EMCAL/AliEMCALDigitizer.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //_________________________________________________________________________
  19 //
  20 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  21 // Class performs digitization of Summable digits
  22 //
  23 // In addition it performs mixing of summable digits from different events.
  24 //
  25 // For each event two branches are created in TreeD:
  26 //   "EMCAL" - list of digits
  27 //   "AliEMCALDigitizer" - AliEMCALDigitizer with all parameters used in digitization
  28 //
  29 // Note, that one cset title for new digits branch, and repeat digitization with
  30 // another set of parameters.
  31 //
  32 // Examples of use:
  33 // root[0] AliEMCALDigitizer * d = new AliEMCALDigitizer() ;
  34 // root[1] d->ExecuteTask()
  35 // Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  36 //                       //Digitizes SDigitis in all events found in file galice.root
  37 //
  38 // root[2] AliEMCALDigitizer * d1 = new AliEMCALDigitizer("galice1.root") ;
  39 //                       // Will read sdigits from galice1.root
  40 // root[3] d1->MixWith("galice2.root")
  41 // Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  42 //                       // Reads another portion of sdigits from galice2.root
  43 // root[3] d1->MixWith("galice3.root")
  44 //                       // Reads another portion of sdigits from galice3.root
  45 // root[4] d->ExecuteTask("deb timing")
  46 //                       // Reads SDigits from files galice1.root, galice2.root ....
  47 //                       // mixes them and stores produced Digits in file galice1.root
  48 //                       // deb - prints number of produced digits
  49 //                       // deb all - prints list of produced digits
  50 //                       // timing  - prints time used for digitization
  51 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  52 //
  53 //*-- Author: Sahal Yacoob (LBL)
  54 // based on : AliEMCALDigitizer
  55 //_________________________________________________________________________________
  56
  57 // --- ROOT system ---
  58 #include "TFile.h"
  59 #include "TTree.h"
  60 #include "TSystem.h"
  61 #include "TROOT.h"
  62 #include "TFolder.h"
  63 #include "TObjString.h"
  64 #include "TGeometry.h"
  65 #include "TBenchmark.h"
  66 // --- Standard library ---
  67 #include <iomanip.h>
  68
  69 // --- AliRoot header files ---
  70
  71 #include "AliRun.h"
  72 #include "AliHeader.h"
  73 #include "AliEMCALDigit.h"
  74 #include "AliEMCALHit.h"
  75 #include "AliEMCALTick.h"
  76 #include "AliEMCALv1.h"
  77 #include "AliEMCALDigitizer.h"
  78 #include "AliEMCALSDigitizer.h"
  79 #include "AliEMCALGeometry.h"
  80 #include "AliEMCALGetter.h"
  81 #include "AliRunDigitizer.h"
  82 ClassImp(AliEMCALDigitizer)
  83
  84
  85 //____________________________________________________________________________
  86   AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer()
  87 {
  88   // ctor
  89
  90   InitParameters() ;
  91
  92 }
  93
  94 //____________________________________________________________________________
  95 AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer(const char *headerFile,const char *name)
  96 {
  97   SetName(name) ;
  98   SetTitle(headerFile) ;
  99   fManager = 0 ;                     // We work in the standalong mode
 100   fSplitFile= 0 ;
 101   InitParameters() ;
 102   Init() ;
 103
 104 }
 105
 106 //____________________________________________________________________________
 107 AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer(AliRunDigitizer * ard):AliDigitizer(ard)
 108 {
 109   // ctor
 110   SetName("Default");
 111   SetTitle("aliroot") ;
 112 }
 113
 114 //____________________________________________________________________________
 115   AliEMCALDigitizer::~AliEMCALDigitizer()
 116 {
 117   // dtor
 118   // gime=0 if Digitizer created by default ctor (to get just the parameters)
 119
 120   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 121
 122   if (gime) {
 123     // remove the task from the folder list
 124     gime->RemoveTask("S",GetName()) ;
 125     gime->RemoveTask("D",GetName()) ;
 126
 127     // remove the Digits from the folder list
 128     gime->RemoveObjects("D", GetName()) ;
 129
 130     // remove the SDigits from the folder list
 131     gime->RemoveSDigits() ;
 132
 133     // Delete gAlice
 134     gime->CloseFile() ;
 135
 136     fSplitFile = 0 ;
 137   }
 138 }
 139
 140 //____________________________________________________________________________
 141 void AliEMCALDigitizer::InitParameters()
 142 {
 143   fSDigitizer = 0 ;
 144   fNinputs = 1 ;
 145   fPinNoise = 0.00001 ;
 146   fTowerDigitThreshold = 0.001 ;
 147   fTimeResolution     = 0.5e-9 ;
 148   fTimeSignalLength   = 1.0e-9 ;
 149   fPreShowerDigitThreshold = fTowerDigitThreshold/25. ;
 150   fInitialized = kFALSE ;
 151   fADCchannelTower = 0.000220;       // width of one ADC channel in GeV
 152   fADCpedestalTower = 0.005 ;      // GeV
 153   fNADCTower = (Int_t) TMath::Power(2,16) ;  // number of channels in Tower ADC
 154
 155   fADCchannelPreSho = 0.0000300;          // width of one ADC channel in Pre Shower
 156   fADCpedestalPreSho = 0.005 ;         //
 157   fNADCPreSho = (Int_t) TMath::Power(2,12);      // number of channels in Pre ShowerADC
 158
 159   fTimeThreshold = 0.001*10000000 ; //Means 1 MeV in terms of SDigits amplitude
 160
 161 }
 162
 163 //____________________________________________________________________________
 164 Bool_t AliEMCALDigitizer::Init()
 165 {
 166   // Makes all memory allocations
 167
 168   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance(GetTitle(), GetName(), "update") ;
 169   if ( gime == 0 ) {
 170     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::Init -> Could not obtain the Getter object !" << endl ;
 171     return kFALSE;
 172   }
 173
 174   //const AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
 175   //fEmcCrystals = geom->GetNModules() *  geom->GetNCristalsInModule() ;
 176
 177   // Post Digits to the white board
 178   gime->PostDigits(GetName() ) ;
 179
 180   // Post Digitizer to the white board
 181   gime->PostDigitizer(this) ;
 182
 183   //Mark that we will use current header file
 184   if(!fManager){
 185     gime->PostSDigits(GetName(),GetTitle()) ;
 186     gime->PostSDigitizer(GetName(),GetTitle()) ;
 187   }
 188   return kTRUE ;
 189
 190 }
 191
 192 //____________________________________________________________________________
 193 void AliEMCALDigitizer::Reset() {
 194   //sets current event number to the first simulated event
 195 if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 196   Init() ;
 197
 198       // Int_t inputs ;
 199       // for(inputs = 0; inputs < fNinputs ;inputs++)
 200       //  fIevent->AddAt(-1, inputs ) ;
 201
 202 }
 203
 204 //____________________________________________________________________________
 205 void AliEMCALDigitizer::Digitize(const Int_t event) {
 206
 207   // Makes the digitization of the collected summable digits
 208   // for this it first creates the array of all EMCAL modules
 209   // filled with noise (different for EMC, CPV and PPSD) and
 210   // after that adds contributions from SDigits. This design
 211   // helps to avoid scanning over the list of digits to add
 212   // contribution of any new SDigit.
 213
 214   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 215   TClonesArray * digits = gime->Digits(GetName()) ;
 216
 217   digits->Clear() ;
 218
 219     const AliEMCALGeometry *geom = gime->EMCALGeometry() ;
 220
 221
 222   //Making digits with noise, first EMC
 223   Int_t nEMC = 2*geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();
 224   Int_t absID ;
 225   TString name      =  geom->GetName() ;
 226
 227  // get first the sdigitizer from the tasks list (must have same name as the digitizer)
 228   const AliEMCALSDigitizer * sDigitizer = gime->SDigitizer(GetName());
 229   if ( !sDigitizer) {
 230     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::Digitize -> SDigitizer with name " << GetName() << " not found " << endl ;
 231     abort() ;
 232   }
 233 // loop through the sdigits posted to the White Board and add them to the noise
 234   TCollection * folderslist = gime->SDigitsFolder()->GetListOfFolders() ;
 235   TIter next(folderslist) ;
 236   TFolder * folder = 0 ;
 237   TClonesArray * sdigits = 0 ;
 238   Int_t input = 0 ;
 239   TObjArray * sdigArray = new TObjArray(2) ;
 240   while ( (folder = (TFolder*)next()) ) {
 241     if ( (sdigits = (TClonesArray*)folder->FindObject(GetName()) ) ) {
 242       TString fileName(folder->GetName()) ;
 243       fileName.ReplaceAll("_","/") ;
 244       cout << "INFO: AliEMCALDigitizer::Digitize -> Adding SDigits "
 245            << GetName() << " from " << fileName << endl ;
 246       sdigArray->AddAt(sdigits, input) ;
 247       input++ ;
 248     }
 249   }
 250
 251   //Find the first tower with signal
 252   Int_t nextSig = 200000 ;
 253   Int_t i;
 254   for(i=0; i<input; i++){
 255     sdigits = (TClonesArray *)sdigArray->At(i) ;
 256     if ( !sdigits->GetEntriesFast() )
 257       continue ;
 258     Int_t curNext = ((AliEMCALDigit *)sdigits->At(0))->GetId() ;
 259      if(curNext < nextSig)
 260        nextSig = curNext ;
 261   }
 262
 263   TArrayI index(input) ;
 264   index.Reset() ;  //Set all indexes to zero
 265
 266   AliEMCALDigit * digit = 0 ;
 267   AliEMCALDigit * curSDigit = 0 ;
 268
 269   TClonesArray * ticks = new TClonesArray("AliEMCALTick",1000) ;
 270
 271   //Put Noise contribution
 272   for(absID = 1; absID <= nEMC; absID++){
 273     Float_t noise = gRandom->Gaus(0., fPinNoise);
 274     new((*digits)[absID-1]) AliEMCALDigit( -1, -1, absID,sDigitizer->Digitize(noise), TimeOfNoise() ) ;
 275     //look if we have to add signal?
 276     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(absID-1) ;
 277     if(absID==nextSig){
 278       //Add SDigits from all inputs
 279       ticks->Clear() ;
 280       Int_t contrib = 0 ;
 281       Float_t a = digit->GetAmp() ;
 282       Float_t b = TMath::Abs( a /fTimeSignalLength) ;
 283       //Mark the beginnign of the signal
 284       new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(digit->GetTime(),0, b);
 285       //Mark the end of the ignal
 286       new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(digit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b);
 287
 288  // loop over input
 289
 290       for(i = 0; i< input ; i++){  //loop over (possible) merge sources
 291         if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 292           curSDigit = (AliEMCALDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;
 293         else
 294           curSDigit = 0 ;
 295         //May be several digits will contribute from the same input
 296         while(curSDigit && curSDigit->GetId() == absID){
 297           //Shift primary to separate primaries belonging different inputs
 298           Int_t primaryoffset ;
 299           if(fManager)
 300             primaryoffset = fManager->GetMask(i) ;
 301           else
 302             primaryoffset = i ;
 303           curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
 304
 305           a = curSDigit->GetAmp() ;
 306           b = a /fTimeSignalLength ;
 307           new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(curSDigit->GetTime(),0, b);
 308           new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(curSDigit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b);
 309
 310           *digit = *digit + *curSDigit ;  //add energies
 311
 312           index[i]++ ;
 313           if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 314             curSDigit = (AliEMCALDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;
 315           else
 316             curSDigit = 0 ;
 317         }
 318       }
 319
 320 //calculate and set time
 321       Float_t time = FrontEdgeTime(ticks) ;
 322       digit->SetTime(time) ;
 323
 324       //Find next signal module
 325       nextSig = 200000 ;
 326       for(i=0; i<input; i++){
 327         sdigits = ((TClonesArray *)sdigArray->At(i)) ;
 328         Int_t curNext = nextSig ;
 329         if(sdigits->GetEntriesFast() > index[i] ){
 330           curNext = ((AliEMCALDigit *) sdigits->At(index[i]))->GetId() ;
 331
 332         }
 333         if(curNext < nextSig) nextSig = curNext ;
 334       }
 335     }
 336   }
 337
 338   ticks->Delete() ;
 339   delete ticks ;
 340
 341
 342
 343
 344   //remove digits below thresholds
 345
 346   for(absID = 0; absID < nEMC/2 ; absID++){
 347    if(sDigitizer->Calibrate(((AliEMCALDigit*)digits->At(absID))->GetAmp()) < fTowerDigitThreshold)
 348       digits->RemoveAt(absID) ;
 349     else
 350       digit->SetTime(gRandom->Gaus(digit->GetTime(),fTimeResolution) ) ;
 351   }
 352
 353   for(absID = nEMC/2; absID < nEMC ; absID++){
 354
 355     if(sDigitizer->Calibrate(((AliEMCALDigit*)digits->At(absID))->GetAmp()) < fPreShowerDigitThreshold)
 356       digits->RemoveAt(absID) ;
 357     else
 358       digit->SetTime(gRandom->Gaus(digit->GetTime(),fTimeResolution) ) ;
 359   }
 360
 361   digits->Compress() ;
 362
 363   Int_t ndigits = digits->GetEntriesFast() ;
 364
 365   digits->Expand(ndigits) ;
 366
 367
 368   //Set indexes in list of digits
 369   //Int_t i ;
 370  for (i = 0 ; i < ndigits ; i++) {
 371     AliEMCALDigit * digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(i) ;
 372     digit->SetIndexInList(i) ;
 373     Float_t energy = sDigitizer->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
 374     digit->SetAmp(DigitizeEnergy(energy,digit->GetId()) ) ;
 375   }
 376 }
 377
 378 //____________________________________________________________________________
 379
 380 Int_t AliEMCALDigitizer::DigitizeEnergy(Float_t energy, Int_t absId)
 381 {
 382   Int_t channel = -999;
 383   Int_t nphi = AliEMCALGetter::GetInstance()->EMCALGeometry()->GetNPhi() ;
 384   Int_t nz   = AliEMCALGetter::GetInstance()->EMCALGeometry()->GetNZ() ;
 385
 386   if(absId <= nphi*nz){  //digitize as tower
 387     channel = static_cast<Int_t> (TMath::Ceil( (energy + fADCpedestalTower)/fADCchannelTower ))  ;
 388   if(channel > fNADCTower )
 389     channel =  fNADCTower ;
 390   } else {
 391     channel =  static_cast<Int_t>(TMath::Ceil( (energy + fADCpedestalPreSho)/fADCchannelPreSho ))  ;
 392   if(channel > fNADCPreSho )
 393     channel =  fNADCPreSho ;
 394   }
 395
 396   return channel ;
 397 }
 398
 399 //____________________________________________________________________________
 400 void AliEMCALDigitizer::Exec(Option_t *option) {
 401   // Managing method
 402 if(strcmp(GetName(), "") == 0 )
 403     Init() ;
 404
 405   if (strstr(option,"print")) {
 406     Print("");
 407     return ;
 408   }
 409
 410   if(strstr(option,"tim"))
 411     gBenchmark->Start("EMCALDigitizer");
 412
 413   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 414
 415   Int_t nevents ;
 416
 417   TTree * treeD ;
 418
 419   if(fManager){
 420     treeD = fManager->GetTreeD() ;
 421     nevents = 1 ;    // Will process only one event
 422   }
 423   else {
 424     gAlice->GetEvent(0) ;
 425     nevents = (Int_t) gAlice->TreeE()->GetEntries() ;
 426     treeD=gAlice->TreeD() ;
 427   }
 428
 429
 430   //Check, if this branch already exits
 431   if (treeD) {
 432     TObjArray * lob = (TObjArray*)treeD->GetListOfBranches() ;
 433     TIter next(lob) ;
 434     TBranch * branch = 0 ;
 435     Bool_t emcalfound = kFALSE, digitizerfound = kFALSE ;
 436
 437     while ( (branch = (TBranch*)next()) && (!emcalfound || !digitizerfound) ) {
 438       if ( (strcmp(branch->GetName(), "EMCAL")==0) &&
 439            (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) )
 440         emcalfound = kTRUE ;
 441
 442       else if ( (strcmp(branch->GetName(), "AliEMCALDigitizer")==0) &&
 443                 (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) )
 444         digitizerfound = kTRUE ;
 445     }
 446
 447     if ( emcalfound ) {
 448       cerr << "WARNING: AliEMCALDigitizer -> Digits branch with name " << GetName()
 449            << " already exits" << endl ;
 450       return ;
 451     }
 452     if ( digitizerfound ) {
 453       cerr << "WARNING: AliEMCALDigitizer -> Digitizer branch with name " << GetName()
 454            << " already exits" << endl ;
 455       return ;
 456     }
 457   }
 458   Int_t ievent ;
 459
 460   for(ievent = 0; ievent < nevents; ievent++){
 461
 462     if(fManager){
 463       Int_t input ;
 464       for(input = 0 ; input < fManager->GetNinputs(); input ++){
 465         TTree * treeS = fManager->GetInputTreeS(input) ;
 466         if(!treeS){
 467           cerr << "AliEMCALDigitizer -> No Input " << endl ;
 468           return ;
 469         }
 470         gime->ReadTreeS(treeS,input) ;
 471       }
 472     }
 473     else
 474       gime->Event(ievent,"S") ;
 475
 476     Digitize(ievent) ; //Add prepared SDigits to digits and add the noise
 477
 478     WriteDigits(ievent) ;
 479
 480     if(strstr(option,"deb"))
 481       PrintDigits(option);
 482
 483     //increment the total number of Digits per run
 484     fDigitsInRun += gime->Digits()->GetEntriesFast() ;
 485   }
 486
 487   if(strstr(option,"tim")){
 488     gBenchmark->Stop("EMCALDigitizer");
 489     cout << "AliEMCALDigitizer:" << endl ;
 490     cout << "  took " << gBenchmark->GetCpuTime("EMCALDigitizer") << " seconds for Digitizing "
 491          <<  gBenchmark->GetCpuTime("EMCALDigitizer")/nevents << " seconds per event " << endl ;
 492     cout << endl ;
 493   }
 494
 495 }
 496
 497
 498
 499 //__________________________________________________________________
 500 void AliEMCALDigitizer::MixWith(char* headerFile){
 501   // Alows produce digits by superimposing background and signal event.
 502   // It is assumed, that headers file with SIGNAL events is opened in
 503   // constructor, and now we set the BACKGROUND event, with which we
 504   // will mix. Thus we avoid writing (changing) huge and expencive
 505   // backgound files: all output will be writen into SIGNAL, i.e.
 506   // opened in constructor file.
 507   //
 508   // One can open as many files to mix with as one wants.
 509
 510 if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 511     Init() ;
 512
 513  if(fManager){
 514     cout << "Can not use this method under AliRunDigitizer " << endl ;
 515     return ;
 516   } // check if the specified SDigits do not already exist on the White Board:
 517   // //Folders/RunMC/Event/Data/EMCAL/SDigits/headerFile/sdigitsname
 518
 519   TString path = "Folders/RunMC/Event/Data/EMCAL/SDigits" ;
 520   path += headerFile ;
 521   path += "/" ;
 522   path += GetName() ;
 523   if ( gROOT->FindObjectAny(path.Data()) ) {
 524     cerr << "WARNING: AliEMCALDigitizer::MixWith -> Entry already exists, do not add" << endl ;
 525     return;
 526   }
 527
 528   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 529   gime->PostSDigits(GetName(),headerFile) ;
 530
 531   // check if the requested file is already open or exist and if SDigits Branch exist
 532   TFile * file = (TFile*)gROOT->FindObject(headerFile);
 533   if ( !file ) {
 534     file = new TFile(headerFile, "READ") ;
 535     if (!file) {
 536       cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::MixWith -> File " << headerFile << " does not exist!" << endl ;
 537       return ;
 538     }
 539   }
 540
 541 }
 542
 543 //__________________________________________________________________
 544 void AliEMCALDigitizer::Print(Option_t* option)const {
 545   if( strcmp(GetName(), "") != 0) {
 546
 547     cout << "------------------- "<< GetName() << " -------------" << endl ;
 548     cout << "Digitizing sDigits from file(s): " <<endl ;
 549
 550   TCollection * folderslist = ((TFolder*)gROOT->FindObjectAny("Folders/RunMC/Event/Data/EMCAL/SDigits"))->GetListOfFolders() ;
 551     TIter next(folderslist) ;
 552     TFolder * folder = 0 ;
 553     while ( (folder = (TFolder*)next()) )
 554       if ( folder->FindObject(GetName())  )
 555         {
 556         cout << "Adding SDigits " << GetName() << " from " << folder->GetName() << endl ;
 557       cout << endl ;
 558       cout << "Writing digits to " << GetTitle() << endl ;
 559
 560       cout << endl ;
 561       cout << "With following parameters: " << endl ;
 562       cout << "     Electronics noise in EMC (fPinNoise) = " << fPinNoise << endl ;
 563       cout << "  Threshold  in EMC  (fTowerDigitThreshold) = " << fTowerDigitThreshold  << endl;
 564       cout << "  Threshold  in PreShower  (fPreShowerDigitThreshold) = " << fPreShowerDigitThreshold  << endl ; ;
 565       cout << "---------------------------------------------------" << endl ;
 566     }
 567     else
 568       cout << "AliEMCALDigitizer not initialized " << endl ;
 569     }
 570 }
 571
 572 //__________________________________________________________________
 573 void AliEMCALDigitizer::PrintDigits(Option_t * option){
 574
 575   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 576   TClonesArray * fDigits = gime->Digits() ;
 577
 578   cout << "AliEMCALDigitiser:"<< endl ;
 579   cout << "       Number of entries in Digits list " << fDigits->GetEntriesFast() << endl ;
 580   cout << endl ;
 581   if(strstr(option,"all")){
 582
 583     //loop over digits
 584     AliEMCALDigit * digit;
 585     cout << "Digit Id " << " Amplitude " <<  " Index "  <<  " Nprim " << " Primaries list " <<  endl;
 586     Int_t index ;
 587     for (index = 0 ; index < fDigits->GetEntries() ; index++) {
 588       digit = (AliEMCALDigit * )  fDigits->At(index) ;
 589       cout << setw(8)  <<  digit->GetId() << " "  <<    setw(3)  <<  digit->GetAmp() <<   "  "
 590            << setw(6)  <<  digit->GetIndexInList() << "  "
 591            << setw(5)  <<  digit->GetNprimary() <<"  ";
 592
 593       Int_t iprimary;
 594       for (iprimary=0; iprimary<digit->GetNprimary(); iprimary++)
 595         cout << setw(5)  <<  digit->GetPrimary(iprimary+1) << " ";
 596       cout << endl;
 597     }
 598
 599   }
 600 }
 601 //_________________________________________________________________________________________
 602 void AliEMCALDigitizer::WriteDigits(Int_t event)
 603 {
 604
 605   // Makes TreeD in the output file.
 606   // Check if branch already exists:
 607   //   if yes, exit without writing: ROOT TTree does not support overwriting/updating of
 608   //      already existing branches.
 609   //   else creates branch with Digits, named "EMCAL", title "...",
 610   //      and branch "AliEMCALDigitizer", with the same title to keep all the parameters
 611   //      and names of files, from which digits are made.
 612
 613   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 614   const TClonesArray * digits = gime->Digits(GetName()) ;
 615  TTree * treeD ;
 616
 617  if(fManager)
 618    treeD = fManager->GetTreeD() ;
 619  else {
 620    if (!gAlice->TreeD() )
 621      gAlice->MakeTree("D",fSplitFile);
 622    treeD = gAlice->TreeD();
 623  }
 624
 625  // -- create Digits branch
 626  Int_t bufferSize = 32000 ;
 627  TBranch * digitsBranch = treeD->Branch("EMCAL",&digits,bufferSize);
 628  digitsBranch->SetTitle(GetName());
 629
 630  // -- Create Digitizer branch
 631  Int_t splitlevel = 0 ;
 632  AliEMCALDigitizer * d = gime->Digitizer(GetName()) ;
 633  TBranch * digitizerBranch = treeD->Branch("AliEMCALDigitizer", "AliEMCALDigitizer", &d,bufferSize,splitlevel);
 634  digitizerBranch->SetTitle(GetName());
 635
 636  digitsBranch->Fill() ;
 637  digitizerBranch->Fill() ;
 638  treeD->AutoSave() ;
 639
 640 }
 641 //____________________________________________________________________________
 642 Float_t AliEMCALDigitizer::FrontEdgeTime(TClonesArray * ticks)
 643 { //
 644   ticks->Sort() ; //Sort in accordance with times of ticks
 645   TIter it(ticks) ;
 646   AliEMCALTick * ctick = (AliEMCALTick *) it.Next() ;
 647   Float_t time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;
 648
 649   AliEMCALTick * t ;
 650   while((t=(AliEMCALTick*) it.Next())){
 651     if(t->GetTime() < time)  //This tick starts before crossing
 652       *ctick+=*t ;
 653     else
 654       return time ;
 655
 656     time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;
 657   }
 658   return time ;
 659 }
 660 //____________________________________________________________________________
 661 Float_t AliEMCALDigitizer::TimeOfNoise(void)
 662 {  // Calculates the time signal generated by noise
 663   //to be rewritten, now returns just big number
 664   return 1. ;
 665
 666 }
 667 //____________________________________________________________________________
 668 void AliEMCALDigitizer::SetSDigitsBranch(const char* title)
 669 {
 670   // we set title (comment) of the SDigits branch in the first! header file
 671   if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 672     Init() ;
 673
 674   AliEMCALGetter::GetInstance()->SDigits()->SetName(title) ;
 675 }
 676
 677 //__________________________________________________________________
 678 void AliEMCALDigitizer::SetSplitFile(const TString splitFileName)
 679 {
 680   // Diverts the Digits in a file separate from the hits file
 681
 682   // I guess it is not going to work if we do merging
 683   if (fManager) {
 684     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::SetSplitFile -> Not yet available in case of merging activated " << endl ;
 685     return ;
 686   }
 687
 688   TDirectory * cwd = gDirectory ;
 689   if ( !(gAlice->GetTreeDFileName() == splitFileName) ) {
 690     if (gAlice->GetTreeDFile() )
 691       gAlice->GetTreeDFile()->Close() ;
 692   }
 693
 694   fSplitFile = gAlice->InitTreeFile("D",splitFileName.Data());
 695   fSplitFile->cd() ;
 696   gAlice->Write(0, TObject::kOverwrite);
 697
 698   TTree *treeE  = gAlice->TreeE();
 699   if (!treeE) {
 700     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::SetSplitFile -> No TreeE found "<<endl;
 701     abort() ;
 702   }
 703
 704   // copy TreeE
 705   AliHeader *header = new AliHeader();
 706   treeE->SetBranchAddress("Header", &header);
 707   treeE->SetBranchStatus("*",1);
 708   TTree *treeENew =  treeE->CloneTree();
 709   treeENew->Write(0, TObject::kOverwrite);
 710
 711   // copy AliceGeom
 712   TGeometry *AliceGeom = static_cast<TGeometry*>(cwd->Get("AliceGeom"));
 713   if (!AliceGeom) {
 714     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::SetSplitFile -> AliceGeom was not found in the input file "<<endl;
 715     abort() ;
 716   }
 717   AliceGeom->Write(0, TObject::kOverwrite);
 718
 719   gAlice->MakeTree("D",fSplitFile);
 720   cwd->cd() ;
 721   cout << "INFO: AliEMCALDigitizer::SetSPlitMode -> Digits will be stored in " << splitFileName.Data() << endl ;
 722 }