EMCAL/AliEMCALHistoUtilities.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-2002, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //_________________________________________________________________________
  19 // This is a set of histogram
  20 // utilities for the EMCAL
  21 // to make some common
  22 // functions easier
  23 //
  24 //*-- Authors: J.L. Klay (LLNL) & Aleksei Pavlinov (WSU)
  25
  26 #include "AliEMCALHistoUtilities.h"
  27
  28 #include <iostream>
  29 #include <iomanip>
  30 #include <fstream>
  31
  32 #include <TROOT.h>
  33 #include <TPad.h>
  34 #include <TFile.h>
  35 #include <TH1.h>
  36 #include <TH2.h>
  37 #include <THnSparse.h>
  38 #include <TF1.h>
  39 #include <TGraph.h>
  40 #include <TGraphErrors.h>
  41 #include <TLatex.h>
  42 #include <TChain.h>
  43 #include <TList.h>
  44 #include <TObjArray.h>
  45 #include <TObjString.h>
  46 #include <TRegexp.h>
  47 #include <TString.h>
  48 #include <TLorentzVector.h>
  49 #include <Gtypes.h> // color, line style and so on
  50 #include <TArrayF.h>
  51
  52 //#include "AliESDCaloCluster.h"
  53 //#include "AliEMCALRecPoint.h"
  54 //#include "AliRunLoader.h"
  55 #include "AliHeader.h"
  56 #include "AliGenEventHeader.h"
  57 #include "AliGenPythiaEventHeader.h"
  58
  59 using namespace std;
  60
  61 ClassImp(AliEMCALHistoUtilities)
  62
  63 AliEMCALHistoUtilities::AliEMCALHistoUtilities(const char *name, const char *tit) : TNamed(name,tit)
  64 {
  65   // constructor
  66 }
  67
  68 AliEMCALHistoUtilities::~AliEMCALHistoUtilities()
  69 {
  70         //destructor
  71 }
  72
  73 TList* AliEMCALHistoUtilities::MoveHistsToList(const char* name, Bool_t putToBrowser)
  74 {
  75   // Move HIST to list
  76   gROOT->cd();
  77   TIter nextHist(gDirectory->GetList());
  78   TList *list = new TList;
  79   list->SetName(name);
  80   TObject *objHist;
  81   while((objHist=nextHist())){
  82     if (!objHist->InheritsFrom("TH1")) continue;
  83     ((TH1*)objHist)->SetDirectory(0); // Remove from gROOT
  84     list->Add(objHist);
  85     gDirectory->GetList()->Remove(objHist);
  86   }
  87   if(putToBrowser) gROOT->GetListOfBrowsables()->Add((TObject*)list);
  88   return list;
  89 }
  90
  91 void AliEMCALHistoUtilities::FillH1(TList *l, Int_t ind, Double_t x, Double_t w, Double_t error)
  92 {
  93   //fill 1d histogram
  94   static TH1* hid=0;
  95   static int  bin=0;
  96   if(l == 0) return;
  97
  98   if(ind>=0 && ind < l->GetSize()){
  99     hid = (TH1*)l->At(ind);
 100     if(error <= 0.0) { // standard way
 101       hid->Fill(x,w);
 102     } else{
 103       bin = hid->FindBin(x);
 104       hid->SetBinContent(bin,w);
 105       hid->SetBinError(bin,error);
 106     }
 107   }
 108 }
 109
 110 void AliEMCALHistoUtilities::FillH2(TList *l, Int_t ind, Double_t x, Double_t y, Double_t w)
 111 {
 112   //fill 2d histogram
 113   static TH2* hid=0;
 114   if(l == 0) return;
 115   if(ind>=0 && ind < l->GetSize()){
 116     hid = (TH2*)l->At(ind);
 117     hid->Fill(x,y,w);
 118   }
 119 }
 120
 121 void AliEMCALHistoUtilities:: FillHnSparse(TList *l, Int_t ind, Double_t* x, Double_t w)
 122 {
 123   // Nov 02,2010: fill THnSparse hist
 124   static THnSparse* hsp=0;
 125   if(l==0 || x==0) return;
 126   if(ind>=0 && ind < l->GetSize()){
 127     hsp = dynamic_cast<THnSparse *>(l->At(ind));
 128     if(hsp) hsp->Fill(x,w);
 129   }
 130 }
 131
 132 int AliEMCALHistoUtilities::SaveListOfHists(TList *mylist,const char* name,Bool_t kSingleKey,const char* opt)
 133 {
 134   //write histograms to file
 135   printf(" Name of out file |%s|\n", name);
 136   int save = 0;
 137   if(mylist && mylist->GetSize() && strlen(name)){
 138     TString nf(name);
 139     if(nf.Contains(".root") == kFALSE) nf += ".root";
 140     TFile file(nf.Data(),opt);
 141     TIter nextHist(mylist);
 142     TObject* objHist=0;
 143     int nh=0;
 144     if(kSingleKey) {
 145        file.cd();
 146        mylist->Write(mylist->GetName(),TObject::kSingleKey);
 147        mylist->ls();
 148        save = 1;
 149     } else {
 150       while((objHist=nextHist())) { // loop over list
 151         if(objHist->InheritsFrom("TH1")) {
 152           TH1* hid = (TH1*)objHist;
 153           file.cd();
 154           hid->Write();
 155           nh++;
 156           printf("Save hist. %s \n",hid ->GetName());
 157         }
 158       }
 159       printf("%i hists. save to file -> %s\n", nh,file.GetName());
 160       if(nh>0) save = 1;
 161     }
 162     file.Close();
 163   } else {
 164     printf("AliEMCALHistoUtilities::SaveListOfHists : N O  S A V I N G \n");
 165   }
 166   return save;
 167 }
 168
 169 void AliEMCALHistoUtilities::AddToNameAndTitle(TNamed *h, const char *name, const char *title)
 170 {
 171   // Oct 15, 2007
 172   if(h==0) return;
 173   if(name  && strlen(name))  h->SetName(Form("%s%s",h->GetName(),name));
 174   if(title && strlen(title)) h->SetTitle(Form("%s%s",h->GetTitle(),title));
 175 }
 176
 177 void AliEMCALHistoUtilities::AddToNameAndTitleToList(TList *l, const char *name, const char *title)
 178 {
 179   // Oct 15, 2007
 180   if(l==0) return;
 181   if(name || title) {
 182     for(int i=0; i<l->GetSize(); i++) {
 183       TObject *o = l->At(i);
 184       if(o->InheritsFrom("TNamed")) {
 185         TNamed *h = dynamic_cast<TNamed *>(o);
 186         AddToNameAndTitle(h, name, title);
 187       }
 188     }
 189   }
 190 }
 191
 192 void AliEMCALHistoUtilities::ResetListOfHists(TList *l)
 193 {
 194   // Oct 15, 2007
 195   if(l==0) return;
 196   for(int i=0; i<l->GetSize(); i++) {
 197     TH1F* h = (TH1F*)l->At(i);
 198     h->Reset();
 199   }
 200 }
 201
 202 TLatex *AliEMCALHistoUtilities::Lat(const char *text, Float_t x,Float_t y, Int_t align, Float_t tsize, short tcolor)
 203 {
 204   // Oct 15, 2007
 205   double y1=y;
 206   TLatex *latex = new TLatex;
 207   latex->SetTextAlign(align);
 208   latex->SetTextSize(tsize);
 209   latex->SetTextColor(tcolor);
 210   latex->DrawLatex(x, y1, text);
 211   printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::lat() -> %s gPad->GetLogy() %i\n",
 212   text, gPad->GetLogy());
 213   return latex;
 214 }
 215
 216 TGraph *AliEMCALHistoUtilities::DrawGraph(Int_t n, Double_t *x, Double_t *y, Int_t markerColor,
 217 Int_t markerStyle, const char* opt, const char* tit, const char* xTit,const char* yTit, Int_t ifun,
 218 const char *optFit, const char *fun)
 219 {
 220   /* Drawing options
 221   chopt='L' :  A simple polyline between every points is drawn
 222   chopt='F' :  A fill area is drawn ('CF' draw a smooth fill area)
 223   chopt='A' :  Axis are drawn around the graph
 224   chopt='C' :  A smooth Curve is drawn
 225   chopt='*' :  A Star is plotted at each point
 226   chopt='P' :  Idem with the current marker
 227   chopt='B' :  A Bar chart is drawn at each point
 228   chopt='1' :  ylow=rwymin
 229   chopt='X+' : The X-axis is drawn on the top side of the plot.
 230   chopt='Y+' : The Y-axis is drawn on the right side of the plot.
 231
 232     Fitting options
 233    The list of fit options is given in parameter option.
 234       option = "W"  Set all errors to 1
 235              = "U" Use a User specified fitting algorithm (via SetFCN)
 236              = "Q" Quiet mode (minimum printing)
 237              = "V" Verbose mode (default is between Q and V)
 238              = "B" Use this option when you want to fix one or more parameters
 239                    and the fitting function is like "gaus","expo","poln","landau".
 240              = "R" Use the Range specified in the function range
 241              = "N" Do not store the graphics function, do not draw
 242              = "0" Do not plot the result of the fit. By default the fitted function
 243                    is drawn unless the option"N" above is specified.
 244              = "+" Add this new fitted function to the list of fitted functions
 245                    (by default, any previous function is deleted)
 246              = "C" In case of linear fitting, not calculate the chisquare
 247                     (saves time)
 248              = "F" If fitting a polN, switch to minuit fitter
 249              = "ROB" In case of linear fitting, compute the LTS regression
 250                      coefficients (robust(resistant) regression), using
 251                      the default fraction of good points
 252                "ROB=0.x" - compute the LTS regression coefficients, using
 253                            0.x as a fraction of good points
 254
 255   */
 256   printf("AliEMCALHistoUtilities::drawGraph started \n");
 257   printf("Drawing opt |%s| : Fitting opt |%s|\n", opt, optFit);
 258
 259     TGraph *gr = new TGraph(n, x, y);
 260     gr->SetMarkerColor(markerColor);
 261     gr->SetLineColor(markerColor);
 262     gr->SetMarkerStyle(markerStyle);
 263     gr->SetTitle(tit);
 264     gr->Draw(opt);
 265
 266     TString ctmp(opt);
 267     if(ctmp.Contains("A")) {
 268        gr->GetHistogram()->SetXTitle(xTit);
 269        gr->GetHistogram()->SetYTitle(yTit);
 270     }
 271     ctmp = optFit;
 272     if(ifun>=0) {
 273       TString sf("pol"); sf += ifun;
 274       gr->Fit(sf.Data(),optFit);
 275       printf("\n ** Fit by Polynomial of degree %i : %s **\n", ifun, sf.Data());
 276     } else if(!ctmp.Contains("no",TString::kIgnoreCase)){
 277       printf("\n ** ifun %i : %s **\n", ifun, fun);
 278       gr->Fit(fun, optFit);
 279     }
 280
 281     return gr;
 282 }
 283
 284 TGraphErrors *AliEMCALHistoUtilities::DrawGraphErrors(const Int_t n,Double_t *x,Double_t *y,Double_t *ex,
 285 Double_t *ey, Int_t markerColor,  Int_t markerStyle, const char* opt, const char* tit,
 286 const char* xTit,const char* yTit, Int_t ifun, const char *optFit, const char *fun)
 287 {
 288   // Oct 15, 2007
 289   printf("AliEMCALHistoUtilities::drawGraphErrors started \n");
 290   printf("Drawing opt |%s| : ifun %i: Fitting opt |%s|, fun |%s|\n",
 291          opt, ifun, optFit, fun);
 292
 293   TGraphErrors *gr = new TGraphErrors(n, x,y,ex,ey);
 294   gr->SetMarkerColor(markerColor);
 295   gr->SetLineColor(markerColor);
 296   gr->SetMarkerStyle(markerStyle);
 297   if(tit&&strlen(tit)>0) gr->SetTitle(tit);
 298
 299   TString ctmp(opt);
 300   if(ctmp.Contains("A")) {
 301      gr->GetHistogram()->SetXTitle(xTit);
 302      gr->GetHistogram()->SetYTitle(yTit);
 303   }
 304   if(ifun>0) {
 305     if(ifun != 999) {
 306       TString sf("pol"); sf += ifun;
 307       gr->Fit(sf.Data(),optFit);
 308       printf("\n ** Fit by Polynomial of degree %i : %s **\n", ifun, sf.Data());
 309     } else {
 310       gr->Fit(fun, optFit);
 311       printf("\n ** Fit by %s **\n", fun);
 312     }
 313   } else {
 314     if(strlen(optFit)) {
 315       printf("\n ** ifun %i : %s **\n", ifun, fun);
 316       gr->Fit(fun, optFit);
 317     }
 318   }
 319
 320   gr->Draw(opt);
 321
 322   return gr;
 323 }
 324
 325 TF1* AliEMCALHistoUtilities::GetResolutionFunction(const char *opt, TString &latexName)
 326 {
 327   // Oct 15, 2007
 328   TString sopt(opt);
 329   sopt.ToUpper();
 330   TF1 *fres=0;
 331   if      (sopt.Contains("FRES1")) {
 332     fres = new TF1("fres","[0]+[1]/sqrt(x)", 0.0, 101.);
 333     latexName = "#frac{#sigma_{E}}{E} = A+#frac{B}{#sqrt{E}}";
 334   } else if(sopt.Contains("FRES2")) {
 335     fres = new TF1("fres","sqrt([0]*[0]+[1]*[1]/x)", 0.0, 101.);
 336     latexName = "#sqrt{A^{2}+#frac{B^{2}}{E}}";
 337   }
 338   if(fres) {
 339     fres->SetParName(0,"A");
 340     fres->SetParName(1,"B");
 341
 342     fres->SetParameter(0, 2.0);
 343     fres->SetParameter(1, 6.6);
 344     fres->SetLineWidth(2);
 345     fres->SetLineColor(kRed);
 346   }
 347   return fres;
 348 }
 349
 350 void AliEMCALHistoUtilities::InitChain(TChain *chain, const char* nameListOfFiles, Int_t nFileMax)
 351 {
 352   // Read name of files from text file with nameListOfFiles and added to the chain
 353   if(chain==0 || nameListOfFiles==0) return;
 354
 355   ifstream fin;
 356   fin.open(nameListOfFiles);
 357   if (!fin.is_open()) {
 358     cout << "Input file "<<nameListOfFiles<<" cannot be opened.\n";
 359     return;
 360   }
 361
 362   Int_t nfiles = 0; // number of files in chain
 363   char nf[200];     // name of current file
 364   while (!fin.getline(nf,200).eof()) {
 365     if(!fin.good()) break;
 366     chain->Add(nf);
 367     nfiles++;
 368     cout<<nfiles<<" "<<nf<<endl;
 369     if(nFileMax && nfiles>=nFileMax) break;
 370   }
 371   fin.close();
 372   //
 373   cout << " \n ********** <I> Accepted file "<< nfiles << "********* \n"<<endl;
 374   //  chainEsd->Print();
 375   //  chain->Lookup();
 376 }
 377
 378 //AliRunLoader* AliEMCALHistoUtilities::InitKinematics(const Int_t nev, const char* galiceName)
 379 //{
 380 //  // Oct 15, 2007
 381 //  // nev == 0 - new file
 382 //  static AliRunLoader *rl = 0;
 383 //
 384 //  if((rl == 0 || nev==0) && galiceName) {
 385 //    //printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::InitKinematics() : nev %i : rl %p : %s (IN)\n",
 386 //      // nev, rl, galiceName);
 387 //    if(rl)  {
 388 //      rl->UnloadgAlice();
 389 //      delete rl;
 390 //    }
 391 //    rl = AliRunLoader::Open(galiceName,AliConfig::GetDefaultEventFolderName(),"read");
 392 //    rl->LoadgAlice(); // obligatory
 393 //    //printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::InitKinematics() : nev %i : rl %p : %s (OUT)\n",
 394 //       //nev, rl, galiceName);
 395 //  }
 396 //  if(rl) {
 397 //    rl->GetEvent(nev);
 398 //    rl->LoadKinematics();
 399 //    /* Get what you need after that
 400 //      rl->LoadHits();
 401 //      AliStack *stack=rl->Stack();
 402 //      AliESDCaloCluster * clus = esd->GetCaloCluster(n);
 403 //      Int_t label = clus->GetLabel(); // what is this
 404 //      TParticle *primary=stack->Particle(label);
 405 //    */
 406 //  }
 407 //  return rl;
 408 //}
 409
 410 //AliRunLoader* AliEMCALHistoUtilities::GetRunLoader(const Int_t nev, const Char_t* galiceName,
 411 //                                     const Char_t* eventFolderName, AliRunLoader* rlOld)
 412 //{
 413 //  // Nov 26, 2007
 414 //  // nev == 0 - new file
 415 //  AliRunLoader *rl = 0;
 416 //
 417 //  if(nev==0 && galiceName) {
 418 //    printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::GetLoader() : nev %i : %s (IN)\n",
 419 //         nev, galiceName);
 420 //    if(rlOld) {
 421 //      rlOld->UnloadgAlice();
 422 //      delete rlOld;
 423 //    }
 424 //    TString folderName(eventFolderName);
 425 //    if(folderName.Length() == 0) folderName = AliConfig::GetDefaultEventFolderName();
 426 //    rl = AliRunLoader::Open(galiceName, folderName.Data(),"read");
 427 //    rl->LoadgAlice(); // obligatory
 428 //    printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::GetLoader() : nev %i : %s : %s (OUT)\n",
 429 //         nev, galiceName, folderName.Data());
 430 //  } else {
 431 //    rl = rlOld;
 432 //  }
 433 //  if(rl) rl->LoadgAlice(); // obligatory
 434 //  // if(rl) rl->GetEvent(nev);
 435 //  return rl;
 436 //}
 437
 438 Double_t AliEMCALHistoUtilities::GetMomentum(const char* nameListOfFiles)
 439 {
 440   // Get momentum value from string  - like /....100GEV/..
 441   Double_t p=-1; // negative if undefined
 442   TString st(nameListOfFiles);
 443   if(st.Length()>=5) {
 444     st.ToUpper();
 445     Ssiz_t ind1 = st.Index("GEV"), ind2=0;
 446     if(ind1>0) {
 447       for(Int_t i=2; i<=10; i++) {
 448         ind2 = st.Index("/",ind1-i);
 449         if(ind2>0 && ind2<ind1) break;
 450       }
 451       TString mom  = st(ind2+1, ind1-ind2-1);
 452       if(mom.IsFloat()) p = mom.Atof();
 453       printf(" dir |%s| : mom |%s| : p %f : ind2,1 %i->%i\n", st.Data(), mom.Data(), p, ind2, ind1);
 454     }
 455   }
 456   return p;
 457 }
 458
 459 int AliEMCALHistoUtilities::ParseString(const TString &topt, TObjArray &Opt)
 460 {
 461   // Moved from AliEMCALGeometry
 462   // Feb 06, 2006
 463   Ssiz_t begin, index, end, end2;
 464   begin = index = end = end2 = 0;
 465   TRegexp separator("[^ ;,\\t\\s/]+");
 466   while ( (begin < topt.Length()) && (index != kNPOS) ) {
 467     // loop over given options
 468     index = topt.Index(separator,&end,begin);
 469     if (index >= 0 && end >= 1) {
 470       TString substring(topt(index,end));
 471       Opt.Add(new TObjString(substring.Data()));
 472     }
 473     begin += end+1;
 474   }
 475   return Opt.GetEntries();
 476 }
 477
 478 // Analysis utilites
 479 //Bool_t AliEMCALHistoUtilities::GetLorentzVectorFromESDCluster(TLorentzVector &v, const AliESDCaloCluster* cl)
 480 //{
 481 //  // May 8, 2007
 482 //  static Double_t e=0.0;
 483 //  static Float_t pos[3];
 484 //  static TVector3 gpos;
 485 //  if(cl==0) return kFALSE;
 486 //
 487 //  e = Double_t(cl->E());
 488 //  if(e<=0.0) {
 489 //    printf(" negative cluster energy : %f \n", e);
 490 //    return kFALSE;
 491 //  }
 492 //  cl->GetPosition(pos);
 493 //  gpos.SetXYZ(Double_t(pos[0]), Double_t(pos[1]), Double_t(pos[2]));
 494 //  gpos.SetMag(e);
 495 //  v.SetVectM(gpos, 0.0);
 496 //
 497 //  return kTRUE;
 498 //}
 499
 500 //Bool_t AliEMCALHistoUtilities::GetLorentzVectorFromRecPoint(TLorentzVector &v, const AliEMCALRecPoint  *rp)
 501 //{
 502 //  // Jun 20, 2007
 503 //  static Double_t e=0.0;
 504 //  static TVector3 gpos;
 505 //  if(rp==0) return kFALSE;
 506 //
 507 //  e = Double_t(rp->GetPointEnergy());
 508 //  if(e<=0.0) {
 509 //    printf(" negative rec.point energy : %f \n", e);
 510 //    return kFALSE;
 511 //  }
 512 //  rp->GetGlobalPosition(gpos);
 513 //  gpos.SetMag(e);
 514 //  v.SetVectM(gpos, 0.0);
 515 //
 516 //  return kTRUE;
 517 //}
 518 //
 519 //// Drawing:
 520 //
 521 void AliEMCALHistoUtilities::DrawHist(TH1* hid,int lineWidth,int lineColor,const char* opt, int lineStyle)
 522 {
 523   // Oct 15, 2007
 524   TString sopt;
 525   sopt = opt;
 526   if(!hid) return;
 527   printf(" Hist. %s : option |%s| \n", hid->GetName(), opt);
 528   if(hid && hid->GetEntries()>=1.) {
 529     if(lineWidth) hid->SetLineWidth(lineWidth);
 530     if(lineColor) hid->SetLineColor(lineColor);
 531     if(lineStyle) hid->SetLineStyle(lineStyle);
 532     if(sopt.Contains("stat",TString::kIgnoreCase)) hid->SetStats(kTRUE);
 533     hid->Draw(opt);
 534   } else {
 535     if   (strcmp(opt,"empty")==0) hid->Draw();
 536     else printf(" has fewer entries %i or hid is zero\n", (int) hid->GetEntries());
 537   }
 538 }
 539
 540 //
 541 //// Fitting:
 542 //
 543 TF1* AliEMCALHistoUtilities::Gausi(const char *addName,double xmi,double xma,double N,double mean,double sig,double width)
 544 {
 545   // Fit by gaus where first parameter is the number of events under ga
 546   // Oct 15, 2007
 547   TString name("gi");
 548   name += addName;
 549   TF1 *f = new TF1(name.Data(), Gi, xmi, xma, 4);
 550   f->SetParNames("INTEGRAL","MEAN","SIGMA","WIDTH");
 551
 552   f->SetParameter(0,N);
 553   f->SetParameter(1,mean);
 554   f->SetParameter(2,sig);
 555
 556   f->FixParameter(3,width); // width of histogramm bin
 557   return f;
 558 }
 559
 560 TF1* AliEMCALHistoUtilities::Gausi(const char *addName, double xmi, double xma, TH1 *h)
 561 {
 562   // You can change parameters after that if you don't like this assumption
 563   if(h) return Gausi(addName, xmi, xma, h->Integral(), h->GetMean(),h->GetRMS(), h->GetBinWidth(1));
 564   else  return 0;
 565 }
 566
 567 TF1* AliEMCALHistoUtilities::GausiPol2(const char *addName,double xmi,double xma, TF1 *g, TF1* bg)
 568 {
 569   // Fit by gaus where first parameter is the number of events under ga
 570   TString name("giPol2");
 571   name += addName;
 572   TF1 *f = new TF1(name.Data(), GiPol2, xmi, xma, 7);
 573   f->SetParNames("INTEGRAL","MEAN","SIGMA","WIDTH","a0","a1","a2");
 574
 575   if(g) {
 576     for(int i=0; i<4; i++) f->SetParameter(i, g->GetParameter(i));
 577     f->FixParameter(3,g->GetParameter(3));
 578   }
 579
 580   if(bg) {
 581     for(int i=4; i<7; i++) f->SetParameter(i, bg->GetParameter(i+4));
 582   }
 583   f->SetLineColor(kRed);
 584   return f;
 585 }
 586
 587 Double_t AliEMCALHistoUtilities::Gi(Double_t *x, Double_t *par)
 588 {
 589   // First parameter is integral (number events under gaus)
 590   // Forth parameter (par[3]) is width of histogram bin
 591   // gaus(0) is a substitute for [0]*exp(-0.5*((x-[1])/[2])**2)
 592
 593   static Double_t c = TMath::Sqrt(2.*TMath::Pi()), y=0.0, f=0.0; // sqrt(2.*pi)
 594
 595   y  = (x[0]-par[1])/par[2];
 596   f  = par[0]*par[3]/(par[2]*c) * TMath::Exp(-0.5*y*y);
 597
 598   return f;
 599 }
 600
 601 Double_t AliEMCALHistoUtilities::GiPol2(Double_t *x, Double_t *par)
 602 {
 603   // First parameter is integral (number events under gaus)
 604   // Forth parameter (par[3]) is width of histogram bin
 605   // gaus(0) is a substitute for [0]*exp(-0.5*((x-[1])/[2])**2)
 606   // + pol2 -> 7 parameters
 607   static Double_t c = TMath::Sqrt(2.*TMath::Pi()), y=0.0, f=0.0; // sqrt(2.*pi)
 608
 609   y  = (x[0]-par[1])/par[2];
 610   f  = par[0]*par[3]/(par[2]*c) * TMath::Exp(-0.5*y*y);
 611
 612   f += par[4] + par[5]*x[0] + par[6]*x[0]*x[0];
 613
 614   return f;
 615 }
 616
 617 // Calibration stuff
 618 Double_t AliEMCALHistoUtilities::GetCorrectionCoefficientForGamma1(const Double_t eRec)
 619 {
 620   // Correction to rec.energy - Jul 15, 2007
 621   // E(gamma) = corr * E(eRec);
 622   /* corr = p0*(eRec-7.5)+p1*(eRec-7.5)*(eRec-7.5)+p2; 0.0<eRec<10.0
 623    1  p0           6.07157e-05   1.15179e-04  -0.00000e+00   1.20997e-03
 624    2  p1           1.50019e-04   3.13566e-05  -0.00000e+00   1.22531e-02
 625    3  p2           9.99019e-01   4.08251e-04  -0.00000e+00   1.40606e-03
 626
 627      corr = p3 + p4*eRec + p5*eRec*eRec
 628    1  p3           9.97135e-01   5.31970e-04   1.37962e-09   1.68120e-08
 629    2  p4           3.15740e-04   2.53371e-05   1.11475e-11   1.74192e-04
 630    3  p5          -1.35383e-06   2.19495e-07  -5.82864e-13   4.52277e-02
 631   */
 632   static Double_t p0=6.07157e-05, p1=1.50019e-04, p2=9.99019e-01;
 633   static Double_t p3=9.97135e-01, p4=3.15740e-04, p5=-1.35383e-06;
 634   static Double_t corr=1.0;
 635   if(eRec>=0.0 && eRec <=10.0) {
 636     corr = p0*(eRec-7.5) + p1*(eRec-7.5)*(eRec-7.5) + p2;
 637   } else if(eRec>10.0 && eRec <=105.0) {
 638     corr = p3 + p4*eRec + p5*eRec*eRec;
 639   }
 640   //printf(" eRec %f | corr %f \n", eRec, corr);
 641   return corr;
 642 }
 643
 644 Double_t AliEMCALHistoUtilities::GetCorrectedEnergyForGamma1(const Double_t eRec)
 645 {
 646   return GetCorrectionCoefficientForGamma1(eRec) * eRec;
 647 }
 648
 649 // Trigger
 650 TList* AliEMCALHistoUtilities::GetTriggersListOfHists(const Int_t scale, const Int_t nTrig, const Bool_t toBrowser)
 651 {
 652   // Oct 22, 2007 - trigger technical assurance
 653   gROOT->cd();
 654   TH1::AddDirectory(1);
 655
 656   new TH1F("00_hXpos2x2", "X coord. of max Amp 2x2",100, -500., +500.);
 657   new TH1F("01_hYpos2x2", "Y coord. of max Amp 2x2",100, -500., +500.);
 658   new TH1F("02_hZpos2x2", "Z coord. of max Amp 2x2",100, -500., +500.);
 659   new TH1F("03_hXposnxn", "X coord. of max Amp NXN",100, -500., +500.);
 660   new TH1F("04_hYposnxn", "Y coord. of max Amp NXN",100, -500., +500.);
 661   new TH1F("05_hZposnxn", "Z coord. of max Amp NXN",100, -500., +500.);
 662   // May 7, 2008 - jet trigger
 663   new TH1F("06_hJetTriggerPhi", "%phi of COG of jet trigger patch", 110, 80., 190.);
 664   new TH1F("07_hJetTriggerEta", "%eta of COG of jet trigger patch", 70, -0.7, +0.7);
 665   //
 666   new TH1F("08_hMaxAmp2x2", "max Amp 2x2", 1000, 0.0, pow(2.,14.));
 667   new TH1F("09_hAmpOutOf2x2", "Amp out of patch 2x2", 1000, 0.0, pow(2.,14.));
 668   new TH1F("10_hMaxAmpnxn", "max Amp NXN", 1000, 0.0, pow(2.,14.));
 669   new TH1F("11_hAmpOutOfnxn", "Amp out of patch nxn", 1000, 0.0, pow(2.,14.));
 670   // May 7, 2008 - jet trigger
 671   for(Int_t i=0; i<nTrig; i++) {
 672     new TH1F(Form("%2.2i_hJetPatchAmp%2.2i",i+12,i), Form("jet patch amplitude : jet trig %i",i),
 673     1000, 0.0, pow(2.,14.));
 674   }
 675   // For checking
 676   Double_t maxEdigit=100., maxN=1000., maxPC = 200.;
 677   if(scale==1) {
 678     maxN  *= 10.;
 679     maxPC *= 10.;
 680   }
 681   Int_t ind = 12+nTrig;
 682   new TH1F(Form("%2.2i_hDigitsAmp",ind++), "amplitude of digits (PC)  ", 1001, -0.5, 1000.5);
 683   new TH1F(Form("%2.2i_hDigitsE",ind++), " energy of digits (PC)", 1000, 0.0, maxEdigit);
 684   new TH1F(Form("%2.2i_hNDigitsInPCs",ind++), " number of digits in PC's", 1000, 0.0, maxN);
 685   new TH1F(Form("%2.2i_hEinInPCs",ind++), " energy in PC's", 200, 0.0, maxPC);
 686
 687   return MoveHistsToList("TriggerLiOfHists", toBrowser);
 688 }
 689
 690 void AliEMCALHistoUtilities::FillTriggersListOfHists(TList *l, TArrayF *triggerPosition, TArrayF *triggerAmplitudes)
 691 {
 692   // Oct 22, 2007 - trigger technical assurance
 693   if(l==0) {
 694     printf("<E> FillTriggersListOfHists() : list of hists undefined. \n");
 695     return;
 696   }
 697   for(int i=0; i<triggerPosition->GetSize(); i++) {
 698     FillH1(l, i, double(triggerPosition->At(i)));
 699   }
 700
 701   for(int i=0; i<triggerAmplitudes->GetSize(); i++) {
 702     FillH1(l, triggerPosition->GetSize() + i, double(triggerAmplitudes->At(i)) );
 703   }
 704 }
 705
 706 // Jet(s) kinematics
 707 TList* AliEMCALHistoUtilities::GetJetsListOfHists(Int_t njet, Bool_t toBrowser)
 708 {
 709   // Oct 30, 2007
 710   gROOT->cd();
 711   TH1::AddDirectory(1);
 712   new TH1F("00_nJet", "number of jets in Pythia",5, -0.5, +4.5);
 713   int ic=1;
 714   for(Int_t ij=0; ij<njet; ij++)
 715   {
 716     new TH1F(Form("%2.2i_EtaOfJet%i",ic++,ij), Form("#eta of jet (%i)",ij),80, -2., 2.);
 717     new TH1F(Form("%2.2i_ThetaOfJet%i",ic++,ij), Form("#theta(degree) of jet (%i)",ij),
 718     180, 0.0, 180.);
 719     new TH1F(Form("%2.2i_PhiOfJet%i",ic++,ij), Form("#phi(degree) of jet (%i)",ij),
 720     180, 0.0, 360.);
 721     new TH1F(Form("%2.2i_PtOfJet%i",ic++,ij), Form(" p_{T} of jet (%i)",ij),
 722     200, 0.0, 200.);
 723     new TH1F(Form("%2.2i_EOfJet%i",ic++,ij), Form(" E of jet (%i)",ij),
 724     200, 0.0, 200.);
 725   }
 726
 727   return MoveHistsToList("JetLiOfHists", toBrowser);
 728 }
 729
 730 //void  AliEMCALHistoUtilities::FillJetKineListOfHists(TList *l, AliRunLoader* rl, TLorentzVector &goodJet)
 731 //{
 732 //  // Oct 30, 2007; Nov 07;
 733 //  // goodJet - output; only one jet with EMCAL acceptance
 734 //
 735 //  // Bad case
 736 //  goodJet.SetPxPyPzE(0., 0., 0., 0.);
 737 //
 738 //  if(l==0 || rl==0) return;
 739 //  //try to get trigger jet info
 740 //  AliHeader* alih = rl->GetHeader();
 741 //  if (alih == 0) return;
 742 //
 743 //  AliGenEventHeader * genh = alih->GenEventHeader();
 744 //  if (genh == 0) return;
 745 //
 746 //  AliGenPythiaEventHeader* genhpy = dynamic_cast<AliGenPythiaEventHeader *>(genh);
 747 //  if(genhpy==0) return; // Not Pythia
 748 //
 749 //  Int_t nj = genhpy->NTriggerJets();
 750 //  FillH1(l, 0, double(nj));
 751 //
 752 //  TLorentzVector* jets[4];
 753 //  nj = nj>4?4:nj;
 754 //
 755 //  int ic=1;
 756 //  for (Int_t i=0; i< nj; i++) {
 757 //     Float_t p[4];
 758 //     genhpy->TriggerJet(i,p);
 759 //     jets[i] = new TLorentzVector(p);
 760 //     FillH1(l, ic++, jets[i]->Eta());
 761 //     FillH1(l, ic++, jets[i]->Theta()*TMath::RadToDeg());
 762 //     FillH1(l, ic++, TVector2::Phi_0_2pi(jets[i]->Phi())*TMath::RadToDeg());
 763 //     FillH1(l, ic++, jets[i]->Pt());
 764 //     FillH1(l, ic++, jets[i]->E());
 765 //
 766 //     //printf(" %i pj %f %f %f %f : ic %i\n", i, p[0], p[1], p[2], p[3], ic);
 767 //     if(ic >= l->GetSize()) break;
 768 //  }
 769 //  if(nj==1) {
 770 //    Double_t eta=jets[0]->Eta(), phi=TVector2::Phi_0_2pi(jets[0]->Phi())*TMath::RadToDeg();
 771 //    if(TMath::Abs(eta)<0.5 && (phi>90.&&phi<180.)) {
 772 //      goodJet = (*jets[0]);
 773 //    }
 774 //  }
 775 //}