252    if (saveProofToAlien) mgr->SetSpecialOutputLocation(proof_outdir);
 253    if (!strcmp(plugin_mode, "test")) mgr->SetNSysInfo(1);
 254    // Load analysis specific libraries
 255    if (!LoadAnalysisLibraries(smode)) {
 256       ::Error("AnalysisTrain", "Could not load analysis libraries");
 257       return;
 258    }
 259
 260    // Create input handler (input container created automatically)
 261    if (iAODanalysis) {
 262    // AOD input handler
 263       AliAODInputHandler *aodH = new AliAODInputHandler();
 264       if (iPWG3d2h) aodH->AddFriend("AliAOD.VertexingHF.root");
 265       mgr->SetInputEventHandler(aodH);
 266    } else {
 267    // ESD input handler
 268       AliESDInputHandler *esdHandler = new AliESDInputHandler();
 269       if (useTAGS) esdHandler->SetReadTags();
 270       mgr->SetInputEventHandler(esdHandler);
 271    }
 272    // Monte Carlo handler
 273    if (useMC && !iAODanalysis) {
 274       AliMCEventHandler* mcHandler = new AliMCEventHandler();
 275       mgr->SetMCtruthEventHandler(mcHandler);
 276       mcHandler->SetReadTR(useTR);
 277    }
 278    // AOD output container, created automatically when setting an AOD handler
 279    if (iAODhandler) {
 280       // AOD output handler
 281       AliAODHandler* aodHandler   = new AliAODHandler();
 282       aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.root");
 283       mgr->SetOutputEventHandler(aodHandler);
 284       if (iAODanalysis) {
 285          aodHandler->SetFillAOD(kFALSE);
 286          aodHandler->SetCreateNonStandardAOD();
 287          if (iJETAN)         aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.Jets.root");
 288 //         if (iPWG3vertexing) aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.VertexingHF.root");
 289       }
 290    }
 291    // Debugging if needed
 292    if (useDBG) mgr->SetDebugLevel(1);
 293    if (saveCanvases) mgr->SetSaveCanvases(kTRUE);
 294
 295    //==========================================================================
 296    // Create the chain. In this example it is created only from ALIEN files but
 297    // can be done to work in batch or grid mode as well.
 298    TChain *chain = CreateChain(smode, plugin_mode);
 299
 300    //==========================================================================
 301    // Load the tasks configuration macros for all wagons. These files are supposed now to be
 302    // in the current workdir, but in AliEn they will be in the file catalog,
 303    // mapped from AliRoot and pecified in the jdl input list.
 304
 305    // For now connection to top input container and common AOD output container
 306    // is done in this macro, but in future these containers will be connected
 307    // from each task configuration macro.
 308
 309    AddAnalysisTasks();
 310
 311    // Run the analysis
 312    //
 313    if (usePLUGIN) {
 314       AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(plugin_mode);
 315       AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->SetGridHandler(alienHandler);
 316    }
 317
 318    if (mgr->InitAnalysis()) {
 319       mgr->PrintStatus();
 320       if (saveTrain || strlen(config_file)) gSystem->ChangeDirectory(train_name);
 321       StartAnalysis(smode, chain);
 322       if (saveTrain && smode=="GRID") {
 323          AliAnalysisAlien *gridhandler = (AliAnalysisAlien*)mgr->GetGridHandler();
 324          TString alien_workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
 325          alien_workdir += train_name;
 326          alien_outdir = gridhandler->GetGridOutputDir();
 327          printf("=== Registering ConfigTrain.C in the work directory <%s> ===\n",
 328                 alien_workdir.Data());
 329          if (AliAnalysisAlien::FileExists(Form("%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data())))
 330             gGrid->Rm(Form("%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data()));
 331          if (strcmp(plugin_mode, "test"))
 332             TFile::Cp(Form("file:%sConfig.C",train_name.Data()), Form("alien://%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data()));
 333       }
 334    }
 335 }
 336
 337 //______________________________________________________________________________
 338 void AddAnalysisTasks()
 339 {
 340 // Add all analysis task wagons to the train
 341    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 342
 343    if (usePhysicsSelection) {
 344    // Physics selection task
 345       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPhysicsSelection.C");
 346       mgr->RegisterExtraFile("event_stat.root");
 347       AddTaskPhysicsSelection(useMC);
 348    }
 349
 350    if (iESDfilter && !iAODanalysis) {
 351       //  ESD filter task configuration.
 352       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskESDFilter.C");
 353       if (iMUONcopyAOD) {
 354          printf("Registering delta AOD file\n");
 355          mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.Muons.root");
 356          mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.Dimuons.root");
 357          AliAnalysisTaskESDfilter *taskesdfilter = AddTaskESDFilter(useKFILTER, kTRUE, kTRUE, usePhysicsSelection);
 358       } else {
 359          AliAnalysisTaskESDfilter *taskesdfilter = AddTaskESDFilter(useKFILTER, kFALSE, kFALSE, usePhysicsSelection);
 360       }
 361    }
 362
 363    // AOD tags
 364    if (useAODTAGS) {
 365       AliAnalysisTaskTagCreator* tagTask = new AliAnalysisTaskTagCreator("AOD Tag Creator");
 366       mgr->AddTask(tagTask);
 367       AliAnalysisDataContainer *coutTags = mgr->CreateContainer("cTag",  TTree::Class(),
 368                                            AliAnalysisManager::kOutputContainer, "AOD.tag.root");
 369       mgr->ConnectInput (tagTask, 0, mgr->GetCommonInputContainer());
 370       mgr->ConnectOutput(tagTask, 1, coutTags);
 371    }
 372
 373 // ********** PWG2 wagons ******************************************************
 374    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 375
 376    // Proton analysis
 377    if (iPWG2spectra) {
 378       // protons
 379       if (iPWG2protons) {
 380         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskProtons.C");
 381         AliAnalysisTaskProtons *taskprotons = AddTaskProtons();
 382         if (!taskprotons) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskProtons cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 383       }
 384       // cascades
 385       if (iPWG2checkcascade) {
 386         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckCascade.C");
 387         AliAnalysisTaskCheckCascade *taskcheckcascade = AddTaskCheckCascade(iCollision);
 388         if (!taskcheckcascade) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckCascade cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 389       }
 390       // v0's
 391       if (iPWG2checkv0) {
 392         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckV0.C");
 393         AliAnalysisTaskCheckV0 *taskcheckV0 = AddTaskCheckV0();
 394         if (!taskcheckV0) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckV0 cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 395       }
 396       // strangeness
 397       if (iPWG2strange) {
 398         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskStrange.C");
 399         AliAnalysisTaskStrange *taskstrange = AddTaskStrange();
 400         if (!taskstrange) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskStrange cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 401       }
 402       // performance cascades
 403       if (iPWG2perfcascade) {
 404         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckPerformanceCascade.C");
 405         AliAnalysisTaskCheckPerformanceCascade *taskperfcascade = AddTaskCheckPerformanceCascade();
 406         if (!taskperfcascade) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckPerformanceCascade cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 407       }
 408        // central
 409       if (iPWG2central) {
 410         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCentral.C");
 411         AliAnalysisTaskCentral *taskcentral = AddTaskCentral();
 412         if (!taskcentral) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCentral cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 413       }
 414   }
 415
 416    // Femtoscopy analysis modules
 417    if (iPWG2femto) {
 418       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/AddTaskFemto.C");
 419       AliAnalysisTaskFemto *taskfemto = AddTaskFemto(configPWG2femto);
 420       if (!taskfemto) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskFemto cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 421    }
 422
 423    // Kink analysis
 424    if (iPWG2kink) {
 425       if (iPWG2kinkESDMC) {
 426         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKink.C");
 427         AliAnalysisKinkESDMC *taskkink1 = AddTaskKink();
 428         if (!taskkink1) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkESDMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 429       }
 430       if (iPWG2kinkLSKstar) {
 431         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignKstar.C");
 432         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink2 = AddTaskKinkResLikeSignKstar();
 433         if (!taskkink2) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 434       }
 435       if (iPWG2kinkLSL1520) {
 436         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignL1520.C");
 437         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink3 = AddTaskKinkResLikeSignL1520();
 438         if (!taskkink3) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 439       }
 440       if (iPWG2kinkLSPhi) {
 441         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignPhi.C");
 442         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink4 = AddTaskKinkResLikeSignPhi();
 443         if (!taskkink4) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 444       }
 445       if (iPWG2kinkKstarESD) {
 446         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceKstarESD.C");
 447         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink5 = AddTaskKinkResonanceKstarESD();
 448         if (!taskkink5) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceKstarESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 449       }
 450       if (iPWG2kinkKstarMC) {
 451         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceKstarMC.C");
 452         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink6 = AddTaskKinkResonanceKstarMC();
 453         if (!taskkink6) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceKstarMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 454       }
 455       if (iPWG2kinkL1520ESD) {
 456         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceL1520ESD.C");
 457         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink7 = AddTaskKinkResonanceL1520ESD();
 458         if (!taskkink7) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceL1520ESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 459       }
 460       if (iPWG2kinkL1520MC) {
 461         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceL1520MC.C");
 462         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink8 = AddTaskKinkResonanceL1520MC();
 463         if (!taskkink8) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceL1520MC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 464       }
 465       if (iPWG2kinkPhiESD) {
 466         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonancePhiESD.C");
 467         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink9 = AddTaskKinkResonancePhiESD();
 468         if (!taskkink9) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonancePhiESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 469       }
 470       if (iPWG2kinkPhiMC) {
 471         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonancePhiMC.C");
 472         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink10 = AddTaskKinkResonancePhiMC();
 473         if (!taskkink10) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonancePhiMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 474       }
 475    }
 476
 477    // Event characterization
 478    if (iPWG2evchar) {
 479       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/EVCHAR/macros/AddTaskSPDdNdEta.C");
 480       AliAnalysisTaskSPDdNdEta *taskspddndeta = AddTaskSPDdNdEta();
 481       if (!taskspddndeta) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskSPDdNdEta cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 482       taskspddndeta->SetReadMC(useMC);
 483    }
 484
 485    // Unicor
 486    if (iPWG2unicor) {
 487       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/UNICOR/AddTaskUnicor.C");
 488       AliAnalysisTaskUnicor *taskunicor = AddTaskUnicor();
 489       if (!taskunicor) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskUnicor cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 490    }
 491
 492    // FMD
 493    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("forward.root");
 494    if (iPWG2forward) {
 495       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FORWARD/analysis/AddTaskFMD.C");
 496       AliFMDAnalysisTaskSE *taskfmd = AddTaskFMD();
 497       if (!taskfmd) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliFMDAnalysisTaskSE cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 498    }
 499    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 500
 501    // Flow analysis
 502    if (iPWG2flow) {
 503       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FLOW/macros/AddTaskFlow.C");
 504       Bool_t SP       = kTRUE;
 505       Bool_t LYZ1SUM  = kTRUE;
 506       Bool_t LYZ1PROD = kTRUE;
 507       Bool_t LYZ2SUM  = kFALSE;
 508       Bool_t LYZ2PROD = kFALSE;
 509       Bool_t LYZEP    = kFALSE;
 510       Bool_t GFC      = kTRUE;
 511       Bool_t QC       = kTRUE;
 512       Bool_t FQD      = kFALSE;
 513       Bool_t MCEP     = kFALSE; //does not work yet 24/12/08
 514       Bool_t kineFromESD = kTRUE;
 515       Bool_t METHODS[] = {SP,LYZ1SUM,LYZ1PROD,LYZ2SUM,LYZ2PROD,LYZEP,GFC,QC,FQD,MCEP};
 516       // Analysis type can be ESD, AOD, MC, ESDMC0, ESDMC1
 517       TString type = "AOD";
 518       if (!iAODanalysis) type = "ESD";
 519       // Boolean to fill/not fill the QA histograms
 520       Bool_t QA = kTRUE;
 521       // Boolean to use/not use weights for the Q vector
 522       Bool_t WEIGHTS[] = {kFALSE,kFALSE,kFALSE}; //Phi, v'(pt), v'(eta)
 523       AliAnalysisTaskFlowEvent* taskFE = AddTaskFlow(type,METHODS,QA,WEIGHTS);
 524       if (!taskFE) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskFlowEvent cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 525    }
 526
 527    // PWG2 resonances
 528    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("resonances.root");
 529    if (iPWG2res) {
 530       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train/AddAnalysisTaskRsnNew.C");
 531       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train/AddAnalysisTaskRsnEffNew.C");
 532       TString path = gROOT->GetMacroPath();
 533       path += ":$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train";
 534       gROOT->SetMacroPath(path);
 535       AddAnalysisTaskRsn(kTRUE);
 536       if (iPWG2rsneff) AddAnalysisTaskRsnEff();
 537    }
 538    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 539
 540 // ********** PWG3 wagons ******************************************************
 541    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG3histograms.root");
 542
 543    // PWG3 vertexing
 544    if (iPWG3vertexing) {
 545       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/AddTaskVertexingHF.C");
 546       if (!iPWG3d2h) TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(configPWG3d2h.Data()), Form("%s/ConfigVertexingHF.C", train_name.Data()));
 547       AliAnalysisTaskSEVertexingHF *taskvertexingHF = AddTaskVertexingHF();
 548       if (!taskvertexingHF) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskSEVertexingHF cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 549       else mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.VertexingHF.root");
 550    }
 551
 552    // PWG3 electrons
 553    if (iPWG3hfe) {
 554       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/hfe/AddTaskHFE.C");
 555       AliAnalysisTaskHFE *taskHFE = AddTaskHFE();
 556       if (!taskHFE) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskHFE cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 557    }
 558
 559    // PWG3 D2h
 560    if (iPWG3d2h) {
 561       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/AddD2HTrain.C");
 562       TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(configPWG3d2h.Data()), Form("%s/ConfigVertexingHF.C", train_name.Data()));
 563       AddD2HTrain(iPWG3d0mass,iPWG3d0massLS,iPWG3dplus, iPWG3LSd0, iPWG3LSjpsi, iPWG3CFd0, iPWG3promptd0);
 564    }
 565
 566    // PWG3 muon
 567    if (iPWG3MuonTrain) {
 568       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/muon/AddPWG3MuonTrain.C");
 569       // iESDAnalysis, iAODAnalysis -> flags to select if the train is AOD or ESD based
 570       // iMuonDistributions, iSingleMuonANAlysis -> flags to switch on/off analysis wagons
 571       Int_t isESDAnalysis = (iAODanalysis)?0:1;
 572       Int_t isAODAnalysis = (iAODanalysis)?1:0;
 573       Int_t addMuonDistributions = 1;
 574       Int_t addSingleMuonAnalysis = 1;
 575       Int_t addMuonHFAnalysis = 1;
 576       Int_t ntaskmuon = AddPWG3MuonTrain(isESDAnalysis,isAODAnalysis,addMuonDistributions,addSingleMuonAnalysis,addMuonHFAnalysis);
 577       printf("Added %d muon tasks\n", ntaskmuon);
 578    }
 579
 580 // ********** PWG4 wagons ******************************************************
 581    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG4histograms.root");
 582
 583     // Jet analysis
 584    if (iJETAN) {
 585       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskJets.C");
 586       if (!iAODanalysis) {
 587          // Default jet reconstructor running on ESD's
 588          AliAnalysisTaskJets * taskjets = AddTaskJets();
 589          if (!taskjets) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskJets cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 590          if (iJETANdelta) {
 591             AddTaskJetsDelta("AliAOD.Jets.root");
 592             mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.Jets.root");
 593          }
 594       } else {
 595          // AOD-based analysis. Add all reconstructors to write into delta AOD's
 596          if (iJETANdelta) {
 597             Int_t ntasksjets = AddTaskJetsDelta("AliAOD.Jets.root");
 598             if (ntasksjets) printf("Added %d jet reconstructors\n", ntasksjets);
 599          }
 600       }
 601    }
 602    // PWG4 hadron correlations
 603    if (iPWG4partcorr) {
 604       Bool_t isSimulation = (runOnData)?kFALSE:kTRUE;
 605       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskPartCorr.C");
 606       AliAnalysisTaskParticleCorrelation *taskpartcorrPHOS = AddTaskPartCorr("AOD", "PHOS", kFALSE, isSimulation);
 607       if (!taskpartcorrPHOS) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskParticleCorrelation PHOS cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 608       AliAnalysisTaskParticleCorrelation *taskpartcorrEMCAL = AddTaskPartCorr("AOD", "EMCAL", kFALSE, isSimulation);
 609       if (!taskpartcorrEMCAL) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskParticleCorrelation EMCAL cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 610       mgr->RegisterExtraFile("deltaAODPartCorr.root");
 611    }
 612
 613    // PWG4 gamma conversion analysis
 614    if (iPWG4gammaconv) {
 615       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskGammaConversion.C");
 616       TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();
 617       gSystem->ChangeDirectory(gSystem->ExpandPathName("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/"));
 618       TString gcArguments = "-run-on-train -run-jet -run-chic -run-neutralmeson -run-cf";
 619       AliAnalysisTaskGammaConversion * taskGammaConversion = AddTaskGammaConversion(gcArguments,mgr->GetCommonInputContainer());
 620       gSystem->ChangeDirectory(cdir);
 621       if (!taskGammaConversion) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskGammaConversion cannot run for these train conditions - EXCLUDED");
 622    }
 623
 624    // PWG4 omega to 3 pions analysis
 625    if (iPWG4omega3pi) {
 626       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskomega3pi.C");
 627       AliAnalysisTaskOmegaPi0PiPi *taskomega3pi = AddTaskomega3pi();
 628       if (!taskomega3pi) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskomega3pi cannot run for these train conditions - EXCLUDED");
 629    }
 630 }
 631
 632 //______________________________________________________________________________
 633 void StartAnalysis(const char *mode, TChain *chain) {
 634 // Start analysis.
 635    Int_t imode = -1;
 636    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 637    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 638    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 639    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 640    switch (imode) {
 641       case 0:
 642          if (!chain) {
 643             ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Cannot create the chain");
 644             return;
 645          }
 646          mgr->StartAnalysis(mode, chain);
 647          return;
 648       case 1:
 649          if (!proof_dataset.Length()) {
 650             ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "proof_dataset is empty");
 651             return;
 652          }
 653          mgr->StartAnalysis(mode, proof_dataset, 1000);
 654          return;
 655       case 2:
 656          if (usePLUGIN) {
 657             if (!mgr->GetGridHandler()) {
 658                ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Grid plugin not initialized");
 659                return;
 660             }
 661             mgr->StartAnalysis("grid");
 662          } else {
 663             if (!chain) {
 664                ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Cannot create the chain");
 665                return;
 666             }
 667             mgr->StartAnalysis(mode, chain);
 668          }
 669          return;
 670    }
 671 }
 672
 673 //______________________________________________________________________________
 674 void CheckModuleFlags(const char *mode) {
 675 // Checks selected modules and insure compatibility
 676    Int_t imode = -1;
 677    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 678    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 679    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 680    if (!iJETAN) iJETANdelta = 0;
 681    if (imode==1) {
 682       if (!usePAR) {
 683          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PAR files enabled due to PROOF analysis");
 684          usePAR = kTRUE;
 685       }
 686    }
 687    if (imode != 2) {
 688       ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "AliEn plugin disabled since not in GRID mode");
 689       usePLUGIN = kFALSE;
 690    }
 691    if (iAODanalysis) {
 692    // AOD analysis
 693       if (useMC)
 694          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "MC usage disabled in analysis on AOD's");
 695       if (useAODTAGS)
 696          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "AOD tags usage disabled in analysis on AOD's");
 697       useMC = kFALSE;
 698       useTR = kFALSE;
 699       useAODTAGS = kFALSE;
 700       if (iESDfilter)
 701          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "ESD filter disabled in analysis on AOD's");
 702       iESDfilter   = 0;
 703       if (!iAODhandler) {
 704          if (iJETAN)
 705             ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "JETAN disabled in analysis on AOD's without AOD handler");
 706          iJETAN = 0;
 707          iJETANdelta = 0;
 708       }
 709       // Disable tasks that do not work yet on AOD data
 710       if (iPWG4gammaconv)
 711          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4gammaconv disabled on AOD's without AOD handler");
 712       iPWG4gammaconv = 0;
 713       if (iPWG2central)
 714          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2central disabled on AOD's");
 715          iPWG2central = 0;
 716       if (iPWG2flow)
 717          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2flow disabled on AOD's");
 718          iPWG2flow = 0;
 719       if (iPWG2femto)
 720          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2femto disabled on AOD's");
 721          iPWG2femto = 0;
 722       if (iPWG2res)
 723          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2res disabled on AOD's");
 724          iPWG2res = 0;
 725        if (iPWG2rsneff)
 726          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2rsneff disabled on AOD's");
 727          iPWG2rsneff = 0;
 728      if (iPWG2kink)
 729          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2kink disabled in analysis on AOD's");
 730          iPWG2kink = 0;
 731       if (iPWG2unicor)
 732          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2unicor disabled in analysis on AOD's");
 733          iPWG2unicor = 0;
 734       if (iPWG2evchar)
 735          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4evchar disabled on AOD's");
 736          iPWG2evchar = 0;
 737       if (iPWG2forward)
 738          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2forward disabled in analysis on AOD's");
 739          iPWG2forward = 0;
 740       if (iPWG3hfe)
 741          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG3hfe disabled on AOD's");
 742          iPWG3hfe = 0;
 743       if (iPWG4omega3pi)
 744          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4omega3pi disabled on AOD's");
 745          iPWG4omega3pi = 0;
 746    } else {
 747    // ESD analysis
 748       if (!useMC) useTR = kFALSE;
 749       if (!useTR) {
 750          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "iPWG2evchar disabled if not reading track references");
 751          iPWG2evchar = 0;
 752       }
 753    }
 754    if (!useMC) {
 755       if (iPWG2perfcascade)
 756          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2perfcascade disabled without MC info");
 757       iPWG2perfcascade = 0;
 758       if (iPWG2central)
 759          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2central disabled without MC info");
 760          iPWG2central = 0;
 761    }
 762    if (iJETAN && !iAODanalysis) iESDfilter=1;
 763    if (iESDfilter) {iAODhandler=1; useCORRFW = kTRUE;}
 764    if (iPWG2spectra || iPWG2flow || iPWG3vertexing || iPWG3hfe || iPWG2res || iPWG2rsneff) useCORRFW = kTRUE;
 765    if (useKFILTER && !useMC) useKFILTER = kFALSE;
 766    if (useAODTAGS && !iAODhandler) useAODTAGS = kFALSE;
 767 }
 768
 769 //______________________________________________________________________________
 770 Bool_t Connect(const char *mode) {
 771 // Connect <username> to the back-end system.
 772    Int_t imode = -1;
 773    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 774    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 775    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 776    TString username = gSystem->Getenv("alien_API_USER");
 777    switch (imode) {
 778       case 0:
 779          break;
 780       case 1:
 781          if  (!username.Length()) {
 782             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Make sure you:\n \
 783                            1. Have called: alien-token-init <username>\n \
 784                            2. Have called: >source /tmp/gclient_env_$UID");
 785             return kFALSE;
 786          }
 787          ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Connecting user <%s> to PROOF cluster <%s>",
 788                 username.Data(), proof_cluster.Data());
 789          gEnv->SetValue("XSec.GSI.DelegProxy", "2");
 790 //         TProof::Open(Form("%s@%s:31093", username.Data(), proof_cluster.Data()));
 791          TProof::Open(Form("%s@%s", username.Data(), proof_cluster.Data()));
 792          if (!gProof) {
 793             if (strcmp(gSystem->Getenv("XrdSecGSISRVNAMES"), "lxfsrd0506.cern.ch"))
 794                ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Environment XrdSecGSISRVNAMES different from lxfsrd0506.cern.ch");
 795             return kFALSE;
 796          }
 797          TGrid::Connect("alien://");
 798          if (gGrid) {
 799             TString homedir = gGrid->GetHomeDirectory();
 800             TString workdir = homedir + train_name;
 801             if (!gGrid->Cd(workdir)) {
 802                gGrid->Cd(homedir);
 803                if (gGrid->Mkdir(workdir)) {
 804                   gGrid->Cd(train_name);
 805                   ::Info("AnalysisTrainNew::Connect()", "Directory %s created", gGrid->Pwd());
 806                }
 807             }
 808             gGrid->Mkdir("proof_output");
 809             gGrid->Cd("proof_output");
 810             proof_outdir = Form("alien://%s", gGrid->Pwd());
 811          }
 812          break;
 813       case 2:
 814          if (usePLUGIN && !gSystem->Getenv("alien_CLOSE_SE")) {
 815             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode),
 816                            "When using the AliEn plugin it is preferable to define the \
 817                            variable alien_CLOSE_SE in your environment.");
 818             return kFALSE;
 819          }
 820          ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Connecting user <%s> to AliEn ...",
 821                 username.Data());
 822          TGrid::Connect("alien://");
 823          if (!gGrid || !gGrid->IsConnected()) return kFALSE;
 824          break;
 825       default:
 826          ::Error("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Unknown run mode: %s", mode);
 827          return kFALSE;
 828    }
 829    ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect","Connected in %s mode", mode);
 830    return kTRUE;
 831 }
 832
 833 //______________________________________________________________________________
 834 Bool_t LoadCommonLibraries(const char *mode)
 835 {
 836 // Load common analysis libraries.
 837    Int_t imode = -1;
 838    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 839    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 840    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 841    if (!gSystem->Getenv("ALICE_ROOT")) {
 842       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadCommonLibraries", "Analysis train requires that analysis libraries are compiled with a local AliRoot");
 843       return kFALSE;
 844    }
 845    Bool_t success = kTRUE;
 846    // ROOT libraries
 847    gSystem->Load("libTree.so");
 848    gSystem->Load("libGeom.so");
 849    gSystem->Load("libVMC.so");
 850    gSystem->Load("libPhysics.so");
 851    gSystem->Load("libMinuit.so");
 852
 853    // Load framework classes. Par option ignored here.
 854    switch (imode) {
 855       case 0:
 856       case 2:
 857          if (useCPAR) {
 858             success &= LoadLibrary("STEERBase", mode, kTRUE);
 859             success &= LoadLibrary("ESD", mode, kTRUE);
 860             success &= LoadLibrary("AOD", mode, kTRUE);
 861             success &= LoadLibrary("ANALYSIS", mode, kTRUE);
 862             success &= LoadLibrary("ANALYSISalice", mode, kTRUE);
 863             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode, kTRUE);
 864          } else {
 865             success &= LoadLibrary("libSTEERBase.so", mode);
 866             success &= LoadLibrary("libESD.so", mode);
 867             success &= LoadLibrary("libAOD.so", mode);
 868             success &= LoadLibrary("libANALYSIS.so", mode);
 869             success &= LoadLibrary("libANALYSISalice.so", mode);
 870             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("libCORRFW.so", mode);
 871             gROOT->ProcessLine(".include $ALICE_ROOT/include");
 872          }
 873          break;
 874       case 1:
 875          Int_t ires = -1;
 876          if (useAFPAR && !gSystem->AccessPathName(AFversion)) ires = gProof->UploadPackage(AFversion);
 877          if (ires < 0) {
 878             success &= LoadLibrary("STEERBase", mode);
 879             success &= LoadLibrary("ESD", mode);
 880             success &= LoadLibrary("AOD", mode);
 881             success &= LoadLibrary("ANALYSIS", mode);
 882             success &= LoadLibrary("ANALYSISalice", mode);
 883             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode);
 884          } else {
 885             ires = gProof->EnablePackage(AFversion);
 886             if (ires<0) success = kFALSE;
 887             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode);
 888          }
 889          break;
 890       default:
 891          ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadCommonLibraries", "Unknown run mode: %s", mode);
 892          return kFALSE;
 893    }
 894    if (success) {
 895       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Load common libraries:    SUCCESS");
 896       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Include path for Aclic compilation:\n%s",
 897               gSystem->GetIncludePath());
 898    } else {
 899       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Load common libraries:    FAILED");
 900    }
 901
 902    return success;
 903 }
 904
 905 //______________________________________________________________________________
 906 Bool_t LoadAnalysisLibraries(const char *mode)
 907 {
 908 // Load common analysis libraries.
 909    Bool_t success = kTRUE;
 910    if (iESDfilter || iPWG3MuonTrain) {
 911       if (!LoadLibrary("PWG3base", mode, kTRUE) ||
 912           !LoadLibrary("PWG3muon", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 913    }
 914    // JETAN
 915    if (iJETAN) {
 916       if (!LoadLibrary("JETAN", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 917    }
 918    if (iJETANdelta) {
 919       if (!LoadLibrary("JETAN", mode, kTRUE) ||
 920           !LoadLibrary("CGAL", mode, kTRUE) ||
 921           !LoadLibrary("fastjet", mode, kTRUE) ||
 922           !LoadLibrary("siscone", mode, kTRUE) ||
 923           !LoadLibrary("SISConePlugin", mode, kTRUE) ||
 924           !LoadLibrary("FASTJETAN", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 925    }
 926    // PWG4 particle correlations
 927    if (iPWG4partcorr) {
 928       if (!LoadLibrary("EMCALUtils", mode, kTRUE) ||
 929           !LoadLibrary("PHOSUtils", mode, kTRUE) ||
 930           !LoadLibrary("PWG4PartCorrBase", mode, kTRUE) ||
 931           !LoadLibrary("PWG4PartCorrDep", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 932    }
 933    // PWG4 gamma conversion
 934    if (iPWG4gammaconv) {
 935       if (!LoadLibrary("PWG4GammaConv", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 936    }
 937    // PWG4 omega to 3 pions
 938    if (iPWG4omega3pi) {
 939       if (!LoadLibrary("PWG4omega3pi", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 940    }
 941    // PWG2 task protons
 942    if (iPWG2spectra) {
 943       if (!LoadLibrary("PWG2spectra", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 944    }
 945    // PWG2 flow
 946    if (iPWG2flow) {
 947       if (!LoadLibrary("PWG2flowCommon", mode, kTRUE) ||
 948           !LoadLibrary("PWG2flowTasks", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 949    }
 950    // PWG2 resonances
 951    if (iPWG2res || iPWG2rsneff) {
 952       if (!LoadLibrary("PWG2resonances", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 953    }
 954    // PWG2 kink
 955    if (iPWG2kink) {
 956       if (!LoadLibrary("PWG2kink", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 957    }
 958    // PWG2 unicor
 959    if (iPWG2unicor) {
 960       if (!LoadLibrary("PWG2unicor", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 961    }
 962    // PWG2 evchar
 963    if (iPWG2evchar) {
 964       if (!LoadLibrary("PWG2evchar", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 965    }
 966    // PWG2 femtoscopy
 967    if (iPWG2femto) {
 968       if (!LoadLibrary("PWG2AOD", mode, kTRUE) ||
 969           !LoadLibrary("PWG2femtoscopy", mode, kTRUE) ||
 970           !LoadLibrary("PWG2femtoscopyUser", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 971 //      TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName("$(ALICE_ROOT)/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/ConfigFemtoAnalysis.C"), Form("%s/ConfigFemtoAnalysis.C", train_name.Data()));
 972 //      anaLibs += "ConfigFemtoAnalysis.C ";
 973    }
 974    // PWG2 FORWARD
 975    if (iPWG2forward) {
 976       if (!LoadLibrary("PWG2forward", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 977    }
 978    // PWG3 Vertexing HF
 979    if (iPWG3vertexing || iPWG3d2h) {
 980       if (!LoadLibrary("PWG3base", mode, kTRUE) ||
 981           !LoadLibrary("PWG3vertexingHF", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 982    }
 983    // PWG3 hfe
 984    if (iPWG3hfe) {
 985       if (!LoadLibrary("PWG3hfe", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 986    }
 987
 988    ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadAnalysisLibraries", "Load other libraries:   SUCCESS");
 989    return kTRUE;
 990 }
 991
 992 //______________________________________________________________________________
 993 Bool_t LoadLibrary(const char *module, const char *mode, Bool_t rec=kFALSE)
 994 {
 995 // Load a module library in a given mode. Reports success.
 996    Int_t imode = -1;
 997    Int_t result;
 998    TString smodule(module);
 999    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
1000    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
1001    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
1002    TString mod(module);
1003    if (!mod.Length()) {
1004       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Empty module name");
1005       return kFALSE;
1006    }
1007    // If a library is specified, just load it
1008    if (smodule.EndsWith(".so")) {
1009       mod.Remove(mod.Index(".so"));
1010       result = gSystem->Load(mod);
1011       if (result < 0) {
1012          ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not load library %s", module);
1013          return kFALSE;
1014       }
1015       if (rec) anaLibs += Form("%s.so ",mod.Data());
1016       return kTRUE;
1017    }
1018    // Check if the library is already loaded
1019    if (strlen(gSystem->GetLibraries(Form("%s.so", module), "", kFALSE)) > 0)
1020       return kTRUE;
1021    switch (imode) {
1022       case 0:
1023       case 2:
1024          if (usePAR) {
1025             result = SetupPar(module);
1026             if (rec) anaPars += Form("%s.par ", module);
1027          } else {
1028             result = gSystem->Load(Form("lib%s.so", module));
1029             if (rec) anaLibs += Form("lib%s.so ", module);
1030          }
1031          break;
1032       case 1:
1033          result = gProof->UploadPackage(module);
1034          if (result<0) {
1035             result = gProof->UploadPackage(gSystem->ExpandPathName(Form("$ALICE_ROOT/%s.par", module)));
1036             if (result<0) {
1037                ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not find module %s.par in current directory nor in $ALICE_ROOT", module);
1038                return kFALSE;
1039             }
1040          }
1041          result = gProof->EnablePackage(module);
1042          break;
1043       default:
1044          return kFALSE;
1045    }
1046    if (result < 0) {
1047       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not load module %s", module);
1048       return kFALSE;
1049    }
1050    return kTRUE;
1051 }
1052
1053
1054 //______________________________________________________________________________
1055 TChain *CreateChain(const char *mode, const char *plugin_mode)
1056 {
1057 // Create the input chain
1058    Int_t imode = -1;
1059    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
1060    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
1061    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
1062    TChain *chain = NULL;
1063    // Local chain
1064    switch (imode) {
1065       case 0:
1066          if (iAODanalysis) {
1067             if (!local_xmldataset.Length()) {
1068                // Local AOD
1069                chain = new TChain("aodTree");
1070                if (gSystem->AccessPathName("data/AliAOD.root"))
1071                   ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChain", "File: AliAOD.root not in ./data dir");
1072                else {
1073                   if (!saveTrain) chain->Add("data/AliAOD.root");
1074                   else            chain->Add("../data/AliAOD.root");
1075                }
1076             } else {
1077                // Interactive AOD
1078                chain = CreateChainSingle(local_xmldataset, "aodTree");
1079             }
1080          } else {
1081             if (!local_xmldataset.Length()) {
1082                // Local ESD
1083                chain = new TChain("esdTree");
1084                if (gSystem->AccessPathName("data/AliESDs.root"))
1085                   ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChain", "File: AliESDs.root not in ./data dir");
1086                else {
1087                   if (!saveTrain) chain->Add("data/AliESDs.root");
1088                   else            chain->Add("../data/AliESDs.root");
1089                }
1090             } else {
1091                // Interactive ESD
1092                chain = CreateChainSingle(local_xmldataset, "esdTree");
1093             }
1094          }
1095          break;
1096       case 1:
1097          break;
1098       case 2:
1099          if (usePLUGIN) {
1100 //            AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(plugin_mode);
1101 //            AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->SetGridHandler(alienHandler);
1102          } else {
1103             TString           treeName = "esdTree";
1104             if (iAODanalysis) treeName = "aodTree";
1105             chain = CreateChainSingle("wn.xml", treeName);
1106          }
1107          break;
1108       default:
1109    }
1110    if (chain && chain->GetNtrees()) return chain;
1111    return NULL;
1112 }
1113
1114 //______________________________________________________________________________
1115 TChain* CreateChainSingle(const char* xmlfile, const char *treeName)
1116 {
1117    printf("*******************************\n");
1118    printf("*** Getting the ESD Chain   ***\n");
1119    printf("*******************************\n");
1120    TAlienCollection * myCollection  = TAlienCollection::Open(xmlfile);
1121
1122    if (!myCollection) {
1123       ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChainSingle", "Cannot create an AliEn collection from %s", xmlfile) ;
1124       return NULL ;
1125    }
1126
1127    TChain* chain = new TChain(treeName);
1128    myCollection->Reset() ;
1129    while ( myCollection->Next() ) chain->Add(myCollection->GetTURL("")) ;
1130    chain->ls();
1131    return chain;
1132 }
1133
1134 //______________________________________________________________________________
1135 Int_t SetupPar(char* pararchivename)
1136 {
1137    if (!pararchivename || !strlen(pararchivename)) return -1;
1138    char processline[1024];
1139    if (gSystem->AccessPathName(Form("%s.par", pararchivename))) {
1140       if (!gSystem->AccessPathName(Form("%s/%s.par", gSystem->Getenv("ALICE_ROOT"),pararchivename))) {
1141          ::Info("AnalysisTrainNew.C::SetupPar", "Getting %s.par from $ALICE_ROOT", pararchivename);
1142          TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(Form("$ALICE_ROOT/%s.par", pararchivename)),
1143                    Form("%s.par",pararchivename));
1144       } else {
1145          ::Error("AnalysisTrainNew.C::SetupPar", "Cannot find %s.par", pararchivename);
1146          return -1;
1147       }
1148    }
1149    if (usePLUGIN && saveTrain) gSystem->Exec(Form("ln -s ../%s.par %s",pararchivename, train_name.Data()));
1150    gSystem->Exec(Form("tar xvzf %s.par", pararchivename));
1151
1152    TString ocwd = gSystem->WorkingDirectory();
1153    if (!gSystem->ChangeDirectory(pararchivename)) return -1;
1154
1155    // check for BUILD.sh and execute
1156    if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
1157       printf("*******************************\n");
1158       printf("*** Building PAR archive    ***\n");
1159       printf("*******************************\n");
1160       if (gSystem->Exec("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
1161          Error("runProcess","Cannot Build the PAR Archive! - Abort!");
1162          return -1;
1163       }
1164    }
1165
1166         // check for SETUP.C and execute
1167         if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/SETUP.C")) {
1168             printf("*******************************\n");
1169             printf("*** Setup PAR archive       ***\n");
1170             printf("*******************************\n");
1171             gROOT->Macro("PROOF-INF/SETUP.C");
1172         }
1173         if (!gSystem->ChangeDirectory(ocwd.Data())) return -1;
1174    return 0;
1175 }
1176
1177 //______________________________________________________________________________
1178 AliAnalysisAlien* CreateAlienHandler(const char *plugin_mode)
1179 {
1180 // Check if user has a valid token, otherwise make one. This has limitations.
1181 // One can always follow the standard procedure of calling alien-token-init then
1182 //   source /tmp/gclient_env_$UID in the current shell.
1183    if (!AliAnalysisGrid::CreateToken()) return NULL;
1184    AliAnalysisAlien *plugin = new AliAnalysisAlien();
1185 // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit" or "terminate")
1186    plugin->SetRunMode(plugin_mode);
1187    if (useProductionMode) plugin->SetProductionMode();
1188    if (!outputSingleFolder.IsNull()) plugin->SetOutputSingleFolder(outputSingleFolder);
1189    plugin->SetJobTag(job_tag);
1190    plugin->SetNtestFiles(1);
1191 //   plugin->SetPreferedSE("ALICE::NIHAM::File");
1192 // Set versions of used packages
1193 //   plugin->SetAPIVersion("V2.4");
1194    plugin->SetAPIVersion("V1.1x");
1195    plugin->SetROOTVersion(root_version);
1196    plugin->SetAliROOTVersion(aliroot_version);
1197 // Declare input data to be processed.
1198 // Method 1: Create automatically XML collections using alien 'find' command.
1199 // Define production directory LFN
1200    plugin->SetGridDataDir(alien_datadir);
1201 // Set data search pattern
1202    if (iAODanalysis) plugin->SetDataPattern("*AliAOD.root");
1203    else              plugin->SetDataPattern("*AliESDs.root");
1204 // ...then add run numbers to be considered
1205    if (!iAODanalysis) plugin->SetRunRange(run_range[0], run_range[1]);
1206 //   for (Int_t i=0; i<10; i++) {
1207 //      if (run_numbers[i]==0) break;
1208 //      plugin->AddRunNumber(run_numbers[i]);
1209 //   }
1210 // Method 2: Declare existing data files (raw collections, xml collections, root file)
1211 // If no path mentioned data is supposed to be in the work directory (see SetGridWorkingDir())
1212 // XML collections added via this method can be combined with the first method if
1213 // the content is compatible (using or not tags)
1214 //   plugin->AddDataFile("tag.xml");
1215 //   plugin->AddDataFile("/alice/data/2008/LHC08c/000057657/raw/Run57657.Merged.RAW.tag.root");
1216 // Define alien work directory where all files will be copied. Relative to alien $HOME.
1217    plugin->SetGridWorkingDir(train_name);
1218 // Declare alien output directory. Relative to working directory.
1219    if (!alien_outdir.Length()) alien_outdir = Form("output_%s",train_name.Data());
1220    plugin->SetGridOutputDir(alien_outdir);
1221
1222    TString ana_sources = "";
1223    TString ana_add = "";
1224    if (usePAR && anaPars.Length()) {
1225       printf("%s\n", anaPars.Data());
1226       TObjArray *arr;
1227       TObjString *objstr;
1228       arr = anaPars.Tokenize(" ");
1229       TIter next(arr);
1230       while ((objstr=(TObjString*)next())) plugin->EnablePackage(objstr->GetString());
1231       delete arr;
1232    }
1233 // Add external packages
1234    if (iJETANdelta) {
1235       plugin->AddExternalPackage("boost::v1_38_0");
1236       plugin->AddExternalPackage("cgal::v3.3.1");
1237       plugin->AddExternalPackage("fastjet::v2.4.0");
1238    }
1239
1240 // Declare the analysis source files names separated by blancs. To be compiled runtime
1241 // using ACLiC on the worker nodes.
1242    ana_sources = ana_sources.Strip();
1243 // Declare all libraries (other than the default ones for the framework. These will be
1244 // loaded by the generated analysis macro. Add all extra files (task .cxx/.h) here.
1245    anaLibs     = anaLibs.Strip();
1246    if (ana_sources.Length()) plugin->SetAnalysisSource(ana_sources);
1247    if (anaLibs.Length())     plugin->SetAdditionalLibs(anaLibs);
1248
1249 // Declare the output file names separated by blancs.
1250 // (can be like: file.root or file.root@ALICE::Niham::File)
1251    plugin->SetDefaultOutputs();
1252    plugin->SetMergeExcludes(mergeExclude);
1253    plugin->SetMaxMergeFiles(maxMergeFiles);
1254    plugin->SetNrunsPerMaster(nRunsPerMaster);
1255 // Optionally define the files to be archived.
1256 //   plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr@ALICE::NIHAM::File root_archive.zip:AliAOD.root,AOD.tag.root@ALICE::NIHAM::File");
1257
1258
1259    // Put default output files to archive
1260    TString listhists = "";
1261    TString listaods  = "";
1262    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
1263    TIter next(mgr->GetOutputs());
1264    AliAnalysisDataContainer *output;
1265    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
1266       const char *filename = output->GetFileName();
1267       if (!(strcmp(filename, "default"))) {
1268          if (!mgr->GetOutputEventHandler()) continue;
1269          filename = mgr->GetOutputEventHandler()->GetOutputFileName();
1270          if (listaods.Length()) listaods += ",";
1271          listaods += filename;
1272          listaods += ",";
1273          listaods += "pyxsec_hists.root";
1274       } else {
1275          if (!strcmp(filename, "pyxsec_hists.root")) continue;
1276          if (listhists.Contains(filename)) continue;
1277          if (listhists.Length()) listhists += ",";
1278          listhists += filename;
1279       }
1280    }
1281    if (mgr->GetExtraFiles().Length()) {
1282       if (listaods.Length()) listaods += ",";
1283       listaods += mgr->GetExtraFiles();
1284       listaods.ReplaceAll(" ", ",");
1285    }
1286    if (listhists.Length()) listhists = Form("hist_archive.zip:%s@%s", listhists.Data(), outputStorages.Data());
1287    if (listaods.Length())  listaods  = Form("aod_archive.zip:%s@%s", listaods.Data(), outputStorages.Data());
1288    if (!listhists.Length() && !listaods.Length()) {
1289       ::Fatal("AnalysisTrainNew", "No task output !");
1290    }
1291    TString outputArchive = Form("log_archive.zip:stderr@%s", outputStorages.Data());
1292    if (listaods.Length()) {
1293       outputArchive += " ";
1294       outputArchive += listaods;
1295    }
1296    if (listhists.Length()) {
1297       outputArchive += " ";
1298       outputArchive += listhists;
1299    }
1300 // Set friends
1301 //   if (iAODanalysis && iPWG3d2h)
1302 //      plugin->SetFriendChainName("AliAOD.VertexingHF.root");
1303    plugin->SetOutputArchive(outputArchive);
1304 // Optionally set a name for the generated analysis macro (default MyAnalysis.C)
1305    plugin->SetAnalysisMacro(Form("%s.C", train_name.Data()));
1306 // Optionally set maximum number of input files/subjob (default 100, put 0 to ignore)
1307    plugin->SetSplitMaxInputFileNumber(nFilesPerJob);
1308 // Optionally set number of failed jobs that will trigger killing waiting sub-jobs.
1309 //   plugin->SetMaxInitFailed(5);
1310 // Optionally resubmit threshold.
1311 //   plugin->SetMasterResubmitThreshold(90);
1312 // Optionally set time to live (default 30000 sec)
1313    plugin->SetTTL(70000);
1314 // Optionally set input format (default xml-single)
1315    plugin->SetInputFormat("xml-single");
1316 // Optionally modify the name of the generated JDL (default analysis.jdl)
1317    plugin->SetJDLName(Form("%s.jdl", train_name.Data()));
1318 // Optionally modify the executable name (default analysis.sh)
1319    plugin->SetExecutable(Form("%s.sh", train_name.Data()));
1320 // Optionally modify job price (default 1)
1321    plugin->SetPrice(1);
1322 // Merge via JDL
1323    plugin->SetMergeViaJDL(useMergeViaJDL);
1324 // Use fastread option
1325    plugin->SetFastReadOption(useFastReadOption);
1326 // UseOverwrite mode
1327    plugin->SetOverwriteMode(useOverwriteMode);
1328 // Optionally modify split mode (default 'se')
1329 //   plugin->SetSplitMode("se");
1330    return plugin;
1331 }
1332
1333 //______________________________________________________________________________
1334 void WriteConfig()
1335 {
1336 // Write train configuration in a file. The file name has the format:
1337 // train_[trainName]_ddMonthyyyy_time.C
1338    if (useDATE) {
1339       gSystem->Exec("date +%d%b%Y_%Hh%M > date.tmp");
1340       ifstream fdate("date.tmp");
1341       if (!fdate.is_open()) {
1342          ::Error("AnalysisTrainNew.C::Export","Could not generate file name");
1343          return;
1344       }
1345       const char date[64];
1346       fdate.getline(date,64);
1347       fdate.close();
1348       gSystem->Exec("rm date.tmp");
1349       train_name = Form("train_%s_%s", train_name.Data(), date);
1350    } else {
1351       train_name = Form("train_%s", train_name.Data());
1352    }
1353    TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();
1354    gSystem->MakeDirectory(train_name);
1355    gSystem->ChangeDirectory(train_name);
1356    ofstream out;
1357    out.open(Form("%sConfig.C",train_name.Data()), ios::out);
1358    if (out.bad()) {
1359       ::Error("AnalysisTrainNew.C::Export", "Cannot open ConfigTrain.C for writing");
1360       return;
1361    }
1362    out << "{" << endl;
1363    out << "   train_name      = " << "\"" << train_name.Data() << "\";" << endl;
1364    out << "   proof_cluster   = " << "\"" << proof_cluster.Data() << "\";" << endl;
1365    out << "   useAFPAR        = " << useAFPAR << ";" << endl;
1366    if (useAFPAR)
1367       out << "   AFversion       = " << AFversion.Data() << ";" << endl;
1368    out << "   proof_dataset   = " << "\"" << proof_dataset.Data() << "\";" << endl;
1369    out << "   usePLUGIN       = " << usePLUGIN << ";" << endl;
1370    out << "   usePAR          = " << usePAR << ";" << endl;
1371    out << "   useCPAR         = " << useCPAR << ";" << endl;
1372    out << "   root_version    = " << "\"" << root_version.Data() << "\";" << endl;
1373    out << "   aliroot_version = " << "\"" << aliroot_version.Data() << "\";" << endl;
1374    out << "   alien_datadir   = " << "\"" << alien_datadir.Data() << "\";" << endl;
1375    if (!alien_outdir.Length()) alien_outdir = Form("output_%s",train_name.Data());
1376    out << "   alien_outdir    = " << "\"" << alien_outdir.Data() << "\";" << endl;
1377    out << "   maxMergeFiles   = " << maxMergeFiles << ";" << endl;
1378    out << "   mergeExclude    = " << "\"" << mergeExclude.Data() << "\";" << endl;
1379    out << "   nRunsPerMaster  = " << nRunsPerMaster << ";" << endl;
1380    out << "   nFilesPerJob    = " << nFilesPerJob << ";" << endl;
1381 //   for (Int_t i=0; i<10; i++) {
1382 //      if (run_numbers[i])
1383 //         out << "   run_numbers[" << i << "]  = " << run_numbers[i] << ";" << endl;
1384 //   }
1385    out << "   run_range[0]    = " << run_range[0] << ";" << endl;
1386    out << "   run_range[1]    = " << run_range[1] << ";" << endl;
1387    out << "   usePhysicsSelection = " << usePhysicsSelection << ";" << endl;
1388    out << "   useMergeViaJDL  = " << useMergeViaJDL << ";" << endl;
1389    out << "   useOverwriteMode  = " << useOverwriteMode << ";" << endl;
1390    out << "   useFastReadOption = " << useFastReadOption << ";" << endl;
1391    out << "   useDBG          = " << useDBG << ";" << endl;
1392    out << "   useMC           = " << useMC << ";" << endl;
1393    out << "   useTAGS         = " << useTAGS << ";" << endl;
1394    out << "   useKFILTER      = " << useKFILTER << ";" << endl;
1395    out << "   useTR           = " << useTR << ";" << endl;
1396    out << "   useCORRFW       = " << useCORRFW << ";" << endl;
1397    out << "   useAODTAGS      = " << useAODTAGS << ";" << endl;
1398    out << "   saveTrain       = " << "kFALSE;" << endl << endl;
1399    out << "   // Analysis modules" << endl;
1400    out << "   iAODanalysis    = " << iAODanalysis << ";" << endl;
1401    out << "   iAODhandler     = " << iAODhandler << ";" << endl;
1402    out << "   iESDfilter      = " << iESDfilter << ";" << endl;
1403    out << "   iMUONcopyAOD    = " << iMUONcopyAOD << ";" << endl;
1404    out << "   iJETAN          = " << iJETAN << ";" << endl;
1405    out << "   iJETANdelta     = " << iJETANdelta << ";" << endl;
1406    out << "   iPWG4partcorr   = " << iPWG4partcorr << ";" << endl;
1407    out << "   iPWG4gammaconv  = " << iPWG4gammaconv << ";" << endl;
1408    out << "   iPWG4omega3pi   = " << iPWG4omega3pi << ";" << endl;
1409    out << "   iPWG3vertexing  = " << iPWG3vertexing << ";" << endl;
1410    out << "   iPWG3hfe        = " << iPWG3hfe << ";" << endl;
1411    out << "   iPWG3d2h        = " << iPWG3d2h << ";" << endl;
1412    out << "     iPWG3d0mass       = " << iPWG3d0mass << ";" << endl;
1413    out << "     iPWG3d0massLS     = " << iPWG3d0massLS << ";" << endl;
1414    out << "     iPWG3dplus        = " << iPWG3dplus << ";" << endl;
1415    out << "     iPWG3LSd0         = " << iPWG3LSd0 << ";" << endl;
1416    out << "     iPWG3LSjpsi       = " << iPWG3LSjpsi << ";" << endl;
1417    out << "     iPWG3CFd0         = " << iPWG3CFd0 << ";" << endl;
1418    out << "     iPWG3promptd0     = " << iPWG3promptd0 << ";" << endl;
1419    out << "   iPWG3MuonTrain      = " << iPWG3MuonTrain << ";" << endl;
1420    out << "   iPWG2femto      = " << iPWG2femto << ";" << endl;
1421    out << "   iPWG2spectra    = " << iPWG2spectra << ";" << endl;
1422    out << "     iPWG2protons      = " << iPWG2protons << ";" << endl;
1423    out << "     iPWG2checkcascade = " << iPWG2checkcascade << ";" << endl;
1424    out << "     iPWG2perfcascade  = " << iPWG2perfcascade << ";" << endl;
1425    out << "     iPWG2checkv0      = " << iPWG2checkv0 << ";" << endl;
1426    out << "     iPWG2strange      = " << iPWG2strange << ";" << endl;
1427    out << "     iPWG2central      = " << iPWG2central << ";" << endl;
1428    out << "   iPWG2flow       = " << iPWG2flow << ";" << endl;
1429    out << "   iPWG2res        = " << iPWG2res << ";" << endl;
1430    out << "     iPWG2rsneff   = " << iPWG2rsneff << ";" << endl;
1431    out << "   iPWG2kink       = " << iPWG2kink << ";" << endl;
1432    out << "     iPWG2kinkESDMC    = " << iPWG2kinkESDMC << ";" << endl;
1433    out << "     iPWG2kinkLSKstar  = " << iPWG2kinkLSKstar << ";" << endl;
1434    out << "     iPWG2kinkLSL1520  = " << iPWG2kinkLSL1520 << ";" << endl;
1435    out << "     iPWG2kinkLSPhi    = " << iPWG2kinkLSPhi << ";" << endl;
1436    out << "     iPWG2kinkKstarESD = " << iPWG2kinkKstarESD << ";" << endl;
1437    out << "     iPWG2kinkKstarMC  = " << iPWG2kinkKstarMC << ";" << endl;
1438    out << "     iPWG2kinkL1520ESD = " << iPWG2kinkL1520ESD << ";" << endl;
1439    out << "     iPWG2kinkL1520MC  = " << iPWG2kinkL1520MC << ";" << endl;
1440    out << "     iPWG2kinkPhiESD   = " << iPWG2kinkPhiESD << ";" << endl;
1441    out << "     iPWG2kinkPhiMC    = " << iPWG2kinkPhiMC << ";" << endl;
1442    out << "   iPWG2unicor     = " << iPWG2unicor << ";" << endl;
1443    out << "   iPWG2evchar     = " << iPWG2evchar << ";" << endl;
1444    out << "   iPWG2forward    = " << iPWG2forward << ";" << endl << endl;
1445    out << "// Configuration fot the wagons" << endl;
1446    out << "   configPWG2femto = \"" << configPWG2femto << "\";" << endl;
1447    out << "   configPWG3d2h   = \"" << configPWG3d2h << "\";" << endl;
1448    out << "}" << endl;
1449    ::Info("AnalysisTrainNew.C::WriteConfig", "Train configuration wrote to file %s", Form("config_%s.C", train_name.Data()));
1450    gSystem->ChangeDirectory(cdir);
1451 }
1452
1453 //______________________________________________________________________________
1454 Bool_t LoadConfig(const char *filename)
1455 {
1456 // Read train configuration from file
1457    if (gSystem->AccessPathName(filename)) {
1458       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadConfig", "Config file name not found");
1459       return kFALSE;
1460    }
1461    gROOT->ProcessLine(Form(".x %s", filename));
1462    ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadConfig", "Train configuration loaded from file %s", filename);
1463    return kTRUE;
1464 }