ANALYSIS/macros/AnalysisTrainNew.C

   1 //===================== ANALYSIS TRAIN =========================================
   2 // To use: copy this macro to your work directory, modify the global part to match
   3 // your needs, then run root.
   4 //    root[0] .L AnalysisTrain.C
   5 // Grid full mode as below (other modes: test, offline, submit, terminate)
   6 //    root[1] AnalysisTrainNew("grid", "full")
   7 // CAF mode (requires root v5-23-02 + aliroot v4-16-Rev08)
   8 //    root[2] AnalysisTrainNew("proof")
   9 // Local mode requires AliESds.root or AliAOD.root in ./data directory
  10 //    root[3] AnalysisTrainNew("local")
  11 // In proof and grid modes, a token is needed and sourcing the produced environment file.
  12 //
  13 // If 'saveTrain' flag is set, the train will generate a directory name and run
  14 // in this directory. A configuration file 'ConfigTrain.C' will be generated.
  15 // One can replay at any time the train via:
  16 //    root[1] AnalysisTrainNew(ana_mode, plugin_mode, "train_default_<date>/ConfigTrain.C")
  17
  18 //==================   TRAIN NAME   ============================================
  19 TString     train_name         = "test"; // *CHANGE ME* (no blancs or special characters)
  20 TString     job_tag            = "test"; // *CHANGE ME*
  21 //==============================================================================
  22
  23 // ### Settings that make sense in PROOF only
  24 //==============================================================================
  25 TString     proof_cluster      = "alicecaf.cern.ch";
  26 Bool_t      useAFPAR           = kFALSE;  // use AF special par file
  27 TString     AFversion          = "AF-v4-17";
  28 // Change CAF dataset here
  29 TString     proof_dataset      = "/COMMON/COMMON/LHC09a4_run8100X#/esdTree";
  30 TString     proof_outdir       = "";
  31
  32 // ### Settings that make sense when using the Alien plugin
  33 //==============================================================================
  34 Int_t       runOnData          = 0;       // Set to 1 if processing real data
  35 Int_t       iCollision         = 0;       // 0=pp, 1=Pb-Pb
  36 Bool_t      usePLUGIN          = kTRUE;   // do not change
  37 Bool_t      useProductionMode  = kTRUE;   // use the plugin in production mode
  38 // Usage of par files ONLY in grid mode and ONLY if the code is not available
  39 // in the deployed AliRoot versions. Par file search path: local dir, if not there $ALICE_ROOT.
  40 // To refresh par files, remove the ones in the workdir, then do "make <target.par>" in
  41 // AliRoot.
  42 Bool_t      usePAR             = kFALSE;  // use par files for extra libs
  43 Bool_t      useCPAR            = kFALSE;  // use par files for common libs
  44 TString     root_version       = "v5-25-04-3";  // *CHANGE ME IF MORE RECENT IN GRID*
  45 TString     aliroot_version    = "v4-18-16-AN";  // *CHANGE ME IF MORE RECENT IN GRID*
  46 // Change production base directory here
  47 TString     alien_datadir      = "/alice/sim/PDC_09/LHC09a4";
  48 // AliEn output directory. If blank will become output_<train_name>
  49 TString     alien_outdir       = "/alice/sim/PDC_09/LHC09a4/AOD3";
  50 // TString     alien_outdir       = "";
  51 // Output folder to write delta AOD's. Considered if not null.
  52 TString     outputSingleFolder = "";
  53 //TString     outputSingleFolder = "deltas";
  54 // Number of files merged in a chunk
  55 Int_t       maxMergeFiles      = 20;
  56 // Files that should not be merged
  57 TString     mergeExclude       = "AliAOD.root AliAOD.VertexingHF.root AliAOD.Jets.root deltaAODPartCorr.root AliAOD.Muons.root resonances.root forward.root";
  58 // Make replicas on the storages below
  59 TString     outputStorages      = "disk=4";
  60 // Number of runs per master job
  61 Int_t       nRunsPerMaster     = 10;
  62 // Maximum number of files per job (gives size of AOD)
  63 Int_t       nFilesPerJob       = 100;
  64 // Int_t       nFilesPerJob       = 1; (AOD->delta AOD production case)
  65 // Set the run range
  66 Int_t       run_range[2]       =  {81007, 81656};  // LHC09a7   *CHANGE ME*
  67 // ### Settings that make sense only for local analysis
  68 //==============================================================================
  69 // Change local xml dataset for local interactive analysis
  70 TString     local_xmldataset   = "";
  71
  72 // ### Other flags to steer the analysis
  73 //==============================================================================
  74 Bool_t      useDATE            = kFALSE; // use date in train name
  75 Bool_t      useDBG             = kFALSE; // activate debugging
  76 Bool_t      useMC              = kTRUE;  // use MC info
  77 Bool_t      useTAGS            = kTRUE; // use ESD tags for selection
  78 Bool_t      useKFILTER         = kTRUE; // use Kinematics filter
  79 Bool_t      useTR              = kTRUE;  // use track references
  80 Bool_t      useCORRFW          = kFALSE; // do not change
  81 Bool_t      useAODTAGS         = kFALSE;  // use AOD tags
  82 Bool_t      saveTrain          = kTRUE;  // save train configuration as:
  83 Bool_t      saveCanvases       = kTRUE; // save canvases created in Terminate
  84 Bool_t      saveProofToAlien   = kFALSE; // save proof outputs in AliEn
  85                                          // train_[trainName]_ddMonthyyyy_time.C
  86 // ### Analysis modules to be included. Some may not be yet fully implemented.
  87 //==============================================================================
  88 Int_t       iAODanalysis       = 0;      // Analysis on input AOD's
  89 Int_t       iAODhandler        = 0;      // Analysis produces an AOD or dAOD's
  90 Int_t       iESDfilter         = 0;      // ESD to AOD filter (barrel + muon tracks)
  91 Int_t       iMUONcopyAOD       = 0;      // Task that copies only muon events in a separate AOD (PWG3)
  92 Int_t       iJETAN             = 0;      // Jet analysis (PWG4)
  93 Int_t       iJETANdelta        = 0;      // Jet delta AODs
  94 Int_t       iPWG4partcorr      = 0;      // Gamma-hadron correlations task (PWG4)
  95 Int_t       iPWG4gammaconv     = 0;      // Gamma conversion analysis (PWG4)
  96 Int_t       iPWG4omega3pi      = 0;      // Omega to 3 pi analysis (PWG4)
  97 Int_t       iPWG3vertexing     = 0;      // Vertexing HF task (PWG3)
  98 Int_t       iPWG3hfe           = 0;      // Electrons analysis (PWG3)
  99 Int_t       iPWG3d2h           = 0;      // D0->2 hadrons (PWG3)
 100 Int_t        iPWG3d0mass       = 0;      // D0 mass (PWG3D2H)
 101 Int_t        iPWG3d0massLS     = 0;      // D0 mass LS (PWG3D2H)
 102 Int_t        iPWG3dplus        = 0;      // D+ analysis (PWG3D2H)
 103 Int_t        iPWG3LSd0         = 0;      // LS D0 analysis (PWG3D2H)
 104 Int_t        iPWG3LSjpsi       = 0;      // LS J/Psi analysis (PWG3D2H)
 105 Int_t        iPWG3CFd0         = 0;      // CF D0 analysis (PWG3D2H)
 106 Int_t        iPWG3promptd0     = 0;      // prompt D0 analysis (PWG3D2H)
 107 Int_t       iPWG3MuonTrain     = 0;      // Muon analysis train
 108 Int_t       iPWG2femto         = 0;      // Femtoscopy task (PWG2)
 109 Int_t       iPWG2spectra       = 1;      // Spectra tasks (PWG2
 110 Int_t        iPWG2protons      = 0;         // Proton-antiproton analysis
 111 Int_t        iPWG2checkcascade = 1;         // Check cascades task
 112 Int_t        iPWG2perfcascade  = 0;         // Check performance cascade
 113 Int_t        iPWG2checkv0      = 0;         // Check V0 task
 114 Int_t        iPWG2strange      = 0;         // Strangeness task
 115 Int_t        iPWG2central      = 0;         // Anisothropy in central collisions
 116 Int_t       iPWG2flow          = 0;      // Flow analysis tasks (PWG2)
 117 Int_t       iPWG2res           = 0;      // Resonances task (PWG2)
 118 Int_t        iPWG2rsneff       = 0;      // Resonances efficiency
 119 Int_t       iPWG2kink          = 0;      // Kink analysis tasks (PWG2)
 120 Int_t        iPWG2kinkESDMC    = 0;         // Kink ESD-MC comparison (PWG2)
 121 Int_t        iPWG2kinkLSKstar  = 0;      // Kink like-sign K* (PWG2)
 122 Int_t        iPWG2kinkLSL1520  = 0;      // Kink like-sign L1520 (PWG2)
 123 Int_t        iPWG2kinkLSPhi    = 0;      // Kink like-sign Phi (PWG2)
 124 Int_t        iPWG2kinkKstarESD = 0;      // Kink Kstar ESD (PWG2)
 125 Int_t        iPWG2kinkKstarMC  = 0;      // Kink Kstar MC (PWG2)
 126 Int_t        iPWG2kinkL1520ESD = 0;      // Kink L1520 ESD (PWG2)
 127 Int_t        iPWG2kinkL1520MC  = 0;      // Kink L1520 MC (PWG2)
 128 Int_t        iPWG2kinkPhiESD   = 0;      // Kink resonances Phi ESD (PWG2)
 129 Int_t        iPWG2kinkPhiMC    = 0;      // Kink resonances Phi MC (PWG2)
 130 Int_t       iPWG2evchar        = 0;      // Event characteristics (PWG2)
 131 Int_t       iPWG2unicor        = 0;      // Unicor analysis (PWG2)
 132 Int_t       iPWG2forward       = 0;      // FMD analysis (PWG2)
 133
 134 // ### Configuration macros used for each module
 135 //==============================================================================
 136 TString     configPWG2femto    = "$ALICE_ROOT/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/Train/Train3/ConfigFemtoAnalysis.C";
 137 //TString     configPWG3d2h      = "$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/ConfigVertexingHF_highmult.C";
 138 TString     configPWG3d2h      = "$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/ConfigVertexingHF.C";
 139 // Temporaries.
 140 TString anaPars = "";
 141 TString anaLibs = "";
 142 // Function signatures
 143 class AliAnalysisAlien;
 144
 145 //______________________________________________________________________________
 146 void AnalysisTrainNew(const char *analysis_mode="grid",
 147                       const char *plugin_mode="full",
 148                       const char *config_file="")
 149 {
 150 // Main analysis train macro. If a configuration file is provided, all parameters
 151 // are taken from there but may be altered by CheckModuleFlags.
 152    if (strlen(config_file) && !LoadConfig(config_file)) return;
 153    TString smode(analysis_mode);
 154    smode.ToUpper();
 155    // Check compatibility of selected modules
 156    CheckModuleFlags(smode);
 157    if (saveTrain)              WriteConfig();
 158
 159    printf("==================================================================\n");
 160    printf("===========    RUNNING ANALYSIS TRAIN %s IN %s MODE   ==========\n", train_name.Data(),smode.Data());
 161    printf("==================================================================\n");
 162    printf("=  Configuring analysis train for:                               =\n");
 163    if (iAODanalysis) printf("=  AOD analysis                                                  =\n");
 164    else              printf("=  ESD analysis                                                  =\n");
 165    if (iESDfilter)   printf("=  ESD filter                                                    =\n");
 166    if (iMUONcopyAOD) printf("=  MUON copy AOD                                                 =\n");
 167    if (iJETAN)       printf("=  Jet analysis                                                  =\n");
 168    if (iJETANdelta)  printf("=     Jet delta AODs                                             =\n");
 169    if (iPWG2spectra) {
 170       printf("=  PWG2 SPECTRA tasks :                                          =\n");
 171       if (iPWG2protons)      printf("=     PWG2 proton-antiproton                                     =\n");
 172       if (iPWG2checkcascade) printf("=     PWG2 check cascades                                        =\n");
 173       if (iPWG2perfcascade)  printf("=     PWG2 performance cascades                                  =\n");
 174       if (iPWG2checkv0)      printf("=     PWG2 check V0                                              =\n");
 175       if (iPWG2strange)      printf("=     PWG2 strangeness                                           =\n");
 176       if (iPWG2central)      printf("=     PWG2 central                                               =\n");
 177    }
 178    if (iPWG2femto) {
 179       printf("=  PWG2 femtoscopy                                               =\n");
 180       printf("   +++ configured by: %s\n", configPWG2femto.Data());
 181    }
 182    if (iPWG2flow)    printf("=  PWG2 flow                                                     =\n");
 183    if (iPWG2res)     printf("=  PWG2 resonances                                               =\n");
 184       if (iPWG2rsneff)    printf("=     PWG2 resonances efficiency                                    =\n");
 185    if (iPWG2kink) {
 186       printf("=  PWG2 kink analysis tasks:                                     =\n");
 187       if (iPWG2kinkESDMC)    printf("=     PWG2 ESD-MC kinks                                          =\n");
 188       if (iPWG2kinkLSKstar)  printf("=     PWG2 kink like-sign analysis K*                            =\n");
 189       if (iPWG2kinkLSL1520)  printf("=     PWG2 kink like-sign analysis L1520                         =\n");
 190       if (iPWG2kinkLSPhi)    printf("=     PWG2 kink like-sign analysis Phi                           =\n");
 191       if (iPWG2kinkKstarESD) printf("=     PWG2 kink Kstar ESD analysis                               =\n");
 192       if (iPWG2kinkKstarMC)  printf("=     PWG2 kink Kstar MC analysis                                =\n");
 193       if (iPWG2kinkL1520ESD) printf("=     PWG2 kink L1520 ESD analysis                               =\n");
 194       if (iPWG2kinkL1520MC)  printf("=     PWG2 kink L1520 MC analysis                                =\n");
 195       if (iPWG2kinkPhiESD) printf("=     PWG2 kink Phi ESD analysis                                 =\n");
 196       if (iPWG2kinkPhiMC)  printf("=     PWG2 kink Phi MC analysis                                  =\n");
 197   }
 198    if (iPWG2evchar)    printf("=  PWG2 event characteristics                                    =\n");
 199    if (iPWG2unicor)    printf("=  PWG2 Unicor analysis                                          =\n");
 200    if (iPWG2forward)   printf("=  PWG2 forward: sharing, density, bkg. correction, dNdEta       =\n");
 201    if (iPWG3vertexing) printf("=  PWG3 vertexing                                                =\n");
 202    if (iPWG3hfe)       printf("=  PWG3 electrons                                                =\n");
 203    if (iPWG3d2h) {
 204       printf("=  PWG3 D0->2 hadrons tasks                                      =\n");
 205       printf("   +++ configured by: %s\n", configPWG3d2h.Data());
 206       if (iPWG3d0mass)       printf("=     PWG3 D0 mass                                               =\n");
 207       if (iPWG3d0massLS)     printf("=     PWG3 D0 mass LS                                            =\n");
 208       if (iPWG3dplus)        printf("=     PWG3 D+ analysis                                           =\n");
 209       if (iPWG3LSd0)         printf("=     PWG3 LS D0                                                 =\n");
 210       if (iPWG3LSjpsi)       printf("=     PWG3 LS J/Psi                                              =\n");
 211       if (iPWG3CFd0)         printf("=     PWG3 CF D0                                                 =\n");
 212       if (iPWG3promptd0)     printf("=     PWG3 prompt D0                                             =\n");
 213    }
 214    if (iPWG3MuonTrain) printf("=  PWG3 muon train                                               =\n");
 215    if (iPWG4partcorr)  printf("=  PWG4 gamma-hadron, pi0 and gamma-jet correlations             =\n");
 216    if (iPWG4gammaconv) printf("=  PWG4 gamma conversion                                         =\n");
 217    if (iPWG4omega3pi)  printf("=  PWG4 omega to 3 pions                                         =\n");
 218    printf("==================================================================\n");
 219    printf(":: use MC truth      %d\n", (UInt_t)useMC);
 220    printf(":: use KINE filter   %d\n", (UInt_t)useKFILTER);
 221    printf(":: use track refs    %d\n", (UInt_t)useTR);
 222    printf(":: use tags          %d\n", (UInt_t)useTAGS);
 223    printf(":: use AOD tags      %d\n", (UInt_t)useAODTAGS);
 224    printf(":: use debugging     %d\n", (UInt_t)useDBG);
 225    printf(":: use PAR files     %d\n", (UInt_t)usePAR);
 226    printf(":: use AliEn plugin  %d\n", (UInt_t)usePLUGIN);
 227
 228    //==========================================================================
 229    // Connect to back-end system
 230    if (!Connect(smode)) {
 231       ::Error("AnalysisTrain", "Could not connect to %s back-end", analysis_mode);
 232       return;
 233    }
 234
 235    // Load common libraries and set include path
 236    if (!LoadCommonLibraries(smode)) {
 237       ::Error("AnalysisTrain", "Could not load common libraries");
 238       return;
 239    }
 240
 241    // Make the analysis manager and connect event handlers
 242    AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("Analysis Train", "Production train");
 243    if (saveProofToAlien) mgr->SetSpecialOutputLocation(proof_outdir);
 244    if (!strcmp(plugin_mode, "test")) mgr->SetNSysInfo(1);
 245    // Load analysis specific libraries
 246    if (!LoadAnalysisLibraries(smode)) {
 247       ::Error("AnalysisTrain", "Could not load analysis libraries");
 248       return;
 249    }
 250
 251    // Create input handler (input container created automatically)
 252    if (iAODanalysis) {
 253    // AOD input handler
 254       AliAODInputHandler *aodH = new AliAODInputHandler();
 255       if (iPWG3d2h) aodH->AddFriend("AliAOD.VertexingHF.root");
 256       mgr->SetInputEventHandler(aodH);
 257    } else {
 258    // ESD input handler
 259       AliESDInputHandler *esdHandler = new AliESDInputHandler();
 260       if (useTAGS) esdHandler->SetReadTags();
 261       mgr->SetInputEventHandler(esdHandler);
 262    }
 263    // Monte Carlo handler
 264    if (useMC && !iAODanalysis) {
 265       AliMCEventHandler* mcHandler = new AliMCEventHandler();
 266       mgr->SetMCtruthEventHandler(mcHandler);
 267       mcHandler->SetReadTR(useTR);
 268    }
 269    // AOD output container, created automatically when setting an AOD handler
 270    if (iAODhandler) {
 271       // AOD output handler
 272       AliAODHandler* aodHandler   = new AliAODHandler();
 273       aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.root");
 274       mgr->SetOutputEventHandler(aodHandler);
 275       if (iAODanalysis) {
 276          aodHandler->SetFillAOD(kFALSE);
 277          aodHandler->SetCreateNonStandardAOD();
 278          if (iJETAN)         aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.Jets.root");
 279 //         if (iPWG3vertexing) aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.VertexingHF.root");
 280       }
 281    }
 282    // Debugging if needed
 283    if (useDBG) mgr->SetDebugLevel(3);
 284    if (saveCanvases) mgr->SetSaveCanvases(kTRUE);
 285
 286    //==========================================================================
 287    // Create the chain. In this example it is created only from ALIEN files but
 288    // can be done to work in batch or grid mode as well.
 289    TChain *chain = CreateChain(smode, plugin_mode);
 290
 291    //==========================================================================
 292    // Load the tasks configuration macros for all wagons. These files are supposed now to be
 293    // in the current workdir, but in AliEn they will be in the file catalog,
 294    // mapped from AliRoot and pecified in the jdl input list.
 295
 296    // For now connection to top input container and common AOD output container
 297    // is done in this macro, but in future these containers will be connected
 298    // from each task configuration macro.
 299
 300    AddAnalysisTasks();
 301
 302    // Run the analysis
 303    //
 304    if (usePLUGIN) {
 305       AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(plugin_mode);
 306       AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->SetGridHandler(alienHandler);
 307    }
 308
 309    if (mgr->InitAnalysis()) {
 310       mgr->PrintStatus();
 311       if (saveTrain || strlen(config_file)) gSystem->ChangeDirectory(train_name);
 312       StartAnalysis(smode, chain);
 313       if (saveTrain && smode=="GRID") {
 314          AliAnalysisAlien *gridhandler = (AliAnalysisAlien*)mgr->GetGridHandler();
 315          TString alien_workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
 316          if (iAODanalysis) alien_workdir += "analysisAOD";
 317          else              alien_workdir += "analysisESD";
 318          alien_outdir = gridhandler->GetGridOutputDir();
 319          printf("=== Registering ConfigTrain.C in the work directory <%s> ===\n",
 320                 alien_workdir.Data());
 321          if (AliAnalysisAlien::FileExists(Form("%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data())))
 322             gGrid->Rm(Form("%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data()));
 323          if (strcmp(plugin_mode, "test"))
 324             TFile::Cp(Form("file:%sConfig.C",train_name.Data()), Form("alien://%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data()));
 325       }
 326    }
 327 }
 328
 329 //______________________________________________________________________________
 330 void AddAnalysisTasks()
 331 {
 332 // Add all analysis task wagons to the train
 333    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 334
 335    if (iESDfilter && !iAODanalysis) {
 336       //  ESD filter task configuration.
 337       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskESDFilter.C");
 338       if (iMUONcopyAOD) {
 339          printf("Registering delta AOD file\n");
 340          mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.Muons.root");
 341          AliAnalysisTaskESDfilter *taskesdfilter = AddTaskESDFilter(useKFILTER, kTRUE);
 342       } else {
 343          AliAnalysisTaskESDfilter *taskesdfilter = AddTaskESDFilter(useKFILTER, kFALSE);
 344       }
 345    }
 346
 347    // AOD tags
 348    if (useAODTAGS) {
 349       AliAnalysisTaskTagCreator* tagTask = new AliAnalysisTaskTagCreator("AOD Tag Creator");
 350       mgr->AddTask(tagTask);
 351       AliAnalysisDataContainer *coutTags = mgr->CreateContainer("cTag",  TTree::Class(),
 352                                            AliAnalysisManager::kOutputContainer, "AOD.tag.root");
 353       mgr->ConnectInput (tagTask, 0, mgr->GetCommonInputContainer());
 354       mgr->ConnectOutput(tagTask, 1, coutTags);
 355    }
 356
 357 // ********** PWG2 wagons ******************************************************
 358    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 359
 360    // Proton analysis
 361    if (iPWG2spectra) {
 362       // protons
 363       if (iPWG2protons) {
 364         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskProtons.C");
 365         AliAnalysisTaskProtons *taskprotons = AddTaskProtons();
 366         if (!taskprotons) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskProtons cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 367       }
 368       // cascades
 369       if (iPWG2checkcascade) {
 370         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckCascade.C");
 371         AliAnalysisTaskCheckCascade *taskcheckcascade = AddTaskCheckCascade(iCollision,runOnData);
 372         if (!taskcheckcascade) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckCascade cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 373       }
 374       // v0's
 375       if (iPWG2checkv0) {
 376         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckV0.C");
 377         AliAnalysisTaskCheckV0 *taskcheckV0 = AddTaskCheckV0();
 378         if (!taskcheckV0) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckV0 cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 379       }
 380       // strangeness
 381       if (iPWG2strange) {
 382         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskStrange.C");
 383         AliAnalysisTaskStrange *taskstrange = AddTaskStrange();
 384         if (!taskstrange) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskStrange cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 385       }
 386       // performance cascades
 387       if (iPWG2perfcascade) {
 388         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckPerformanceCascade.C");
 389         AliAnalysisTaskCheckPerformanceCascade *taskperfcascade = AddTaskCheckPerformanceCascade();
 390         if (!taskperfcascade) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckPerformanceCascade cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 391       }
 392        // central
 393       if (iPWG2central) {
 394         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCentral.C");
 395         AliAnalysisTaskCentral *taskcentral = AddTaskCentral();
 396         if (!taskcentral) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCentral cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 397       }
 398   }
 399
 400    // Femtoscopy analysis modules
 401    if (iPWG2femto) {
 402       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/AddTaskFemto.C");
 403       AliAnalysisTaskFemto *taskfemto = AddTaskFemto(configPWG2femto);
 404       if (!taskfemto) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskFemto cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 405    }
 406
 407    // Kink analysis
 408    if (iPWG2kink) {
 409       if (iPWG2kinkESDMC) {
 410         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKink.C");
 411         AliAnalysisKinkESDMC *taskkink1 = AddTaskKink();
 412         if (!taskkink1) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkESDMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 413       }
 414       if (iPWG2kinkLSKstar) {
 415         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignKstar.C");
 416         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink2 = AddTaskKinkResLikeSignKstar();
 417         if (!taskkink2) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 418       }
 419       if (iPWG2kinkLSL1520) {
 420         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignL1520.C");
 421         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink3 = AddTaskKinkResLikeSignL1520();
 422         if (!taskkink3) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 423       }
 424       if (iPWG2kinkLSPhi) {
 425         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignPhi.C");
 426         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink4 = AddTaskKinkResLikeSignPhi();
 427         if (!taskkink4) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 428       }
 429       if (iPWG2kinkKstarESD) {
 430         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceKstarESD.C");
 431         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink5 = AddTaskKinkResonanceKstarESD();
 432         if (!taskkink5) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceKstarESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 433       }
 434       if (iPWG2kinkKstarMC) {
 435         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceKstarMC.C");
 436         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink6 = AddTaskKinkResonanceKstarMC();
 437         if (!taskkink6) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceKstarMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 438       }
 439       if (iPWG2kinkL1520ESD) {
 440         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceL1520ESD.C");
 441         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink7 = AddTaskKinkResonanceL1520ESD();
 442         if (!taskkink7) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceL1520ESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 443       }
 444       if (iPWG2kinkL1520MC) {
 445         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceL1520MC.C");
 446         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink8 = AddTaskKinkResonanceL1520MC();
 447         if (!taskkink8) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceL1520MC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 448       }
 449       if (iPWG2kinkPhiESD) {
 450         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonancePhiESD.C");
 451         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink9 = AddTaskKinkResonancePhiESD();
 452         if (!taskkink9) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonancePhiESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 453       }
 454       if (iPWG2kinkPhiMC) {
 455         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonancePhiMC.C");
 456         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink10 = AddTaskKinkResonancePhiMC();
 457         if (!taskkink10) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonancePhiMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 458       }
 459    }
 460
 461    // Event characterization
 462    if (iPWG2evchar) {
 463       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/EVCHAR/macros/AddTaskSPDdNdEta.C");
 464       AliAnalysisTaskSPDdNdEta *taskspddndeta = AddTaskSPDdNdEta();
 465       if (!taskspddndeta) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskSPDdNdEta cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 466       taskspddndeta->SetReadMC(useMC);
 467    }
 468
 469    // Unicor
 470    if (iPWG2unicor) {
 471       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/UNICOR/AddTaskUnicor.C");
 472       AliAnalysisTaskUnicor *taskunicor = AddTaskUnicor();
 473       if (!taskunicor) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskUnicor cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 474    }
 475
 476    // FMD
 477    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("forward.root");
 478    if (iPWG2forward) {
 479       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FORWARD/analysis/AddTaskFMD.C");
 480       AliFMDAnalysisTaskSE *taskfmd = AddTaskFMD();
 481       if (!taskfmd) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliFMDAnalysisTaskSE cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 482    }
 483    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 484
 485    // Flow analysis
 486    if (iPWG2flow) {
 487       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FLOW/macros/AddTaskFlow.C");
 488       Bool_t SP       = kTRUE;
 489       Bool_t LYZ1SUM  = kTRUE;
 490       Bool_t LYZ1PROD = kTRUE;
 491       Bool_t LYZ2SUM  = kFALSE;
 492       Bool_t LYZ2PROD = kFALSE;
 493       Bool_t LYZEP    = kFALSE;
 494       Bool_t GFC      = kTRUE;
 495       Bool_t QC       = kTRUE;
 496       Bool_t FQD      = kFALSE;
 497       Bool_t MCEP     = kFALSE; //does not work yet 24/12/08
 498       Bool_t kineFromESD = kTRUE;
 499       Bool_t METHODS[] = {SP,LYZ1SUM,LYZ1PROD,LYZ2SUM,LYZ2PROD,LYZEP,GFC,QC,FQD,MCEP};
 500       // Analysis type can be ESD, AOD, MC, ESDMC0, ESDMC1
 501       TString type = "AOD";
 502       if (!iAODanalysis) type = "ESD";
 503       // Boolean to fill/not fill the QA histograms
 504       Bool_t QA = kTRUE;
 505       // Boolean to use/not use weights for the Q vector
 506       Bool_t WEIGHTS[] = {kFALSE,kFALSE,kFALSE}; //Phi, v'(pt), v'(eta)
 507       AliAnalysisTaskFlowEvent* taskFE = AddTaskFlow(type,METHODS,QA,WEIGHTS);
 508       if (!taskFE) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskFlowEvent cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 509    }
 510
 511    // PWG2 resonances
 512    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("resonances.root");
 513    if (iPWG2res) {
 514       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train/AddAnalysisTaskRsnNew.C");
 515       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train/AddAnalysisTaskRsnEffNew.C");
 516       TString path = gROOT->GetMacroPath();
 517       path += ":$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train";
 518       gROOT->SetMacroPath(path);
 519       AddAnalysisTaskRsn(kTRUE);
 520       if (iPWG2rsneff) AddAnalysisTaskRsnEff();
 521    }
 522    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 523
 524 // ********** PWG3 wagons ******************************************************
 525    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG3histograms.root");
 526
 527    // PWG3 vertexing
 528    if (iPWG3vertexing) {
 529       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/AddTaskVertexingHF.C");
 530       if (!iPWG3d2h) TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(configPWG3d2h.Data()), Form("%s/ConfigVertexingHF.C", train_name.Data()));
 531       AliAnalysisTaskSEVertexingHF *taskvertexingHF = AddTaskVertexingHF();
 532       if (!taskvertexingHF) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskSEVertexingHF cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 533       else mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.VertexingHF.root");
 534    }
 535
 536    // PWG3 electrons
 537    if (iPWG3hfe) {
 538       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/hfe/AddTaskHFE.C");
 539       AliAnalysisTaskHFE *taskHFE = AddTaskHFE();
 540       if (!taskHFE) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskHFE cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 541    }
 542
 543    // PWG3 D2h
 544    if (iPWG3d2h) {
 545       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/AddD2HTrain.C");
 546       TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(configPWG3d2h.Data()), Form("%s/ConfigVertexingHF.C", train_name.Data()));
 547       AddD2HTrain(iPWG3d0mass,iPWG3d0massLS,iPWG3dplus, iPWG3LSd0, iPWG3LSjpsi, iPWG3CFd0, iPWG3promptd0);
 548    }
 549
 550    // PWG3 muon
 551    if (iPWG3MuonTrain) {
 552       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/muon/AddPWG3MuonTrain.C");
 553       // iESDAnalysis, iAODAnalysis -> flags to select if the train is AOD or ESD based
 554       // iMuonDistributions, iSingleMuonANAlysis -> flags to switch on/off analysis wagons
 555       Int_t isESDAnalysis = (iAODanalysis)?0:1;
 556       Int_t isAODAnalysis = (iAODanalysis)?1:0;
 557       Int_t addMuonDistributions = 1;
 558       Int_t addSingleMuonAnalysis = 1;
 559       Int_t addMuonHFAnalysis = 1;
 560       Int_t ntaskmuon = AddPWG3MuonTrain(isESDAnalysis,isAODAnalysis,addMuonDistributions,addSingleMuonAnalysis,addMuonHFAnalysis);
 561       printf("Added %d muon tasks\n", ntaskmuon);
 562    }
 563
 564 // ********** PWG4 wagons ******************************************************
 565    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG4histograms.root");
 566
 567     // Jet analysis
 568    if (iJETAN) {
 569       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskJets.C");
 570       if (!iAODanalysis) {
 571          // Default jet reconstructor running on ESD's
 572          AliAnalysisTaskJets * taskjets = AddTaskJets();
 573          if (!taskjets) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskJets cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 574          if (iJETANdelta) {
 575             AddTaskJetsDelta("AliAOD.Jets.root");
 576             mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.Jets.root");
 577          }
 578       } else {
 579          // AOD-based analysis. Add all reconstructors to write into delta AOD's
 580          if (iJETANdelta) {
 581             Int_t ntasksjets = AddTaskJetsDelta("AliAOD.Jets.root");
 582             if (ntasksjets) printf("Added %d jet reconstructors\n", ntasksjets);
 583          }
 584       }
 585    }
 586    // PWG4 hadron correlations
 587    if (iPWG4partcorr) {
 588       Bool_t isSimulation = (runOnData)?kFALSE:kTRUE;
 589       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskPartCorr.C");
 590       AliAnalysisTaskParticleCorrelation *taskpartcorrPHOS = AddTaskPartCorr("AOD", "PHOS", useMC, kFALSE, isSimulation);
 591       if (!taskpartcorrPHOS) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskParticleCorrelation PHOS cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 592       AliAnalysisTaskParticleCorrelation *taskpartcorrEMCAL = AddTaskPartCorr("AOD", "EMCAL", useMC, kFALSE, isSimulation);
 593       if (!taskpartcorrEMCAL) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskParticleCorrelation EMCAL cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 594       mgr->RegisterExtraFile("deltaAODPartCorr.root");
 595    }
 596
 597    // PWG4 gamma conversion analysis
 598    if (iPWG4gammaconv) {
 599       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskGammaConversion.C");
 600       TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();
 601       gSystem->ChangeDirectory(gSystem->ExpandPathName("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/"));
 602       TString gcArguments = "-run-on-train -run-jet -run-chic -run-neutralmeson -run-cf";
 603       AliAnalysisTaskGammaConversion * taskGammaConversion = AddTaskGammaConversion(gcArguments,mgr->GetCommonInputContainer());
 604       gSystem->ChangeDirectory(cdir);
 605       if (!taskGammaConversion) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskGammaConversion cannot run for these train conditions - EXCLUDED");
 606    }
 607
 608    // PWG4 omega to 3 pions analysis
 609    if (iPWG4omega3pi) {
 610       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskomega3pi.C");
 611       AliAnalysisTaskOmegaPi0PiPi *taskomega3pi = AddTaskomega3pi();
 612       if (!taskomega3pi) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskomega3pi cannot run for these train conditions - EXCLUDED");
 613    }
 614 }
 615
 616 //______________________________________________________________________________
 617 void StartAnalysis(const char *mode, TChain *chain) {
 618 // Start analysis.
 619    Int_t imode = -1;
 620    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 621    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 622    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 623    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 624    switch (imode) {
 625       case 0:
 626          if (!chain) {
 627             ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Cannot create the chain");
 628             return;
 629          }
 630          mgr->StartAnalysis(mode, chain);
 631          return;
 632       case 1:
 633          if (!proof_dataset.Length()) {
 634             ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "proof_dataset is empty");
 635             return;
 636          }
 637          mgr->StartAnalysis(mode, proof_dataset, 1000);
 638          return;
 639       case 2:
 640          if (usePLUGIN) {
 641             if (!mgr->GetGridHandler()) {
 642                ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Grid plugin not initialized");
 643                return;
 644             }
 645             mgr->StartAnalysis("grid");
 646          } else {
 647             if (!chain) {
 648                ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Cannot create the chain");
 649                return;
 650             }
 651             mgr->StartAnalysis(mode, chain);
 652          }
 653          return;
 654    }
 655 }
 656
 657 //______________________________________________________________________________
 658 void CheckModuleFlags(const char *mode) {
 659 // Checks selected modules and insure compatibility
 660    Int_t imode = -1;
 661    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 662    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 663    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 664    if (!iJETAN) iJETANdelta = 0;
 665    if (imode==1) {
 666       if (!usePAR) {
 667          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PAR files enabled due to PROOF analysis");
 668          usePAR = kTRUE;
 669       }
 670    }
 671    if (imode != 2) {
 672       ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "AliEn plugin disabled since not in GRID mode");
 673       usePLUGIN = kFALSE;
 674    }
 675    if (iAODanalysis) {
 676    // AOD analysis
 677       if (useMC)
 678          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "MC usage disabled in analysis on AOD's");
 679       if (useAODTAGS)
 680          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "AOD tags usage disabled in analysis on AOD's");
 681       useMC = kFALSE;
 682       useTR = kFALSE;
 683       useAODTAGS = kFALSE;
 684       if (iESDfilter)
 685          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "ESD filter disabled in analysis on AOD's");
 686       iESDfilter   = 0;
 687       if (!iAODhandler) {
 688          if (iJETAN)
 689             ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "JETAN disabled in analysis on AOD's without AOD handler");
 690          iJETAN = 0;
 691          iJETANdelta = 0;
 692       }
 693       // Disable tasks that do not work yet on AOD data
 694       if (iPWG4gammaconv)
 695          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4gammaconv disabled on AOD's without AOD handler");
 696       iPWG4gammaconv = 0;
 697       if (iPWG2central)
 698          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2central disabled on AOD's");
 699          iPWG2central = 0;
 700       if (iPWG2flow)
 701          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2flow disabled on AOD's");
 702          iPWG2flow = 0;
 703       if (iPWG2femto)
 704          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2femto disabled on AOD's");
 705          iPWG2femto = 0;
 706       if (iPWG2res)
 707          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2res disabled on AOD's");
 708          iPWG2res = 0;
 709        if (iPWG2rsneff)
 710          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2rsneff disabled on AOD's");
 711          iPWG2rsneff = 0;
 712      if (iPWG2kink)
 713          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2kink disabled in analysis on AOD's");
 714          iPWG2kink = 0;
 715       if (iPWG2unicor)
 716          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2unicor disabled in analysis on AOD's");
 717          iPWG2unicor = 0;
 718       if (iPWG2evchar)
 719          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4evchar disabled on AOD's");
 720          iPWG2evchar = 0;
 721       if (iPWG2forward)
 722          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2forward disabled in analysis on AOD's");
 723          iPWG2forward = 0;
 724       if (iPWG3hfe)
 725          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG3hfe disabled on AOD's");
 726          iPWG3hfe = 0;
 727       if (iPWG4omega3pi)
 728          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4omega3pi disabled on AOD's");
 729          iPWG4omega3pi = 0;
 730    } else {
 731    // ESD analysis
 732       if (!useMC) useTR = kFALSE;
 733       if (!useTR) {
 734          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "iPWG2evchar disabled if not reading track references");
 735          iPWG2evchar = 0;
 736       }
 737    }
 738    if (!useMC) {
 739       if (iPWG2perfcascade)
 740          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2perfcascade disabled without MC info");
 741       iPWG2perfcascade = 0;
 742       if (iPWG2central)
 743          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2central disabled without MC info");
 744          iPWG2central = 0;
 745    }
 746    if (iJETAN && !iAODanalysis) iESDfilter=1;
 747    if (iESDfilter) {iAODhandler=1; useCORRFW = kTRUE;}
 748    if (iPWG2spectra || iPWG2flow || iPWG3vertexing || iPWG3hfe || iPWG2res || iPWG2rsneff) useCORRFW = kTRUE;
 749    if (useKFILTER && !useMC) useKFILTER = kFALSE;
 750    if (useAODTAGS && !iAODhandler) useAODTAGS = kFALSE;
 751 }
 752
 753 //______________________________________________________________________________
 754 Bool_t Connect(const char *mode) {
 755 // Connect <username> to the back-end system.
 756    Int_t imode = -1;
 757    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 758    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 759    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 760    TString username = gSystem->Getenv("alien_API_USER");
 761    switch (imode) {
 762       case 0:
 763          break;
 764       case 1:
 765          if  (!username.Length()) {
 766             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Make sure you:\n \
 767                            1. Have called: alien-token-init <username>\n \
 768                            2. Have called: >source /tmp/gclient_env_$UID");
 769             return kFALSE;
 770          }
 771          ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Connecting user <%s> to PROOF cluster <%s>",
 772                 username.Data(), proof_cluster.Data());
 773          gEnv->SetValue("XSec.GSI.DelegProxy", "2");
 774 //         TProof::Open(Form("%s@%s:31093", username.Data(), proof_cluster.Data()));
 775          TProof::Open(Form("%s@%s", username.Data(), proof_cluster.Data()));
 776          if (!gProof) {
 777             if (strcmp(gSystem->Getenv("XrdSecGSISRVNAMES"), "lxfsrd0506.cern.ch"))
 778                ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Environment XrdSecGSISRVNAMES different from lxfsrd0506.cern.ch");
 779             return kFALSE;
 780          }
 781          TGrid::Connect("alien://");
 782          if (gGrid) {
 783             TString homedir = gGrid->GetHomeDirectory();
 784             TString workdir = homedir + train_name;
 785             if (!gGrid->Cd(workdir)) {
 786                gGrid->Cd(homedir);
 787                if (gGrid->Mkdir(workdir)) {
 788                   gGrid->Cd(train_name);
 789                   ::Info("AnalysisTrainNew::Connect()", "Directory %s created", gGrid->Pwd());
 790                }
 791             }
 792             gGrid->Mkdir("proof_output");
 793             gGrid->Cd("proof_output");
 794             proof_outdir = Form("alien://%s", gGrid->Pwd());
 795          }
 796          break;
 797       case 2:
 798          if  (!username.Length()) {
 799             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Make sure you:\n \
 800                            1. Have called: alien-token-init <username>\n \
 801                            2. Have called: >source /tmp/gclient_env_$UID");
 802             return kFALSE;
 803          }
 804          if (usePLUGIN && !gSystem->Getenv("alien_CLOSE_SE")) {
 805             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode),
 806                            "When using the AliEn plugin it is preferable to define the \
 807                            variable alien_CLOSE_SE in your environment.");
 808             return kFALSE;
 809          }
 810          ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Connecting user <%s> to AliEn ...",
 811                 username.Data());
 812          TGrid::Connect("alien://");
 813          if (!gGrid || !gGrid->IsConnected()) return kFALSE;
 814          break;
 815       default:
 816          ::Error("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Unknown run mode: %s", mode);
 817          return kFALSE;
 818    }
 819    ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect","Connected in %s mode", mode);
 820    return kTRUE;
 821 }
 822
 823 //______________________________________________________________________________
 824 Bool_t LoadCommonLibraries(const char *mode)
 825 {
 826 // Load common analysis libraries.
 827    Int_t imode = -1;
 828    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 829    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 830    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 831    if (!gSystem->Getenv("ALICE_ROOT")) {
 832       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadCommonLibraries", "Analysis train requires that analysis libraries are compiled with a local AliRoot");
 833       return kFALSE;
 834    }
 835    Bool_t success = kTRUE;
 836    // ROOT libraries
 837    gSystem->Load("libTree.so");
 838    gSystem->Load("libGeom.so");
 839    gSystem->Load("libVMC.so");
 840    gSystem->Load("libPhysics.so");
 841    gSystem->Load("libMinuit.so");
 842
 843    // Load framework classes. Par option ignored here.
 844    switch (imode) {
 845       case 0:
 846       case 2:
 847          if (useCPAR) {
 848             success &= LoadLibrary("STEERBase", mode, kTRUE);
 849             success &= LoadLibrary("ESD", mode, kTRUE);
 850             success &= LoadLibrary("AOD", mode, kTRUE);
 851             success &= LoadLibrary("ANALYSIS", mode, kTRUE);
 852             success &= LoadLibrary("ANALYSISalice", mode, kTRUE);
 853             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode, kTRUE);
 854          } else {
 855             success &= LoadLibrary("libSTEERBase.so", mode);
 856             success &= LoadLibrary("libESD.so", mode);
 857             success &= LoadLibrary("libAOD.so", mode);
 858             success &= LoadLibrary("libANALYSIS.so", mode);
 859             success &= LoadLibrary("libANALYSISalice.so", mode);
 860             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("libCORRFW.so", mode);
 861             gROOT->ProcessLine(".include $ALICE_ROOT/include");
 862          }
 863          break;
 864       case 1:
 865          Int_t ires = -1;
 866          if (useAFPAR && !gSystem->AccessPathName(AFversion)) ires = gProof->UploadPackage(AFversion);
 867          if (ires < 0) {
 868             success &= LoadLibrary("STEERBase", mode);
 869             success &= LoadLibrary("ESD", mode);
 870             success &= LoadLibrary("AOD", mode);
 871             success &= LoadLibrary("ANALYSIS", mode);
 872             success &= LoadLibrary("ANALYSISalice", mode);
 873             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode);
 874          } else {
 875             ires = gProof->EnablePackage(AFversion);
 876             if (ires<0) success = kFALSE;
 877             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode);
 878          }
 879          break;
 880       default:
 881          ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadCommonLibraries", "Unknown run mode: %s", mode);
 882          return kFALSE;
 883    }
 884    if (success) {
 885       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Load common libraries:    SUCCESS");
 886       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Include path for Aclic compilation:\n%s",
 887               gSystem->GetIncludePath());
 888    } else {
 889       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Load common libraries:    FAILED");
 890    }
 891
 892    return success;
 893 }
 894
 895 //______________________________________________________________________________
 896 Bool_t LoadAnalysisLibraries(const char *mode)
 897 {
 898 // Load common analysis libraries.
 899    Bool_t success = kTRUE;
 900    if (iESDfilter || iPWG3MuonTrain) {
 901       if (!LoadLibrary("PWG3base", mode, kTRUE) ||
 902           !LoadLibrary("PWG3muon", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 903    }
 904    // JETAN
 905    if (iJETAN) {
 906       if (!LoadLibrary("JETAN", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 907    }
 908    if (iJETANdelta) {
 909       if (!LoadLibrary("JETAN", mode, kTRUE) ||
 910           !LoadLibrary("CGAL", mode, kTRUE) ||
 911           !LoadLibrary("fastjet", mode, kTRUE) ||
 912           !LoadLibrary("siscone", mode, kTRUE) ||
 913           !LoadLibrary("SISConePlugin", mode, kTRUE) ||
 914           !LoadLibrary("FASTJETAN", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 915    }
 916    // PWG4 particle correlations
 917    if (iPWG4partcorr) {
 918       if (!LoadLibrary("EMCALUtils", mode, kTRUE) ||
 919           !LoadLibrary("PHOSUtils", mode, kTRUE) ||
 920           !LoadLibrary("PWG4PartCorrBase", mode, kTRUE) ||
 921           !LoadLibrary("PWG4PartCorrDep", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 922    }
 923    // PWG4 gamma conversion
 924    if (iPWG4gammaconv) {
 925       if (!LoadLibrary("PWG4GammaConv", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 926    }
 927    // PWG4 omega to 3 pions
 928    if (iPWG4omega3pi) {
 929       if (!LoadLibrary("PWG4omega3pi", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 930    }
 931    // PWG2 task protons
 932    if (iPWG2spectra) {
 933       if (!LoadLibrary("PWG2spectra", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 934    }
 935    // PWG2 flow
 936    if (iPWG2flow) {
 937       if (!LoadLibrary("PWG2flowCommon", mode, kTRUE) ||
 938           !LoadLibrary("PWG2flowTasks", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 939    }
 940    // PWG2 resonances
 941    if (iPWG2res || iPWG2rsneff) {
 942       if (!LoadLibrary("PWG2resonances", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 943    }
 944    // PWG2 kink
 945    if (iPWG2kink) {
 946       if (!LoadLibrary("PWG2kink", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 947    }
 948    // PWG2 unicor
 949    if (iPWG2unicor) {
 950       if (!LoadLibrary("PWG2unicor", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 951    }
 952    // PWG2 evchar
 953    if (iPWG2evchar) {
 954       if (!LoadLibrary("PWG2evchar", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 955    }
 956    // PWG2 femtoscopy
 957    if (iPWG2femto) {
 958       if (!LoadLibrary("PWG2AOD", mode, kTRUE) ||
 959           !LoadLibrary("PWG2femtoscopy", mode, kTRUE) ||
 960           !LoadLibrary("PWG2femtoscopyUser", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 961 //      TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName("$(ALICE_ROOT)/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/ConfigFemtoAnalysis.C"), Form("%s/ConfigFemtoAnalysis.C", train_name.Data()));
 962 //      anaLibs += "ConfigFemtoAnalysis.C ";
 963    }
 964    // PWG2 FORWARD
 965    if (iPWG2forward) {
 966       if (!LoadLibrary("PWG2forward", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 967    }
 968    // PWG3 Vertexing HF
 969    if (iPWG3vertexing || iPWG3d2h) {
 970       if (!LoadLibrary("PWG3base", mode, kTRUE) ||
 971           !LoadLibrary("PWG3vertexingHF", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 972    }
 973    // PWG3 hfe
 974    if (iPWG3hfe) {
 975       if (!LoadLibrary("PWG3hfe", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 976    }
 977
 978    ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadAnalysisLibraries", "Load other libraries:   SUCCESS");
 979    return kTRUE;
 980 }
 981
 982 //______________________________________________________________________________
 983 Bool_t LoadLibrary(const char *module, const char *mode, Bool_t rec=kFALSE)
 984 {
 985 // Load a module library in a given mode. Reports success.
 986    Int_t imode = -1;
 987    Int_t result;
 988    TString smodule(module);
 989    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 990    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 991    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 992    TString mod(module);
 993    if (!mod.Length()) {
 994       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Empty module name");
 995       return kFALSE;
 996    }
 997    // If a library is specified, just load it
 998    if (smodule.EndsWith(".so")) {
 999       mod.Remove(mod.Index(".so"));
1000       result = gSystem->Load(mod);
1001       if (result < 0) {
1002          ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not load library %s", module);
1003          return kFALSE;
1004       }
1005       if (rec) anaLibs += Form("%s.so ",mod.Data());
1006       return kTRUE;
1007    }
1008    // Check if the library is already loaded
1009    if (strlen(gSystem->GetLibraries(Form("%s.so", module), "", kFALSE)) > 0)
1010       return kTRUE;
1011    switch (imode) {
1012       case 0:
1013       case 2:
1014          if (usePAR) {
1015             result = SetupPar(module);
1016             if (rec) anaPars += Form("%s.par ", module);
1017          } else {
1018             result = gSystem->Load(Form("lib%s.so", module));
1019             if (rec) anaLibs += Form("lib%s.so ", module);
1020          }
1021          break;
1022       case 1:
1023          result = gProof->UploadPackage(module);
1024          if (result<0) {
1025             result = gProof->UploadPackage(gSystem->ExpandPathName(Form("$ALICE_ROOT/%s.par", module)));
1026             if (result<0) {
1027                ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not find module %s.par in current directory nor in $ALICE_ROOT", module);
1028                return kFALSE;
1029             }
1030          }
1031          result = gProof->EnablePackage(module);
1032          break;
1033       default:
1034          return kFALSE;
1035    }
1036    if (result < 0) {
1037       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not load module %s", module);
1038       return kFALSE;
1039    }
1040    return kTRUE;
1041 }
1042
1043
1044 //______________________________________________________________________________
1045 TChain *CreateChain(const char *mode, const char *plugin_mode)
1046 {
1047 // Create the input chain
1048    Int_t imode = -1;
1049    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
1050    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
1051    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
1052    TChain *chain = NULL;
1053    // Local chain
1054    switch (imode) {
1055       case 0:
1056          if (iAODanalysis) {
1057             if (!local_xmldataset.Length()) {
1058                // Local AOD
1059                chain = new TChain("aodTree");
1060                if (gSystem->AccessPathName("data/AliAOD.root"))
1061                   ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChain", "File: AliAOD.root not in ./data dir");
1062                else {
1063                   if (!saveTrain) chain->Add("data/AliAOD.root");
1064                   else            chain->Add("../data/AliAOD.root");
1065                }
1066             } else {
1067                // Interactive AOD
1068                chain = CreateChainSingle(local_xmldataset, "aodTree");
1069             }
1070          } else {
1071             if (!local_xmldataset.Length()) {
1072                // Local ESD
1073                chain = new TChain("esdTree");
1074                if (gSystem->AccessPathName("data/AliESDs.root"))
1075                   ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChain", "File: AliESDs.root not in ./data dir");
1076                else {
1077                   if (!saveTrain) chain->Add("data/AliESDs.root");
1078                   else            chain->Add("../data/AliESDs.root");
1079                }
1080             } else {
1081                // Interactive ESD
1082                chain = CreateChainSingle(local_xmldataset, "esdTree");
1083             }
1084          }
1085          break;
1086       case 1:
1087          break;
1088       case 2:
1089          if (usePLUGIN) {
1090 //            AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(plugin_mode);
1091 //            AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->SetGridHandler(alienHandler);
1092          } else {
1093             TString           treeName = "esdTree";
1094             if (iAODanalysis) treeName = "aodTree";
1095             chain = CreateChainSingle("wn.xml", treeName);
1096          }
1097          break;
1098       default:
1099    }
1100    if (chain && chain->GetNtrees()) return chain;
1101    return NULL;
1102 }
1103
1104 //______________________________________________________________________________
1105 TChain* CreateChainSingle(const char* xmlfile, const char *treeName)
1106 {
1107    printf("*******************************\n");
1108    printf("*** Getting the ESD Chain   ***\n");
1109    printf("*******************************\n");
1110    TAlienCollection * myCollection  = TAlienCollection::Open(xmlfile);
1111
1112    if (!myCollection) {
1113       ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChainSingle", "Cannot create an AliEn collection from %s", xmlfile) ;
1114       return NULL ;
1115    }
1116
1117    TChain* chain = new TChain(treeName);
1118    myCollection->Reset() ;
1119    while ( myCollection->Next() ) chain->Add(myCollection->GetTURL("")) ;
1120    chain->ls();
1121    return chain;
1122 }
1123
1124 //______________________________________________________________________________
1125 Int_t SetupPar(char* pararchivename)
1126 {
1127    if (!pararchivename || !strlen(pararchivename)) return -1;
1128    char processline[1024];
1129    if (gSystem->AccessPathName(Form("%s.par", pararchivename))) {
1130       if (!gSystem->AccessPathName(Form("%s/%s.par", gSystem->Getenv("ALICE_ROOT"),pararchivename))) {
1131          ::Info("AnalysisTrainNew.C::SetupPar", "Getting %s.par from $ALICE_ROOT", pararchivename);
1132          TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(Form("$ALICE_ROOT/%s.par", pararchivename)),
1133                    Form("%s.par",pararchivename));
1134       } else {
1135          ::Error("AnalysisTrainNew.C::SetupPar", "Cannot find %s.par", pararchivename);
1136          return -1;
1137       }
1138    }
1139    if (usePLUGIN && saveTrain) gSystem->Exec(Form("ln -s ../%s.par %s",pararchivename, train_name.Data()));
1140    gSystem->Exec(Form("tar xvzf %s.par", pararchivename));
1141
1142    TString ocwd = gSystem->WorkingDirectory();
1143    if (!gSystem->ChangeDirectory(pararchivename)) return -1;
1144
1145    // check for BUILD.sh and execute
1146    if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
1147       printf("*******************************\n");
1148       printf("*** Building PAR archive    ***\n");
1149       printf("*******************************\n");
1150       if (gSystem->Exec("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
1151          Error("runProcess","Cannot Build the PAR Archive! - Abort!");
1152          return -1;
1153       }
1154    }
1155
1156         // check for SETUP.C and execute
1157         if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/SETUP.C")) {
1158             printf("*******************************\n");
1159             printf("*** Setup PAR archive       ***\n");
1160             printf("*******************************\n");
1161             gROOT->Macro("PROOF-INF/SETUP.C");
1162         }
1163         if (!gSystem->ChangeDirectory(ocwd.Data())) return -1;
1164    return 0;
1165 }
1166
1167 //______________________________________________________________________________
1168 AliAnalysisAlien* CreateAlienHandler(const char *plugin_mode)
1169 {
1170 // Check if user has a valid token, otherwise make one. This has limitations.
1171 // One can always follow the standard procedure of calling alien-token-init then
1172 //   source /tmp/gclient_env_$UID in the current shell.
1173    if (!AliAnalysisGrid::CreateToken()) return NULL;
1174    AliAnalysisAlien *plugin = new AliAnalysisAlien();
1175 // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit" or "terminate")
1176    plugin->SetRunMode(plugin_mode);
1177    if (useProductionMode) plugin->SetProductionMode();
1178    if (!outputSingleFolder.IsNull()) plugin->SetOutputSingleFolder(outputSingleFolder);
1179    plugin->SetJobTag(job_tag);
1180    plugin->SetNtestFiles(1);
1181 //   plugin->SetPreferedSE("ALICE::NIHAM::File");
1182 // Set versions of used packages
1183 //   plugin->SetAPIVersion("V2.4");
1184    plugin->SetAPIVersion("V1.1x");
1185    plugin->SetROOTVersion(root_version);
1186    plugin->SetAliROOTVersion(aliroot_version);
1187 // Declare input data to be processed.
1188 // Method 1: Create automatically XML collections using alien 'find' command.
1189 // Define production directory LFN
1190    plugin->SetGridDataDir(alien_datadir);
1191 // Set data search pattern
1192    if (iAODanalysis) plugin->SetDataPattern("*AliAOD.root");
1193    else              plugin->SetDataPattern("*ESD.tag.root");
1194 // ...then add run numbers to be considered
1195    if (!iAODanalysis) plugin->SetRunRange(run_range[0], run_range[1]);
1196 //   for (Int_t i=0; i<10; i++) {
1197 //      if (run_numbers[i]==0) break;
1198 //      plugin->AddRunNumber(run_numbers[i]);
1199 //   }
1200 // Method 2: Declare existing data files (raw collections, xml collections, root file)
1201 // If no path mentioned data is supposed to be in the work directory (see SetGridWorkingDir())
1202 // XML collections added via this method can be combined with the first method if
1203 // the content is compatible (using or not tags)
1204 //   plugin->AddDataFile("tag.xml");
1205 //   plugin->AddDataFile("/alice/data/2008/LHC08c/000057657/raw/Run57657.Merged.RAW.tag.root");
1206 // Define alien work directory where all files will be copied. Relative to alien $HOME.
1207    if (iAODanalysis) plugin->SetGridWorkingDir("analysisAOD");
1208    else              plugin->SetGridWorkingDir("analysisESD");
1209 // Declare alien output directory. Relative to working directory.
1210    if (!alien_outdir.Length()) alien_outdir = Form("output_%s",train_name.Data());
1211    plugin->SetGridOutputDir(alien_outdir);
1212
1213    TString ana_sources = "";
1214    TString ana_add = "";
1215    if (usePAR && anaPars.Length()) {
1216       printf("%s\n", anaPars.Data());
1217       TObjArray *arr;
1218       TObjString *objstr;
1219       arr = anaPars.Tokenize(" ");
1220       TIter next(arr);
1221       while ((objstr=(TObjString*)next())) plugin->EnablePackage(objstr->GetString());
1222       delete arr;
1223    }
1224 // Add external packages
1225    if (iJETANdelta) {
1226       plugin->AddExternalPackage("boost::v1_38_0");
1227       plugin->AddExternalPackage("cgal::v3.3.1");
1228       plugin->AddExternalPackage("fastjet::v2.4.0");
1229    }
1230
1231 // Declare the analysis source files names separated by blancs. To be compiled runtime
1232 // using ACLiC on the worker nodes.
1233    ana_sources = ana_sources.Strip();
1234 // Declare all libraries (other than the default ones for the framework. These will be
1235 // loaded by the generated analysis macro. Add all extra files (task .cxx/.h) here.
1236    anaLibs     = anaLibs.Strip();
1237    if (ana_sources.Length()) plugin->SetAnalysisSource(ana_sources);
1238    if (anaLibs.Length())     plugin->SetAdditionalLibs(anaLibs);
1239
1240 // Declare the output file names separated by blancs.
1241 // (can be like: file.root or file.root@ALICE::Niham::File)
1242    plugin->SetDefaultOutputs();
1243    plugin->SetMergeExcludes(mergeExclude);
1244    plugin->SetMaxMergeFiles(maxMergeFiles);
1245    plugin->SetNrunsPerMaster(nRunsPerMaster);
1246 // Optionally define the files to be archived.
1247 //   plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr@ALICE::NIHAM::File root_archive.zip:AliAOD.root,AOD.tag.root@ALICE::NIHAM::File");
1248
1249
1250    // Put default output files to archive
1251    TString listhists = "";
1252    TString listaods  = "";
1253    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
1254    TIter next(mgr->GetOutputs());
1255    AliAnalysisDataContainer *output;
1256    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
1257       const char *filename = output->GetFileName();
1258       if (!(strcmp(filename, "default"))) {
1259          if (!mgr->GetOutputEventHandler()) continue;
1260          filename = mgr->GetOutputEventHandler()->GetOutputFileName();
1261          if (listaods.Length()) listaods += ",";
1262          listaods += filename;
1263          listaods += ",";
1264          listaods += "pyxsec_hists.root";
1265       } else {
1266          if (!strcmp(filename, "pyxsec_hists.root")) continue;
1267          if (listhists.Contains(filename)) continue;
1268          if (listhists.Length()) listhists += ",";
1269          listhists += filename;
1270       }
1271    }
1272    if (mgr->GetExtraFiles().Length()) {
1273       if (listaods.Length()) listaods += ",";
1274       listaods += mgr->GetExtraFiles();
1275       listaods.ReplaceAll(" ", ",");
1276    }
1277    if (listhists.Length()) listhists = Form("hist_archive.zip:%s@%s", listhists.Data(), outputStorages.Data());
1278    if (listaods.Length())  listaods  = Form("aod_archive.zip:%s@%s", listaods.Data(), outputStorages.Data());
1279    if (!listhists.Length() && !listaods.Length()) {
1280       ::Fatal("AnalysisTrainNew", "No task output !");
1281    }
1282    TString outputArchive = Form("log_archive.zip:stderr@%s", outputStorages.Data());
1283    if (listaods.Length()) {
1284       outputArchive += " ";
1285       outputArchive += listaods;
1286    }
1287    if (listhists.Length()) {
1288       outputArchive += " ";
1289       outputArchive += listhists;
1290    }
1291 // Set friends
1292 //   if (iAODanalysis && iPWG3d2h)
1293 //      plugin->SetFriendChainName("AliAOD.VertexingHF.root");
1294    plugin->SetOutputArchive(outputArchive);
1295 // Optionally set a name for the generated analysis macro (default MyAnalysis.C)
1296    plugin->SetAnalysisMacro(Form("%s.C", train_name.Data()));
1297 // Optionally set maximum number of input files/subjob (default 100, put 0 to ignore)
1298    plugin->SetSplitMaxInputFileNumber(nFilesPerJob);
1299 // Optionally set number of failed jobs that will trigger killing waiting sub-jobs.
1300 //   plugin->SetMaxInitFailed(5);
1301 // Optionally resubmit threshold.
1302 //   plugin->SetMasterResubmitThreshold(90);
1303 // Optionally set time to live (default 30000 sec)
1304    plugin->SetTTL(70000);
1305 // Optionally set input format (default xml-single)
1306    plugin->SetInputFormat("xml-single");
1307 // Optionally modify the name of the generated JDL (default analysis.jdl)
1308    plugin->SetJDLName(Form("%s.jdl", train_name.Data()));
1309 // Optionally modify the executable name (default analysis.sh)
1310    plugin->SetExecutable(Form("%s.sh", train_name.Data()));
1311 // Optionally modify job price (default 1)
1312    plugin->SetPrice(1);
1313 // Optionally modify split mode (default 'se')
1314 //   plugin->SetSplitMode("se");
1315    return plugin;
1316 }
1317
1318 //______________________________________________________________________________
1319 void WriteConfig()
1320 {
1321 // Write train configuration in a file. The file name has the format:
1322 // train_[trainName]_ddMonthyyyy_time.C
1323    if (useDATE) {
1324       gSystem->Exec("date +%d%b%Y_%Hh%M > date.tmp");
1325       ifstream fdate("date.tmp");
1326       if (!fdate.is_open()) {
1327          ::Error("AnalysisTrainNew.C::Export","Could not generate file name");
1328          return;
1329       }
1330       const char date[64];
1331       fdate.getline(date,64);
1332       fdate.close();
1333       gSystem->Exec("rm date.tmp");
1334       train_name = Form("train_%s_%s", train_name.Data(), date);
1335    } else {
1336       train_name = Form("train_%s", train_name.Data());
1337    }
1338    TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();
1339    gSystem->MakeDirectory(train_name);
1340    gSystem->ChangeDirectory(train_name);
1341    ofstream out;
1342    out.open(Form("%sConfig.C",train_name.Data()), ios::out);
1343    if (out.bad()) {
1344       ::Error("AnalysisTrainNew.C::Export", "Cannot open ConfigTrain.C for writing");
1345       return;
1346    }
1347    out << "{" << endl;
1348    out << "   train_name      = " << "\"" << train_name.Data() << "\";" << endl;
1349    out << "   proof_cluster   = " << "\"" << proof_cluster.Data() << "\";" << endl;
1350    out << "   useAFPAR        = " << useAFPAR << ";" << endl;
1351    if (useAFPAR)
1352       out << "   AFversion       = " << AFversion.Data() << ";" << endl;
1353    out << "   proof_dataset   = " << "\"" << proof_dataset.Data() << "\";" << endl;
1354    out << "   usePLUGIN       = " << usePLUGIN << ";" << endl;
1355    out << "   usePAR          = " << usePAR << ";" << endl;
1356    out << "   useCPAR         = " << useCPAR << ";" << endl;
1357    out << "   root_version    = " << "\"" << root_version.Data() << "\";" << endl;
1358    out << "   aliroot_version = " << "\"" << aliroot_version.Data() << "\";" << endl;
1359    out << "   alien_datadir   = " << "\"" << alien_datadir.Data() << "\";" << endl;
1360    if (!alien_outdir.Length()) alien_outdir = Form("output_%s",train_name.Data());
1361    out << "   alien_outdir    = " << "\"" << alien_outdir.Data() << "\";" << endl;
1362    out << "   maxMergeFiles   = " << maxMergeFiles << ";" << endl;
1363    out << "   mergeExclude    = " << "\"" << mergeExclude.Data() << "\";" << endl;
1364    out << "   nRunsPerMaster  = " << nRunsPerMaster << ";" << endl;
1365    out << "   nFilesPerJob    = " << nFilesPerJob << ";" << endl;
1366 //   for (Int_t i=0; i<10; i++) {
1367 //      if (run_numbers[i])
1368 //         out << "   run_numbers[" << i << "]  = " << run_numbers[i] << ";" << endl;
1369 //   }
1370    out << "   run_range[0]    = " << run_range[0] << ";" << endl;
1371    out << "   run_range[1]    = " << run_range[1] << ";" << endl;
1372    out << "   useDBG          = " << useDBG << ";" << endl;
1373    out << "   useMC           = " << useMC << ";" << endl;
1374    out << "   useTAGS         = " << useTAGS << ";" << endl;
1375    out << "   useKFILTER      = " << useKFILTER << ";" << endl;
1376    out << "   useTR           = " << useTR << ";" << endl;
1377    out << "   useCORRFW       = " << useCORRFW << ";" << endl;
1378    out << "   useAODTAGS      = " << useAODTAGS << ";" << endl;
1379    out << "   saveTrain       = " << "kFALSE;" << endl << endl;
1380    out << "   // Analysis modules" << endl;
1381    out << "   iAODanalysis    = " << iAODanalysis << ";" << endl;
1382    out << "   iAODhandler     = " << iAODhandler << ";" << endl;
1383    out << "   iESDfilter      = " << iESDfilter << ";" << endl;
1384    out << "   iMUONcopyAOD    = " << iMUONcopyAOD << ";" << endl;
1385    out << "   iJETAN          = " << iJETAN << ";" << endl;
1386    out << "   iJETANdelta     = " << iJETANdelta << ";" << endl;
1387    out << "   iPWG4partcorr   = " << iPWG4partcorr << ";" << endl;
1388    out << "   iPWG4gammaconv  = " << iPWG4gammaconv << ";" << endl;
1389    out << "   iPWG4omega3pi   = " << iPWG4omega3pi << ";" << endl;
1390    out << "   iPWG3vertexing  = " << iPWG3vertexing << ";" << endl;
1391    out << "   iPWG3hfe        = " << iPWG3hfe << ";" << endl;
1392    out << "   iPWG3d2h        = " << iPWG3d2h << ";" << endl;
1393    out << "     iPWG3d0mass       = " << iPWG3d0mass << ";" << endl;
1394    out << "     iPWG3d0massLS     = " << iPWG3d0massLS << ";" << endl;
1395    out << "     iPWG3dplus        = " << iPWG3dplus << ";" << endl;
1396    out << "     iPWG3LSd0         = " << iPWG3LSd0 << ";" << endl;
1397    out << "     iPWG3LSjpsi       = " << iPWG3LSjpsi << ";" << endl;
1398    out << "     iPWG3CFd0         = " << iPWG3CFd0 << ";" << endl;
1399    out << "     iPWG3promptd0     = " << iPWG3promptd0 << ";" << endl;
1400    out << "   iPWG3MuonTrain      = " << iPWG3MuonTrain << ";" << endl;
1401    out << "   iPWG2femto      = " << iPWG2femto << ";" << endl;
1402    out << "   iPWG2spectra    = " << iPWG2spectra << ";" << endl;
1403    out << "     iPWG2protons      = " << iPWG2protons << ";" << endl;
1404    out << "     iPWG2checkcascade = " << iPWG2checkcascade << ";" << endl;
1405    out << "     iPWG2perfcascade  = " << iPWG2perfcascade << ";" << endl;
1406    out << "     iPWG2checkv0      = " << iPWG2checkv0 << ";" << endl;
1407    out << "     iPWG2strange      = " << iPWG2strange << ";" << endl;
1408    out << "     iPWG2central      = " << iPWG2central << ";" << endl;
1409    out << "   iPWG2flow       = " << iPWG2flow << ";" << endl;
1410    out << "   iPWG2res        = " << iPWG2res << ";" << endl;
1411    out << "     iPWG2rsneff   = " << iPWG2rsneff << ";" << endl;
1412    out << "   iPWG2kink       = " << iPWG2kink << ";" << endl;
1413    out << "     iPWG2kinkESDMC    = " << iPWG2kinkESDMC << ";" << endl;
1414    out << "     iPWG2kinkLSKstar  = " << iPWG2kinkLSKstar << ";" << endl;
1415    out << "     iPWG2kinkLSL1520  = " << iPWG2kinkLSL1520 << ";" << endl;
1416    out << "     iPWG2kinkLSPhi    = " << iPWG2kinkLSPhi << ";" << endl;
1417    out << "     iPWG2kinkKstarESD = " << iPWG2kinkKstarESD << ";" << endl;
1418    out << "     iPWG2kinkKstarMC  = " << iPWG2kinkKstarMC << ";" << endl;
1419    out << "     iPWG2kinkL1520ESD = " << iPWG2kinkL1520ESD << ";" << endl;
1420    out << "     iPWG2kinkL1520MC  = " << iPWG2kinkL1520MC << ";" << endl;
1421    out << "     iPWG2kinkPhiESD   = " << iPWG2kinkPhiESD << ";" << endl;
1422    out << "     iPWG2kinkPhiMC    = " << iPWG2kinkPhiMC << ";" << endl;
1423    out << "   iPWG2unicor     = " << iPWG2unicor << ";" << endl;
1424    out << "   iPWG2evchar     = " << iPWG2evchar << ";" << endl;
1425    out << "   iPWG2forward    = " << iPWG2forward << ";" << endl << endl;
1426    out << "// Configuration fot the wagons" << endl;
1427    out << "   configPWG2femto = \"" << configPWG2femto << "\";" << endl;
1428    out << "   configPWG3d2h   = \"" << configPWG3d2h << "\";" << endl;
1429    out << "}" << endl;
1430    ::Info("AnalysisTrainNew.C::WriteConfig", "Train configuration wrote to file %s", Form("config_%s.C", train_name.Data()));
1431    gSystem->ChangeDirectory(cdir);
1432 }
1433
1434 //______________________________________________________________________________
1435 Bool_t LoadConfig(const char *filename)
1436 {
1437 // Read train configuration from file
1438    if (gSystem->AccessPathName(filename)) {
1439       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadConfig", "Config file name not found");
1440       return kFALSE;
1441    }
1442    gROOT->ProcessLine(Form(".x %s", filename));
1443    ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadConfig", "Train configuration loaded from file %s", filename);
1444    return kTRUE;
1445 }