EMCAL/AliCaloRawAnalyzer.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * This file is property of and copyright by                              *
   3  * the Relativistic Heavy Ion Group (RHIG), Yale University, US, 2009     *
   4  *                                                                        *
   5  * Primary Author: Per Thomas Hille <perthomas.hille@yale.edu>            *
   6  *                                                                        *
   7  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   8  * Please report bugs to p.t.hille@fys.uio.no                             *
   9  *                                                                        *
  10  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
  11  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
  12  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  13  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  14  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  15  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  16  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  17  **************************************************************************/
  18
  19
  20 // Base class for extraction
  21 // of signal amplitude and peak position
  22 // From CALO Calorimeter RAW data (from the RCU)
  23 // Contains some utilities for preparing / selecting
  24 // Signals suitable for signal extraction
  25 // By derived classes
  26
  27 #include "AliLog.h"
  28 #include "AliCaloRawAnalyzer.h"
  29 #include "AliCaloBunchInfo.h"
  30 #include "AliCaloFitResults.h"
  31 #include "TMath.h"
  32 #include <iostream>
  33 using namespace std;
  34
  35 ClassImp(AliCaloRawAnalyzer)
  36
  37 AliCaloRawAnalyzer::AliCaloRawAnalyzer(const char *name) :  TObject(),
  38                                                             fMinTimeIndex(-1),
  39                                                             fMaxTimeIndex(-1),
  40                                                             fFitArrayCut(5),
  41                                                             fAmpCut(4),
  42                                                             fNsampleCut(5),
  43                                                             fIsZerosupressed( false ),
  44                                                             fVerbose( false )
  45 {
  46   //Comment
  47   sprintf(fName, "%s", name);
  48   for(int i=0; i < MAXSAMPLES; i++ )
  49     {
  50       fReversed[i] = 0;
  51     }
  52 }
  53
  54 AliCaloRawAnalyzer::~AliCaloRawAnalyzer()
  55 {
  56
  57 }
  58
  59
  60 void
  61 AliCaloRawAnalyzer::SetTimeConstraint(const int min, const int max )
  62 {
  63   //Require that the bin if the maximum ADC value is between min and max (timebin)
  64   if(  ( min > max ) || min > MAXSAMPLES  || max > MAXSAMPLES  )
  65     {
  66       AliWarning( Form( "Attempt to set Invalid time bin range (Min , Max) = (%d, %d), Ingored",  min, max ) );
  67     }
  68   else
  69     {
  70       fMinTimeIndex  = min;
  71       fMaxTimeIndex  = max;
  72     }
  73 }
  74
  75
  76 UShort_t
  77 AliCaloRawAnalyzer::Max(const UShort_t *data, const int length ) const
  78 {
  79   //------------
  80   UShort_t tmpmax  = data[0];
  81
  82   for(int i=0; i < length; i++)
  83     {
  84       if( tmpmax  <  data[i] )
  85         {
  86           tmpmax = data[i];
  87         }
  88     }
  89   return tmpmax;
  90 }
  91
  92
  93 void
  94 AliCaloRawAnalyzer::SelectSubarray( const Double_t *fData, const int length, const short maxindex, int *const first,  int *const last ) const
  95 {
  96   //Selection of subset of data from one bunch that will be used for fitting or
  97   //Peak finding.  Go to the left and right of index of the maximum time bin
  98   //Untile the ADC value is less that fFitArrayCut
  99   int tmpfirst =  maxindex;
 100   int tmplast  =  maxindex;
 101
 102   while((  tmpfirst  ) > 0  &&  ( fData[tmpfirst] >  fFitArrayCut   ))
 103     {
 104       tmpfirst -- ;
 105     }
 106
 107   while(( tmplast ) <  length   && ( fData [tmplast] >  fFitArrayCut ))
 108     {
 109       tmplast ++;
 110     }
 111
 112   *first = tmpfirst +1;
 113   *last =  tmplast -1;
 114 }
 115
 116
 117
 118 Float_t
 119 AliCaloRawAnalyzer::ReverseAndSubtractPed( const AliCaloBunchInfo *bunch, const UInt_t /*altrocfg1*/,  const UInt_t /*altrocfg2*/, double *outarray ) const
 120 {
 121   //Time sample comes in reversed order, revers them back
 122   //Subtract the baseline based on content of altrocfg1 and altrocfg2.
 123   Int_t length =  bunch->GetLength();
 124   const UShort_t *sig = bunch->GetData();
 125
 126   double ped = EvaluatePedestal( sig , length);
 127
 128   for( int i=0; i < length; i++ )
 129     {
 130       outarray[i] = sig[length -i -1] - ped;
 131     }
 132
 133   return ped;
 134 }
 135
 136
 137
 138 Float_t
 139 AliCaloRawAnalyzer::EvaluatePedestal(const UShort_t * const data, const int /*length*/ ) const
 140 {
 141   //  double ped = 0;
 142   double tmp = 0;
 143
 144   if( fIsZerosupressed == false )
 145     {
 146       for(int i=0; i < 5; i++ )
 147         {
 148           tmp += data[i];
 149         }
 150     }
 151
 152   //  cout << __FILE__ << __LINE__ << "XXXXXXXXXXX returning " <<   tmp/5 << endl;
 153
 154   return  tmp/5;
 155 }
 156
 157
 158 short
 159 AliCaloRawAnalyzer::Max( const AliCaloBunchInfo *const bunch , int *const maxindex ) const
 160 {
 161   //comment
 162   short tmpmax = -1;
 163   int tmpindex = -1;
 164   const UShort_t *sig = bunch->GetData();
 165
 166   for(int i=0; i < bunch->GetLength(); i++ )
 167     {
 168       if( sig[i] > tmpmax )
 169         {
 170           tmpmax   =  sig[i];
 171           tmpindex =  i;
 172         }
 173     }
 174
 175   if(maxindex != 0 )
 176     {
 177       *maxindex =  bunch->GetLength() -1 - tmpindex + bunch->GetStartBin();
 178     }
 179
 180   return  tmpmax;
 181 }
 182
 183
 184 int
 185 AliCaloRawAnalyzer::SelectBunch( const vector<AliCaloBunchInfo> &bunchvector,short *const maxampbin, short *const maxamplitude ) const
 186 {
 187   //We select the bunch with the highest amplitude unless any time constraints is set
 188   short max = -1;
 189   short bunchindex = -1;
 190   short maxall = -1;
 191   int indx = -1;
 192
 193   for(unsigned int i=0; i < bunchvector.size(); i++ )
 194     {
 195       max = Max(  &bunchvector.at(i), &indx );
 196       if( IsInTimeRange( indx) )
 197         {
 198           if( max > maxall )
 199             {
 200               maxall = max;
 201               bunchindex = i;
 202             }
 203         }
 204     }
 205
 206   *maxampbin     = indx;
 207   *maxamplitude  = max;
 208   return  bunchindex;
 209 }
 210
 211
 212 bool
 213 AliCaloRawAnalyzer::IsInTimeRange( const int maxindex  ) const
 214 {
 215   // Ckeck if the index of the max ADC vaue is consistent with trigger.
 216   if( ( fMinTimeIndex  < 0 && fMaxTimeIndex  < 0) ||fMaxTimeIndex  < 0 )
 217     {
 218       return true;
 219     }
 220   return ( maxindex < fMaxTimeIndex ) && ( maxindex > fMinTimeIndex  ) ? true : false;
 221 }
 222
 223
 224 void
 225 AliCaloRawAnalyzer::PrintBunches( const vector<AliCaloBunchInfo> &bvctr ) const
 226 {
 227   //comment
 228   cout << __FILE__ << __LINE__<< "*************** Printing Bunches *******************" << endl;
 229   cout << __FILE__ << __LINE__<< "*** There are " << bvctr.size() << ", bunches" << endl;
 230
 231   for(unsigned int i=0; i < bvctr.size() ; i++ )
 232     {
 233       PrintBunch( bvctr.at(i) );
 234       cout << " bunch = "  <<  i  << endl;
 235     }
 236   cout << __FILE__ << __LINE__<< "*************** Done ... *******************" << endl;
 237 }
 238
 239
 240 void
 241 AliCaloRawAnalyzer::PrintBunch( const AliCaloBunchInfo &bunch ) const
 242 {
 243   //comment
 244   cout << __FILE__ << ":" << __LINE__ << endl;
 245   cout << __FILE__ << __LINE__   << ", startimebin = " << bunch.GetStartBin() << ", length =" <<  bunch.GetLength() << endl;
 246   const UShort_t *sig =  bunch.GetData();
 247
 248   for ( Int_t j = 0; j <  bunch.GetLength();  j++)
 249     {
 250       printf("%d\t", sig[j] );
 251     }
 252   cout << endl;
 253 }
 254
 255 AliCaloFitResults
 256 AliCaloRawAnalyzer::Evaluate( const vector<AliCaloBunchInfo>  &/*bunchvector*/, const UInt_t /*altrocfg1*/,  const UInt_t /*altrocfg2*/)
 257 { // method to do the selection of what should possibly be fitted
 258   // not implemented for base class
 259   return AliCaloFitResults( 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 );
 260 }
 261
 262 int
 263 AliCaloRawAnalyzer::PreFitEvaluateSamples( const vector<AliCaloBunchInfo>  &bunchvector, const UInt_t altrocfg1,  const UInt_t altrocfg2, Int_t & index, Float_t & maxf, short & maxamp, short & maxampindex, Float_t & ped, int & first, int & last)
 264 { // method to do the selection of what should possibly be fitted
 265   int nsamples  = 0;
 266   index = SelectBunch( bunchvector,  &maxampindex,  &maxamp ); // select the bunch with the highest amplitude unless any time constraints is set
 267
 268
 269   if( index >= 0 && maxamp > fAmpCut) // something valid was found, and non-zero amplitude
 270     {
 271       // use more convenient numbering and possibly subtract pedestal
 272       ped  = ReverseAndSubtractPed( &(bunchvector.at(index)),  altrocfg1, altrocfg2, fReversed  );
 273       maxf = TMath::MaxElement( bunchvector.at(index).GetLength(),  fReversed );
 274
 275       if ( maxf > fAmpCut ) // possibly significant signal
 276         {
 277           // select array around max to possibly be used in fit
 278           maxampindex -= bunchvector.at(index).GetStartBin(); // PTH - why isn't this index also reversed for call below?
 279           SelectSubarray( fReversed,  bunchvector.at(index).GetLength(),  maxampindex , &first, &last);
 280
 281           // sanity check: maximum should not be in first or last bin
 282           // if we should do a fit
 283           if (first!=maxampindex && last!=maxampindex) {
 284             // calculate how many samples we have
 285             nsamples =  last - first + 1;
 286           }
 287         }
 288     }
 289
 290   return nsamples;
 291 }
 292