HLT/global/AliHLTGlobalEsdConverterComponent.cxx

   1 // $Id$
   2
   3 //**************************************************************************
   4 //* This file is property of and copyright by the ALICE HLT Project        *
   5 //* ALICE Experiment at CERN, All rights reserved.                         *
   6 //*                                                                        *
   7 //* Primary Authors: Matthias Richter <Matthias.Richter@ift.uib.no>        *
   8 //*                  for The ALICE HLT Project.                            *
   9 //*                                                                        *
  10 //* Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
  11 //* documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
  12 //* without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  13 //* copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  14 //* appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  15 //* about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  16 //* provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  17 //**************************************************************************
  18
  19 //  @file   AliHLTGlobalEsdConverterComponent.cxx
  20 //  @author Matthias Richter
  21 //  @date
  22 //  @brief  Global ESD converter component.
  23 //
  24
  25 // see header file for class documentation
  26 // or
  27 // refer to README to build package
  28 // or
  29 // visit http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt
  30
  31 #include <cassert>
  32 #include "AliHLTGlobalEsdConverterComponent.h"
  33 #include "AliHLTGlobalBarrelTrack.h"
  34 #include "AliHLTExternalTrackParam.h"
  35 #include "AliHLTTrackMCLabel.h"
  36 #include "AliHLTCTPData.h"
  37 #include "AliHLTErrorGuard.h"
  38 #include "AliESDEvent.h"
  39 #include "AliESDtrack.h"
  40 #include "AliESDMuonTrack.h"
  41 #include "AliESDMuonCluster.h"
  42 #include "AliCDBEntry.h"
  43 #include "AliCDBManager.h"
  44 #include "AliPID.h"
  45 #include "TTree.h"
  46 #include "TList.h"
  47 #include "TClonesArray.h"
  48 #include "TTimeStamp.h"
  49 #include "THnSparse.h"
  50 #include "AliHLTESDCaloClusterMaker.h"
  51 #include "AliHLTCaloClusterDataStruct.h"
  52 #include "AliHLTCaloClusterReader.h"
  53 #include "AliESDCaloCluster.h"
  54 #include "AliESDVZERO.h"
  55 #include "AliHLTGlobalVertexerComponent.h"
  56 #include "AliHLTVertexFinderBase.h"
  57
  58 /** ROOT macro for the implementation of ROOT specific class methods */
  59 ClassImp(AliHLTGlobalEsdConverterComponent)
  60
  61 AliHLTGlobalEsdConverterComponent::AliHLTGlobalEsdConverterComponent()
  62   : AliHLTProcessor()
  63   , fWriteTree(0)
  64   , fVerbosity(0)
  65   , fESD(NULL)
  66   , fSolenoidBz(-5.00668)
  67   , fBenchmark("EsdConverter")
  68   , fBenchmarkHistosFilename("$PWD/histosBenchmark.root")
  69   , fInitialTime(0)
  70 {
  71   // see header file for class documentation
  72   // or
  73   // refer to README to build package
  74   // or
  75   // visit http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt
  76
  77     TFile *f = TFile::Open(fBenchmarkHistosFilename,"READ");
  78   if(f!=0x0){
  79         TNamed *t = (TNamed*)f->Get("time");
  80         if(t!=0x0){
  81           fInitialTime = atoi(t->GetTitle());
  82         }
  83   }
  84
  85 }
  86
  87 AliHLTGlobalEsdConverterComponent::~AliHLTGlobalEsdConverterComponent()
  88 {
  89   // see header file for class documentation
  90   if (fESD) delete fESD;
  91   fESD=NULL;
  92 }
  93
  94 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::Configure(const char* arguments)
  95 {
  96   // see header file for class documentation
  97   int iResult=0;
  98   if (!arguments) return iResult;
  99
 100   TString allArgs=arguments;
 101   TString argument;
 102   int bMissingParam=0;
 103
 104   TObjArray* pTokens=allArgs.Tokenize(" ");
 105   if (pTokens) {
 106     for (int i=0; i<pTokens->GetEntries() && iResult>=0; i++) {
 107       argument=((TObjString*)pTokens->At(i))->String();
 108       if (argument.IsNull()) continue;
 109
 110       if (argument.CompareTo("-solenoidBz")==0) {
 111         if ((bMissingParam=(++i>=pTokens->GetEntries()))) break;
 112         HLTWarning("argument -solenoidBz is deprecated, magnetic field set up globally (%f)", GetBz());
 113         continue;
 114       } else {
 115         HLTError("unknown argument %s", argument.Data());
 116         iResult=-EINVAL;
 117         break;
 118       }
 119     }
 120     delete pTokens;
 121   }
 122   if (bMissingParam) {
 123     HLTError("missing parameter for argument %s", argument.Data());
 124     iResult=-EINVAL;
 125   }
 126
 127   return iResult;
 128 }
 129
 130 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::Reconfigure(const char* cdbEntry, const char* chainId)
 131 {
 132   // see header file for class documentation
 133   int iResult=0;
 134   const char* path=NULL;
 135   const char* defaultNotify="";
 136   if (cdbEntry) {
 137     path=cdbEntry;
 138     defaultNotify=" (default)";
 139   }
 140   if (path) {
 141     HLTInfo("reconfigure from entry %s%s, chain id %s", path, defaultNotify,(chainId!=NULL && chainId[0]!=0)?chainId:"<none>");
 142     AliCDBEntry *pEntry = AliCDBManager::Instance()->Get(path/*,GetRunNo()*/);
 143     if (pEntry) {
 144       TObjString* pString=dynamic_cast<TObjString*>(pEntry->GetObject());
 145       if (pString) {
 146         HLTInfo("received configuration object string: \'%s\'", pString->String().Data());
 147         iResult=Configure(pString->String().Data());
 148       } else {
 149         HLTError("configuration object \"%s\" has wrong type, required TObjString", path);
 150       }
 151     } else {
 152       HLTError("can not fetch object \"%s\" from CDB", path);
 153     }
 154   }
 155
 156   return iResult;
 157 }
 158
 159 void AliHLTGlobalEsdConverterComponent::GetInputDataTypes(AliHLTComponentDataTypeList& list)
 160 {
 161   // see header file for class documentation
 162   list.push_back(kAliHLTDataTypeTrack);
 163   list.push_back(kAliHLTDataTypeTrackMC);
 164   list.push_back(kAliHLTDataTypeCaloCluster);
 165   list.push_back(kAliHLTDataTypedEdx );
 166   list.push_back(kAliHLTDataTypeESDVertex );
 167   list.push_back(kAliHLTDataTypeESDObject);
 168   list.push_back(kAliHLTDataTypeTObject);
 169   list.push_back(kAliHLTDataTypeGlobalVertexer);
 170   list.push_back(kAliHLTDataTypeV0Finder); // array of track ids for V0s
 171   list.push_back(kAliHLTDataTypeKFVertex); // KFVertex object from vertexer
 172   list.push_back(kAliHLTDataTypePrimaryFinder); // array of track ids for prim vertex
 173   list.push_back(kAliHLTDataTypeESDContent);
 174 }
 175
 176 AliHLTComponentDataType AliHLTGlobalEsdConverterComponent::GetOutputDataType()
 177 {
 178   // see header file for class documentation
 179   return kAliHLTDataTypeESDObject|kAliHLTDataOriginOut;
 180 }
 181
 182 void AliHLTGlobalEsdConverterComponent::GetOutputDataSize(unsigned long& constBase, double& inputMultiplier)
 183 {
 184   // see header file for class documentation
 185   constBase=2000000;
 186   inputMultiplier=10.0;
 187 }
 188
 189 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::DoInit(int argc, const char** argv)
 190 {
 191   // see header file for class documentation
 192   int iResult=0;
 193   TString argument="";
 194   int bMissingParam=0;
 195
 196   // default list of skiped ESD objects
 197   TString skipObjects=
 198     // "AliESDRun,"
 199     // "AliESDHeader,"
 200     // "AliESDZDC,"
 201     "AliESDFMD,"
 202     // "AliESDVZERO,"
 203     // "AliESDTZERO,"
 204     // "TPCVertex,"
 205     // "SPDVertex,"
 206     // "PrimaryVertex,"
 207     // "AliMultiplicity,"
 208     // "PHOSTrigger,"
 209     // "EMCALTrigger,"
 210     // "SPDPileupVertices,"
 211     // "TrkPileupVertices,"
 212     "Cascades,"
 213     "Kinks,"
 214     "AliRawDataErrorLogs,"
 215     "AliESDACORDE";
 216
 217   iResult=Reconfigure(NULL, NULL);
 218   TString allArgs = "";
 219   for ( int i = 0; i < argc; i++ ) {
 220     if ( !allArgs.IsNull() ) allArgs += " ";
 221     allArgs += argv[i];
 222   }
 223
 224   TObjArray* pTokens=allArgs.Tokenize(" ");
 225   if (pTokens) {
 226     for (int i=0; i<pTokens->GetEntries() && iResult>=0; i++) {
 227       argument=((TObjString*)pTokens->At(i))->String();
 228       if (argument.IsNull()) continue;
 229
 230       // -notree
 231       if (argument.CompareTo("-notree")==0) {
 232         fWriteTree=0;
 233
 234         // -tree
 235       } else if (argument.CompareTo("-tree")==0) {
 236         fWriteTree=1;
 237       } else if (argument.CompareTo("-solenoidBz")==0) {
 238         if ((bMissingParam=(++i>=pTokens->GetEntries()))) break;
 239         HLTInfo("Magnetic Field set to: %s", ((TObjString*)pTokens->At(i))->String().Data());
 240         HLTWarning("argument '-solenoidBz' is deprecated, solenoid field initiaized from CDB settings");
 241         continue;
 242       } else if (argument.Contains("-skipobject=")) {
 243         argument.ReplaceAll("-skipobject=", "");
 244         skipObjects=argument;
 245       } else {
 246         HLTError("unknown argument %s", argument.Data());
 247         iResult=-EINVAL;
 248         break;
 249       }
 250     }
 251   }
 252   if (bMissingParam) {
 253     HLTError("missing parameter for argument %s", argument.Data());
 254     iResult=-EINVAL;
 255   }
 256
 257   fSolenoidBz=GetBz();
 258
 259   if (iResult>=0) {
 260     fESD = new AliESDEvent;
 261     if (fESD) {
 262       fESD->CreateStdContent();
 263
 264       // remove some of the objects which are not needed
 265       if (fESD->GetList() && !skipObjects.IsNull()) {
 266         pTokens=skipObjects.Tokenize(",");
 267         if (pTokens) {
 268           const char* id=NULL;
 269           TIter next(pTokens);
 270           TObject* pObject=NULL;
 271           while ((pObject=next())!=NULL) {
 272             id=((TObjString*)pObject)->String().Data();
 273             TObject* pObj=fESD->GetList()->FindObject(id);
 274             if (pObj) {
 275               HLTDebug("removing object %s", id);
 276               fESD->GetList()->Remove(pObj);
 277               delete pObj;
 278             } else {
 279               HLTWarning("failed to remove object '%s' from ESD", id);
 280             }
 281           }
 282           fESD->GetStdContent();
 283           delete pTokens;
 284         }
 285       }
 286     } else {
 287       iResult=-ENOMEM;
 288     }
 289
 290     SetupCTPData();
 291   }
 292
 293   fBenchmark.SetTimer(0,"total");
 294
 295   return iResult;
 296 }
 297
 298 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::DoDeinit()
 299 {
 300   // see header file for class documentation
 301   if (fESD) delete fESD;
 302   fESD=NULL;
 303
 304   return 0;
 305 }
 306
 307 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::DoEvent(const AliHLTComponentEventData& /*evtData*/,
 308                                                AliHLTComponentTriggerData& trigData)
 309 {
 310   // see header file for class documentation
 311   int iResult=0;
 312   bool benchmark = true;
 313   if (!fESD) return -ENODEV;
 314
 315   if (!IsDataEvent()) return iResult;
 316   fBenchmark.StartNewEvent();
 317   fBenchmark.Start(0);
 318
 319   AliESDEvent* pESD = fESD;
 320
 321   pESD->Reset();
 322   pESD->SetMagneticField(fSolenoidBz);
 323   pESD->SetRunNumber(GetRunNo());
 324   pESD->SetPeriodNumber(GetPeriodNumber());
 325   pESD->SetOrbitNumber(GetOrbitNumber());
 326   pESD->SetBunchCrossNumber(GetBunchCrossNumber());
 327   pESD->SetTimeStamp(GetTimeStamp());
 328
 329   const AliHLTCTPData* pCTPData=CTPData();
 330   if (pCTPData) {
 331     AliHLTTriggerMask_t mask=pCTPData->ActiveTriggers(trigData);
 332     for (int index=0; index<gkNCTPTriggerClasses; index++) {
 333       if ((mask&(AliHLTTriggerMask_t(0x1)<<index)) == 0) continue;
 334       pESD->SetTriggerClass(pCTPData->Name(index), index);
 335     }
 336     //first 50 triggers
 337     AliHLTTriggerMask_t mask50;
 338     mask50.set(); // set all bits
 339     mask50 >>= 50; // shift 50 right
 340     pESD->SetTriggerMask((mask&mask50).to_ulong());
 341     //next 50
 342     pESD->SetTriggerMaskNext50((mask>>50).to_ulong());
 343   }
 344
 345   TTree* pTree = NULL;
 346   if (fWriteTree)
 347     pTree = new TTree("esdTree", "Tree with HLT ESD objects");
 348
 349   if (pTree) {
 350     pTree->SetDirectory(0);
 351   }
 352
 353   if ((iResult=ProcessBlocks(pTree, pESD))>=0) {
 354     // TODO: set the specification correctly
 355     if (pTree) {
 356       // the esd structure is written to the user info and is
 357       // needed in te ReadFromTree method to read all objects correctly
 358       pTree->GetUserInfo()->Add(pESD);
 359       pESD->WriteToTree(pTree);
 360       iResult=PushBack(pTree, kAliHLTDataTypeESDTree|kAliHLTDataOriginOut, 0);
 361     } else {
 362       iResult=PushBack(pESD, kAliHLTDataTypeESDObject|kAliHLTDataOriginOut, 0);
 363     }
 364     fBenchmark.AddOutput(GetLastObjectSize());
 365   }
 366   if (pTree) {
 367     // clear user info list to prevent objects from being deleted
 368     pTree->GetUserInfo()->Clear();
 369     delete pTree;
 370   }
 371
 372   fBenchmark.Stop(0);
 373   HLTWarning( fBenchmark.GetStatistics() );
 374
 375
 376
 377
 378
 379
 380     if(benchmark){
 381
 382         TTimeStamp ts;
 383         Double_t time = (Double_t) ts.GetSec() - fInitialTime;
 384         Int_t nV0s = pESD->GetNumberOfV0s();
 385         Int_t nTracks = pESD->GetNumberOfTracks();
 386
 387
 388         Double_t statistics[10];
 389         TString names[10];
 390         fBenchmark.GetStatisticsData(statistics, names);
 391           statistics[5] = nTracks;
 392           statistics[6] = time;
 393           statistics[7] = nV0s;
 394
 395           FillBenchmarkHistos( statistics, names);
 396   printf("\nTIME:  %.9f \n\n",time);
 397           fBenchmark.Reset();
 398
 399   }
 400
 401
 402
 403
 404
 405   return iResult;
 406 }
 407
 408 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::ProcessBlocks(TTree* pTree, AliESDEvent* pESD)
 409 {
 410   // see header file for class documentation
 411
 412   int iResult=0;
 413   int iAddedDataBlocks=0;
 414
 415   // check if there is an ESD block in the input and copy its content first to the
 416   // ESD
 417   const TObject* pEsdObj = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDObject, "AliESDEvent");
 418   AliESDEvent* pInputESD=NULL;
 419   if (pEsdObj) pInputESD=dynamic_cast<AliESDEvent*>(const_cast<TObject*>(pEsdObj));
 420   if (pInputESD) {
 421     pInputESD->GetStdContent();
 422     *pESD=*pInputESD;
 423   }
 424   if (GetNextInputObject()!=NULL) {
 425     HLTWarning("handling of multiple ESD input objects not implemented, skipping input");
 426   }
 427
 428   // Barrel tracking
 429   // tracks are based on the TPC tracks, and only updated from the ITS information
 430   // Sequence:
 431   // 1) extract MC information for TPC and ITS from specific data blocks and store in
 432   //    intermediate vector arrays
 433   // 2) extract TPC tracks, update with MC labels if available, the track parameters
 434   //    are estimated at the first cluster position
 435   // 2.1) propagate to last cluster position and update kTPCout, sets also outer param (fOp)
 436   // 2.2) update kTPCin, sets also inner param (fIp) and TPC inner param (fTPCInner)
 437   // 2.3) update kTPCrefit using the same parameters at the first cluster position
 438   //      HLT has strictly spoking no refit, but we want the flag to be set
 439   //      can be changed to be done after all the individual barrel detector parameters
 440   //      have been updated by looping over the tracks again
 441   // 3) extract ITS tracks, the tracks are actually TPC tracks updated from the ITS
 442   //    tracking information
 443   // 3.1) TODO 2010-07-12: handle ITS standalone tracks by updating kITSout before kITSin
 444   // 3.2) update with kITSin
 445   //    TODO 2010-07-12 find out if the kITSrefit has to be set as well
 446   // 4) extract TRD tracks and add to ESD
 447   //    TODO 2010-07-12 at the moment there is no matching or merging of TPC and TRD tracks
 448   // 5) Add Trigger Detectors
 449   //    VZERO, ZDC
 450
 451   // 1) first read MC information (if present)
 452   std::map<int,int> mcLabelsTPC;
 453   std::map<int,int> mcLabelsITS;
 454
 455   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrackMC|kAliHLTDataOriginTPC);
 456        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 457
 458     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 459
 460     AliHLTTrackMCData* dataPtr = reinterpret_cast<AliHLTTrackMCData*>( pBlock->fPtr );
 461     if (sizeof(AliHLTTrackMCData)+dataPtr->fCount*sizeof(AliHLTTrackMCLabel)==pBlock->fSize) {
 462       for( unsigned int il=0; il<dataPtr->fCount; il++ ){
 463         AliHLTTrackMCLabel &lab = dataPtr->fLabels[il];
 464         mcLabelsTPC[lab.fTrackID] = lab.fMCLabel;
 465       }
 466     } else {
 467       HLTWarning("data mismatch in block %s (0x%08x): count %d, size %d -> ignoring track MC information",
 468                  DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification,
 469                  dataPtr->fCount, pBlock->fSize);
 470     }
 471   }
 472
 473   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrackMC|kAliHLTDataOriginITS);
 474        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 475
 476     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 477
 478     AliHLTTrackMCData* dataPtr = reinterpret_cast<AliHLTTrackMCData*>( pBlock->fPtr );
 479     if (sizeof(AliHLTTrackMCData)+dataPtr->fCount*sizeof(AliHLTTrackMCLabel)==pBlock->fSize) {
 480       for( unsigned int il=0; il<dataPtr->fCount; il++ ){
 481         AliHLTTrackMCLabel &lab = dataPtr->fLabels[il];
 482         mcLabelsITS[lab.fTrackID] = lab.fMCLabel;
 483       }
 484     } else {
 485       HLTWarning("data mismatch in block %s (0x%08x): count %d, size %d -> ignoring track MC information",
 486                  DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification,
 487                  dataPtr->fCount, pBlock->fSize);
 488     }
 489   }
 490
 491
 492   // read dEdx information (if present)
 493   // TODO 2010-07-12 this needs to be verified
 494
 495   AliHLTFloat32_t *dEdxTPC = 0;
 496   Int_t ndEdxTPC = 0;
 497   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypedEdx|kAliHLTDataOriginTPC);
 498        pBlock!=NULL; pBlock=NULL/*GetNextInputBlock() there is only one block*/) {
 499     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 500     dEdxTPC = reinterpret_cast<AliHLTFloat32_t*>( pBlock->fPtr );
 501     ndEdxTPC = pBlock->fSize / (3*sizeof(AliHLTFloat32_t));
 502   }
 503
 504   // 2) convert the TPC tracks to ESD tracks
 505   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack|kAliHLTDataOriginTPC);
 506        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 507     if (pInputESD && pInputESD->GetNumberOfTracks()>0) {
 508       HLTWarning("Tracks array already filled from the input esd block, additional filling from TPC tracks block might cause inconsistent content");
 509     }
 510     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 511     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
 512     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>=0) {
 513       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
 514            element!=tracks.end(); element++) {
 515         Float_t points[4] = {
 516           static_cast<Float_t>(element->GetX()),
 517           static_cast<Float_t>(element->GetY()),
 518           static_cast<Float_t>(element->GetLastPointX()),
 519           static_cast<Float_t>(element->GetLastPointY())
 520         };
 521
 522         Int_t mcLabel = -1;
 523         if( mcLabelsTPC.find(element->TrackID())!=mcLabelsTPC.end() )
 524           mcLabel = mcLabelsTPC[element->TrackID()];
 525         element->SetLabel( mcLabel );
 526
 527         AliESDtrack iotrack;
 528
 529         // for the moment, the number of clusters are not set when processing the
 530         // kTPCin update, only at kTPCout
 531         // there ar emainly three parameters updated for kTPCout
 532         //   number of clusters
 533         //   chi2
 534         //   pid signal
 535         // The first one can be updated already at that stage here, while the two others
 536         // eventually require to update from the ITS tracks before. The exact scheme
 537         // needs to be checked
 538         iotrack.SetID( element->TrackID() );
 539
 540         // 2.1 set kTPCout
 541         // TODO 2010-07-12 disabled for the moment because of bug
 542         // https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69875
 543         // the propagation does not work, there is an offset in z
 544         // propagate to last cluster and update parameters with flag kTPCout
 545         // Note: updating with flag kITSout further down will overwrite the outer
 546         // parameter again so this can be done only for ITS standalone tracks, meaning
 547         // tracks in the ITS not associated with any TPC track
 548         // HLT does not provide such standalone tracking
 549         {
 550           AliHLTGlobalBarrelTrack outPar(*element);
 551           //outPar.AliExternalTrackParam::PropagateTo( element->GetLastPointX(), fSolenoidBz );
 552           const Int_t N=10; // number of steps.
 553           const Float_t xRange = element->GetLastPointX() - element->GetX();
 554           const Float_t xStep = xRange / N ;
 555           for(int i = 1; i <= N; ++i) {
 556             if(!outPar.AliExternalTrackParam::PropagateTo(element->GetX() + xStep * i, fSolenoidBz)) break;
 557           }
 558           outPar.SetLabel(element->GetLabel());
 559           iotrack.UpdateTrackParams(&outPar,AliESDtrack::kTPCout);
 560         }
 561         // 2.2 TPC tracking estimates parameters at first cluster
 562         iotrack.UpdateTrackParams(&(*element),AliESDtrack::kTPCin);
 563
 564         // 2.3 use the same parameters also for kTPCrefit, there is no proper refit in HLT
 565         // maybe this can be done later, however also the inner parameter is changed which
 566         // is used as a reference point in the display. That point should be at the first
 567         // TPC cluster
 568         iotrack.UpdateTrackParams(&(*element),AliESDtrack::kTPCrefit);
 569         iotrack.SetTPCPoints(points);
 570         if( element->TrackID()<ndEdxTPC ){
 571           AliHLTFloat32_t *val = &(dEdxTPC[3*element->TrackID()]);
 572           iotrack.SetTPCsignal( val[0], val[1], (UChar_t) val[2] );
 573           //AliTPCseed s;
 574           //s.Set( element->GetX(), element->GetAlpha(),
 575           //element->GetParameter(), element->GetCovariance() );
 576           //s.SetdEdx( val[0] );
 577           //s.CookPID();
 578           //iotrack.SetTPCpid(s.TPCrPIDs() );
 579         } else {
 580           if( dEdxTPC ) HLTWarning("Wrong number of dEdx TPC labels");
 581         }
 582         iotrack.SetLabel(mcLabel);
 583         pESD->AddTrack(&iotrack);
 584         if (fVerbosity>0) element->Print();
 585       }
 586       HLTInfo("converted %d track(s) to AliESDtrack and added to ESD", tracks.size());
 587       iAddedDataBlocks++;
 588     } else if (iResult<0) {
 589       HLTError("can not extract tracks from data block of type %s (specification %08x) of size %d: error %d",
 590                DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification, pBlock->fSize, iResult);
 591     }
 592   }
 593
 594
 595   // Get ITS SPD vertex
 596   for( const AliHLTComponentBlockData *i= GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeESDVertex|kAliHLTDataOriginITS); i!=NULL; i=GetNextInputBlock() ){
 597     fBenchmark.AddInput(i->fSize);
 598   }
 599
 600   for ( const TObject *iter = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDVertex|kAliHLTDataOriginITS); iter != NULL; iter = GetNextInputObject() ) {
 601     AliESDVertex *vtx = dynamic_cast<AliESDVertex*>(const_cast<TObject*>( iter ) );
 602     pESD->SetPrimaryVertexSPD( vtx );
 603   }
 604
 605   // 3.1. now update ESD tracks with the ITSOut info
 606   // updating track parameters with flag kITSout will overwrite parameter set above with flag kTPCout
 607   // TODO 2010-07-12 there are some issues with this updating sequence, for the moment update with
 608   // flag kITSout is disabled, would require
 609   // a) to update kTPCout after kITSout
 610   // b) update only for ITS standalone tracks. The HLT ITS tracker does not provide standalone
 611   //    tracking, every track is related to a TPC track
 612   // Furthermore there seems to be a bug as the data blocks describe track parameters around the
 613   // vertex, not at the outer ITS
 614   // bug https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69872
 615   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack|kAliHLTDataOriginITSOut);
 616        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 617     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 618     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
 619     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>0) {
 620       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
 621            element!=tracks.end(); element++) {
 622         int tpcID=element->TrackID();
 623         // the ITS tracker assigns the TPC track used as seed for a certain track to
 624         // the trackID
 625         if( tpcID<0 || tpcID>=pESD->GetNumberOfTracks()) continue;
 626         AliESDtrack *tESD = pESD->GetTrack( tpcID );
 627         element->SetLabel(tESD->GetLabel());
 628         // 2010-07-12 disabled, see above, bugfix https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69872
 629         //if( tESD ) tESD->UpdateTrackParams( &(*element), AliESDtrack::kITSout );
 630       }
 631     }
 632   }
 633
 634   // 3.2. now update ESD tracks with the ITS info
 635   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack|kAliHLTDataOriginITS);
 636        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 637     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 638     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
 639     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>0) {
 640       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
 641            element!=tracks.end(); element++) {
 642         int tpcID=element->TrackID();
 643         // the ITS tracker assigns the TPC track used as seed for a certain track to
 644         // the trackID
 645         if( tpcID<0 || tpcID>=pESD->GetNumberOfTracks()) continue;
 646         Int_t mcLabel = -1;
 647         if( mcLabelsITS.find(element->TrackID())!=mcLabelsITS.end() )
 648           mcLabel = mcLabelsITS[element->TrackID()];
 649         AliESDtrack *tESD = pESD->GetTrack( tpcID );
 650         if (!tESD) continue;
 651         // the labels for the TPC and ITS tracking params can be different, e.g.
 652         // there can be a decay. The ITS label should then be the better one, the
 653         // TPC label is saved in a member of AliESDtrack
 654         if (mcLabel>=0) {
 655           // upadte only if the ITS label is available, otherwise keep TPC label
 656           element->SetLabel( mcLabel );
 657         } else {
 658           // bugfix https://savannah.cern.ch/bugs/?69713
 659           element->SetLabel( tESD->GetLabel() );
 660         }
 661         tESD->UpdateTrackParams( &(*element), AliESDtrack::kITSin );
 662
 663         // TODO: add a proper refit
 664         //tESD->UpdateTrackParams( &(*element), AliESDtrack::kTPCrefit );
 665       }
 666     }
 667   }
 668
 669   // update with  vertices and vertex-fitted tracks
 670   // output of the GlobalVertexerComponent
 671   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeGlobalVertexer);
 672        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 673     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 674     AliHLTGlobalVertexerComponent::FillESD( pESD, reinterpret_cast<AliHLTGlobalVertexerComponent::AliHLTGlobalVertexerData* >(pBlock->fPtr) );
 675   }
 676
 677   // update with  vertices and vertex-fitted tracks
 678   // output of PrimaryVertexer and V0Finder components
 679
 680   TObject* pBase = (TObject*)GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeKFVertex | kAliHLTDataOriginOut);
 681   if (pBase) {
 682     AliKFVertex* kfVertex = dynamic_cast<AliKFVertex *>(pBase);
 683     if (kfVertex) {
 684       const AliHLTComponentBlockData* pP = GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypePrimaryFinder | kAliHLTDataOriginOut);
 685       if (pP && pP->fSize && pP->fPtr) {
 686         const AliHLTComponentBlockData* pV0 = GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeV0Finder | kAliHLTDataOriginOut);
 687         if (pV0 && pV0->fPtr && pInputESD && pInputESD->GetNumberOfV0s()>0) {
 688           const int* v0s = static_cast<const int*>(pV0->fPtr);
 689           HLTWarning("V0 array already filled from the input esd block, additional filling from V0 block of %d entries might cause inconsistent content", v0s[0]);
 690         }
 691         AliHLTVertexFinderBase::FillESD(pESD, kfVertex, pP->fPtr, pV0?pV0->fPtr:NULL);
 692       } else
 693         HLTWarning("Problem with primary finder's data block");
 694     } else {
 695       HLTWarning("primary vertex block of wrong type, expecting AliKFVertex instead of %s", pBase->GetName());
 696     }
 697   } else {
 698     // throw an error if there is a V0 data block which can not be handled without
 699     // the AliKFVertex object
 700     if (GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeV0Finder | kAliHLTDataOriginOut)!=NULL) {
 701       ALIHLTERRORGUARD(1, "missing AliKFVertex object ignoring V0 data block of type %s",
 702                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeV0Finder|kAliHLTDataOriginOut).c_str());
 703     }
 704   }
 705
 706   // Fill DCA parameters for TPC tracks
 707   // TODO 2010-07-12 this propagates also the TPC inner param to beamline
 708   // sounds not very reasonable
 709   // https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69873
 710   for (int i=0; i<pESD->GetNumberOfTracks(); i++) {
 711     if (!pESD->GetTrack(i) ||
 712         !pESD->GetTrack(i)->GetTPCInnerParam() ) continue;
 713     pESD->GetTrack(i)->RelateToVertexTPC(pESD->GetPrimaryVertexTracks(), fSolenoidBz, 1000 );
 714   }
 715
 716   // loop over all tracks and set the TPC refit flag by updating with the
 717   // original TPC inner parameter if not yet set
 718   // TODO: replace this by a proper refit
 719   // code is comented for the moment as it does not fully solve the problems with
 720   // the display
 721   // - would set the main parameters to the TPC inner wall again, or
 722   // - changes the inner param if the parameters are propagated, so we loose the track
 723   //   reference point for the display
 724   // with the current sequence we have the latter case as the DCA operations above
 725   // change the TPC inner parameters
 726   /*
 727   for (int i=0; i<pESD->GetNumberOfTracks(); i++) {
 728     if (!pESD->GetTrack(i) ||
 729         !pESD->GetTrack(i)->GetTPCInnerParam() ||
 730         pESD->GetTrack(i)->IsOn(AliESDtrack::kTPCrefit)) continue;
 731     AliESDtrack* tESD=pESD->GetTrack(i);
 732     AliHLTGlobalBarrelTrack inner(*tESD->GetTPCInnerParam());
 733     inner.SetLabel(tESD->GetLabel());
 734     tESD->UpdateTrackParams(&inner, AliESDtrack::kTPCrefit);
 735   }
 736   */
 737
 738   // 4. convert the HLT TRD tracks to ESD tracks
 739   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack | kAliHLTDataOriginTRD);
 740        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 741     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 742     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
 743     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>0) {
 744       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
 745            element!=tracks.end(); element++) {
 746
 747         Double_t TRDpid[AliPID::kSPECIES], eProb(0.2), restProb((1-eProb)/(AliPID::kSPECIES-1)); //eprob(element->GetTRDpid...);
 748         for(Int_t i=0; i<AliPID::kSPECIES; i++){
 749           switch(i){
 750           case AliPID::kElectron: TRDpid[AliPID::kElectron]=eProb; break;
 751           default: TRDpid[i]=restProb; break;
 752           }
 753         }
 754
 755         AliESDtrack iotrack;
 756         iotrack.UpdateTrackParams(&(*element),AliESDtrack::kTRDout);
 757         iotrack.SetStatus(AliESDtrack::kTRDin);
 758         iotrack.SetTRDpid(TRDpid);
 759
 760         pESD->AddTrack(&iotrack);
 761         if (fVerbosity>0) element->Print();
 762       }
 763       HLTInfo("converted %d track(s) to AliESDtrack and added to ESD", tracks.size());
 764       iAddedDataBlocks++;
 765     } else if (iResult<0) {
 766       HLTError("can not extract tracks from data block of type %s (specification %08x) of size %d: error %d",
 767                DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification, pBlock->fSize, iResult);
 768     }
 769   }
 770   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeCaloCluster | kAliHLTDataOriginAny); pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock())
 771     {
 772       fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 773       AliHLTCaloClusterHeaderStruct *caloClusterHeaderPtr = reinterpret_cast<AliHLTCaloClusterHeaderStruct*>(pBlock->fPtr);
 774
 775       HLTDebug("%d HLT clusters from spec: 0x%X", caloClusterHeaderPtr->fNClusters, pBlock->fSpecification);
 776
 777       //AliHLTCaloClusterReader reader;
 778       //reader.SetMemory(caloClusterHeaderPtr);
 779
 780       AliHLTESDCaloClusterMaker clusterMaker;
 781
 782       int nClusters = clusterMaker.FillESD(pESD, caloClusterHeaderPtr);
 783
 784       HLTInfo("converted %d cluster(s) to AliESDCaloCluster and added to ESD", nClusters);
 785       iAddedDataBlocks++;
 786     }
 787
 788   // 5) Add Trigger Detectors
 789   //    VZERO, ZDC
 790
 791   // FIXME: the size of all input blocks can be added in one loop
 792   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginVZERO);
 793        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 794     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 795   }
 796
 797   for ( const TObject *pObject = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginVZERO);
 798         pObject != NULL; pObject = GetNextInputObject() ) {
 799     AliESDVZERO *esdVZERO = dynamic_cast<AliESDVZERO*>(const_cast<TObject*>( pObject ) );
 800     if (esdVZERO) {
 801       pESD->SetVZEROData( esdVZERO );
 802       break;
 803     } else {
 804       ALIHLTERRORGUARD(1, "input object of data type %s is not of class AliESDVZERO",
 805                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginVZERO).c_str());
 806     }
 807   }
 808
 809   // FIXME: the size of all input blocks can be added in one loop
 810   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC);
 811        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 812     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 813   }
 814   for ( const TObject *pObject = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC);
 815         pObject != NULL; pObject = GetNextInputObject() ) {
 816     AliESDZDC *esdZDC = dynamic_cast<AliESDZDC*>(const_cast<TObject*>( pObject ) );
 817     if (esdZDC) {
 818 #ifndef HAVE_NOT_ALIZDCRECONSTRUCTOR_r43770
 819       pESD->SetZDCData( esdZDC );
 820 #else
 821       ALIHLTERRORGUARD(1, "Processing of ZDC data requires AliRoot r43770m skipping data block of type %s",
 822                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC).c_str());
 823 #endif
 824       break;
 825     } else {
 826       ALIHLTERRORGUARD(1, "input object of data type %s is not of class AliESDZDC",
 827                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC).c_str());
 828     }
 829   }
 830
 831   // Add tracks and clusters from MUON.
 832   for( const AliHLTComponentBlockData *i= GetFirstInputBlock(kAliHLTAnyDataType | kAliHLTDataOriginMUON); i!=NULL; i=GetNextInputBlock() ){
 833     fBenchmark.AddInput(i->fSize);
 834   }
 835
 836   for (const TObject* obj = GetFirstInputObject(kAliHLTAnyDataType | kAliHLTDataOriginMUON);
 837        obj != NULL;
 838        obj = GetNextInputObject()
 839       )
 840   {
 841     const TClonesArray* tracklist = NULL;
 842     const TClonesArray* clusterlist = NULL;
 843     if (obj->IsA() == AliESDEvent::Class())
 844     {
 845       const AliESDEvent* event = static_cast<const AliESDEvent*>(obj);
 846       HLTDebug("Received a MUON ESD with specification: 0x%X", GetSpecification(obj));
 847       if (event->GetList() == NULL) continue;
 848       tracklist = dynamic_cast<const TClonesArray*>(event->GetList()->FindObject("MuonTracks"));
 849       if (tracklist == NULL) continue;
 850       clusterlist = dynamic_cast<const TClonesArray*>(event->GetList()->FindObject("MuonClusters"));
 851       if (clusterlist == NULL) continue;
 852     }
 853     else if (obj->IsA() == TClonesArray::Class())
 854     {
 855       if (!strcmp(obj->GetName(), "MuonTracks")) {
 856         tracklist = static_cast<const TClonesArray*>(obj);
 857         HLTDebug("Received a MUON TClonesArray of tracks with specification: 0x%X", GetSpecification(obj));
 858       } else {
 859         clusterlist = static_cast<const TClonesArray*>(obj);
 860         HLTDebug("Received a MUON TClonesArray of clusters with specification: 0x%X", GetSpecification(obj));
 861       }
 862     }
 863     else
 864     {
 865       // Cannot handle this object type.
 866       continue;
 867     }
 868     // copy tracks
 869     if (tracklist) {
 870       HLTDebug("Received %d MUON tracks.", tracklist->GetEntriesFast());
 871       if (tracklist->GetEntriesFast() > 0)
 872       {
 873         const AliESDMuonTrack* track = dynamic_cast<const AliESDMuonTrack*>(tracklist->UncheckedAt(0));
 874         if (track == NULL)
 875         {
 876           HLTError(Form("%s from MUON does not contain AliESDMuonTrack objects.", obj->ClassName()));
 877           continue;
 878         }
 879       }
 880       for (Int_t i = 0; i < tracklist->GetEntriesFast(); ++i)
 881       {
 882         AliESDMuonTrack* track = pESD->NewMuonTrack();
 883         *track = *(static_cast<const AliESDMuonTrack*>(tracklist->UncheckedAt(i)));
 884       }
 885     }
 886     // copy clusters
 887     if (clusterlist) {
 888       HLTDebug("Received %d MUON clusters.", clusterlist->GetEntriesFast());
 889       if (clusterlist->GetEntriesFast() > 0)
 890       {
 891         const AliESDMuonCluster* cluster = dynamic_cast<const AliESDMuonCluster*>(clusterlist->UncheckedAt(0));
 892         if (cluster == NULL)
 893         {
 894           HLTError(Form("%s from MUON does not contain AliESDMuonCluster objects.", obj->ClassName()));
 895           continue;
 896         }
 897       }
 898       for (Int_t i = 0; i < clusterlist->GetEntriesFast(); ++i)
 899       {
 900         AliESDMuonCluster* cluster = pESD->NewMuonCluster();
 901         *cluster = *(static_cast<const AliESDMuonCluster*>(clusterlist->UncheckedAt(i)));
 902       }
 903     }
 904   }
 905
 906   if (iAddedDataBlocks>0 && pTree) {
 907     pTree->Fill();
 908   }
 909
 910
 911
 912
 913   if (iResult>=0) iResult=iAddedDataBlocks;
 914   return iResult;
 915 }
 916
 917
 918
 919
 920 void AliHLTGlobalEsdConverterComponent::FillBenchmarkHistos(Double_t *statistics, TString */*names*/){
 921
 922
 923 //  cout<<"Now writing benchmarks to " <<  fBenchmarkHistosFilename <<endl<<endl;
 924
 925   TFile *f = TFile::Open(fBenchmarkHistosFilename,"UPDATE");
 926   THnSparseD *s = (THnSparseD*)f->Get("benchmarkInformation");
 927   TNamed *t = (TNamed*)f->Get("time");
 928
 929   if(!s){
 930         HLTWarning( "Benchmark Histograms not available!" );
 931         return;
 932   }
 933   s->Fill(statistics);
 934
 935   TList histosList;
 936   histosList.Add(s);
 937   histosList.Add(t);
 938   histosList.SaveAs(fBenchmarkHistosFilename);
 939
 940 }