EMCAL/AliEMCALClusterizerv1.cxx

   1
   2 /**************************************************************************
   3  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   4  *                                                                        *
   5  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   6  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   7  *                                                                        *
   8  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   9  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
  10  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  11  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  12  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  13  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  14  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  15  **************************************************************************/
  16
  17 /* $Id$ */
  18
  19 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
  20 //  August 2002 Yves Schutz: clone PHOS as closely as possible and intoduction
  21 //                           of new  IO (à la PHOS)
  22 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  23 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and
  24 //  unfolds the clusters having several local maxima.
  25 //  Results are stored in TreeR#, branches EMCALTowerRP (EMC recPoints),
  26 //  EMCALPreShoRP (CPV RecPoints) and AliEMCALClusterizer (Clusterizer with all
  27 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
  28 //  This TTask is normally called from Reconstructioner, but can as well be used in
  29 //  standalone mode.
  30 // Use Case:
  31 //  root [0] AliEMCALClusterizerv1 * cl = new AliEMCALClusterizerv1("galice.root")
  32 //  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  33 //               //reads gAlice from header file "..."
  34 //  root [1] cl->ExecuteTask()
  35 //               //finds RecPoints in all events stored in galice.root
  36 //  root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2")
  37 //               //sets another title for Digitis (input) branch
  38 //  root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")
  39 //               //sets another title four output branches
  40 //  root [4] cl->SetTowerLocalMaxCut(0.03)
  41 //               //set clusterization parameters
  42 //  root [5] cl->ExecuteTask("deb all time")
  43 //               //once more finds RecPoints options are
  44 //               // deb - print number of found rec points
  45 //               // deb all - print number of found RecPoints and some their characteristics
  46 //               // time - print benchmarking results
  47
  48 // --- ROOT system ---
  49
  50 #include "TROOT.h"
  51 #include "TFile.h"
  52 #include "TFolder.h"
  53 #include "TMath.h"
  54 #include "TMinuit.h"
  55 #include "TTree.h"
  56 #include "TSystem.h"
  57 #include "TBenchmark.h"
  58
  59 // --- Standard library ---
  60
  61
  62 // --- AliRoot header files ---
  63 #include "AliRunLoader.h"
  64 #include "AliRun.h"
  65 #include "AliEMCALLoader.h"
  66 #include "AliEMCALClusterizerv1.h"
  67 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  68 #include "AliEMCALDigit.h"
  69 #include "AliEMCALDigitizer.h"
  70 #include "AliEMCAL.h"
  71 #include "AliEMCALGeometry.h"
  72
  73 ClassImp(AliEMCALClusterizerv1)
  74
  75 Int_t addOn[20][60][60];
  76
  77 //____________________________________________________________________________
  78   AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1() : AliEMCALClusterizer()
  79 {
  80   // default ctor (to be used mainly by Streamer)
  81
  82   InitParameters() ;
  83   fDefaultInit = kTRUE ;
  84   for(Int_t is=0;is<20;is++){
  85     for(Int_t i=0;i<60;i++){
  86       for(Int_t j=0;j<60;j++){
  87         addOn[is][i][j]=0;
  88       }
  89     }
  90   }
  91 //PH   cout<<"file to read 1"<<endl;
  92   ReadFile();
  93 //PH   cout<<"file read 1"<<endl;
  94 }
  95
  96 //____________________________________________________________________________
  97 AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1(const TString alirunFileName, const TString eventFolderName)
  98 :AliEMCALClusterizer(alirunFileName, eventFolderName)
  99 {
 100   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
 101
 102   InitParameters() ;
 103   Init() ;
 104   fDefaultInit = kFALSE ;
 105   for(Int_t is=0;is<20;is++){
 106     for(Int_t i=0;i<60;i++){
 107       for(Int_t j=0;j<60;j++){
 108         addOn[is][i][j]=0;
 109       }
 110     }
 111   }
 112 //PH   cout<<"file to read 2"<<endl;
 113   ReadFile();
 114 //PH   cout<<"file read 2"<<endl;
 115
 116 }
 117
 118 //____________________________________________________________________________
 119   AliEMCALClusterizerv1::~AliEMCALClusterizerv1()
 120 {
 121   // dtor
 122
 123 }
 124
 125 //____________________________________________________________________________
 126 const TString AliEMCALClusterizerv1::BranchName() const
 127 {
 128    return GetName();
 129
 130 }
 131
 132 //____________________________________________________________________________
 133 Float_t  AliEMCALClusterizerv1::Calibrate(Int_t amp) const
 134 {
 135   //To be replased later by the method, reading individual parameters from the database
 136   return -fADCpedestalECA + amp * fADCchannelECA ;
 137 }
 138
 139 //____________________________________________________________________________
 140 void AliEMCALClusterizerv1::Exec(Option_t * option)
 141 {
 142   // Steering method to perform clusterization for events
 143   // in the range from fFirstEvent to fLastEvent.
 144   // This range is optionally set by SetEventRange().
 145   // if fLastEvent=-1 (by default), then process events until the end.
 146
 147   if(strstr(option,"tim"))
 148     gBenchmark->Start("EMCALClusterizer");
 149
 150   if(strstr(option,"print"))
 151     Print("") ;
 152
 153   //AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 154   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::GetRunLoader();
 155   AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(rl->GetDetectorLoader("EMCAL"));
 156
 157   if (fLastEvent == -1)
 158     fLastEvent = rl->GetNumberOfEvents() - 1;
 159   Int_t nEvents   = fLastEvent - fFirstEvent + 1;
 160
 161   Int_t ievent ;
 162   rl->LoadDigits("EMCAL");
 163   for (ievent = fFirstEvent; ievent <= fLastEvent; ievent++) {
 164     rl->GetEvent(ievent);
 165     GetCalibrationParameters() ;
 166
 167     fNumberOfECAClusters = 0;
 168
 169     MakeClusters() ;
 170
 171     if(fToUnfold)
 172       MakeUnfolding() ;
 173
 174     WriteRecPoints() ;
 175
 176     if(strstr(option,"deb"))
 177       PrintRecPoints(option) ;
 178
 179     //increment the total number of recpoints per run
 180     fRecPointsInRun += emcalLoader->RecPoints()->GetEntriesFast() ;
 181   }
 182
 183   Unload();
 184
 185   if(strstr(option,"tim")){
 186     gBenchmark->Stop("EMCALClusterizer");
 187     printf("Exec took %f seconds for Clusterizing %f seconds per event",
 188          gBenchmark->GetCpuTime("EMCALClusterizer"), gBenchmark->GetCpuTime("EMCALClusterizer")/nEvents ) ;
 189   }
 190
 191   SaveHists();
 192
 193 }
 194
 195 //____________________________________________________________________________
 196 Bool_t AliEMCALClusterizerv1::FindFit(AliEMCALRecPoint * emcRP, AliEMCALDigit ** maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
 197                                     Int_t nPar, Float_t * fitparameters) const
 198 {
 199   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima
 200   // The initial values for fitting procedure are set equal to the positions of local maxima.
 201   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3 electromagnetic showers
 202
 203   AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
 204   TClonesArray *digits = emcalLoader->Digits();
 205   /*
 206   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 207   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 208   */
 209
 210   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
 211   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
 212   gMinuit->SetFCN(AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;
 213                                          // To set the address of the minimization function
 214   TList * toMinuit = new TList();
 215   toMinuit->AddAt(emcRP,0) ;
 216   toMinuit->AddAt(digits,1) ;
 217
 218   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
 219
 220   // filling initial values for fit parameters
 221   AliEMCALDigit * digit ;
 222
 223   Int_t ierflg  = 0;
 224   Int_t index   = 0 ;
 225   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
 226
 227   Int_t iDigit ;
 228
 229   AliEMCALGeometry * geom = AliEMCALGeometry::GetInstance(); //gime->EMCALGeometry() ;
 230
 231   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
 232     digit = maxAt[iDigit];
 233
 234     Int_t relid[2] ;
 235     Float_t x = 0.;
 236     Float_t z = 0.;
 237     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 238     geom->PosInAlice(relid, x, z) ;
 239
 240     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
 241
 242     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 243     index++ ;
 244     if(ierflg != 0){
 245       Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : x = %f",  x ) ;
 246       return kFALSE;
 247     }
 248     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 249     index++ ;
 250     if(ierflg != 0){
 251        Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : z = %f", z) ;
 252       return kFALSE;
 253     }
 254     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
 255     index++ ;
 256     if(ierflg != 0){
 257      Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : energy = %f", energy) ;
 258       return kFALSE;
 259     }
 260   }
 261
 262   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ; The number of function call slightly
 263                       //  depends on it.
 264   Double_t p1 = 1.0 ;
 265   Double_t p2 = 0.0 ;
 266
 267   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls
 268   gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient
 269   gMinuit->SetMaxIterations(5);
 270   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
 271
 272   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize
 273
 274   if(ierflg == 4){  // Minimum not found
 275     Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Fit not converged, cluster abandoned " ) ;
 276     return kFALSE ;
 277   }
 278   for(index = 0; index < nPar; index++){
 279     Double_t err ;
 280     Double_t val ;
 281     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
 282     fitparameters[index] = val ;
 283    }
 284
 285   delete toMinuit ;
 286   return kTRUE;
 287
 288 }
 289
 290 //____________________________________________________________________________
 291 void AliEMCALClusterizerv1::GetCalibrationParameters()
 292 {
 293   // Gets the parameters for the calibration from the digitizer
 294   //AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 295   AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
 296
 297   if ( !emcalLoader->Digitizer() )
 298     emcalLoader->LoadDigitizer();
 299   AliEMCALDigitizer * dig = dynamic_cast<AliEMCALDigitizer*>(emcalLoader->Digitizer());
 300
 301   fADCchannelECA   = dig->GetECAchannel() ;
 302   fADCpedestalECA  = dig->GetECApedestal();
 303 //PH  cout<<"ChannelECA, peds "<<fADCchannelECA<<" "<<fADCpedestalECA<<endl;
 304 }
 305
 306 //____________________________________________________________________________
 307 void AliEMCALClusterizerv1::Init()
 308 {
 309   // Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
 310   // Attach the Clusterizer task to the list of EMCAL tasks
 311
 312   //AliEMCALGeometry * geom = AliEMCALGeometry::GetInstance() ;
 313   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::GetRunLoader();
 314   AliEMCALGeometry *geom = dynamic_cast<AliEMCAL*>(rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))->GetGeometry();
 315   AliInfo(Form("geom 0x%x",geom));
 316
 317 //Sub  fNTowers = geom->GetNZ() *  geom->GetNPhi() ;
 318   fNTowers =400;
 319   if(!gMinuit)
 320     gMinuit = new TMinuit(100) ;
 321  //Sub if ( !gime->Clusterizer() )
 322  //Sub   gime->PostClusterizer(this);
 323  BookHists();
 324 }
 325
 326 //____________________________________________________________________________
 327 void AliEMCALClusterizerv1::InitParameters()
 328 {
 329   // Initializes the parameters for the Clusterizer
 330   fNumberOfECAClusters = 0;
 331
 332   fECAClusteringThreshold   = 0.5;  // value obtained from Alexei
 333   fECALocMaxCut = 0.03;
 334
 335   fECAW0     = 4.5 ;
 336   fTimeGate = 1.e-8 ;
 337   fToUnfold = kFALSE ;
 338   fRecPointsInRun  = 0 ;
 339   fMinECut = 0.3;
 340 }
 341
 342 //____________________________________________________________________________
 343 Int_t AliEMCALClusterizerv1::AreNeighbours(AliEMCALDigit * d1, AliEMCALDigit * d2)const
 344 {
 345   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour but continue searching
 346   //                                       = 1 are neighbour
 347   //                                       = 2 are not neighbour but do not continue searching
 348   // neighbours are defined as digits having at least a common vertex
 349   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster
 350   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster
 351
 352   //AliEMCALGeometry * geom = AliEMCALGetter::Instance()->EMCALGeometry() ;
 353    AliEMCALGeometry * geom = AliEMCALGeometry::GetInstance() ;
 354
 355   Int_t rv = 0 ;
 356
 357   Int_t relid1[2] ;
 358  //Sub geom->AbsToRelNumbering(d1->GetId(), relid1) ;
 359     Int_t nSupMod=0;
 360     Int_t nTower=0;
 361     Int_t nIphi=0;
 362     Int_t nIeta=0;
 363     Int_t iphi=0;
 364     Int_t ieta=0;
 365    geom->GetCellIndex(d1->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
 366    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nTower,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 367    relid1[0]=ieta;
 368    relid1[1]=iphi;
 369
 370
 371     Int_t nSupMod1=0;
 372     Int_t nTower1=0;
 373     Int_t nIphi1=0;
 374     Int_t nIeta1=0;
 375     Int_t iphi1=0;
 376     Int_t ieta1=0;
 377    geom->GetCellIndex(d2->GetId(), nSupMod1,nTower1,nIphi1,nIeta1);
 378    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1, nTower1,nIphi1,nIeta1, iphi1,ieta1);
 379    Int_t relid2[2] ;
 380    relid2[0]=ieta1;
 381    relid2[1]=iphi1;
 382
 383   //Sub  geom->AbsToRelNumbering(d2->GetId(), relid2) ;
 384
 385
 386   Int_t rowdiff = TMath::Abs( relid1[0] - relid2[0] ) ;
 387   Int_t coldiff = TMath::Abs( relid1[1] - relid2[1] ) ;
 388
 389   if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 )){
 390       rv = 1 ;
 391   }
 392   else {
 393     if((relid2[0] > relid1[0]) && (relid2[1] > relid1[1]+1))
 394       rv = 2; //  Difference in row numbers is too large to look further
 395   }
 396
 397   if (gDebug == 2 )
 398 if(rv==1)printf("AreNeighbours: neighbours=%d, id1=%d, relid1=%d,%d \n id2=%d, relid2=%d,%d \n",
 399          rv, d1->GetId(), relid1[0], relid1[1],
 400          d2->GetId(), relid2[0], relid2[1]) ;
 401
 402   return rv ;
 403 }
 404
 405 //____________________________________________________________________________
 406 void AliEMCALClusterizerv1::Unload()
 407 {
 408   // Unloads the Digits and RecPoints
 409   AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
 410
 411   emcalLoader->UnloadDigits() ;
 412   emcalLoader->UnloadRecPoints() ;
 413 }
 414
 415 //____________________________________________________________________________
 416 void AliEMCALClusterizerv1::WriteRecPoints()
 417 {
 418
 419   // Creates new branches with given title
 420   // fills and writes into TreeR.
 421
 422   AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
 423
 424   TObjArray * aECARecPoints = emcalLoader->RecPoints() ;
 425
 426   TClonesArray * digits = emcalLoader->Digits() ;
 427   TTree * treeR = emcalLoader->TreeR();
 428   if ( treeR==0 ) {
 429     emcalLoader->MakeRecPointsContainer();
 430     treeR = emcalLoader->TreeR();
 431   }
 432   Int_t index ;
 433
 434   //Evaluate position, dispersion and other RecPoint properties for EC section
 435   for(index = 0; index < aECARecPoints->GetEntries(); index++)
 436     (dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(index)))->EvalAll(fECAW0,digits) ;
 437
 438   aECARecPoints->Sort() ;
 439
 440   for(index = 0; index < aECARecPoints->GetEntries(); index++)
 441     (dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(index)))->SetIndexInList(index) ;
 442
 443   Int_t bufferSize = 32000 ;
 444   Int_t splitlevel = 0 ;
 445
 446   //EC section branch
 447
 448   TBranch * branchECA = 0;
 449   if ((branchECA = treeR->GetBranch("EMCALECARP")))
 450     branchECA->SetAddress(&aECARecPoints);
 451   else
 452     treeR->Branch("EMCALECARP","TObjArray",&aECARecPoints,bufferSize,splitlevel);
 453   treeR->Fill() ;
 454
 455   emcalLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 456   //emcalLoader->WriteClusterizer("OVERWRITE");
 457   emcalLoader->WriteReconstructioner("OVERWRITE");
 458 }
 459
 460 //____________________________________________________________________________
 461 void AliEMCALClusterizerv1::MakeClusters()
 462 {
 463   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
 464   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
 465
 466   AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
 467
 468   TObjArray * aECARecPoints = emcalLoader->RecPoints() ;
 469
 470   AliEMCALGeometry * geom = AliEMCALGeometry::GetInstance();
 471   if (geom==0)
 472      AliFatal("Did not get geometry from EMCALLoader");
 473
 474   aECARecPoints->Clear();
 475
 476   TClonesArray * digits = emcalLoader->Digits() ;
 477   TClonesArray * digitsC =  dynamic_cast<TClonesArray*>(digits->Clone()) ;
 478
 479   // Clusterization starts
 480   TIter nextdigit(digitsC) ;
 481   AliEMCALDigit * digit;
 482
 483   cout << "Outer Loop" << endl;
 484   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigit())) ) { // scan over the list of digitsC
 485     AliEMCALRecPoint * clu = 0 ;
 486
 487     TArrayI clusterECAdigitslist(50000);
 488
 489 ////////////////////////temp solution, embedding///////////////////
 490    int nSupMod=0, nTower=0, nIphi=0, nIeta=0;
 491    int iphi=0, ieta=0;
 492    geom->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
 493    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nTower,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 494
 495    //cout << "Some checking" << endl;
 496    if (geom->CheckAbsCellId(digit->GetId()) && (Calibrate(digit->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) > fECAClusteringThreshold  ) ){
 497       //if(addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]>0)cout<<"11 digit, add "<<ieta<<" "<<iphi<<" "<<addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]<<" "<<digit->GetAmp()<<endl;
 498 //          cout<<"crossed the threshold "<<endl;
 499       Int_t iDigitInECACluster = 0;
 500       // start a new Tower RecPoint
 501       if(fNumberOfECAClusters >= aECARecPoints->GetSize())
 502           aECARecPoints->Expand(2*fNumberOfECAClusters+1) ;
 503       AliEMCALRecPoint * rp = new  AliEMCALRecPoint("") ;
 504       //rp->SetGeom(geom);
 505       aECARecPoints->AddAt(rp, fNumberOfECAClusters) ;
 506       clu = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(fNumberOfECAClusters)) ;
 507       fNumberOfECAClusters++ ;
 508       clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1])) ;
 509       clusterECAdigitslist[iDigitInECACluster] = digit->GetIndexInList() ;
 510       iDigitInECACluster++ ;
 511 //    cout<<" 1st setp:cluno, digNo "<<fNumberOfECAClusters<<" "<<iDigitInECACluster<<endl;
 512       digitsC->Remove(digit) ;
 513       AliDebug(1,Form("MakeClusters: OK id = %d, ene = %f , thre = %f \n", digit->GetId(),Calibrate(digit->GetAmp()), fECAClusteringThreshold));
 514       nextdigit.Reset() ;
 515
 516       AliEMCALDigit * digitN ;
 517       Int_t index = 0 ;
 518
 519       // Find the neighbours
 520       while (index < iDigitInECACluster){ // scan over digits already in cluster
 521         digit =  (AliEMCALDigit*)digits->At(clusterECAdigitslist[index]);
 522         index++ ;
 523         while ( (digitN = (AliEMCALDigit *)nextdigit())) { // scan over the reduced list of digits
 524           // cout<<"we have new digit "<<endl;
 525           // check that the digit is above the min E Cut
 526           geom->GetCellIndex(digitN->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
 527           geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nTower,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 528           if( Calibrate(digitN->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) < fMinECut  )  digitsC->Remove(digitN);
 529           //cout<<" new digit above ECut "<<endl;
 530           Int_t ineb = AreNeighbours(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!!
 531 //      cout<<" new digit neighbour?? "<<ineb<<endl;
 532          switch (ineb ) {
 533           case 0 :   // not a neighbour
 534             break ;
 535           case 1 :   // are neighbours
 536             //if(addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]>0)cout<<"22 digit, add "<<nSupMod<<" "<<ieta<<" "<<iphi<<" "<<addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]<<" "<<digit->GetAmp()<<endl;
 537             clu->AddDigit(*digitN, Calibrate( digitN->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) ) ;
 538             clusterECAdigitslist[iDigitInECACluster] = digitN->GetIndexInList() ;
 539             iDigitInECACluster++ ;
 540 //    cout<<"when neighbour: cluno, digNo "<<digit->GetId()<<" "<<fNumberOfECAClusters<<" "<<iDigitInECACluster<<endl;
 541             digitsC->Remove(digitN) ;
 542 //          break ;
 543 //          case 2 :   // too far from each other
 544 //Subh      goto endofloop1;
 545 //          cout<<"earlier go to end of loop"<<endl;
 546           } // switch
 547     //cout<<"in nextDigit loop "<<fNumberOfECAClusters<<" "<<iDigitInECACluster<<endl;
 548         } // while digitN
 549         //cout << "Done neighbout searching" << endl;
 550         nextdigit.Reset() ;
 551       } // loop over ECA cluster
 552     } // energy threshold
 553     else if(Calibrate(digit->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) < fMinECut  ){
 554       //if(addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]>0)cout<<"33 digit, add  "<<ieta<<" "<<iphi<<" "<<addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]<<" "<<digit->GetAmp()<<endl;
 555       digitsC->Remove(digit);
 556     }
 557     //cout<<"after endofloop: cluno, digNo "<<fNumberOfECAClusters<<endl;
 558   } // while digit
 559   delete digitsC ;
 560   AliDebug(1,Form("total no of clusters %d from %d digits",fNumberOfECAClusters,digits->GetEntriesFast()));
 561 }
 562
 563 //____________________________________________________________________________
 564 void AliEMCALClusterizerv1::MakeUnfolding() const
 565 {
 566   Fatal("AliEMCALClusterizerv1::MakeUnfolding", "--> Unfolding not implemented") ;
 567
 568 }
 569
 570 //____________________________________________________________________________
 571 Double_t  AliEMCALClusterizerv1::ShowerShape(Double_t r)
 572 {
 573   // Shape of the shower (see EMCAL TDR)
 574   // If you change this function, change also the gradient evaluation in ChiSquare()
 575
 576   Double_t r4    = r*r*r*r ;
 577   Double_t r295  = TMath::Power(r, 2.95) ;
 578   Double_t shape = TMath::Exp( -r4 * (1. / (2.32 + 0.26 * r4) + 0.0316 / (1 + 0.0652 * r295) ) ) ;
 579   return shape ;
 580 }
 581
 582 //____________________________________________________________________________
 583 void  AliEMCALClusterizerv1::UnfoldCluster(AliEMCALRecPoint * /*iniTower*/,
 584                                            Int_t /*nMax*/,
 585                                            AliEMCALDigit ** /*maxAt*/,
 586                                            Float_t * /*maxAtEnergy*/) const
 587 {
 588   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers
 589
 590   Fatal("UnfoldCluster", "--> Unfolding not implemented") ;
 591
 592 }
 593
 594 //_____________________________________________________________________________
 595 void AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & /*nPar*/, Double_t * /*Grad*/,
 596                                                Double_t & /*fret*/,
 597                                                Double_t * /*x*/, Int_t /*iflag*/)
 598 {
 599   // Calculates the Chi square for the cluster unfolding minimization
 600   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
 601
 602   ::Fatal("UnfoldingChiSquare","Unfolding not implemented") ;
 603 }
 604 //____________________________________________________________________________
 605 void AliEMCALClusterizerv1::Print(Option_t * /*option*/)const
 606 {
 607   // Print clusterizer parameters
 608
 609   TString message("\n") ;
 610
 611   if( strcmp(GetName(), "") !=0 ){
 612
 613     // Print parameters
 614
 615     TString taskName(GetName()) ;
 616     taskName.ReplaceAll(Version(), "") ;
 617
 618     printf("--------------- ");
 619     printf(taskName.Data()) ;
 620     printf(" ");
 621     printf(GetTitle()) ;
 622     printf("-----------\n");
 623     printf("Clusterizing digits from the file: ");
 624     printf(taskName.Data());
 625     printf("\n                           Branch: ");
 626     printf(GetName());
 627     printf("\n                       ECA Local Maximum cut    = %f", fECALocMaxCut);
 628     printf("\n                       ECA Logarithmic weight   = %f", fECAW0);
 629     if(fToUnfold)
 630       printf("\nUnfolding on\n");
 631     else
 632       printf("\nUnfolding off\n");
 633
 634     printf("------------------------------------------------------------------");
 635   }
 636   else
 637     printf("AliEMCALClusterizerv1 not initialized ") ;
 638 }
 639
 640 //____________________________________________________________________________
 641 void AliEMCALClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
 642 {
 643   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliEMCALClusterizer
 644   AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
 645   TObjArray * aECARecPoints = emcalLoader->RecPoints() ;
 646
 647   printf("PrintRecPoints: Clusterization result:") ;
 648
 649   printf("event # %d\n", emcalLoader->GetRunLoader()->GetEventNumber() ) ;
 650   printf("           Found %d ECA Rec Points\n ",
 651          aECARecPoints->GetEntriesFast()) ;
 652
 653   fRecPointsInRun +=  aECARecPoints->GetEntriesFast() ;
 654
 655   if(strstr(option,"all")) {
 656     Int_t index =0;
 657     printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n") ;
 658     printf("Clusters in ECAL section\n") ;
 659     printf("Index    Ene(GeV) Multi Module     phi     r   theta    X    Y      Z   Dispersion Lambda 1   Lambda 2  # of prim  Primaries list\n") ;
 660    Float_t maxE=0;
 661    Float_t maxL1=0;
 662    Float_t maxL2=0;
 663    Float_t maxDis=0;
 664
 665     for (index = 0 ; index < aECARecPoints->GetEntries() ; index++) {
 666       AliEMCALRecPoint * rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint * >(aECARecPoints->At(index)) ;
 667       TVector3  globalpos;
 668       //rp->GetGlobalPosition(globalpos);
 669       TVector3  localpos;
 670       rp->GetLocalPosition(localpos);
 671       Float_t lambda[2];
 672       rp->GetElipsAxis(lambda);
 673       Int_t * primaries;
 674       Int_t nprimaries;
 675       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
 676       printf("\n%6d  %8.4f  %3d     %4.1f    %4.1f %4.1f  %4.1f %4.1f %4.1f    %4.1f   %4f  %4f    %2d     : ",
 677              rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetMultiplicity(),
 678              globalpos.X(), globalpos.Y(), globalpos.Z(), localpos.X(), localpos.Y(), localpos.Z(),
 679              rp->GetDispersion(), lambda[0], lambda[1], nprimaries) ;
 680   /////////////
 681       if(rp->GetEnergy()>maxE){
 682               maxE=rp->GetEnergy();
 683               maxL1=lambda[0];
 684               maxL2=lambda[1];
 685               maxDis=rp->GetDispersion();
 686       }
 687       pointE->Fill(rp->GetEnergy());
 688       pointL1->Fill(lambda[0]);
 689       pointL2->Fill(lambda[1]);
 690       pointDis->Fill(rp->GetDispersion());
 691       pointMult->Fill(rp->GetMultiplicity());
 692       /////////////
 693       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++) {
 694         printf("%d ", primaries[iprimary] ) ;
 695       }
 696     }
 697
 698       MaxE->Fill(maxE);
 699       MaxL1->Fill(maxL1);
 700       MaxL2->Fill(maxL2);
 701       MaxDis->Fill(maxDis);
 702
 703
 704     printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n");
 705   }
 706 }
 707   void AliEMCALClusterizerv1::BookHists()
 708 {
 709         pointE = new TH1F("pointE","point energy", 2000, 0.0, 150.);
 710         pointL1 = new TH1F("pointL1","point L1", 1000, 0.0, 3.);
 711         pointL2 = new TH1F("pointL2","point L2", 1000, 0.0, 3.);
 712         pointDis = new TH1F("pointDis","point Dis", 1000, 0.0, 3.);
 713         pointMult = new TH1F("pointMult","point Mult", 100, 0.0, 100.);
 714         digitAmp = new TH1F("digitAmp","Digit Amplitude", 2000, 0.0, 5000.);
 715         MaxE = new TH1F("maxE","Max point energy", 2000, 0.0, 150.);
 716         MaxL1 = new TH1F("maxL1","Max point L1", 1000, 0.0, 3.);
 717         MaxL2 = new TH1F("maxL2","Max point L2", 1000, 0.0, 3.);
 718         MaxDis = new TH1F("maxDis","Max point Dis", 1000, 0.0, 3.);
 719 }
 720 void AliEMCALClusterizerv1::SaveHists()
 721 {
 722  recofile=new TFile("reco.root","RECREATE");
 723         pointE->Write();
 724         pointL1->Write();
 725         pointL2->Write();
 726         pointDis->Write();
 727         pointMult->Write();
 728         digitAmp->Write();
 729       MaxE->Write();
 730       MaxL1->Write();
 731       MaxL2->Write();
 732       MaxDis->Write();
 733 recofile->Close();
 734 }
 735
 736 void AliEMCALClusterizerv1::ReadFile()
 737 {
 738   return; // 3-jan-05
 739         FILE *fp = fopen("hijing1.dat","r");
 740         for(Int_t line=0;line<9113;line++){
 741          Int_t eg,l1,l2,sm;
 742          Int_t ncols0;
 743          ncols0 = fscanf(fp,"%d %d %d %d",&sm,&l1,&l2,&eg);
 744         // cout<<eg<<" "<<l1<<" "<<l2<<endl;
 745          addOn[sm-1][l1-1][l2-1]=eg;
 746          //addOn[sm-1][l1-1][l2-1]=0;
 747         }
 748 }
 749