ANALYSIS/macros/AnalysisTrainNew.C

   1 //===================== ANALYSIS TRAIN =========================================
   2 // To use: copy this macro to your work directory, modify the global part to match
   3 // your needs, then run root.
   4 //    root[0] .L AnalysisTrain.C
   5 // Grid full mode as below (other modes: test, offline, submit, terminate)
   6 //    root[1] AnalysisTrainNew("grid", "full")
   7 // CAF mode (requires root v5-23-02 + aliroot v4-16-Rev08)
   8 //    root[2] AnalysisTrainNew("proof")
   9 // Local mode requires AliESds.root or AliAOD.root in ./data directory
  10 //    root[3] AnalysisTrainNew("local")
  11 // In proof and grid modes, a token is needed and sourcing the produced environment file.
  12 //
  13 // If 'saveTrain' flag is set, the train will generate a directory name and run
  14 // in this directory. A configuration file 'ConfigTrain.C' will be generated.
  15 // One can replay at any time the train via:
  16 //    root[1] AnalysisTrainNew(ana_mode, plugin_mode, "train_default_<date>/ConfigTrain.C")
  17
  18 //==================   TRAIN NAME   ============================================
  19 //TString     train_name         = "GAMMAtest"; // *CHANGE ME* (no blancs or special characters)
  20 TString     train_name         = "LHC09b4AOD"; // *CHANGE ME* (no blancs or special characters)
  21 TString     job_tag            = "LHC09b4: standard AODs with MC info, AOD tags and pyxsec_hist"; // *CHANGE ME*
  22 //==============================================================================
  23
  24 // ### Settings that make sense in PROOF only
  25 //==============================================================================
  26 TString     proof_cluster      = "alicecaf.cern.ch";
  27 Bool_t      useAFPAR           = kFALSE;  // use AF special par file
  28 TString     AFversion          = "AF-v4-16";
  29 // Change CAF dataset here
  30 TString     proof_dataset      = "/COMMON/COMMON/LHC09a4_run8100X#/esdTree";
  31 TString     proof_outdir       = "";
  32
  33 // ### Settings that make sense when using the Alien plugin
  34 //==============================================================================
  35 Bool_t      usePLUGIN          = kTRUE;   // do not change
  36 Bool_t      useProductionMode  = kTRUE;   // use the plugin in production mode
  37 // Usage of par files ONLY in grid mode and ONLY if the code is not available
  38 // in the deployed AliRoot versions. Par file search path: local dir, if not there $ALICE_ROOT.
  39 // To refresh par files, remove the ones in the workdir, then do "make <target.par>" in
  40 // AliRoot.
  41 Bool_t      usePAR             = kFALSE;  // use par files for extra libs
  42 Bool_t      useCPAR            = kFALSE;  // use par files for common libs
  43 TString     root_version       = "v5-24-00";  // *CHANGE ME IF MORE RECENT IN GRID*
  44 TString     aliroot_version    = "v4-18-03-AN";  // *CHANGE ME IF MORE RECENT IN GRID*
  45 // Change production base directory here
  46 TString     alien_datadir      = "/alice/sim/LHC09b4/";
  47 // AliEn output directory. If blank will become output_<train_name>
  48 TString     alien_outdir       = "/alice/sim/LHC09b4/AOD";
  49 // TString     alien_outdir       = "";
  50 // Number of files merged in a chunk
  51 Int_t       maxMergeFiles      = 50;
  52 // Files that should not be merged
  53 TString     mergeExclude       = "AliAOD.root AliAOD.VertexingHF.root";
  54 // Files that should be archived
  55 TString     outputArchive      = "aod_archive.zip:AliAOD.root,AOD.tag.root,pyxsec_hists.root@ALICE::NIHAM::File";
  56 // Number of runs per master job
  57 Int_t       nRunsPerMaster     = 1;
  58 // Maximum number of files per job (gives size of AOD)
  59 Int_t       nFilesPerJob       = 100;
  60 // Set the run range
  61 Int_t       run_range[2]       =  {117003, 117019};  // LHC09a4   *CHANGE ME*
  62 //Int_t       run_range[2]       =  {90000, 90040}; // LHC09a5
  63 // ### Settings that make sense only for local analysis
  64 //==============================================================================
  65 // Change local xml dataset for local interactive analysis
  66 TString     local_xmldataset   = "";
  67
  68 // ### Other flags to steer the analysis
  69 //==============================================================================
  70 Bool_t      useDATE            = kFALSE; // use date in train name
  71 Bool_t      useDBG             = kTRUE; // activate debugging
  72 Bool_t      useMC              = kTRUE;  // use MC info
  73 Bool_t      useTAGS            = kFALSE; // use ESD tags for selection
  74 Bool_t      useKFILTER         = kTRUE;  // use Kinematics filter
  75 Bool_t      useTR              = kTRUE;  // use track references
  76 Bool_t      useCORRFW          = kFALSE; // do not change
  77 Bool_t      useAODTAGS         = kTRUE;  // use AOD tags
  78 Bool_t      saveTrain          = kTRUE;  // save train configuration as:
  79 Bool_t      saveProofToAlien   = kFALSE; // save proof outputs in AliEn
  80                                          // train_[trainName]_ddMonthyyyy_time.C
  81 // ### Analysis modules to be included. Some may not be yet fully implemented.
  82 //==============================================================================
  83 Int_t       iAODanalysis       = 0;      // Analysis on input AOD's
  84 Int_t       iAODhandler        = 1;      // Analysis produces an AOD or dAOD's
  85 Int_t       iESDfilter         = 1;      // ESD to AOD filter (barrel + muon tracks)
  86 Int_t       iMUONcopyAOD       = 0;      // Task that copies only muon events in a separate AOD (PWG3)
  87 Int_t       iJETAN             = 0;      // Jet analysis (PWG4) - needs ESD filter
  88 Int_t       iPWG4partcorr      = 0;      // Gamma-hadron correlations task (PWG4)
  89 Int_t       iPWG4gammaconv     = 0;      // Gamma conversion analysis (PWG4)  # NOT YET WORKING - WAITING FOR FEEDBACK #
  90 Int_t       iPWG4omega3pi      = 0;      // Omega to 3 pi analysis (PWG4)
  91 Int_t       iPWG3vertexing     = 0;      // Vertexing HF task (PWG2)
  92 Int_t       iPWG2femto         = 0;      // Femtoscopy task (PWG2)
  93 Int_t       iPWG2spectra       = 0;      // Spectra tasks (PWG2
  94 Int_t        iPWG2protons      = 0;         // Proton-antiproton analysis
  95 Int_t        iPWG2checkcascade = 0;         // Check cascades task
  96 Int_t        iPWG2perfcascade  = 0;         // Check performance cascade
  97 Int_t        iPWG2checkv0      = 0;         // Check V0 task
  98 Int_t        iPWG2strange      = 0;         // Strangeness task
  99 Int_t       iPWG2flow          = 0;      // Flow analysis tasks (PWG2)   = crashes in AliCFManager
 100 Int_t       iPWG2res           = 0;      // Resonances task (PWG2)
 101 Int_t       iPWG2kink          = 0;      // Kink analysis tasks (PWG2)
 102 Int_t        iPWG2kinkESDMC    = 0;         // Kink ESD-MC comparison (PWG2)
 103 Int_t        iPWG2kinkres      = 0;         // Kink resonances (PWG2)
 104 Int_t        iPWG2kinklikesign = 0;         // Kink like-sign (PWG2)
 105 Int_t       iPWG2evchar        = 0;      // Event characteristics (PWG2)
 106 Int_t       iPWG2unicor        = 0;      // Unicor analysis (PWG2)
 107
 108 // Temporaries.
 109 TString anaPars = "";
 110 TString anaLibs = "";
 111 // Function signatures
 112 class AliAnalysisAlien;
 113
 114 //______________________________________________________________________________
 115 void AnalysisTrainNew(const char *analysis_mode="grid",
 116                       const char *plugin_mode="full",
 117                       const char *config_file="")
 118 {
 119 // Main analysis train macro. If a configuration file is provided, all parameters
 120 // are taken from there but may be altered by CheckModuleFlags.
 121    if (strlen(config_file) && !LoadConfig(config_file)) return;
 122    TString smode(analysis_mode);
 123    smode.ToUpper();
 124    if (saveTrain)              WriteConfig();
 125    // Check compatibility of selected modules
 126    CheckModuleFlags(smode);
 127
 128    printf("==================================================================\n");
 129    printf("===========    RUNNING ANALYSIS TRAIN %s IN %s MODE   ==========\n", train_name.Data(),smode.Data());
 130    printf("==================================================================\n");
 131    printf("=  Configuring analysis train for:                               =\n");
 132    if (iAODanalysis) printf("=  AOD analysis                                                  =\n");
 133    else              printf("=  ESD analysis                                                  =\n");
 134    if (iESDfilter)   printf("=  ESD filter                                                    =\n");
 135    if (iMUONcopyAOD) printf("=  MUON copy AOD                                                 =\n");
 136    if (iJETAN)       printf("=  Jet analysis                                                  =\n");
 137    if (iPWG2spectra) {
 138       printf("=  PWG2 SPECTRA tasks :                                          =\n");
 139       if (iPWG2protons)      printf("=     PWG2 proton-antiproton                                     =\n");
 140       if (iPWG2checkcascade) printf("=     PWG2 check cascades                                        =\n");
 141       if (iPWG2perfcascade)  printf("=     PWG2 performance cascades                                  =\n");
 142       if (iPWG2checkv0)      printf("=     PWG2 check V0                                              =\n");
 143       if (iPWG2strange)      printf("=     PWG2 strangeness                                           =\n");
 144    }
 145    if (iPWG2femto)   printf("=  PWG2 femtoscopy                                               =\n");
 146    if (iPWG2flow)    printf("=  PWG2 flow                                                     =\n");
 147    if (iPWG2res)     printf("=  PWG2 resonances                                               =\n");
 148    if (iPWG2kink) {
 149       printf("=  PWG2 kink analysis tasks:                                     =\n");
 150       if (iPWG2kinkESDMC)    printf("=     PWG2 ESD-MC kinks                                          =\n");
 151       if (iPWG2kinkres)      printf("=     PWG2 kink resonances                                       =\n");
 152       if (iPWG2kinklikesign) printf("=     PWG2 kink like-sign analysis                               =\n");
 153    }
 154    if (iPWG2evchar)    printf("=  PWG2 event characteristics                                =\n");
 155    if (iPWG2unicor)    printf("=  PWG2 Unicor analysis                                      =\n");
 156    if (iPWG3vertexing) printf("=  PWG3 vertexing                                            =\n");
 157    if (iPWG4partcorr)  printf("=  PWG4 gamma-hadron, pi0 and gamma-jet correlations         =\n");
 158    if (iPWG4gammaconv) printf("=  PWG4 gamma conversion                                     =\n");
 159    if (iPWG4omega3pi)  printf("=  PWG4 omega to 3 pions                                     =\n");
 160    printf("==================================================================\n");
 161    printf(":: use MC truth      %d\n", (UInt_t)useMC);
 162    printf(":: use KINE filter   %d\n", (UInt_t)useKFILTER);
 163    printf(":: use track refs    %d\n", (UInt_t)useTR);
 164    printf(":: use tags          %d\n", (UInt_t)useTAGS);
 165    printf(":: use AOD tags      %d\n", (UInt_t)useAODTAGS);
 166    printf(":: use debugging     %d\n", (UInt_t)useDBG);
 167    printf(":: use PAR files     %d\n", (UInt_t)usePAR);
 168    printf(":: use AliEn plugin  %d\n", (UInt_t)usePLUGIN);
 169
 170    //==========================================================================
 171    // Connect to back-end system
 172    if (!Connect(smode)) {
 173       ::Error("AnalysisTrain", "Could not connect to %s back-end", analysis_mode);
 174       return;
 175    }
 176
 177    // Load common libraries and set include path
 178    if (!LoadCommonLibraries(smode)) {
 179       ::Error("AnalysisTrain", "Could not load common libraries");
 180       return;
 181    }
 182
 183    // Make the analysis manager and connect event handlers
 184    AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("Analysis Train", "Production train");
 185    if (saveProofToAlien) mgr->SetSpecialOutputLocation(proof_outdir);
 186
 187    // Load analysis specific libraries
 188    if (!LoadAnalysisLibraries(smode)) {
 189       ::Error("AnalysisTrain", "Could not load analysis libraries");
 190       return;
 191    }
 192
 193    // Create input handler (input container created automatically)
 194    if (iAODanalysis) {
 195    // AOD input handler
 196       AliAODInputHandler *aodH = new AliAODInputHandler();
 197       mgr->SetInputEventHandler(aodH);
 198    } else {
 199    // ESD input handler
 200       AliESDInputHandler *esdHandler = new AliESDInputHandler();
 201       if (useTAGS) esdHandler->SetReadTags();
 202       mgr->SetInputEventHandler(esdHandler);
 203    }
 204    // Monte Carlo handler
 205    if (useMC && !iAODanalysis) {
 206       AliMCEventHandler* mcHandler = new AliMCEventHandler();
 207       mgr->SetMCtruthEventHandler(mcHandler);
 208       mcHandler->SetReadTR(useTR);
 209    }
 210    // AOD output container, created automatically when setting an AOD handler
 211    if (iAODhandler) {
 212       // AOD output handler
 213       AliAODHandler* aodHandler   = new AliAODHandler();
 214       aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.root");
 215       mgr->SetOutputEventHandler(aodHandler);
 216       if (iAODanalysis) {
 217          aodHandler->SetCreateNonStandardAOD();
 218          if (iJETAN)         aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.Jets.root");
 219          if (iPWG3vertexing) aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.VertexingHF.root");
 220       }
 221    }
 222    // Debugging if needed
 223    if (useDBG) mgr->SetDebugLevel(3);
 224
 225    //==========================================================================
 226    // Create the chain. In this example it is created only from ALIEN files but
 227    // can be done to work in batch or grid mode as well.
 228    TChain *chain = CreateChain(smode, plugin_mode);
 229
 230    //==========================================================================
 231    // Load the tasks configuration macros for all wagons. These files are supposed now to be
 232    // in the current workdir, but in AliEn they will be in the file catalog,
 233    // mapped from AliRoot and pecified in the jdl input list.
 234
 235    // For now connection to top input container and common AOD output container
 236    // is done in this macro, but in future these containers will be connected
 237    // from each task configuration macro.
 238
 239    if (iESDfilter && !iAODanalysis) {
 240       //  ESD filter task configuration.
 241       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskESDFilter.C");
 242       AliAnalysisTaskESDfilter *taskesdfilter = AddTaskESDFilter(useKFILTER);
 243    }
 244
 245    // AOD tags
 246    if (useAODTAGS) {
 247       AliAnalysisTaskTagCreator* tagTask = new AliAnalysisTaskTagCreator("AOD Tag Creator");
 248       mgr->AddTask(tagTask);
 249       AliAnalysisDataContainer *coutTags = mgr->CreateContainer("cTag",  TTree::Class(),
 250                                            AliAnalysisManager::kOutputContainer, "AOD.tag.root");
 251       mgr->ConnectInput (tagTask, 0, mgr->GetCommonInputContainer());
 252       mgr->ConnectOutput(tagTask, 1, coutTags);
 253    }
 254
 255     // Jet analysis
 256    if (iJETAN) {
 257       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskJets.C");
 258       AliAnalysisTaskJets *taskjets = 0;
 259       TString anatype = mgr->GetInputEventHandler()->GetDataType();
 260       taskjets = AddTaskJets(anatype, "UA1");
 261       taskjets = AddTaskJets(anatype, "Fastjet");
 262       if (!taskjets) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskJets cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 263    }
 264
 265    // Proton analysis
 266    if (iPWG2spectra) {
 267       // protons
 268       if (iPWG2protons) {
 269         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskProtons.C");
 270         AliAnalysisTaskProtons *taskprotons = AddTaskProtons();
 271         if (!taskprotons) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskProtons cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 272       }
 273       // cascades
 274       if (iPWG2checkcascade) {
 275         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckCascade.C");
 276         AliAnalysisTaskCheckCascade *taskcheckcascade = AddTaskCheckCascade();
 277         if (!taskcheckcascade) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckCascade cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 278       }
 279       // v0's
 280       if (iPWG2checkv0) {
 281         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckV0.C");
 282         AliAnalysisTaskCheckV0 *taskcheckV0 = AddTaskCheckV0();
 283         if (!taskcheckV0) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckV0 cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 284       }
 285       // strangeness
 286       if (iPWG2strange) {
 287         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskStrange.C");
 288         AliAnalysisTaskStrange *taskstrange = AddTaskStrange();
 289         if (!taskstrange) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskStrange cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 290       }
 291       // performance cascades
 292       if (iPWG2perfcascade) {
 293         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckPerformanceCascade.C");
 294         AliAnalysisTaskCheckPerformanceCascade *taskperfcascade = AddTaskCheckPerformanceCascade();
 295         if (!taskperfcascade) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckPerformanceCascade cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 296       }
 297    }
 298
 299    // Femtoscopy analysis modules
 300    if (iPWG2femto) {
 301       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/AddTaskFemto.C");
 302       AliAnalysisTaskFemto *taskfemto = AddTaskFemto();
 303       if (!taskfemto) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskFemto cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 304    }
 305
 306    // Kink analysis
 307    if (iPWG2kink) {
 308       if (iPWG2kinkESDMC) {
 309         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKink.C");
 310         AliAnalysisKinkESDMC *taskkink = AddTaskKink();
 311         if (!taskkink) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkESDMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 312       }
 313       if (iPWG2kinkres) {
 314         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonance.C");
 315         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkinkres = AddTaskKinkResonance();
 316         if (!taskkinkres) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskKinkResonance cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 317       }
 318       if (iPWG2kinklikesign) {
 319         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceLikeSign.C");
 320         AliResonanceKinkLikeSign *taskkinklikesign = AddTaskKinkResonanceLikeSign();
 321         if (!taskkinklikesign) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 322       }
 323    }
 324
 325    // Event characterization
 326    if (iPWG2evchar) {
 327       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/EVCHAR/macros/AddTaskSPDdNdEta.C");
 328       AliAnalysisTaskSPDdNdEta *taskspddndeta = AddTaskSPDdNdEta();
 329       if (!taskspddndeta) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskSPDdNdEta cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 330       taskspddndeta->SetReadMC(useMC);
 331    }
 332
 333    // Unicor
 334    if (iPWG2unicor) {
 335       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/UNICOR/AddTaskUnicor.C");
 336       AliAnalysisTaskUnicor *taskunicor = AddTaskUnicor();
 337       if (!taskspddndeta) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskUnicor cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 338    }
 339
 340    // Flow analysis
 341    if (iPWG2flow) {
 342       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FLOW/macros/AddTaskFlow.C");
 343       Bool_t SP       = kTRUE;
 344       Bool_t LYZ1SUM  = kTRUE;
 345       Bool_t LYZ1PROD = kTRUE;
 346       Bool_t LYZ2SUM  = kFALSE;
 347       Bool_t LYZ2PROD = kFALSE;
 348       Bool_t LYZEP    = kFALSE;
 349       Bool_t GFC      = kTRUE;
 350       Bool_t QC       = kTRUE;
 351       Bool_t FQD      = kFALSE;
 352       Bool_t MCEP     = kFALSE; //does not work yet 24/12/08
 353       Bool_t kineFromESD = kTRUE;
 354       Bool_t METHODS[] = {SP,LYZ1SUM,LYZ1PROD,LYZ2SUM,LYZ2PROD,LYZEP,GFC,QC,FQD,MCEP};
 355       // Analysis type can be ESD, AOD, MC, ESDMC0, ESDMC1
 356       TString type = "AOD";
 357       if (!iAODanalysis) type = "ESD";
 358       if (useMC) {
 359          type += "MC";
 360          if (!kineFromESD) type += "1";
 361          else type += "0";
 362       }
 363       // Boolean to fill/not fill the QA histograms
 364       Bool_t QA = kTRUE;
 365       // Boolean to use/not use weights for the Q vector
 366       Bool_t WEIGHTS[] = {kFALSE,kFALSE,kFALSE}; //Phi, v'(pt), v'(eta)
 367       AliAnalysisTaskFlowEvent* taskFE = AddTaskFlow(type,METHODS,QA,WEIGHTS);
 368       if (!taskFE) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskFlowEvent cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 369    }
 370
 371    // PWG2 resonances
 372    if (iPWG2res) {
 373       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train/AddAnalysisTaskRsn.C");
 374       TString path = gROOT->GetMacroPath();
 375       path += ":$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train";
 376       gROOT->SetMacroPath(path);
 377       AddAnalysisTaskRsn(kTRUE);
 378    }
 379
 380    // PWG3 vertexing
 381    if (iPWG3vertexing) {
 382       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/AddTaskVertexingHF.C");
 383       AliAnalysisTaskSEVertexingHF *taskvertexingHF = AddTaskVertexingHF();
 384       if (!taskvertexingHF) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskSEVertexingHF cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 385    }
 386
 387    // PWG4 hadron correlations
 388    if (iPWG4partcorr) {
 389       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskPartCorr.C");
 390       AliAnalysisTaskParticleCorrelation *taskpartcorrPHOS = AddTaskPartCorr("AOD", "PHOS");
 391       if (!taskpartcorrPHOS) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskParticleCorrelation PHOS cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 392       AliAnalysisTaskParticleCorrelation *taskpartcorrEMCAL = AddTaskPartCorr("AOD", "EMCAL");
 393       if (!taskpartcorrEMCAL) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskParticleCorrelation EMCAL cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 394    }
 395
 396    // PWG4 gamma conversion analysis
 397    if (iPWG4gammaconv) {
 398       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskGammaConversion.C");
 399       TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();
 400       gSystem->ChangeDirectory(gSystem->ExpandPathName("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/"));
 401       TString gcArguments = "-run-on-train -run-jet -run-chic -run-neutralmeson";
 402       AliAnalysisTaskGammaConversion * taskGammaConversion = AddTaskGammaConversion(gcArguments,mgr->GetCommonInputContainer());
 403       gSystem->ChangeDirectory(cdir);
 404       if (!taskGammaConversion) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskGammaConversion cannot run for these train conditions - EXCLUDED");
 405    }
 406
 407    // PWG4 omega to 3 pions analysis
 408    if (iPWG4omega3pi) {
 409       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskomega3pi.C");
 410       AliAnalysisTaskOmegaPi0PiPi *taskomega3pi = AddTaskomega3pi();
 411       if (!taskomega3pi) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskomega3pi cannot run for these train conditions - EXCLUDED");
 412    }
 413
 414    //==========================================================================
 415    // FOR THE REST OF THE TASKS THE MACRO AddTaskXXX() is not yet implemented/
 416    // Run the analysis
 417    //
 418    if (mgr->InitAnalysis()) {
 419       mgr->PrintStatus();
 420       if (saveTrain || strlen(config_file)) gSystem->ChangeDirectory(train_name);
 421       StartAnalysis(smode, chain);
 422       if (saveTrain && smode=="GRID") {
 423          AliAnalysisAlien *gridhandler = (AliAnalysisAlien*)mgr->GetGridHandler();
 424          TString alien_workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
 425          if (iAODanalysis) alien_workdir += "analysisAOD";
 426          else              alien_workdir += "analysisESD";
 427          alien_outdir = gridhandler->GetGridOutputDir();
 428          printf("=== Registering ConfigTrain.C in the work directory <%s> ===\n",
 429                 alien_workdir.Data());
 430          if (AliAnalysisAlien::FileExists(Form("%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data())))
 431             gGrid->Rm(Form("%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data()));
 432          TFile::Cp(Form("file:%sConfig.C",train_name.Data()), Form("alien://%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data()));
 433       }
 434    }
 435 }
 436
 437 //______________________________________________________________________________
 438 void StartAnalysis(const char *mode, TChain *chain) {
 439 // Start analysis.
 440    Int_t imode = -1;
 441    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 442    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 443    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 444    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 445    switch (imode) {
 446       case 0:
 447          if (!chain) {
 448             ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Cannot create the chain");
 449             return;
 450          }
 451          mgr->StartAnalysis(mode, chain);
 452          return;
 453       case 1:
 454          if (!proof_dataset.Length()) {
 455             ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "proof_dataset is empty");
 456             return;
 457          }
 458          mgr->StartAnalysis(mode, proof_dataset, 1000);
 459          return;
 460       case 2:
 461          if (usePLUGIN) {
 462             if (!mgr->GetGridHandler()) {
 463                ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Grid plugin not initialized");
 464                return;
 465             }
 466             mgr->StartAnalysis("grid");
 467          } else {
 468             if (!chain) {
 469                ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Cannot create the chain");
 470                return;
 471             }
 472             mgr->StartAnalysis(mode, chain);
 473          }
 474          return;
 475    }
 476 }
 477
 478 //______________________________________________________________________________
 479 void CheckModuleFlags(const char *mode) {
 480 // Checks selected modules and insure compatibility
 481    Int_t imode = -1;
 482    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 483    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 484    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 485    if (imode==1) {
 486       if (!usePAR) {
 487          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PAR files enabled due to PROOF analysis");
 488          usePAR = kTRUE;
 489       }
 490    }
 491    if (imode != 2) {
 492       ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "AliEn plugin disabled since not in GRID mode");
 493       usePLUGIN = kFALSE;
 494    }
 495    if (iAODanalysis) {
 496    // AOD analysis
 497       if (useMC)
 498          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "MC usage disabled in analysis on AOD's");
 499       if (useAODTAGS)
 500          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "AOD tags usage disabled in analysis on AOD's");
 501       useMC = kFALSE;
 502       useTR = kFALSE;
 503       useAODTAGS = kFALSE;
 504       if (iESDfilter)
 505          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "ESD filter disabled in analysis on AOD's");
 506       iESDfilter   = 0;
 507       if (!iAODhandler) {
 508          if (iJETAN)
 509             ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "JETAN disabled in analysis on AOD's without AOD handler");
 510          iJETAN = 0;
 511          if (iPWG4gammaconv)
 512             ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "iPWG4gammaconv disabled on AOD's without AOD handler");
 513          iPWG4gammaconv = 0;
 514          if (iPWG4partcorr)
 515             ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4partcorr disabled on AOD's without AOD handler");
 516          iPWG4partcorr = 0;
 517       }
 518       // Disable tasks that do not work yet on AOD data
 519       if (iPWG2flow)
 520          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2flow disabled on AOD's");
 521          iPWG2flow = 0;
 522       if (iPWG2femto)
 523          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2femto disabled on AOD's");
 524          iPWG2femto = 0;
 525       if (iPWG2res)
 526          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2res disabled on AOD's");
 527          iPWG2res = 0;
 528       if (iPWG2kink)
 529          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2kink disabled in analysis on AOD's");
 530          iPWG2kink = 0;
 531       if (iPWG2unicor)
 532          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2unicor disabled in analysis on AOD's");
 533          iPWG2unicor = 0;
 534       if (iPWG2evchar)
 535          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4evchar disabled on AOD's");
 536          iPWG2evchar = 0;
 537       if (iPWG4omega3pi)
 538          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4omega3pi disabled on AOD's");
 539          iPWG4omega3pi = 0;
 540       if (iPWG4partcorr)
 541          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4partcorr disabled on AOD's");
 542          iPWG4partcorr = 0;
 543    } else {
 544    // ESD analysis
 545       iMUONcopyAOD = 0;
 546       if (!useMC) useTR = kFALSE;
 547       if (!useTR) {
 548          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "iPWG2evchar disabled if not reading track references");
 549          iPWG2evchar = 0;
 550       }
 551    }
 552    if (!useMC) {
 553       if (iPWG2perfcascade)
 554          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2perfcascade disabled without MC info");
 555       iPWG2perfcascade = 0;
 556    }
 557    if (iJETAN && !iAODanalysis) iESDfilter=1;
 558    if (iESDfilter) {iAODhandler=1; useCORRFW = kTRUE;}
 559    if (iPWG2spectra || iPWG2flow || iPWG3vertexing) useCORRFW = kTRUE;
 560    if (useKFILTER && !useMC) useKFILTER = kFALSE;
 561    if (useAODTAGS && !iAODhandler) useAODTAGS = kFALSE;
 562 }
 563
 564 //______________________________________________________________________________
 565 Bool_t Connect(const char *mode) {
 566 // Connect <username> to the back-end system.
 567    Int_t imode = -1;
 568    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 569    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 570    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 571    TString username = gSystem->Getenv("alien_API_USER");
 572    switch (imode) {
 573       case 0:
 574          break;
 575       case 1:
 576          if  (!username.Length()) {
 577             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Make sure you:\n \
 578                            1. Have called: alien-token-init <username>\n \
 579                            2. Have called: >source /tmp/gclient_env_$UID");
 580             return kFALSE;
 581          }
 582          ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Connecting user <%s> to PROOF cluster <%s>",
 583                 username.Data(), proof_cluster.Data());
 584          gEnv->SetValue("XSec.GSI.DelegProxy", "2");
 585 //         TProof::Open(Form("%s@%s:31093", username.Data(), proof_cluster.Data()));
 586          TProof::Open(Form("%s@%s", username.Data(), proof_cluster.Data()));
 587          if (!gProof) {
 588             if (strcmp(gSystem->Getenv("XrdSecGSISRVNAMES"), "lxfsrd0506.cern.ch"))
 589                ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Environment XrdSecGSISRVNAMES different from lxfsrd0506.cern.ch");
 590             return kFALSE;
 591          }
 592          TGrid::Connect("alien://");
 593          if (gGrid) {
 594             TString homedir = gGrid->GetHomeDirectory();
 595             TString workdir = homedir + train_name;
 596             if (!gGrid->Cd(workdir)) {
 597                gGrid->Cd(homedir);
 598                if (gGrid->Mkdir(workdir)) {
 599                   gGrid->Cd(train_name);
 600                   ::Info("AnalysisTrainNew::Connect()", "Directory %s created", gGrid->Pwd());
 601                }
 602             }
 603             gGrid->Mkdir("proof_output");
 604             gGrid->Cd("proof_output");
 605             proof_outdir = Form("alien://%s", gGrid->Pwd());
 606          }
 607          break;
 608       case 2:
 609          if  (!username.Length()) {
 610             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Make sure you:\n \
 611                            1. Have called: alien-token-init <username>\n \
 612                            2. Have called: >source /tmp/gclient_env_$UID");
 613             return kFALSE;
 614          }
 615          if (usePLUGIN && !gSystem->Getenv("alien_CLOSE_SE")) {
 616             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode),
 617                            "When using the AliEn plugin it is preferable to define the \
 618                            variable alien_CLOSE_SE in your environment.");
 619             return kFALSE;
 620          }
 621          ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Connecting user <%s> to AliEn ...",
 622                 username.Data());
 623          TGrid::Connect("alien://");
 624          if (!gGrid || !gGrid->IsConnected()) return kFALSE;
 625          break;
 626       default:
 627          ::Error("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Unknown run mode: %s", mode);
 628          return kFALSE;
 629    }
 630    ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect","Connected in %s mode", mode);
 631    return kTRUE;
 632 }
 633
 634 //______________________________________________________________________________
 635 Bool_t LoadCommonLibraries(const char *mode)
 636 {
 637 // Load common analysis libraries.
 638    Int_t imode = -1;
 639    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 640    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 641    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 642    if (!gSystem->Getenv("ALICE_ROOT")) {
 643       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadCommonLibraries", "Analysis train requires that analysis libraries are compiled with a local AliRoot");
 644       return kFALSE;
 645    }
 646    Bool_t success = kTRUE;
 647    // ROOT libraries
 648    gSystem->Load("libTree.so");
 649    gSystem->Load("libGeom.so");
 650    gSystem->Load("libVMC.so");
 651    gSystem->Load("libPhysics.so");
 652
 653    // Load framework classes. Par option ignored here.
 654    switch (imode) {
 655       case 0:
 656       case 2:
 657          if (useCPAR) {
 658             success &= LoadLibrary("STEERBase", mode, kTRUE);
 659             success &= LoadLibrary("ESD", mode, kTRUE);
 660             success &= LoadLibrary("AOD", mode, kTRUE);
 661             success &= LoadLibrary("ANALYSIS", mode, kTRUE);
 662             success &= LoadLibrary("ANALYSISalice", mode, kTRUE);
 663             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode, kTRUE);
 664          } else {
 665             success &= LoadLibrary("libSTEERBase.so", mode);
 666             success &= LoadLibrary("libESD.so", mode);
 667             success &= LoadLibrary("libAOD.so", mode);
 668             success &= LoadLibrary("libANALYSIS.so", mode);
 669             success &= LoadLibrary("libANALYSISalice.so", mode);
 670             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("libCORRFW.so", mode);
 671             gROOT->ProcessLine(".include $ALICE_ROOT/include");
 672          }
 673          break;
 674       case 1:
 675          Int_t ires = -1;
 676          if (useAFPAR && !gSystem->AccessPathName(AFversion)) ires = gProof->UploadPackage(AFversion);
 677          if (ires < 0) {
 678             success &= LoadLibrary("STEERBase", mode);
 679             success &= LoadLibrary("ESD", mode);
 680             success &= LoadLibrary("AOD", mode);
 681             success &= LoadLibrary("ANALYSIS", mode);
 682             success &= LoadLibrary("ANALYSISalice", mode);
 683             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode);
 684          } else {
 685             ires = gProof->EnablePackage(AFversion);
 686             if (ires<0) success = kFALSE;
 687             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode);
 688          }
 689          break;
 690       default:
 691          ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadCommonLibraries", "Unknown run mode: %s", mode);
 692          return kFALSE;
 693    }
 694    if (success) {
 695       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Load common libraries:    SUCCESS");
 696       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Include path for Aclic compilation:\n%s",
 697               gSystem->GetIncludePath());
 698    } else {
 699       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Load common libraries:    FAILED");
 700    }
 701
 702    return success;
 703 }
 704
 705 //______________________________________________________________________________
 706 Bool_t LoadAnalysisLibraries(const char *mode)
 707 {
 708 // Load common analysis libraries.
 709    Bool_t success = kTRUE;
 710    if (iESDfilter) {
 711       if (!LoadLibrary("PWG3base", mode, kTRUE) ||
 712           !LoadLibrary("PWG3muon", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 713    }
 714    // JETAN
 715    if (iJETAN) {
 716       if (!LoadLibrary("JETAN", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 717    }
 718    // PWG4 particle correlations
 719    if (iPWG4partcorr) {
 720       if (!LoadLibrary("PWG4PartCorrBase", mode, kTRUE) ||
 721           !LoadLibrary("PWG4PartCorrDep", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 722    }
 723    // PWG4 gamma conversion
 724    if (iPWG4gammaconv) {
 725       if (!LoadLibrary("PWG4GammaConv", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 726    }
 727    // PWG4 omega to 3 pions
 728    if (iPWG4omega3pi) {
 729       if (!LoadLibrary("PWG4omega3pi", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 730    }
 731    // PWG2 task protons
 732    if (iPWG2spectra) {
 733       if (!LoadLibrary("PWG2spectra", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 734    }
 735    // PWG2 flow
 736    if (iPWG2flow) {
 737       if (!LoadLibrary("PWG2flowCommon", mode, kTRUE) ||
 738           !LoadLibrary("PWG2flowTasks", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 739    }
 740    // PWG2 resonances
 741    if (iPWG2res) {
 742       if (!LoadLibrary("PWG2resonances", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 743    }
 744    // PWG2 kink
 745    if (iPWG2kink) {
 746       if (!LoadLibrary("PWG2kink", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 747    }
 748    // PWG2 unicor
 749    if (iPWG2unicor) {
 750       if (!LoadLibrary("PWG2unicor", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 751    }
 752    // PWG2 evchar
 753    if (iPWG2evchar) {
 754       if (!LoadLibrary("PWG2evchar", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 755    }
 756    // PWG2 femtoscopy
 757    if (iPWG2femto) {
 758       if (!LoadLibrary("PWG2AOD", mode, kTRUE) ||
 759           !LoadLibrary("PWG2femtoscopy", mode, kTRUE) ||
 760           !LoadLibrary("PWG2femtoscopyUser", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 761       TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName("$(ALICE_ROOT)/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/ConfigFemtoAnalysis.C"), Form("%s/ConfigFemtoAnalysis.C", train_name.Data()));
 762       anaLibs += "ConfigFemtoAnalysis.C ";
 763    }
 764    // Vertexing HF
 765    if (iPWG3vertexing) {
 766       if (!LoadLibrary("PWG3base", mode, kTRUE) ||
 767           !LoadLibrary("PWG3vertexingHF", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 768    }
 769    ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadAnalysisLibraries", "Load other libraries:   SUCCESS");
 770    return kTRUE;
 771 }
 772
 773 //______________________________________________________________________________
 774 Bool_t LoadLibrary(const char *module, const char *mode, Bool_t rec=kFALSE)
 775 {
 776 // Load a module library in a given mode. Reports success.
 777    Int_t imode = -1;
 778    Int_t result;
 779    TString smodule(module);
 780    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 781    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 782    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 783    TString mod(module);
 784    if (!mod.Length()) {
 785       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Empty module name");
 786       return kFALSE;
 787    }
 788    // If a library is specified, just load it
 789    if (smodule.EndsWith(".so")) {
 790       mod.Remove(mod.Index(".so"));
 791       result = gSystem->Load(mod);
 792       if (result < 0) {
 793          ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not load library %s", module);
 794          return kFALSE;
 795       }
 796       if (rec) anaLibs += Form("%s.so ",mod.Data());
 797       return kTRUE;
 798    }
 799    // Check if the library is already loaded
 800    if (strlen(gSystem->GetLibraries(Form("%s.so", module), "", kFALSE)) > 0)
 801       return kTRUE;
 802    switch (imode) {
 803       case 0:
 804       case 2:
 805          if (usePAR) {
 806             result = SetupPar(module);
 807             if (rec) anaPars += Form("%s.par ", module);
 808          } else {
 809             result = gSystem->Load(Form("lib%s.so", module));
 810             if (rec) anaLibs += Form("lib%s.so ", module);
 811          }
 812          break;
 813       case 1:
 814          result = gProof->UploadPackage(module);
 815          if (result<0) {
 816             result = gProof->UploadPackage(gSystem->ExpandPathName(Form("$ALICE_ROOT/%s.par", module)));
 817             if (result<0) {
 818                ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not find module %s.par in current directory nor in $ALICE_ROOT", module);
 819                return kFALSE;
 820             }
 821          }
 822          result = gProof->EnablePackage(module);
 823          break;
 824       default:
 825          return kFALSE;
 826    }
 827    if (result < 0) {
 828       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not load module %s", module);
 829       return kFALSE;
 830    }
 831    return kTRUE;
 832 }
 833
 834
 835 //______________________________________________________________________________
 836 TChain *CreateChain(const char *mode, const char *plugin_mode)
 837 {
 838 // Create the input chain
 839    Int_t imode = -1;
 840    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 841    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 842    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 843    TChain *chain = NULL;
 844    // Local chain
 845    switch (imode) {
 846       case 0:
 847          if (iAODanalysis) {
 848             if (!local_xmldataset.Length()) {
 849                // Local AOD
 850                chain = new TChain("aodTree");
 851                if (gSystem->AccessPathName("data/AliAOD.root"))
 852                   ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChain", "File: AliAOD.root not in ./data dir");
 853                else {
 854                   if (!saveTrain) chain->Add("data/AliAOD.root");
 855                   else            chain->Add("../data/AliAOD.root");
 856                }
 857             } else {
 858                // Interactive AOD
 859                chain = CreateChainSingle(local_xmldataset, "aodTree");
 860             }
 861          } else {
 862             if (!local_xmldataset.Length()) {
 863                // Local ESD
 864                chain = new TChain("esdTree");
 865                if (gSystem->AccessPathName("data/AliESDs.root"))
 866                   ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChain", "File: AliESDs.root not in ./data dir");
 867                else {
 868                   if (!saveTrain) chain->Add("data/AliESDs.root");
 869                   else            chain->Add("../data/AliESDs.root");
 870                }
 871             } else {
 872                // Interactive ESD
 873                chain = CreateChainSingle(local_xmldataset, "esdTree");
 874             }
 875          }
 876          break;
 877       case 1:
 878          break;
 879       case 2:
 880          if (usePLUGIN) {
 881             AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(plugin_mode);
 882             AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->SetGridHandler(alienHandler);
 883          } else {
 884             TString           treeName = "esdTree";
 885             if (iAODanalysis) treeName = "aodTree";
 886             chain = CreateChainSingle("wn.xml", treeName);
 887          }
 888          break;
 889       default:
 890    }
 891    if (chain && chain->GetNtrees()) return chain;
 892    return NULL;
 893 }
 894
 895 //______________________________________________________________________________
 896 TChain* CreateChainSingle(const char* xmlfile, const char *treeName)
 897 {
 898    printf("*******************************\n");
 899    printf("*** Getting the ESD Chain   ***\n");
 900    printf("*******************************\n");
 901    TAlienCollection * myCollection  = TAlienCollection::Open(xmlfile);
 902
 903    if (!myCollection) {
 904       ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChainSingle", "Cannot create an AliEn collection from %s", xmlfile) ;
 905       return NULL ;
 906    }
 907
 908    TChain* chain = new TChain(treeName);
 909    myCollection->Reset() ;
 910    while ( myCollection->Next() ) chain->Add(myCollection->GetTURL("")) ;
 911    chain->ls();
 912    return chain;
 913 }
 914
 915 //______________________________________________________________________________
 916 Int_t SetupPar(char* pararchivename)
 917 {
 918    if (!pararchivename || !strlen(pararchivename)) return -1;
 919    char processline[1024];
 920    if (gSystem->AccessPathName(Form("%s.par", pararchivename))) {
 921       if (!gSystem->AccessPathName(Form("%s/%s.par", gSystem->Getenv("ALICE_ROOT"),pararchivename))) {
 922          ::Info("AnalysisTrainNew.C::SetupPar", "Getting %s.par from $ALICE_ROOT", pararchivename);
 923          TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(Form("$ALICE_ROOT/%s.par", pararchivename)),
 924                    Form("%s.par",pararchivename));
 925       } else {
 926          ::Error("AnalysisTrainNew.C::SetupPar", "Cannot find %s.par", pararchivename);
 927          return -1;
 928       }
 929    }
 930    if (usePLUGIN && saveTrain) gSystem->Exec(Form("ln -s ../%s.par %s",pararchivename, train_name.Data()));
 931    gSystem->Exec(Form("tar xvzf %s.par", pararchivename));
 932
 933    TString ocwd = gSystem->WorkingDirectory();
 934    if (!gSystem->ChangeDirectory(pararchivename)) return -1;
 935
 936    // check for BUILD.sh and execute
 937    if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
 938       printf("*******************************\n");
 939       printf("*** Building PAR archive    ***\n");
 940       printf("*******************************\n");
 941       if (gSystem->Exec("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
 942          Error("runProcess","Cannot Build the PAR Archive! - Abort!");
 943          return -1;
 944       }
 945    }
 946
 947         // check for SETUP.C and execute
 948         if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/SETUP.C")) {
 949             printf("*******************************\n");
 950             printf("*** Setup PAR archive       ***\n");
 951             printf("*******************************\n");
 952             gROOT->Macro("PROOF-INF/SETUP.C");
 953         }
 954         if (!gSystem->ChangeDirectory(ocwd.Data())) return -1;
 955    return 0;
 956 }
 957
 958 //______________________________________________________________________________
 959 AliAnalysisAlien* CreateAlienHandler(const char *plugin_mode)
 960 {
 961 // Check if user has a valid token, otherwise make one. This has limitations.
 962 // One can always follow the standard procedure of calling alien-token-init then
 963 //   source /tmp/gclient_env_$UID in the current shell.
 964    if (!AliAnalysisGrid::CreateToken()) return NULL;
 965    AliAnalysisAlien *plugin = new AliAnalysisAlien();
 966 // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit" or "terminate")
 967    plugin->SetRunMode(plugin_mode);
 968    if (useProductionMode) plugin->SetProductionMode();
 969    plugin->SetJobTag(job_tag);
 970    plugin->SetNtestFiles(1);
 971 //   plugin->SetPreferedSE("ALICE::Legnaro::SE");
 972 // Set versions of used packages
 973    plugin->SetAPIVersion("V2.4");
 974    plugin->SetROOTVersion(root_version);
 975    plugin->SetAliROOTVersion(aliroot_version);
 976 // Declare input data to be processed.
 977 // Method 1: Create automatically XML collections using alien 'find' command.
 978 // Define production directory LFN
 979    plugin->SetGridDataDir(alien_datadir);
 980 // Set data search pattern
 981    if (iAODanalysis) plugin->SetDataPattern("*AliAOD.root");
 982    else              plugin->SetDataPattern("*ESD.tag.root");
 983 // ...then add run numbers to be considered
 984    plugin->SetRunRange(run_range[0], run_range[1]);
 985 //   for (Int_t i=0; i<10; i++) {
 986 //      if (run_numbers[i]==0) break;
 987 //      plugin->AddRunNumber(run_numbers[i]);
 988 //   }
 989 // Method 2: Declare existing data files (raw collections, xml collections, root file)
 990 // If no path mentioned data is supposed to be in the work directory (see SetGridWorkingDir())
 991 // XML collections added via this method can be combined with the first method if
 992 // the content is compatible (using or not tags)
 993 //   plugin->AddDataFile("tag.xml");
 994 //   plugin->AddDataFile("/alice/data/2008/LHC08c/000057657/raw/Run57657.Merged.RAW.tag.root");
 995 // Define alien work directory where all files will be copied. Relative to alien $HOME.
 996    if (iAODanalysis) plugin->SetGridWorkingDir("analysisAOD");
 997    else              plugin->SetGridWorkingDir("analysisESD");
 998 // Declare alien output directory. Relative to working directory.
 999    if (!alien_outdir.Length()) alien_outdir = Form("output_%s",train_name.Data());
1000    plugin->SetGridOutputDir(alien_outdir);
1001
1002    TString ana_sources = "";
1003    TString ana_add = "";
1004    if (usePAR && anaPars.Length()) {
1005       printf("%s\n", anaPars.Data());
1006       TObjArray *arr;
1007       TObjString *objstr;
1008       arr = anaPars.Tokenize(" ");
1009       TIter next(arr);
1010       while ((objstr=(TObjString*)next())) plugin->EnablePackage(objstr->GetString());
1011       delete arr;
1012    }
1013
1014 // Declare the analysis source files names separated by blancs. To be compiled runtime
1015 // using ACLiC on the worker nodes.
1016    ana_sources = ana_sources.Strip();
1017 // Declare all libraries (other than the default ones for the framework. These will be
1018 // loaded by the generated analysis macro. Add all extra files (task .cxx/.h) here.
1019    anaLibs     = anaLibs.Strip();
1020    if (ana_sources.Length()) plugin->SetAnalysisSource(ana_sources);
1021    if (anaLibs.Length())     plugin->SetAdditionalLibs(anaLibs);
1022
1023 // Declare the output file names separated by blancs.
1024 // (can be like: file.root or file.root@ALICE::Niham::File)
1025    plugin->SetDefaultOutputs();
1026    plugin->SetMergeExcludes(mergeExclude);
1027    plugin->SetMaxMergeFiles(maxMergeFiles);
1028    plugin->SetNrunsPerMaster(nRunsPerMaster);
1029 // Optionally define the files to be archived.
1030 //   plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr@ALICE::NIHAM::File root_archive.zip:AliAOD.root,AOD.tag.root@ALICE::NIHAM::File");
1031    plugin->SetOutputArchive(Form("log_archive.zip:stdout,stderr %s",outputArchive.Data()));
1032 // Optionally set a name for the generated analysis macro (default MyAnalysis.C)
1033    plugin->SetAnalysisMacro(Form("%s.C", train_name.Data()));
1034 // Optionally set maximum number of input files/subjob (default 100, put 0 to ignore)
1035    plugin->SetSplitMaxInputFileNumber(nFilesPerJob);
1036 // Optionally set number of failed jobs that will trigger killing waiting sub-jobs.
1037 //   plugin->SetMaxInitFailed(5);
1038 // Optionally resubmit threshold.
1039 //   plugin->SetMasterResubmitThreshold(90);
1040 // Optionally set time to live (default 30000 sec)
1041    plugin->SetTTL(30000);
1042 // Optionally set input format (default xml-single)
1043    plugin->SetInputFormat("xml-single");
1044 // Optionally modify the name of the generated JDL (default analysis.jdl)
1045    plugin->SetJDLName(Form("%s.jdl", train_name.Data()));
1046 // Optionally modify the executable name (default analysis.sh)
1047    plugin->SetExecutable(Form("%s.sh", train_name.Data()));
1048 // Optionally modify job price (default 1)
1049    plugin->SetPrice(1);
1050 // Optionally modify split mode (default 'se')
1051    plugin->SetSplitMode("se");
1052    return plugin;
1053 }
1054
1055 //______________________________________________________________________________
1056 void WriteConfig()
1057 {
1058 // Write train configuration in a file. The file name has the format:
1059 // train_[trainName]_ddMonthyyyy_time.C
1060    if (useDATE) {
1061       gSystem->Exec("date +%d%b%Y_%Hh%M > date.tmp");
1062       ifstream fdate("date.tmp");
1063       if (!fdate.is_open()) {
1064          ::Error("AnalysisTrainNew.C::Export","Could not generate file name");
1065          return;
1066       }
1067       const char date[64];
1068       fdate.getline(date,64);
1069       fdate.close();
1070       gSystem->Exec("rm date.tmp");
1071       train_name = Form("train_%s_%s", train_name.Data(), date);
1072    } else {
1073       train_name = Form("train_%s", train_name.Data());
1074    }
1075    TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();
1076    gSystem->MakeDirectory(train_name);
1077    gSystem->ChangeDirectory(train_name);
1078    ofstream out;
1079    out.open(Form("%sConfig.C",train_name.Data()), ios::out);
1080    if (out.bad()) {
1081       ::Error("AnalysisTrainNew.C::Export", "Cannot open ConfigTrain.C for writing");
1082       return;
1083    }
1084    out << "{" << endl;
1085    out << "   train_name      = " << "\"" << train_name.Data() << "\";" << endl;
1086    out << "   proof_cluster   = " << "\"" << proof_cluster.Data() << "\";" << endl;
1087    out << "   useAFPAR        = " << useAFPAR << ";" << endl;
1088    if (useAFPAR)
1089       out << "   AFversion       = " << AFversion.Data() << ";" << endl;
1090    out << "   proof_dataset   = " << "\"" << proof_dataset.Data() << "\";" << endl;
1091    out << "   usePLUGIN       = " << usePLUGIN << ";" << endl;
1092    out << "   usePAR          = " << usePAR << ";" << endl;
1093    out << "   useCPAR         = " << useCPAR << ";" << endl;
1094    out << "   root_version    = " << "\"" << root_version.Data() << "\";" << endl;
1095    out << "   aliroot_version = " << "\"" << aliroot_version.Data() << "\";" << endl;
1096    out << "   alien_datadir   = " << "\"" << alien_datadir.Data() << "\";" << endl;
1097    if (!alien_outdir.Length()) alien_outdir = Form("output_%s",train_name.Data());
1098    out << "   alien_outdir    = " << "\"" << alien_outdir.Data() << "\";" << endl;
1099    out << "   maxMergeFiles   = " << maxMergeFiles << ";" << endl;
1100    out << "   mergeExclude    = " << "\"" << mergeExclude.Data() << "\";" << endl;
1101    out << "   nRunsPerMaster  = " << nRunsPerMaster << ";" << endl;
1102    out << "   nFilesPerJob    = " << nFilesPerJob << ";" << endl;
1103 //   for (Int_t i=0; i<10; i++) {
1104 //      if (run_numbers[i])
1105 //         out << "   run_numbers[" << i << "]  = " << run_numbers[i] << ";" << endl;
1106 //   }
1107    out << "   run_range[0]    = " << run_range[0] << ";" << endl;
1108    out << "   run_range[1]    = " << run_range[1] << ";" << endl;
1109    out << "   useDBG          = " << useDBG << ";" << endl;
1110    out << "   useMC           = " << useMC << ";" << endl;
1111    out << "   useTAGS         = " << useTAGS << ";" << endl;
1112    out << "   useKFILTER      = " << useKFILTER << ";" << endl;
1113    out << "   useTR           = " << useTR << ";" << endl;
1114    out << "   useCORRFW       = " << useCORRFW << ";" << endl;
1115    out << "   useAODTAGS      = " << useAODTAGS << ";" << endl;
1116    out << "   saveTrain       = " << "kFALSE;" << endl << endl;
1117    out << "   // Analysis modules" << endl;
1118    out << "   iAODanalysis    = " << iAODanalysis << ";" << endl;
1119    out << "   iAODhandler     = " << iAODhandler << ";" << endl;
1120    out << "   iESDfilter      = " << iESDfilter << ";" << endl;
1121    out << "   iMUONcopyAOD    = " << iMUONcopyAOD << ";" << endl;
1122    out << "   iJETAN          = " << iJETAN << ";" << endl;
1123    out << "   iPWG4partcorr   = " << iPWG4partcorr << ";" << endl;
1124    out << "   iPWG4gammaconv  = " << iPWG4gammaconv << ";" << endl;
1125    out << "   iPWG4omega3pi   = " << iPWG4omega3pi << ";" << endl;
1126    out << "   iPWG2femto      = " << iPWG2femto << ";" << endl;
1127    out << "   iPWG2spectra    = " << iPWG2spectra << ";" << endl;
1128    out << "     iPWG2protons      = " << iPWG2protons << ";" << endl;
1129    out << "     iPWG2checkcascade = " << iPWG2checkcascade << ";" << endl;
1130    out << "     iPWG2perfcascade  = " << iPWG2perfcascade << ";" << endl;
1131    out << "     iPWG2checkv0      = " << iPWG2checkv0 << ";" << endl;
1132    out << "     iPWG2strange      = " << iPWG2strange << ";" << endl;
1133    out << "   iPWG2flow       = " << iPWG2flow << ";" << endl;
1134    out << "   iPWG2res        = " << iPWG2res << ";" << endl;
1135    out << "   iPWG2kink       = " << iPWG2kink << ";" << endl;
1136    out << "     iPWG2kinkESDMC    = " << iPWG2kinkESDMC << ";" << endl;
1137    out << "     iPWG2kinkres      = " << iPWG2kinkres << ";" << endl;
1138    out << "     iPWG2kinklikesign = " << iPWG2kinklikesign << ";" << endl;
1139    out << "   iPWG2unicor     = " << iPWG2unicor << ";" << endl;
1140    out << "   iPWG2evchar     = " << iPWG2evchar << ";" << endl;
1141    out << "}" << endl;
1142    ::Info("AnalysisTrainNew.C::WriteConfig", "Train configuration wrote to file %s", Form("config_%s.C", train_name.Data()));
1143    gSystem->ChangeDirectory(cdir);
1144 }
1145
1146 //______________________________________________________________________________
1147 Bool_t LoadConfig(const char *filename)
1148 {
1149 // Read train configuration from file
1150    if (gSystem->AccessPathName(filename)) {
1151       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadConfig", "Config file name not found");
1152       return kFALSE;
1153    }
1154    gROOT->ProcessLine(Form(".x %s", filename));
1155    ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadConfig", "Train configuration loaded from file %s", filename);
1156    return kTRUE;
1157 }