EMCAL/AliEMCALDigitizer.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //_________________________________________________________________________
  19 //
  20 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  21 // Class performs digitization of Summable digits
  22 //
  23 // In addition it performs mixing of summable digits from different events.
  24 //
  25 // For each event two branches are created in TreeD:
  26 //   "EMCAL" - list of digits
  27 //   "AliEMCALDigitizer" - AliEMCALDigitizer with all parameters used in digitization
  28 //
  29 // Note, that one cset title for new digits branch, and repeat digitization with
  30 // another set of parameters.
  31 //
  32 // Examples of use:
  33 // root[0] AliEMCALDigitizer * d = new AliEMCALDigitizer() ;
  34 // root[1] d->ExecuteTask()
  35 // Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  36 //                       //Digitizes SDigitis in all events found in file galice.root
  37 //
  38 // root[2] AliEMCALDigitizer * d1 = new AliEMCALDigitizer("galice1.root") ;
  39 //                       // Will read sdigits from galice1.root
  40 // root[3] d1->MixWith("galice2.root")
  41 // Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  42 //                       // Reads another portion of sdigits from galice2.root
  43 // root[3] d1->MixWith("galice3.root")
  44 //                       // Reads another portion of sdigits from galice3.root
  45 // root[4] d->ExecuteTask("deb timing")
  46 //                       // Reads SDigits from files galice1.root, galice2.root ....
  47 //                       // mixes them and stores produced Digits in file galice1.root
  48 //                       // deb - prints number of produced digits
  49 //                       // deb all - prints list of produced digits
  50 //                       // timing  - prints time used for digitization
  51 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  52 //
  53 //*-- Author: Sahal Yacoob (LBL)
  54 // based on : AliEMCALDigitizer
  55 //_________________________________________________________________________________
  56
  57 // --- ROOT system ---
  58 #include "TFile.h"
  59 #include "TTree.h"
  60 #include "TSystem.h"
  61 #include "TROOT.h"
  62 #include "TFolder.h"
  63 #include "TObjString.h"
  64 #include "TGeometry.h"
  65 #include "TBenchmark.h"
  66 // --- Standard library ---
  67 #include <iomanip.h>
  68
  69 // --- AliRoot header files ---
  70
  71 #include "AliRun.h"
  72 #include "AliHeader.h"
  73 #include "AliEMCALDigit.h"
  74 #include "AliEMCALHit.h"
  75 #include "AliEMCALTick.h"
  76 #include "AliEMCALv1.h"
  77 #include "AliEMCALDigitizer.h"
  78 #include "AliEMCALSDigitizer.h"
  79 #include "AliEMCALGeometry.h"
  80 #include "AliEMCALGetter.h"
  81 #include "AliRunDigitizer.h"
  82 ClassImp(AliEMCALDigitizer)
  83
  84
  85 //____________________________________________________________________________
  86   AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer()
  87 {
  88   // ctor
  89
  90   fSDigitizer = 0 ;
  91   fNinputs = 0 ;
  92   fPinNoise = 0.0 ;
  93   fTowerDigitThreshold = 0.0 ;
  94   fTimeResolution     = 0. ;
  95   fTimeSignalLength   = 0. ;
  96   fPreShowerDigitThreshold = 0. ;
  97   fADCchannelTower = 0.0;      // width of one ADC channel in GeV
  98   fADCpedestalTower = 0. ;      // pedestal of ADC
  99   fNADCTower = 0;  // number of channels in Tower ADC
 100
 101   fADCchannelPreSho  = 0.0;          // width of one ADC channel in Pre Shower
 102   fADCpedestalPreSho = 0.0 ;         // pedestal of ADC
 103   fNADCPreSho = 0;      // number of channels in Pre Shower ADC
 104   fTimeThreshold = 0.0; //Means 1 MeV in terms of SDigits amplitude
 105   fManager = 0 ;
 106   fSplitFile= 0 ;
 107
 108
 109
 110 }
 111 //____________________________________________________________________________
 112 Bool_t AliEMCALDigitizer::Init()
 113 {
 114   // Makes all memory allocations
 115
 116   fSDigitizer = 0 ;
 117   fNinputs = 1 ;
 118   fPinNoise = 0.00001 ;
 119   fTowerDigitThreshold = 0.001 ;
 120   fTimeResolution     = 0.5e-9 ;
 121   fTimeSignalLength   = 1.0e-9 ;
 122   fPreShowerDigitThreshold = fTowerDigitThreshold/25. ;
 123   fInitialized = kFALSE ;
 124   fADCchannelTower = 0.000220;       // width of one ADC channel in GeV
 125   fADCpedestalTower = 0.005 ;      // GeV
 126   fNADCTower = (Int_t) TMath::Power(2,16) ;  // number of channels in Tower ADC
 127
 128   fADCchannelPreSho = 0.0000300;          // width of one ADC channel in Pre Shower
 129   fADCpedestalPreSho = 0.005 ;         //
 130   fNADCPreSho = (Int_t) TMath::Power(2,12);      // number of channels in Pre ShowerADC
 131
 132   fTimeThreshold = 0.001*10000000 ; //Means 1 MeV in terms of SDigits amplitude
 133
 134
 135
 136   if(fManager)
 137     SetTitle("aliroot") ;
 138   else if (strcmp(GetTitle(),"")==0)
 139     SetTitle("galice.root") ;
 140
 141   if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 142     SetName("Default") ;
 143
 144   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance(GetTitle(), GetName(), "update") ;
 145   if ( gime == 0 ) {
 146     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::Init -> Could not obtain the Getter object !" << endl ;
 147     return kFALSE;
 148   }
 149
 150   //const AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
 151   //fEmcCrystals = geom->GetNModules() *  geom->GetNCristalsInModule() ;
 152
 153   // Post Digits to the white board
 154   gime->PostDigits(GetName() ) ;
 155
 156   // Post Digitizer to the white board
 157   gime->PostDigitizer(this) ;
 158
 159   //Mark that we will use current header file
 160   if(!fManager){
 161     gime->PostSDigits(GetName(),GetTitle()) ;
 162     gime->PostSDigitizer(GetName(),GetTitle()) ;
 163   }
 164   return kTRUE ;
 165
 166
 167
 168 }
 169
 170 //____________________________________________________________________________
 171 AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer(const char *headerFile,const char *name)
 172 {
 173   SetName(name) ;
 174   SetTitle(headerFile) ;
 175   fManager = 0 ;                     // We work in the standalong mode
 176   fSplitFile= 0 ;
 177   Init() ;
 178
 179
 180
 181 }
 182 //____________________________________________________________________________
 183 AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer(AliRunDigitizer * ard):AliDigitizer(ard)
 184 {
 185   // ctor
 186   SetName("");     //Will call init in the digitizing
 187   SetTitle("aliroot") ;
 188 }
 189
 190 //____________________________________________________________________________
 191   AliEMCALDigitizer::~AliEMCALDigitizer()
 192 {
 193   // dtor
 194
 195   if (fSplitFile)
 196     if ( fSplitFile->IsOpen() )
 197       fSplitFile->Close() ;
 198
 199 }
 200
 201 //____________________________________________________________________________
 202 void AliEMCALDigitizer::Reset() {
 203   //sets current event number to the first simulated event
 204 if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 205   Init() ;
 206
 207       // Int_t inputs ;
 208       // for(inputs = 0; inputs < fNinputs ;inputs++)
 209       //  fIevent->AddAt(-1, inputs ) ;
 210
 211 }
 212
 213 //____________________________________________________________________________
 214 void AliEMCALDigitizer::Digitize(const Int_t event) {
 215
 216   // Makes the digitization of the collected summable digits
 217   // for this it first creates the array of all EMCAL modules
 218   // filled with noise (different for EMC, CPV and PPSD) and
 219   // after that adds contributions from SDigits. This design
 220   // helps to avoid scanning over the list of digits to add
 221   // contribution of any new SDigit.
 222
 223   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 224   TClonesArray * digits = gime->Digits(GetName()) ;
 225
 226   digits->Clear() ;
 227
 228     const AliEMCALGeometry *geom = gime->EMCALGeometry() ;
 229
 230
 231   //Making digits with noise, first EMC
 232   Int_t nEMC = 2*geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();
 233   Int_t absID ;
 234   TString name      =  geom->GetName() ;
 235
 236  // get first the sdigitizer from the tasks list (must have same name as the digitizer)
 237   const AliEMCALSDigitizer * sDigitizer = gime->SDigitizer(GetName());
 238   if ( !sDigitizer) {
 239     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::Digitize -> SDigitizer with name " << GetName() << " not found " << endl ;
 240     abort() ;
 241   }
 242 // loop through the sdigits posted to the White Board and add them to the noise
 243   TCollection * folderslist = gime->SDigitsFolder()->GetListOfFolders() ;
 244   TIter next(folderslist) ;
 245   TFolder * folder = 0 ;
 246   TClonesArray * sdigits = 0 ;
 247   Int_t input = 0 ;
 248   TObjArray * sdigArray = new TObjArray(2) ;
 249   while ( (folder = (TFolder*)next()) )
 250     if ( (sdigits = (TClonesArray*)folder->FindObject(GetName()) ) ) {
 251       TString fileName(folder->GetName()) ;
 252       fileName.ReplaceAll("_","/") ;
 253       cout << "INFO: AliEMCALDigitizer::Digitize -> Adding SDigits "
 254            << GetName() << " from " << fileName << endl ;
 255       sdigArray->AddAt(sdigits, input) ;
 256       input++ ;
 257     }
 258
 259
 260   //Find the first tower with signal
 261   Int_t nextSig = 200000 ;
 262   Int_t i;
 263   for(i=0; i<input; i++){
 264     sdigits = (TClonesArray *)sdigArray->At(i) ;
 265     if ( !sdigits->GetEntriesFast() )
 266       continue ;
 267     Int_t curNext = ((AliEMCALDigit *)sdigits->At(0))->GetId() ;
 268      if(curNext < nextSig)
 269        nextSig = curNext ;
 270   }
 271
 272   TArrayI index(input) ;
 273   index.Reset() ;  //Set all indexes to zero
 274
 275   AliEMCALDigit * digit = 0 ;
 276   AliEMCALDigit * curSDigit = 0 ;
 277
 278   TClonesArray * ticks = new TClonesArray("AliEMCALTick",1000) ;
 279
 280   //Put Noise contribution
 281   for(absID = 1; absID <= nEMC; absID++){
 282     Float_t noise = gRandom->Gaus(0., fPinNoise);
 283     new((*digits)[absID-1]) AliEMCALDigit( -1, -1, absID,sDigitizer->Digitize(noise), TimeOfNoise() ) ;
 284     //look if we have to add signal?
 285     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(absID-1) ;
 286     if(absID==nextSig){
 287       //Add SDigits from all inputs
 288       ticks->Clear() ;
 289       Int_t contrib = 0 ;
 290       Float_t a = digit->GetAmp() ;
 291       Float_t b = TMath::Abs( a /fTimeSignalLength) ;
 292       //Mark the beginnign of the signal
 293       new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(digit->GetTime(),0, b);
 294       //Mark the end of the ignal
 295       new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(digit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b);
 296
 297  // loop over input
 298
 299       for(i = 0; i< input ; i++){  //loop over (possible) merge sources
 300         if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 301           curSDigit = (AliEMCALDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;
 302         else
 303           curSDigit = 0 ;
 304         //May be several digits will contribute from the same input
 305         while(curSDigit && curSDigit->GetId() == absID){
 306           //Shift primary to separate primaries belonging different inputs
 307           Int_t primaryoffset ;
 308           if(fManager)
 309             primaryoffset = fManager->GetMask(i) ;
 310           else
 311             primaryoffset = i ;
 312           curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
 313
 314           a = curSDigit->GetAmp() ;
 315           b = a /fTimeSignalLength ;
 316           new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(curSDigit->GetTime(),0, b);
 317           new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(curSDigit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b);
 318
 319           *digit = *digit + *curSDigit ;  //add energies
 320
 321           index[i]++ ;
 322           if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 323             curSDigit = (AliEMCALDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;
 324           else
 325             curSDigit = 0 ;
 326         }
 327       }
 328
 329 //calculate and set time
 330       Float_t time = FrontEdgeTime(ticks) ;
 331       digit->SetTime(time) ;
 332
 333       //Find next signal module
 334       nextSig = 200000 ;
 335       for(i=0; i<input; i++){
 336         sdigits = ((TClonesArray *)sdigArray->At(i)) ;
 337         Int_t curNext = nextSig ;
 338         if(sdigits->GetEntriesFast() > index[i] ){
 339           curNext = ((AliEMCALDigit *) sdigits->At(index[i]))->GetId() ;
 340
 341         }
 342         if(curNext < nextSig) nextSig = curNext ;
 343       }
 344     }
 345   }
 346
 347   ticks->Delete() ;
 348   delete ticks ;
 349
 350
 351
 352
 353   //remove digits below thresholds
 354   for(absID = 0; absID < nEMC/2 ; absID++){
 355
 356     if(sDigitizer->Calibrate(((AliEMCALDigit*)digits->At(absID))->GetAmp()) < fTowerDigitThreshold)
 357       digits->RemoveAt(absID) ;
 358     else
 359       digit->SetTime(gRandom->Gaus(digit->GetTime(),fTimeResolution) ) ;
 360   }
 361
 362   for(absID = nEMC/2; absID < nEMC ; absID++){
 363
 364     if(sDigitizer->Calibrate(((AliEMCALDigit*)digits->At(absID))->GetAmp()) < fPreShowerDigitThreshold)
 365       digits->RemoveAt(absID) ;
 366     else
 367       digit->SetTime(gRandom->Gaus(digit->GetTime(),fTimeResolution) ) ;
 368   }
 369
 370   digits->Compress() ;
 371
 372   Int_t ndigits = digits->GetEntriesFast() ;
 373
 374   digits->Expand(ndigits) ;
 375
 376
 377   //Set indexes in list of digits
 378   //Int_t i ;
 379  for (i = 0 ; i < ndigits ; i++) {
 380     AliEMCALDigit * digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(i) ;
 381     digit->SetIndexInList(i) ;
 382     Float_t energy = sDigitizer->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
 383     digit->SetAmp(DigitizeEnergy(energy,digit->GetId()) ) ;
 384   }
 385 }
 386
 387 //____________________________________________________________________________
 388
 389 Int_t AliEMCALDigitizer::DigitizeEnergy(Float_t energy, Int_t absId)
 390 {
 391   Int_t channel = -999;
 392   Int_t nphi = AliEMCALGetter::GetInstance()->EMCALGeometry()->GetNPhi() ;
 393   Int_t nz   = AliEMCALGetter::GetInstance()->EMCALGeometry()->GetNZ() ;
 394
 395   if(absId <= nphi*nz){  //digitize as tower
 396     channel = static_cast<Int_t> (TMath::Ceil( (energy + fADCpedestalTower)/fADCchannelTower ))  ;
 397   if(channel > fNADCTower )
 398     channel =  fNADCTower ;
 399   } else {
 400     channel =  static_cast<Int_t>(TMath::Ceil( (energy + fADCpedestalPreSho)/fADCchannelPreSho ))  ;
 401   if(channel > fNADCPreSho )
 402     channel =  fNADCPreSho ;
 403   }
 404
 405   return channel ;
 406 }
 407
 408 //____________________________________________________________________________
 409 void AliEMCALDigitizer::Exec(Option_t *option) {
 410   // Managing method
 411 if(strcmp(GetName(), "") == 0 )
 412     Init() ;
 413
 414   if (strstr(option,"print")) {
 415     Print("");
 416     return ;
 417   }
 418
 419   if(strstr(option,"tim"))
 420     gBenchmark->Start("EMCALDigitizer");
 421
 422   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 423
 424   Int_t nevents ;
 425
 426   TTree * treeD ;
 427
 428   if(fManager){
 429     treeD = fManager->GetTreeD() ;
 430     nevents = 1 ;    // Will process only one event
 431   }
 432   else {
 433     gAlice->GetEvent(0) ;
 434     nevents = (Int_t) gAlice->TreeE()->GetEntries() ;
 435     treeD=gAlice->TreeD() ;
 436   }
 437
 438
 439   //Check, if this branch already exits
 440   if (treeD) {
 441     TObjArray * lob = (TObjArray*)treeD->GetListOfBranches() ;
 442     TIter next(lob) ;
 443     TBranch * branch = 0 ;
 444     Bool_t emcalfound = kFALSE, digitizerfound = kFALSE ;
 445
 446     while ( (branch = (TBranch*)next()) && (!emcalfound || !digitizerfound) ) {
 447       if ( (strcmp(branch->GetName(), "EMCAL")==0) &&
 448            (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) )
 449         emcalfound = kTRUE ;
 450
 451       else if ( (strcmp(branch->GetName(), "AliEMCALDigitizer")==0) &&
 452                 (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) )
 453         digitizerfound = kTRUE ;
 454     }
 455
 456     if ( emcalfound ) {
 457       cerr << "WARNING: AliEMCALDigitizer -> Digits branch with name " << GetName()
 458            << " already exits" << endl ;
 459       return ;
 460     }
 461     if ( digitizerfound ) {
 462       cerr << "WARNING: AliEMCALDigitizer -> Digitizer branch with name " << GetName()
 463            << " already exits" << endl ;
 464       return ;
 465     }
 466   }
 467   Int_t ievent ;
 468
 469   for(ievent = 0; ievent < nevents; ievent++){
 470
 471     if(fManager){
 472       Int_t input ;
 473       for(input = 0 ; input < fManager->GetNinputs(); input ++){
 474         TTree * treeS = fManager->GetInputTreeS(input) ;
 475         if(!treeS){
 476           cerr << "AliEMCALDigitizer -> No Input " << endl ;
 477           return ;
 478         }
 479         gime->ReadTreeS(treeS,input) ;
 480       }
 481     }
 482     else
 483       gime->Event(ievent,"S") ;
 484
 485     Digitize(ievent) ; //Add prepared SDigits to digits and add the noise
 486
 487     WriteDigits(ievent) ;
 488
 489     if(strstr(option,"deb"))
 490       PrintDigits(option);
 491
 492     //increment the total number of Digits per run
 493     fDigitsInRun += gime->Digits()->GetEntriesFast() ;
 494   }
 495
 496   if (fSplitFile)
 497     if ( fSplitFile->IsOpen() )
 498       fSplitFile->Close() ;
 499
 500   if(strstr(option,"tim")){
 501     gBenchmark->Stop("EMCALDigitizer");
 502     cout << "AliEMCALDigitizer:" << endl ;
 503     cout << "  took " << gBenchmark->GetCpuTime("EMCALDigitizer") << " seconds for Digitizing "
 504          <<  gBenchmark->GetCpuTime("EMCALDigitizer")/nevents << " seconds per event " << endl ;
 505     cout << endl ;
 506   }
 507
 508 }
 509
 510
 511
 512 //__________________________________________________________________
 513 void AliEMCALDigitizer::MixWith(char* headerFile){
 514   // Alows produce digits by superimposing background and signal event.
 515   // It is assumed, that headers file with SIGNAL events is opened in
 516   // constructor, and now we set the BACKGROUND event, with which we
 517   // will mix. Thus we avoid writing (changing) huge and expencive
 518   // backgound files: all output will be writen into SIGNAL, i.e.
 519   // opened in constructor file.
 520   //
 521   // One can open as many files to mix with as one wants.
 522
 523 if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 524     Init() ;
 525
 526  if(fManager){
 527     cout << "Can not use this method under AliRunDigitizer " << endl ;
 528     return ;
 529   } // check if the specified SDigits do not already exist on the White Board:
 530   // //Folders/RunMC/Event/Data/EMCAL/SDigits/headerFile/sdigitsname
 531
 532   TString path = "Folders/RunMC/Event/Data/EMCAL/SDigits" ;
 533   path += headerFile ;
 534   path += "/" ;
 535   path += GetName() ;
 536   if ( gROOT->FindObjectAny(path.Data()) ) {
 537     cerr << "WARNING: AliEMCALDigitizer::MixWith -> Entry already exists, do not add" << endl ;
 538     return;
 539   }
 540
 541   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 542   gime->PostSDigits(GetName(),headerFile) ;
 543
 544   // check if the requested file is already open or exist and if SDigits Branch exist
 545   TFile * file = (TFile*)gROOT->FindObject(headerFile);
 546   if ( !file ) {
 547     file = new TFile(headerFile, "READ") ;
 548     if (!file) {
 549       cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::MixWith -> File " << headerFile << " does not exist!" << endl ;
 550       return ;
 551     }
 552   }
 553
 554 }
 555
 556 //__________________________________________________________________
 557 void AliEMCALDigitizer::Print(Option_t* option)const {
 558   if( strcmp(GetName(), "") != 0) {
 559
 560     cout << "------------------- "<< GetName() << " -------------" << endl ;
 561     cout << "Digitizing sDigits from file(s): " <<endl ;
 562
 563   TCollection * folderslist = ((TFolder*)gROOT->FindObjectAny("Folders/RunMC/Event/Data/EMCAL/SDigits"))->GetListOfFolders() ;
 564     TIter next(folderslist) ;
 565     TFolder * folder = 0 ;
 566     while ( (folder = (TFolder*)next()) )
 567       if ( folder->FindObject(GetName())  )
 568         {
 569         cout << "Adding SDigits " << GetName() << " from " << folder->GetName() << endl ;
 570       cout << endl ;
 571       cout << "Writing digits to " << GetTitle() << endl ;
 572
 573       cout << endl ;
 574       cout << "With following parameters: " << endl ;
 575       cout << "     Electronics noise in EMC (fPinNoise) = " << fPinNoise << endl ;
 576       cout << "  Threshold  in EMC  (fTowerDigitThreshold) = " << fTowerDigitThreshold  << endl;
 577       cout << "  Threshold  in PreShower  (fPreShowerDigitThreshold) = " << fPreShowerDigitThreshold  << endl ; ;
 578       cout << "---------------------------------------------------" << endl ;
 579     }
 580     else
 581       cout << "AliEMCALDigitizer not initialized " << endl ;
 582     }
 583 }
 584
 585 //__________________________________________________________________
 586 void AliEMCALDigitizer::PrintDigits(Option_t * option){
 587
 588   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 589   TClonesArray * fDigits = gime->Digits() ;
 590
 591   cout << "AliEMCALDigitiser:"<< endl ;
 592   cout << "       Number of entries in Digits list " << fDigits->GetEntriesFast() << endl ;
 593   cout << endl ;
 594   if(strstr(option,"all")){
 595
 596     //loop over digits
 597     AliEMCALDigit * digit;
 598     cout << "Digit Id " << " Amplitude " <<  " Index "  <<  " Nprim " << " Primaries list " <<  endl;
 599     Int_t index ;
 600     for (index = 0 ; index < fDigits->GetEntries() ; index++) {
 601       digit = (AliEMCALDigit * )  fDigits->At(index) ;
 602       cout << setw(8)  <<  digit->GetId() << " "  <<    setw(3)  <<  digit->GetAmp() <<   "  "
 603            << setw(6)  <<  digit->GetIndexInList() << "  "
 604            << setw(5)  <<  digit->GetNprimary() <<"  ";
 605
 606       Int_t iprimary;
 607       for (iprimary=0; iprimary<digit->GetNprimary(); iprimary++)
 608         cout << setw(5)  <<  digit->GetPrimary(iprimary+1) << " ";
 609       cout << endl;
 610     }
 611
 612   }
 613 }
 614 //_________________________________________________________________________________________
 615 void AliEMCALDigitizer::WriteDigits(Int_t event)
 616 {
 617
 618   // Makes TreeD in the output file.
 619   // Check if branch already exists:
 620   //   if yes, exit without writing: ROOT TTree does not support overwriting/updating of
 621   //      already existing branches.
 622   //   else creates branch with Digits, named "EMCAL", title "...",
 623   //      and branch "AliEMCALDigitizer", with the same title to keep all the parameters
 624   //      and names of files, from which digits are made.
 625
 626   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::GetInstance() ;
 627   const TClonesArray * digits = gime->Digits(GetName()) ;
 628  TTree * treeD ;
 629
 630  if(fManager)
 631    treeD = fManager->GetTreeD() ;
 632  else {
 633    if (!gAlice->TreeD() )
 634      gAlice->MakeTree("D",fSplitFile);
 635    treeD = gAlice->TreeD();
 636  }
 637
 638  // -- create Digits branch
 639  Int_t bufferSize = 32000 ;
 640  TBranch * digitsBranch = treeD->Branch("EMCAL",&digits,bufferSize);
 641  digitsBranch->SetTitle(GetName());
 642
 643  // -- Create Digitizer branch
 644  Int_t splitlevel = 0 ;
 645  AliEMCALDigitizer * d = gime->Digitizer(GetName()) ;
 646  TBranch * digitizerBranch = treeD->Branch("AliEMCALDigitizer", "AliEMCALDigitizer", &d,bufferSize,splitlevel);
 647  digitizerBranch->SetTitle(GetName());
 648
 649  digitsBranch->Fill() ;
 650  digitizerBranch->Fill() ;
 651  treeD->AutoSave() ;
 652
 653 }
 654 //____________________________________________________________________________
 655 Float_t AliEMCALDigitizer::FrontEdgeTime(TClonesArray * ticks)
 656 { //
 657   ticks->Sort() ; //Sort in accordance with times of ticks
 658   TIter it(ticks) ;
 659   AliEMCALTick * ctick = (AliEMCALTick *) it.Next() ;
 660   Float_t time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;
 661
 662   AliEMCALTick * t ;
 663   while((t=(AliEMCALTick*) it.Next())){
 664     if(t->GetTime() < time)  //This tick starts before crossing
 665       *ctick+=*t ;
 666     else
 667       return time ;
 668
 669     time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;
 670   }
 671   return time ;
 672 }
 673 //____________________________________________________________________________
 674 Float_t AliEMCALDigitizer::TimeOfNoise(void)
 675 {  // Calculates the time signal generated by noise
 676   //to be rewritten, now returns just big number
 677   return 1. ;
 678
 679 }
 680 //____________________________________________________________________________
 681 void AliEMCALDigitizer::SetSDigitsBranch(const char* title)
 682 {
 683   // we set title (comment) of the SDigits branch in the first! header file
 684   if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 685     Init() ;
 686
 687   AliEMCALGetter::GetInstance()->SDigits()->SetName(title) ;
 688 }
 689
 690 //__________________________________________________________________
 691 void AliEMCALDigitizer::SetSplitFile(const TString splitFileName)
 692 {
 693   // Diverts the Digits in a file separate from the hits file
 694
 695   // I guess it is not going to work if we do merging
 696   if (fManager) {
 697     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::SetSplitFile -> Not yet available in case of merging activated " << endl ;
 698     return ;
 699   }
 700
 701   TDirectory * cwd = gDirectory ;
 702   if ( !(gAlice->GetTreeDFileName() == splitFileName) ) {
 703     if (gAlice->GetTreeDFile() )
 704       gAlice->GetTreeDFile()->Close() ;
 705   }
 706
 707   fSplitFile = gAlice->InitTreeFile("D",splitFileName.Data());
 708   fSplitFile->cd() ;
 709   if ( !fSplitFile->Get("gAlice") )
 710     gAlice->Write();
 711
 712   TTree *treeE  = gAlice->TreeE();
 713   if (!treeE) {
 714     cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::SetSplitFile -> No TreeE found "<<endl;
 715     abort() ;
 716   }
 717
 718   // copy TreeE
 719   if ( !fSplitFile->Get("TreeE") ) {
 720     AliHeader *header = new AliHeader();
 721     treeE->SetBranchAddress("Header", &header);
 722     treeE->SetBranchStatus("*",1);
 723     TTree *treeENew =  treeE->CloneTree();
 724     treeENew->Write();
 725   }
 726
 727   // copy AliceGeom
 728   if ( !fSplitFile->Get("AliceGeom") ) {
 729     TGeometry *AliceGeom = static_cast<TGeometry*>(cwd->Get("AliceGeom"));
 730     if (!AliceGeom) {
 731       cerr << "ERROR: AliEMCALDigitizer::SetSplitFile -> AliceGeom was not found in the input file "<<endl;
 732       abort() ;
 733     }
 734     AliceGeom->Write();
 735   }
 736
 737   gAlice->MakeTree("D",fSplitFile);
 738   cwd->cd() ;
 739   cout << "INFO: AliEMCALDigitizer::SetSPlitMode -> Digits will be stored in " << splitFileName.Data() << endl ;
 740 }