ANALYSIS/macros/AnalysisTrainNew.C

   1 //===================== ANALYSIS TRAIN =========================================
   2 // To use: copy this macro to your work directory, modify the global part to match
   3 // your needs, then run root.
   4 //    root[0] .L AnalysisTrain.C
   5 // Grid full mode as below (other modes: test, offline, submit, terminate)
   6 //    root[1] AnalysisTrainNew("grid", "full")
   7 // CAF mode (requires root v5-23-02 + aliroot v4-16-Rev08)
   8 //    root[2] AnalysisTrainNew("proof")
   9 // Local mode requires AliESds.root or AliAOD.root in ./data directory
  10 //    root[3] AnalysisTrainNew("local")
  11 // In proof and grid modes, a token is needed and sourcing the produced environment file.
  12 //
  13 // If 'saveTrain' flag is set, the train will generate a directory name and run
  14 // in this directory. A configuration file 'ConfigTrain.C' will be generated.
  15 // One can replay at any time the train via:
  16 //    root[1] AnalysisTrainNew(ana_mode, plugin_mode, "train_default_<date>/ConfigTrain.C")
  17
  18 //==================   TRAIN NAME   ============================================
  19 TString     train_name         = "TR008_LHC09a2ESD"; // *CHANGE ME* (no blancs or special characters)
  20 TString     job_tag            = "TR008: ESD+MC analysis -> AOD + delta AOD + histograms"; // *CHANGE ME*
  21 //==============================================================================
  22
  23 // ### Settings that make sense in PROOF only
  24 //==============================================================================
  25 TString     proof_cluster      = "alicecaf.cern.ch";
  26 Bool_t      useAFPAR           = kFALSE;  // use AF special par file
  27 TString     AFversion          = "AF-v4-17";
  28 // Change CAF dataset here
  29 TString     proof_dataset      = "/COMMON/COMMON/LHC09a4_run8100X#/esdTree";
  30 TString     proof_outdir       = "";
  31
  32 // ### Settings that make sense when using the Alien plugin
  33 //==============================================================================
  34 Bool_t      usePLUGIN          = kTRUE;   // do not change
  35 Bool_t      useProductionMode  = kTRUE;   // use the plugin in production mode
  36 // Usage of par files ONLY in grid mode and ONLY if the code is not available
  37 // in the deployed AliRoot versions. Par file search path: local dir, if not there $ALICE_ROOT.
  38 // To refresh par files, remove the ones in the workdir, then do "make <target.par>" in
  39 // AliRoot.
  40 Bool_t      usePAR             = kFALSE;  // use par files for extra libs
  41 Bool_t      useCPAR            = kFALSE;  // use par files for common libs
  42 TString     root_version       = "v20091109-1";  // *CHANGE ME IF MORE RECENT IN GRID*
  43 TString     aliroot_version    = "v4-18-11-AN";  // *CHANGE ME IF MORE RECENT IN GRID*
  44 // Change production base directory here
  45 TString     alien_datadir      = "/alice/sim/PDC_08b/LHC09a2";
  46 // AliEn output directory. If blank will become output_<train_name>
  47 TString     alien_outdir       = "/alice/sim/PDC_08b/LHC09a2/AOD1";
  48 // TString     alien_outdir       = "";
  49 // Number of files merged in a chunk
  50 Int_t       maxMergeFiles      = 20;
  51 // Files that should not be merged
  52 TString     mergeExclude       = "AliAOD.root AliAOD.VertexingHF.root AliAOD.Jets.root deltaAODPartCorr.root forward.root resonances.root";
  53 // Make replicas on the storages below
  54 TString     outputStorages      = "ALICE::NIHAM::File,ALICE::CNAF::SE,ALICE::FZK::SE,ALICE::GSI::SE";
  55 // Number of runs per master job
  56 Int_t       nRunsPerMaster     = 10;
  57 // Maximum number of files per job (gives size of AOD)
  58 Int_t       nFilesPerJob       = 20;
  59 // Set the run range
  60 Int_t       run_range[2]       =  {80000, 80025};  // LHC09a1   *CHANGE ME*
  61 //Int_t       run_range[2]       =  {70000, 70000};
  62 // ### Settings that make sense only for local analysis
  63 //==============================================================================
  64 // Change local xml dataset for local interactive analysis
  65 TString     local_xmldataset   = "";
  66
  67 // ### Other flags to steer the analysis
  68 //==============================================================================
  69 Bool_t      useDATE            = kFALSE; // use date in train name
  70 Bool_t      useDBG             = kFALSE; // activate debugging
  71 Bool_t      useMC              = kTRUE;  // use MC info
  72 Bool_t      useTAGS            = kTRUE; // use ESD tags for selection
  73 Bool_t      useKFILTER         = kTRUE; // use Kinematics filter
  74 Bool_t      useTR              = kTRUE;  // use track references
  75 Bool_t      useCORRFW          = kFALSE; // do not change
  76 Bool_t      useAODTAGS         = kFALSE;  // use AOD tags
  77 Bool_t      saveTrain          = kTRUE;  // save train configuration as:
  78 Bool_t      saveProofToAlien   = kFALSE; // save proof outputs in AliEn
  79                                          // train_[trainName]_ddMonthyyyy_time.C
  80 // ### Analysis modules to be included. Some may not be yet fully implemented.
  81 //==============================================================================
  82 Int_t       iAODanalysis       = 0;      // Analysis on input AOD's
  83 Int_t       iAODhandler        = 1;      // Analysis produces an AOD or dAOD's
  84 Int_t       iESDfilter         = 1;      // ESD to AOD filter (barrel + muon tracks)
  85 Int_t       iMUONcopyAOD       = 1;      // Task that copies only muon events in a separate AOD (PWG3)
  86 Int_t       iJETAN             = 1;      // Jet analysis (PWG4)
  87 Int_t       iJETANdelta        = 1;      // Jet delta AODs
  88 Int_t       iPWG4partcorr      = 1;      // Gamma-hadron correlations task (PWG4)
  89 Int_t       iPWG4gammaconv     = 1;      // Gamma conversion analysis (PWG4)
  90 Int_t       iPWG4omega3pi      = 1;      // Omega to 3 pi analysis (PWG4)
  91 Int_t       iPWG3vertexing     = 1;      // Vertexing HF task (PWG3)
  92 Int_t       iPWG3hfe           = 1;      // Electrons analysis (PWG3)
  93 Int_t       iPWG3d2h           = 1;      // D0->2 hadrons (PWG3)
  94 Int_t        iPWG3d0mass       = 1;      // D0 mass (PWG3D2H)
  95 Int_t        iPWG3d0massLS     = 1;      // D0 mass LS (PWG3D2H)
  96 Int_t        iPWG3dplus        = 1;      // D+ analysis (PWG3D2H)
  97 Int_t        iPWG3LSd0         = 1;      // LS D0 analysis (PWG3D2H)
  98 Int_t        iPWG3LSjpsi       = 1;      // LS J/Psi analysis (PWG3D2H)
  99 Int_t        iPWG3CFd0         = 1;      // CF D0 analysis (PWG3D2H)
 100 Int_t        iPWG3promptd0     = 1;      // prompt D0 analysis (PWG3D2H)
 101 Int_t       iPWG2femto         = 1;      // Femtoscopy task (PWG2)
 102 Int_t       iPWG2spectra       = 1;      // Spectra tasks (PWG2
 103 Int_t        iPWG2protons      = 1;         // Proton-antiproton analysis
 104 Int_t        iPWG2checkcascade = 1;         // Check cascades task
 105 Int_t        iPWG2perfcascade  = 1;         // Check performance cascade
 106 Int_t        iPWG2checkv0      = 1;         // Check V0 task
 107 Int_t        iPWG2strange      = 1;         // Strangeness task
 108 Int_t        iPWG2central      = 1;         // Anisothropy in central collisions
 109 Int_t       iPWG2flow          = 1;      // Flow analysis tasks (PWG2)
 110 Int_t       iPWG2res           = 1;      // Resonances task (PWG2)
 111 Int_t        iPWG2rsneff       = 1;      // Resonances efficiency
 112 Int_t       iPWG2kink          = 1;      // Kink analysis tasks (PWG2)
 113 Int_t        iPWG2kinkESDMC    = 1;         // Kink ESD-MC comparison (PWG2)
 114 Int_t        iPWG2kinkLSKstar  = 1;      // Kink like-sign K* (PWG2)
 115 Int_t        iPWG2kinkLSL1520  = 1;      // Kink like-sign L1520 (PWG2)
 116 Int_t        iPWG2kinkLSPhi    = 1;      // Kink like-sign Phi (PWG2)
 117 Int_t        iPWG2kinkKstarESD = 1;      // Kink Kstar ESD (PWG2)
 118 Int_t        iPWG2kinkKstarMC  = 1;      // Kink Kstar MC (PWG2)
 119 Int_t        iPWG2kinkL1520ESD = 1;      // Kink L1520 ESD (PWG2)
 120 Int_t        iPWG2kinkL1520MC  = 1;      // Kink L1520 MC (PWG2)
 121 Int_t        iPWG2kinkPhiESD   = 1;      // Kink resonances Phi ESD (PWG2)
 122 Int_t        iPWG2kinkPhiMC    = 1;      // Kink resonances Phi MC (PWG2)
 123 Int_t       iPWG2evchar        = 1;      // Event characteristics (PWG2)
 124 Int_t       iPWG2unicor        = 1;      // Unicor analysis (PWG2)
 125 Int_t       iPWG2forward       = 1;      // FMD analysis (PWG2)
 126
 127 // ### Configuration macros used for each module
 128 //==============================================================================
 129 TString     configPWG2femto    = "$ALICE_ROOT/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/Train/Train3/ConfigFemtoAnalysis.C";
 130 //TString     configPWG3d2h      = "$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/ConfigVertexingHF_highmult.C";
 131 TString     configPWG3d2h      = "$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/ConfigVertexingHF_highmult.C";
 132 // Temporaries.
 133 TString anaPars = "";
 134 TString anaLibs = "";
 135 // Function signatures
 136 class AliAnalysisAlien;
 137
 138 //______________________________________________________________________________
 139 void AnalysisTrainNew(const char *analysis_mode="grid",
 140                       const char *plugin_mode="full",
 141                       const char *config_file="")
 142 {
 143 // Main analysis train macro. If a configuration file is provided, all parameters
 144 // are taken from there but may be altered by CheckModuleFlags.
 145    if (strlen(config_file) && !LoadConfig(config_file)) return;
 146    TString smode(analysis_mode);
 147    smode.ToUpper();
 148    // Check compatibility of selected modules
 149    CheckModuleFlags(smode);
 150    if (saveTrain)              WriteConfig();
 151
 152    printf("==================================================================\n");
 153    printf("===========    RUNNING ANALYSIS TRAIN %s IN %s MODE   ==========\n", train_name.Data(),smode.Data());
 154    printf("==================================================================\n");
 155    printf("=  Configuring analysis train for:                               =\n");
 156    if (iAODanalysis) printf("=  AOD analysis                                                  =\n");
 157    else              printf("=  ESD analysis                                                  =\n");
 158    if (iESDfilter)   printf("=  ESD filter                                                    =\n");
 159    if (iMUONcopyAOD) printf("=  MUON copy AOD                                                 =\n");
 160    if (iJETAN)       printf("=  Jet analysis                                                  =\n");
 161    if (iJETANdelta)  printf("=     Jet delta AODs                                             =\n");
 162    if (iPWG2spectra) {
 163       printf("=  PWG2 SPECTRA tasks :                                          =\n");
 164       if (iPWG2protons)      printf("=     PWG2 proton-antiproton                                     =\n");
 165       if (iPWG2checkcascade) printf("=     PWG2 check cascades                                        =\n");
 166       if (iPWG2perfcascade)  printf("=     PWG2 performance cascades                                  =\n");
 167       if (iPWG2checkv0)      printf("=     PWG2 check V0                                              =\n");
 168       if (iPWG2strange)      printf("=     PWG2 strangeness                                           =\n");
 169       if (iPWG2central)      printf("=     PWG2 central                                               =\n");
 170    }
 171    if (iPWG2femto) {
 172       printf("=  PWG2 femtoscopy                                               =\n");
 173       printf("   +++ configured by: %s\n", configPWG2femto.Data());
 174    }
 175    if (iPWG2flow)    printf("=  PWG2 flow                                                     =\n");
 176    if (iPWG2res)     printf("=  PWG2 resonances                                               =\n");
 177       if (iPWG2rsneff)    printf("=     PWG2 resonances efficiency                                    =\n");
 178    if (iPWG2kink) {
 179       printf("=  PWG2 kink analysis tasks:                                     =\n");
 180       if (iPWG2kinkESDMC)    printf("=     PWG2 ESD-MC kinks                                          =\n");
 181       if (iPWG2kinkLSKstar)  printf("=     PWG2 kink like-sign analysis K*                            =\n");
 182       if (iPWG2kinkLSL1520)  printf("=     PWG2 kink like-sign analysis L1520                         =\n");
 183       if (iPWG2kinkLSPhi)    printf("=     PWG2 kink like-sign analysis Phi                           =\n");
 184       if (iPWG2kinkKstarESD) printf("=     PWG2 kink Kstar ESD analysis                               =\n");
 185       if (iPWG2kinkKstarMC)  printf("=     PWG2 kink Kstar MC analysis                                =\n");
 186       if (iPWG2kinkL1520ESD) printf("=     PWG2 kink L1520 ESD analysis                               =\n");
 187       if (iPWG2kinkL1520MC)  printf("=     PWG2 kink L1520 MC analysis                                =\n");
 188       if (iPWG2kinkPhiESD) printf("=     PWG2 kink Phi ESD analysis                                 =\n");
 189       if (iPWG2kinkPhiMC)  printf("=     PWG2 kink Phi MC analysis                                  =\n");
 190   }
 191    if (iPWG2evchar)    printf("=  PWG2 event characteristics                                    =\n");
 192    if (iPWG2unicor)    printf("=  PWG2 Unicor analysis                                          =\n");
 193    if (iPWG2forward)   printf("=  PWG2 forward: sharing, density, bkg. correction, dNdEta       =\n");
 194    if (iPWG3vertexing) printf("=  PWG3 vertexing                                                =\n");
 195    if (iPWG3hfe)       printf("=  PWG3 electrons                                                =\n");
 196    if (iPWG3d2h) {
 197       printf("=  PWG3 D0->2 hadrons tasks                                      =\n");
 198       printf("   +++ configured by: %s\n", configPWG3d2h.Data());
 199       if (iPWG3d0mass)       printf("=     PWG3 D0 mass                                               =\n");
 200       if (iPWG3d0massLS)     printf("=     PWG3 D0 mass LS                                            =\n");
 201       if (iPWG3dplus)        printf("=     PWG3 D+ analysis                                           =\n");
 202       if (iPWG3LSd0)         printf("=     PWG3 LS D0                                                 =\n");
 203       if (iPWG3LSjpsi)       printf("=     PWG3 LS J/Psi                                              =\n");
 204       if (iPWG3CFd0)         printf("=     PWG3 CF D0                                                 =\n");
 205       if (iPWG3promptd0)     printf("=     PWG3 prompt D0                                             =\n");
 206    }
 207    if (iPWG4partcorr)  printf("=  PWG4 gamma-hadron, pi0 and gamma-jet correlations             =\n");
 208    if (iPWG4gammaconv) printf("=  PWG4 gamma conversion                                         =\n");
 209    if (iPWG4omega3pi)  printf("=  PWG4 omega to 3 pions                                         =\n");
 210    printf("==================================================================\n");
 211    printf(":: use MC truth      %d\n", (UInt_t)useMC);
 212    printf(":: use KINE filter   %d\n", (UInt_t)useKFILTER);
 213    printf(":: use track refs    %d\n", (UInt_t)useTR);
 214    printf(":: use tags          %d\n", (UInt_t)useTAGS);
 215    printf(":: use AOD tags      %d\n", (UInt_t)useAODTAGS);
 216    printf(":: use debugging     %d\n", (UInt_t)useDBG);
 217    printf(":: use PAR files     %d\n", (UInt_t)usePAR);
 218    printf(":: use AliEn plugin  %d\n", (UInt_t)usePLUGIN);
 219
 220    //==========================================================================
 221    // Connect to back-end system
 222    if (!Connect(smode)) {
 223       ::Error("AnalysisTrain", "Could not connect to %s back-end", analysis_mode);
 224       return;
 225    }
 226
 227    // Load common libraries and set include path
 228    if (!LoadCommonLibraries(smode)) {
 229       ::Error("AnalysisTrain", "Could not load common libraries");
 230       return;
 231    }
 232
 233    // Make the analysis manager and connect event handlers
 234    AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("Analysis Train", "Production train");
 235    if (saveProofToAlien) mgr->SetSpecialOutputLocation(proof_outdir);
 236    if (!strcmp(plugin_mode, "test")) mgr->SetNSysInfo(1);
 237    // Load analysis specific libraries
 238    if (!LoadAnalysisLibraries(smode)) {
 239       ::Error("AnalysisTrain", "Could not load analysis libraries");
 240       return;
 241    }
 242
 243    // Create input handler (input container created automatically)
 244    if (iAODanalysis) {
 245    // AOD input handler
 246       AliAODInputHandler *aodH = new AliAODInputHandler();
 247       if (iPWG3d2h) aodH->AddFriend("AliAOD.VertexingHF.root");
 248       mgr->SetInputEventHandler(aodH);
 249    } else {
 250    // ESD input handler
 251       AliESDInputHandler *esdHandler = new AliESDInputHandler();
 252       if (useTAGS) esdHandler->SetReadTags();
 253       mgr->SetInputEventHandler(esdHandler);
 254    }
 255    // Monte Carlo handler
 256    if (useMC && !iAODanalysis) {
 257       AliMCEventHandler* mcHandler = new AliMCEventHandler();
 258       mgr->SetMCtruthEventHandler(mcHandler);
 259       mcHandler->SetReadTR(useTR);
 260    }
 261    // AOD output container, created automatically when setting an AOD handler
 262    if (iAODhandler) {
 263       // AOD output handler
 264       AliAODHandler* aodHandler   = new AliAODHandler();
 265       aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.root");
 266       mgr->SetOutputEventHandler(aodHandler);
 267       if (iAODanalysis) {
 268          aodHandler->SetFillAOD(kFALSE);
 269          aodHandler->SetCreateNonStandardAOD();
 270          if (iJETAN)         aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.Jets.root");
 271 //         if (iPWG3vertexing) aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.VertexingHF.root");
 272       }
 273    }
 274    // Debugging if needed
 275    if (useDBG) mgr->SetDebugLevel(3);
 276
 277    //==========================================================================
 278    // Create the chain. In this example it is created only from ALIEN files but
 279    // can be done to work in batch or grid mode as well.
 280    TChain *chain = CreateChain(smode, plugin_mode);
 281
 282    //==========================================================================
 283    // Load the tasks configuration macros for all wagons. These files are supposed now to be
 284    // in the current workdir, but in AliEn they will be in the file catalog,
 285    // mapped from AliRoot and pecified in the jdl input list.
 286
 287    // For now connection to top input container and common AOD output container
 288    // is done in this macro, but in future these containers will be connected
 289    // from each task configuration macro.
 290
 291    AddAnalysisTasks();
 292
 293    // Run the analysis
 294    //
 295    if (usePLUGIN) {
 296       AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(plugin_mode);
 297       AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->SetGridHandler(alienHandler);
 298    }
 299
 300    if (mgr->InitAnalysis()) {
 301       mgr->PrintStatus();
 302       if (saveTrain || strlen(config_file)) gSystem->ChangeDirectory(train_name);
 303       StartAnalysis(smode, chain);
 304       if (saveTrain && smode=="GRID") {
 305          AliAnalysisAlien *gridhandler = (AliAnalysisAlien*)mgr->GetGridHandler();
 306          TString alien_workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
 307          if (iAODanalysis) alien_workdir += "analysisAOD";
 308          else              alien_workdir += "analysisESD";
 309          alien_outdir = gridhandler->GetGridOutputDir();
 310          printf("=== Registering ConfigTrain.C in the work directory <%s> ===\n",
 311                 alien_workdir.Data());
 312          if (AliAnalysisAlien::FileExists(Form("%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data())))
 313             gGrid->Rm(Form("%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data()));
 314          if (strcmp(plugin_mode, "test"))
 315             TFile::Cp(Form("file:%sConfig.C",train_name.Data()), Form("alien://%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data()));
 316       }
 317    }
 318 }
 319
 320 //______________________________________________________________________________
 321 void AddAnalysisTasks()
 322 {
 323 // Add all analysis task wagons to the train
 324    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 325
 326    if (iESDfilter && !iAODanalysis) {
 327       //  ESD filter task configuration.
 328       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskESDFilter.C");
 329       if (iMUONcopyAOD) {
 330          printf("Registering delta AOD file\n");
 331          mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.Muons.root");
 332          AliAnalysisTaskESDfilter *taskesdfilter = AddTaskESDFilter(useKFILTER, kTRUE);
 333       } else {
 334          AliAnalysisTaskESDfilter *taskesdfilter = AddTaskESDFilter(useKFILTER, kFALSE);
 335       }
 336    }
 337
 338    // AOD tags
 339    if (useAODTAGS) {
 340       AliAnalysisTaskTagCreator* tagTask = new AliAnalysisTaskTagCreator("AOD Tag Creator");
 341       mgr->AddTask(tagTask);
 342       AliAnalysisDataContainer *coutTags = mgr->CreateContainer("cTag",  TTree::Class(),
 343                                            AliAnalysisManager::kOutputContainer, "AOD.tag.root");
 344       mgr->ConnectInput (tagTask, 0, mgr->GetCommonInputContainer());
 345       mgr->ConnectOutput(tagTask, 1, coutTags);
 346    }
 347
 348 // ********** PWG2 wagons ******************************************************
 349    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 350
 351    // Proton analysis
 352    if (iPWG2spectra) {
 353       // protons
 354       if (iPWG2protons) {
 355         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskProtons.C");
 356         AliAnalysisTaskProtons *taskprotons = AddTaskProtons();
 357         if (!taskprotons) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskProtons cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 358       }
 359       // cascades
 360       if (iPWG2checkcascade) {
 361         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckCascade.C");
 362         AliAnalysisTaskCheckCascade *taskcheckcascade = AddTaskCheckCascade();
 363         if (!taskcheckcascade) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckCascade cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 364       }
 365       // v0's
 366       if (iPWG2checkv0) {
 367         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckV0.C");
 368         AliAnalysisTaskCheckV0 *taskcheckV0 = AddTaskCheckV0();
 369         if (!taskcheckV0) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckV0 cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 370       }
 371       // strangeness
 372       if (iPWG2strange) {
 373         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskStrange.C");
 374         AliAnalysisTaskStrange *taskstrange = AddTaskStrange();
 375         if (!taskstrange) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskStrange cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 376       }
 377       // performance cascades
 378       if (iPWG2perfcascade) {
 379         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckPerformanceCascade.C");
 380         AliAnalysisTaskCheckPerformanceCascade *taskperfcascade = AddTaskCheckPerformanceCascade();
 381         if (!taskperfcascade) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckPerformanceCascade cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 382       }
 383        // central
 384       if (iPWG2central) {
 385         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCentral.C");
 386         AliAnalysisTaskCentral *taskcentral = AddTaskCentral();
 387         if (!taskcentral) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCentral cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 388       }
 389   }
 390
 391    // Femtoscopy analysis modules
 392    if (iPWG2femto) {
 393       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/AddTaskFemto.C");
 394       AliAnalysisTaskFemto *taskfemto = AddTaskFemto(configPWG2femto);
 395       if (!taskfemto) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskFemto cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 396    }
 397
 398    // Kink analysis
 399    if (iPWG2kink) {
 400       if (iPWG2kinkESDMC) {
 401         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKink.C");
 402         AliAnalysisKinkESDMC *taskkink1 = AddTaskKink();
 403         if (!taskkink1) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkESDMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 404       }
 405       if (iPWG2kinkLSKstar) {
 406         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignKstar.C");
 407         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink2 = AddTaskKinkResLikeSignKstar();
 408         if (!taskkink2) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 409       }
 410       if (iPWG2kinkLSL1520) {
 411         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignL1520.C");
 412         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink3 = AddTaskKinkResLikeSignL1520();
 413         if (!taskkink3) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 414       }
 415       if (iPWG2kinkLSPhi) {
 416         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignPhi.C");
 417         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink4 = AddTaskKinkResLikeSignPhi();
 418         if (!taskkink4) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 419       }
 420       if (iPWG2kinkKstarESD) {
 421         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceKstarESD.C");
 422         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink5 = AddTaskKinkResonanceKstarESD();
 423         if (!taskkink5) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceKstarESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 424       }
 425       if (iPWG2kinkKstarMC) {
 426         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceKstarMC.C");
 427         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink6 = AddTaskKinkResonanceKstarMC();
 428         if (!taskkink6) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceKstarMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 429       }
 430       if (iPWG2kinkL1520ESD) {
 431         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceL1520ESD.C");
 432         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink7 = AddTaskKinkResonanceL1520ESD();
 433         if (!taskkink7) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceL1520ESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 434       }
 435       if (iPWG2kinkL1520MC) {
 436         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceL1520MC.C");
 437         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink8 = AddTaskKinkResonanceL1520MC();
 438         if (!taskkink8) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceL1520MC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 439       }
 440       if (iPWG2kinkPhiESD) {
 441         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonancePhiESD.C");
 442         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink9 = AddTaskKinkResonancePhiESD();
 443         if (!taskkink9) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonancePhiESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 444       }
 445       if (iPWG2kinkPhiMC) {
 446         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonancePhiMC.C");
 447         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink10 = AddTaskKinkResonancePhiMC();
 448         if (!taskkink10) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonancePhiMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 449       }
 450    }
 451
 452    // Event characterization
 453    if (iPWG2evchar) {
 454       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/EVCHAR/macros/AddTaskSPDdNdEta.C");
 455       AliAnalysisTaskSPDdNdEta *taskspddndeta = AddTaskSPDdNdEta();
 456       if (!taskspddndeta) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskSPDdNdEta cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 457       taskspddndeta->SetReadMC(useMC);
 458    }
 459
 460    // Unicor
 461    if (iPWG2unicor) {
 462       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/UNICOR/AddTaskUnicor.C");
 463       AliAnalysisTaskUnicor *taskunicor = AddTaskUnicor();
 464       if (!taskunicor) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskUnicor cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 465    }
 466
 467    // FMD
 468    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("forward.root");
 469    if (iPWG2forward) {
 470       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FORWARD/analysis/AddTaskFMD.C");
 471       AliFMDAnalysisTaskSE *taskfmd = AddTaskFMD();
 472       if (!taskfmd) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliFMDAnalysisTaskSE cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 473    }
 474    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 475
 476    // Flow analysis
 477    if (iPWG2flow) {
 478       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FLOW/macros/AddTaskFlow.C");
 479       Bool_t SP       = kTRUE;
 480       Bool_t LYZ1SUM  = kTRUE;
 481       Bool_t LYZ1PROD = kTRUE;
 482       Bool_t LYZ2SUM  = kFALSE;
 483       Bool_t LYZ2PROD = kFALSE;
 484       Bool_t LYZEP    = kFALSE;
 485       Bool_t GFC      = kTRUE;
 486       Bool_t QC       = kTRUE;
 487       Bool_t FQD      = kFALSE;
 488       Bool_t MCEP     = kFALSE; //does not work yet 24/12/08
 489       Bool_t kineFromESD = kTRUE;
 490       Bool_t METHODS[] = {SP,LYZ1SUM,LYZ1PROD,LYZ2SUM,LYZ2PROD,LYZEP,GFC,QC,FQD,MCEP};
 491       // Analysis type can be ESD, AOD, MC, ESDMC0, ESDMC1
 492       TString type = "AOD";
 493       if (!iAODanalysis) type = "ESD";
 494       // Boolean to fill/not fill the QA histograms
 495       Bool_t QA = kTRUE;
 496       // Boolean to use/not use weights for the Q vector
 497       Bool_t WEIGHTS[] = {kFALSE,kFALSE,kFALSE}; //Phi, v'(pt), v'(eta)
 498       AliAnalysisTaskFlowEvent* taskFE = AddTaskFlow(type,METHODS,QA,WEIGHTS);
 499       if (!taskFE) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskFlowEvent cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 500    }
 501
 502    // PWG2 resonances
 503    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("resonances.root");
 504    if (iPWG2res) {
 505       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train/AddAnalysisTaskRsn.C");
 506       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train/AddAnalysisTaskRsnEff.C");
 507       TString path = gROOT->GetMacroPath();
 508       path += ":$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train";
 509       gROOT->SetMacroPath(path);
 510       AddAnalysisTaskRsn(kTRUE);
 511       if (iPWG2rsneff) AddAnalysisTaskRsnEff();
 512    }
 513    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 514
 515 // ********** PWG3 wagons ******************************************************
 516    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG3histograms.root");
 517
 518    // PWG3 vertexing
 519    if (iPWG3vertexing) {
 520       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/AddTaskVertexingHF.C");
 521       if (!iPWG3d2h) TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(configPWG3d2h.Data()), Form("%s/ConfigVertexingHF.C", train_name.Data()));
 522       AliAnalysisTaskSEVertexingHF *taskvertexingHF = AddTaskVertexingHF();
 523       if (!taskvertexingHF) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskSEVertexingHF cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 524       else mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.VertexingHF.root");
 525    }
 526
 527    // PWG3 electrons
 528    if (iPWG3hfe) {
 529       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/hfe/AddTaskHFE.C");
 530       AliAnalysisTaskHFE *taskHFE = AddTaskHFE();
 531       if (!taskHFE) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskHFE cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 532    }
 533
 534    // PWG3 D2h
 535    if (iPWG3d2h) {
 536       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/AddD2HTrain.C");
 537       TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(configPWG3d2h.Data()), Form("%s/ConfigVertexingHF.C", train_name.Data()));
 538       AddD2HTrain(iPWG3d0mass,iPWG3d0massLS,iPWG3dplus, iPWG3LSd0, iPWG3LSjpsi, iPWG3CFd0, iPWG3promptd0);
 539    }
 540
 541 // ********** PWG4 wagons ******************************************************
 542    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG4histograms.root");
 543
 544     // Jet analysis
 545    if (iJETAN) {
 546       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskJets.C");
 547       if (!iAODanalysis) {
 548          // Default jet reconstructor running on ESD's
 549          AliAnalysisTaskJets * taskjets = AddTaskJets();
 550          if (!taskjets) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskJets cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 551          if (iJETANdelta) {
 552             AddTaskJetsDelta("AliAOD.Jets.root");
 553             mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.Jets.root");
 554          }
 555       } else {
 556          // AOD-based analysis. Add all reconstructors to write into delta AOD's
 557          if (iJETANdelta) AddTaskJetsDelta();
 558          AliAnalysisTaskJets * taskjets = AddTaskJets();
 559          taskjets->SetNonStdBranch("jetsAOD_UA1_04");
 560       }
 561    }
 562    // PWG4 hadron correlations
 563    if (iPWG4partcorr) {
 564       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskPartCorr.C");
 565       AliAnalysisTaskParticleCorrelation *taskpartcorrPHOS = AddTaskPartCorr("AOD", "PHOS");
 566       if (!taskpartcorrPHOS) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskParticleCorrelation PHOS cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 567       AliAnalysisTaskParticleCorrelation *taskpartcorrEMCAL = AddTaskPartCorr("AOD", "EMCAL");
 568       if (!taskpartcorrEMCAL) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskParticleCorrelation EMCAL cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 569       mgr->RegisterExtraFile("deltaAODPartCorr.root");
 570    }
 571
 572    // PWG4 gamma conversion analysis
 573    if (iPWG4gammaconv) {
 574       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskGammaConversion.C");
 575       TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();
 576       gSystem->ChangeDirectory(gSystem->ExpandPathName("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/"));
 577       TString gcArguments = "-run-on-train -run-jet -run-chic -run-neutralmeson -run-cf";
 578       AliAnalysisTaskGammaConversion * taskGammaConversion = AddTaskGammaConversion(gcArguments,mgr->GetCommonInputContainer());
 579       gSystem->ChangeDirectory(cdir);
 580       if (!taskGammaConversion) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskGammaConversion cannot run for these train conditions - EXCLUDED");
 581    }
 582
 583    // PWG4 omega to 3 pions analysis
 584    if (iPWG4omega3pi) {
 585       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskomega3pi.C");
 586       AliAnalysisTaskOmegaPi0PiPi *taskomega3pi = AddTaskomega3pi();
 587       if (!taskomega3pi) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskomega3pi cannot run for these train conditions - EXCLUDED");
 588    }
 589 }
 590
 591 //______________________________________________________________________________
 592 void StartAnalysis(const char *mode, TChain *chain) {
 593 // Start analysis.
 594    Int_t imode = -1;
 595    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 596    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 597    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 598    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 599    switch (imode) {
 600       case 0:
 601          if (!chain) {
 602             ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Cannot create the chain");
 603             return;
 604          }
 605          mgr->StartAnalysis(mode, chain);
 606          return;
 607       case 1:
 608          if (!proof_dataset.Length()) {
 609             ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "proof_dataset is empty");
 610             return;
 611          }
 612          mgr->StartAnalysis(mode, proof_dataset, 1000);
 613          return;
 614       case 2:
 615          if (usePLUGIN) {
 616             if (!mgr->GetGridHandler()) {
 617                ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Grid plugin not initialized");
 618                return;
 619             }
 620             mgr->StartAnalysis("grid");
 621          } else {
 622             if (!chain) {
 623                ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Cannot create the chain");
 624                return;
 625             }
 626             mgr->StartAnalysis(mode, chain);
 627          }
 628          return;
 629    }
 630 }
 631
 632 //______________________________________________________________________________
 633 void CheckModuleFlags(const char *mode) {
 634 // Checks selected modules and insure compatibility
 635    Int_t imode = -1;
 636    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 637    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 638    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 639    if (!iJETAN) iJETANdelta = 0;
 640    if (imode==1) {
 641       if (!usePAR) {
 642          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PAR files enabled due to PROOF analysis");
 643          usePAR = kTRUE;
 644       }
 645    }
 646    if (imode != 2) {
 647       ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "AliEn plugin disabled since not in GRID mode");
 648       usePLUGIN = kFALSE;
 649    }
 650    if (iAODanalysis) {
 651    // AOD analysis
 652       if (useMC)
 653          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "MC usage disabled in analysis on AOD's");
 654       if (useAODTAGS)
 655          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "AOD tags usage disabled in analysis on AOD's");
 656       useMC = kFALSE;
 657       useTR = kFALSE;
 658       useAODTAGS = kFALSE;
 659       if (iESDfilter)
 660          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "ESD filter disabled in analysis on AOD's");
 661       iESDfilter   = 0;
 662       if (!iAODhandler) {
 663          if (iJETAN)
 664             ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "JETAN disabled in analysis on AOD's without AOD handler");
 665          iJETAN = 0;
 666          iJETANdelta = 0;
 667       }
 668       // Disable tasks that do not work yet on AOD data
 669       if (iPWG4gammaconv)
 670          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4gammaconv disabled on AOD's without AOD handler");
 671       iPWG4gammaconv = 0;
 672       if (iPWG2central)
 673          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2central disabled on AOD's");
 674          iPWG2central = 0;
 675       if (iPWG2flow)
 676          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2flow disabled on AOD's");
 677          iPWG2flow = 0;
 678       if (iPWG2femto)
 679          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2femto disabled on AOD's");
 680          iPWG2femto = 0;
 681       if (iPWG2res)
 682          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2res disabled on AOD's");
 683          iPWG2res = 0;
 684        if (iPWG2rsneff)
 685          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2rsneff disabled on AOD's");
 686          iPWG2rsneff = 0;
 687      if (iPWG2kink)
 688          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2kink disabled in analysis on AOD's");
 689          iPWG2kink = 0;
 690       if (iPWG2unicor)
 691          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2unicor disabled in analysis on AOD's");
 692          iPWG2unicor = 0;
 693       if (iPWG2evchar)
 694          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4evchar disabled on AOD's");
 695          iPWG2evchar = 0;
 696       if (iPWG2forward)
 697          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2forward disabled in analysis on AOD's");
 698          iPWG2forward = 0;
 699       if (iPWG3hfe)
 700          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG3hfe disabled on AOD's");
 701          iPWG3hfe = 0;
 702       if (iPWG3vertexing)
 703          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG3vertexing disabled on AOD's");
 704 //         iPWG3vertexing = 0;
 705       if (iPWG4omega3pi)
 706          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4omega3pi disabled on AOD's");
 707          iPWG4omega3pi = 0;
 708       if (iPWG4partcorr)
 709          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4partcorr disabled on AOD's");
 710          iPWG4partcorr = 0;
 711    } else {
 712    // ESD analysis
 713       if (!useMC) useTR = kFALSE;
 714       if (!useTR) {
 715          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "iPWG2evchar disabled if not reading track references");
 716          iPWG2evchar = 0;
 717       }
 718    }
 719    if (!useMC) {
 720       if (iPWG2perfcascade)
 721          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2perfcascade disabled without MC info");
 722       iPWG2perfcascade = 0;
 723       if (iPWG2central)
 724          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2central disabled without MC info");
 725          iPWG2central = 0;
 726    }
 727    if (iJETAN && !iAODanalysis) iESDfilter=1;
 728    if (iESDfilter) {iAODhandler=1; useCORRFW = kTRUE;}
 729    if (iPWG2spectra || iPWG2flow || iPWG3vertexing || iPWG3hfe || iPWG2res || iPWG2rsneff) useCORRFW = kTRUE;
 730    if (useKFILTER && !useMC) useKFILTER = kFALSE;
 731    if (useAODTAGS && !iAODhandler) useAODTAGS = kFALSE;
 732 }
 733
 734 //______________________________________________________________________________
 735 Bool_t Connect(const char *mode) {
 736 // Connect <username> to the back-end system.
 737    Int_t imode = -1;
 738    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 739    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 740    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 741    TString username = gSystem->Getenv("alien_API_USER");
 742    switch (imode) {
 743       case 0:
 744          break;
 745       case 1:
 746          if  (!username.Length()) {
 747             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Make sure you:\n \
 748                            1. Have called: alien-token-init <username>\n \
 749                            2. Have called: >source /tmp/gclient_env_$UID");
 750             return kFALSE;
 751          }
 752          ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Connecting user <%s> to PROOF cluster <%s>",
 753                 username.Data(), proof_cluster.Data());
 754          gEnv->SetValue("XSec.GSI.DelegProxy", "2");
 755 //         TProof::Open(Form("%s@%s:31093", username.Data(), proof_cluster.Data()));
 756          TProof::Open(Form("%s@%s", username.Data(), proof_cluster.Data()));
 757          if (!gProof) {
 758             if (strcmp(gSystem->Getenv("XrdSecGSISRVNAMES"), "lxfsrd0506.cern.ch"))
 759                ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Environment XrdSecGSISRVNAMES different from lxfsrd0506.cern.ch");
 760             return kFALSE;
 761          }
 762          TGrid::Connect("alien://");
 763          if (gGrid) {
 764             TString homedir = gGrid->GetHomeDirectory();
 765             TString workdir = homedir + train_name;
 766             if (!gGrid->Cd(workdir)) {
 767                gGrid->Cd(homedir);
 768                if (gGrid->Mkdir(workdir)) {
 769                   gGrid->Cd(train_name);
 770                   ::Info("AnalysisTrainNew::Connect()", "Directory %s created", gGrid->Pwd());
 771                }
 772             }
 773             gGrid->Mkdir("proof_output");
 774             gGrid->Cd("proof_output");
 775             proof_outdir = Form("alien://%s", gGrid->Pwd());
 776          }
 777          break;
 778       case 2:
 779          if  (!username.Length()) {
 780             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Make sure you:\n \
 781                            1. Have called: alien-token-init <username>\n \
 782                            2. Have called: >source /tmp/gclient_env_$UID");
 783             return kFALSE;
 784          }
 785          if (usePLUGIN && !gSystem->Getenv("alien_CLOSE_SE")) {
 786             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode),
 787                            "When using the AliEn plugin it is preferable to define the \
 788                            variable alien_CLOSE_SE in your environment.");
 789             return kFALSE;
 790          }
 791          ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Connecting user <%s> to AliEn ...",
 792                 username.Data());
 793          TGrid::Connect("alien://");
 794          if (!gGrid || !gGrid->IsConnected()) return kFALSE;
 795          break;
 796       default:
 797          ::Error("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Unknown run mode: %s", mode);
 798          return kFALSE;
 799    }
 800    ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect","Connected in %s mode", mode);
 801    return kTRUE;
 802 }
 803
 804 //______________________________________________________________________________
 805 Bool_t LoadCommonLibraries(const char *mode)
 806 {
 807 // Load common analysis libraries.
 808    Int_t imode = -1;
 809    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 810    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 811    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 812    if (!gSystem->Getenv("ALICE_ROOT")) {
 813       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadCommonLibraries", "Analysis train requires that analysis libraries are compiled with a local AliRoot");
 814       return kFALSE;
 815    }
 816    Bool_t success = kTRUE;
 817    // ROOT libraries
 818    gSystem->Load("libTree.so");
 819    gSystem->Load("libGeom.so");
 820    gSystem->Load("libVMC.so");
 821    gSystem->Load("libPhysics.so");
 822    gSystem->Load("libMinuit.so");
 823
 824    // Load framework classes. Par option ignored here.
 825    switch (imode) {
 826       case 0:
 827       case 2:
 828          if (useCPAR) {
 829             success &= LoadLibrary("STEERBase", mode, kTRUE);
 830             success &= LoadLibrary("ESD", mode, kTRUE);
 831             success &= LoadLibrary("AOD", mode, kTRUE);
 832             success &= LoadLibrary("ANALYSIS", mode, kTRUE);
 833             success &= LoadLibrary("ANALYSISalice", mode, kTRUE);
 834             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode, kTRUE);
 835          } else {
 836             success &= LoadLibrary("libSTEERBase.so", mode);
 837             success &= LoadLibrary("libESD.so", mode);
 838             success &= LoadLibrary("libAOD.so", mode);
 839             success &= LoadLibrary("libANALYSIS.so", mode);
 840             success &= LoadLibrary("libANALYSISalice.so", mode);
 841             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("libCORRFW.so", mode);
 842             gROOT->ProcessLine(".include $ALICE_ROOT/include");
 843          }
 844          break;
 845       case 1:
 846          Int_t ires = -1;
 847          if (useAFPAR && !gSystem->AccessPathName(AFversion)) ires = gProof->UploadPackage(AFversion);
 848          if (ires < 0) {
 849             success &= LoadLibrary("STEERBase", mode);
 850             success &= LoadLibrary("ESD", mode);
 851             success &= LoadLibrary("AOD", mode);
 852             success &= LoadLibrary("ANALYSIS", mode);
 853             success &= LoadLibrary("ANALYSISalice", mode);
 854             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode);
 855          } else {
 856             ires = gProof->EnablePackage(AFversion);
 857             if (ires<0) success = kFALSE;
 858             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode);
 859          }
 860          break;
 861       default:
 862          ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadCommonLibraries", "Unknown run mode: %s", mode);
 863          return kFALSE;
 864    }
 865    if (success) {
 866       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Load common libraries:    SUCCESS");
 867       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Include path for Aclic compilation:\n%s",
 868               gSystem->GetIncludePath());
 869    } else {
 870       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Load common libraries:    FAILED");
 871    }
 872
 873    return success;
 874 }
 875
 876 //______________________________________________________________________________
 877 Bool_t LoadAnalysisLibraries(const char *mode)
 878 {
 879 // Load common analysis libraries.
 880    Bool_t success = kTRUE;
 881    if (iESDfilter) {
 882       if (!LoadLibrary("PWG3base", mode, kTRUE) ||
 883           !LoadLibrary("PWG3muon", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 884    }
 885    // JETAN
 886    if (iJETAN) {
 887       if (!LoadLibrary("JETAN", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 888    }
 889    if (iJETANdelta) {
 890       if (!LoadLibrary("JETAN", mode, kTRUE) ||
 891           !LoadLibrary("CGAL", mode, kTRUE) ||
 892           !LoadLibrary("fastjet", mode, kTRUE) ||
 893           !LoadLibrary("siscone", mode, kTRUE) ||
 894           !LoadLibrary("SISConePlugin", mode, kTRUE) ||
 895           !LoadLibrary("FASTJETAN", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 896    }
 897    // PWG4 particle correlations
 898    if (iPWG4partcorr) {
 899       if (!LoadLibrary("EMCALUtils", mode, kTRUE) ||
 900           !LoadLibrary("PHOSUtils", mode, kTRUE) ||
 901           !LoadLibrary("PWG4PartCorrBase", mode, kTRUE) ||
 902           !LoadLibrary("PWG4PartCorrDep", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 903    }
 904    // PWG4 gamma conversion
 905    if (iPWG4gammaconv) {
 906       if (!LoadLibrary("PWG4GammaConv", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 907    }
 908    // PWG4 omega to 3 pions
 909    if (iPWG4omega3pi) {
 910       if (!LoadLibrary("PWG4omega3pi", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 911    }
 912    // PWG2 task protons
 913    if (iPWG2spectra) {
 914       if (!LoadLibrary("PWG2spectra", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 915    }
 916    // PWG2 flow
 917    if (iPWG2flow) {
 918       if (!LoadLibrary("PWG2flowCommon", mode, kTRUE) ||
 919           !LoadLibrary("PWG2flowTasks", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 920    }
 921    // PWG2 resonances
 922    if (iPWG2res || iPWG2rsneff) {
 923       if (!LoadLibrary("PWG2resonances", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 924    }
 925    // PWG2 kink
 926    if (iPWG2kink) {
 927       if (!LoadLibrary("PWG2kink", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 928    }
 929    // PWG2 unicor
 930    if (iPWG2unicor) {
 931       if (!LoadLibrary("PWG2unicor", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 932    }
 933    // PWG2 evchar
 934    if (iPWG2evchar) {
 935       if (!LoadLibrary("PWG2evchar", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 936    }
 937    // PWG2 femtoscopy
 938    if (iPWG2femto) {
 939       if (!LoadLibrary("PWG2AOD", mode, kTRUE) ||
 940           !LoadLibrary("PWG2femtoscopy", mode, kTRUE) ||
 941           !LoadLibrary("PWG2femtoscopyUser", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 942 //      TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName("$(ALICE_ROOT)/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/ConfigFemtoAnalysis.C"), Form("%s/ConfigFemtoAnalysis.C", train_name.Data()));
 943 //      anaLibs += "ConfigFemtoAnalysis.C ";
 944    }
 945    // PWG2 FORWARD
 946    if (iPWG2forward) {
 947       if (!LoadLibrary("PWG2forward", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 948    }
 949    // PWG3 Vertexing HF
 950    if (iPWG3vertexing || iPWG3d2h) {
 951       if (!LoadLibrary("PWG3base", mode, kTRUE) ||
 952           !LoadLibrary("PWG3vertexingHF", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 953    }
 954    // PWG3 hfe
 955    if (iPWG3hfe) {
 956       if (!LoadLibrary("PWG3hfe", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 957    }
 958
 959    ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadAnalysisLibraries", "Load other libraries:   SUCCESS");
 960    return kTRUE;
 961 }
 962
 963 //______________________________________________________________________________
 964 Bool_t LoadLibrary(const char *module, const char *mode, Bool_t rec=kFALSE)
 965 {
 966 // Load a module library in a given mode. Reports success.
 967    Int_t imode = -1;
 968    Int_t result;
 969    TString smodule(module);
 970    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 971    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 972    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 973    TString mod(module);
 974    if (!mod.Length()) {
 975       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Empty module name");
 976       return kFALSE;
 977    }
 978    // If a library is specified, just load it
 979    if (smodule.EndsWith(".so")) {
 980       mod.Remove(mod.Index(".so"));
 981       result = gSystem->Load(mod);
 982       if (result < 0) {
 983          ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not load library %s", module);
 984          return kFALSE;
 985       }
 986       if (rec) anaLibs += Form("%s.so ",mod.Data());
 987       return kTRUE;
 988    }
 989    // Check if the library is already loaded
 990    if (strlen(gSystem->GetLibraries(Form("%s.so", module), "", kFALSE)) > 0)
 991       return kTRUE;
 992    switch (imode) {
 993       case 0:
 994       case 2:
 995          if (usePAR) {
 996             result = SetupPar(module);
 997             if (rec) anaPars += Form("%s.par ", module);
 998          } else {
 999             result = gSystem->Load(Form("lib%s.so", module));
1000             if (rec) anaLibs += Form("lib%s.so ", module);
1001          }
1002          break;
1003       case 1:
1004          result = gProof->UploadPackage(module);
1005          if (result<0) {
1006             result = gProof->UploadPackage(gSystem->ExpandPathName(Form("$ALICE_ROOT/%s.par", module)));
1007             if (result<0) {
1008                ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not find module %s.par in current directory nor in $ALICE_ROOT", module);
1009                return kFALSE;
1010             }
1011          }
1012          result = gProof->EnablePackage(module);
1013          break;
1014       default:
1015          return kFALSE;
1016    }
1017    if (result < 0) {
1018       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not load module %s", module);
1019       return kFALSE;
1020    }
1021    return kTRUE;
1022 }
1023
1024
1025 //______________________________________________________________________________
1026 TChain *CreateChain(const char *mode, const char *plugin_mode)
1027 {
1028 // Create the input chain
1029    Int_t imode = -1;
1030    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
1031    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
1032    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
1033    TChain *chain = NULL;
1034    // Local chain
1035    switch (imode) {
1036       case 0:
1037          if (iAODanalysis) {
1038             if (!local_xmldataset.Length()) {
1039                // Local AOD
1040                chain = new TChain("aodTree");
1041                if (gSystem->AccessPathName("data/AliAOD.root"))
1042                   ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChain", "File: AliAOD.root not in ./data dir");
1043                else {
1044                   if (!saveTrain) chain->Add("data/AliAOD.root");
1045                   else            chain->Add("../data/AliAOD.root");
1046                }
1047             } else {
1048                // Interactive AOD
1049                chain = CreateChainSingle(local_xmldataset, "aodTree");
1050             }
1051          } else {
1052             if (!local_xmldataset.Length()) {
1053                // Local ESD
1054                chain = new TChain("esdTree");
1055                if (gSystem->AccessPathName("data/AliESDs.root"))
1056                   ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChain", "File: AliESDs.root not in ./data dir");
1057                else {
1058                   if (!saveTrain) chain->Add("data/AliESDs.root");
1059                   else            chain->Add("../data/AliESDs.root");
1060                }
1061             } else {
1062                // Interactive ESD
1063                chain = CreateChainSingle(local_xmldataset, "esdTree");
1064             }
1065          }
1066          break;
1067       case 1:
1068          break;
1069       case 2:
1070          if (usePLUGIN) {
1071 //            AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(plugin_mode);
1072 //            AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->SetGridHandler(alienHandler);
1073          } else {
1074             TString           treeName = "esdTree";
1075             if (iAODanalysis) treeName = "aodTree";
1076             chain = CreateChainSingle("wn.xml", treeName);
1077          }
1078          break;
1079       default:
1080    }
1081    if (chain && chain->GetNtrees()) return chain;
1082    return NULL;
1083 }
1084
1085 //______________________________________________________________________________
1086 TChain* CreateChainSingle(const char* xmlfile, const char *treeName)
1087 {
1088    printf("*******************************\n");
1089    printf("*** Getting the ESD Chain   ***\n");
1090    printf("*******************************\n");
1091    TAlienCollection * myCollection  = TAlienCollection::Open(xmlfile);
1092
1093    if (!myCollection) {
1094       ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChainSingle", "Cannot create an AliEn collection from %s", xmlfile) ;
1095       return NULL ;
1096    }
1097
1098    TChain* chain = new TChain(treeName);
1099    myCollection->Reset() ;
1100    while ( myCollection->Next() ) chain->Add(myCollection->GetTURL("")) ;
1101    chain->ls();
1102    return chain;
1103 }
1104
1105 //______________________________________________________________________________
1106 Int_t SetupPar(char* pararchivename)
1107 {
1108    if (!pararchivename || !strlen(pararchivename)) return -1;
1109    char processline[1024];
1110    if (gSystem->AccessPathName(Form("%s.par", pararchivename))) {
1111       if (!gSystem->AccessPathName(Form("%s/%s.par", gSystem->Getenv("ALICE_ROOT"),pararchivename))) {
1112          ::Info("AnalysisTrainNew.C::SetupPar", "Getting %s.par from $ALICE_ROOT", pararchivename);
1113          TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(Form("$ALICE_ROOT/%s.par", pararchivename)),
1114                    Form("%s.par",pararchivename));
1115       } else {
1116          ::Error("AnalysisTrainNew.C::SetupPar", "Cannot find %s.par", pararchivename);
1117          return -1;
1118       }
1119    }
1120    if (usePLUGIN && saveTrain) gSystem->Exec(Form("ln -s ../%s.par %s",pararchivename, train_name.Data()));
1121    gSystem->Exec(Form("tar xvzf %s.par", pararchivename));
1122
1123    TString ocwd = gSystem->WorkingDirectory();
1124    if (!gSystem->ChangeDirectory(pararchivename)) return -1;
1125
1126    // check for BUILD.sh and execute
1127    if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
1128       printf("*******************************\n");
1129       printf("*** Building PAR archive    ***\n");
1130       printf("*******************************\n");
1131       if (gSystem->Exec("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
1132          Error("runProcess","Cannot Build the PAR Archive! - Abort!");
1133          return -1;
1134       }
1135    }
1136
1137         // check for SETUP.C and execute
1138         if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/SETUP.C")) {
1139             printf("*******************************\n");
1140             printf("*** Setup PAR archive       ***\n");
1141             printf("*******************************\n");
1142             gROOT->Macro("PROOF-INF/SETUP.C");
1143         }
1144         if (!gSystem->ChangeDirectory(ocwd.Data())) return -1;
1145    return 0;
1146 }
1147
1148 //______________________________________________________________________________
1149 AliAnalysisAlien* CreateAlienHandler(const char *plugin_mode)
1150 {
1151 // Check if user has a valid token, otherwise make one. This has limitations.
1152 // One can always follow the standard procedure of calling alien-token-init then
1153 //   source /tmp/gclient_env_$UID in the current shell.
1154    if (!AliAnalysisGrid::CreateToken()) return NULL;
1155    AliAnalysisAlien *plugin = new AliAnalysisAlien();
1156 // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit" or "terminate")
1157    plugin->SetRunMode(plugin_mode);
1158    if (useProductionMode) plugin->SetProductionMode();
1159    plugin->SetJobTag(job_tag);
1160    plugin->SetNtestFiles(1);
1161 //   plugin->SetPreferedSE("ALICE::NIHAM::File");
1162 // Set versions of used packages
1163 //   plugin->SetAPIVersion("V2.4");
1164    plugin->SetAPIVersion("V1.0x");
1165    plugin->SetROOTVersion(root_version);
1166    plugin->SetAliROOTVersion(aliroot_version);
1167 // Declare input data to be processed.
1168 // Method 1: Create automatically XML collections using alien 'find' command.
1169 // Define production directory LFN
1170    plugin->SetGridDataDir(alien_datadir);
1171 // Set data search pattern
1172    if (iAODanalysis) plugin->SetDataPattern("*AliAOD.root");
1173    else              plugin->SetDataPattern("*ESD.tag.root");
1174 // ...then add run numbers to be considered
1175    if (!iAODanalysis) plugin->SetRunRange(run_range[0], run_range[1]);
1176 //   for (Int_t i=0; i<10; i++) {
1177 //      if (run_numbers[i]==0) break;
1178 //      plugin->AddRunNumber(run_numbers[i]);
1179 //   }
1180 // Method 2: Declare existing data files (raw collections, xml collections, root file)
1181 // If no path mentioned data is supposed to be in the work directory (see SetGridWorkingDir())
1182 // XML collections added via this method can be combined with the first method if
1183 // the content is compatible (using or not tags)
1184 //   plugin->AddDataFile("tag.xml");
1185 //   plugin->AddDataFile("/alice/data/2008/LHC08c/000057657/raw/Run57657.Merged.RAW.tag.root");
1186 // Define alien work directory where all files will be copied. Relative to alien $HOME.
1187    if (iAODanalysis) plugin->SetGridWorkingDir("analysisAOD");
1188    else              plugin->SetGridWorkingDir("analysisESD");
1189 // Declare alien output directory. Relative to working directory.
1190    if (!alien_outdir.Length()) alien_outdir = Form("output_%s",train_name.Data());
1191    plugin->SetGridOutputDir(alien_outdir);
1192
1193    TString ana_sources = "";
1194    TString ana_add = "";
1195    if (usePAR && anaPars.Length()) {
1196       printf("%s\n", anaPars.Data());
1197       TObjArray *arr;
1198       TObjString *objstr;
1199       arr = anaPars.Tokenize(" ");
1200       TIter next(arr);
1201       while ((objstr=(TObjString*)next())) plugin->EnablePackage(objstr->GetString());
1202       delete arr;
1203    }
1204 // Add external packages
1205    if (iJETANdelta) {
1206       plugin->AddExternalPackage("boost::v1_38_0");
1207       plugin->AddExternalPackage("cgal::v3.3.1");
1208       plugin->AddExternalPackage("fastjet::v2.4.0");
1209    }
1210
1211 // Declare the analysis source files names separated by blancs. To be compiled runtime
1212 // using ACLiC on the worker nodes.
1213    ana_sources = ana_sources.Strip();
1214 // Declare all libraries (other than the default ones for the framework. These will be
1215 // loaded by the generated analysis macro. Add all extra files (task .cxx/.h) here.
1216    anaLibs     = anaLibs.Strip();
1217    if (ana_sources.Length()) plugin->SetAnalysisSource(ana_sources);
1218    if (anaLibs.Length())     plugin->SetAdditionalLibs(anaLibs);
1219
1220 // Declare the output file names separated by blancs.
1221 // (can be like: file.root or file.root@ALICE::Niham::File)
1222    plugin->SetDefaultOutputs();
1223    plugin->SetMergeExcludes(mergeExclude);
1224    plugin->SetMaxMergeFiles(maxMergeFiles);
1225    plugin->SetNrunsPerMaster(nRunsPerMaster);
1226 // Optionally define the files to be archived.
1227 //   plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr@ALICE::NIHAM::File root_archive.zip:AliAOD.root,AOD.tag.root@ALICE::NIHAM::File");
1228
1229
1230    // Put default output files to archive
1231    TString listhists = "";
1232    TString listaods  = "";
1233    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
1234    TIter next(mgr->GetOutputs());
1235    AliAnalysisDataContainer *output;
1236    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
1237       const char *filename = output->GetFileName();
1238       if (!(strcmp(filename, "default"))) {
1239          if (!mgr->GetOutputEventHandler()) continue;
1240          filename = mgr->GetOutputEventHandler()->GetOutputFileName();
1241          if (listaods.Length()) listaods += ",";
1242          listaods += filename;
1243          listaods += ",";
1244          listaods += "pyxsec_hists.root";
1245       } else {
1246          if (!strcmp(filename, "pyxsec_hists.root")) continue;
1247          if (listhists.Contains(filename)) continue;
1248          if (listhists.Length()) listhists += ",";
1249          listhists += filename;
1250       }
1251    }
1252    if (mgr->GetExtraFiles().Length()) {
1253       if (listaods.Length()) listaods += ",";
1254       listaods += mgr->GetExtraFiles();
1255       listaods.ReplaceAll(" ", ",");
1256    }
1257    if (listhists.Length()) listhists = Form("hist_archive.zip:%s@%s", listhists.Data(), outputStorages.Data());;
1258    if (listaods.Length())  listaods  = Form("aod_archive.zip:%s@%s", listaods.Data(), outputStorages.Data());;
1259    if (!listhists.Length() && !listaods.Length()) {
1260       ::Fatal("AnalysisTrainNew", "No task output !");
1261    }
1262    TString outputArchive = "log_archive.zip:stdout,stderr@ALICE::CERN::SE";
1263    if (listaods.Length()) {
1264       outputArchive += " ";
1265       outputArchive += listaods;
1266    }
1267    if (listhists.Length()) {
1268       outputArchive += " ";
1269       outputArchive += listhists;
1270    }
1271 // Set friends
1272 //   if (iAODanalysis && iPWG3d2h)
1273 //      plugin->SetFriendChainName("AliAOD.VertexingHF.root");
1274    plugin->SetOutputArchive(outputArchive);
1275 // Optionally set a name for the generated analysis macro (default MyAnalysis.C)
1276    plugin->SetAnalysisMacro(Form("%s.C", train_name.Data()));
1277 // Optionally set maximum number of input files/subjob (default 100, put 0 to ignore)
1278    plugin->SetSplitMaxInputFileNumber(nFilesPerJob);
1279 // Optionally set number of failed jobs that will trigger killing waiting sub-jobs.
1280 //   plugin->SetMaxInitFailed(5);
1281 // Optionally resubmit threshold.
1282 //   plugin->SetMasterResubmitThreshold(90);
1283 // Optionally set time to live (default 30000 sec)
1284    plugin->SetTTL(70000);
1285 // Optionally set input format (default xml-single)
1286    plugin->SetInputFormat("xml-single");
1287 // Optionally modify the name of the generated JDL (default analysis.jdl)
1288    plugin->SetJDLName(Form("%s.jdl", train_name.Data()));
1289 // Optionally modify the executable name (default analysis.sh)
1290    plugin->SetExecutable(Form("%s.sh", train_name.Data()));
1291 // Optionally modify job price (default 1)
1292    plugin->SetPrice(1);
1293 // Optionally modify split mode (default 'se')
1294 //   plugin->SetSplitMode("se");
1295    return plugin;
1296 }
1297
1298 //______________________________________________________________________________
1299 void WriteConfig()
1300 {
1301 // Write train configuration in a file. The file name has the format:
1302 // train_[trainName]_ddMonthyyyy_time.C
1303    if (useDATE) {
1304       gSystem->Exec("date +%d%b%Y_%Hh%M > date.tmp");
1305       ifstream fdate("date.tmp");
1306       if (!fdate.is_open()) {
1307          ::Error("AnalysisTrainNew.C::Export","Could not generate file name");
1308          return;
1309       }
1310       const char date[64];
1311       fdate.getline(date,64);
1312       fdate.close();
1313       gSystem->Exec("rm date.tmp");
1314       train_name = Form("train_%s_%s", train_name.Data(), date);
1315    } else {
1316       train_name = Form("train_%s", train_name.Data());
1317    }
1318    TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();
1319    gSystem->MakeDirectory(train_name);
1320    gSystem->ChangeDirectory(train_name);
1321    ofstream out;
1322    out.open(Form("%sConfig.C",train_name.Data()), ios::out);
1323    if (out.bad()) {
1324       ::Error("AnalysisTrainNew.C::Export", "Cannot open ConfigTrain.C for writing");
1325       return;
1326    }
1327    out << "{" << endl;
1328    out << "   train_name      = " << "\"" << train_name.Data() << "\";" << endl;
1329    out << "   proof_cluster   = " << "\"" << proof_cluster.Data() << "\";" << endl;
1330    out << "   useAFPAR        = " << useAFPAR << ";" << endl;
1331    if (useAFPAR)
1332       out << "   AFversion       = " << AFversion.Data() << ";" << endl;
1333    out << "   proof_dataset   = " << "\"" << proof_dataset.Data() << "\";" << endl;
1334    out << "   usePLUGIN       = " << usePLUGIN << ";" << endl;
1335    out << "   usePAR          = " << usePAR << ";" << endl;
1336    out << "   useCPAR         = " << useCPAR << ";" << endl;
1337    out << "   root_version    = " << "\"" << root_version.Data() << "\";" << endl;
1338    out << "   aliroot_version = " << "\"" << aliroot_version.Data() << "\";" << endl;
1339    out << "   alien_datadir   = " << "\"" << alien_datadir.Data() << "\";" << endl;
1340    if (!alien_outdir.Length()) alien_outdir = Form("output_%s",train_name.Data());
1341    out << "   alien_outdir    = " << "\"" << alien_outdir.Data() << "\";" << endl;
1342    out << "   maxMergeFiles   = " << maxMergeFiles << ";" << endl;
1343    out << "   mergeExclude    = " << "\"" << mergeExclude.Data() << "\";" << endl;
1344    out << "   nRunsPerMaster  = " << nRunsPerMaster << ";" << endl;
1345    out << "   nFilesPerJob    = " << nFilesPerJob << ";" << endl;
1346 //   for (Int_t i=0; i<10; i++) {
1347 //      if (run_numbers[i])
1348 //         out << "   run_numbers[" << i << "]  = " << run_numbers[i] << ";" << endl;
1349 //   }
1350    out << "   run_range[0]    = " << run_range[0] << ";" << endl;
1351    out << "   run_range[1]    = " << run_range[1] << ";" << endl;
1352    out << "   useDBG          = " << useDBG << ";" << endl;
1353    out << "   useMC           = " << useMC << ";" << endl;
1354    out << "   useTAGS         = " << useTAGS << ";" << endl;
1355    out << "   useKFILTER      = " << useKFILTER << ";" << endl;
1356    out << "   useTR           = " << useTR << ";" << endl;
1357    out << "   useCORRFW       = " << useCORRFW << ";" << endl;
1358    out << "   useAODTAGS      = " << useAODTAGS << ";" << endl;
1359    out << "   saveTrain       = " << "kFALSE;" << endl << endl;
1360    out << "   // Analysis modules" << endl;
1361    out << "   iAODanalysis    = " << iAODanalysis << ";" << endl;
1362    out << "   iAODhandler     = " << iAODhandler << ";" << endl;
1363    out << "   iESDfilter      = " << iESDfilter << ";" << endl;
1364    out << "   iMUONcopyAOD    = " << iMUONcopyAOD << ";" << endl;
1365    out << "   iJETAN          = " << iJETAN << ";" << endl;
1366    out << "   iJETANdelta     = " << iJETANdelta << ";" << endl;
1367    out << "   iPWG4partcorr   = " << iPWG4partcorr << ";" << endl;
1368    out << "   iPWG4gammaconv  = " << iPWG4gammaconv << ";" << endl;
1369    out << "   iPWG4omega3pi   = " << iPWG4omega3pi << ";" << endl;
1370    out << "   iPWG3vertexing  = " << iPWG3vertexing << ";" << endl;
1371    out << "   iPWG3hfe        = " << iPWG3hfe << ";" << endl;
1372    out << "   iPWG3d2h        = " << iPWG3d2h << ";" << endl;
1373    out << "     iPWG3d0mass       = " << iPWG3d0mass << ";" << endl;
1374    out << "     iPWG3d0massLS     = " << iPWG3d0massLS << ";" << endl;
1375    out << "     iPWG3dplus        = " << iPWG3dplus << ";" << endl;
1376    out << "     iPWG3LSd0         = " << iPWG3LSd0 << ";" << endl;
1377    out << "     iPWG3LSjpsi       = " << iPWG3LSjpsi << ";" << endl;
1378    out << "     iPWG3CFd0         = " << iPWG3CFd0 << ";" << endl;
1379    out << "     iPWG3promptd0     = " << iPWG3promptd0 << ";" << endl;
1380    out << "   iPWG2femto      = " << iPWG2femto << ";" << endl;
1381    out << "   iPWG2spectra    = " << iPWG2spectra << ";" << endl;
1382    out << "     iPWG2protons      = " << iPWG2protons << ";" << endl;
1383    out << "     iPWG2checkcascade = " << iPWG2checkcascade << ";" << endl;
1384    out << "     iPWG2perfcascade  = " << iPWG2perfcascade << ";" << endl;
1385    out << "     iPWG2checkv0      = " << iPWG2checkv0 << ";" << endl;
1386    out << "     iPWG2strange      = " << iPWG2strange << ";" << endl;
1387    out << "     iPWG2central      = " << iPWG2central << ";" << endl;
1388    out << "   iPWG2flow       = " << iPWG2flow << ";" << endl;
1389    out << "   iPWG2res        = " << iPWG2res << ";" << endl;
1390    out << "     iPWG2rsneff   = " << iPWG2rsneff << ";" << endl;
1391    out << "   iPWG2kink       = " << iPWG2kink << ";" << endl;
1392    out << "     iPWG2kinkESDMC    = " << iPWG2kinkESDMC << ";" << endl;
1393    out << "     iPWG2kinkLSKstar  = " << iPWG2kinkLSKstar << ";" << endl;
1394    out << "     iPWG2kinkLSL1520  = " << iPWG2kinkLSL1520 << ";" << endl;
1395    out << "     iPWG2kinkLSPhi    = " << iPWG2kinkLSPhi << ";" << endl;
1396    out << "     iPWG2kinkKstarESD = " << iPWG2kinkKstarESD << ";" << endl;
1397    out << "     iPWG2kinkKstarMC  = " << iPWG2kinkKstarMC << ";" << endl;
1398    out << "     iPWG2kinkL1520ESD = " << iPWG2kinkL1520ESD << ";" << endl;
1399    out << "     iPWG2kinkL1520MC  = " << iPWG2kinkL1520MC << ";" << endl;
1400    out << "     iPWG2kinkPhiESD   = " << iPWG2kinkPhiESD << ";" << endl;
1401    out << "     iPWG2kinkPhiMC    = " << iPWG2kinkPhiMC << ";" << endl;
1402    out << "   iPWG2unicor     = " << iPWG2unicor << ";" << endl;
1403    out << "   iPWG2evchar     = " << iPWG2evchar << ";" << endl;
1404    out << "   iPWG2forward    = " << iPWG2forward << ";" << endl << endl;
1405    out << "// Configuration fot the wagons" << endl;
1406    out << "   configPWG2femto = \"" << configPWG2femto << "\";" << endl;
1407    out << "   configPWG3d2h   = \"" << configPWG3d2h << "\";" << endl;
1408    out << "}" << endl;
1409    ::Info("AnalysisTrainNew.C::WriteConfig", "Train configuration wrote to file %s", Form("config_%s.C", train_name.Data()));
1410    gSystem->ChangeDirectory(cdir);
1411 }
1412
1413 //______________________________________________________________________________
1414 Bool_t LoadConfig(const char *filename)
1415 {
1416 // Read train configuration from file
1417    if (gSystem->AccessPathName(filename)) {
1418       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadConfig", "Config file name not found");
1419       return kFALSE;
1420    }
1421    gROOT->ProcessLine(Form(".x %s", filename));
1422    ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadConfig", "Train configuration loaded from file %s", filename);
1423    return kTRUE;
1424 }