EMCAL/AliEMCALTrigger.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16
  17 //_________________________________________________________________________
  18 //
  19 //  Class for trigger analysis.
  20 //  Digits are grouped in TRU's  (Trigger Units). A TRU consists of 384
  21 //  cells ordered fNTRUPhi x fNTRUEta. The algorithm searches all possible 2x2
  22 //  and nxn (n is a multiple of 2) cell combinations per each TRU,  adding the
  23 //  digits amplitude and finding the maximum. If found, look if it is isolated.
  24 //  Maxima are transformed in ADC time samples. Each time bin is compared to the trigger
  25 //  threshold until it is larger and then, triggers are set. Thresholds need to be fixed.
  26 //  Thresholds need to be fixed. Last 2 modules are half size in Phi, I considered
  27 //  that the number of TRU is maintained for the last modules but decision not taken.
  28 //  If different, then this must be changed.
  29 //  Usage:
  30 //
  31 //  //Inside the event loop
  32 //  AliEMCALTrigger *tr = new AliEMCALTrigger();//Init Trigger
  33 //  tr->SetL0Threshold(100); //Arbitrary threshold values
  34 //  tr->SetL1JetLowPtThreshold(1000);
  35 //  tr->SetL1JetMediumPtThreshold(10000);
  36 //  tr->SetL1JetHighPtThreshold(20000);
  37 //  ...
  38 //  tr->Trigger(); //Execute Trigger
  39 //  tr->Print(""); //Print results
  40 //
  41 //*-- Author: Gustavo Conesa & Yves Schutz (IFIC, CERN)
  42 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  43
  44
  45 // --- ROOT system ---
  46
  47 // --- ALIROOT system ---
  48 #include "AliRun.h"
  49 #include "AliRunLoader.h"
  50 #include "AliTriggerInput.h"
  51 #include "AliEMCAL.h"
  52 #include "AliEMCALLoader.h"
  53 #include "AliEMCALDigit.h"
  54 #include "AliEMCALTrigger.h"
  55 #include "AliEMCALGeometry.h"
  56 #include "AliEMCALRawUtils.h"
  57
  58 ClassImp(AliEMCALTrigger)
  59
  60 //______________________________________________________________________
  61 AliEMCALTrigger::AliEMCALTrigger()
  62   : AliTriggerDetector(),
  63     f2x2MaxAmp(-1), f2x2CellPhi(-1),  f2x2CellEta(-1),
  64     f2x2SM(0),
  65     fnxnMaxAmp(-1), fnxnCellPhi(-1),  fnxnCellEta(-1),
  66     fnxnSM(0),
  67     fADCValuesHighnxn(0),fADCValuesLownxn(0),
  68     fADCValuesHigh2x2(0),fADCValuesLow2x2(0),
  69     fDigitsList(0),
  70     fL0Threshold(100),fL1JetLowPtThreshold(200),
  71     fL1JetMediumPtThreshold(500), fL1JetHighPtThreshold(1000),
  72     fNTRU(3), fNTRUEta(3), fNTRUPhi(1),
  73     fNCellsPhi(24), fNCellsEta(16),
  74     fPatchSize(1),  fIsolPatchSize(1),
  75     f2x2AmpOutOfPatch(-1), fnxnAmpOutOfPatch(-1),
  76     f2x2AmpOutOfPatchThres(100000),  fnxnAmpOutOfPatchThres(100000),
  77     fIs2x2Isol(kFALSE), fIsnxnIsol(kFALSE),
  78     fSimulation(kTRUE), fIsolateInSuperModule(kTRUE)
  79 {
  80   //ctor
  81   fADCValuesHighnxn = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  82   fADCValuesLownxn  = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  83   fADCValuesHigh2x2 = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  84   fADCValuesLow2x2  = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  85
  86   SetName("EMCAL");
  87   CreateInputs();
  88
  89    //Print("") ;
  90 }
  91
  92
  93
  94 //____________________________________________________________________________
  95 AliEMCALTrigger::AliEMCALTrigger(const AliEMCALTrigger & trig)
  96   : AliTriggerDetector(trig),
  97     f2x2MaxAmp(trig.f2x2MaxAmp),
  98     f2x2CellPhi(trig.f2x2CellPhi),
  99     f2x2CellEta(trig.f2x2CellEta),
 100     f2x2SM(trig.f2x2SM),
 101     fnxnMaxAmp(trig.fnxnMaxAmp),
 102     fnxnCellPhi(trig.fnxnCellPhi),
 103     fnxnCellEta(trig.fnxnCellEta),
 104     fnxnSM(trig.fnxnSM),
 105     fADCValuesHighnxn(trig.fADCValuesHighnxn),
 106     fADCValuesLownxn(trig.fADCValuesLownxn),
 107     fADCValuesHigh2x2(trig.fADCValuesHigh2x2),
 108     fADCValuesLow2x2(trig.fADCValuesLow2x2),
 109     fDigitsList(trig.fDigitsList),
 110     fL0Threshold(trig.fL0Threshold),
 111     fL1JetLowPtThreshold(trig.fL1JetLowPtThreshold),
 112     fL1JetMediumPtThreshold(trig.fL1JetMediumPtThreshold),
 113     fL1JetHighPtThreshold(trig.fL1JetHighPtThreshold),
 114     fNTRU(trig.fNTRU), fNTRUEta(trig.fNTRUEta), fNTRUPhi(trig.fNTRUPhi),
 115     fNCellsPhi(trig.fNCellsPhi), fNCellsEta(trig.fNCellsEta),
 116     fPatchSize(trig.fPatchSize),
 117     fIsolPatchSize(trig.fIsolPatchSize),
 118     f2x2AmpOutOfPatch(trig.f2x2AmpOutOfPatch),
 119     fnxnAmpOutOfPatch(trig.fnxnAmpOutOfPatch),
 120     f2x2AmpOutOfPatchThres(trig.f2x2AmpOutOfPatchThres),
 121     fnxnAmpOutOfPatchThres(trig.fnxnAmpOutOfPatchThres),
 122     fIs2x2Isol(trig.fIs2x2Isol),
 123     fIsnxnIsol(trig.fIsnxnIsol),
 124     fSimulation(trig.fSimulation),
 125     fIsolateInSuperModule(trig.fIsolateInSuperModule)
 126 {
 127   // cpy ctor
 128 }
 129
 130 AliEMCALTrigger::~AliEMCALTrigger() {
 131   delete [] fADCValuesHighnxn;
 132   delete [] fADCValuesLownxn;
 133   delete [] fADCValuesHigh2x2;
 134   delete [] fADCValuesLow2x2;
 135 }
 136
 137 //----------------------------------------------------------------------
 138 void AliEMCALTrigger::CreateInputs()
 139 {
 140    // inputs
 141
 142    // Do not create inputs again!!
 143    if( fInputs.GetEntriesFast() > 0 ) return;
 144
 145    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "EMCAL_L0",       "EMCAL L0", 0x02 ) );
 146    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "EMCAL_JetHPt_L1","EMCAL Jet High Pt L1",   0x04 ) );
 147    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "EMCAL_JetMPt_L1","EMCAL Jet Medium Pt L1", 0x08 ) );
 148    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "EMCAL_JetLPt_L1","EMCAL Jet Low Pt L1",    0x016 ) );
 149
 150 }
 151
 152 //____________________________________________________________________________
 153 Bool_t AliEMCALTrigger::IsPatchIsolated(Int_t iPatchType, const TClonesArray * ampmatrixes, const Int_t iSM, const Int_t mtru, const Float_t maxamp, const Int_t maxphi, const Int_t maxeta) {
 154
 155   //Calculate if the maximum patch found is isolated, find amplitude around maximum (2x2 or nxn) patch,
 156   //inside isolation patch . iPatchType = 0 means calculation for 2x2 patch,
 157   //iPatchType = 1 means calculation for nxn patch.
 158   //In the next table there is an example of the different options of patch size and isolation patch size:
 159   //                                                                                 Patch Size (fPatchSize)
 160   //                                                             0                          1                                  2
 161   //          fIsolPatchSize                 2x2 (not overlap)   4x4 (overlapped)        6x6(overlapped) ...
 162   //                   1                                       4x4                      8x8                              10x10
 163   //                   2                                       6x6                     12x12                           14x14
 164   //                   3                                       8x8                     16x16                           18x18
 165
 166   Bool_t b = kFALSE;
 167   Float_t amp = 0;
 168
 169   //Get matrix of TRU or Module with maximum amplitude patch.
 170   Int_t itru = mtru+iSM*fNTRU ; //number of tru, min 0 max 8*5.
 171   TMatrixD * ampmatrix   = 0x0;
 172   Int_t colborder = 0;
 173   Int_t rowborder = 0;
 174
 175   if(fIsolateInSuperModule){
 176     ampmatrix = dynamic_cast<TMatrixD *>(ampmatrixes->At(iSM)) ;
 177     rowborder = fNCellsPhi*fNTRUPhi;
 178     colborder = fNCellsEta*fNTRUEta;
 179     AliDebug(2,"Isolate trigger in Module");
 180   }
 181   else{
 182     ampmatrix = dynamic_cast<TMatrixD *>(ampmatrixes->At(itru)) ;
 183     rowborder = fNCellsPhi;
 184     colborder = fNCellsEta;
 185     AliDebug(2,"Isolate trigger in TRU");
 186   }
 187
 188   //Define patch cells
 189   Int_t isolcells   = fIsolPatchSize*(1+iPatchType);
 190   Int_t ipatchcells = 2*(1+fPatchSize*iPatchType);
 191   Int_t minrow      = maxphi - isolcells;
 192   Int_t mincol      = maxeta - isolcells;
 193   Int_t maxrow      = maxphi + isolcells + ipatchcells;
 194   Int_t maxcol      = maxeta + isolcells + ipatchcells;
 195
 196   AliDebug(2,Form("Number of added Isol Cells %d, Patch Size %d",isolcells, ipatchcells));
 197   AliDebug(2,Form("Patch: minrow %d, maxrow %d, mincol %d, maxcol %d",minrow,maxrow,mincol,maxcol));
 198
 199   if(minrow < 0 || mincol < 0 || maxrow > rowborder || maxcol > colborder){
 200     AliDebug(1,Form("Out of Module/TRU range, cannot isolate patch"));
 201     return kFALSE;
 202   }
 203
 204   //Add amplitudes in all isolation patch
 205   for(Int_t irow = minrow ; irow <  maxrow; irow ++)
 206     for(Int_t icol = mincol ; icol < maxcol ; icol ++)
 207       amp += (*ampmatrix)(irow,icol);
 208
 209   AliDebug(2,Form("Type %d, Maximum amplitude %f, patch+isol square %f",iPatchType, maxamp, amp));
 210
 211   if(amp < maxamp){
 212     AliError(Form("Bad sum: Type %d, Maximum amplitude %f, patch+isol square %f",iPatchType, maxamp, amp));
 213     return kFALSE;
 214   }
 215   else
 216     amp-=maxamp; //Calculate energy in isolation patch that do not comes from maximum patch.
 217
 218   AliDebug(2, Form("Maximum amplitude %f, Out of patch %f",maxamp, amp));
 219
 220   //Fill isolation amplitude data member and say if patch is isolated.
 221   if(iPatchType == 0){ //2x2 case
 222     f2x2AmpOutOfPatch = amp;
 223     if(amp < f2x2AmpOutOfPatchThres)
 224       b=kTRUE;
 225   }
 226   else  if(iPatchType == 1){ //nxn case
 227     fnxnAmpOutOfPatch = amp;
 228     if(amp < fnxnAmpOutOfPatchThres)
 229       b=kTRUE;
 230   }
 231
 232   return b;
 233
 234 }
 235
 236 //____________________________________________________________________________
 237 void AliEMCALTrigger::MakeSlidingCell(const TClonesArray * amptrus, const TClonesArray * timeRtrus, const Int_t isupermod,TMatrixD &ampmax2, TMatrixD &ampmaxn){
 238
 239   //Sums energy of all possible 2x2 (L0) and nxn (L1) cells per each TRU.
 240   //Fast signal in the experiment is given by 2x2 cells,
 241   //for this reason we loop inside the TRU cells by 2.
 242
 243   //Declare and initialize variables
 244   Int_t nCellsPhi  = fNCellsPhi;//geom->GetNPhi()*2/geom->GetNTRUPhi() ;
 245   if(isupermod > 9)
 246     nCellsPhi =  nCellsPhi / 2 ; //Half size SM. Not Final.
 247   // 12(tow)*2(cell)/1 TRU, cells in Phi in one TRU
 248   Int_t nCellsEta  = fNCellsEta ;//geom->GetNEta()*2/geom->GetNTRUEta() ;
 249   // 24(mod)*2(tower)/3 TRU, cells in Eta in one TRU
 250   //Int_t nTRU          = geom->GeNTRU();//3 TRU per super module
 251
 252   Float_t amp2 = 0 ;
 253   Float_t ampn = 0 ;
 254   for(Int_t i = 0; i < 4; i++){
 255     for(Int_t j = 0; j < fNTRU; j++){
 256       ampmax2(i,j) = -1;
 257       ampmaxn(i,j) = -1;
 258     }
 259   }
 260
 261   //Create matrix that will contain 2x2 amplitude sums
 262   //used to calculate the nxn sums
 263   TMatrixD tru2x2(nCellsPhi/2,nCellsEta/2) ;
 264   for(Int_t i = 0; i < nCellsPhi/2; i++)
 265     for(Int_t j = 0; j < nCellsEta/2; j++)
 266       tru2x2(i,j) = -1;
 267
 268   //Loop over all TRUS in a supermodule
 269   for(Int_t itru = 0 + isupermod * fNTRU ; itru < (isupermod+1)*fNTRU ; itru++) {
 270     TMatrixD * amptru   = dynamic_cast<TMatrixD *>(amptrus->At(itru)) ;
 271     TMatrixD * timeRtru = dynamic_cast<TMatrixD *>(timeRtrus->At(itru)) ;
 272     Int_t mtru = itru-isupermod*fNTRU ; //Number of TRU in Supermodule
 273
 274     //Sliding 2x2, add 2x2 amplitudes (NOT OVERLAP)
 275     for(Int_t irow = 0 ; irow <  nCellsPhi; irow += 2){
 276       for(Int_t icol = 0 ; icol < nCellsEta ; icol += 2){
 277         amp2 = (*amptru)(irow,icol)+(*amptru)(irow+1,icol)+
 278           (*amptru)(irow,icol+1)+(*amptru)(irow+1,icol+1);
 279
 280         //Fill matrix with added 2x2 cells for use in nxn sums
 281         tru2x2(irow/2,icol/2) = amp2 ;
 282         //Select 2x2 maximum sums to select L0
 283         if(amp2 > ampmax2(0,mtru)){
 284           ampmax2(0,mtru) = amp2 ;
 285           ampmax2(1,mtru) = irow;
 286           ampmax2(2,mtru) = icol;
 287         }
 288       }
 289     }
 290
 291     //Find most recent time in the selected 2x2 cell
 292     ampmax2(3,mtru) = 1 ;
 293     Int_t row2 =  static_cast <Int_t> (ampmax2(1,mtru));
 294     Int_t col2 =  static_cast <Int_t> (ampmax2(2,mtru));
 295     for(Int_t i = 0; i<2; i++){
 296       for(Int_t j = 0; j<2; j++){
 297         if((*amptru)(row2+i,col2+j) > 0 &&  (*timeRtru)(row2+i,col2+j)> 0){
 298           if((*timeRtru)(row2+i,col2+j) <  ampmax2(3,mtru)  )
 299             ampmax2(3,mtru) =  (*timeRtru)(row2+i,col2+j);
 300         }
 301       }
 302     }
 303
 304     //Sliding nxn, add nxn amplitudes  (OVERLAP)
 305     if(fPatchSize > 0){
 306       for(Int_t irow = 0 ; irow <  nCellsPhi/2; irow++){
 307         for(Int_t icol = 0 ; icol < nCellsEta/2 ; icol++){
 308           ampn = 0;
 309           if( (irow+fPatchSize) < nCellsPhi/2 && (icol+fPatchSize) < nCellsEta/2){//Avoid exit the TRU
 310             for(Int_t i = 0 ; i <= fPatchSize ; i++)
 311               for(Int_t j = 0 ; j <= fPatchSize ; j++)
 312                 ampn += tru2x2(irow+i,icol+j);
 313             //Select nxn maximum sums to select L1
 314             if(ampn > ampmaxn(0,mtru)){
 315               ampmaxn(0,mtru) = ampn ;
 316               ampmaxn(1,mtru) = irow*2;
 317               ampmaxn(2,mtru) = icol*2;
 318             }
 319           }
 320         }
 321       }
 322
 323       //Find most recent time in selected nxn cell
 324       ampmaxn(3,mtru) = 1 ;
 325       Int_t rown =  static_cast <Int_t> (ampmaxn(1,mtru));
 326       Int_t coln =  static_cast <Int_t> (ampmaxn(2,mtru));
 327       for(Int_t i = 0; i<4*fPatchSize; i++){
 328         for(Int_t j = 0; j<4*fPatchSize; j++){
 329           if( (rown+i) < nCellsPhi && (coln+j) < nCellsEta/2){//Avoid exit the TRU
 330             if((*amptru)(rown+i,coln+j) > 0 &&  (*timeRtru)(rown+i,coln+j)> 0){
 331               if((*timeRtru)(rown+i,coln+j) <  ampmaxn(3,mtru)  )
 332                 ampmaxn(3,mtru) =  (*timeRtru)(rown+i,coln+j);
 333             }
 334           }
 335         }
 336       }
 337     }
 338     else {
 339         ampmaxn(0,mtru) =  ampmax2(0,mtru);
 340         ampmaxn(1,mtru) =  ampmax2(1,mtru);
 341         ampmaxn(2,mtru) =  ampmax2(2,mtru);
 342         ampmaxn(3,mtru) =  ampmax2(3,mtru);
 343       }
 344   }
 345 }
 346
 347 //____________________________________________________________________________
 348 void AliEMCALTrigger::Print(const Option_t * opt) const
 349 {
 350
 351   //Prints main parameters
 352
 353   if(! opt)
 354     return;
 355   AliTriggerInput* in = 0x0 ;
 356
 357   printf( "             Maximum Amplitude after Sliding Cell, \n") ;
 358   printf( "               -2x2 cells sum (not overlapped): %10.2f, in Super Module %d\n",
 359           f2x2MaxAmp,f2x2SM) ;
 360   printf( "               -2x2 from row %d to row %d and from column %d to column %d\n", f2x2CellPhi, f2x2CellPhi+2, f2x2CellEta, f2x2CellEta+2) ;
 361   printf( "               -2x2 Isolation Patch %d x %d, Amplitude out of 2x2 patch is %f, threshold %f, Isolated? %d \n",
 362           2*fIsolPatchSize+2, 2*fIsolPatchSize+2,  f2x2AmpOutOfPatch,  f2x2AmpOutOfPatchThres,static_cast<Int_t> (fIs2x2Isol)) ;
 363   if(fPatchSize > 0){
 364     printf( "             Patch Size, n x n: %d x %d cells\n",2*(fPatchSize+1), 2*(fPatchSize+1));
 365     printf( "               -nxn cells sum (overlapped)    : %10.2f, in Super Module %d\n",
 366             fnxnMaxAmp,fnxnSM) ;
 367     printf( "               -nxn from row %d to row %d and from column %d to column %d\n", fnxnCellPhi, fnxnCellPhi+4*fPatchSize, fnxnCellEta, fnxnCellEta+4*fPatchSize) ;
 368     printf( "               -nxn Isolation Patch %d x %d, Amplitude out of nxn patch is %f, threshold %f, Isolated? %d \n",
 369             4*fIsolPatchSize+2*(fPatchSize+1),4*fIsolPatchSize+2*(fPatchSize+1) ,  fnxnAmpOutOfPatch,  fnxnAmpOutOfPatchThres,static_cast<Int_t> (fIsnxnIsol) ) ;
 370   }
 371
 372   printf( "             Isolate in SuperModule? %d\n",
 373           fIsolateInSuperModule) ;
 374
 375   printf( "             Threshold for LO %10.2f\n",
 376           fL0Threshold) ;
 377   in = (AliTriggerInput*)fInputs.FindObject( "EMCAL_L0" );
 378   if(in->GetValue())
 379     printf( "             *** EMCAL LO is set ***\n") ;
 380
 381   printf( "             Jet Low Pt Threshold for L1 %10.2f\n",
 382           fL1JetLowPtThreshold) ;
 383   in = (AliTriggerInput*)fInputs.FindObject( "EMCAL_JetLPt_L1" );
 384   if(in->GetValue())
 385     printf( "             *** EMCAL Jet Low Pt for L1 is set ***\n") ;
 386
 387   printf( "             Jet Medium Pt Threshold for L1 %10.2f\n",
 388           fL1JetMediumPtThreshold) ;
 389   in = (AliTriggerInput*) fInputs.FindObject( "EMCAL_JetMPt_L1" );
 390   if(in->GetValue())
 391     printf( "             *** EMCAL Jet Medium Pt for L1 is set ***\n") ;
 392
 393   printf( "             Jet High Pt Threshold for L1 %10.2f\n",
 394           fL1JetHighPtThreshold) ;
 395   in = (AliTriggerInput*) fInputs.FindObject( "EMCAL_JetHPt_L1" );
 396   if(in->GetValue())
 397     printf( "             *** EMCAL Jet High Pt for L1 is set ***\n") ;
 398
 399 }
 400
 401 //____________________________________________________________________________
 402 void AliEMCALTrigger::SetTriggers(const TClonesArray * ampmatrix,const Int_t iSM,
 403                                   const TMatrixD &ampmax2,
 404                                   const TMatrixD &ampmaxn, const AliEMCALGeometry *geom)
 405 {
 406
 407   //Checks the 2x2 and nxn maximum amplitude per each TRU and
 408   //compares with the different L0 and L1 triggers thresholds
 409   Float_t max2[] = {-1,-1,-1,-1} ;
 410   Float_t maxn[] = {-1,-1,-1,-1} ;
 411   Int_t   mtru2  = -1 ;
 412   Int_t   mtrun  = -1 ;
 413
 414   //Find maximum summed amplitude of all the TRU
 415   //in a Super Module
 416     for(Int_t i = 0 ; i < fNTRU ; i++){
 417       if(max2[0] < ampmax2(0,i) ){
 418         max2[0] =  ampmax2(0,i) ; // 2x2 summed max amplitude
 419         max2[1] =  ampmax2(1,i) ; // corresponding phi position in TRU
 420         max2[2] =  ampmax2(2,i) ; // corresponding eta position in TRU
 421         max2[3] =  ampmax2(3,i) ; // corresponding most recent time
 422         mtru2   = i ;
 423       }
 424       if(maxn[0] < ampmaxn(0,i) ){
 425         maxn[0] =  ampmaxn(0,i) ; // nxn summed max amplitude
 426         maxn[1] =  ampmaxn(1,i) ; // corresponding phi position in TRU
 427         maxn[2] =  ampmaxn(2,i) ; // corresponding eta position in TRU
 428         maxn[3] =  ampmaxn(3,i) ; // corresponding most recent time
 429         mtrun   = i ;
 430       }
 431     }
 432
 433   //--------Set max amplitude if larger than in other Super Modules------------
 434   Float_t maxtimeR2 = -1 ;
 435   Float_t maxtimeRn = -1 ;
 436   static AliEMCALRawUtils rawUtil;
 437   Int_t nTimeBins = rawUtil.GetRawFormatTimeBins() ;
 438
 439   //Set max of 2x2 amplitudes and select L0 trigger
 440   if(max2[0] > f2x2MaxAmp ){
 441     f2x2MaxAmp  = max2[0] ;
 442     f2x2SM      = iSM ;
 443     maxtimeR2   = max2[3] ;
 444     geom->GetCellPhiEtaIndexInSModuleFromTRUIndex(mtru2,
 445                                                   static_cast<Int_t>(max2[1]),
 446                                                   static_cast<Int_t>(max2[2]),
 447                                                   f2x2CellPhi,f2x2CellEta) ;
 448
 449     //Isolated patch?
 450     if(fIsolateInSuperModule)
 451       fIs2x2Isol =  IsPatchIsolated(0, ampmatrix, iSM, mtru2,  f2x2MaxAmp, f2x2CellPhi,f2x2CellEta) ;
 452     else
 453       fIs2x2Isol =  IsPatchIsolated(0, ampmatrix, iSM, mtru2,  f2x2MaxAmp,  static_cast<Int_t>(max2[1]), static_cast<Int_t>(max2[2])) ;
 454
 455     //Transform digit amplitude in Raw Samples
 456     if (fADCValuesLow2x2 == 0) {
 457       fADCValuesLow2x2  = new Int_t[nTimeBins];
 458       fADCValuesHigh2x2 = new Int_t[nTimeBins];
 459     }
 460     rawUtil.RawSampledResponse(maxtimeR2, f2x2MaxAmp, fADCValuesHigh2x2, fADCValuesLow2x2) ;
 461
 462     //Set Trigger Inputs, compare ADC time bins until threshold is attained
 463     //Set L0
 464     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 465       if(fADCValuesHigh2x2[i] >= fL0Threshold          || fADCValuesLow2x2[i] >= fL0Threshold){
 466         SetInput("EMCAL_L0") ;
 467         break;
 468       }
 469     }
 470   }
 471
 472   //------------Set max of nxn amplitudes and select L1 trigger---------
 473   if(maxn[0] > fnxnMaxAmp ){
 474     fnxnMaxAmp  = maxn[0] ;
 475     fnxnSM      = iSM ;
 476     maxtimeRn   = maxn[3] ;
 477     geom->GetCellPhiEtaIndexInSModuleFromTRUIndex(mtrun,
 478                                                   static_cast<Int_t>(maxn[1]),
 479                                                   static_cast<Int_t>(maxn[2]),
 480                                                   fnxnCellPhi,fnxnCellEta) ;
 481
 482     //Isolated patch?
 483     if(fIsolateInSuperModule)
 484       fIsnxnIsol =  IsPatchIsolated(1, ampmatrix, iSM, mtrun,  fnxnMaxAmp, fnxnCellPhi, fnxnCellEta) ;
 485     else
 486       fIsnxnIsol =  IsPatchIsolated(1, ampmatrix, iSM, mtrun,  fnxnMaxAmp,  static_cast<Int_t>(maxn[1]), static_cast<Int_t>(maxn[2])) ;
 487
 488     //Transform digit amplitude in Raw Samples
 489     if (fADCValuesLownxn == 0) {
 490       fADCValuesHighnxn = new Int_t[nTimeBins];
 491       fADCValuesLownxn  = new Int_t[nTimeBins];
 492     }
 493     rawUtil.RawSampledResponse(maxtimeRn, fnxnMaxAmp, fADCValuesHighnxn, fADCValuesLownxn) ;
 494
 495     //Set Trigger Inputs, compare ADC time bins until threshold is attained
 496     //SetL1 Low
 497     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 498       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetLowPtThreshold  || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetLowPtThreshold){
 499         SetInput("EMCAL_JetLPt_L1") ;
 500         break;
 501       }
 502     }
 503
 504     //SetL1 Medium
 505     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 506       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetMediumPtThreshold || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetMediumPtThreshold){
 507         SetInput("EMCAL_JetMPt_L1") ;
 508         break;
 509       }
 510     }
 511
 512     //SetL1 High
 513     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 514       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetHighPtThreshold || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetHighPtThreshold){
 515         SetInput("EMCAL_JetHPt_L1") ;
 516         break;
 517       }
 518     }
 519   }
 520 }
 521
 522 //____________________________________________________________________________
 523 void AliEMCALTrigger::FillTRU(const AliEMCALGeometry *geom, const TClonesArray * digits, TClonesArray * ampmatrix, TClonesArray * ampmatrixsmod, TClonesArray * timeRmatrix) {
 524
 525 //  Orders digits ampitudes list in fNTRU TRUs (384 cells) per supermodule.
 526 //  Each TRU is a TMatrixD, and they are kept in TClonesArrays. The number of
 527 //  TRU in phi is fNTRUPhi, and the number of TRU in eta is fNTRUEta.
 528 //  Last 2 modules are half size in Phi, I considered that the number of TRU
 529 //  is maintained for the last modules but decision not taken. If different,
 530 //  then this must be changed. Also fill a matrix with all amplitudes in supermodule for isolation studies.
 531
 532   //Check data members
 533
 534   if(fNTRUEta*fNTRUPhi != fNTRU)
 535     Error("FillTRU"," Wrong number of TRUS per Eta or Phi");
 536
 537   //Initilize and declare variables
 538   //List of TRU matrices initialized to 0.
 539   Int_t nPhi = geom->GetNPhi();
 540   Int_t nZ = geom->GetNZ();
 541   Int_t nCellsPhi  = nPhi*2/fNTRUPhi;
 542   Int_t nCellsPhi2 = nPhi/fNTRUPhi; //HalfSize modules
 543   Int_t nCellsEta  = nZ*2/fNTRUEta;
 544
 545   Int_t id       = -1;
 546   Float_t amp    = -1;
 547   Float_t timeR  = -1;
 548   Int_t iSupMod  = -1;
 549   Int_t nModule  = -1;
 550   Int_t nIphi    = -1;
 551   Int_t nIeta    = -1;
 552   Int_t iphi     = -1;
 553   Int_t ieta     = -1;
 554
 555   //List of TRU matrices initialized to 0.
 556   Int_t nSup = geom->GetNumberOfSuperModules();
 557   for(Int_t k = 0; k < fNTRU*nSup; k++){
 558     TMatrixD amptrus(nCellsPhi,nCellsEta) ;
 559     TMatrixD timeRtrus(nCellsPhi,nCellsEta) ;
 560     // Do we need to initialise? I think TMatrixD does it by itself...
 561     for(Int_t i = 0; i < nCellsPhi; i++){
 562       for(Int_t j = 0; j < nCellsEta; j++){
 563         amptrus(i,j) = 0.0;
 564         timeRtrus(i,j) = 0.0;
 565       }
 566     }
 567     new((*ampmatrix)[k])   TMatrixD(amptrus) ;
 568     new((*timeRmatrix)[k]) TMatrixD(timeRtrus) ;
 569   }
 570
 571   //List of Modules matrices initialized to 0.
 572   for(Int_t k = 0; k < nSup ; k++){
 573     TMatrixD  ampsmods( nPhi*2, nZ*2) ;
 574     for(Int_t i = 0; i <  nPhi*2; i++){
 575       for(Int_t j = 0; j < nZ*2; j++){
 576         ampsmods(i,j)   = 0.0;
 577       }
 578     }
 579     new((*ampmatrixsmod)[k])   TMatrixD(ampsmods) ;
 580   }
 581
 582   AliEMCALDigit * dig ;
 583
 584   //Digits loop to fill TRU matrices with amplitudes.
 585   for(Int_t idig = 0 ; idig < digits->GetEntriesFast() ; idig++){
 586
 587     dig = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(idig)) ;
 588     amp    = dig->GetAmp() ;   // Energy of the digit (arbitrary units)
 589     id     = dig->GetId() ;    // Id label of the cell
 590     timeR  = dig->GetTimeR() ; // Earliest time of the digit
 591
 592     //Get eta and phi cell position in supermodule
 593     Bool_t bCell = geom->GetCellIndex(id, iSupMod, nModule, nIphi, nIeta) ;
 594     if(!bCell)
 595       Error("FillTRU","Wrong cell id number") ;
 596
 597     geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,nModule,nIphi, nIeta,iphi,ieta);
 598
 599     //Check to which TRU in the supermodule belongs the cell.
 600     //Supermodules are divided in a TRU matrix of dimension
 601     //(fNTRUPhi,fNTRUEta).
 602     //Each TRU is a cell matrix of dimension (nCellsPhi,nCellsEta)
 603
 604     //First calculate the row and column in the supermodule
 605     //of the TRU to which the cell belongs.
 606     Int_t col   = ieta/nCellsEta;
 607     Int_t row   = iphi/nCellsPhi;
 608     if(iSupMod > 9)
 609       row   = iphi/nCellsPhi2;
 610     //Calculate label number of the TRU
 611     Int_t itru  = row + col*fNTRUPhi + iSupMod*fNTRU ;
 612
 613     //Fill TRU matrix with cell values
 614     TMatrixD * amptrus   = dynamic_cast<TMatrixD *>(ampmatrix->At(itru)) ;
 615     TMatrixD * timeRtrus = dynamic_cast<TMatrixD *>(timeRmatrix->At(itru)) ;
 616
 617     //Calculate row and column of the cell inside the TRU with number itru
 618     Int_t irow = iphi - row *  nCellsPhi;
 619     if(iSupMod > 9)
 620       irow = iphi - row *  nCellsPhi2;
 621     Int_t icol = ieta - col *  nCellsEta;
 622
 623     (*amptrus)(irow,icol) = amp ;
 624     (*timeRtrus)(irow,icol) = timeR ;
 625
 626     //####################SUPERMODULE MATRIX ##################
 627     TMatrixD * ampsmods   = dynamic_cast<TMatrixD *>(ampmatrixsmod->At(iSupMod)) ;
 628     (*ampsmods)(iphi,ieta)   = amp ;
 629
 630   }
 631 }
 632 //____________________________________________________________________________
 633 void AliEMCALTrigger::Trigger()
 634 {
 635   //Main Method to select triggers.
 636   AliRunLoader *runLoader = AliRunLoader::GetRunLoader();
 637   AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>
 638     (runLoader->GetDetectorLoader("EMCAL"));
 639
 640   //Load EMCAL Geometry
 641   AliEMCALGeometry * geom = 0;
 642   if (runLoader->GetAliRun() && runLoader->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))
 643     geom = dynamic_cast<AliEMCAL*>(runLoader->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))->GetGeometry();
 644   if (geom == 0)
 645     geom = AliEMCALGeometry::GetInstance(AliEMCALGeometry::GetDefaulGeometryName());
 646
 647   if (geom==0)
 648     AliFatal("Did not get geometry from EMCALLoader");
 649
 650   //Define parameters
 651   Int_t nSuperModules = geom->GetNumberOfSuperModules() ; //12 SM in EMCAL
 652   fNTRU       = geom->GetNTRU();    //3 TRU per super module
 653   fNTRUEta    = geom->GetNTRUEta(); //3 TRU in eta per super module
 654   fNTRUPhi    = geom->GetNTRUPhi(); //1 TRU  in phi per super module
 655   fNCellsPhi  = geom->GetNPhi()*2/geom->GetNTRUPhi() ;
 656   fNCellsEta  = geom->GetNEta()*2/geom->GetNTRUEta() ;
 657
 658   //Intialize data members each time the trigger is called in event loop
 659   f2x2MaxAmp = -1; f2x2CellPhi = -1;  f2x2CellEta = -1;
 660   fnxnMaxAmp = -1; fnxnCellPhi = -1;  fnxnCellEta = -1;
 661
 662   //Take the digits list if simulation
 663   if(fSimulation){
 664     runLoader->LoadDigits("EMCAL");
 665     fDigitsList = emcalLoader->Digits() ;
 666   }
 667   if(!fDigitsList)
 668     AliFatal("Digits not found !") ;
 669
 670   //Take the digits list
 671
 672   //Fill TRU Matrix
 673   TClonesArray * amptrus   = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
 674   TClonesArray * ampsmods  = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
 675   TClonesArray * timeRtrus = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
 676
 677   FillTRU(geom,fDigitsList, amptrus, ampsmods, timeRtrus) ;
 678
 679   //Do Cell Sliding and select Trigger
 680   //Initialize varible that will contain maximum amplitudes and
 681   //its corresponding cell position in eta and phi, and time.
 682   TMatrixD ampmax2(4,fNTRU) ;
 683   TMatrixD ampmaxn(4,fNTRU) ;
 684
 685   for(Int_t iSM = 0 ; iSM < nSuperModules ; iSM++) {
 686     //Do 2x2 and nxn sums, select maximums.
 687     MakeSlidingCell(amptrus, timeRtrus, iSM, ampmax2, ampmaxn);
 688
 689     //Set the trigger
 690     if(fIsolateInSuperModule)
 691       SetTriggers(ampsmods,iSM,ampmax2,ampmaxn,geom) ;
 692     if(!fIsolateInSuperModule)
 693       SetTriggers(amptrus,iSM,ampmax2,ampmaxn,geom) ;
 694   }
 695
 696   amptrus->Delete();
 697   delete amptrus; amptrus = 0;
 698   ampsmods->Delete();
 699   delete ampsmods; ampsmods = 0;
 700   timeRtrus->Delete();
 701   delete timeRtrus; timeRtrus = 0;
 702   //Print();
 703
 704 }