EMCAL/AliEMCALQADataMakerRec.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /*
  16 Based on the QA code for PHOS written by Yves Schutz July 2007
  17
  18 Authors:  J.Klay (Cal Poly) May 2008
  19           S. Salur LBL April 2008
  20
  21 */
  22
  23 // --- ROOT system ---
  24 #include <TClonesArray.h>
  25 #include <TFile.h>
  26 #include <TH1F.h>
  27 #include <TH1I.h>
  28 #include <TH2F.h>
  29 #include <TProfile.h>
  30
  31 // --- Standard library ---
  32
  33
  34 // --- AliRoot header files ---
  35 #include "AliESDCaloCluster.h"
  36 #include "AliESDCaloCells.h"
  37 #include "AliESDEvent.h"
  38 #include "AliLog.h"
  39 #include "AliEMCALQADataMakerRec.h"
  40 #include "AliQAChecker.h"
  41 #include "AliEMCALDigit.h"
  42 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  43 #include "AliEMCALRawUtils.h"
  44 #include "AliEMCALReconstructor.h"
  45 #include "AliEMCALRecParam.h"
  46 #include "AliRawReader.h"
  47 #include "AliCaloRawStreamV3.h"
  48 #include "AliEMCALGeoParams.h"
  49
  50 ClassImp(AliEMCALQADataMakerRec)
  51
  52 //____________________________________________________________________________
  53   AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec() :
  54     AliQADataMakerRec(AliQAv1::GetDetName(AliQAv1::kEMCAL), "EMCAL Quality Assurance Data Maker"),
  55     fSuperModules(4), // FIXME!!! number of SuperModules; 4 for 2009; update default to 12 for later runs..
  56     fFirstPedestalSample(0),
  57     fLastPedestalSample(15),
  58     fMinSignalHG(0),
  59     fMaxSignalHG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax)
  60 {
  61   // ctor
  62 }
  63
  64 //____________________________________________________________________________
  65 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(const AliEMCALQADataMakerRec& qadm) :
  66   AliQADataMakerRec(),
  67   fSuperModules(qadm.GetSuperModules()),
  68   fFirstPedestalSample(qadm.GetFirstPedestalSample()),
  69   fLastPedestalSample(qadm.GetLastPedestalSample()),
  70   fMinSignalHG(qadm.GetMinSignalHG()),
  71   fMaxSignalHG(qadm.GetMaxSignalHG())
  72 {
  73   //copy ctor
  74   SetName((const char*)qadm.GetName()) ;
  75   SetTitle((const char*)qadm.GetTitle());
  76 }
  77
  78 //__________________________________________________________________
  79 AliEMCALQADataMakerRec& AliEMCALQADataMakerRec::operator = (const AliEMCALQADataMakerRec& qadm )
  80 {
  81   // Equal operator.
  82   this->~AliEMCALQADataMakerRec();
  83   new(this) AliEMCALQADataMakerRec(qadm);
  84   return *this;
  85 }
  86
  87 //____________________________________________________________________________
  88 void AliEMCALQADataMakerRec::EndOfDetectorCycle(AliQAv1::TASKINDEX_t task, TObjArray ** list)
  89 {
  90   //Detector specific actions at end of cycle
  91   // do the QA checking
  92   AliQAChecker::Instance()->Run(AliQAv1::kEMCAL, task, list) ;
  93 }
  94
  95 //____________________________________________________________________________
  96 void AliEMCALQADataMakerRec::InitESDs()
  97 {
  98   //Create histograms to controll ESD
  99   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 100   const Bool_t image    = kTRUE ;
 101
 102   TH1F * h1 = new TH1F("hESDCaloClusterE",  "ESDs CaloCluster energy in EMCAL;Energy [MeV];Counts",    200, 0., 20.) ;
 103   h1->Sumw2() ;
 104   Add2ESDsList(h1, kESDCaloClusE, !expert, image)  ;
 105
 106   TH1I * h2 = new TH1I("hESDCaloClusterM", "ESDs CaloCluster multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 100, 0,  100) ;
 107   h2->Sumw2() ;
 108   Add2ESDsList(h2, kESDCaloClusM, !expert, image)  ;
 109
 110   TH1F * h3 = new TH1F("hESDCaloCellA",  "ESDs CaloCell amplitude in EMCAL;Energy [MeV];Counts",    500, 0., 250.) ;
 111   h3->Sumw2() ;
 112   Add2ESDsList(h3, kESDCaloCellA, !expert, image)  ;
 113
 114   TH1I * h4 = new TH1I("hESDCaloCellM", "ESDs CaloCell multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 200, 0,  1000) ;
 115   h4->Sumw2() ;
 116   Add2ESDsList(h4, kESDCaloCellM, !expert, image) ;
 117
 118 }
 119
 120 //____________________________________________________________________________
 121 void AliEMCALQADataMakerRec::InitDigits()
 122 {
 123   // create Digits histograms in Digits subdir
 124   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 125   const Bool_t image    = kTRUE ;
 126
 127   TH1I * h0 = new TH1I("hEmcalDigits",    "Digits amplitude distribution in EMCAL;Amplitude [ADC counts];Counts",    500, 0, 500) ;
 128   h0->Sumw2() ;
 129   Add2DigitsList(h0, 0, !expert, image) ;
 130   TH1I * h1 = new TH1I("hEmcalDigitsMul", "Digits multiplicity distribution in EMCAL;# of Digits;Entries", 200, 0, 2000) ;
 131   h1->Sumw2() ;
 132   Add2DigitsList(h1, 1, !expert, image) ;
 133 }
 134
 135 //____________________________________________________________________________
 136 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRecPoints()
 137 {
 138   // create Reconstructed Points histograms in RecPoints subdir
 139   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 140   const Bool_t image    = kTRUE ;
 141
 142   TH1F* h0 = new TH1F("hEMCALRpE","EMCAL RecPoint energies;Energy [MeV];Counts",200, 0.,20.); //GeV
 143   h0->Sumw2();
 144   Add2RecPointsList(h0,kRecPE, !expert, image);
 145
 146   TH1I* h1 = new TH1I("hEMCALRpM","EMCAL RecPoint multiplicities;# of Clusters;Entries",100,0,100);
 147   h1->Sumw2();
 148   Add2RecPointsList(h1,kRecPM, !expert, image);
 149
 150   TH1I* h2 = new TH1I("hEMCALRpDigM","EMCAL RecPoint Digit Multiplicities;# of Digits;Entries",20,0,20);
 151   h2->Sumw2();
 152   Add2RecPointsList(h2,kRecPDigM, !expert, image);
 153
 154 }
 155
 156 //____________________________________________________________________________
 157 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRaws()
 158 {
 159   // create Raws histograms in Raws subdir
 160    const Bool_t expert   = kTRUE ;
 161    const Bool_t saveCorr = kTRUE ;
 162    const Bool_t image    = kTRUE ;
 163
 164   int nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 165   int nTot = fSuperModules * nTowersPerSM; // max number of towers in all SuperModules
 166
 167   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 168   TProfile * h0 = new TProfile("hLowEmcalSupermodules", "Low Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 169                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 170   Add2RawsList(h0, kNsmodLG, !expert, image, !saveCorr) ;
 171   TProfile * h1 = new TProfile("hHighEmcalSupermodules", "High Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 172                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 173   Add2RawsList(h1, kNsmodHG, !expert, image, !saveCorr) ;
 174
 175   // where did max sample occur? (bins are towers)
 176   TProfile * h2 = new TProfile("hLowEmcalRawtime", "Low Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 177                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 178   Add2RawsList(h2, kTimeLG, !expert, image, !saveCorr) ;
 179   TProfile * h3 = new TProfile("hHighEmcalRawtime", "High Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 180                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 181   Add2RawsList(h3, kTimeHG, !expert, image, !saveCorr) ;
 182
 183   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are towers)
 184   TProfile * h4 = new TProfile("hLowEmcalRawMaxMinusMin", "Low Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 185                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 186   Add2RawsList(h4, kSigLG, !expert, image, !saveCorr) ;
 187   TProfile * h5 = new TProfile("hHighEmcalRawMaxMinusMin", "High Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 188                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 189   Add2RawsList(h5, kSigHG, !expert, image, !saveCorr) ;
 190
 191   // total counter: channels per event
 192   TH1I * h6 = new TH1I("hLowNtot", "Low Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200, 0, nTot) ;
 193   h6->Sumw2() ;
 194   Add2RawsList(h6, kNtotLG, !expert, image, !saveCorr) ;
 195   TH1I * h7 = new TH1I("hHighNtot", "High Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200,0, nTot) ;
 196   h7->Sumw2() ;
 197   Add2RawsList(h7, kNtotHG, !expert, image, !saveCorr) ;
 198
 199   // pedestal (bins are towers)
 200   TProfile * h8 = new TProfile("hLowEmcalRawPed", "Low Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 201                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 202   Add2RawsList(h8, kPedLG, !expert, image, !saveCorr) ;
 203   TProfile * h9 = new TProfile("hHighEmcalRawPed", "High Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 204                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 205   Add2RawsList(h9, kPedHG, !expert, image, !saveCorr) ;
 206
 207   // pedestal rms (standard dev = sqrt of variance estimator for pedestal) (bins are towers)
 208   TProfile * h10 = new TProfile("hLowEmcalRawPedRMS", "Low Gain EMC: Pedestal RMS vs towerId;Tower Id;Width [ADC counts]",
 209                                 nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 210   Add2RawsList(h10, kPedRMSLG, !expert, image, !saveCorr) ;
 211   TProfile * h11 = new TProfile("hHighEmcalRawPedRMS", "High Gain EMC: Pedestal RMS vs towerId;Tower Id;Width [ADC counts]",
 212                                 nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 213   Add2RawsList(h11, kPedRMSHG, !expert, image, !saveCorr) ;
 214
 215
 216   // now repeat the same for TRU and LEDMon data
 217   int nTot2x2 = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // max number of TRU channels for all SuperModules
 218
 219   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 220   TProfile * hT0 = new TProfile("hTRUEmcalSupermodules", "TRU EMC: # of TRU channels vs SuperMod;SM Id;# of TRU channels",
 221                                 fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 222   Add2RawsList(hT0, kNsmodTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 223
 224   // where did max sample occur? (bins are TRU channels)
 225   TProfile * hT1 = new TProfile("hTRUEmcalRawtime", "TRU EMC: Time at Max vs 2x2Id;2x2 Id;Time [ticks]",
 226                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
 227   Add2RawsList(hT1, kTimeTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 228
 229   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are TRU channels)
 230   TProfile * hT2 = new TProfile("hTRUEmcalRawMaxMinusMin", "TRU EMC: Max - Min vs 2x2Id;2x2 Id;Max-Min [ADC counts]",
 231                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
 232   Add2RawsList(hT2, kSigTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 233
 234   // total counter: channels per event
 235   TH1I * hT3 = new TH1I("hTRUNtot", "TRU EMC: Total Number of found TRU channels;# of TRU Channels;Counts", 200, 0, nTot2x2) ;
 236   hT3->Sumw2() ;
 237   Add2RawsList(hT3, kNtotTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 238
 239   // pedestal (bins are TRU channels)
 240   TProfile * hT4 = new TProfile("hTRUEmcalRawPed", "TRU EMC: Pedestal vs 2x2Id;2x2 Id;Pedestal [ADC counts]",
 241                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
 242   Add2RawsList(hT4, kPedTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 243
 244   // pedestal rms (standard dev = sqrt of variance estimator for pedestal) (bins are TRU channels)
 245   TProfile * hT5 = new TProfile("hTRUEmcalRawPedRMS", "TRU EMC: Pedestal RMS vs 2x2Id;2x2 Id;Width [ADC counts]",
 246                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
 247   Add2RawsList(hT5, kPedRMSTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 248
 249   // and also LED Mon..
 250   // LEDMon has both high and low gain channels, just as regular FEE/towers
 251   int nTotLEDMon = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // max number of LEDMon channels for all SuperModules
 252
 253   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 254   TProfile * hL0 = new TProfile("hLowLEDMONEmcalSupermodules", "LowLEDMON Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 255                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 256   Add2RawsList(hL0, kNsmodLGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 257   TProfile * hL1 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalSupermodules", "HighLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 258                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 259   Add2RawsList(hL1, kNsmodHGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 260
 261   // where did max sample occur? (bins are strips)
 262   TProfile * hL2 = new TProfile("hLowLEDMONEmcalRawtime", "LowLEDMON Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 263                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 264   Add2RawsList(hL2, kTimeLGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 265   TProfile * hL3 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawtime", "HighLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 266                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 267   Add2RawsList(hL3, kTimeHGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 268
 269   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are strips)
 270   TProfile * hL4 = new TProfile("hLowLEDMONEmcalRawMaxMinusMin", "LowLEDMON Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 271                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 272   Add2RawsList(hL4, kSigLGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 273   TProfile * hL5 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "HighLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 274                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 275   Add2RawsList(hL5, kSigHGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 276
 277   // total counter: channels per event
 278   TH1I * hL6 = new TH1I("hLowLEDMONNtot", "LowLEDMON Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200, 0, nTotLEDMon) ;
 279   hL6->Sumw2() ;
 280   Add2RawsList(hL6, kNtotLGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 281   TH1I * hL7 = new TH1I("hHighLEDMonNtot", "HighLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200,0, nTotLEDMon) ;
 282   hL7->Sumw2() ;
 283   Add2RawsList(hL7, kNtotHGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 284
 285   // pedestal (bins are strips)
 286   TProfile * hL8 = new TProfile("hLowLEDMONEmcalRawPed", "LowLEDMON Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 287                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 288   Add2RawsList(hL8, kPedLGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 289   TProfile * hL9 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPed", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 290                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 291   Add2RawsList(hL9, kPedHGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 292
 293   // pedestal rms (standard dev = sqrt of variance estimator for pedestal) (bins are strips)
 294   TProfile * hL10 = new TProfile("hLowLEDMONEmcalRawPedRMS", "LowLEDMON Gain EMC: Pedestal RMS vs stripId;Strip Id;Width [ADC counts]",
 295                                 nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 296   Add2RawsList(hL10, kPedRMSLGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 297   TProfile * hL11 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPedRMS", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal RMS vs stripId;Strip Id;Width [ADC counts]",
 298                                 nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 299   Add2RawsList(hL11, kPedRMSHGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 300
 301 }
 302
 303 //____________________________________________________________________________
 304 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeESDs(AliESDEvent * esd)
 305 {
 306   // make QA data from ESDs
 307
 308   Int_t nTot = 0 ;
 309   for ( Int_t index = 0; index < esd->GetNumberOfCaloClusters() ; index++ ) {
 310     AliESDCaloCluster * clu = esd->GetCaloCluster(index) ;
 311     if( clu->IsEMCAL() ) {
 312       GetESDsData(kESDCaloClusE)->Fill(clu->E()) ;
 313       nTot++ ;
 314     }
 315   }
 316   GetESDsData(kESDCaloClusM)->Fill(nTot) ;
 317
 318   //fill calo cells
 319   AliESDCaloCells* cells = esd->GetEMCALCells();
 320   GetESDsData(kESDCaloCellM)->Fill(cells->GetNumberOfCells()) ;
 321
 322   for ( Int_t index = 0; index < cells->GetNumberOfCells() ; index++ ) {
 323     GetESDsData(kESDCaloCellA)->Fill(cells->GetAmplitude(index)) ;
 324   }
 325
 326 }
 327
 328 //____________________________________________________________________________
 329 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRaws(AliRawReader* rawReader)
 330 {
 331   //Fill prepared histograms with Raw digit properties
 332
 333   //Raw histogram filling not yet implemented
 334   //
 335   //Need to figure out how to get the info we want without having to
 336   //actually run Raw2Digits twice.
 337   //I suspect what we actually want is a raw digits method, not a true
 338   //emcal raw data method, but this doesn't seem to be allowed in
 339   //AliQADataMakerRec.h
 340
 341   // For now, to avoid redoing the expensive signal fits we just
 342   // look at max vs min of the signal spextra, a la online usage in
 343   // AliCaloCalibPedestal
 344
 345   rawReader->Reset() ;
 346   AliCaloRawStreamV3 in(rawReader,"EMCAL");
 347
 348   // setup
 349   int nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 350   int nRows = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; // number of rows per SuperModule
 351   int nStripsPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // number of strips per SuperModule
 352   int n2x2PerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // number of TRU 2x2's per SuperModule
 353
 354   int sampleMin = 0;
 355   int sampleMax = AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax; // 0x3ff = 1023 = 10-bit range
 356
 357   // for the pedestal calculation
 358   Bool_t selectPedestalSamples = kTRUE;
 359
 360   // SM counters; decl. should be safe, assuming we don't get more than expected SuperModules..
 361   int nTotalSMLG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 362   int nTotalSMHG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 363   int nTotalSMTRU[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 364   int nTotalSMLGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 365   int nTotalSMHGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 366
 367   // indices for the reading
 368   int iSM = 0;
 369   int sample = 0;
 370   int time = 0;
 371   // counters, on sample level
 372   int i = 0; // the sample number in current event.
 373   int maxTime = 0;
 374   int startBin = 0;
 375
 376   // calc. quantities
 377   double meanPed = 0, squaredMean = 0, rmsPed = 0;
 378
 379   // start loop over input stream
 380   while (in.NextDDL()) {
 381     while (in.NextChannel()) {
 382
 383       // counters
 384       int max = sampleMin, min = sampleMax; // min and max sample values
 385
 386       // for the pedestal calculation
 387       int sampleSum = 0; // sum of samples
 388       int squaredSampleSum = 0; // sum of samples squared
 389       int nSum = 0; // number of samples in sum
 390
 391       while (in.NextBunch()) {
 392         const UShort_t *sig = in.GetSignals();
 393         startBin = in.GetStartTimeBin();
 394         for (i = 0; i < in.GetBunchLength(); i++) {
 395           sample = sig[i];
 396           time = startBin--;
 397
 398           // check if it's a min or max value
 399           if (sample < min) min = sample;
 400           if (sample > max) {
 401             max = sample;
 402             maxTime = time;
 403           }
 404
 405           // should we add it for the pedestal calculation?
 406           if ( (fFirstPedestalSample<=time && time<=fLastPedestalSample) || // sample time in range
 407                !selectPedestalSamples ) { // or we don't restrict the sample range.. - then we'll take all
 408             sampleSum += sample;
 409             squaredSampleSum += sample*sample;
 410             nSum++;
 411           }
 412
 413         } // loop over samples in bunch
 414       } // loop over bunches
 415
 416       // calculate pedesstal estimate: mean of possibly selected samples
 417       if (nSum > 0) {
 418         meanPed = sampleSum / (1.0 * nSum);
 419         squaredMean = squaredSampleSum / (1.0 * nSum);
 420         // The variance (rms squared) is equal to the mean of the squares minus the square of the mean..
 421         rmsPed = sqrt(squaredMean - meanPed*meanPed);
 422       }
 423       else {
 424         meanPed = 0;
 425         squaredMean = 0;
 426         rmsPed  = 0;
 427       }
 428
 429       // it should be enough to check the SuperModule info for each DDL really, but let's keep it here for now
 430       iSM = in.GetModule(); //The modules are numbered starting from 0
 431
 432       if (iSM>=0 && iSM<fSuperModules) { // valid module reading, can go on with filling
 433
 434         if ( in.IsLowGain() || in.IsHighGain() ) { // regular towers
 435           int towerId = iSM*nTowersPerSM + in.GetColumn()*nRows + in.GetRow();
 436
 437           if ( in.IsLowGain() ) {
 438             //fill the low gain histograms, and counters
 439             nTotalSMLG[iSM]++; // one more channel found
 440             GetRawsData(kSigLG)->Fill(towerId, max - min);
 441             GetRawsData(kTimeLG)->Fill(towerId, maxTime);
 442             if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
 443               GetRawsData(kPedLG)->Fill(towerId, meanPed);
 444               GetRawsData(kPedRMSLG)->Fill(towerId, rmsPed);
 445             }
 446           } // gain==0
 447           else if ( in.IsHighGain() ) {
 448             //fill the high gain ones
 449             nTotalSMHG[iSM]++; // one more channel found
 450             int signal = max - min;
 451             // only fill the max-min signal info and maxTime, if the
 452             // signal was in the selected range
 453             if ( (signal > fMinSignalHG) && (signal < fMaxSignalHG) ) {
 454               GetRawsData(kSigHG)->Fill(towerId, signal);
 455               GetRawsData(kTimeHG)->Fill(towerId, maxTime);
 456             } // signal
 457             if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
 458               GetRawsData(kPedHG)->Fill(towerId, meanPed);
 459               GetRawsData(kPedRMSHG)->Fill(towerId, rmsPed);
 460             }
 461           }
 462         } // low or high gain
 463         // TRU
 464         else if ( in.IsTRUData() ) {
 465           // for TRU data, the mapping class holds the channel info in the Column..
 466           int TRU2x2Id = iSM*n2x2PerSM + in.GetColumn();
 467
 468           //fill the low gain histograms, and counters
 469           nTotalSMTRU[iSM]++; // one more channel found
 470           GetRawsData(kSigTRU)->Fill(TRU2x2Id, max - min);
 471           GetRawsData(kTimeTRU)->Fill(TRU2x2Id, maxTime);
 472           if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
 473             GetRawsData(kPedTRU)->Fill(TRU2x2Id, meanPed);
 474             GetRawsData(kPedRMSTRU)->Fill(TRU2x2Id, rmsPed);
 475           }
 476         }
 477         // LED Mon
 478         else if ( in.IsLEDMonData() ) {
 479           // for LED Mon data, the mapping class holds the gain info in the Row variable
 480           // and the Strip number in the Column..
 481           int gain = in.GetRow();
 482           int stripId = iSM*nStripsPerSM + in.GetColumn();
 483
 484           if ( gain == 0 ) {
 485             //fill the low gain histograms, and counters
 486             nTotalSMLGLEDMon[iSM]++; // one more channel found
 487             GetRawsData(kSigLGLEDMon)->Fill(stripId, max - min);
 488             GetRawsData(kTimeLGLEDMon)->Fill(stripId, maxTime);
 489             if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
 490               GetRawsData(kPedLGLEDMon)->Fill(stripId, meanPed);
 491               GetRawsData(kPedRMSLGLEDMon)->Fill(stripId, rmsPed);
 492             }
 493           } // gain==0
 494           else if ( gain == 1 ) {
 495             //fill the high gain ones
 496             nTotalSMHGLEDMon[iSM]++; // one more channel found
 497             GetRawsData(kSigHGLEDMon)->Fill(stripId, max - min);
 498             GetRawsData(kTimeHGLEDMon)->Fill(stripId, maxTime);
 499             if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
 500               GetRawsData(kPedHGLEDMon)->Fill(stripId, meanPed);
 501               GetRawsData(kPedRMSHGLEDMon)->Fill(stripId, rmsPed);
 502             }
 503           } // low or high gain
 504         } // LEDMon
 505
 506       } // SM index OK
 507
 508     }// end while over channel
 509
 510   }//end while over DDL's, of input stream
 511
 512   // let's also fill the SM and event counter histograms
 513   int nTotalHG = 0;
 514   int nTotalLG = 0;
 515   int nTotalTRU = 0;
 516   int nTotalHGLEDMon = 0;
 517   int nTotalLGLEDMon = 0;
 518   for (iSM=0; iSM<fSuperModules; iSM++) {
 519     nTotalLG += nTotalSMLG[iSM];
 520     nTotalHG += nTotalSMHG[iSM];
 521     nTotalTRU += nTotalSMTRU[iSM];
 522     nTotalLG += nTotalSMLGLEDMon[iSM];
 523     nTotalHG += nTotalSMHGLEDMon[iSM];
 524     GetRawsData(kNsmodLG)->Fill(iSM, nTotalSMLG[iSM]);
 525     GetRawsData(kNsmodHG)->Fill(iSM, nTotalSMHG[iSM]);
 526     GetRawsData(kNsmodTRU)->Fill(iSM, nTotalSMTRU[iSM]);
 527     GetRawsData(kNsmodLGLEDMon)->Fill(iSM, nTotalSMLGLEDMon[iSM]);
 528     GetRawsData(kNsmodHGLEDMon)->Fill(iSM, nTotalSMHGLEDMon[iSM]);
 529   }
 530   GetRawsData(kNtotLG)->Fill(nTotalLG);
 531   GetRawsData(kNtotHG)->Fill(nTotalHG);
 532   GetRawsData(kNtotTRU)->Fill(nTotalTRU);
 533   GetRawsData(kNtotLGLEDMon)->Fill(nTotalLGLEDMon);
 534   GetRawsData(kNtotHGLEDMon)->Fill(nTotalHGLEDMon);
 535
 536   // just in case the next rawreader consumer forgets to reset; let's do it here again..
 537   rawReader->Reset() ;
 538
 539   return;
 540 }
 541
 542 //____________________________________________________________________________
 543 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits()
 544 {
 545   // makes data from Digits
 546
 547   GetDigitsData(1)->Fill(fDigitsArray->GetEntriesFast()) ;
 548   TIter next(fDigitsArray) ;
 549   AliEMCALDigit * digit ;
 550   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(next())) ) {
 551     GetDigitsData(0)->Fill( digit->GetAmp()) ;
 552   }
 553
 554 }
 555
 556 //____________________________________________________________________________
 557 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits(TTree * digitTree)
 558 {
 559   // makes data from Digit Tree
 560   if (fDigitsArray)
 561     fDigitsArray->Clear() ;
 562   else
 563     fDigitsArray = new TClonesArray("AliEMCALDigit", 1000) ;
 564
 565   TBranch * branch = digitTree->GetBranch("EMCAL") ;
 566   if ( ! branch ) {
 567     AliWarning("EMCAL branch in Digit Tree not found") ;
 568   } else {
 569     branch->SetAddress(&fDigitsArray) ;
 570     branch->GetEntry(0) ;
 571     MakeDigits() ;
 572   }
 573
 574 }
 575
 576 //____________________________________________________________________________
 577 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRecPoints(TTree * clustersTree)
 578 {
 579   // makes data from RecPoints
 580   TBranch *emcbranch = clustersTree->GetBranch("EMCALECARP");
 581   if (!emcbranch) {
 582     AliError("can't get the branch with the EMCAL clusters !");
 583     return;
 584   }
 585
 586   TObjArray * emcrecpoints = new TObjArray(100) ;
 587   emcbranch->SetAddress(&emcrecpoints);
 588   emcbranch->GetEntry(0);
 589
 590   GetRecPointsData(kRecPM)->Fill(emcrecpoints->GetEntriesFast()) ;
 591   TIter next(emcrecpoints) ;
 592   AliEMCALRecPoint * rp ;
 593   while ( (rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(next())) ) {
 594     GetRecPointsData(kRecPE)->Fill( rp->GetEnergy()) ;
 595     GetRecPointsData(kRecPDigM)->Fill(rp->GetMultiplicity());
 596   }
 597   emcrecpoints->Delete();
 598   delete emcrecpoints;
 599
 600 }
 601
 602 //____________________________________________________________________________
 603 void AliEMCALQADataMakerRec::StartOfDetectorCycle()
 604 {
 605   //Detector specific actions at start of cycle
 606
 607 }
 608