EMCAL/AliEMCALRecPoint.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 //_________________________________________________________________________
  17 //  Reconstructed Points for the EMCAL
  18 //  A RecPoint is a cluster of digits
  19 //
  20 //
  21 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)
  22 //*-- Author: Dmitri Peressounko (RRC KI & SUBATECH)
  23 //*-- Author: Heather Gray (LBL) merged AliEMCALRecPoint and AliEMCALTowerRecPoint 02/04
  24
  25 // --- ROOT system ---
  26 #include "TPad.h"
  27 #include "TGraph.h"
  28 #include "TPaveText.h"
  29 #include "TClonesArray.h"
  30 #include "TMath.h"
  31 #include "TGeoMatrix.h"
  32 #include "TGeoManager.h"
  33 #include "TGeoPhysicalNode.h"
  34 #include "TRandom.h"
  35
  36 // --- Standard library ---
  37 #include <Riostream.h>
  38
  39 // --- AliRoot header files ---
  40 //#include "AliGenerator.h"
  41 class AliGenerator;
  42 class AliEMCAL;
  43 #include "AliLog.h"
  44 #include "AliGeomManager.h"
  45 #include "AliEMCALGeometry.h"
  46 #include "AliEMCALHit.h"
  47 #include "AliEMCALDigit.h"
  48 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  49 #include "AliCaloCalibPedestal.h"
  50 #include "AliEMCALGeoParams.h"
  51
  52 ClassImp(AliEMCALRecPoint)
  53
  54 //____________________________________________________________________________
  55 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint()
  56   : AliCluster(), fGeomPtr(0),
  57     fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
  58     fGlobPos(0,0,0),fLocPos(0,0,0),
  59     fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(200),
  60     fMulTrack(0), fDigitsList(0), fTracksList(0),
  61     fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
  62     fEnergyList(0), fTimeList(0), fAbsIdList(0),
  63     fTime(0.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),  //HG check this
  64     fDETracksList(0), fMulParent(0), fMaxParent(0),
  65     fParentsList(0), fDEParentsList(0), fSuperModuleNumber(0),
  66     fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1), fSharedCluster(kFALSE)
  67 {
  68   // ctor
  69   fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
  70
  71   fLambda[0] = 0;
  72   fLambda[1] = 0;
  73
  74 }
  75
  76 //____________________________________________________________________________
  77 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const char *)
  78   : AliCluster(), fGeomPtr(0),
  79     fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
  80     fGlobPos(0,0,0), fLocPos(0,0,0),
  81     fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(1000), fMulTrack(0),
  82     fDigitsList(new Int_t[fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[fMaxTrack]),
  83     fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
  84     fEnergyList(new Float_t[fMaxDigit]), fTimeList(new Float_t[fMaxDigit]),
  85     fAbsIdList(new Int_t[fMaxDigit]), fTime(-1.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),
  86     fDETracksList(new Float_t[fMaxTrack]), fMulParent(0), fMaxParent(1000),
  87     fParentsList(new Int_t[fMaxParent]), fDEParentsList(new Float_t[fMaxParent]),
  88     fSuperModuleNumber(0), fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1),fSharedCluster(kFALSE)
  89 {
  90   // ctor
  91   for (Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++)
  92     fDETracksList[i] = 0;
  93   for (Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
  94     fParentsList[i] = -1;
  95     fDEParentsList[i] = 0;
  96   }
  97
  98   fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
  99   fLambda[0] = 0;
 100   fLambda[1] = 0;
 101 }
 102
 103 //____________________________________________________________________________
 104 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const AliEMCALRecPoint & rp)
 105   : AliCluster(rp), fGeomPtr(rp.fGeomPtr),
 106     fAmp(rp.fAmp), fIndexInList(rp.fIndexInList),
 107     fGlobPos(rp.fGlobPos),fLocPos(rp.fLocPos),
 108     fMaxDigit(rp.fMaxDigit), fMulDigit(rp.fMulDigit),
 109     fMaxTrack(rp.fMaxTrack), fMulTrack(rp.fMaxTrack),
 110     fDigitsList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[rp.fMaxTrack]),
 111     fClusterType(rp.fClusterType), fCoreEnergy(rp.fCoreEnergy),
 112     fDispersion(rp.fDispersion),
 113     fEnergyList(new Float_t[rp.fMaxDigit]), fTimeList(new Float_t[rp.fMaxDigit]),
 114     fAbsIdList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTime(rp.fTime), fNExMax(rp.fNExMax),fCoreRadius(rp.fCoreRadius),
 115     fDETracksList(new Float_t[rp.fMaxTrack]), fMulParent(rp.fMulParent),
 116     fMaxParent(rp.fMaxParent), fParentsList(new Int_t[rp.fMaxParent]),
 117     fDEParentsList(new Float_t[rp.fMaxParent]),
 118     fSuperModuleNumber(rp.fSuperModuleNumber), fDigitIndMax(rp.fDigitIndMax),
 119     fDistToBadTower(rp.fDistToBadTower), fSharedCluster(rp.fSharedCluster)
 120 {
 121   //copy ctor
 122   fLambda[0] = rp.fLambda[0];
 123   fLambda[1] = rp.fLambda[1];
 124
 125   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulDigit; i++) {
 126     fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
 127     fTimeList[i] = rp.fTimeList[i];
 128     fAbsIdList[i] = rp.fAbsIdList[i];
 129   }
 130
 131   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
 132
 133   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulParent; i++) {
 134     fParentsList[i] = rp.fParentsList[i];
 135     fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
 136   }
 137
 138 }
 139 //____________________________________________________________________________
 140 AliEMCALRecPoint::~AliEMCALRecPoint()
 141 {
 142   // dtor
 143   if ( fEnergyList )
 144     delete[] fEnergyList ;
 145   if ( fTimeList )
 146     delete[] fTimeList ;
 147   if ( fAbsIdList )
 148     delete[] fAbsIdList ;
 149    if ( fDETracksList)
 150     delete[] fDETracksList;
 151    if ( fParentsList)
 152     delete[] fParentsList;
 153    if ( fDEParentsList)
 154     delete[] fDEParentsList;
 155
 156    delete [] fDigitsList ;
 157    delete [] fTracksList ;
 158 }
 159
 160 //____________________________________________________________________________
 161 AliEMCALRecPoint& AliEMCALRecPoint::operator= (const AliEMCALRecPoint &rp)
 162 {
 163   // assignment operator
 164
 165   if(&rp == this) return *this;
 166
 167   fGeomPtr = rp.fGeomPtr;
 168   fAmp = rp.fAmp;
 169   fIndexInList = rp.fIndexInList;
 170   fGlobPos = rp.fGlobPos;
 171   fLocPos  = rp.fLocPos;
 172   fMaxDigit = rp.fMaxDigit;
 173   fMulDigit = rp.fMulDigit;
 174   fMaxTrack = rp.fMaxTrack;
 175   fMulTrack = rp.fMaxTrack;
 176   for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) fDigitsList[i] = rp.fDigitsList[i];
 177   for(Int_t i = 0; i<fMaxTrack; i++) fTracksList[i] = rp.fTracksList[i];
 178   fClusterType = rp.fClusterType;
 179   fCoreEnergy  = rp.fCoreEnergy;
 180   fDispersion  = rp.fDispersion;
 181   for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) {
 182     fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
 183     fTimeList[i]   = rp.fTimeList[i];
 184     fAbsIdList[i]  = rp.fAbsIdList[i];
 185   }
 186   fTime = rp.fTime;
 187   fNExMax = rp.fNExMax;
 188   fCoreRadius = rp.fCoreRadius;
 189   for(Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
 190   fMulParent = rp.fMulParent;
 191   fMaxParent = rp.fMaxParent;
 192   for(Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
 193     fParentsList[i] = rp.fParentsList[i];
 194     fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
 195   }
 196   fSuperModuleNumber = rp.fSuperModuleNumber;
 197   fDigitIndMax = rp.fDigitIndMax;
 198
 199   fLambda[0] = rp.fLambda[0];
 200   fLambda[1] = rp.fLambda[1];
 201
 202   fDistToBadTower = rp.fDistToBadTower;
 203   fSharedCluster  = rp.fSharedCluster;
 204
 205   return *this;
 206
 207 }
 208
 209 //____________________________________________________________________________
 210 void AliEMCALRecPoint::AddDigit(AliEMCALDigit & digit, const Float_t energy, const Bool_t shared)
 211 {
 212   // Adds a digit to the RecPoint
 213   // and accumulates the total amplitude and the multiplicity
 214
 215   if(fEnergyList == 0)
 216     fEnergyList =  new Float_t[fMaxDigit];
 217   if(fTimeList == 0)
 218     fTimeList   =  new Float_t[fMaxDigit];
 219   if(fAbsIdList == 0) {
 220     fAbsIdList  =  new Int_t  [fMaxDigit];
 221   }
 222
 223   if ( fMulDigit >= fMaxDigit ) { // increase the size of the lists
 224     fMaxDigit*=2 ;
 225     Int_t   * tempo   = new Int_t  [fMaxDigit];
 226     Float_t * tempoE  = new Float_t[fMaxDigit];
 227     Float_t * tempoT  = new Float_t[fMaxDigit];
 228     Int_t   * tempoId = new Int_t  [fMaxDigit];
 229
 230     Int_t index ;
 231     for ( index = 0 ; index < fMulDigit ; index++ ){
 232       tempo  [index] = fDigitsList[index] ;
 233       tempoE [index] = fEnergyList[index] ;
 234       tempoT [index] = fTimeList  [index] ;
 235       tempoId[index] = fAbsIdList [index] ;
 236     }
 237
 238     delete [] fDigitsList ;
 239     delete [] fEnergyList ;
 240     delete [] fTimeList ;
 241     delete [] fAbsIdList ;
 242
 243     fDigitsList = tempo;
 244     fEnergyList = tempoE;
 245     fTimeList   = tempoT;
 246     fAbsIdList  = tempoId;
 247   } // if
 248
 249   fDigitsList[fMulDigit]   = digit.GetIndexInList()  ;
 250   fEnergyList[fMulDigit]   = energy ;
 251   fTimeList  [fMulDigit]   = digit.GetTime();
 252   fAbsIdList [fMulDigit]   = digit.GetId();
 253   fMulDigit++ ;
 254   fAmp += energy ;
 255
 256   if(shared) fSharedCluster = kTRUE;
 257 }
 258 //____________________________________________________________________________
 259 Bool_t AliEMCALRecPoint::AreNeighbours(AliEMCALDigit * digit1, AliEMCALDigit * digit2 ) const
 260 {
 261   // Tells if (true) or not (false) two digits are neighbours
 262   // A neighbour is defined as being two digits which share a corner
 263   // ONLY USED IN CASE OF UNFOLDING
 264
 265   Bool_t areNeighbours = kFALSE ;
 266   Int_t nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 267   Int_t nSupMod1=0, nModule1=0, nIphi1=0, nIeta1=0;
 268   Int_t relid1[2] , relid2[2] ; // ieta, iphi
 269   Int_t rowdiff=0, coldiff=0;
 270
 271   areNeighbours = kFALSE ;
 272
 273   fGeomPtr->GetCellIndex(digit1->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 274   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, relid1[0],relid1[1]);
 275
 276   fGeomPtr->GetCellIndex(digit2->GetId(), nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1);
 277   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1, relid2[0],relid2[1]);
 278
 279   // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2-1
 280   // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
 281   if(fSharedCluster){
 282     if(nSupMod1%2) relid1[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 283     else           relid2[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 284   }
 285
 286   rowdiff = TMath::Abs( relid1[0] - relid2[0] ) ;
 287   coldiff = TMath::Abs( relid1[1] - relid2[1] ) ;
 288
 289   if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 ) && (coldiff + rowdiff > 0))
 290   areNeighbours = kTRUE ;
 291
 292   return areNeighbours;
 293 }
 294
 295 //____________________________________________________________________________
 296 Int_t AliEMCALRecPoint::Compare(const TObject * obj) const
 297 {
 298   // Compares two RecPoints according to their position in the EMCAL modules
 299
 300   Float_t delta = 1 ; //Width of "Sorting row".
 301
 302   Int_t rv = 2 ;
 303
 304   AliEMCALRecPoint * clu = (AliEMCALRecPoint *)obj ;
 305
 306   TVector3 locpos1;
 307   GetLocalPosition(locpos1);
 308   TVector3 locpos2;
 309   clu->GetLocalPosition(locpos2);
 310
 311   Int_t rowdif = (Int_t)(TMath::Ceil(locpos1.X()/delta)-TMath::Ceil(locpos2.X()/delta)) ;
 312   if (rowdif> 0)
 313     rv = 1 ;
 314   else if(rowdif < 0)
 315     rv = -1 ;
 316   else if(locpos1.Y()>locpos2.Y())
 317     rv = -1 ;
 318   else
 319     rv = 1 ;
 320
 321   return rv ;
 322 }
 323
 324 //___________________________________________________________________________
 325  void AliEMCALRecPoint::Draw(Option_t *option)
 326  {
 327    // Draw this AliEMCALRecPoint with its current attributes
 328
 329    AppendPad(option);
 330  }
 331
 332 //____________________________________________________________________________
 333 void AliEMCALRecPoint::EvalAll(Float_t logWeight,TClonesArray * digits, const Bool_t justClusters)
 334 {
 335   // Evaluates cluster parameters
 336
 337   // First calculate the index of digit with maximum amplitude and get
 338   // the supermodule number where it sits.
 339
 340   fDigitIndMax       = GetMaximalEnergyIndex();
 341   fSuperModuleNumber = fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(GetAbsIdMaxDigit());
 342
 343   //Evaluate global and local position
 344   EvalGlobalPosition(logWeight, digits) ;
 345   EvalLocalPosition(logWeight, digits) ;
 346
 347   //Evaluate shower parameters
 348   EvalElipsAxis(logWeight, digits) ;
 349   EvalDispersion(logWeight, digits) ;
 350
 351   //EvalCoreEnergy(logWeight, digits);
 352   EvalTime(digits) ;
 353   EvalPrimaries(digits) ;
 354   EvalParents(digits);
 355
 356   //Called last because it sets the global position of the cluster?
 357   //Do not call it when recalculating clusters out of standard reconstruction
 358   if(!justClusters){
 359     EvalLocal2TrackingCSTransform();
 360   }
 361
 362 }
 363
 364 //____________________________________________________________________________
 365 void  AliEMCALRecPoint::EvalDispersion(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 366 {
 367   // Calculates the dispersion of the shower at the origin of the RecPoint
 368   // in cell units - Nov 16,2006
 369
 370   Double_t d = 0., wtot = 0., w = 0.;
 371   Int_t iDigit=0, nstat=0;
 372   AliEMCALDigit * digit=0;
 373
 374   // Calculates the dispersion in cell units
 375   Double_t etai, phii, etaMean=0.0, phiMean=0.0;
 376   int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 377   int iphi=0, ieta=0;
 378   // Calculate mean values
 379   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 380     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 381
 382     if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
 383       fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 384       fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 385
 386       // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 387       // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
 388       if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 389
 390       etai=(Double_t)ieta;
 391       phii=(Double_t)iphi;
 392       w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 393
 394       if(w>0.0) {
 395         phiMean += phii*w;
 396         etaMean += etai*w;
 397         wtot    += w;
 398       }
 399     }
 400   }
 401   if (wtot>0) {
 402     phiMean /= wtot ;
 403     etaMean /= wtot ;
 404   } else AliError(Form("Wrong weight %f\n", wtot));
 405
 406   // Calculate dispersion
 407   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 408     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 409
 410     if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
 411       fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 412       fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 413
 414       // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 415       // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
 416       if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 417
 418       etai=(Double_t)ieta;
 419       phii=(Double_t)iphi;
 420       w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 421
 422       if(w>0.0) {
 423         nstat++;
 424         d += w*((etai-etaMean)*(etai-etaMean)+(phii-phiMean)*(phii-phiMean));
 425       }
 426     }
 427   }
 428
 429   if ( wtot > 0 && nstat>1) d /= wtot ;
 430   else                      d = 0. ;
 431
 432   fDispersion = TMath::Sqrt(d) ;
 433   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDispersion() : Dispersion %f \n",fDispersion);
 434 }
 435
 436 //____________________________________________________________________________
 437 void AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels(AliCaloCalibPedestal* caloped)
 438 {
 439   //For each EMC rec. point set the distance to the nearest bad channel.
 440   //AliInfo(Form("%d bad channel(s) found.\n", caloped->GetDeadTowerCount()));
 441   //It is done in cell units and not in global or local position as before (Sept 2010)
 442
 443   if(!caloped->GetDeadTowerCount()) return;
 444
 445   //Get channels map of the supermodule where the cluster is.
 446   TH2D* hMap  = caloped->GetDeadMap(fSuperModuleNumber);
 447
 448   Int_t dRrow, dReta;
 449   Float_t  minDist = 10000.;
 450   Float_t  dist    = 0.;
 451   Int_t nSupMod, nModule;
 452   Int_t nIphi, nIeta;
 453   Int_t iphi, ieta;
 454   fDigitIndMax  = GetMaximalEnergyIndex();
 455   fGeomPtr->GetCellIndex(fAbsIdList[fDigitIndMax], nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 456   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 457
 458   //Loop on tower status map
 459   for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
 460     for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
 461       //Check if tower is bad.
 462       if(hMap->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
 463       //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
 464
 465       dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
 466       dReta=TMath::Abs(icol-ieta);
 467       dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
 468       if(dist < minDist) minDist = dist;
 469
 470     }
 471   }
 472
 473   //In case the cluster is shared by 2 SuperModules, need to check the map of the second Super Module
 474   if (fSharedCluster) {
 475     TH2D* hMap2 = 0;
 476     Int_t nSupMod2 = -1;
 477
 478     //The only possible combinations are (0,1), (2,3) ... (10,11)
 479     if(fSuperModuleNumber%2) nSupMod2 = fSuperModuleNumber-1;
 480     else                     nSupMod2 = fSuperModuleNumber+1;
 481     hMap2  = caloped->GetDeadMap(nSupMod2);
 482
 483     //Loop on tower status map of second super module
 484     for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
 485       for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
 486         //Check if tower is bad.
 487         if(hMap2->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
 488         //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
 489         dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
 490
 491         if(fSuperModuleNumber%2) {
 492           dReta=TMath::Abs(icol-(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+ieta));
 493        }
 494        else {
 495          dReta=TMath::Abs(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+icol-ieta);
 496        }
 497
 498        dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
 499         if(dist < minDist) minDist = dist;
 500
 501       }
 502     }
 503
 504   }// shared cluster in 2 SuperModules
 505
 506   fDistToBadTower = minDist;
 507   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannel() - Distance to Bad is %f cm, shared cluster? %d \n",fDistToBadTower,fSharedCluster);
 508 }
 509
 510
 511 //____________________________________________________________________________
 512 void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 513 {
 514   // Calculates the center of gravity in the local EMCAL-module coordinates
 515   //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
 516
 517   AliEMCALDigit * digit=0;
 518   Int_t i=0, nstat=0;
 519
 520   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 521   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 522
 523   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 524
 525   //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
 526   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 527     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 528
 529     if(!digit) {
 530       AliError("No Digit!!");
 531       continue;
 532     }
 533
 534     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 535
 536     //Temporal patch, due to mapping problem, need to swap "y" in one of the 2 SM, although no effect in position calculation. GCB 05/2010
 537     if(fSharedCluster && fSuperModuleNumber != fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId())) xyzi[1]*=-1;
 538
 539     //printf("EvalLocalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local x,y,z %f %f %f \n",
 540     //          digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 541
 542     if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 543     else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 544
 545     if(w>0.0) {
 546       wtot += w ;
 547       nstat++;
 548       for(i=0; i<3; i++ ) {
 549         clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 550         clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 551       }
 552     }
 553   }
 554   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 555   if ( wtot > 0 ) {
 556     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 557     for(i=0; i<3; i++ ) {
 558       clXYZ[i] /= wtot;
 559       if(nstat>1) {
 560         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 561         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 562         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 563           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 564         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 565       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 566     }
 567   } else {
 568     for(i=0; i<3; i++ ) {
 569       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 570     }
 571   }
 572
 573   //    // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
 574   //    // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
 575   //    // Rndm generates a number in ]0,1]
 576   //    if (fMulDigit==1) {
 577   //      clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 578   //      clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 579   //    }
 580
 581   //Set position in local vector
 582   fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
 583   fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
 584   fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
 585
 586   if (gDebug==2)
 587     printf("EvalLocalPosition Cluster: Local (x,y,z) = (%f,%f,%f) \n", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ;
 588
 589 }
 590
 591
 592 //____________________________________________________________________________
 593 void AliEMCALRecPoint::EvalGlobalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 594 {
 595   // Calculates the center of gravity in the global ALICE coordinates
 596   //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
 597
 598   AliEMCALDigit * digit=0;
 599   Int_t i=0, nstat=0;
 600
 601   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 602   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 603
 604   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, lxyzi[3], xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 605
 606   //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
 607   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 608     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 609
 610     if(!digit) {
 611       AliError("No Digit!!");
 612       continue;
 613     }
 614
 615     //Get the local coordinates of the cell
 616     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, lxyzi[0], lxyzi[1], lxyzi[2]);
 617
 618     //Now get the global coordinate
 619     fGeomPtr->GetGlobal(lxyzi,xyzi, fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()));
 620     //TVector3 pos(xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 621     //printf("EvalGlobalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local (x,y,z) = (%f %f %f), eta %f, phi%f \n",
 622     //     digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()),dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2],pos.Eta(),pos.Phi()*TMath::RadToDeg());
 623
 624     if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 625     else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 626
 627     if(w>0.0) {
 628       wtot += w ;
 629       nstat++;
 630       for(i=0; i<3; i++ ) {
 631         clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 632         clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 633       }
 634     }
 635   }
 636   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 637   if ( wtot > 0 ) {
 638     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 639     for(i=0; i<3; i++ ) {
 640       clXYZ[i] /= wtot;
 641       if(nstat>1) {
 642         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 643         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 644         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 645           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 646         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 647       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 648     }
 649   } else {
 650     for(i=0; i<3; i++ ) {
 651       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 652     }
 653   }
 654
 655 //  // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
 656 //  // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
 657 //  // Rndm generates a number in ]0,1]
 658 //  if (fMulDigit==1) {
 659 //    clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 660 //    clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 661 //  }
 662
 663   //Set position in global vector
 664   fGlobPos.SetX(clXYZ[0]);
 665   fGlobPos.SetY(clXYZ[1]);
 666   fGlobPos.SetZ(clXYZ[2]);
 667
 668   if (gDebug==2)
 669         printf("EvalGlobalPosition Cluster: (x ,y ,z) = (%f,%f,%f), eta %f,phi %f\n",
 670                    fGlobPos.X(), fGlobPos.Y(), fGlobPos.Z(),fGlobPos.Eta(),fGlobPos.Phi()*TMath::RadToDeg()) ;
 671 }
 672
 673 //____________________________________________________________________________
 674 void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFit(Double_t deff, Double_t logWeight,
 675 Double_t phiSlope, TClonesArray * digits)
 676 {
 677   // Evaluates local position of clusters in SM
 678
 679   Double_t ycorr=0;
 680   AliEMCALDigit *digit=0;
 681   Int_t i=0, nstat=0;
 682   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 683
 684   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 685   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 686
 687   for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
 688     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 689     if(digit){
 690       dist = deff;
 691       //fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 692       fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 693
 694       if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 695       else                 w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 696
 697       if(w>0.0) {
 698         wtot += w ;
 699         nstat++;
 700         for(i=0; i<3; i++ ) {
 701           clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 702           clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 703         }
 704       }
 705     }else AliError("Digit null");
 706   }//loop
 707   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 708   if ( wtot > 0 ) {
 709     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 710     for(i=0; i<3; i++ ) {
 711       clXYZ[i] /= wtot;
 712       if(nstat>1) {
 713         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 714         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 715         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 716           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 717         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 718       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 719     }
 720   } else {
 721     for(i=0; i<3; i++ ) {
 722       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 723     }
 724   }
 725   // clRmsXYZ[i] ??
 726   if(phiSlope != 0.0 && logWeight > 0.0 && wtot) {
 727     // Correction in phi direction (y - coords here); Aug 16;
 728     // May be put to global level or seperate method
 729     ycorr = clXYZ[1] * (1. + phiSlope);
 730     //printf(" y %f : ycorr %f : slope %f \n", clXYZ[1], ycorr, phiSlope);
 731     clXYZ[1] = ycorr;
 732   }
 733
 734   fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
 735   fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
 736   fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
 737
 738 //  if (gDebug==2)
 739 //    printf("EvalLocalPosition: eta,phi,r = %f,%f,%f", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ;
 740 }
 741
 742 //_____________________________________________________________________________
 743 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2(TClonesArray * digits, TArrayD &ed)
 744 {
 745   // Evaluated local position of rec.point using digits
 746   // and parametrisation of w0 and deff
 747   //printf(" <I> AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2() \n");
 748   return AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(digits, ed, fLocPos);
 749 }
 750
 751 //_____________________________________________________________________________
 752 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
 753 {
 754   // Used when digits should be recalibrated
 755   Double_t deff=0, w0=0, esum=0;
 756   Int_t iDigit=0;
 757   //  AliEMCALDigit *digit;
 758
 759   if(ed.GetSize() && (digits->GetEntries()!=ed.GetSize())) return kFALSE;
 760
 761   // Calculate sum energy of digits
 762   esum = 0.0;
 763   for(iDigit=0; iDigit<ed.GetSize(); iDigit++) esum += ed[iDigit];
 764
 765   GetDeffW0(esum, deff, w0);
 766
 767   return EvalLocalPositionFromDigits(esum, deff, w0, digits, ed, locPos);
 768 }
 769
 770 //_____________________________________________________________________________
 771 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(const Double_t esum, const Double_t deff, const Double_t w0, TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
 772 {
 773   //Evaluate position of digits in supermodule.
 774   AliEMCALDigit *digit=0;
 775
 776   Int_t i=0, nstat=0;
 777   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 778   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 779
 780   // Get pointer to EMCAL geometry
 781   // (can't use fGeomPtr in static method)
 782   AliEMCALGeometry* geo = AliEMCALGeometry::GetInstance();
 783
 784   for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
 785     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(iDigit));
 786     if(digit){
 787       //geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 788       geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 789
 790       if(w0 > 0.0)  w = TMath::Max( 0., w0 + TMath::Log(ed[iDigit] / esum));
 791       else          w = ed[iDigit]; // just energy
 792
 793       if(w>0.0) {
 794         wtot += w ;
 795         nstat++;
 796         for(i=0; i<3; i++ ) {
 797           clXYZ[i] += (w*xyzi[i]);
 798         }
 799       }
 800     }else AliError("Digit null");
 801   }//loop
 802   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 803   if (wtot > 0) {
 804     for(i=0; i<3; i++ ) {
 805       clXYZ[i] /= wtot;
 806     }
 807     locPos.SetX(clXYZ[0]);
 808     locPos.SetY(clXYZ[1]);
 809     locPos.SetZ(clXYZ[2]);
 810     return kTRUE;
 811   } else {
 812     return kFALSE;
 813   }
 814
 815 }
 816
 817 //_____________________________________________________________________________
 818 void AliEMCALRecPoint::GetDeffW0(const Double_t esum , Double_t &deff,  Double_t &w0)
 819 {
 820   //
 821   // Aug 31, 2001
 822   // Applied for simulation data with threshold 3 adc
 823   // Calculate efective distance (deff) and weigh parameter (w0)
 824   // for coordinate calculation; 0.5 GeV < esum <100 GeV.
 825   // Look to:  http://rhic.physics.wayne.edu/~pavlinov/ALICE/SHISHKEBAB/RES/CALIB/GEOMCORR/deffandW0VaEgamma_2.gif
 826   //
 827   Double_t e=0.0;
 828   const  Double_t kdp0=9.25147, kdp1=1.16700; // Hard coded now
 829   const  Double_t kwp0=4.83713, kwp1=-2.77970e-01, kwp2 = 4.41116;
 830
 831   // No extrapolation here
 832   e = esum<0.5?0.5:esum;
 833   e = e>100.?100.:e;
 834
 835   deff = kdp0 + kdp1*TMath::Log(e);
 836   w0   = kwp0 / (1. + TMath::Exp(kwp1*(e+kwp2)));
 837   //printf("<I> AliEMCALRecPoint::GetDeffW0 esum %5.2f : deff %5.2f : w0 %5.2f \n", esum, deff, w0);
 838 }
 839
 840 //______________________________________________________________________________
 841 void AliEMCALRecPoint::EvalCoreEnergy(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 842 {
 843   // This function calculates energy in the core,
 844   // i.e. within a radius rad = fCoreEnergy around the center. Beyond this radius
 845   // in accordance with shower profile the energy deposition
 846   // should be less than 2%
 847   // Unfinished - Nov 15,2006
 848   // Distance is calculate in (phi,eta) units
 849
 850   AliEMCALDigit * digit = 0 ;
 851
 852   Int_t iDigit=0;
 853
 854   if (!fLocPos.Mag()) {
 855     EvalLocalPosition(logWeight, digits);
 856   }
 857
 858   Double_t phiPoint = fLocPos.Phi(), etaPoint = fLocPos.Eta();
 859   Double_t eta, phi, distance;
 860   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 861     digit = (AliEMCALDigit *) ( digits->At(fDigitsList[iDigit]) ) ;
 862
 863     eta = phi = 0.0;
 864     fGeomPtr->EtaPhiFromIndex(digit->GetId(),eta, phi) ;
 865     phi = phi * TMath::DegToRad();
 866
 867     distance = TMath::Sqrt((eta-etaPoint)*(eta-etaPoint)+(phi-phiPoint)*(phi-phiPoint));
 868     if(distance < fCoreRadius)
 869       fCoreEnergy += fEnergyList[iDigit] ;
 870   }
 871
 872 }
 873 //____________________________________________________________________________
 874 void  AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis(Float_t logWeight,TClonesArray * digits)
 875 {
 876   // Calculates the axis of the shower ellipsoid in eta and phi
 877   // in cell units
 878
 879   TString gn(fGeomPtr->GetName());
 880
 881   Double_t wtot = 0.;
 882   Double_t x    = 0.;
 883   Double_t z    = 0.;
 884   Double_t dxx  = 0.;
 885   Double_t dzz  = 0.;
 886   Double_t dxz  = 0.;
 887
 888   AliEMCALDigit * digit = 0;
 889
 890   Double_t etai =0, phii=0, w=0;
 891   int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 892   int iphi=0, ieta=0;
 893   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 894     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 895     etai = phii = 0.;
 896     // Nov 15,2006 - use cell numbers as coordinates
 897     // Copied for shish-kebab geometry, ieta,iphi is cast as double as eta,phi
 898     // We can use the eta,phi(or coordinates) of cell
 899     nSupMod = nModule = nIphi = nIeta = iphi = ieta = 0;
 900
 901     fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 902     fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 903
 904     // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 905     // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
 906     if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 907
 908     etai=(Double_t)ieta;
 909     phii=(Double_t)iphi;
 910
 911     w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 912     // fAmp summed amplitude of digits, i.e. energy of recpoint
 913     // Gives smaller value of lambda than log weight
 914     // w = fEnergyList[iDigit] / fAmp; // Nov 16, 2006 - try just energy
 915
 916     dxx  += w * etai * etai ;
 917     x    += w * etai ;
 918     dzz  += w * phii * phii ;
 919     z    += w * phii ;
 920
 921     dxz  += w * etai * phii ;
 922
 923     wtot += w ;
 924   }
 925
 926   if ( wtot > 0 ) {
 927     dxx /= wtot ;
 928     x   /= wtot ;
 929     dxx -= x * x ;
 930     dzz /= wtot ;
 931     z   /= wtot ;
 932     dzz -= z * z ;
 933     dxz /= wtot ;
 934     dxz -= x * z ;
 935
 936     fLambda[0] =  0.5 * (dxx + dzz) + TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
 937     if(fLambda[0] > 0)
 938       fLambda[0] = TMath::Sqrt(fLambda[0]) ;
 939     else
 940       fLambda[0] = 0;
 941
 942     fLambda[1] =  0.5 * (dxx + dzz) - TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
 943
 944     if(fLambda[1] > 0) //To avoid exception if numerical errors lead to negative lambda.
 945       fLambda[1] = TMath::Sqrt(fLambda[1]) ;
 946     else
 947       fLambda[1]= 0. ;
 948   } else {
 949     fLambda[0]= 0. ;
 950     fLambda[1]= 0. ;
 951   }
 952
 953   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis() lambdas  = %f,%f \n", fLambda[0],fLambda[1]) ;
 954
 955 }
 956
 957 //______________________________________________________________________________
 958 void  AliEMCALRecPoint::EvalPrimaries(TClonesArray * digits)
 959 {
 960   // Constructs the list of primary particles (tracks) which
 961   // have contributed to this RecPoint and calculate deposited energy
 962   // for each track
 963
 964   AliEMCALDigit * digit =0;
 965   Int_t * primArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
 966   memset(primArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
 967   Float_t * dEPrimArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
 968   memset(dEPrimArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
 969
 970   Int_t index ;
 971   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
 972     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ;
 973     if(!digit) {
 974       AliError("No Digit!!");
 975       continue;
 976     }
 977
 978     Int_t nprimaries = digit->GetNprimary() ;
 979     if ( nprimaries == 0 ) continue ;
 980     Int_t jndex ;
 981     for ( jndex = 0 ; jndex < nprimaries ; jndex++ ) { // all primaries in digit
 982       if ( fMulTrack > fMaxTrack ) {
 983         fMulTrack = fMaxTrack ;
 984         Error("EvalPrimaries", "increase fMaxTrack ")  ;
 985         break ;
 986       }
 987       Int_t newPrimary = digit->GetPrimary(jndex+1);
 988       Float_t dEPrimary = digit->GetDEPrimary(jndex+1);
 989       Int_t kndex ;
 990       Bool_t already = kFALSE ;
 991       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulTrack ; kndex++ ) { //check if not already stored
 992         if ( newPrimary == primArray[kndex] ){
 993           already = kTRUE ;
 994           dEPrimArray[kndex] += dEPrimary;
 995           break ;
 996         }
 997       } // end of check
 998       if ( !already && (fMulTrack < fMaxTrack)) { // store it
 999         primArray[fMulTrack] = newPrimary ;
1000         dEPrimArray[fMulTrack] = dEPrimary ;
1001         fMulTrack++ ;
1002       } // store it
1003     } // all primaries in digit
1004   } // all digits
1005
1006   Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulTrack];
1007   TMath::Sort(fMulTrack,dEPrimArray,sortIdx);
1008   for(index = 0; index < fMulTrack; index++) {
1009     fTracksList[index] = primArray[sortIdx[index]] ;
1010     fDETracksList[index] = dEPrimArray[sortIdx[index]] ;
1011   }
1012   delete [] sortIdx;
1013   delete [] primArray ;
1014   delete [] dEPrimArray ;
1015
1016 }
1017
1018 //______________________________________________________________________________
1019 void  AliEMCALRecPoint::EvalParents(TClonesArray * digits)
1020 {
1021   // Constructs the list of parent particles (tracks) which have contributed to this RecPoint
1022
1023   AliEMCALDigit * digit=0 ;
1024   Int_t * parentArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
1025   memset(parentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1026   Float_t * dEParentArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
1027   memset(dEParentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1028
1029   Int_t index ;
1030   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
1031     if (fDigitsList[index] >= digits->GetEntries() || fDigitsList[index] < 0)
1032       AliError(Form("Trying to get invalid digit %d (idx in WriteRecPoint %d)",fDigitsList[index],index));
1033     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ;
1034     if(!digit) {
1035       AliError("No Digit!!");
1036       continue;
1037     }
1038
1039     Int_t nparents = digit->GetNiparent() ;
1040     if ( nparents == 0 ) continue ;
1041
1042     Int_t jndex ;
1043     for ( jndex = 0 ; jndex < nparents ; jndex++ ) { // all primaries in digit
1044       if ( fMulParent > fMaxParent ) {
1045         fMulTrack = - 1 ;
1046         Error("EvalParents", "increase fMaxParent")  ;
1047         break ;
1048       }
1049       Int_t newParent = digit->GetIparent(jndex+1) ;
1050       Float_t newdEParent = digit->GetDEParent(jndex+1) ;
1051       Int_t kndex ;
1052       Bool_t already = kFALSE ;
1053       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulParent ; kndex++ ) { //check if not already stored
1054         if ( newParent == parentArray[kndex] ){
1055           dEParentArray[kndex] += newdEParent;
1056           already = kTRUE ;
1057           break ;
1058         }
1059       } // end of check
1060       if ( !already && (fMulParent < fMaxParent)) { // store it
1061         parentArray[fMulParent] = newParent ;
1062         dEParentArray[fMulParent] = newdEParent ;
1063         fMulParent++ ;
1064       } // store it
1065     } // all parents in digit
1066   } // all digits
1067
1068   if (fMulParent>0) {
1069     Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulParent];
1070     TMath::Sort(fMulParent,dEParentArray,sortIdx);
1071     for(index = 0; index < fMulParent; index++) {
1072       fParentsList[index] = parentArray[sortIdx[index]] ;
1073       fDEParentsList[index] = dEParentArray[sortIdx[index]] ;
1074     }
1075     delete [] sortIdx;
1076   }
1077
1078   delete [] parentArray;
1079   delete [] dEParentArray;
1080 }
1081
1082 //____________________________________________________________________________
1083 void AliEMCALRecPoint::GetLocalPosition(TVector3 & lpos) const
1084 {
1085   // returns the position of the cluster in the local reference system
1086   // of the sub-detector
1087
1088   lpos = fLocPos;
1089 }
1090
1091 //____________________________________________________________________________
1092 void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos) const
1093 {
1094   // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
1095   // These are now the Cartesian X, Y and Z
1096   //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
1097   // fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, fSuperModuleNumber);
1098   gpos = fGlobPos;
1099
1100 }
1101
1102 //____________________________________________________________________________
1103 //void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos, TMatrixF & gmat) const
1104 //{
1105 //  // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
1106 //  // These are now the Cartesian X, Y and Z
1107 //  //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
1108 //
1109 //  //To be implemented
1110 //  fGeomPtr->GetGlobalEMCAL(this, gpos, gmat);
1111 //
1112 //}
1113
1114 //_____________________________________________________________________________
1115 void AliEMCALRecPoint::EvalLocal2TrackingCSTransform()
1116 {
1117   //Evaluates local to "tracking" c.s. transformation (B.P.).
1118   //All evaluations should be completed before calling for this
1119   //function.
1120   //See ALICE PPR Chapter 5 p.18 for "tracking" c.s. definition,
1121   //or just ask Jouri Belikov. :)
1122
1123   SetVolumeId(AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kEMCAL,GetSuperModuleNumber()));
1124
1125   const TGeoHMatrix* tr2loc = GetTracking2LocalMatrix();
1126   if(!tr2loc) AliFatal(Form("No Tracking2LocalMatrix found."));
1127
1128   Double_t lxyz[3] = {fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z()};
1129   Double_t txyz[3] = {0,0,0};
1130
1131   tr2loc->MasterToLocal(lxyz,txyz);
1132   SetX(txyz[0]); SetY(txyz[1]); SetZ(txyz[2]);
1133
1134   if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>0) {
1135     TVector3 gpos; //TMatrixF gmat;
1136     //GetGlobalPosition(gpos,gmat); //Not doing anythin special, replace by next line.
1137     fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, GetSuperModuleNumber());
1138
1139     Float_t gxyz[3];
1140     GetGlobalXYZ(gxyz);
1141     AliInfo(Form("lCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), tCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), gCS-->(%.3f,%.3f,%.3f),  gCScalc-\
1142 ->(%.3f,%.3f,%.3f), supermodule %d",
1143                  fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z(),
1144                  GetX(),GetY(),GetZ(),
1145                  gpos.X(),gpos.Y(),gpos.Z(),
1146                  gxyz[0],gxyz[1],gxyz[2],GetSuperModuleNumber()));
1147   }
1148
1149 }
1150
1151 //____________________________________________________________________________
1152 Float_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergy(void) const
1153 {
1154   // Finds the maximum energy in the cluster
1155
1156   Float_t menergy = 0. ;
1157
1158   Int_t iDigit;
1159   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1160
1161     if(fEnergyList[iDigit] > menergy)
1162       menergy = fEnergyList[iDigit] ;
1163   }
1164   return menergy ;
1165 }
1166
1167 //____________________________________________________________________________
1168 Int_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergyIndex(void) const
1169 {
1170   // Finds the maximum energy in the cluster
1171
1172   Float_t menergy = 0. ;
1173   Int_t mid       = 0  ;
1174   Int_t iDigit;
1175
1176   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1177
1178     if(fEnergyList[iDigit] > menergy){
1179       menergy = fEnergyList[iDigit] ;
1180       mid     = iDigit ;
1181     }
1182   }//loop on cluster digits
1183
1184   return mid ;
1185 }
1186
1187
1188 //____________________________________________________________________________
1189 Int_t AliEMCALRecPoint::GetMultiplicityAtLevel(Float_t H) const
1190 {
1191   // Calculates the multiplicity of digits with energy larger than H*energy
1192
1193   Int_t multipl   = 0 ;
1194   Int_t iDigit ;
1195   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1196
1197     if(fEnergyList[iDigit] > H * fAmp)
1198       multipl++ ;
1199   }
1200   return multipl ;
1201 }
1202
1203 //____________________________________________________________________________
1204 Int_t  AliEMCALRecPoint::GetNumberOfLocalMax(AliEMCALDigit **  maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
1205                                                Float_t locMaxCut,TClonesArray * digits) const
1206 {
1207   // Calculates the number of local maxima in the cluster using fLocalMaxCut as the minimum
1208   // energy difference between two local maxima
1209
1210   AliEMCALDigit * digit  = 0;
1211   AliEMCALDigit * digitN = 0;
1212
1213   Int_t iDigitN = 0 ;
1214   Int_t iDigit  = 0 ;
1215
1216   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++)
1217     maxAt[iDigit] = (AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
1218
1219   for(iDigit = 0 ; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
1220     if(maxAt[iDigit]) {
1221       digit = maxAt[iDigit] ;
1222
1223       for(iDigitN = 0; iDigitN < fMulDigit; iDigitN++) {
1224         digitN = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigitN]) ;
1225
1226         if ( AreNeighbours(digit, digitN) ) {
1227           if (fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] ) {
1228             maxAt[iDigitN] = 0 ;
1229             // but may be digit too is not local max ?
1230             if(fEnergyList[iDigit] < fEnergyList[iDigitN] + locMaxCut)
1231               maxAt[iDigit] = 0 ;
1232           }
1233           else {
1234             maxAt[iDigit] = 0 ;
1235             // but may be digitN too is not local max ?
1236             if(fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] - locMaxCut)
1237               maxAt[iDigitN] = 0 ;
1238           }
1239         } // if Areneighbours
1240       } // while digitN
1241     } // slot not empty
1242   } // while digit
1243
1244   iDigitN = 0 ;
1245   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
1246     if(maxAt[iDigit] ){
1247       maxAt[iDigitN] = maxAt[iDigit] ;
1248       maxAtEnergy[iDigitN] = fEnergyList[iDigit] ;
1249       iDigitN++ ;
1250     }
1251   }
1252   return iDigitN ;
1253 }
1254
1255 //____________________________________________________________________________
1256 Int_t AliEMCALRecPoint::GetPrimaryIndex() const
1257 {
1258   // Get the primary track index in TreeK which deposits the most energy
1259   // in Digits which forms RecPoint.
1260
1261   if (fMulTrack)
1262     return fTracksList[0];
1263   return -12345;
1264 }
1265
1266 //____________________________________________________________________________
1267 void AliEMCALRecPoint::EvalTime(TClonesArray * digits){
1268   // time is set to the time of the digit with the maximum energy
1269
1270   Float_t maxE  = 0;
1271   Int_t   maxAt = 0;
1272   for(Int_t idig=0; idig < fMulDigit; idig++){
1273     if(fEnergyList[idig] > maxE){
1274       maxE  = fEnergyList[idig] ;
1275       maxAt = idig;
1276     }
1277   }
1278   fTime = ((AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[maxAt]))->GetTime() ;
1279
1280 }
1281
1282 //______________________________________________________________________________
1283 void AliEMCALRecPoint::Paint(Option_t *)
1284 {
1285   // Paint this ALiRecPoint as a TMarker  with its current attributes
1286
1287   TVector3 pos(0.,0.,0.)  ;
1288   GetLocalPosition(pos)   ;
1289   Coord_t x = pos.X()     ;
1290   Coord_t y = pos.Z()     ;
1291   Color_t markercolor = 1 ;
1292   Size_t  markersize  = 1.;
1293   Style_t markerstyle = 5 ;
1294
1295   if (!gPad->IsBatch()) {
1296     gVirtualX->SetMarkerColor(markercolor) ;
1297     gVirtualX->SetMarkerSize (markersize)  ;
1298     gVirtualX->SetMarkerStyle(markerstyle) ;
1299   }
1300   gPad->SetAttMarkerPS(markercolor,markerstyle,markersize) ;
1301   gPad->PaintPolyMarker(1,&x,&y,"") ;
1302 }
1303
1304 //_____________________________________________________________________
1305 Double_t AliEMCALRecPoint::TmaxInCm(const Double_t e , const Int_t key)
1306 {
1307   // e energy in GeV)
1308   // key  =  0(gamma, default)
1309   //     !=  0(electron)
1310   const Double_t ca   = 4.82;  // shower max parameter - first guess; ca=TMath::Log(1000./8.07)
1311   Double_t tmax = 0.;    // position of electromagnetic shower max in cm
1312
1313   Double_t x0   = 1.31;  // radiation lenght (cm)
1314   //If old geometry in use
1315   if(!((fGeomPtr->GetEMCGeometry()->GetGeoName()).Contains("V1"))) x0 = 1.28;
1316
1317   if(e>0.1) {
1318     tmax = TMath::Log(e) + ca;
1319     if      (key==0) tmax += 0.5;
1320     else             tmax -= 0.5;
1321     tmax *= x0; // convert to cm
1322   }
1323   return tmax;
1324 }
1325
1326 //______________________________________________________________________________
1327 Float_t AliEMCALRecPoint::EtaToTheta(Float_t arg) const
1328 {
1329   //Converts Theta (Radians) to Eta(Radians)
1330   return (2.*TMath::ATan(TMath::Exp(-arg)));
1331 }
1332
1333 //______________________________________________________________________________
1334 Float_t AliEMCALRecPoint::ThetaToEta(Float_t arg) const
1335 {
1336   //Converts Eta (Radians) to Theta(Radians)
1337   return (-1 * TMath::Log(TMath::Tan(0.5 * arg)));
1338 }
1339
1340 //____________________________________________________________________________
1341 void AliEMCALRecPoint::Print(Option_t *opt) const
1342 {
1343   // Print the list of digits belonging to the cluster
1344   if(strlen(opt)==0) return;
1345   TString message ;
1346   message  = "AliEMCALRecPoint:\n" ;
1347   message +=  " digits # = " ;
1348   AliInfo(message.Data()) ;
1349
1350   Int_t iDigit;
1351   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1352     printf(" %d ", fDigitsList[iDigit] ) ;
1353   printf("\n");
1354
1355   AliInfo(" Energies = ") ;
1356   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1357     printf(" %f ", fEnergyList[iDigit] ) ;
1358   printf("\n");
1359
1360   AliInfo("\n Abs Ids = ") ;
1361   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1362     printf(" %i ", fAbsIdList[iDigit] ) ;
1363   printf("\n");
1364
1365   AliInfo(" Primaries  ") ;
1366   for(iDigit = 0;iDigit < fMulTrack; iDigit++)
1367     printf(" %d ", fTracksList[iDigit]) ;
1368
1369   printf("\n Local x %6.2f y %7.2f z %7.1f \n", fLocPos[0], fLocPos[1], fLocPos[2]);
1370
1371   message  = "       ClusterType     = %d" ;
1372   message += "       Multiplicity    = %d" ;
1373   message += "       Cluster Energy  = %f" ;
1374   message += "       Core energy     = %f" ;
1375   message += "       Core radius     = %f" ;
1376   message += "       Number of primaries %d" ;
1377   message += "       Stored at position %d" ;
1378   AliInfo(Form(message.Data(), fClusterType, fMulDigit, fAmp, fCoreEnergy, fCoreRadius, fMulTrack, GetIndexInList()) ) ;
1379 }
1380
1381 //___________________________________________________________
1382 Double_t  AliEMCALRecPoint::GetPointEnergy() const
1383 {
1384   //Returns energy ....
1385   Double_t e=0.0;
1386   for(int ic=0; ic<GetMultiplicity(); ic++) e += double(fEnergyList[ic]);
1387   return e;
1388 }