EMCAL/AliEMCALDigitizer.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //_________________________________________________________________________
  19 //
  20 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  21 // Class performs digitization of Summable digits
  22 //
  23 // In addition it performs mixing of summable digits from different events.
  24 //
  25 // For each event two branches are created in TreeD:
  26 //   "EMCAL" - list of digits
  27 //   "AliEMCALDigitizer" - AliEMCALDigitizer with all parameters used in digitization
  28 //
  29 // Note, that one cset title for new digits branch, and repeat digitization with
  30 // another set of parameters.
  31 //
  32 // Examples of use:
  33 // root[0] AliEMCALDigitizer * d = new AliEMCALDigitizer() ;
  34 // root[1] d->ExecuteTask()
  35 // Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  36 //                       //Digitizes SDigitis in all events found in file galice.root
  37 //
  38 // root[2] AliEMCALDigitizer * d1 = new AliEMCALDigitizer("galice1.root") ;
  39 //                       // Will read sdigits from galice1.root
  40 // root[3] d1->MixWith("galice2.root")
  41 // Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  42 //                       // Reads another portion of sdigits from galice2.root
  43 // root[3] d1->MixWith("galice3.root")
  44 //                       // Reads another portion of sdigits from galice3.root
  45 // root[4] d->ExecuteTask("deb timing")
  46 //                       // Reads SDigits from files galice1.root, galice2.root ....
  47 //                       // mixes them and stores produced Digits in file galice1.root
  48 //                       // deb - prints number of produced digits
  49 //                       // deb all - prints list of produced digits
  50 //                       // timing  - prints time used for digitization
  51 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  52 //
  53 //*-- Author: Sahal Yacoob (LBL)
  54 // based on : AliEMCALDigitizer
  55 //_________________________________________________________________________________
  56
  57 // --- ROOT system ---
  58 #include "TFile.h"
  59 #include "TTree.h"
  60 #include "TSystem.h"
  61 #include "TROOT.h"
  62 #include "TFolder.h"
  63 #include "TObjString.h"
  64 #include "TGeometry.h"
  65 #include "TBenchmark.h"
  66 // --- Standard library ---
  67 #include <iomanip.h>
  68
  69 // --- AliRoot header files ---
  70
  71 #include "AliRun.h"
  72 #include "AliHeader.h"
  73 #include "AliEMCALDigit.h"
  74 #include "AliEMCALHit.h"
  75 #include "AliEMCALTick.h"
  76 #include "AliEMCALv1.h"
  77 #include "AliEMCALDigitizer.h"
  78 #include "AliEMCALSDigitizer.h"
  79 #include "AliEMCALGeometry.h"
  80 #include "AliEMCALGetter.h"
  81 #include "AliRunDigitizer.h"
  82 ClassImp(AliEMCALDigitizer)
  83
  84
  85 //____________________________________________________________________________
  86   AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer()
  87 {
  88   // ctor
  89
  90   InitParameters() ;
  91   fDefaultInit = kTRUE ;
  92
  93 }
  94
  95 //____________________________________________________________________________
  96 AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer(const char *headerFile,const char *name)
  97 {
  98   SetName(name) ;
  99   SetTitle(headerFile) ;
 100   fManager = 0 ;                     // We work in the standalong mode
 101   fSplitFile= 0 ;
 102   InitParameters() ;
 103   Init() ;
 104   fDefaultInit = kFALSE ;
 105
 106 }
 107
 108 //____________________________________________________________________________
 109 AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer(AliRunDigitizer * ard):AliDigitizer(ard)
 110 {
 111   // ctor
 112   SetName("Default");
 113   SetTitle("aliroot") ;
 114 }
 115
 116 //____________________________________________________________________________
 117   AliEMCALDigitizer::~AliEMCALDigitizer()
 118 {
 119   // dtor
 120   // fDefaultInit = kTRUE if Digitizer created by default ctor (to get just the parameters)
 121
 122   if (!fDefaultInit) {
 123     AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 124
 125     // remove the task from the folder list
 126     gime->RemoveTask("S",GetName()) ;
 127     gime->RemoveTask("D",GetName()) ;
 128
 129     // remove the Digits from the folder list
 130     gime->RemoveObjects("D", GetName()) ;
 131
 132     // remove the SDigits from the folder list
 133     gime->RemoveSDigits() ;
 134
 135     // Delete gAlice
 136     gime->CloseFile() ;
 137
 138     fSplitFile = 0 ;
 139   }
 140 }
 141
 142 //____________________________________________________________________________
 143 void AliEMCALDigitizer::InitParameters()
 144 {
 145   fSDigitizer = 0 ;
 146   fNinputs = 1 ;
 147   fPinNoise = 0.00001 ;
 148   fTowerDigitThreshold = 0.001 ;
 149   fTimeResolution     = 0.5e-9 ;
 150   fTimeSignalLength   = 1.0e-9 ;
 151   fPreShowerDigitThreshold = fTowerDigitThreshold/25. ;
 152   fInitialized = kFALSE ;
 153   fADCchannelTower = 0.000220;       // width of one ADC channel in GeV
 154   fADCpedestalTower = 0.005 ;      // GeV
 155   fNADCTower = (Int_t) TMath::Power(2,16) ;  // number of channels in Tower ADC
 156
 157   fADCchannelPreSho = 0.0000300;          // width of one ADC channel in Pre Shower
 158   fADCpedestalPreSho = 0.005 ;         //
 159   fNADCPreSho = (Int_t) TMath::Power(2,12);      // number of channels in Pre ShowerADC
 160
 161   fTimeThreshold = 0.001*10000000 ; //Means 1 MeV in terms of SDigits amplitude
 162
 163 }
 164
 165 //____________________________________________________________________________
 166 Bool_t AliEMCALDigitizer::Init()
 167 {
 168   // Makes all memory allocations
 169
 170   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance(GetTitle(), GetName(), "update") ;
 171   if ( gime == 0 ) {
 172     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::Init -> Could not obtain the Getter object !" << endl ;
 173     return kFALSE;
 174   }
 175
 176   //const AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
 177   //fEmcCrystals = geom->GetNModules() *  geom->GetNCristalsInModule() ;
 178
 179   // Post Digits to the white board
 180   gime->PostDigits(GetName() ) ;
 181
 182   // Post Digitizer to the white board
 183   gime->PostDigitizer(this) ;
 184
 185   //Mark that we will use current header file
 186   if(!fManager){
 187     gime->PostSDigits(GetName(),GetTitle()) ;
 188     gime->PostSDigitizer(GetName(),GetTitle()) ;
 189   }
 190   return kTRUE ;
 191
 192 }
 193
 194 //____________________________________________________________________________
 195 void AliEMCALDigitizer::Reset() {
 196   //sets current event number to the first simulated event
 197 if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 198   Init() ;
 199
 200       // Int_t inputs ;
 201       // for(inputs = 0; inputs < fNinputs ;inputs++)
 202       //  fIevent->AddAt(-1, inputs ) ;
 203
 204 }
 205
 206 //____________________________________________________________________________
 207 void AliEMCALDigitizer::Digitize(const Int_t event) {
 208
 209   // Makes the digitization of the collected summable digits
 210   // for this it first creates the array of all EMCAL modules
 211   // filled with noise (different for EMC, CPV and PPSD) and
 212   // after that adds contributions from SDigits. This design
 213   // helps to avoid scanning over the list of digits to add
 214   // contribution of any new SDigit.
 215
 216   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 217   TClonesArray * digits = gime->Digits(GetName()) ;
 218
 219   digits->Clear() ;
 220
 221     const AliEMCALGeometry *geom = gime->EMCALGeometry() ;
 222
 223
 224   //Making digits with noise, first EMC
 225   Int_t nEMC = 2*geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();
 226   Int_t absID ;
 227   TString name      =  geom->GetName() ;
 228
 229  // get first the sdigitizer from the tasks list (must have same name as the digitizer)
 230   const AliEMCALSDigitizer * sDigitizer = gime->SDigitizer(GetName());
 231   if ( !sDigitizer) {
 232     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::Digitize -> SDigitizer with name " << GetName() << " not found " << endl ;
 233     abort() ;
 234   }
 235 // loop through the sdigits posted to the White Board and add them to the noise
 236   TCollection * folderslist = gime->SDigitsFolder()->GetListOfFolders() ;
 237   TIter next(folderslist) ;
 238   TFolder * folder = 0 ;
 239   TClonesArray * sdigits = 0 ;
 240   Int_t input = 0 ;
 241   TObjArray * sdigArray = new TObjArray(2) ;
 242   while ( (folder = (TFolder*)next()) ) {
 243     if ( (sdigits = (TClonesArray*)folder->FindObject(GetName()) ) ) {
 244       TString fileName(folder->GetName()) ;
 245       fileName.ReplaceAll("_","/") ;
 246       cout << "INFO: AliEMCALDigitizer::Digitize -> Adding SDigits "
 247            << GetName() << " from " << fileName << endl ;
 248       sdigArray->AddAt(sdigits, input) ;
 249       input++ ;
 250     }
 251   }
 252
 253   //Find the first tower with signal
 254   Int_t nextSig = 200000 ;
 255   Int_t i;
 256   for(i=0; i<input; i++){
 257     sdigits = (TClonesArray *)sdigArray->At(i) ;
 258     if ( !sdigits->GetEntriesFast() )
 259       continue ;
 260     Int_t curNext = ((AliEMCALDigit *)sdigits->At(0))->GetId() ;
 261      if(curNext < nextSig)
 262        nextSig = curNext ;
 263   }
 264
 265   TArrayI index(input) ;
 266   index.Reset() ;  //Set all indexes to zero
 267
 268   AliEMCALDigit * digit = 0 ;
 269   AliEMCALDigit * curSDigit = 0 ;
 270
 271   TClonesArray * ticks = new TClonesArray("AliEMCALTick",1000) ;
 272
 273   //Put Noise contribution
 274   for(absID = 1; absID <= nEMC; absID++){
 275     Float_t noise = gRandom->Gaus(0., fPinNoise);
 276     new((*digits)[absID-1]) AliEMCALDigit( -1, -1, absID,sDigitizer->Digitize(noise), TimeOfNoise() ) ;
 277     //look if we have to add signal?
 278     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(absID-1) ;
 279     if(absID==nextSig){
 280       //Add SDigits from all inputs
 281       ticks->Clear() ;
 282       Int_t contrib = 0 ;
 283       Float_t a = digit->GetAmp() ;
 284       Float_t b = TMath::Abs( a /fTimeSignalLength) ;
 285       //Mark the beginnign of the signal
 286       new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(digit->GetTime(),0, b);
 287       //Mark the end of the ignal
 288       new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(digit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b);
 289
 290  // loop over input
 291
 292       for(i = 0; i< input ; i++){  //loop over (possible) merge sources
 293         if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 294           curSDigit = (AliEMCALDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;
 295         else
 296           curSDigit = 0 ;
 297         //May be several digits will contribute from the same input
 298         while(curSDigit && curSDigit->GetId() == absID){
 299           //Shift primary to separate primaries belonging different inputs
 300           Int_t primaryoffset ;
 301           if(fManager)
 302             primaryoffset = fManager->GetMask(i) ;
 303           else
 304             primaryoffset = i ;
 305           curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
 306
 307           a = curSDigit->GetAmp() ;
 308           b = a /fTimeSignalLength ;
 309           new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(curSDigit->GetTime(),0, b);
 310           new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(curSDigit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b);
 311
 312           *digit = *digit + *curSDigit ;  //add energies
 313
 314           index[i]++ ;
 315           if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 316             curSDigit = (AliEMCALDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;
 317           else
 318             curSDigit = 0 ;
 319         }
 320       }
 321
 322 //calculate and set time
 323       Float_t time = FrontEdgeTime(ticks) ;
 324       digit->SetTime(time) ;
 325
 326       //Find next signal module
 327       nextSig = 200000 ;
 328       for(i=0; i<input; i++){
 329         sdigits = ((TClonesArray *)sdigArray->At(i)) ;
 330         Int_t curNext = nextSig ;
 331         if(sdigits->GetEntriesFast() > index[i] ){
 332           curNext = ((AliEMCALDigit *) sdigits->At(index[i]))->GetId() ;
 333
 334         }
 335         if(curNext < nextSig) nextSig = curNext ;
 336       }
 337     }
 338   }
 339
 340   ticks->Delete() ;
 341   delete ticks ;
 342
 343
 344
 345
 346   //remove digits below thresholds
 347
 348   for(absID = 0; absID < nEMC/2 ; absID++){
 349    if(sDigitizer->Calibrate(((AliEMCALDigit*)digits->At(absID))->GetAmp()) < fTowerDigitThreshold)
 350       digits->RemoveAt(absID) ;
 351     else
 352       digit->SetTime(gRandom->Gaus(digit->GetTime(),fTimeResolution) ) ;
 353   }
 354
 355   for(absID = nEMC/2; absID < nEMC ; absID++){
 356
 357     if(sDigitizer->Calibrate(((AliEMCALDigit*)digits->At(absID))->GetAmp()) < fPreShowerDigitThreshold)
 358       digits->RemoveAt(absID) ;
 359     else
 360       digit->SetTime(gRandom->Gaus(digit->GetTime(),fTimeResolution) ) ;
 361   }
 362
 363   digits->Compress() ;
 364
 365   Int_t ndigits = digits->GetEntriesFast() ;
 366
 367   digits->Expand(ndigits) ;
 368
 369
 370   //Set indexes in list of digits
 371   //Int_t i ;
 372  for (i = 0 ; i < ndigits ; i++) {
 373     AliEMCALDigit * digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(i) ;
 374     digit->SetIndexInList(i) ;
 375     Float_t energy = sDigitizer->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
 376     digit->SetAmp(DigitizeEnergy(energy,digit->GetId()) ) ;
 377   }
 378 }
 379
 380 //____________________________________________________________________________
 381
 382 Int_t AliEMCALDigitizer::DigitizeEnergy(Float_t energy, Int_t absId)
 383 {
 384   Int_t channel = -999;
 385   Int_t nphi = AliEMCALGetter::GetInstance()->EMCALGeometry()->GetNPhi() ;
 386   Int_t nz   = AliEMCALGetter::GetInstance()->EMCALGeometry()->GetNZ() ;
 387
 388   if(absId <= nphi*nz){  //digitize as tower
 389     channel = static_cast<Int_t> (TMath::Ceil( (energy + fADCpedestalTower)/fADCchannelTower ))  ;
 390   if(channel > fNADCTower )
 391     channel =  fNADCTower ;
 392   } else {
 393     channel =  static_cast<Int_t>(TMath::Ceil( (energy + fADCpedestalPreSho)/fADCchannelPreSho ))  ;
 394   if(channel > fNADCPreSho )
 395     channel =  fNADCPreSho ;
 396   }
 397
 398   return channel ;
 399 }
 400
 401 //____________________________________________________________________________
 402 void AliEMCALDigitizer::Exec(Option_t *option) {
 403   // Managing method
 404 if(strcmp(GetName(), "") == 0 )
 405     Init() ;
 406
 407   if (strstr(option,"print")) {
 408     Print("");
 409     return ;
 410   }
 411
 412   if(strstr(option,"tim"))
 413     gBenchmark->Start("EMCALDigitizer");
 414
 415   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 416
 417   Int_t nevents ;
 418
 419   TTree * treeD ;
 420
 421   if(fManager){
 422     treeD = fManager->GetTreeD() ;
 423     nevents = 1 ;    // Will process only one event
 424   }
 425   else {
 426     gAlice->GetEvent(0) ;
 427     nevents = (Int_t) gAlice->TreeE()->GetEntries() ;
 428     treeD=gAlice->TreeD() ;
 429   }
 430
 431
 432   //Check, if this branch already exits
 433   if (treeD) {
 434     TObjArray * lob = (TObjArray*)treeD->GetListOfBranches() ;
 435     TIter next(lob) ;
 436     TBranch * branch = 0 ;
 437     Bool_t emcalfound = kFALSE, digitizerfound = kFALSE ;
 438
 439     while ( (branch = (TBranch*)next()) && (!emcalfound || !digitizerfound) ) {
 440       if ( (strcmp(branch->GetName(), "EMCAL")==0) &&
 441            (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) )
 442         emcalfound = kTRUE ;
 443
 444       else if ( (strcmp(branch->GetName(), "AliEMCALDigitizer")==0) &&
 445                 (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) )
 446         digitizerfound = kTRUE ;
 447     }
 448
 449     if ( emcalfound ) {
 450       cerr << "WARNING: AliEMCALDigitizer -> Digits branch with name " << GetName()
 451            << " already exits" << endl ;
 452       return ;
 453     }
 454     if ( digitizerfound ) {
 455       cerr << "WARNING: AliEMCALDigitizer -> Digitizer branch with name " << GetName()
 456            << " already exits" << endl ;
 457       return ;
 458     }
 459   }
 460   Int_t ievent ;
 461
 462   for(ievent = 0; ievent < nevents; ievent++){
 463
 464     if(fManager){
 465       Int_t input ;
 466       for(input = 0 ; input < fManager->GetNinputs(); input ++){
 467         TTree * treeS = fManager->GetInputTreeS(input) ;
 468         if(!treeS){
 469           cerr << "AliEMCALDigitizer -> No Input " << endl ;
 470           return ;
 471         }
 472         gime->ReadTreeS(treeS,input) ;
 473       }
 474     }
 475     else
 476       gime->Event(ievent,"S") ;
 477
 478     Digitize(ievent) ; //Add prepared SDigits to digits and add the noise
 479
 480     WriteDigits(ievent) ;
 481
 482     if(strstr(option,"deb"))
 483       PrintDigits(option);
 484
 485     //increment the total number of Digits per run
 486     fDigitsInRun += gime->Digits()->GetEntriesFast() ;
 487   }
 488
 489   if(strstr(option,"tim")){
 490     gBenchmark->Stop("EMCALDigitizer");
 491     cout << "AliEMCALDigitizer:" << endl ;
 492     cout << "  took " << gBenchmark->GetCpuTime("EMCALDigitizer") << " seconds for Digitizing "
 493          <<  gBenchmark->GetCpuTime("EMCALDigitizer")/nevents << " seconds per event " << endl ;
 494     cout << endl ;
 495   }
 496
 497 }
 498
 499
 500
 501 //__________________________________________________________________
 502 void AliEMCALDigitizer::MixWith(char* headerFile){
 503   // Alows produce digits by superimposing background and signal event.
 504   // It is assumed, that headers file with SIGNAL events is opened in
 505   // constructor, and now we set the BACKGROUND event, with which we
 506   // will mix. Thus we avoid writing (changing) huge and expencive
 507   // backgound files: all output will be writen into SIGNAL, i.e.
 508   // opened in constructor file.
 509   //
 510   // One can open as many files to mix with as one wants.
 511
 512 if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 513     Init() ;
 514
 515  if(fManager){
 516     cout << "Can not use this method under AliRunDigitizer " << endl ;
 517     return ;
 518   } // check if the specified SDigits do not already exist on the White Board:
 519   // //Folders/RunMC/Event/Data/EMCAL/SDigits/headerFile/sdigitsname
 520
 521   TString path = "Folders/RunMC/Event/Data/EMCAL/SDigits" ;
 522   path += headerFile ;
 523   path += "/" ;
 524   path += GetName() ;
 525   if ( gROOT->FindObjectAny(path.Data()) ) {
 526     cerr << "WARNING: AliEMCALDigitizer::MixWith -> Entry already exists, do not add" << endl ;
 527     return;
 528   }
 529
 530   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 531   gime->PostSDigits(GetName(),headerFile) ;
 532
 533   // check if the requested file is already open or exist and if SDigits Branch exist
 534   TFile * file = (TFile*)gROOT->FindObject(headerFile);
 535   if ( !file ) {
 536     file = new TFile(headerFile, "READ") ;
 537     if (!file) {
 538       cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::MixWith -> File " << headerFile << " does not exist!" << endl ;
 539       return ;
 540     }
 541   }
 542
 543 }
 544
 545 //__________________________________________________________________
 546 void AliEMCALDigitizer::Print(Option_t* option)const {
 547   if( strcmp(GetName(), "") != 0) {
 548
 549     cout << "------------------- "<< GetName() << " -------------" << endl ;
 550     cout << "Digitizing sDigits from file(s): " <<endl ;
 551
 552   TCollection * folderslist = ((TFolder*)gROOT->FindObjectAny("Folders/RunMC/Event/Data/EMCAL/SDigits"))->GetListOfFolders() ;
 553     TIter next(folderslist) ;
 554     TFolder * folder = 0 ;
 555     while ( (folder = (TFolder*)next()) )
 556       if ( folder->FindObject(GetName())  )
 557         {
 558         cout << "Adding SDigits " << GetName() << " from " << folder->GetName() << endl ;
 559       cout << endl ;
 560       cout << "Writing digits to " << GetTitle() << endl ;
 561
 562       cout << endl ;
 563       cout << "With following parameters: " << endl ;
 564       cout << "     Electronics noise in EMC (fPinNoise) = " << fPinNoise << endl ;
 565       cout << "  Threshold  in EMC  (fTowerDigitThreshold) = " << fTowerDigitThreshold  << endl;
 566       cout << "  Threshold  in PreShower  (fPreShowerDigitThreshold) = " << fPreShowerDigitThreshold  << endl ; ;
 567       cout << "---------------------------------------------------" << endl ;
 568     }
 569     else
 570       cout << "AliEMCALDigitizer not initialized " << endl ;
 571     }
 572 }
 573
 574 //__________________________________________________________________
 575 void AliEMCALDigitizer::PrintDigits(Option_t * option){
 576
 577   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 578   TClonesArray * fDigits = gime->Digits() ;
 579
 580   cout << "AliEMCALDigitiser:"<< endl ;
 581   cout << "       Number of entries in Digits list " << fDigits->GetEntriesFast() << endl ;
 582   cout << endl ;
 583   if(strstr(option,"all")){
 584
 585     //loop over digits
 586     AliEMCALDigit * digit;
 587     cout << "Digit Id " << " Amplitude " <<  " Index "  <<  " Nprim " << " Primaries list " <<  endl;
 588     Int_t index ;
 589     for (index = 0 ; index < fDigits->GetEntries() ; index++) {
 590       digit = (AliEMCALDigit * )  fDigits->At(index) ;
 591       cout << setw(8)  <<  digit->GetId() << " "  <<    setw(3)  <<  digit->GetAmp() <<   "  "
 592            << setw(6)  <<  digit->GetIndexInList() << "  "
 593            << setw(5)  <<  digit->GetNprimary() <<"  ";
 594
 595       Int_t iprimary;
 596       for (iprimary=0; iprimary<digit->GetNprimary(); iprimary++)
 597         cout << setw(5)  <<  digit->GetPrimary(iprimary+1) << " ";
 598       cout << endl;
 599     }
 600
 601   }
 602 }
 603 //_________________________________________________________________________________________
 604 void AliEMCALDigitizer::WriteDigits(Int_t event)
 605 {
 606
 607   // Makes TreeD in the output file.
 608   // Check if branch already exists:
 609   //   if yes, exit without writing: ROOT TTree does not support overwriting/updating of
 610   //      already existing branches.
 611   //   else creates branch with Digits, named "EMCAL", title "...",
 612   //      and branch "AliEMCALDigitizer", with the same title to keep all the parameters
 613   //      and names of files, from which digits are made.
 614
 615   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 616   const TClonesArray * digits = gime->Digits(GetName()) ;
 617  TTree * treeD ;
 618
 619  if(fManager)
 620    treeD = fManager->GetTreeD() ;
 621  else {
 622    if (!gAlice->TreeD() )
 623      gAlice->MakeTree("D",fSplitFile);
 624    treeD = gAlice->TreeD();
 625  }
 626
 627  // -- create Digits branch
 628  Int_t bufferSize = 32000 ;
 629  TBranch * digitsBranch = treeD->Branch("EMCAL",&digits,bufferSize);
 630  digitsBranch->SetTitle(GetName());
 631
 632  // -- Create Digitizer branch
 633  Int_t splitlevel = 0 ;
 634  AliEMCALDigitizer * d = gime->Digitizer(GetName()) ;
 635  TBranch * digitizerBranch = treeD->Branch("AliEMCALDigitizer", "AliEMCALDigitizer", &d,bufferSize,splitlevel);
 636  digitizerBranch->SetTitle(GetName());
 637
 638  digitsBranch->Fill() ;
 639  digitizerBranch->Fill() ;
 640  treeD->AutoSave() ;
 641
 642 }
 643 //____________________________________________________________________________
 644 Float_t AliEMCALDigitizer::FrontEdgeTime(TClonesArray * ticks)
 645 { //
 646   ticks->Sort() ; //Sort in accordance with times of ticks
 647   TIter it(ticks) ;
 648   AliEMCALTick * ctick = (AliEMCALTick *) it.Next() ;
 649   Float_t time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;
 650
 651   AliEMCALTick * t ;
 652   while((t=(AliEMCALTick*) it.Next())){
 653     if(t->GetTime() < time)  //This tick starts before crossing
 654       *ctick+=*t ;
 655     else
 656       return time ;
 657
 658     time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;
 659   }
 660   return time ;
 661 }
 662 //____________________________________________________________________________
 663 Float_t AliEMCALDigitizer::TimeOfNoise(void)
 664 {  // Calculates the time signal generated by noise
 665   //to be rewritten, now returns just big number
 666   return 1. ;
 667
 668 }
 669 //____________________________________________________________________________
 670 void AliEMCALDigitizer::SetSDigitsBranch(const char* title)
 671 {
 672   // we set title (comment) of the SDigits branch in the first! header file
 673   if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 674     Init() ;
 675
 676   AliEMCALGetter::GetInstance()->SDigits()->SetName(title) ;
 677 }
 678
 679 //__________________________________________________________________
 680 void AliEMCALDigitizer::SetSplitFile(const TString splitFileName)
 681 {
 682   // Diverts the Digits in a file separate from the hits file
 683
 684   // I guess it is not going to work if we do merging
 685   if (fManager) {
 686     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::SetSplitFile -> Not yet available in case of merging activated " << endl ;
 687     return ;
 688   }
 689
 690   TDirectory * cwd = gDirectory ;
 691   if ( !(gAlice->GetTreeDFileName() == splitFileName) ) {
 692     if (gAlice->GetTreeDFile() )
 693       gAlice->GetTreeDFile()->Close() ;
 694   }
 695
 696   fSplitFile = gAlice->InitTreeFile("D",splitFileName.Data());
 697   fSplitFile->cd() ;
 698   gAlice->Write(0, TObject::kOverwrite);
 699
 700   TTree *treeE  = gAlice->TreeE();
 701   if (!treeE) {
 702     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::SetSplitFile -> No TreeE found "<<endl;
 703     abort() ;
 704   }
 705
 706   // copy TreeE
 707   AliHeader *header = new AliHeader();
 708   treeE->SetBranchAddress("Header", &header);
 709   treeE->SetBranchStatus("*",1);
 710   TTree *treeENew =  treeE->CloneTree();
 711   treeENew->Write(0, TObject::kOverwrite);
 712
 713   // copy AliceGeom
 714   TGeometry *AliceGeom = static_cast<TGeometry*>(cwd->Get("AliceGeom"));
 715   if (!AliceGeom) {
 716     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::SetSplitFile -> AliceGeom was not found in the input file "<<endl;
 717     abort() ;
 718   }
 719   AliceGeom->Write(0, TObject::kOverwrite);
 720
 721   gAlice->MakeTree("D",fSplitFile);
 722   cwd->cd() ;
 723   cout << "INFO: AliEMCALDigitizer::SetSPlitMode -> Digits will be stored in " << splitFileName.Data() << endl ;
 724 }