FMD/AliFMDPreprocessor.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 2004, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 /** @file    AliFMDPreprocessor.cxx
  17     @author  Hans Hjersing Dalsgaard <canute@nbi.dk>
  18     @date    Mon Mar 27 12:39:09 2006
  19     @brief   Shuttle "preprocessor" for the FMD
  20 */
  21 //___________________________________________________________________
  22 //
  23 // The class processes data points from DCS (via Amanada), and DAQ DA
  24 // files (via FXS) to make calibration data for the FMD.
  25 //
  26 // Data points:
  27 //    *  Nothing yet.
  28 //
  29 // DAQ FXS file:
  30 //    * pedestals - a (ASCII) Comma Separated Values files with the
  31 //                  fields
  32 //                       rcu     DDL number
  33 //                       board   FEC board number
  34 //                       chip    ALTRO chip number on FEC
  35 //                       channel ALTRO channel number
  36 //                       strip   VA1 strip number
  37 //                       sample  Sample number
  38 //                       ped     Mean of ADC spectra
  39 //                       noise   Spread of ADC spectra
  40 //                       mu      Mean of Gaussian fit to ADC spectra
  41 //                       sigma   Variance of Gaussian fit to ADC spectra
  42 //                       chi2    Chi^2 per degrees of freedom of fit
  43 //    * Gains     - a (ASCII) Comma Separated Values files with the
  44 //                  fields
  45 //                       rcu     DDL number
  46 //                       board   FEC board number
  47 //                       chip    ALTRO chip number on FEC
  48 //                       channel ALTRO channel number
  49 //                       strip   VA1 strip number
  50 //                       gain    Slope of gain
  51 //                       error   Error on gain
  52 //                       chi2    Chi^2 per degrees of freedom of fit
  53 //
  54 // See also
  55 //
  56 //   http://aliceinfo.cern.ch/Offline/Activities/Shuttle.html
  57 //
  58 // Latest changes by Christian Holm Christensen
  59 //
  60
  61 // #include <iostream>
  62
  63 #include <fstream>
  64 #include "AliFMDPreprocessor.h"
  65 #include "AliFMDCalibPedestal.h"
  66 #include "AliFMDCalibGain.h"
  67 #include "AliFMDCalibStripRange.h"
  68 #include "AliFMDCalibSampleRate.h"
  69 #include "AliFMDParameters.h"
  70 #include "AliCDBMetaData.h"
  71 #include "AliCDBManager.h"
  72 // #include "AliDCSValue.h"
  73 #include "AliLog.h"
  74 #include <TTimeStamp.h>
  75 // #include <TFile.h>
  76 #include <TObjString.h>
  77 #include <TString.h>
  78 #include <TNamed.h>
  79
  80
  81 ClassImp(AliFMDPreprocessor)
  82 #if 0 // Do not remove - here to make Emacs happy
  83 ;
  84 #endif
  85
  86 //____________________________________________________
  87 Bool_t AliFMDPreprocessor::GetAndCheckFileSources(TList*&     list,
  88                                                   Int_t       system,
  89                                                   const char* id)
  90 {
  91   // Convinience function
  92   // Parameters:
  93   //   list     On return, list of files.
  94   //   system   Alice system (DAQ, DCS, ...)
  95   //   id       File id
  96   // Return:
  97   //   kTRUE on success.
  98   list = GetFileSources(system, id);
  99   if (!list) {
 100     TString sys;
 101     switch (system) {
 102     case kDAQ: sys = "DAQ";     break;
 103     case kDCS: sys = "DCS";     break;
 104     default:   sys = "unknown"; break;
 105     }
 106     Log(Form("Failed to get file sources for %s/%s", sys.Data(), system));
 107     return kFALSE;
 108   }
 109   return kTRUE;
 110 }
 111
 112 //____________________________________________________
 113 AliCDBEntry*
 114 AliFMDPreprocessor::GetFromCDB(const char* second, const char* third)
 115 {
 116   return GetFromOCDB(second, third);
 117 }
 118
 119
 120 //____________________________________________________
 121 UInt_t AliFMDPreprocessor::Process(TMap* /* dcsAliasMap */)
 122 {
 123   // Main member function.
 124   // Parameters:
 125   //    dcsAliassMap   Map of DCS data point aliases.
 126   // Return
 127   //    0 on success, >0 otherwise
 128   Bool_t resultPed   = kTRUE;
 129   Bool_t resultGain  = kTRUE;
 130   Bool_t resultRange = kTRUE;
 131   Bool_t resultRate  = kTRUE;
 132   Bool_t resultZero  = kTRUE;
 133
 134   // Do we need this ?
 135   // if(!dcsAliasMap) return 1;
 136   //
 137   // Invoking the cdb manager and the FMD parameters class
 138   // AliCDBManager* cdb   = AliCDBManager::Instance();
 139   // cdb->SetDefaultStorage("local://$ALICE_ROOT");
 140   // cdb->SetRun(0);
 141   AliFMDParameters* pars = AliFMDParameters::Instance();
 142   pars->Init(this, false, AliFMDParameters::kAltroMap);
 143
 144   // This is if the SOR contains Fee parameters, and we run a DA to
 145   // extract these parameters.   The same code could work if we get
 146   // the information from DCS via the FXS
 147   TList* files = 0;
 148   AliFMDCalibSampleRate*      calibRate  = 0;
 149   AliFMDCalibStripRange*      calibRange = 0;
 150   AliFMDCalibZeroSuppression* calibZero  = 0;
 151   // Disabled for now.
 152 #if 0
 153   if (GetAndCheckFileSources(files, kDAQ,"info"))
 154     GetInfoCalibration(files, calibRate, calibRange, calibZero);
 155   resultRate  = (!calibRate  ? kFALSE : kTRUE);
 156   resultRange = (!calibRange ? kFALSE : kTRUE);
 157   resultZero  = (!calibZero  ? kFALSE : kTRUE);
 158 #endif
 159
 160   // Gt the run type
 161   TString runType(GetRunType());
 162
 163   //Creating calibration objects
 164   AliFMDCalibPedestal* calibPed  = 0;
 165   AliFMDCalibGain*     calibGain = 0;
 166   if (runType.Contains("PEDESTAL", TString::kIgnoreCase)) {
 167     if (GetAndCheckFileSources(files, kDAQ, "pedestals")) {
 168       if(files->GetSize())
 169         calibPed = GetPedestalCalibration(files);
 170     }
 171     resultPed = (calibPed ? kTRUE : kFALSE);
 172   }
 173   if (runType.Contains("PULSER", TString::kIgnoreCase)) {
 174     if (GetAndCheckFileSources(files, kDAQ, "gains")) {
 175       if(files->GetSize())
 176         calibGain = GetGainCalibration(files);
 177     }
 178     resultGain = (calibGain ? kTRUE : kFALSE);
 179   }
 180
 181   //Storing Calibration objects
 182   AliCDBMetaData metaData;
 183   metaData.SetBeamPeriod(0);
 184   metaData.SetResponsible("Hans H. Dalsgaard");
 185   metaData.SetComment("Preprocessor stores pedestals and gains for the FMD.");
 186
 187   if(calibPed)  {
 188     resultPed  = Store("Calib","Pedestal", calibPed, &metaData, 0, kTRUE);
 189     delete calibPed;
 190   }
 191   if(calibGain) {
 192     resultGain = Store("Calib","PulseGain", calibGain, &metaData, 0, kTRUE);
 193     delete calibGain;
 194   }
 195   if(calibRange) {
 196     resultRange = Store("Calib","StripRange", calibRange, &metaData, 0, kTRUE);
 197     delete calibRange;
 198   }
 199   if(calibRate) {
 200     resultRate = Store("Calib","SampleRate", calibRate, &metaData, 0, kTRUE);
 201     delete calibRate;
 202   }
 203   if(calibZero) {
 204     resultZero = Store("Calib","ZeroSuppression", calibZero,&metaData,0,kTRUE);
 205     delete calibZero;
 206   }
 207
 208 #if 0
 209   // Disabled until we implement GetInfoCalibration properly
 210   Bool_t success = (resultPed && resultGain  && resultRange &&
 211                     resultRate  && resultZero);
 212 #endif
 213   Bool_t success = resultPed && resultGain;
 214   Log(Form("FMD preprocessor was %s", (success ? "successful" : "failed")));
 215   return (success ? 0 : 1);
 216 }
 217
 218 //____________________________________________________________________
 219 Bool_t
 220 AliFMDPreprocessor::GetInfoCalibration(TList* files,
 221                                        AliFMDCalibSampleRate*&      s,
 222                                        AliFMDCalibStripRange*&      r,
 223                                        AliFMDCalibZeroSuppression*& z)
 224 {
 225   // Get info calibrations.
 226   // Parameters:
 227   //     files List of files.
 228   //     s     On return, newly allocated object
 229   //     r     On return, newly allocated object
 230   //     z     On return, newly allocated object
 231   // Return:
 232   //     kTRUE on success
 233   if (!files) return kTRUE; // Should really be false
 234   if (files->GetEntries() <= 0) return kTRUE;
 235
 236   s = new AliFMDCalibSampleRate();
 237   r = new AliFMDCalibStripRange();
 238   z = new AliFMDCalibZeroSuppression();
 239
 240   // AliFMDParameters*    pars     = AliFMDParameters::Instance();
 241   TIter                iter(files);
 242   TObjString*          fileSource;
 243
 244   while((fileSource = dynamic_cast<TObjString*>(iter.Next()))) {
 245     const Char_t* filename = GetFile(kDAQ, "info", fileSource->GetName());
 246     std::ifstream in(filename);
 247     if(!in) {
 248       Log(Form("File %s not found!", filename));
 249       continue;
 250     }
 251   }
 252   return kTRUE;
 253 }
 254
 255
 256 //____________________________________________________________________
 257 AliFMDCalibPedestal*
 258 AliFMDPreprocessor::GetPedestalCalibration(TList* pedFiles)
 259 {
 260   // Read DAQ DA produced CSV files of pedestals, and return a
 261   // calibration object.
 262   // Parameters:
 263   //   pedFiles     List of pedestal files
 264   // Return
 265   //   A pointer to a newly allocated AliFMDCalibPedestal object, or
 266   //   null in case of errors.
 267   if(!pedFiles) return 0;
 268
 269   AliFMDCalibPedestal* calibPed = new AliFMDCalibPedestal();
 270   AliFMDParameters*    pars     = AliFMDParameters::Instance();
 271   TIter                iter(pedFiles);
 272   TObjString*          fileSource;
 273
 274   while((fileSource = dynamic_cast<TObjString*>(iter.Next()))) {
 275     const Char_t* filename = GetFile(kDAQ, "pedestals", fileSource->GetName());
 276     std::ifstream in(filename);
 277     if(!in) {
 278       Log(Form("File %s not found!", filename));
 279       continue;
 280     }
 281
 282     // Get header (how long is it ?)
 283     TString header;
 284     header.ReadLine(in);
 285     header.ToLower();
 286     if(!header.Contains("pedestal")) {
 287       Log("File header is not from pedestal!");
 288       continue;
 289     }
 290     Log("File contains data from pedestals");
 291
 292     // Read columns line
 293     int lineno = 2;
 294     header.ReadLine(in);
 295
 296     // Loop until EOF
 297     while(in.peek()!=EOF) {
 298       if(in.bad()) {
 299         Log(Form("Bad read at line %d in %s", lineno, filename));
 300         break;
 301       }
 302       UInt_t ddl=2, board, chip, channel, strip, sample, tb;
 303       Float_t ped, noise, mu, sigma, chi2ndf;
 304       Char_t c[11];
 305
 306       in >> ddl      >> c[0]
 307          >> board    >> c[1]
 308          >> chip     >> c[2]
 309          >> channel  >> c[3]
 310          >> strip    >> c[4]
 311          >> sample   >> c[5]
 312          >> tb       >> c[6]
 313          >> ped      >> c[7]
 314          >> noise    >> c[8]
 315          >> mu       >> c[9]
 316          >> sigma    >> c[10]
 317          >> chi2ndf;
 318       lineno++;
 319
 320       // Ignore trailing garbage
 321       if (strip > 127) continue;
 322
 323       //Setting DDL to comply with the FMD in DAQ
 324       UInt_t FmdDDLBase = 3072;
 325       ddl = ddl - FmdDDLBase;
 326       //Setting the pedestals via the hardware address
 327       UShort_t det, sec, str;
 328       Char_t ring;
 329
 330       pars->Hardware2Detector(ddl,board,chip,channel,det,ring,sec,str);
 331       strip += str;
 332
 333       calibPed->Set(det,ring,sec,strip,ped,noise);
 334
 335     }
 336   }
 337   return calibPed;
 338 }
 339
 340 //____________________________________________________________________
 341 AliFMDCalibGain*
 342 AliFMDPreprocessor::GetGainCalibration(TList* gainFiles)
 343 {
 344   // Read DAQ DA produced CSV files of pedestals, and return a
 345   // calibration object.
 346   // Parameters:
 347   //   pedFiles     List of pedestal files
 348   // Return
 349   //   A pointer to a newly allocated AliFMDCalibPedestal object, or
 350   //   null in case of errors.
 351   if(!gainFiles) return 0;
 352
 353   AliFMDCalibGain*  calibGain  = new AliFMDCalibGain();
 354   AliFMDParameters* pars       = AliFMDParameters::Instance();
 355   TIter             iter(gainFiles);
 356   TObjString*       fileSource;
 357   while((fileSource = dynamic_cast<TObjString *>(iter.Next()))) {
 358     const Char_t* filename = GetFile(kDAQ, "gains", fileSource->GetName());
 359     std::ifstream in(filename);
 360     if(!in) {
 361       Log(Form("File %s not found!", filename));
 362       continue;
 363     }
 364
 365     //Get header (how long is it ?)
 366     TString header;
 367     header.ReadLine(in);
 368     header.ToLower();
 369     if(!header.Contains("gain")) {
 370       Log("File header is not from gain!");
 371       continue;
 372     }
 373     Log("File contains data from pulse gain");
 374
 375     // Read column headers
 376     header.ReadLine(in);
 377
 378     int lineno  = 2;
 379     // Read until EOF
 380     while(in.peek()!=EOF) {
 381       if(in.bad()) {
 382         Log(Form("Bad read at line %d in %s", lineno, filename));
 383         break;
 384       }
 385       UInt_t ddl=2, board, chip, channel, strip;
 386       Float_t gain,error,  chi2ndf;
 387       Char_t c[7];
 388
 389       in >> ddl      >> c[0]
 390          >> board    >> c[1]
 391          >> chip     >> c[2]
 392          >> channel  >> c[3]
 393          >> strip    >> c[4]
 394          >> gain     >> c[5]
 395          >> error    >> c[6]
 396          >> chi2ndf;
 397       lineno++;
 398       // Ignore trailing garbage
 399       if(strip > 127) continue;
 400
 401       //Setting DDL to comply with the FMD in DAQ
 402       UInt_t FmdDDLBase = 3072;
 403       ddl = ddl - FmdDDLBase;
 404       //Setting the pedestals via the hardware address
 405       UShort_t det, sec, str;
 406       Char_t ring;
 407       pars->Hardware2Detector(ddl,board,chip,channel,det,ring,sec,str);
 408
 409       strip += str;
 410       calibGain->Set(det,ring,sec,strip,gain);
 411     }
 412   }
 413   return calibGain;
 414 }
 415
 416 //____________________________________________________________________
 417 //
 418 // EOF
 419 //