ANALYSIS/macros/QAtrain_duo.C

   1 // QAtrain_duo - assumes having 2 sets of input data files using 2 suffixes:
   2 //    AliESDs_barrel.root AliESDfriends_barrel.root ...  suffix = _barrel
   3 //    AliESDs_outer.root AliESDfriends_outer.root ...    suffix = _outer
   4 // HOW TO RUN (for run_no=158285):
   5 // QA job: should call:
   6 //    ln -fs AliESDs_barrel.root AliESDs.root
   7 //    ln -fs AliESDfriends_barrel.root AliESDfriends.root
   8 //    ... same for all specific reco files
   9 //    aliroot -b -q QAtrain_duo.C\(\"_barrel\"\,158285\) producing:
  10 //      -> EventStat_temp_barrel.root QAresults_barrel.root 400_400_0_350.stat
  11 //
  12 //    ln -fs AliESDs_outer.root AliESDs.root
  13 //    ln -fs AliESDfriends_outer.root AliESDfriends.root
  14 //    ... same for all specific reco files
  15 //    aliroot QAtrain_duo.C\(\"_outer\"\,158285\) producing:
  16 //      -> EventStat_temp_outer.root QAresults_outer.root 400_400_0_380.stat
  17 //
  18 // Each merging job:
  19 // for stages i < 5
  20 //    aliroot -b -q QAtrain_duo.C\(\"_barrel\"\,158285\,\"wn.xml\"\,i\)
  21 //    aliroot -b -q QAtrain_duo.C\(\"_outer\"\,158285\,\"wn.xml\"\,i\)
  22 //      -> same output files as the QA jobs (except .stat)
  23 // for stage 5
  24 //    aliroot -b -q QAtrain_duo.C\(\"_barrel\"\,158285\,\"Stage_5.xml\"\,5\)
  25 //      -> event_stat_barrel.root trending_barrel.root 145230_145230_0_120345.stat
  26 //    aliroot -b -q QAtrain_duo.C\(\"_outer\"\,158285\,\"Stage_5.xml\"\,5\)
  27 //      -> event_stat_outer.root trending_outer.root 145230_145230_0_132897.stat
  28 #include "Riostream.h"
  29 void LoadLibraries();
  30 void AddAnalysisTasks(const char *, const char *);
  31 void QAmerge(const char *,const char *, Int_t);
  32
  33 Int_t iCollisionType = 0; // 0=pp, 1=PbPb
  34 // Trigger mask.
  35
  36 UInt_t kTriggerInt = AliVEvent::kAnyINT;
  37 UInt_t kTriggerMuonBarrel = AliVEvent::kMUU7 | AliVEvent::kMuonUnlikeLowPt8 | AliVEvent::kMuonUnlikeLowPt0;
  38 UInt_t kTriggerEMC   = AliVEvent::kEMC7 | AliVEvent::kEMC8 | AliVEvent::kEMCEJE | AliVEvent::kEMCEGA;
  39 UInt_t kTriggerHM   = AliVEvent::kHighMult;
  40 // Main trigger mask used:
  41 UInt_t kTriggerMask = kTriggerInt;
  42
  43 Int_t runNumbers[5] = {158626};
  44
  45 Bool_t doCDBconnect   = 1;
  46 Bool_t doEventStat    = 1;
  47 Bool_t doCentrality   = 0;
  48 Bool_t doQAsym        = 1;
  49 Bool_t doVZERO        = 1;   // there is a 2nd file
  50 Bool_t doVZEROPbPb    = 1;
  51 Bool_t doVertex       = 1;
  52 Bool_t doSPD          = 1;   // needs RP
  53 Bool_t doTPC          = 1;
  54 Bool_t doHLT          = 1;
  55 Bool_t doSDD          = 1;   // needs RP
  56 Bool_t doSSDdEdx      = 1;
  57
  58 Bool_t doTRD          = 1;
  59 Bool_t doITS          = 1;
  60 Bool_t doITSsaTracks  = 1;
  61 Bool_t doITSalign     = 1;
  62 Bool_t doCALO         = 1;
  63 Bool_t doMUONTrig     = 1;
  64 Bool_t doImpParRes    = 1;
  65 Bool_t doMUON         = 1;
  66 Bool_t doTOF          = 1;
  67 Bool_t doHMPID        = 1;
  68 Bool_t doT0           = 1;
  69 Bool_t doZDC          = 1;
  70 Bool_t doPIDResponse  = 1;
  71 Bool_t doPIDqa        = 1; //new
  72 Bool_t doFMD          = 1; // new
  73 Bool_t doPHOS         = 1; // new
  74 Bool_t doPHOSTrig     = 1; // new
  75 Bool_t doEMCAL        = 1;
  76 Bool_t doFBFqa        = 1; // new - not ported yet to revision
  77
  78                // Debug level
  79 Int_t       debug_level        = 1;        // Debugging
  80 Int_t       run_number = 0;
  81
  82 void QAtrain_duo(const char *suffix="", Int_t run = 0,
  83              const char *xmlfile   = "wn.xml",
  84              Int_t  stage          = 0, /*0 = QA train, 1...n - merging stage*/
  85              const char *cdb     = "raw://")
  86 {
  87   run_number = run;
  88   TString ss(suffix);
  89   ss.ToLower();
  90   Bool_t ibarrel = (ss.Contains("barrel"))?kTRUE:kFALSE;
  91
  92   TString cdbString(cdb);
  93   if (cdbString.Contains("raw://"))
  94   {
  95     TGrid::Connect("alien://");
  96     if (!gGrid || !gGrid->IsConnected()) {
  97       ::Error("QAtrain", "No grid connection");
  98       return;
  99     }
 100   }
 101   // Set temporary merging directory to current one
 102   gSystem->Setenv("TMPDIR", gSystem->pwd());
 103   // Set temporary compilation directory to current one
 104   gSystem->SetBuildDir(gSystem->pwd(), kTRUE);
 105   // Load libraries
 106   LoadLibraries();
 107   printf("Include path: %s\n", gSystem->GetIncludePath());
 108   // Create manager
 109   AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("PilotAnalysis", "Production train");
 110   mgr->SetRunFromPath(run_number);
 111   // Input handler
 112   AliESDInputHandlerRP *esdHandler = new AliESDInputHandlerRP();
 113   if (ibarrel) {
 114     esdHandler->SetReadFriends(kTRUE);
 115     esdHandler->SetActiveBranches("ESDfriend");
 116   }
 117   mgr->SetInputEventHandler(esdHandler);
 118   mgr->SetDebugLevel(debug_level);
 119   mgr->SetFileInfoLog("fileinfo.log");
 120
 121   // AnalysisTasks
 122   AddAnalysisTasks(suffix, cdb);
 123   if (stage>0) {
 124     QAmerge(suffix, xmlfile, stage);
 125     return;
 126   }
 127   // Input chain
 128   TChain *chain = new TChain("esdTree");
 129   chain->Add("AliESDs.root");
 130   TStopwatch timer;
 131   timer.Start();
 132   if (mgr->InitAnalysis()) {
 133     mgr->PrintStatus();
 134     mgr->SetSkipTerminate(kTRUE);
 135 //    mgr->SetNSysInfo(1);
 136     mgr->StartAnalysis("local", chain);
 137   }
 138   timer.Print();
 139 }
 140
 141 void LoadLibraries()
 142 {
 143   gSystem->SetIncludePath("-I. -I$ROOTSYS/include -I$ALICE_ROOT/include -I$ALICE_ROOT -I$ALICE_ROOT/ITS -I$ALICE_ROOT/TRD -I$ALICE_ROOT/PWGPP -I$ALICE_ROOT/PWGPP/TRD");
 144   gSystem->Load("libANALYSIS");
 145   gSystem->Load("libANALYSISalice");
 146   gSystem->Load("libCORRFW");
 147   gSystem->Load("libTENDER");
 148   gSystem->Load("libPWGPP.so");
 149   gSystem->Load("libAliHLTTrigger.so");
 150
 151   if (doEMCAL || doPHOS || doCALO) {
 152      gSystem->Load("libEMCALUtils");
 153      gSystem->Load("libPHOSUtils");
 154      gSystem->Load("libPWGCaloTrackCorrBase");
 155      gSystem->Load("libPWGGACaloTrackCorrelations");
 156      gSystem->Load("libPWGGACaloTasks");
 157      gSystem->Load("libPWGGAPHOSTasks");
 158      gSystem->Load("libPWGEMCAL");
 159      gSystem->Load("libPWGGAEMCALTasks");
 160   }
 161   if(doMUON || doMUONTrig) {
 162      gSystem->Load("libPWGmuon");
 163      gSystem->Load("libPWGPPMUONlite");
 164      gSystem->Load("libPWGmuondep");
 165   }
 166   if (doFMD) {
 167      gSystem->Load("libPWGLFforward2");
 168   }
 169 }
 170
 171 void AddAnalysisTasks(const char *suffix, const char *cdb_location)
 172 {
 173   TString ss(suffix);
 174   ss.ToLower();
 175   Bool_t ibarrel = (ss.Contains("barrel"))?kTRUE:kFALSE;
 176   Bool_t iall = ss.IsNull();
 177   AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 178   mgr->SetCommonFileName(Form("QAresults%s.root",suffix));
 179   // Statistics task
 180   mgr->AddStatisticsTask(kTriggerMask);
 181   //
 182   // CDB connection
 183   //
 184   if (doCDBconnect) {
 185     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/PilotTrain/AddTaskCDBconnect.C");
 186     AliTaskCDBconnect *taskCDB = AddTaskCDBconnect();
 187     if (!taskCDB) return;
 188     AliCDBManager *cdb = AliCDBManager::Instance();
 189     cdb->SetDefaultStorage(cdb_location);
 190     taskCDB->SetRunNumber(run_number);
 191   }
 192
 193   //
 194   // Event Statistics (Jan Fiete)
 195   //
 196   if (doEventStat) {
 197       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPhysicsSelection.C");
 198       AliPhysicsSelectionTask* physSelTask = AddTaskPhysicsSelection(kFALSE /*MC*/);
 199       AliAnalysisDataContainer *cstatsout = (AliAnalysisDataContainer*)mgr->GetOutputs()->FindObject("cstatsout");
 200       cstatsout->SetFileName(Form("EventStat_temp%s.root", suffix));
 201   }
 202
 203   //
 204   // Centrality (A. Toia)
 205   //
 206   if (doCentrality) {
 207 //     if (!iCollisionType) {
 208 //        printf("Disabling centrality task for p-p\n");
 209 //        doCentrality = kFALSE;
 210 //     } else {
 211         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskCentrality.C");
 212         AliCentralitySelectionTask *taskCentrality = AddTaskCentrality();
 213       AliAnalysisDataContainer *centralityout = (AliAnalysisDataContainer*)mgr->GetOutputs()->FindObject("CentralityStat");
 214       centralityout->SetFileName(Form("EventStat_temp%s.root", suffix));
 215 //     }
 216   }
 217
 218   // Vertexing (A. Dainese)
 219   //
 220   if (doVertex && (ibarrel || iall)) {
 221     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/macros/AddTaskVertexESD.C");
 222     AliAnalysisTaskVertexESD* taskvertexesd =  AddTaskVertexESD(kFALSE, kTriggerMask);
 223     taskvertexesd->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 224   }
 225
 226   // TPC QA (E. Sicking)
 227   //
 228   if (doQAsym && (ibarrel || iall)) {
 229   // offline trigger in AddTask
 230     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/PilotTrain/AddTaskQAsym.C");
 231     AliAnalysisTaskSE * taskqasim = AddTaskQAsym(0, kTriggerMask, kTriggerHM, kTriggerEMC, kTriggerMuonBarrel);
 232   }
 233   //
 234   // VZERO QA  (C. Cheshkov)
 235   //
 236   if (doVZERO && (ibarrel || iall)) {
 237     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/PilotTrain/AddTaskVZEROQA.C");
 238     AliAnalysisTaskSE * taskv0qa = AddTaskVZEROQA(0);
 239 //  taskv0qa->SelectCollisionCandidates();
 240     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/PilotTrain/AddTaskVZEROQATrig.C");
 241     AliAnaVZEROQA *taskv0qatrig = AddTaskVZEROQATrig(0);
 242     taskv0qatrig->SelectCollisionCandidates(AliVEvent::kINT8);
 243
 244   }
 245   if (doVZEROPbPb && iCollisionType==1) {
 246     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/VZERO/AddTaskVZEROPbPb.C");
 247     AliAnaVZEROPbPb* taskV0PbPb = (AliAnaVZEROPbPb*)AddTaskVZEROPbPb(0);
 248 //    taskV0PbPb->SetClassesNames("CTRUE-,C0HWU-,CPBI2WU_B1-,CPBI2_B1-,CPBI1WU-,CPBI1-,CVHNWU-,CVHN-,CVLNWU-,CVLN-");
 249 //    taskV0PbPb->SetClassesNames("CTRUE-,C0HWU-,CPBI2WU,CPBI2,CPBI1WU-,CPBI1-,CVHNWU,CVHN,CVLNWU,CVLN");
 250 //    taskV0PbPb->SetClassesNames("CTRUE-,C0HWU-,CPBI2WU-,CPBI2-,CPBI2WU_B1-,CPBI2_B1-,CPBI1WU-,CPBI1-,CVHNWU-,CVHN-,CVHN_R2-,CVHNWU_R2-,CVLNWU-,CVLN-,CVLN_B2-,CVLNWU_B2-");
 251 //    taskV0PbPb->SetClassesNames("CTRUE-,C0HWU-,CPBI2WU-,CPBI2-,CPBI2WU_B1-,CPBI2_B1-,CPBI1WU-,CPBI1-,CVHNWU-,CVHN-,CVHN_R2-,CVHNWU_R2-,CVLNWU-,CVLN-,CVLN_R1-,CVLN_B2-,CVLNWU_R1-,CVLNWU_B2-");
 252     taskV0PbPb->SetClassesNames("CTRUE-,C0HWU-,CPBI2WU-,CPBI2-,CPBI2WU_B1-,CPBI2_B1-,CPBI1WU-,CPBI1-,CVHNWU-,CVHN-,CVHN_R2-,CVHNWU_R2-,CVLNWU-,CVLN-,CVLN_R1-,CVLN_B2-,CVLNWU_R1-,CVLNWU_B2-,CSEMI_R1-,CSEMIWU_R1-,CCENT_R2-,CCENTWU_R2-");
 253   }
 254   //
 255   // TPC (Jacek Otwinowski & Michael Knichel)
 256   //
 257   //
 258   // Optionally MC information can be used by setting the 1st argument to true
 259   // Optionally friends information can be switched off by setting the 2st argument
 260   // to false
 261   // Optionally highMult axis can be used by setting the 3st argument to true (for PbPb)
 262   if (doTPC && (ibarrel || iall)) {
 263     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/TPC/macros/AddTaskPerformanceTPCdEdxQA.C");
 264     AliPerformanceTask *tpcQA = 0;
 265     if (iCollisionType) {
 266        // High multiplicity Pb-Pb
 267        tpcQA = AddTaskPerformanceTPCdEdxQA(kFALSE, kTRUE, kTRUE);
 268     } else {
 269       // Low multiplicity (pp)
 270        tpcQA = AddTaskPerformanceTPCdEdxQA(kFALSE, kTRUE, kFALSE);
 271     }
 272     tpcQA->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 273   }
 274
 275   // HLT (Alberica Toia)
 276   if (doHLT && (ibarrel || iall)) {
 277     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/TPC/macros/AddTaskPerformanceTPCdEdxQA.C");
 278     AliPerformanceTask *hltQA = AddTaskPerformanceTPCdEdxQA(kFALSE, kTRUE, kFALSE,0,kTRUE);
 279     hltQA->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 280   }
 281   //
 282   // SPD (A. Mastroserio)
 283   //
 284   if (doSPD && (ibarrel || iall)) {
 285     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/PilotTrain/AddTaskSPDQA.C");
 286     AliAnalysisTaskSPD* taskspdqa = (AliAnalysisTaskSPD*)AddTaskSPDQA();
 287     // Request from Annalisa
 288     if (iCollisionType) taskspdqa->SetHeavyIonMode();
 289     taskspdqa->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 290     taskspdqa->SetOCDBInfo(run_number, cdb_location);
 291   }
 292   //
 293   // SDD (F. Prino)
 294   //
 295   if (doSDD && (ibarrel || iall)) {
 296     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/PilotTrain/AddSDDPoints.C");
 297     AliAnalysisTaskSE* tasksdd = AddSDDPoints();
 298     tasksdd->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 299   }
 300   //
 301   // SSD dEdx (Marek Chojnacki)
 302   //
 303   if (doSSDdEdx && (ibarrel || iall)) {
 304     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/PilotTrain/AddTaskdEdxSSDQA.C");
 305     AliAnalysisTaskSE* taskssddedx = AddTaskdEdxSSDQA();
 306     taskssddedx->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 307   }
 308
 309   //
 310   // ITS
 311   //
 312   if (doITS && (ibarrel || iall)) {
 313   // hardcoded non-zero trigger mask
 314       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/macros/AddTaskPerformanceITS.C");
 315       AliAnalysisTaskITSTrackingCheck *itsQA = 0;
 316       AliAnalysisTaskITSTrackingCheck *itsQACent0010 = 0;
 317       AliAnalysisTaskITSTrackingCheck *itsQACent3050 = 0;
 318       AliAnalysisTaskITSTrackingCheck *itsQACent6080 = 0;
 319       if(iCollisionType==0) {
 320         itsQA = AddTaskPerformanceITS(kFALSE);
 321       } else {
 322         itsQA = AddTaskPerformanceITS(kFALSE);
 323         itsQACent0010 = AddTaskPerformanceITS(kFALSE,kFALSE,kFALSE,3500,10000);
 324         itsQACent3050 = AddTaskPerformanceITS(kFALSE,kFALSE,kFALSE,590,1570);
 325         itsQACent6080 = AddTaskPerformanceITS(kFALSE,kFALSE,kFALSE,70,310);
 326       }
 327   }
 328   //
 329   // ITS saTracks, align (F.Prino)
 330   //
 331   if (doITSsaTracks && (ibarrel || iall)) {
 332   // offline trigger in AddTask
 333      gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/macros/AddTaskITSsaTracks.C");
 334      AliAnalysisTaskITSsaTracks *itssaTracks = AddTaskITSsaTracks(kFALSE,kFALSE);
 335      itssaTracks->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 336   }
 337   if (doITSalign && (ibarrel || iall)) {
 338   // no offline trigger selection
 339      gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/macros/AddTaskITSAlign.C");
 340      AliAnalysisTaskITSAlignQA *itsAlign = AddTaskITSAlign(0,2012);
 341   }
 342   //
 343   // TRD (Alex Bercuci, M. Fasel)
 344   //
 345   if(doTRD && (ibarrel || iall)) {
 346   // no offline trigger selection
 347       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/macros/AddTrainPerformanceTRD.C");
 348       // steer individual TRD tasks
 349       Bool_t
 350       doCheckESD(kTRUE),  // AliTRDcheckESD
 351       doCheckDET(kTRUE),  // AliTRDcheckDET
 352       doEffic(kTRUE),     // AliTRDefficiency
 353       doResolution(kTRUE),// AliTRDresolution
 354       doCheckPID(kTRUE),  // AliTRDcheckPID
 355       doV0Monitor(kFALSE);// AliTRDv0Monitor
 356       AddTrainPerformanceTRD(Translate(doCheckESD, doCheckDET, doEffic, doResolution, doCheckPID, doV0Monitor));
 357   }
 358
 359   //
 360   // ZDC (Chiara Oppedisano)
 361   //
 362   if(doZDC && (ibarrel || iall)) {
 363   // hardcoded kMB trigger mask
 364      gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/ZDC/AddTaskZDCQA.C");
 365      AliAnalysisTaskSE *taskZDC = AddTaskZDCQA();
 366      taskZDC->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 367   }
 368   //
 369   // Calorimetry (Gustavo Conesa)
 370   //
 371
 372   if(doCALO) {
 373   // - In case of MC analysis, it skips the triggered events wagon (given that
 374   //the normal wagon is always suffixed as "default")
 375   //- No need to pass the type of data
 376   //- No need to specify the year. In principle the year is only needed when
 377   //setting the size of some histograms (change in number of SM along the years),
 378   //I do not know how to access automatically the run number when the histograms
 379   // are created in the UserCreateOutput. By default I set them to the maximum
 380   //expected size, but I still let the possibility to check the year.
 381
 382   //So the way to initialize the task in trunk is now
 383
 384   //AddTaskCalorimeterQA(Bool_t kSimulation = kFALSE,
 385                                    //  const char *suffix="default",
 386                                    // TString outputFile = "",
 387                                    //  Int_t year = 2012,
 388                                    //  Bool_t kPrintSettings = kFALSE)
 389
 390   //So, in principle only the first 2 need to be specified.
 391
 392
 393       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGGA/CaloTrackCorrelations/macros/QA/AddTaskCalorimeterQA.C");
 394       AliAnalysisTaskCaloTrackCorrelation *taskCaloQA = AddTaskCalorimeterQA(kFALSE, "default");
 395       taskCaloQA->SetDebugLevel(0);
 396       // offline mask set in AddTask to kMB
 397       taskCaloQA->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 398       // Add a new calo task with EMC1 trigger only
 399       taskCaloQA = AddTaskCalorimeterQA(kFALSE, "trigEMC");
 400       taskCaloQA->SetDebugLevel(0);
 401       taskCaloQA->SelectCollisionCandidates(kTriggerEMC);
 402   }
 403
 404   //
 405   // Muon Trigger
 406   //
 407
 408   if(doMUONTrig) {
 409   // no offline trigger selection
 410       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/macros/AddTaskMTRchamberEfficiency.C");
 411       AliAnalysisTaskTrigChEff *taskMuonTrig = AddTaskMTRchamberEfficiency();
 412       taskMuonTrig->GetMuonTrackCuts()->SetCustomParamFromRun(160000,2);
 413   }
 414
 415   //
 416   // Impact parameter resolution (xianbao.yuan@pd.infn.it, andrea.dainese@pd.infn.it)
 417   //
 418   if (doImpParRes && (ibarrel || iall)) {
 419     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/macros/AddTaskImpParRes.C");
 420     AliAnalysisTaskSE* taskimpparres=0;
 421     if(iCollisionType==0) {
 422        taskimpparres= AddTaskImpParRes();
 423     } else {
 424        taskimpparres= AddTaskImpParRes(kFALSE,-1,kFALSE,kFALSE);
 425     }
 426     taskimpparres->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 427   }
 428   //
 429   // MUON QA (Philippe Pillot)
 430   //
 431   if (doMUON) {
 432   // trigger analysis internal
 433     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/PilotTrain/AddTaskMuonQA.C");
 434     AliAnalysisTaskMuonQA* taskmuonqa= AddTaskMuonQA();
 435     taskmuonqa->GetTrackCuts()->SetCustomParamFromRun(160000,2);
 436   }
 437   //
 438   // TOF (Francesca Bellini)
 439   //
 440   if (doTOF && (ibarrel || iall)) {
 441     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/TOF/AddTaskTOFQA.C");
 442     AliAnalysisTaskTOFqa *tofQA = AddTaskTOFQA();
 443     tofQA->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 444   }
 445    //
 446   // PIDResponse(JENS)
 447   //
 448   if (doPIDResponse && (ibarrel || iall)) {
 449     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPIDResponse.C");
 450     AliAnalysisTaskPIDResponse *PIDResponse = AddTaskPIDResponse();
 451     PIDResponse->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 452   }
 453
 454   //
 455   // PIDqa(JENS)
 456   //
 457   if (doPIDqa && (ibarrel || iall)) {
 458     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPIDqa.C");
 459     AliAnalysisTaskPIDqa *PIDQA = AddTaskPIDqa();
 460     PIDQA->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 461   }
 462
 463   //
 464   // HMPID QA (Giacomo Volpe)
 465   //
 466   if (doHMPID && (ibarrel || iall)) {
 467     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/HMPID/AddTaskHmpidQA.C");
 468     AliAnalysisTaskSE* taskhmpidqa= AddTaskHmpidQA(kFALSE);
 469       // offline mask set in AddTask to kMB
 470     taskhmpidqa->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 471   }
 472
 473
 474   // T0 QA (Alla Mayevskaya)
 475   if (doT0 && (ibarrel || iall)) {
 476   // no offline trigger selection
 477     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/T0/AddTaskT0QA.C");
 478     AliT0AnalysisTaskQA* taskt0qa= AddTaskT0QA();
 479     taskt0qa->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 480   }
 481   // FMD QA (Christian Holm Christiansen)
 482   if (doFMD && (ibarrel || iall)) {
 483     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGLF/FORWARD/analysis2/AddTaskForwardQA.C");
 484     // Parameters: usemc, usecentrality
 485     AliForwardQATask *forwardQA = (AliAnalysisTaskSE *)AddTaskForwardQA(kFALSE, kFALSE);
 486     forwardQA->SetDebug(0);
 487     // No offline trigger config. needed (see #84077)
 488   }
 489    //
 490   // PHOS QA (Boris Polishchuk)
 491   //
 492   if (doPHOS) {
 493     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGGA/PHOSTasks/CaloCellQA/macros/AddTaskCaloCellsQA.C");
 494     AliAnalysisTaskCaloCellsQA *taskPHOSCellQA1 = AddTaskCaloCellsQA(4, 1, NULL,"PHOSCellsQA_AnyInt");
 495     taskPHOSCellQA1->SelectCollisionCandidates(kTriggerMask);
 496     taskPHOSCellQA1->GetCaloCellsQA()->SetClusterEnergyCuts(0.3,0.3,1.0);
 497     AliAnalysisTaskCaloCellsQA *taskPHOSCellQA2 = AddTaskCaloCellsQA(4, 1, NULL,"PHOSCellsQA_PHI7");
 498     taskPHOSCellQA2->SelectCollisionCandidates(AliVEvent::kPHI7);
 499     taskPHOSCellQA2->GetCaloCellsQA()->SetClusterEnergyCuts(0.3,0.3,1.0);
 500     // Pi0 QA fo PbPb
 501     if (iCollisionType) {
 502       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGGA/PHOSTasks/PHOS_PbPbQA/macros/AddTaskPHOSPbPb.C");
 503       AliAnalysisTaskPHOSPbPbQA* phosPbPb = AddTaskPHOSPbPbQA(0);
 504     }
 505   }
 506   if (doPHOSTrig) {
 507      gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGGA/PHOSTasks/PHOS_TriggerQA/macros/AddTaskPHOSTriggerQA.C");
 508      AliAnalysisTaskPHOSTriggerQA *taskPHOSTrig = AddTaskPHOSTriggerQA(NULL);
 509   }
 510   //
 511   // EMCAL QA (Gustavo Conesa)
 512   //
 513   if (doEMCAL) {
 514      gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGGA/EMCALTasks/macros/AddTaskEMCALTriggerQA.C");
 515      AliAnalysisTaskEMCALTriggerQA *emctrig = AddTaskEMCALTriggerQA();
 516 //     emctrig->GetRecoUtils()->SwitchOffBadChannelsRemoval();
 517   }
 518   //
 519   // FLOW and BF QA (C.Perez && A.Rodriguez)
 520   //
 521   if (doFBFqa && (ibarrel || iall)) {
 522     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGPP/macros/AddTaskFBFqa.C");
 523     AliAnalysisTaskSE *qaFBFMB = (AliAnalysisTaskSE*) AddTaskFBFqa("qaFBFmb",kFALSE);
 524     qaFBFMB->SelectCollisionCandidates(AliVEvent::kMB);
 525     AliAnalysisTaskSE *qaFBFSC = (AliAnalysisTaskSE*) AddTaskFBFqa("qaFBFsc",kFALSE);
 526     qaFBFSC->SelectCollisionCandidates(AliVEvent::kSemiCentral);
 527     AliAnalysisTaskSE *qaFBFCE = (AliAnalysisTaskSE*) AddTaskFBFqa("qaFBFce",kFALSE);
 528     qaFBFCE->SelectCollisionCandidates(AliVEvent::kCentral);
 529   }
 530 }
 531
 532 void QAmerge(const char *suffix, const char *dir, Int_t stage)
 533 {
 534 // Merging method
 535   TStopwatch timer;
 536   timer.Start();
 537   TString outputDir = dir;
 538   TString outputFiles = Form("QAresults%s.root,EventStat_temp%s.root,RecoQAresults%s.root",suffix,suffix,suffix);
 539   TString mergeExcludes = "";
 540   TObjArray *list = outputFiles.Tokenize(",");
 541   TIter *iter = new TIter(list);
 542   TObjString *str;
 543   TString outputFile;
 544   Bool_t merged = kTRUE;
 545   while((str=(TObjString*)iter->Next())) {
 546     outputFile = str->GetString();
 547     // Skip already merged outputs
 548     if (!gSystem->AccessPathName(outputFile)) {
 549        printf("Output file <%s> found. Not merging again.",outputFile.Data());
 550        continue;
 551     }
 552     if (mergeExcludes.Contains(outputFile.Data())) continue;
 553     merged = AliAnalysisAlien::MergeOutput(outputFile, outputDir, 10, stage);
 554     if (!merged && !outputFile.Contains("RecoQAresults")) {
 555        printf("ERROR: Cannot merge %s\n", outputFile.Data());
 556        continue;
 557     }
 558   }
 559   // read the analysis manager from file
 560   TString infolog = "fileinfo.log";
 561   AliAnalysisAlien::MergeInfo(infolog, dir);
 562   if (!outputDir.Contains("Stage")) {
 563     ofstream out;
 564     out.open("outputs_valid", ios::out);
 565     out.close();
 566     return;
 567   }
 568   AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 569   mgr->SetRunFromPath(mgr->GetRunFromAlienPath(dir));
 570   mgr->SetSkipTerminate(kFALSE);
 571   if (!mgr->InitAnalysis()) return;
 572   mgr->PrintStatus();
 573   AliLog::SetGlobalLogLevel(AliLog::kError);
 574   TTree *tree = NULL;
 575   gROOT->cd();
 576   mgr->StartAnalysis("gridterminate", tree);
 577   if (strlen(suffix)) {
 578      if (gSystem->Exec(Form("mv trending.root trending%s.root", suffix)))
 579         ::Error("QAmerge", "File trending.root was not produced");
 580      if (gSystem->Exec(Form("mv event_stat.root event_stat%s.root", suffix)))
 581         ::Error("QAmerge", "File trending.root was not produced");
 582   }
 583   ofstream out;
 584   out.open("outputs_valid", ios::out);
 585   out.close();
 586   timer.Print();
 587 }