HLT/global/AliHLTGlobalEsdConverterComponent.cxx

   1 // $Id$
   2
   3 //**************************************************************************
   4 //* This file is property of and copyright by the ALICE HLT Project        *
   5 //* ALICE Experiment at CERN, All rights reserved.                         *
   6 //*                                                                        *
   7 //* Primary Authors: Matthias Richter <Matthias.Richter@ift.uib.no>        *
   8 //*                  for The ALICE HLT Project.                            *
   9 //*                                                                        *
  10 //* Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
  11 //* documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
  12 //* without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  13 //* copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  14 //* appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  15 //* about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  16 //* provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  17 //**************************************************************************
  18
  19 //  @file   AliHLTGlobalEsdConverterComponent.cxx
  20 //  @author Matthias Richter
  21 //  @date
  22 //  @brief  Global ESD converter component.
  23 //
  24
  25 // see header file for class documentation
  26 // or
  27 // refer to README to build package
  28 // or
  29 // visit http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt
  30
  31 #include <cassert>
  32 #include "AliHLTGlobalEsdConverterComponent.h"
  33 #include "AliHLTGlobalBarrelTrack.h"
  34 #include "AliHLTExternalTrackParam.h"
  35 #include "AliHLTTrackMCLabel.h"
  36 #include "AliHLTCTPData.h"
  37 #include "AliHLTErrorGuard.h"
  38 #include "AliESDEvent.h"
  39 #include "AliESDtrack.h"
  40 #include "AliESDMuonTrack.h"
  41 #include "AliESDMuonCluster.h"
  42 #include "AliCDBEntry.h"
  43 #include "AliCDBManager.h"
  44 #include "AliPID.h"
  45 #include "TTree.h"
  46 #include "TList.h"
  47 #include "TClonesArray.h"
  48 #include "AliHLTESDCaloClusterMaker.h"
  49 #include "AliHLTCaloClusterDataStruct.h"
  50 #include "AliHLTCaloClusterReader.h"
  51 #include "AliESDCaloCluster.h"
  52 #include "AliESDVZERO.h"
  53 #include "AliHLTGlobalVertexerComponent.h"
  54 #include "AliHLTVertexFinderBase.h"
  55
  56 /** ROOT macro for the implementation of ROOT specific class methods */
  57 ClassImp(AliHLTGlobalEsdConverterComponent)
  58
  59 AliHLTGlobalEsdConverterComponent::AliHLTGlobalEsdConverterComponent()
  60   : AliHLTProcessor()
  61   , fWriteTree(0)
  62   , fVerbosity(0)
  63   , fESD(NULL)
  64   , fSolenoidBz(-5.00668)
  65   , fBenchmark("EsdConverter")
  66 {
  67   // see header file for class documentation
  68   // or
  69   // refer to README to build package
  70   // or
  71   // visit http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt
  72 }
  73
  74 AliHLTGlobalEsdConverterComponent::~AliHLTGlobalEsdConverterComponent()
  75 {
  76   // see header file for class documentation
  77   if (fESD) delete fESD;
  78   fESD=NULL;
  79 }
  80
  81 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::Configure(const char* arguments)
  82 {
  83   // see header file for class documentation
  84   int iResult=0;
  85   if (!arguments) return iResult;
  86
  87   TString allArgs=arguments;
  88   TString argument;
  89   int bMissingParam=0;
  90
  91   TObjArray* pTokens=allArgs.Tokenize(" ");
  92   if (pTokens) {
  93     for (int i=0; i<pTokens->GetEntries() && iResult>=0; i++) {
  94       argument=((TObjString*)pTokens->At(i))->String();
  95       if (argument.IsNull()) continue;
  96
  97       if (argument.CompareTo("-solenoidBz")==0) {
  98         if ((bMissingParam=(++i>=pTokens->GetEntries()))) break;
  99         HLTWarning("argument -solenoidBz is deprecated, magnetic field set up globally (%f)", GetBz());
 100         continue;
 101       } else {
 102         HLTError("unknown argument %s", argument.Data());
 103         iResult=-EINVAL;
 104         break;
 105       }
 106     }
 107     delete pTokens;
 108   }
 109   if (bMissingParam) {
 110     HLTError("missing parameter for argument %s", argument.Data());
 111     iResult=-EINVAL;
 112   }
 113
 114   return iResult;
 115 }
 116
 117 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::Reconfigure(const char* cdbEntry, const char* chainId)
 118 {
 119   // see header file for class documentation
 120   int iResult=0;
 121   const char* path=NULL;
 122   const char* defaultNotify="";
 123   if (cdbEntry) {
 124     path=cdbEntry;
 125     defaultNotify=" (default)";
 126   }
 127   if (path) {
 128     HLTInfo("reconfigure from entry %s%s, chain id %s", path, defaultNotify,(chainId!=NULL && chainId[0]!=0)?chainId:"<none>");
 129     AliCDBEntry *pEntry = AliCDBManager::Instance()->Get(path/*,GetRunNo()*/);
 130     if (pEntry) {
 131       TObjString* pString=dynamic_cast<TObjString*>(pEntry->GetObject());
 132       if (pString) {
 133         HLTInfo("received configuration object string: \'%s\'", pString->String().Data());
 134         iResult=Configure(pString->String().Data());
 135       } else {
 136         HLTError("configuration object \"%s\" has wrong type, required TObjString", path);
 137       }
 138     } else {
 139       HLTError("can not fetch object \"%s\" from CDB", path);
 140     }
 141   }
 142
 143   return iResult;
 144 }
 145
 146 void AliHLTGlobalEsdConverterComponent::GetInputDataTypes(AliHLTComponentDataTypeList& list)
 147 {
 148   // see header file for class documentation
 149   list.push_back(kAliHLTDataTypeTrack);
 150   list.push_back(kAliHLTDataTypeTrackMC);
 151   list.push_back(kAliHLTDataTypeCaloCluster);
 152   list.push_back(kAliHLTDataTypedEdx );
 153   list.push_back(kAliHLTDataTypeESDVertex );
 154   list.push_back(kAliHLTDataTypeESDObject);
 155   list.push_back(kAliHLTDataTypeTObject);
 156   list.push_back(kAliHLTDataTypeGlobalVertexer);
 157   list.push_back(kAliHLTDataTypeV0Finder); // array of track ids for V0s
 158   list.push_back(kAliHLTDataTypeKFVertex); // KFVertex object from vertexer
 159   list.push_back(kAliHLTDataTypePrimaryFinder); // array of track ids for prim vertex
 160   list.push_back(kAliHLTDataTypeESDContent);
 161 }
 162
 163 AliHLTComponentDataType AliHLTGlobalEsdConverterComponent::GetOutputDataType()
 164 {
 165   // see header file for class documentation
 166   return kAliHLTDataTypeESDObject|kAliHLTDataOriginOut;
 167 }
 168
 169 void AliHLTGlobalEsdConverterComponent::GetOutputDataSize(unsigned long& constBase, double& inputMultiplier)
 170 {
 171   // see header file for class documentation
 172   constBase=2000000;
 173   inputMultiplier=10.0;
 174 }
 175
 176 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::DoInit(int argc, const char** argv)
 177 {
 178   // see header file for class documentation
 179   int iResult=0;
 180   TString argument="";
 181   int bMissingParam=0;
 182
 183   // default list of skiped ESD objects
 184   TString skipObjects=
 185     // "AliESDRun,"
 186     // "AliESDHeader,"
 187     // "AliESDZDC,"
 188     "AliESDFMD,"
 189     // "AliESDVZERO,"
 190     // "AliESDTZERO,"
 191     // "TPCVertex,"
 192     // "SPDVertex,"
 193     // "PrimaryVertex,"
 194     // "AliMultiplicity,"
 195     // "PHOSTrigger,"
 196     // "EMCALTrigger,"
 197     // "SPDPileupVertices,"
 198     // "TrkPileupVertices,"
 199     "Cascades,"
 200     "Kinks,"
 201     "AliRawDataErrorLogs,"
 202     "AliESDACORDE";
 203
 204   iResult=Reconfigure(NULL, NULL);
 205   TString allArgs = "";
 206   for ( int i = 0; i < argc; i++ ) {
 207     if ( !allArgs.IsNull() ) allArgs += " ";
 208     allArgs += argv[i];
 209   }
 210
 211   TObjArray* pTokens=allArgs.Tokenize(" ");
 212   if (pTokens) {
 213     for (int i=0; i<pTokens->GetEntries() && iResult>=0; i++) {
 214       argument=((TObjString*)pTokens->At(i))->String();
 215       if (argument.IsNull()) continue;
 216
 217       // -notree
 218       if (argument.CompareTo("-notree")==0) {
 219         fWriteTree=0;
 220
 221         // -tree
 222       } else if (argument.CompareTo("-tree")==0) {
 223         fWriteTree=1;
 224       } else if (argument.CompareTo("-solenoidBz")==0) {
 225         if ((bMissingParam=(++i>=pTokens->GetEntries()))) break;
 226         HLTInfo("Magnetic Field set to: %s", ((TObjString*)pTokens->At(i))->String().Data());
 227         HLTWarning("argument '-solenoidBz' is deprecated, solenoid field initiaized from CDB settings");
 228         continue;
 229       } else if (argument.Contains("-skipobject=")) {
 230         argument.ReplaceAll("-skipobject=", "");
 231         skipObjects=argument;
 232       } else {
 233         HLTError("unknown argument %s", argument.Data());
 234         iResult=-EINVAL;
 235         break;
 236       }
 237     }
 238   }
 239   if (bMissingParam) {
 240     HLTError("missing parameter for argument %s", argument.Data());
 241     iResult=-EINVAL;
 242   }
 243
 244   fSolenoidBz=GetBz();
 245
 246   if (iResult>=0) {
 247     fESD = new AliESDEvent;
 248     if (fESD) {
 249       fESD->CreateStdContent();
 250
 251       // remove some of the objects which are not needed
 252       if (fESD->GetList() && !skipObjects.IsNull()) {
 253         pTokens=skipObjects.Tokenize(",");
 254         if (pTokens) {
 255           const char* id=NULL;
 256           TIter next(pTokens);
 257           TObject* pObject=NULL;
 258           while ((pObject=next())!=NULL) {
 259             id=((TObjString*)pObject)->String().Data();
 260             TObject* pObj=fESD->GetList()->FindObject(id);
 261             if (pObj) {
 262               HLTDebug("removing object %s", id);
 263               fESD->GetList()->Remove(pObj);
 264               delete pObj;
 265             } else {
 266               HLTWarning("failed to remove object '%s' from ESD", id);
 267             }
 268           }
 269           fESD->GetStdContent();
 270           delete pTokens;
 271         }
 272       }
 273     } else {
 274       iResult=-ENOMEM;
 275     }
 276
 277     SetupCTPData();
 278   }
 279
 280   fBenchmark.SetTimer(0,"total");
 281
 282   return iResult;
 283 }
 284
 285 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::DoDeinit()
 286 {
 287   // see header file for class documentation
 288   if (fESD) delete fESD;
 289   fESD=NULL;
 290
 291   return 0;
 292 }
 293
 294 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::DoEvent(const AliHLTComponentEventData& /*evtData*/,
 295                                                AliHLTComponentTriggerData& trigData)
 296 {
 297   // see header file for class documentation
 298   int iResult=0;
 299   if (!fESD) return -ENODEV;
 300
 301   if (!IsDataEvent()) return iResult;
 302   fBenchmark.StartNewEvent();
 303   fBenchmark.Start(0);
 304
 305   AliESDEvent* pESD = fESD;
 306
 307   pESD->Reset();
 308   pESD->SetMagneticField(fSolenoidBz);
 309   pESD->SetRunNumber(GetRunNo());
 310   pESD->SetPeriodNumber(GetPeriodNumber());
 311   pESD->SetOrbitNumber(GetOrbitNumber());
 312   pESD->SetBunchCrossNumber(GetBunchCrossNumber());
 313   pESD->SetTimeStamp(GetTimeStamp());
 314
 315   const AliHLTCTPData* pCTPData=CTPData();
 316   if (pCTPData) {
 317     AliHLTTriggerMask_t mask=pCTPData->ActiveTriggers(trigData);
 318     for (int index=0; index<gkNCTPTriggerClasses; index++) {
 319       if ((mask&(AliHLTTriggerMask_t(0x1)<<index)) == 0) continue;
 320       pESD->SetTriggerClass(pCTPData->Name(index), index);
 321     }
 322     //first 50 triggers
 323     AliHLTTriggerMask_t mask50;
 324     mask50.set(); // set all bits
 325     mask50 >>= 50; // shift 50 right
 326     pESD->SetTriggerMask((mask&mask50).to_ulong());
 327     /* next 50, to be implemented
 328     pESD->SetTriggerMaskNext50((mask>>50).to_ulong());
 329     */
 330   }
 331
 332   TTree* pTree = NULL;
 333   if (fWriteTree)
 334     pTree = new TTree("esdTree", "Tree with HLT ESD objects");
 335
 336   if (pTree) {
 337     pTree->SetDirectory(0);
 338   }
 339
 340   if ((iResult=ProcessBlocks(pTree, pESD))>=0) {
 341     // TODO: set the specification correctly
 342     if (pTree) {
 343       // the esd structure is written to the user info and is
 344       // needed in te ReadFromTree method to read all objects correctly
 345       pTree->GetUserInfo()->Add(pESD);
 346       pESD->WriteToTree(pTree);
 347       iResult=PushBack(pTree, kAliHLTDataTypeESDTree|kAliHLTDataOriginOut, 0);
 348     } else {
 349       iResult=PushBack(pESD, kAliHLTDataTypeESDObject|kAliHLTDataOriginOut, 0);
 350     }
 351     fBenchmark.AddOutput(GetLastObjectSize());
 352   }
 353   if (pTree) {
 354     // clear user info list to prevent objects from being deleted
 355     pTree->GetUserInfo()->Clear();
 356     delete pTree;
 357   }
 358
 359   fBenchmark.Stop(0);
 360   HLTWarning( fBenchmark.GetStatistics() );
 361
 362   return iResult;
 363 }
 364
 365 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::ProcessBlocks(TTree* pTree, AliESDEvent* pESD)
 366 {
 367   // see header file for class documentation
 368
 369   int iResult=0;
 370   int iAddedDataBlocks=0;
 371
 372   // check if there is an ESD block in the input and copy its content first to the
 373   // ESD
 374   const TObject* pEsdObj = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDObject, "AliESDEvent");
 375   AliESDEvent* pInputESD=NULL;
 376   if (pEsdObj) pInputESD=dynamic_cast<AliESDEvent*>(const_cast<TObject*>(pEsdObj));
 377   if (pInputESD) {
 378     pInputESD->GetStdContent();
 379     *pESD=*pInputESD;
 380   }
 381   if (GetNextInputObject()!=NULL) {
 382     HLTWarning("handling of multiple ESD input objects not implemented, skipping input");
 383   }
 384
 385   // Barrel tracking
 386   // tracks are based on the TPC tracks, and only updated from the ITS information
 387   // Sequence:
 388   // 1) extract MC information for TPC and ITS from specific data blocks and store in
 389   //    intermediate vector arrays
 390   // 2) extract TPC tracks, update with MC labels if available, the track parameters
 391   //    are estimated at the first cluster position
 392   // 2.1) propagate to last cluster position and update kTPCout, sets also outer param (fOp)
 393   // 2.2) update kTPCin, sets also inner param (fIp) and TPC inner param (fTPCInner)
 394   // 2.3) update kTPCrefit using the same parameters at the first cluster position
 395   //      HLT has strictly spoking no refit, but we want the flag to be set
 396   //      can be changed to be done after all the individual barrel detector parameters
 397   //      have been updated by looping over the tracks again
 398   // 3) extract ITS tracks, the tracks are actually TPC tracks updated from the ITS
 399   //    tracking information
 400   // 3.1) TODO 2010-07-12: handle ITS standalone tracks by updating kITSout before kITSin
 401   // 3.2) update with kITSin
 402   //    TODO 2010-07-12 find out if the kITSrefit has to be set as well
 403   // 4) extract TRD tracks and add to ESD
 404   //    TODO 2010-07-12 at the moment there is no matching or merging of TPC and TRD tracks
 405   // 5) Add Trigger Detectors
 406   //    VZERO, ZDC
 407
 408   // 1) first read MC information (if present)
 409   std::map<int,int> mcLabelsTPC;
 410   std::map<int,int> mcLabelsITS;
 411
 412   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrackMC|kAliHLTDataOriginTPC);
 413        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 414
 415     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 416
 417     AliHLTTrackMCData* dataPtr = reinterpret_cast<AliHLTTrackMCData*>( pBlock->fPtr );
 418     if (sizeof(AliHLTTrackMCData)+dataPtr->fCount*sizeof(AliHLTTrackMCLabel)==pBlock->fSize) {
 419       for( unsigned int il=0; il<dataPtr->fCount; il++ ){
 420         AliHLTTrackMCLabel &lab = dataPtr->fLabels[il];
 421         mcLabelsTPC[lab.fTrackID] = lab.fMCLabel;
 422       }
 423     } else {
 424       HLTWarning("data mismatch in block %s (0x%08x): count %d, size %d -> ignoring track MC information",
 425                  DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification,
 426                  dataPtr->fCount, pBlock->fSize);
 427     }
 428   }
 429
 430   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrackMC|kAliHLTDataOriginITS);
 431        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 432
 433     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 434
 435     AliHLTTrackMCData* dataPtr = reinterpret_cast<AliHLTTrackMCData*>( pBlock->fPtr );
 436     if (sizeof(AliHLTTrackMCData)+dataPtr->fCount*sizeof(AliHLTTrackMCLabel)==pBlock->fSize) {
 437       for( unsigned int il=0; il<dataPtr->fCount; il++ ){
 438         AliHLTTrackMCLabel &lab = dataPtr->fLabels[il];
 439         mcLabelsITS[lab.fTrackID] = lab.fMCLabel;
 440       }
 441     } else {
 442       HLTWarning("data mismatch in block %s (0x%08x): count %d, size %d -> ignoring track MC information",
 443                  DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification,
 444                  dataPtr->fCount, pBlock->fSize);
 445     }
 446   }
 447
 448
 449   // read dEdx information (if present)
 450   // TODO 2010-07-12 this needs to be verified
 451
 452   AliHLTFloat32_t *dEdxTPC = 0;
 453   Int_t ndEdxTPC = 0;
 454   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypedEdx|kAliHLTDataOriginTPC);
 455        pBlock!=NULL; pBlock=NULL/*GetNextInputBlock() there is only one block*/) {
 456     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 457     dEdxTPC = reinterpret_cast<AliHLTFloat32_t*>( pBlock->fPtr );
 458     ndEdxTPC = pBlock->fSize / (3*sizeof(AliHLTFloat32_t));
 459   }
 460
 461   // 2) convert the TPC tracks to ESD tracks
 462   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack|kAliHLTDataOriginTPC);
 463        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 464     if (pInputESD && pInputESD->GetNumberOfTracks()>0) {
 465       HLTWarning("Tracks array already filled from the input esd block, additional filling from TPC tracks block might cause inconsistent content");
 466     }
 467     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 468     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
 469     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>=0) {
 470       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
 471            element!=tracks.end(); element++) {
 472         Float_t points[4] = {
 473           static_cast<Float_t>(element->GetX()),
 474           static_cast<Float_t>(element->GetY()),
 475           static_cast<Float_t>(element->GetLastPointX()),
 476           static_cast<Float_t>(element->GetLastPointY())
 477         };
 478
 479         Int_t mcLabel = -1;
 480         if( mcLabelsTPC.find(element->TrackID())!=mcLabelsTPC.end() )
 481           mcLabel = mcLabelsTPC[element->TrackID()];
 482         element->SetLabel( mcLabel );
 483
 484         AliESDtrack iotrack;
 485
 486         // for the moment, the number of clusters are not set when processing the
 487         // kTPCin update, only at kTPCout
 488         // there ar emainly three parameters updated for kTPCout
 489         //   number of clusters
 490         //   chi2
 491         //   pid signal
 492         // The first one can be updated already at that stage here, while the two others
 493         // eventually require to update from the ITS tracks before. The exact scheme
 494         // needs to be checked
 495         iotrack.SetID( element->TrackID() );
 496
 497         // 2.1 set kTPCout
 498         // TODO 2010-07-12 disabled for the moment because of bug
 499         // https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69875
 500         // the propagation does not work, there is an offset in z
 501         // propagate to last cluster and update parameters with flag kTPCout
 502         // Note: updating with flag kITSout further down will overwrite the outer
 503         // parameter again so this can be done only for ITS standalone tracks, meaning
 504         // tracks in the ITS not associated with any TPC track
 505         // HLT does not provide such standalone tracking
 506         {
 507           AliHLTGlobalBarrelTrack outPar(*element);
 508           //outPar.AliExternalTrackParam::PropagateTo( element->GetLastPointX(), fSolenoidBz );
 509           const Int_t N=10; // number of steps.
 510           const Float_t xRange = element->GetLastPointX() - element->GetX();
 511           const Float_t xStep = xRange / N ;
 512           for(int i = 1; i <= N; ++i) {
 513             if(!outPar.AliExternalTrackParam::PropagateTo(element->GetX() + xStep * i, fSolenoidBz)) break;
 514           }
 515           outPar.SetLabel(element->GetLabel());
 516           iotrack.UpdateTrackParams(&outPar,AliESDtrack::kTPCout);
 517         }
 518         // 2.2 TPC tracking estimates parameters at first cluster
 519         iotrack.UpdateTrackParams(&(*element),AliESDtrack::kTPCin);
 520
 521         // 2.3 use the same parameters also for kTPCrefit, there is no proper refit in HLT
 522         // maybe this can be done later, however also the inner parameter is changed which
 523         // is used as a reference point in the display. That point should be at the first
 524         // TPC cluster
 525         iotrack.UpdateTrackParams(&(*element),AliESDtrack::kTPCrefit);
 526         iotrack.SetTPCPoints(points);
 527         if( element->TrackID()<ndEdxTPC ){
 528           AliHLTFloat32_t *val = &(dEdxTPC[3*element->TrackID()]);
 529           iotrack.SetTPCsignal( val[0], val[1], (UChar_t) val[2] );
 530           //AliTPCseed s;
 531           //s.Set( element->GetX(), element->GetAlpha(),
 532           //element->GetParameter(), element->GetCovariance() );
 533           //s.SetdEdx( val[0] );
 534           //s.CookPID();
 535           //iotrack.SetTPCpid(s.TPCrPIDs() );
 536         } else {
 537           if( dEdxTPC ) HLTWarning("Wrong number of dEdx TPC labels");
 538         }
 539         iotrack.SetLabel(mcLabel);
 540         pESD->AddTrack(&iotrack);
 541         if (fVerbosity>0) element->Print();
 542       }
 543       HLTInfo("converted %d track(s) to AliESDtrack and added to ESD", tracks.size());
 544       iAddedDataBlocks++;
 545     } else if (iResult<0) {
 546       HLTError("can not extract tracks from data block of type %s (specification %08x) of size %d: error %d",
 547                DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification, pBlock->fSize, iResult);
 548     }
 549   }
 550
 551
 552   // Get ITS SPD vertex
 553   for( const AliHLTComponentBlockData *i= GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeESDVertex|kAliHLTDataOriginITS); i!=NULL; i=GetNextInputBlock() ){
 554     fBenchmark.AddInput(i->fSize);
 555   }
 556
 557   for ( const TObject *iter = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDVertex|kAliHLTDataOriginITS); iter != NULL; iter = GetNextInputObject() ) {
 558     AliESDVertex *vtx = dynamic_cast<AliESDVertex*>(const_cast<TObject*>( iter ) );
 559     pESD->SetPrimaryVertexSPD( vtx );
 560   }
 561
 562   // 3.1. now update ESD tracks with the ITSOut info
 563   // updating track parameters with flag kITSout will overwrite parameter set above with flag kTPCout
 564   // TODO 2010-07-12 there are some issues with this updating sequence, for the moment update with
 565   // flag kITSout is disabled, would require
 566   // a) to update kTPCout after kITSout
 567   // b) update only for ITS standalone tracks. The HLT ITS tracker does not provide standalone
 568   //    tracking, every track is related to a TPC track
 569   // Furthermore there seems to be a bug as the data blocks describe track parameters around the
 570   // vertex, not at the outer ITS
 571   // bug https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69872
 572   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack|kAliHLTDataOriginITSOut);
 573        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 574     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 575     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
 576     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>0) {
 577       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
 578            element!=tracks.end(); element++) {
 579         int tpcID=element->TrackID();
 580         // the ITS tracker assigns the TPC track used as seed for a certain track to
 581         // the trackID
 582         if( tpcID<0 || tpcID>=pESD->GetNumberOfTracks()) continue;
 583         AliESDtrack *tESD = pESD->GetTrack( tpcID );
 584         element->SetLabel(tESD->GetLabel());
 585         // 2010-07-12 disabled, see above, bugfix https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69872
 586         //if( tESD ) tESD->UpdateTrackParams( &(*element), AliESDtrack::kITSout );
 587       }
 588     }
 589   }
 590
 591   // 3.2. now update ESD tracks with the ITS info
 592   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack|kAliHLTDataOriginITS);
 593        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 594     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 595     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
 596     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>0) {
 597       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
 598            element!=tracks.end(); element++) {
 599         int tpcID=element->TrackID();
 600         // the ITS tracker assigns the TPC track used as seed for a certain track to
 601         // the trackID
 602         if( tpcID<0 || tpcID>=pESD->GetNumberOfTracks()) continue;
 603         Int_t mcLabel = -1;
 604         if( mcLabelsITS.find(element->TrackID())!=mcLabelsITS.end() )
 605           mcLabel = mcLabelsITS[element->TrackID()];
 606         AliESDtrack *tESD = pESD->GetTrack( tpcID );
 607         if (!tESD) continue;
 608         // the labels for the TPC and ITS tracking params can be different, e.g.
 609         // there can be a decay. The ITS label should then be the better one, the
 610         // TPC label is saved in a member of AliESDtrack
 611         if (mcLabel>=0) {
 612           // upadte only if the ITS label is available, otherwise keep TPC label
 613           element->SetLabel( mcLabel );
 614         } else {
 615           // bugfix https://savannah.cern.ch/bugs/?69713
 616           element->SetLabel( tESD->GetLabel() );
 617         }
 618         tESD->UpdateTrackParams( &(*element), AliESDtrack::kITSin );
 619
 620         // TODO: add a proper refit
 621         //tESD->UpdateTrackParams( &(*element), AliESDtrack::kTPCrefit );
 622       }
 623     }
 624   }
 625
 626   // update with  vertices and vertex-fitted tracks
 627   // output of the GlobalVertexerComponent
 628   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeGlobalVertexer);
 629        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 630     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 631     AliHLTGlobalVertexerComponent::FillESD( pESD, reinterpret_cast<AliHLTGlobalVertexerComponent::AliHLTGlobalVertexerData* >(pBlock->fPtr) );
 632   }
 633
 634   // update with  vertices and vertex-fitted tracks
 635   // output of PrimaryVertexer and V0Finder components
 636   TObject* pBase = (TObject*)GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeKFVertex | kAliHLTDataOriginOut);
 637   if (pBase) {
 638     AliKFVertex* kfVertex = dynamic_cast<AliKFVertex *>(pBase);
 639     if (kfVertex) {
 640       const AliHLTComponentBlockData* pP = GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypePrimaryFinder | kAliHLTDataOriginOut);
 641       if (pP && pP->fSize && pP->fPtr) {
 642         const AliHLTComponentBlockData* pV0 = GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeV0Finder | kAliHLTDataOriginOut);
 643         if (pV0 && pV0->fPtr && pInputESD && pInputESD->GetNumberOfV0s()>0) {
 644           const int* v0s = static_cast<const int*>(pV0->fPtr);
 645           HLTWarning("V0 array already filled from the input esd block, additional filling from V0 block of %d entries might cause inconsistent content", v0s[0]);
 646         }
 647         AliHLTVertexFinderBase::FillESD(pESD, kfVertex, pP->fPtr, pV0?pV0->fPtr:NULL);
 648       } else
 649         HLTWarning("Problem with primary finder's data block");
 650     } else {
 651       HLTWarning("primary vertex block of wrong type, expecting AliKFVertex instead of %s", pBase->GetName());
 652     }
 653   } else {
 654     // throw an error if there is a V0 data block which can not be handled without
 655     // the AliKFVertex object
 656     if (GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeV0Finder | kAliHLTDataOriginOut)!=NULL) {
 657       ALIHLTERRORGUARD(1, "missing AliKFVertex object ignoring V0 data block of type %s",
 658                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeV0Finder|kAliHLTDataOriginOut).c_str());
 659     }
 660   }
 661
 662   // Fill DCA parameters for TPC tracks
 663   // TODO 2010-07-12 this propagates also the TPC inner param to beamline
 664   // sounds not very reasonable
 665   // https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69873
 666   for (int i=0; i<pESD->GetNumberOfTracks(); i++) {
 667     if (!pESD->GetTrack(i) ||
 668         !pESD->GetTrack(i)->GetTPCInnerParam() ) continue;
 669     pESD->GetTrack(i)->RelateToVertexTPC(pESD->GetPrimaryVertexTracks(), fSolenoidBz, 1000 );
 670   }
 671
 672   // loop over all tracks and set the TPC refit flag by updating with the
 673   // original TPC inner parameter if not yet set
 674   // TODO: replace this by a proper refit
 675   // code is comented for the moment as it does not fully solve the problems with
 676   // the display
 677   // - would set the main parameters to the TPC inner wall again, or
 678   // - changes the inner param if the parameters are propagated, so we loose the track
 679   //   reference point for the display
 680   // with the current sequence we have the latter case as the DCA operations above
 681   // change the TPC inner parameters
 682   /*
 683   for (int i=0; i<pESD->GetNumberOfTracks(); i++) {
 684     if (!pESD->GetTrack(i) ||
 685         !pESD->GetTrack(i)->GetTPCInnerParam() ||
 686         pESD->GetTrack(i)->IsOn(AliESDtrack::kTPCrefit)) continue;
 687     AliESDtrack* tESD=pESD->GetTrack(i);
 688     AliHLTGlobalBarrelTrack inner(*tESD->GetTPCInnerParam());
 689     inner.SetLabel(tESD->GetLabel());
 690     tESD->UpdateTrackParams(&inner, AliESDtrack::kTPCrefit);
 691   }
 692   */
 693
 694   // 4. convert the HLT TRD tracks to ESD tracks
 695   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack | kAliHLTDataOriginTRD);
 696        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 697     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 698     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
 699     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>0) {
 700       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
 701            element!=tracks.end(); element++) {
 702
 703         Double_t TRDpid[AliPID::kSPECIES], eProb(0.2), restProb((1-eProb)/(AliPID::kSPECIES-1)); //eprob(element->GetTRDpid...);
 704         for(Int_t i=0; i<AliPID::kSPECIES; i++){
 705           switch(i){
 706           case AliPID::kElectron: TRDpid[AliPID::kElectron]=eProb; break;
 707           default: TRDpid[i]=restProb; break;
 708           }
 709         }
 710
 711         AliESDtrack iotrack;
 712         iotrack.UpdateTrackParams(&(*element),AliESDtrack::kTRDout);
 713         iotrack.SetStatus(AliESDtrack::kTRDin);
 714         iotrack.SetTRDpid(TRDpid);
 715
 716         pESD->AddTrack(&iotrack);
 717         if (fVerbosity>0) element->Print();
 718       }
 719       HLTInfo("converted %d track(s) to AliESDtrack and added to ESD", tracks.size());
 720       iAddedDataBlocks++;
 721     } else if (iResult<0) {
 722       HLTError("can not extract tracks from data block of type %s (specification %08x) of size %d: error %d",
 723                DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification, pBlock->fSize, iResult);
 724     }
 725   }
 726   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeCaloCluster | kAliHLTDataOriginAny); pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock())
 727     {
 728       fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 729       AliHLTCaloClusterHeaderStruct *caloClusterHeaderPtr = reinterpret_cast<AliHLTCaloClusterHeaderStruct*>(pBlock->fPtr);
 730
 731       HLTDebug("%d HLT clusters from spec: 0x%X", caloClusterHeaderPtr->fNClusters, pBlock->fSpecification);
 732
 733       //AliHLTCaloClusterReader reader;
 734       //reader.SetMemory(caloClusterHeaderPtr);
 735
 736       AliHLTESDCaloClusterMaker clusterMaker;
 737
 738       int nClusters = clusterMaker.FillESD(pESD, caloClusterHeaderPtr);
 739
 740       HLTInfo("converted %d cluster(s) to AliESDCaloCluster and added to ESD", nClusters);
 741       iAddedDataBlocks++;
 742     }
 743
 744   // 5) Add Trigger Detectors
 745   //    VZERO, ZDC
 746
 747   // FIXME: the size of all input blocks can be added in one loop
 748   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginVZERO);
 749        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 750     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 751   }
 752
 753   for ( const TObject *pObject = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginVZERO);
 754         pObject != NULL; pObject = GetNextInputObject() ) {
 755     AliESDVZERO *esdVZERO = dynamic_cast<AliESDVZERO*>(const_cast<TObject*>( pObject ) );
 756     if (esdVZERO) {
 757       pESD->SetVZEROData( esdVZERO );
 758       break;
 759     } else {
 760       ALIHLTERRORGUARD(1, "input object of data type %s is not of class AliESDVZERO",
 761                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginVZERO).c_str());
 762     }
 763   }
 764
 765   // FIXME: the size of all input blocks can be added in one loop
 766   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC);
 767        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
 768     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
 769   }
 770   for ( const TObject *pObject = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC);
 771         pObject != NULL; pObject = GetNextInputObject() ) {
 772     AliESDZDC *esdZDC = dynamic_cast<AliESDZDC*>(const_cast<TObject*>( pObject ) );
 773     if (esdZDC) {
 774 #ifndef HAVE_NOT_ALIZDCRECONSTRUCTOR_r43770
 775       pESD->SetZDCData( esdZDC );
 776 #else
 777       ALIHLTERRORGUARD(1, "Processing of ZDC data requires AliRoot r43770m skipping data block of type %s",
 778                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC).c_str());
 779 #endif
 780       break;
 781     } else {
 782       ALIHLTERRORGUARD(1, "input object of data type %s is not of class AliESDZDC",
 783                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC).c_str());
 784     }
 785   }
 786
 787   // Add tracks and clusters from MUON.
 788   for( const AliHLTComponentBlockData *i= GetFirstInputBlock(kAliHLTAnyDataType | kAliHLTDataOriginMUON); i!=NULL; i=GetNextInputBlock() ){
 789     fBenchmark.AddInput(i->fSize);
 790   }
 791
 792   for (const TObject* obj = GetFirstInputObject(kAliHLTAnyDataType | kAliHLTDataOriginMUON);
 793        obj != NULL;
 794        obj = GetNextInputObject()
 795       )
 796   {
 797     const TClonesArray* tracklist = NULL;
 798     const TClonesArray* clusterlist = NULL;
 799     if (obj->IsA() == AliESDEvent::Class())
 800     {
 801       const AliESDEvent* event = static_cast<const AliESDEvent*>(obj);
 802       HLTDebug("Received a MUON ESD with specification: 0x%X", GetSpecification(obj));
 803       if (event->GetList() == NULL) continue;
 804       tracklist = dynamic_cast<const TClonesArray*>(event->GetList()->FindObject("MuonTracks"));
 805       if (tracklist == NULL) continue;
 806       clusterlist = dynamic_cast<const TClonesArray*>(event->GetList()->FindObject("MuonClusters"));
 807       if (clusterlist == NULL) continue;
 808     }
 809     else if (obj->IsA() == TClonesArray::Class())
 810     {
 811       if (!strcmp(obj->GetName(), "MuonTracks")) {
 812         tracklist = static_cast<const TClonesArray*>(obj);
 813         HLTDebug("Received a MUON TClonesArray of tracks with specification: 0x%X", GetSpecification(obj));
 814       } else {
 815         clusterlist = static_cast<const TClonesArray*>(obj);
 816         HLTDebug("Received a MUON TClonesArray of clusters with specification: 0x%X", GetSpecification(obj));
 817       }
 818     }
 819     else
 820     {
 821       // Cannot handle this object type.
 822       continue;
 823     }
 824     // copy tracks
 825     if (tracklist) {
 826       HLTDebug("Received %d MUON tracks.", tracklist->GetEntriesFast());
 827       if (tracklist->GetEntriesFast() > 0)
 828       {
 829         const AliESDMuonTrack* track = dynamic_cast<const AliESDMuonTrack*>(tracklist->UncheckedAt(0));
 830         if (track == NULL)
 831         {
 832           HLTError(Form("%s from MUON does not contain AliESDMuonTrack objects.", obj->ClassName()));
 833           continue;
 834         }
 835       }
 836       for (Int_t i = 0; i < tracklist->GetEntriesFast(); ++i)
 837       {
 838         AliESDMuonTrack* track = pESD->NewMuonTrack();
 839         *track = *(static_cast<const AliESDMuonTrack*>(tracklist->UncheckedAt(i)));
 840       }
 841     }
 842     // copy clusters
 843     if (clusterlist) {
 844       HLTDebug("Received %d MUON clusters.", clusterlist->GetEntriesFast());
 845       if (clusterlist->GetEntriesFast() > 0)
 846       {
 847         const AliESDMuonCluster* cluster = dynamic_cast<const AliESDMuonCluster*>(clusterlist->UncheckedAt(0));
 848         if (cluster == NULL)
 849         {
 850           HLTError(Form("%s from MUON does not contain AliESDMuonCluster objects.", obj->ClassName()));
 851           continue;
 852         }
 853       }
 854       for (Int_t i = 0; i < clusterlist->GetEntriesFast(); ++i)
 855       {
 856         AliESDMuonCluster* cluster = pESD->NewMuonCluster();
 857         *cluster = *(static_cast<const AliESDMuonCluster*>(clusterlist->UncheckedAt(i)));
 858       }
 859     }
 860   }
 861
 862   if (iAddedDataBlocks>0 && pTree) {
 863     pTree->Fill();
 864   }
 865
 866   if (iResult>=0) iResult=iAddedDataBlocks;
 867   return iResult;
 868 }