EMCAL/AliEMCALClusterizerv1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2
   3  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   4
   5  *                                                                        *
   6
   7  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   8
   9  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
  10
  11  *                                                                        *
  12
  13  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
  14
  15  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
  16
  17  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  18
  19  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  20
  21  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  22
  23  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  24
  25  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  26
  27  **************************************************************************/
  28
  29 /* $Id$ */
  30
  31
  32
  33 /* $Log:
  34
  35    1 October 2000. Yuri Kharlov:
  36
  37      AreNeighbours()
  38
  39      PPSD upper layer is considered if number of layers>1
  40
  41
  42
  43    18 October 2000. Yuri Kharlov:
  44
  45      AliEMCALClusterizerv1()
  46
  47      CPV clusterizing parameters added
  48
  49
  50
  51      MakeClusters()
  52
  53      After first PPSD digit remove EMC digits only once
  54
  55 */
  56
  57 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
  58
  59 //  August 2002 Yves Schutz: clone PHOS as closely as possible and intoduction
  60
  61 //                           of new  IO (à la PHOS)
  62
  63 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  64
  65 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and
  66
  67 //  unfolds the clusters having several local maxima.
  68
  69 //  Results are stored in TreeR#, branches EMCALTowerRP (EMC recPoints),
  70
  71 //  EMCALPreShoRP (CPV RecPoints) and AliEMCALClusterizer (Clusterizer with all
  72
  73 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
  74
  75 //  This TTask is normally called from Reconstructioner, but can as well be used in
  76
  77 //  standalone mode.
  78
  79 // Use Case:
  80
  81 //  root [0] AliEMCALClusterizerv1 * cl = new AliEMCALClusterizerv1("galice.root")
  82
  83 //  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  84
  85 //               //reads gAlice from header file "..."
  86
  87 //  root [1] cl->ExecuteTask()
  88
  89 //               //finds RecPoints in all events stored in galice.root
  90
  91 //  root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2")
  92
  93 //               //sets another title for Digitis (input) branch
  94
  95 //  root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")
  96
  97 //               //sets another title four output branches
  98
  99 //  root [4] cl->SetTowerLocalMaxCut(0.03)
 100
 101 //               //set clusterization parameters
 102
 103 //  root [5] cl->ExecuteTask("deb all time")
 104
 105 //               //once more finds RecPoints options are
 106
 107 //               // deb - print number of found rec points
 108
 109 //               // deb all - print number of found RecPoints and some their characteristics
 110
 111 //               // time - print benchmarking results
 112
 113
 114
 115 // --- ROOT system ---
 116
 117
 118
 119 #include "TROOT.h"
 120
 121 #include "TFile.h"
 122
 123 #include "TFolder.h"
 124
 125 #include "TMath.h"
 126
 127 #include "TMinuit.h"
 128
 129 #include "TTree.h"
 130
 131 #include "TSystem.h"
 132
 133 #include "TBenchmark.h"
 134
 135
 136
 137 // --- Standard library ---
 138
 139
 140
 141 #include <iostream.h>
 142
 143 #include <iomanip.h>
 144
 145
 146
 147 // --- AliRoot header files ---
 148
 149
 150
 151 #include "AliEMCALClusterizerv1.h"
 152
 153 #include "AliEMCALDigit.h"
 154
 155 #include "AliEMCALDigitizer.h"
 156
 157 #include "AliEMCALTowerRecPoint.h"
 158
 159 #include "AliEMCAL.h"
 160
 161 #include "AliEMCALGetter.h"
 162
 163 #include "AliEMCALGeometry.h"
 164
 165 #include "AliRun.h"
 166
 167
 168
 169 ClassImp(AliEMCALClusterizerv1)
 170
 171
 172
 173 //____________________________________________________________________________
 174
 175   AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1() : AliEMCALClusterizer()
 176
 177 {
 178
 179   // default ctor (to be used mainly by Streamer)
 180
 181
 182
 183   InitParameters() ;
 184
 185   fDefaultInit = kTRUE ;
 186
 187 }
 188
 189
 190
 191 //____________________________________________________________________________
 192
 193 AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1(const char* headerFile, const char* name, const Bool_t toSplit)
 194
 195 :AliEMCALClusterizer(headerFile, name, toSplit)
 196
 197 {
 198
 199   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
 200
 201
 202
 203   InitParameters() ;
 204
 205   Init() ;
 206
 207   fDefaultInit = kFALSE ;
 208
 209
 210
 211 }
 212
 213
 214
 215 //____________________________________________________________________________
 216
 217   AliEMCALClusterizerv1::~AliEMCALClusterizerv1()
 218
 219 {
 220
 221   // dtor
 222
 223   fSplitFile = 0 ;
 224
 225
 226
 227 }
 228
 229
 230
 231 //____________________________________________________________________________
 232
 233 const TString AliEMCALClusterizerv1::BranchName() const
 234
 235 {
 236
 237   TString branchName(GetName() ) ;
 238
 239   branchName.Remove(branchName.Index(Version())-1) ;
 240
 241   return branchName ;
 242
 243 }
 244
 245
 246
 247 //____________________________________________________________________________
 248
 249 Float_t  AliEMCALClusterizerv1::Calibrate(Int_t amp, Bool_t inpresho) const
 250
 251 {//To be replased later by the method, reading individual parameters from the database
 252
 253
 254
 255   if ( inpresho ) // calibrate as pre shower
 256
 257      return -fADCpedestalPreSho + amp * fADCchannelPreSho ;
 258
 259
 260
 261   else //calibrate as tower
 262
 263     return -fADCpedestalTower + amp * fADCchannelTower ;
 264
 265 }
 266
 267
 268
 269 //____________________________________________________________________________
 270
 271 void AliEMCALClusterizerv1::Exec(Option_t * option)
 272
 273 {
 274
 275   // Steering method
 276
 277
 278
 279   if( strcmp(GetName(), "")== 0 )
 280
 281     Init() ;
 282
 283
 284
 285   if(strstr(option,"tim"))
 286
 287     gBenchmark->Start("EMCALClusterizer");
 288
 289
 290
 291   if(strstr(option,"print"))
 292
 293     Print("") ;
 294
 295
 296
 297   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 298
 299   if(gime->BranchExists("RecPoints"))
 300
 301     return ;
 302
 303   Int_t nevents = gime->MaxEvent() ;
 304
 305   Int_t ievent ;
 306
 307
 308
 309   for(ievent = 0; ievent < nevents; ievent++){
 310
 311
 312
 313     gime->Event(ievent,"D") ;
 314
 315
 316
 317     if(ievent == 0)
 318
 319       GetCalibrationParameters() ;
 320
 321
 322
 323     fNumberOfTowerClusters = fNumberOfPreShoClusters = 0 ;
 324
 325
 326
 327     MakeClusters() ;
 328
 329
 330
 331     if(fToUnfold)
 332
 333       MakeUnfolding() ;
 334
 335
 336
 337     WriteRecPoints(ievent) ;
 338
 339
 340
 341     if(strstr(option,"deb"))
 342
 343       PrintRecPoints(option) ;
 344
 345
 346
 347     //increment the total number of digits per run
 348
 349     fRecPointsInRun += gime->TowerRecPoints()->GetEntriesFast() ;
 350
 351     fRecPointsInRun += gime->PreShowerRecPoints()->GetEntriesFast() ;
 352
 353  }
 354
 355
 356
 357   if(strstr(option,"tim")){
 358
 359     gBenchmark->Stop("EMCALClusterizer");
 360
 361     cout << "AliEMCALClusterizer:" << endl ;
 362
 363     cout << "  took " << gBenchmark->GetCpuTime("EMCALClusterizer") << " seconds for Clusterizing "
 364
 365          <<  gBenchmark->GetCpuTime("EMCALClusterizer")/nevents << " seconds per event " << endl ;
 366
 367     cout << endl ;
 368
 369   }
 370
 371
 372
 373 }
 374
 375
 376
 377 //____________________________________________________________________________
 378
 379 Bool_t AliEMCALClusterizerv1::FindFit(AliEMCALTowerRecPoint * emcRP, AliEMCALDigit ** maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
 380
 381                                     Int_t nPar, Float_t * fitparameters) const
 382
 383 {
 384
 385   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima
 386
 387   // The initial values for fitting procedure are set equal to the positions of local maxima.
 388
 389   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3 electromagnetic showers
 390
 391
 392
 393   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 394
 395   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 396
 397
 398
 399
 400
 401   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
 402
 403   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
 404
 405   gMinuit->SetFCN(AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;
 406
 407                                          // To set the address of the minimization function
 408
 409
 410
 411   TList * toMinuit = new TList();
 412
 413   toMinuit->AddAt(emcRP,0) ;
 414
 415   toMinuit->AddAt(digits,1) ;
 416
 417
 418
 419   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
 420
 421
 422
 423   // filling initial values for fit parameters
 424
 425   AliEMCALDigit * digit ;
 426
 427
 428
 429   Int_t ierflg  = 0;
 430
 431   Int_t index   = 0 ;
 432
 433   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
 434
 435
 436
 437   Int_t iDigit ;
 438
 439
 440
 441   AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
 442
 443
 444
 445   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
 446
 447     digit = maxAt[iDigit];
 448
 449
 450
 451     Int_t relid[4] ;
 452
 453     Float_t x = 0.;
 454
 455     Float_t z = 0.;
 456
 457     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 458
 459     geom->PosInAlice(relid, x, z) ;
 460
 461
 462
 463     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
 464
 465
 466
 467     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 468
 469     index++ ;
 470
 471     if(ierflg != 0){
 472
 473       cout << "EMCAL Unfolding>  Unable to set initial value for fit procedure : x = " << x << endl ;
 474
 475       return kFALSE;
 476
 477     }
 478
 479     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 480
 481     index++ ;
 482
 483     if(ierflg != 0){
 484
 485       cout << "EMCAL Unfolding>  Unable to set initial value for fit procedure : z = " << z << endl ;
 486
 487       return kFALSE;
 488
 489     }
 490
 491     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
 492
 493     index++ ;
 494
 495     if(ierflg != 0){
 496
 497       cout << "EMCAL Unfolding>  Unable to set initial value for fit procedure : energy = " << energy << endl ;
 498
 499       return kFALSE;
 500
 501     }
 502
 503   }
 504
 505
 506
 507   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ; The number of function call slightly
 508
 509                       //  depends on it.
 510
 511   Double_t p1 = 1.0 ;
 512
 513   Double_t p2 = 0.0 ;
 514
 515
 516
 517   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls
 518
 519   gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient
 520
 521   gMinuit->SetMaxIterations(5);
 522
 523   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
 524
 525
 526
 527   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize
 528
 529
 530
 531   if(ierflg == 4){  // Minimum not found
 532
 533     cout << "EMCAL Unfolding>  Fit not converged, cluster abandoned "<< endl ;
 534
 535     return kFALSE ;
 536
 537   }
 538
 539   for(index = 0; index < nPar; index++){
 540
 541     Double_t err ;
 542
 543     Double_t val ;
 544
 545     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
 546
 547     fitparameters[index] = val ;
 548
 549    }
 550
 551
 552
 553   delete toMinuit ;
 554
 555   return kTRUE;
 556
 557
 558
 559 }
 560
 561
 562
 563 //____________________________________________________________________________
 564
 565 void AliEMCALClusterizerv1::GetCalibrationParameters()
 566
 567 {
 568
 569   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 570
 571   const AliEMCALDigitizer * dig = gime->Digitizer(BranchName()) ;
 572
 573
 574
 575   fADCchannelTower   = dig->GetTowerchannel() ;
 576
 577   fADCpedestalTower  = dig->GetTowerpedestal();
 578
 579
 580
 581   fADCchannelPreSho  = dig->GetPreShochannel() ;
 582
 583   fADCpedestalPreSho = dig->GetPreShopedestal() ;
 584
 585
 586
 587 }
 588
 589
 590
 591 //____________________________________________________________________________
 592
 593 void AliEMCALClusterizerv1::Init()
 594
 595 {
 596
 597   // Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
 598
 599   // Attach the Clusterizer task to the list of EMCAL tasks
 600
 601
 602
 603   if ( strcmp(GetTitle(), "") == 0 )
 604
 605     SetTitle("galice.root") ;
 606
 607
 608
 609   TString branchname = GetName() ;
 610
 611   branchname.Remove(branchname.Index(Version())-1) ;
 612
 613
 614
 615   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance(GetTitle(), branchname.Data(), fToSplit ) ;
 616
 617   if ( gime == 0 ) {
 618
 619     cerr << "ERROR: AliEMCALClusterizerv1::Init -> Could not obtain the Getter object !" << endl ;
 620
 621     return ;
 622
 623   }
 624
 625
 626
 627   fSplitFile = 0 ;
 628
 629   if(fToSplit){
 630
 631     // construct the name of the file as /path/EMCAL.SDigits.root
 632
 633     //First - extract full path if necessary
 634
 635     TString fileName(GetTitle()) ;
 636
 637     Ssiz_t islash = fileName.Last('/') ;
 638
 639     if(islash<fileName.Length())
 640
 641       fileName.Remove(islash+1,fileName.Length()) ;
 642
 643     else
 644
 645       fileName="" ;
 646
 647     // Next - append the file name
 648
 649     fileName+="EMCAL.RecData." ;
 650
 651     if((strcmp(branchname.Data(),"Default")!=0)&&(strcmp(branchname.Data(),"")!=0)){
 652
 653       fileName+=branchname ;
 654
 655       fileName+="." ;
 656
 657     }
 658
 659     fileName+="root" ;
 660
 661     // Finally - check if the file already opened or open the file
 662
 663     fSplitFile = static_cast<TFile*>(gROOT->GetFile(fileName.Data()));
 664
 665     if(!fSplitFile)
 666
 667       fSplitFile =  TFile::Open(fileName.Data(),"update") ;
 668
 669   }
 670
 671
 672
 673
 674
 675   const AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
 676
 677   fNTowers = geom->GetNZ() *  geom->GetNPhi() ;
 678
 679
 680
 681   if(!gMinuit)
 682
 683     gMinuit = new TMinuit(100) ;
 684
 685
 686
 687   gime->PostClusterizer(this) ;
 688
 689   gime->PostRecPoints(branchname ) ;
 690
 691
 692
 693 }
 694
 695
 696
 697 //____________________________________________________________________________
 698
 699 void AliEMCALClusterizerv1::InitParameters()
 700
 701 {
 702
 703   fNumberOfPreShoClusters = fNumberOfTowerClusters = 0 ;
 704
 705
 706
 707
 708
 709
 710
 711   fPreShoClusteringThreshold  = 0.0001;
 712
 713   fTowerClusteringThreshold   = 0.2;
 714
 715
 716
 717   fTowerLocMaxCut  = 0.03 ;
 718
 719   fPreShoLocMaxCut = 0.03 ;
 720
 721
 722
 723   fW0     = 4.5 ;
 724
 725   fW0CPV  = 4.0 ;
 726
 727
 728
 729   fTimeGate = 1.e-8 ;
 730
 731
 732
 733   fToUnfold = kFALSE ;
 734
 735
 736
 737   TString clusterizerName( GetName()) ;
 738
 739   if (clusterizerName.IsNull() )
 740
 741     clusterizerName = "Default" ;
 742
 743   clusterizerName.Append(":") ;
 744
 745   clusterizerName.Append(Version()) ;
 746
 747   SetName(clusterizerName) ;
 748
 749   fRecPointsInRun          = 0 ;
 750
 751
 752
 753 }
 754
 755
 756
 757 //____________________________________________________________________________
 758
 759 Int_t AliEMCALClusterizerv1::AreNeighbours(AliEMCALDigit * d1, AliEMCALDigit * d2)const
 760
 761 {
 762
 763   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour but continue searching
 764
 765   //                                       = 1 are neighbour
 766
 767   //                                       = 2 are not neighbour but do not continue searching
 768
 769   // neighbours are defined as digits having at least a common vertex
 770
 771   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster
 772
 773   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster
 774
 775
 776
 777    AliEMCALGeometry * geom = AliEMCALGetter::GetInstance()->EMCALGeometry() ;
 778
 779
 780
 781   Int_t rv = 0 ;
 782
 783
 784
 785   Int_t relid1[4] ;
 786
 787   geom->AbsToRelNumbering(d1->GetId(), relid1) ;
 788
 789
 790
 791   Int_t relid2[4] ;
 792
 793   geom->AbsToRelNumbering(d2->GetId(), relid2) ;
 794
 795
 796
 797   if ( (relid1[0] == relid2[0]) && (relid1[1]==relid2[1]) ) { // inside the same EMCAL Arm
 798
 799     Int_t rowdiff = TMath::Abs( relid1[2] - relid2[2] ) ;
 800
 801     Int_t coldiff = TMath::Abs( relid1[3] - relid2[3] ) ;
 802
 803
 804
 805     if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 )){
 806
 807       if((relid1[1] != 0) || (TMath::Abs(d1->GetTime() - d2->GetTime() ) < fTimeGate))
 808
 809       rv = 1 ;
 810
 811     }
 812
 813     else {
 814
 815       if((relid2[2] > relid1[2]) && (relid2[3] > relid1[3]+1))
 816
 817         rv = 2; //  Difference in row numbers is too large to look further
 818
 819     }
 820
 821
 822
 823   }
 824
 825   else {
 826
 827
 828
 829     if( (relid1[0] < relid2[0]) || (relid1[1] != relid2[1]) )
 830
 831       rv=2 ;
 832
 833
 834
 835   }
 836
 837
 838
 839   return rv ;
 840
 841 }
 842
 843
 844
 845
 846
 847 //____________________________________________________________________________
 848
 849 Bool_t AliEMCALClusterizerv1::IsInTower(AliEMCALDigit * digit) const
 850
 851 {
 852
 853   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a EMCAL-Tower
 854
 855
 856
 857   Bool_t rv = kFALSE ;
 858
 859   if (!digit->IsInPreShower())
 860
 861     rv = kTRUE;
 862
 863   return rv ;
 864
 865 }
 866
 867
 868
 869 //____________________________________________________________________________
 870
 871 Bool_t AliEMCALClusterizerv1::IsInPreShower(AliEMCALDigit * digit) const
 872
 873 {
 874
 875   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a EMCAL-PreShower
 876
 877
 878
 879   Bool_t rv = kFALSE ;
 880
 881   if (digit->IsInPreShower())
 882
 883     rv = kTRUE;
 884
 885   return rv ;
 886
 887 }
 888
 889
 890
 891 //____________________________________________________________________________
 892
 893 void AliEMCALClusterizerv1::WriteRecPoints(Int_t event)
 894
 895 {
 896
 897
 898
 899   // Creates new branches with given title
 900
 901   // fills and writes into TreeR.
 902
 903
 904
 905   AliEMCALGetter *gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 906
 907   TObjArray * towerRecPoints = gime->TowerRecPoints() ;
 908
 909   TObjArray * preshoRecPoints = gime->PreShowerRecPoints() ;
 910
 911   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 912
 913   TTree * treeR ;
 914
 915
 916
 917   if(fToSplit){
 918
 919     if(!fSplitFile)
 920
 921       return ;
 922
 923     fSplitFile->cd() ;
 924
 925     TString name("TreeR") ;
 926
 927     name += event ;
 928
 929     treeR = dynamic_cast<TTree*>(fSplitFile->Get(name));
 930
 931   }
 932
 933   else{
 934
 935     treeR = gAlice->TreeR();
 936
 937   }
 938
 939
 940
 941   if(!treeR){
 942
 943     gAlice->MakeTree("R", fSplitFile);
 944
 945     treeR = gAlice->TreeR() ;
 946
 947   }
 948
 949
 950
 951   Int_t index ;
 952
 953   //Evaluate position, dispersion and other RecPoint properties...
 954
 955   for(index = 0; index < towerRecPoints->GetEntries(); index++)
 956
 957     (dynamic_cast<AliEMCALTowerRecPoint *>(towerRecPoints->At(index)))->EvalAll(fW0,digits) ;
 958
 959
 960
 961   towerRecPoints->Sort() ;
 962
 963
 964
 965   for(index = 0; index < towerRecPoints->GetEntries(); index++)
 966
 967     (dynamic_cast<AliEMCALTowerRecPoint *>(towerRecPoints->At(index)))->SetIndexInList(index) ;
 968
 969
 970
 971   towerRecPoints->Expand(towerRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 972
 973
 974
 975   //Now the same for pre shower
 976
 977   for(index = 0; index < preshoRecPoints->GetEntries(); index++)
 978
 979     (dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(preshoRecPoints->At(index)))->EvalAll(fW0CPV,digits)  ;
 980
 981
 982
 983   preshoRecPoints->Sort() ;
 984
 985
 986
 987   for(index = 0; index < preshoRecPoints->GetEntries(); index++)
 988
 989     (dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(preshoRecPoints->At(index)))->SetIndexInList(index) ;
 990
 991
 992
 993   preshoRecPoints->Expand(preshoRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 994
 995
 996
 997   Int_t bufferSize = 32000 ;
 998
 999   Int_t splitlevel = 0 ;
1000
1001
1002
1003   //First Tower branch
1004
1005   TBranch * towerBranch = treeR->Branch("EMCALTowerRP","TObjArray",&towerRecPoints,bufferSize,splitlevel);
1006
1007   towerBranch->SetTitle(BranchName());
1008
1009
1010
1011   //Now Pre Shower branch
1012
1013   TBranch * preshoBranch = treeR->Branch("EMCALPreShoRP","TObjArray",&preshoRecPoints,bufferSize,splitlevel);
1014
1015   preshoBranch->SetTitle(BranchName());
1016
1017
1018
1019   //And Finally  clusterizer branch
1020
1021   AliEMCALClusterizerv1 * cl = (AliEMCALClusterizerv1*)gime->Clusterizer(BranchName()) ;
1022
1023   TBranch * clusterizerBranch = treeR->Branch("AliEMCALClusterizer","AliEMCALClusterizerv1",
1024
1025                                               &cl,bufferSize,splitlevel);
1026
1027   clusterizerBranch->SetTitle(BranchName());
1028
1029
1030
1031   towerBranch        ->Fill() ;
1032
1033   preshoBranch        ->Fill() ;
1034
1035   clusterizerBranch->Fill() ;
1036
1037
1038
1039   treeR->AutoSave() ; //Write(0,kOverwrite) ;
1040
1041   if(gAlice->TreeR()!=treeR)
1042
1043     treeR->Delete();
1044
1045 }
1046
1047
1048
1049 //____________________________________________________________________________
1050
1051 void AliEMCALClusterizerv1::MakeClusters()
1052
1053 {
1054
1055   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
1056
1057   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
1058
1059
1060
1061   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
1062
1063
1064
1065   TObjArray * towerRecPoints  = gime->TowerRecPoints(BranchName()) ;
1066
1067   TObjArray * preshoRecPoints = gime->PreShowerRecPoints(BranchName()) ;
1068
1069   towerRecPoints->Delete() ;
1070
1071   preshoRecPoints->Delete() ;
1072
1073
1074
1075   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
1076
1077   if ( !digits ) {
1078
1079     cerr << "ERROR:  AliEMCALClusterizerv1::MakeClusters -> Digits with name "
1080
1081          << GetName() << " not found ! " << endl ;
1082
1083     abort() ;
1084
1085   }
1086
1087   TClonesArray * digitsC =  dynamic_cast<TClonesArray*>(digits->Clone()) ;
1088
1089
1090
1091
1092
1093   // Clusterization starts
1094
1095
1096
1097   TIter nextdigit(digitsC) ;
1098
1099   AliEMCALDigit * digit ;
1100
1101   Bool_t notremoved = kTRUE ;
1102
1103
1104
1105   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigit())) ) { // scan over the list of digitsC
1106
1107     AliEMCALRecPoint * clu = 0 ;
1108
1109
1110
1111     TArrayI clusterdigitslist(1500) ;
1112
1113     Int_t index ;
1114
1115
1116
1117     if (( IsInTower (digit)  && Calibrate(digit->GetAmp(),digit->IsInPreShower()) > fTowerClusteringThreshold  ) ||
1118
1119         ( IsInPreShower (digit) && Calibrate(digit->GetAmp(),digit->IsInPreShower()) > fPreShoClusteringThreshold  ) ) {
1120
1121
1122
1123       Int_t iDigitInCluster = 0 ;
1124
1125
1126
1127       if  ( IsInTower(digit) ) {
1128
1129         // start a new Tower RecPoint
1130
1131         if(fNumberOfTowerClusters >= towerRecPoints->GetSize())
1132
1133           towerRecPoints->Expand(2*fNumberOfTowerClusters+1) ;
1134
1135
1136
1137         towerRecPoints->AddAt(new  AliEMCALTowerRecPoint(""), fNumberOfTowerClusters) ;
1138
1139         clu = dynamic_cast<AliEMCALTowerRecPoint *>(towerRecPoints->At(fNumberOfTowerClusters)) ;
1140
1141         fNumberOfTowerClusters++ ;
1142
1143         clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp(),digit->IsInPreShower())) ;
1144
1145         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList() ;
1146
1147         iDigitInCluster++ ;
1148
1149         digitsC->Remove(digit) ;
1150
1151
1152
1153       } else {
1154
1155
1156
1157         // start a new Pre Shower cluster
1158
1159         if(fNumberOfPreShoClusters >= preshoRecPoints->GetSize())
1160
1161           preshoRecPoints->Expand(2*fNumberOfPreShoClusters+1);
1162
1163
1164
1165         preshoRecPoints->AddAt(new AliEMCALTowerRecPoint(""), fNumberOfPreShoClusters) ;
1166
1167
1168
1169         clu =  dynamic_cast<AliEMCALTowerRecPoint *>(preshoRecPoints->At(fNumberOfPreShoClusters))  ;
1170
1171         fNumberOfPreShoClusters++ ;
1172
1173         clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp(),digit->IsInPreShower() ) );
1174
1175         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList()  ;
1176
1177         iDigitInCluster++ ;
1178
1179         digitsC->Remove(digit) ;
1180
1181         nextdigit.Reset() ;
1182
1183
1184
1185         // Here we remove remaining Tower digits, which cannot make a cluster
1186
1187
1188
1189         if( notremoved ) {
1190
1191           while( ( digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigit()) ) ) {
1192
1193             if( IsInTower(digit) )
1194
1195               digitsC->Remove(digit) ;
1196
1197             else
1198
1199               break ;
1200
1201           }
1202
1203           notremoved = kFALSE ;
1204
1205         }
1206
1207
1208
1209       } // else
1210
1211
1212
1213       nextdigit.Reset() ;
1214
1215
1216
1217       AliEMCALDigit * digitN ;
1218
1219       index = 0 ;
1220
1221       while (index < iDigitInCluster){ // scan over digits already in cluster
1222
1223         digit =  (AliEMCALDigit*)digits->At(clusterdigitslist[index])  ;
1224
1225         index++ ;
1226
1227         while ( (digitN = (AliEMCALDigit *)nextdigit()) ) { // scan over the reduced list of digits
1228
1229           Int_t ineb = AreNeighbours(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!!
1230
1231          switch (ineb ) {
1232
1233           case 0 :   // not a neighbour
1234
1235             break ;
1236
1237           case 1 :   // are neighbours
1238
1239             clu->AddDigit(*digitN, Calibrate( digitN->GetAmp(), digitN->IsInPreShower() ) ) ;
1240
1241             clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digitN->GetIndexInList() ;
1242
1243             iDigitInCluster++ ;
1244
1245             digitsC->Remove(digitN) ;
1246
1247             break ;
1248
1249           case 2 :   // too far from each other
1250
1251             goto endofloop;
1252
1253           } // switch
1254
1255
1256
1257         } // while digitN
1258
1259
1260
1261       endofloop: ;
1262
1263         nextdigit.Reset() ;
1264
1265
1266
1267       } // loop over cluster
1268
1269
1270
1271     } // energy theshold
1272
1273
1274
1275
1276
1277   } // while digit
1278
1279
1280
1281   delete digitsC ;
1282
1283
1284
1285 }
1286
1287
1288
1289 //____________________________________________________________________________
1290
1291 void AliEMCALClusterizerv1::MakeUnfolding()
1292
1293 {
1294
1295   Fatal("AliEMCALClusterizerv1::MakeUnfolding", "--> Unfolding not implemented") ;
1296
1297
1298
1299 //   // Unfolds clusters using the shape of an ElectroMagnetic shower
1300
1301 //   // Performs unfolding of all EMC/CPV clusters
1302
1303
1304
1305 //   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
1306
1307
1308
1309 //   const AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
1310
1311 //   TObjArray * emcRecPoints = gime->TowerRecPoints() ;
1312
1313 //   TObjArray * cpvRecPoints = gime->PreShoRecPoints() ;
1314
1315 //   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
1316
1317
1318
1319 //   // Unfold first EMC clusters
1320
1321 //   if(fNumberOfTowerClusters > 0){
1322
1323
1324
1325 //     Int_t nModulesToUnfold = geom->GetNModules() ;
1326
1327
1328
1329 //     Int_t numberofNotUnfolded = fNumberOfTowerClusters ;
1330
1331 //     Int_t index ;
1332
1333 //     for(index = 0 ; index < numberofNotUnfolded ; index++){
1334
1335
1336
1337 //       AliEMCALTowerRecPoint * emcRecPoint = (AliEMCALTowerRecPoint *) emcRecPoints->At(index) ;
1338
1339 //       if(emcRecPoint->GetEMCALMod()> nModulesToUnfold)
1340
1341 //      break ;
1342
1343
1344
1345 //       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
1346
1347 //       Int_t * maxAt = new Int_t[nMultipl] ;
1348
1349 //       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
1350
1351 //       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fTowerLocMaxCut,digits) ;
1352
1353
1354
1355 //       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
1356
1357 //      UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
1358
1359 //      emcRecPoints->Remove(emcRecPoint);
1360
1361 //      emcRecPoints->Compress() ;
1362
1363 //      index-- ;
1364
1365 //      fNumberOfTowerClusters -- ;
1366
1367 //      numberofNotUnfolded-- ;
1368
1369 //       }
1370
1371
1372
1373 //       delete[] maxAt ;
1374
1375 //       delete[] maxAtEnergy ;
1376
1377 //     }
1378
1379 //   }
1380
1381 //   // Unfolding of EMC clusters finished
1382
1383
1384
1385
1386
1387 //   // Unfold now CPV clusters
1388
1389 //   if(fNumberOfPreShoClusters > 0){
1390
1391
1392
1393 //     Int_t nModulesToUnfold = geom->GetNModules() ;
1394
1395
1396
1397 //     Int_t numberofPreShoNotUnfolded = fNumberOfPreShoClusters ;
1398
1399 //     Int_t index ;
1400
1401 //     for(index = 0 ; index < numberofPreShoNotUnfolded ; index++){
1402
1403
1404
1405 //       AliEMCALRecPoint * recPoint = (AliEMCALRecPoint *) cpvRecPoints->At(index) ;
1406
1407
1408
1409 //       if(recPoint->GetEMCALMod()> nModulesToUnfold)
1410
1411 //      break ;
1412
1413
1414
1415 //       AliEMCALTowerRecPoint * emcRecPoint = (AliEMCALTowerRecPoint*) recPoint ;
1416
1417
1418
1419 //       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
1420
1421 //       Int_t * maxAt = new Int_t[nMultipl] ;
1422
1423 //       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
1424
1425 //       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fPreShoLocMaxCut,digits) ;
1426
1427
1428
1429 //       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
1430
1431 //      UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
1432
1433 //      cpvRecPoints->Remove(emcRecPoint);
1434
1435 //      cpvRecPoints->Compress() ;
1436
1437 //      index-- ;
1438
1439 //      numberofPreShoNotUnfolded-- ;
1440
1441 //      fNumberOfPreShoClusters-- ;
1442
1443 //       }
1444
1445
1446
1447 //       delete[] maxAt ;
1448
1449 //       delete[] maxAtEnergy ;
1450
1451 //     }
1452
1453 //   }
1454
1455 //   //Unfolding of PreSho clusters finished
1456
1457
1458
1459 }
1460
1461
1462
1463 //____________________________________________________________________________
1464
1465 Double_t  AliEMCALClusterizerv1::ShowerShape(Double_t r)
1466
1467 {
1468
1469   // Shape of the shower (see EMCAL TDR)
1470
1471   // If you change this function, change also the gradient evaluation in ChiSquare()
1472
1473
1474
1475   Double_t r4    = r*r*r*r ;
1476
1477   Double_t r295  = TMath::Power(r, 2.95) ;
1478
1479   Double_t shape = TMath::Exp( -r4 * (1. / (2.32 + 0.26 * r4) + 0.0316 / (1 + 0.0652 * r295) ) ) ;
1480
1481   return shape ;
1482
1483 }
1484
1485
1486
1487 //____________________________________________________________________________
1488
1489 void  AliEMCALClusterizerv1::UnfoldCluster(AliEMCALTowerRecPoint * iniTower,
1490
1491                                                  Int_t nMax,
1492
1493                                                  AliEMCALDigit ** maxAt,
1494
1495                                                  Float_t * maxAtEnergy)
1496
1497 {
1498
1499   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers
1500
1501
1502
1503   Fatal("AliEMCALClusterizerv1::UnfoldCluster", "--> Unfolding not implemented") ;
1504
1505
1506
1507  //  AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
1508
1509 //   const AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
1510
1511 //   const TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
1512
1513 //   TObjArray * emcRecPoints = gime->TowerRecPoints() ;
1514
1515 //   TObjArray * cpvRecPoints = gime->PreShoRecPoints() ;
1516
1517
1518
1519 //   Int_t nPar = 3 * nMax ;
1520
1521 //   Float_t * fitparameters = new Float_t[nPar] ;
1522
1523
1524
1525 //   Bool_t rv = FindFit(iniTower, maxAt, maxAtEnergy, nPar, fitparameters) ;
1526
1527 //   if( !rv ) {
1528
1529 //     // Fit failed, return and remove cluster
1530
1531 //     delete[] fitparameters ;
1532
1533 //     return ;
1534
1535 //   }
1536
1537
1538
1539 //   // create ufolded rec points and fill them with new energy lists
1540
1541 //   // First calculate energy deposited in each sell in accordance with fit (without fluctuations): efit[]
1542
1543 //   // and later correct this number in acordance with actual energy deposition
1544
1545
1546
1547 //   Int_t nDigits = iniTower->GetMultiplicity() ;
1548
1549 //   Float_t * efit = new Float_t[nDigits] ;
1550
1551 //   Float_t xDigit=0.,zDigit=0.,distance=0. ;
1552
1553 //   Float_t xpar=0.,zpar=0.,epar=0.  ;
1554
1555 //   Int_t relid[4] ;
1556
1557 //   AliEMCALDigit * digit = 0 ;
1558
1559 //   Int_t * emcDigits = iniTower->GetDigitsList() ;
1560
1561
1562
1563 //   Int_t iparam ;
1564
1565 //   Int_t iDigit ;
1566
1567 //   for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
1568
1569 //     digit = (AliEMCALDigit*) digits->At(emcDigits[iDigit] ) ;
1570
1571 //     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
1572
1573 //     geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
1574
1575 //     efit[iDigit] = 0;
1576
1577
1578
1579 //     iparam = 0 ;
1580
1581 //     while(iparam < nPar ){
1582
1583 //       xpar = fitparameters[iparam] ;
1584
1585 //       zpar = fitparameters[iparam+1] ;
1586
1587 //       epar = fitparameters[iparam+2] ;
1588
1589 //       iparam += 3 ;
1590
1591 //       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
1592
1593 //       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
1594
1595 //       efit[iDigit] += epar * ShowerShape(distance) ;
1596
1597 //     }
1598
1599 //   }
1600
1601
1602
1603
1604
1605 //   // Now create new RecPoints and fill energy lists with efit corrected to fluctuations
1606
1607 //   // so that energy deposited in each cell is distributed betwin new clusters proportionally
1608
1609 //   // to its contribution to efit
1610
1611
1612
1613 //   Float_t * emcEnergies = iniTower->GetEnergiesList() ;
1614
1615 //   Float_t ratio ;
1616
1617
1618
1619 //   iparam = 0 ;
1620
1621 //   while(iparam < nPar ){
1622
1623 //     xpar = fitparameters[iparam] ;
1624
1625 //     zpar = fitparameters[iparam+1] ;
1626
1627 //     epar = fitparameters[iparam+2] ;
1628
1629 //     iparam += 3 ;
1630
1631
1632
1633 //     AliEMCALTowerRecPoint * emcRP = 0 ;
1634
1635
1636
1637 //     if(iniTower->IsTower()){ //create new entries in fTowerRecPoints...
1638
1639
1640
1641 //       if(fNumberOfTowerClusters >= emcRecPoints->GetSize())
1642
1643 //      emcRecPoints->Expand(2*fNumberOfTowerClusters) ;
1644
1645
1646
1647 //       (*emcRecPoints)[fNumberOfTowerClusters] = new AliEMCALTowerRecPoint("") ;
1648
1649 //       emcRP = (AliEMCALTowerRecPoint *) emcRecPoints->At(fNumberOfTowerClusters);
1650
1651 //       fNumberOfTowerClusters++ ;
1652
1653 //     }
1654
1655 //     else{//create new entries in fPreShoRecPoints
1656
1657 //       if(fNumberOfPreShoClusters >= cpvRecPoints->GetSize())
1658
1659 //      cpvRecPoints->Expand(2*fNumberOfPreShoClusters) ;
1660
1661
1662
1663 //       (*cpvRecPoints)[fNumberOfPreShoClusters] = new AliEMCALPreShoRecPoint("") ;
1664
1665 //       emcRP = (AliEMCALTowerRecPoint *) cpvRecPoints->At(fNumberOfPreShoClusters);
1666
1667 //       fNumberOfPreShoClusters++ ;
1668
1669 //     }
1670
1671
1672
1673 //     Float_t eDigit ;
1674
1675 //     for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
1676
1677 //       digit = (AliEMCALDigit*) digits->At( emcDigits[iDigit] ) ;
1678
1679 //       geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
1680
1681 //       geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
1682
1683 //       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
1684
1685 //       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
1686
1687 //       ratio = epar * ShowerShape(distance) / efit[iDigit] ;
1688
1689 //       eDigit = emcEnergies[iDigit] * ratio ;
1690
1691 //       emcRP->AddDigit( *digit, eDigit ) ;
1692
1693 //     }
1694
1695 //   }
1696
1697
1698
1699 //   delete[] fitparameters ;
1700
1701 //   delete[] efit ;
1702
1703
1704
1705 }
1706
1707
1708
1709 //_____________________________________________________________________________
1710
1711 void AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & nPar, Double_t * Grad, Double_t & fret, Double_t * x, Int_t iflag)
1712
1713 {
1714
1715   // Calculates the Chi square for the cluster unfolding minimization
1716
1717   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
1718
1719
1720
1721   abort() ;
1722
1723  //  Fatal("AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare","-->Unfolding not implemented") ;
1724
1725
1726
1727 //   TList * toMinuit = (TList*) gMinuit->GetObjectFit() ;
1728
1729
1730
1731 //   AliEMCALTowerRecPoint * emcRP = (AliEMCALTowerRecPoint*) toMinuit->At(0)  ;
1732
1733 //   TClonesArray * digits = (TClonesArray*)toMinuit->At(1)  ;
1734
1735
1736
1737
1738
1739
1740
1741 //   //  AliEMCALTowerRecPoint * emcRP = (AliEMCALTowerRecPoint *) gMinuit->GetObjectFit() ; // TowerRecPoint to fit
1742
1743
1744
1745 //   Int_t * emcDigits     = emcRP->GetDigitsList() ;
1746
1747
1748
1749 //   Int_t nOdigits = emcRP->GetDigitsMultiplicity() ;
1750
1751
1752
1753 //   Float_t * emcEnergies = emcRP->GetEnergiesList() ;
1754
1755
1756
1757 //   const AliEMCALGeometry * geom = AliEMCALGetter::GetInstance()->EMCALGeometry() ;
1758
1759 //   fret = 0. ;
1760
1761 //   Int_t iparam ;
1762
1763
1764
1765 //   if(iflag == 2)
1766
1767 //     for(iparam = 0 ; iparam < nPar ; iparam++)
1768
1769 //       Grad[iparam] = 0 ; // Will evaluate gradient
1770
1771
1772
1773 //   Double_t efit ;
1774
1775
1776
1777 //   AliEMCALDigit * digit ;
1778
1779 //   Int_t iDigit ;
1780
1781
1782
1783 //   for( iDigit = 0 ; iDigit < nOdigits ; iDigit++) {
1784
1785
1786
1787 //     digit = (AliEMCALDigit*) digits->At( emcDigits[iDigit] ) ;
1788
1789
1790
1791 //     Int_t relid[4] ;
1792
1793 //     Float_t xDigit ;
1794
1795 //     Float_t zDigit ;
1796
1797
1798
1799 //     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
1800
1801
1802
1803 //     geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
1804
1805
1806
1807 //      if(iflag == 2){  // calculate gradient
1808
1809 //        Int_t iParam = 0 ;
1810
1811 //        efit = 0 ;
1812
1813 //        while(iParam < nPar ){
1814
1815 //       Double_t distance = (xDigit - x[iParam]) * (xDigit - x[iParam]) ;
1816
1817 //       iParam++ ;
1818
1819 //       distance += (zDigit - x[iParam]) * (zDigit - x[iParam]) ;
1820
1821 //       distance = TMath::Sqrt( distance ) ;
1822
1823 //       iParam++ ;
1824
1825 //       efit += x[iParam] * ShowerShape(distance) ;
1826
1827 //       iParam++ ;
1828
1829 //        }
1830
1831 //        Double_t sum = 2. * (efit - emcEnergies[iDigit]) / emcEnergies[iDigit] ; // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
1832
1833 //        iParam = 0 ;
1834
1835 //        while(iParam < nPar ){
1836
1837 //       Double_t xpar = x[iParam] ;
1838
1839 //       Double_t zpar = x[iParam+1] ;
1840
1841 //       Double_t epar = x[iParam+2] ;
1842
1843 //       Double_t dr = TMath::Sqrt( (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar) );
1844
1845 //       Double_t shape = sum * ShowerShape(dr) ;
1846
1847 //       Double_t r4 = dr*dr*dr*dr ;
1848
1849 //       Double_t r295 = TMath::Power(dr,2.95) ;
1850
1851 //       Double_t deriv =-4. * dr*dr * ( 2.32 / ( (2.32 + 0.26 * r4) * (2.32 + 0.26 * r4) ) +
1852
1853 //                                       0.0316 * (1. + 0.0171 * r295) / ( ( 1. + 0.0652 * r295) * (1. + 0.0652 * r295) ) ) ;
1854
1855
1856
1857 //       Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (xpar - xDigit) ;  // Derivative over x
1858
1859 //       iParam++ ;
1860
1861 //       Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (zpar - zDigit) ;  // Derivative over z
1862
1863 //       iParam++ ;
1864
1865 //       Grad[iParam] += shape ;                                  // Derivative over energy
1866
1867 //       iParam++ ;
1868
1869 //        }
1870
1871 //      }
1872
1873 //      efit = 0;
1874
1875 //      iparam = 0 ;
1876
1877
1878
1879 //      while(iparam < nPar ){
1880
1881 //        Double_t xpar = x[iparam] ;
1882
1883 //        Double_t zpar = x[iparam+1] ;
1884
1885 //        Double_t epar = x[iparam+2] ;
1886
1887 //        iparam += 3 ;
1888
1889 //        Double_t distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
1890
1891 //        distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
1892
1893 //        efit += epar * ShowerShape(distance) ;
1894
1895 //      }
1896
1897
1898
1899 //      fret += (efit-emcEnergies[iDigit])*(efit-emcEnergies[iDigit])/emcEnergies[iDigit] ;
1900
1901 //      // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
1902
1903 //   }
1904
1905
1906
1907 }
1908
1909
1910
1911 //____________________________________________________________________________
1912
1913 void AliEMCALClusterizerv1::Print(Option_t * option)const
1914
1915 {
1916
1917   // Print clusterizer parameters
1918
1919
1920
1921   if( strcmp(GetName(), "") !=0 ){
1922
1923
1924
1925     // Print parameters
1926
1927
1928
1929     TString taskName(GetName()) ;
1930
1931     taskName.ReplaceAll(Version(), "") ;
1932
1933
1934
1935     cout << "---------------"<< taskName.Data() << " " << GetTitle()<< "-----------" << endl
1936
1937          << "Clusterizing digits from the file: " << taskName.Data() << endl
1938
1939          << "                           Branch: " << GetName() << endl
1940
1941          << endl
1942
1943          << "                       EMC Clustering threshold = " << fTowerClusteringThreshold << endl
1944
1945          << "                       EMC Local Maximum cut    = " << fTowerLocMaxCut << endl
1946
1947          << "                       EMC Logarothmic weight   = " << fW0 << endl
1948
1949          << endl
1950
1951          << "                       CPV Clustering threshold = " << fPreShoClusteringThreshold << endl
1952
1953          << "                       CPV Local Maximum cut    = " << fPreShoLocMaxCut << endl
1954
1955        << "                       CPV Logarothmic weight   = " << fW0CPV << endl
1956
1957          << endl ;
1958
1959     if(fToUnfold)
1960
1961       cout << " Unfolding on " << endl ;
1962
1963     else
1964
1965       cout << " Unfolding off " << endl ;
1966
1967
1968
1969     cout << "------------------------------------------------------------------" <<endl ;
1970
1971   }
1972
1973   else
1974
1975     cout << " AliEMCALClusterizerv1 not initialized " << endl ;
1976
1977 }
1978
1979 //____________________________________________________________________________
1980
1981 void AliEMCALClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
1982
1983 {
1984
1985   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliEMCALClusterizer
1986
1987
1988
1989   TObjArray * towerRecPoints = AliEMCALGetter::GetInstance()->TowerRecPoints() ;
1990
1991   TObjArray * preshoRecPoints = AliEMCALGetter::GetInstance()->PreShowerRecPoints() ;
1992
1993
1994
1995   cout << "AliEMCALClusterizerv1: : event "<<gAlice->GetEvNumber() << endl ;
1996
1997   cout << "       Found "<< towerRecPoints->GetEntriesFast() << " TOWER Rec Points and "
1998
1999            << preshoRecPoints->GetEntriesFast() << " PRE SHOWER RecPoints" << endl ;
2000
2001
2002
2003   fRecPointsInRun +=  towerRecPoints->GetEntriesFast() ;
2004
2005   fRecPointsInRun +=  preshoRecPoints->GetEntriesFast() ;
2006
2007
2008
2009   if(strstr(option,"all")) {
2010
2011
2012
2013     cout << "Tower clusters " << endl ;
2014
2015     cout << " Index  Ene(MeV)   Multi  Module     phi     r  theta    Lambda 1   Lambda 2  # of prim  Primaries list "      <<  endl;
2016
2017
2018
2019     Int_t index ;
2020
2021     for (index = 0 ; index < towerRecPoints->GetEntries() ; index++) {
2022
2023       AliEMCALTowerRecPoint * rp = dynamic_cast<AliEMCALTowerRecPoint * >(towerRecPoints->At(index)) ;
2024
2025       TVector3  globalpos;
2026
2027       rp->GetGlobalPosition(globalpos);
2028
2029       Float_t lambda[2];
2030
2031       rp->GetElipsAxis(lambda);
2032
2033       Int_t * primaries;
2034
2035       Int_t nprimaries;
2036
2037       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
2038
2039
2040
2041       cout << setw(4) << rp->GetIndexInList() << "   "
2042
2043            << setw(7) << setprecision(3) << rp->GetEnergy() << "      "
2044
2045            << setw(3) << rp->GetMultiplicity() << "      "
2046
2047            << setw(1) << rp->GetEMCALArm() << "     "
2048
2049            << setw(5) << setprecision(4) << globalpos.X() << "  "
2050
2051            << setw(5) << setprecision(4) << globalpos.Y() << "  "
2052
2053            << setw(5) << setprecision(4) << globalpos.Z() << "     "
2054
2055            << setw(4) << setprecision(2) << lambda[0]  << "  "
2056
2057            << setw(4) << setprecision(2) << lambda[1]  << "  "
2058
2059            << setw(2) << nprimaries << "  " ;
2060
2061
2062
2063       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++)
2064
2065         cout << setw(4) <<   primaries[iprimary] << "  "  ;
2066
2067       cout << endl ;
2068
2069     }
2070
2071
2072
2073     //Now plot Pre shower recPoints
2074
2075
2076
2077     cout << "-----------------------------------------------------------------------"<<endl ;
2078
2079
2080
2081     cout << "PreShower clusters " << endl ;
2082
2083     cout << " Index  Ene(MeV)   Multi  Module     phi     r  theta    Lambda 1   Lambda 2  # of prim  Primaries list "      <<  endl;
2084
2085
2086
2087     for (index = 0 ; index < preshoRecPoints->GetEntries() ; index++) {
2088
2089       AliEMCALTowerRecPoint * rp = dynamic_cast<AliEMCALTowerRecPoint *>(preshoRecPoints->At(index)) ;
2090
2091       TVector3  globalpos;
2092
2093       rp->GetGlobalPosition(globalpos);
2094
2095       Float_t lambda[2];
2096
2097       rp->GetElipsAxis(lambda);
2098
2099       Int_t * primaries;
2100
2101       Int_t nprimaries;
2102
2103       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
2104
2105
2106
2107       cout << setw(4) << rp->GetIndexInList() << "   "
2108
2109            << setw(7) << setprecision(3) << rp->GetEnergy() << "      "
2110
2111            << setw(3) << rp->GetMultiplicity() << "      "
2112
2113            << setw(1) << rp->GetEMCALArm() << "     "
2114
2115            << setw(5) << setprecision(4) << globalpos.X() << "  "
2116
2117            << setw(5) << setprecision(4) << globalpos.Y() << "  "
2118
2119            << setw(5) << setprecision(4) << globalpos.Z() << "     "
2120
2121            << setw(4) << setprecision(2) << lambda[0]  << "  "
2122
2123            << setw(4) << setprecision(2) << lambda[1]  << "  "
2124
2125            << setw(2) << nprimaries << "  " ;
2126
2127
2128
2129       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++)
2130
2131         cout << setw(4) <<   primaries[iprimary] << "  "  ;
2132
2133       cout << endl ;
2134
2135     }
2136
2137
2138
2139     cout << "-----------------------------------------------------------------------"<<endl ;
2140
2141   }
2142
2143 }
2144
2145
2146