ITS/AliITS.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
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   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
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  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
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  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18
  19 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  20 //                                                                           //
  21 //      An overview of the basic philosophy of the ITS code development      //
  22 // and analysis is show in the figure below.                                 //
  23 //Begin_Html                                                                 //
  24 /*
  25 <img src="picts/ITS/ITS_Analysis_schema.gif">
  26 </pre>
  27 <br clear=left>
  28 <font size=+2 color=red>
  29 <p>Roberto Barbera is in charge of the ITS Offline code (1999).
  30 <a href="mailto:roberto.barbera@ct.infn.it">Roberto Barbera</a>.
  31 </font>
  32 <pre>
  33 */
  34 //End_Html
  35 //
  36 //  AliITS. Inner Traking System base class.
  37 //  This class contains the base procedures for the Inner Tracking System
  38 //
  39 //Begin_Html
  40 /*
  41 <img src="picts/ITS/AliITS_Class_Diagram.gif">
  42 </pre>
  43 <br clear=left>
  44 <font size=+2 color=red>
  45 <p>This show the class diagram of the different elements that are part of
  46 the AliITS class.
  47 </font>
  48 <pre>
  49 */
  50 //End_Html
  51 //
  52 // Version: 0
  53 // Written by Rene Brun, Federico Carminati, and Roberto Barbera
  54 //
  55 // Version: 1
  56 // Modified and documented by Bjorn S. Nilsen
  57 // July 11 1999
  58 //
  59 // Version: 2
  60 // Modified and documented by A. Bologna
  61 // October 18 1999
  62 //
  63 // AliITS is the general base class for the ITS. Also see AliDetector for
  64 // futher information.
  65 //
  66 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  67
  68 #include <stdlib.h>
  69 #include <TClonesArray.h>
  70 #include <TFile.h>
  71 #include <TParticle.h>
  72 #include <TString.h>
  73 #include <TTree.h>
  74 #include <TVirtualMC.h>
  75 #include "AliDetector.h"
  76 #include "AliITS.h"
  77 #include "AliITSDetTypeSim.h"
  78 #include "AliITSDDLRawData.h"
  79 #include "AliITSLoader.h"
  80 #include "AliITShit.h"
  81 #include "AliITSmodule.h"
  82 #include "AliITSpListItem.h"
  83 #include "AliITSsimulation.h"
  84 #include "AliITSsimulationFastPoints.h"
  85 #include "AliMC.h"
  86 #include "AliITSDigitizer.h"
  87 #include "AliITSRecPoint.h"
  88 #include "AliITSsegmentationSPD.h"
  89 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
  90 #include "AliITSsimulationSDD.h"
  91 #include "AliITSCalibrationSDD.h"
  92 #include "AliITSsegmentationSSD.h"
  93 #include "AliITSRawStreamSPD.h"
  94 #include "AliITSRawStreamSSD.h"
  95 #include "AliITSRawStreamSDD.h"
  96 #include "AliRawReader.h"
  97 #include "AliRun.h"
  98 #include "AliLog.h"
  99 #include "AliITSInitGeometry.h"
 100 #include "AliITSFOSignalsSPD.h"
 101
 102 ClassImp(AliITS)
 103
 104 //______________________________________________________________________
 105 AliITS::AliITS() : AliDetector(),
 106 fDetTypeSim(0),
 107 fEuclidOut(0),
 108 fOpt("All"),
 109 fIdN(0),
 110 fIdSens(0),
 111 fIdName(0),
 112 fITSmodules(0),
 113 fTiming(kFALSE),
 114 fSimuParam(0)
 115 {
 116   // Default initializer for ITS
 117   //      The default constructor of the AliITS class. In addition to
 118   // creating the AliITS class it zeros the variables fIshunt (a member
 119   // of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros the pointers
 120   // fIdSens, and fIdName. The AliDetector default constructor
 121   // is also called.
 122
 123 //    SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 124 //PH    SetMarkerColor(kRed);
 125 }
 126 //______________________________________________________________________
 127 AliITS::AliITS(const Char_t *title):
 128   AliDetector("ITS",title),
 129   fDetTypeSim(0),
 130   fEuclidOut(0),
 131   fOpt("All"),
 132   fIdN(0),
 133   fIdSens(0),
 134   fIdName(0),
 135   fITSmodules(0),
 136   fTiming(kFALSE),
 137   fSimuParam(0)
 138 {
 139     //     The standard Constructor for the ITS class.
 140     // It also zeros the variables
 141     // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
 142     // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
 143     // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
 144     // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
 145     // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
 146     // class for a description of these parameters and its constructor
 147     // functions.
 148     // Inputs:
 149     //   Char_t *title  Simulation title for the ITS
 150     // Outputs:
 151     //   none.
 152     // Return:
 153     //   none.
 154
 155     fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560); // from AliDetector
 156     if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 157     //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
 158     SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 159     fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
 160     //PH  SetMarkerColor(kRed);
 161     if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 162     fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 163 }
 164 //______________________________________________________________________
 165 AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):
 166   AliDetector(name,title),
 167   fDetTypeSim(0),
 168   fEuclidOut(0),
 169   fOpt("All"),
 170   fIdN(0),
 171   fIdSens(0),
 172   fIdName(0),
 173   fITSmodules(0),
 174   fTiming(kFALSE),
 175   fSimuParam(0)
 176 {
 177   //     The standard Constructor for the ITS class.
 178   // It also zeros the variables
 179   // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
 180   // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
 181   // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
 182   // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
 183   // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
 184   // class for a description of these parameters and its constructor
 185   // functions.
 186
 187   fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560);
 188   if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 189   //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
 190
 191   SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 192
 193   fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
 194   //PH  SetMarkerColor(kRed);
 195   if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 196   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 197
 198 }
 199 //______________________________________________________________________
 200 AliITS::~AliITS(){
 201     // Default destructor for ITS.
 202     //     The default destructor of the AliITS class. In addition to deleting
 203     // the AliITS class it deletes the memory pointed to by
 204     // fIdSens, fIdName, fDetTypeSim and it's contents.
 205     // Inputs:
 206     //      none.
 207     // Outputs:
 208     //      none.
 209     // Return:
 210     //      none.
 211
 212     if (fHits) {
 213       fHits->Delete();
 214       delete fHits;
 215       fHits=0;
 216     }
 217     if(fITSmodules) {
 218         this->ClearModules();
 219         delete fITSmodules;
 220         fITSmodules = 0;
 221     }// end if fITSmodules!=0
 222
 223     delete[] fIdName;  // Array of TStrings
 224     delete[] fIdSens;
 225
 226     if (fDetTypeSim){
 227       delete fDetTypeSim;
 228       fDetTypeSim = 0;
 229     }
 230     if(fSimuParam){
 231       delete fSimuParam;
 232       fSimuParam=0;
 233     }
 234 }
 235 //______________________________________________________________________
 236 AliDigitizer* AliITS::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager)const{
 237     // Creates the AliITSDigitizer in a standard way for use via AliModule.
 238     // This function can not be included in the .h file because of problems
 239     // with the order of inclusion (recursive).
 240     // Inputs:
 241     //    AliRunDigitizer *manager  The Manger class for Digitization
 242     // Output:
 243     //    none.
 244     // Return:
 245     //    A new AliITSRunDigitizer (cast as a AliDigitizer).
 246
 247      return new AliITSDigitizer(manager);
 248 }
 249 //______________________________________________________________________
 250 void AliITS::Init(){
 251     // Initializer ITS after it has been built
 252     //     This routine initializes the AliITS class. It is intended to be
 253     // called from the Init function in AliITSv?. Besides displaying a banner
 254     // indicating that it has been called it initializes the array fIdSens
 255     // and sets the default segmentation, response, digit and raw cluster
 256     // classes therefore it should be called after a call to CreateGeometry.
 257     // Inputs:
 258     //      none.
 259     // Outputs:
 260     //      none.
 261     // Return:
 262     //      none.
 263     Int_t i;
 264     // Array of TStrings
 265     if(gMC) for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = gMC->VolId(fIdName[i]);
 266
 267 }
 268 //______________________________________________________________________
 269 void AliITS::SetDefaults(){
 270     // sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes.
 271     // Inputs:
 272     //      none.
 273     // Outputs:
 274     //      none.
 275     // Return:
 276     //      none.
 277     AliInfoClass("AliITS::Setting Defaults");
 278     if(!fDetTypeSim) {
 279      Error("SetDefaults()","fDetTypeSim is 0!");
 280      return;
 281     }
 282
 283     fDetTypeSim->SetDefaults();
 284     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 285
 286 }
 287 //______________________________________________________________________
 288 void AliITS::SetDefaultSimulation(){
 289     // sets the default simulation.
 290     // Inputs:
 291     //      none.
 292     // Outputs:
 293     //      none.
 294     // Return:
 295     //      none.
 296     if(!fDetTypeSim) {
 297      Error("SetDefaultSimulation()","fDetTypeSim is 0!");
 298      return;
 299     }
 300
 301     fDetTypeSim->SetDefaultSimulation();
 302     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 303
 304 }
 305
 306
 307 //______________________________________________________________________
 308 void AliITS::MakeBranch(Option_t* option){
 309     // Creates Tree branches for the ITS.
 310     // Inputs:
 311     //      Option_t *option    String of Tree types S,D, and/or R.
 312     //      const char *file    String of the file name where these branches
 313     //                          are to be stored. If blank then these branches
 314     //                          are written to the same tree as the Hits were
 315     //                          read from.
 316     // Outputs:
 317     //      none.
 318     // Return:
 319     //      none.
 320   if(!fDetTypeSim) {
 321     Error("MakeBranch","fDetTypeSim is 0!");
 322     return;
 323   }
 324
 325   Bool_t cH = (strstr(option,"H")!=0);
 326   Bool_t cS = (strstr(option,"S")!=0);
 327   Bool_t cD = (strstr(option,"D")!=0);
 328
 329   if(cH && (fHits == 0x0)) fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 330   AliDetector::MakeBranch(option);
 331
 332   if(cS) MakeBranchS(0);
 333   if(cD) MakeBranchD(0);
 334
 335
 336 }
 337 //___________________________________________________________________
 338 void AliITS::MakeBranchS(const char* fl){
 339
 340   // Creates Tree Branch for the ITS summable digits.
 341   // Inputs:
 342   //      cont char *fl  File name where SDigits branch is to be written
 343   //                     to. If blank it write the SDigits to the same
 344   //                     file in which the Hits were found.
 345
 346
 347   if(!fDetTypeSim){
 348     Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
 349   }
 350   Int_t buffersize = 4000;
 351   char branchname[30];
 352
 353   // only one branch for SDigits.
 354   sprintf(branchname,"%s",GetName());
 355
 356   if(fLoader->TreeS()){
 357     TClonesArray* sdig = (TClonesArray*)fDetTypeSim->GetSDigits();
 358     MakeBranchInTree(fLoader->TreeS(),branchname,&sdig,buffersize,fl);
 359   }
 360 }
 361 //______________________________________________________________________
 362 void AliITS::MakeBranchD(const char* file){
 363
 364   //Make branch for digits
 365   if(!fDetTypeSim) {
 366     Warning("MakeBranchD","fDetTypeSim is 0!");
 367     return;
 368   }
 369   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 370   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 371   MakeBranchInTreeD(fLoader->TreeD(),file);
 372 }
 373
 374 //___________________________________________________________________
 375 void AliITS:: MakeBranchInTreeD(TTree* treeD, const char* file){
 376   // Creates Tree branches for the ITS.
 377
 378   if(!fDetTypeSim){
 379     Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
 380   }
 381   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 382   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 383
 384   const Char_t *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 385   const Char_t* digclass;
 386   Int_t buffersize = 4000;
 387   Char_t branchname[30];
 388
 389   if(!fDetTypeSim->GetDigits()){
 390     fDetTypeSim->SetDigits(new TObjArray(fgkNTYPES));
 391   }
 392   for(Int_t i=0;i<fgkNTYPES;i++){
 393     digclass = fDetTypeSim->GetDigitClassName(i);
 394     TString classn = digclass;
 395     if(!((fDetTypeSim->GetDigits())->At(i))){
 396       (fDetTypeSim->GetDigits())->AddAt(new TClonesArray(classn.Data(),1000),i);
 397     }
 398     else ResetDigits(i);
 399     if(fgkNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
 400     else sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 401     TObjArray* dig = DigitsAddress(i);
 402     if(GetDigits() && treeD) AliDetector::MakeBranchInTree(treeD,branchname, &dig,buffersize,file);
 403   }
 404
 405 }
 406 //______________________________________________________________________
 407 void AliITS::SetTreeAddress(){
 408     // Set branch address for the Trees.
 409     // Inputs:
 410     //      none.
 411     // Outputs:
 412     //      none.
 413     // Return:
 414     //      none.
 415
 416   if(!fDetTypeSim) {
 417     Error("SetTreeAddress","fDetTypeSim is 0!");
 418     return;
 419   }
 420
 421   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 422   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 423
 424   TTree *treeS = fLoader->TreeS();
 425   TTree *treeD = fLoader->TreeD();
 426   if (fLoader->TreeH() && (fHits == 0x0)) {
 427       fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 428   }
 429   AliDetector::SetTreeAddress();
 430
 431   fDetTypeSim->SetTreeAddressS(treeS, (Char_t*)GetName());
 432   fDetTypeSim->SetTreeAddressD(treeD, (Char_t*)GetName());
 433 }
 434 //______________________________________________________________________
 435 void AliITS::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits){
 436     // Add an ITS hit
 437     //     The function to add information to the AliITShit class. See the
 438     // AliITShit class for a full description. This function allocates the
 439     // necessary new space for the hit information and passes the variable
 440     // track, and the pointers *vol and *hits to the AliITShit constructor
 441     // function.
 442     // Inputs:
 443     //      Int_t   track   Track number which produced this hit.
 444     //      Int_t   *vol    Array of Integer Hit information. See AliITShit.h
 445     //      Float_t *hits   Array of Floating Hit information.  see AliITShit.h
 446     // Outputs:
 447     //      none.
 448     // Return:
 449     //      none.
 450   TClonesArray &lhits = *fHits;
 451   new(lhits[fNhits++]) AliITShit(fIshunt,track,vol,hits);
 452 }
 453
 454 //______________________________________________________________________
 455 void AliITS::FillModules(Int_t evnt,Int_t bgrev,Int_t nmodules,
 456                          Option_t *option, const char *filename){
 457   // fill the modules with the sorted by module hits; add hits from
 458   // background if option=Add.
 459
 460   static TTree *trH1;                 //Tree with background hits
 461   static Bool_t first=kTRUE;
 462   static TFile *file;
 463   const char *addBgr = strstr(option,"Add");
 464
 465   evnt = nmodules; // Dummy use of variables to remove warnings
 466   if (addBgr ) {
 467     if(first) {
 468       file=new TFile(filename);
 469     } // end if first
 470     first=kFALSE;
 471     file->cd();
 472     file->ls();
 473     // Get Hits Tree header from file
 474     if(trH1) delete trH1;
 475     trH1=0;
 476
 477     char treeName[20];
 478     sprintf(treeName,"TreeH%d",bgrev);
 479     trH1 = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 480     if (!trH1) {
 481       Error("FillModules","cannot find Hits Tree for event:%d",bgrev);
 482     } // end if !trH1
 483     // Set branch addresses
 484   } // end if addBgr
 485
 486   FillModules(fLoader->TreeH(),0); // fill from this file's tree.
 487
 488   if (addBgr ) {
 489     FillModules(trH1,10000000); // Default mask 10M.
 490     TTree *fAli=fLoader->GetRunLoader()->TreeK();
 491     TFile *fileAli=0;
 492     if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
 493     fileAli->cd();
 494   } // end if add
 495
 496
 497 }
 498 //______________________________________________________________________
 499 void AliITS::FillModules(TTree *treeH, Int_t mask) {
 500     // fill the modules with the sorted by module hits;
 501     // can be called many times to do a merging
 502     // Inputs:
 503     //      TTree *treeH  The tree containing the hits to be copied into
 504     //                    the modules.
 505     //      Int_t mask    The track number mask to indecate which file
 506     //                    this hits came from.
 507     // Outputs:
 508     //      none.
 509     // Return:
 510     //      none.
 511
 512     if (treeH == 0x0)
 513      {
 514        Error("FillModules","Tree is NULL");
 515      }
 516     Int_t lay,lad,det,index;
 517     AliITShit *itsHit=0;
 518     AliITSmodule *mod=0;
 519     char branchname[20];
 520     sprintf(branchname,"%s",GetName());
 521     TBranch *branch = treeH->GetBranch(branchname);
 522     if (!branch) {
 523         Error("FillModules","%s branch in TreeH not found",branchname);
 524         return;
 525     } // end if !branch
 526     branch->SetAddress(&fHits);
 527     Int_t nTracks =(Int_t) treeH->GetEntries();
 528     Int_t iPrimTrack,h;
 529     for(iPrimTrack=0; iPrimTrack<nTracks; iPrimTrack++){
 530         ResetHits();
 531         Int_t nBytes = treeH->GetEvent(iPrimTrack);
 532         if (nBytes <= 0) continue;
 533         Int_t nHits = fHits->GetEntriesFast();
 534         for(h=0; h<nHits; h++){
 535             itsHit = (AliITShit *)fHits->UncheckedAt(h);
 536             itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
 537             if (GetITSgeom()) {
 538                 index = GetITSgeom()->GetModuleIndex(lay,lad,det);
 539             } else {
 540                 index=det-1; // This should not be used.
 541             } // end if [You must have fITSgeom for this to work!]
 542             mod = GetModule(index);
 543             itsHit->SetTrack(itsHit->GetTrack()+mask); // Set track mask.
 544             mod->AddHit(itsHit,iPrimTrack,h);
 545         } // end loop over hits
 546     } // end loop over tracks
 547 }
 548
 549 //______________________________________________________________________
 550 Bool_t AliITS::InitModules(Int_t size,Int_t &nmodules){
 551     // Initialize the modules array.
 552     // Inputs:
 553     //      Int_t size  Size of array of the number of modules to be
 554     //                  created. If size <=0 then the number of modules
 555     //                  is gotten from AliITSgeom class kept in fITSgeom.
 556     // Outputs:
 557     //      Int_t &nmodules The number of modules existing.
 558     // Return:
 559     //      none.
 560
 561     if(fITSmodules){
 562         fITSmodules->Delete();
 563         delete fITSmodules;
 564     } // end fir fITSmoudles
 565
 566     if(!fDetTypeSim) {
 567       Error("InitModules","fDetTypeSim is null!");
 568       return kFALSE;
 569     }
 570     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 571
 572     Int_t nl,indexMAX,index;
 573
 574     if(size<=0){ // default to using data stored in AliITSgeom
 575         if(fDetTypeSim->GetITSgeom()==0) {
 576             Error("InitModules","fITSgeom not defined");
 577             return kFALSE;
 578         } // end if fITSgeom==0
 579         nl = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetNlayers();
 580         indexMAX = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetIndexMax();
 581         nmodules = indexMAX;
 582         fITSmodules = new TObjArray(indexMAX);
 583         for(index=0;index<indexMAX;index++){
 584             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 585         } // end for index
 586     }else{
 587         fITSmodules = new TObjArray(size);
 588         for(index=0;index<size;index++) {
 589             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 590         } // end for index
 591
 592         nmodules = size;
 593     } // end i size<=0
 594     return kTRUE;
 595 }
 596 //______________________________________________________________________
 597 void AliITS::Hits2SDigits(){
 598     // Standard Hits to summable Digits function.
 599     // Inputs:
 600     //      none.
 601     // Outputs:
 602     //      none.
 603
 604
 605    if(!fDetTypeSim) {
 606      Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is null!");
 607      return;
 608   }
 609
 610   SetDefaults();
 611   fLoader->LoadHits("read");
 612   fLoader->LoadSDigits("recreate");
 613   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
 614   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 615   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 616
 617   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
 618         // Do the Hits to Digits operation. Use Standard input values.
 619         // Event number from file, no background hit merging , use size from
 620         // AliITSgeom class, option="All", input from this file only.
 621     rl->GetEvent(iEvent);
 622     if (!fLoader->TreeS()) fLoader->MakeTree("S");
 623     MakeBranch("S");
 624     SetTreeAddress();
 625     HitsToPreDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
 626   } // end for iEvent
 627
 628   fLoader->UnloadHits();
 629   fLoader->UnloadSDigits();
 630
 631 }
 632 //______________________________________________________________________
 633 void AliITS::Hits2Digits(){
 634
 635   //Conversion from hits to digits
 636   if(!fDetTypeSim) {
 637     Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
 638     return;
 639   }
 640
 641   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 642   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 643   SetDefaults();
 644
 645   fLoader->LoadHits("read");
 646   fLoader->LoadDigits("recreate");
 647   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
 648   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
 649     rl->GetEvent(iEvent);
 650     if (!fLoader->TreeD()) fLoader->MakeTree("D");
 651     MakeBranch("D");
 652     SetTreeAddress();
 653     HitsToDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
 654   }
 655
 656   fLoader->UnloadHits();
 657   fLoader->UnloadDigits();
 658
 659 }
 660
 661 //______________________________________________________________________
 662 void AliITS::HitsToDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 663                           Option_t *option,Option_t *opt,
 664                           const char *filename){
 665     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for
 666     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 667     // the condition below will disappear when the geom class will be
 668     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 669     // 7 is the SDD beam test version.
 670     // Inputs:
 671     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 672     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 673     //      Int_t nmodules   Not used.
 674     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
 675     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 676     //                       background hits are considered.
 677     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
 678     // Outputs:
 679     //      none.
 680     // Return:
 681     //      none.
 682
 683   if(!fDetTypeSim) {
 684     Error("HitsToDigits","fDetTypeSim is null!");
 685     return;
 686   }
 687   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 688   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 689   if(!GetITSgeom()) return; // need transformations to do digitization.
 690   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 691
 692   const char *all = strstr(opt,"All");
 693   const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
 694                         strstr(opt,"SSD")};
 695   static Bool_t setDef=kTRUE;
 696   if (setDef) SetDefaultSimulation();
 697   setDef=kFALSE;
 698
 699   Int_t nmodules;
 700   InitModules(size,nmodules);
 701   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
 702
 703   // Reset Fast-OR signals for this event
 704   fDetTypeSim->ResetFOSignals();
 705
 706   AliITSsimulation *sim      = 0;
 707   AliITSmodule     *mod      = 0;
 708   Int_t id;
 709   for(Int_t module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 710     id       = geom->GetModuleType(module);
 711     if (!all && !det[id]) continue;
 712     sim      = (AliITSsimulation*)fDetTypeSim->GetSimulationModel(id);
 713     if (!sim) {
 714       Error("HitsToDigits","The simulation class was not "
 715             "instanciated for module %d type %s!",module,
 716             geom->GetModuleTypeName(module));
 717       exit(1);
 718     } // end if !sim
 719     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 720     sim->DigitiseModule(mod,module,evNumber);
 721     // fills all branches - wasted disk space
 722     fLoader->TreeD()->Fill();
 723     ResetDigits();
 724   } // end for module
 725
 726   ClearModules();
 727
 728   // Add random noise to FO signals
 729   if (all || det[0]) { // SPD present
 730     fDetTypeSim->ProcessNoiseForFastOr();
 731   }
 732
 733   // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
 734   if (all || det[0]) { // SPD present
 735     fDetTypeSim->WriteFOSignals();
 736   }
 737
 738
 739   fLoader->TreeD()->GetEntries();
 740   fLoader->TreeD()->AutoSave();
 741   // reset tree
 742   fLoader->TreeD()->Reset();
 743 }
 744 //_____________________________________________________________________
 745 void AliITS::Hits2PreDigits(){
 746   // Turn hits into SDigits
 747
 748   if(!fDetTypeSim) {
 749     Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
 750     return;
 751   }
 752
 753   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 754   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 755   SetDefaults();
 756
 757   HitsToPreDigits(fLoader->GetRunLoader()->GetEventNumber(),
 758                   0,-1," ",fOpt," ");
 759 }
 760
 761 //______________________________________________________________________
 762 void AliITS::HitsToPreDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 763                              Option_t *option,Option_t *opt,
 764                              const char *filename){
 765     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for
 766     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 767     // the condition below will disappear when the geom class will be
 768     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 769     // 7 is the SDD beam test version.
 770     // Inputs:
 771     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 772     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 773     //      Int_t nmodules   Not used.
 774     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
 775     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 776     //                       background hits are considered.
 777     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
 778     // Outputs:
 779     //      none.
 780     // Return:
 781     //      none.
 782
 783
 784   if(!fDetTypeSim) {
 785     Error("HitsToPreDigits","fDetTypeSim is null!");
 786     return;
 787   }
 788   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 789   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 790
 791   if(!GetITSgeom()){
 792     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 793     return; // need transformations to do digitization.
 794   }
 795   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 796
 797   const char *all = strstr(opt,"All");
 798   const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
 799                         strstr(opt,"SSD")};
 800   static Bool_t setDef=kTRUE;
 801   if (setDef) SetDefaultSimulation();
 802   setDef=kFALSE;
 803
 804   Int_t nmodules;
 805   InitModules(size,nmodules);
 806   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
 807
 808
 809   AliITSsimulation *sim      = 0;
 810   AliITSmodule     *mod      = 0;
 811   Int_t id,module;
 812   for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 813     id       = geom->GetModuleType(module);
 814     if (!all && !det[id]) continue;
 815     sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
 816     if (!sim) {
 817       Error("HitsToPreDigits","The simulation class was not "
 818             "instanciated for module %d type %s!",module,
 819             geom->GetModuleTypeName(module));
 820       exit(1);
 821     } // end if !sim
 822     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 823     sim->SDigitiseModule(mod,module,evNumber);
 824     // fills all branches - wasted disk space
 825     fLoader->TreeS()->Fill();
 826     fDetTypeSim->ResetSDigits();
 827   } // end for module
 828
 829   ClearModules();
 830
 831
 832   fLoader->TreeS()->GetEntries();
 833   fLoader->TreeS()->AutoSave();
 834   fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
 835   // reset tree
 836   fLoader->TreeS()->Reset();
 837 }
 838
 839 //_____________________________________________________________________
 840 void AliITS::HitsToFastRecPoints(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 841                                   Option_t *opt0,Option_t *opt1,
 842                                  const char *flnm){
 843     // keep galice.root for signal and name differently the file for
 844     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 845     // the condition below will disappear when the geom class will be
 846     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 847     // Inputs:
 848     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 849     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 850     //      Int_t size       Size used by InitModules. See InitModules.
 851     //      Option_t *opt0   Option passed to FillModules. See FillModules.
 852     //      Option_t *opt1   String indicating if merging hits or not. To
 853     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 854     //                       background hits are considered.
 855     //      Test_t *flnm     File name containing the background hits..
 856     // Outputs:
 857     //      none.
 858     // Return:
 859     //      none.
 860
 861
 862
 863   if(!GetITSgeom()){
 864     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 865     return; // need transformations to do digitization.
 866   }
 867   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 868
 869   AliITSLoader *pITSloader = (AliITSLoader*)fLoader;
 870
 871   const char *all = strstr(opt1,"All");
 872   const char *det[3] ={strstr(opt1,"SPD"),strstr(opt1,"SDD"),
 873                        strstr(opt1,"SSD")};
 874   Int_t nmodules;
 875   InitModules(size,nmodules);
 876   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,opt0,flnm);
 877
 878   AliITSsimulation *sim      = 0;
 879   AliITSmodule     *mod      = 0;
 880   Int_t id,module;
 881
 882   TTree *lTR = pITSloader->TreeR();
 883   if(!lTR) {
 884     pITSloader->MakeTree("R");
 885     lTR = pITSloader->TreeR();
 886   }
 887
 888   TClonesArray* ptarray = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
 889   TBranch* branch = (TBranch*)lTR->Branch("ITSRecPointsF",&ptarray);
 890   branch->SetAddress(&ptarray);
 891   //m.b. : this change is nothing but a nice way to make sure
 892   //the CPU goes up !
 893   for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 894     id       = geom->GetModuleType(module);
 895     if (!all && !det[id]) continue;
 896     sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
 897     if (!sim) {
 898       Error("HitsToFastPoints","The simulation class was not "
 899             "instanciated for module %d type %x!",module,
 900             geom->GetModuleTypeName(module));
 901       exit(1);
 902     } // end if !sim
 903     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 904     sim->CreateFastRecPoints(mod,module,gRandom,ptarray);
 905     lTR->Fill();
 906     ptarray->Clear();
 907   } // end for module
 908
 909   ClearModules();
 910   fLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 911   delete ptarray;
 912 }
 913 //_____________________________________________________________________
 914 Int_t AliITS::Hits2Clusters(TTree *hTree, TTree *cTree) {
 915   //------------------------------------------------------------
 916   // This function creates ITS clusters
 917   //------------------------------------------------------------
 918   if(!GetITSgeom()){
 919     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 920     return 1; // need transformations to do digitization.
 921   }
 922   AliITSgeom *geom=GetITSgeom();
 923   Int_t mmax=geom->GetIndexMax();
 924
 925   InitModules(-1,mmax);
 926   FillModules(hTree,0);
 927
 928   TClonesArray *points = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
 929   TBranch *branch=cTree->GetBranch("ITSRecPoints");
 930   if (!branch) cTree->Branch("ITSRecPoints",&points);
 931   else branch->SetAddress(&points);
 932
 933   AliITSsimulationFastPoints sim;
 934   Int_t ncl=0;
 935   for (Int_t m=0; m<mmax; m++) {
 936     AliITSmodule *mod=GetModule(m);
 937     sim.CreateFastRecPoints(mod,m,gRandom,points);
 938     ncl+=points->GetEntriesFast();
 939     cTree->Fill();
 940     points->Clear();
 941   }
 942
 943   AliDebug(1,Form("Number of found fast clusters : %d",ncl));
 944
 945   //cTree->Write();
 946
 947   delete points;
 948   return 0;
 949 }
 950
 951 //_____________________________________________________________________
 952 void AliITS::CheckLabels(Int_t lab[3]) const {
 953   //------------------------------------------------------------
 954   // Tries to find mother's labels
 955   //------------------------------------------------------------
 956
 957   if(lab[0]<0 && lab[1]<0 && lab[2]<0) return; // In case of no labels just exit
 958
 959   Int_t ntracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
 960   for (Int_t i=0;i<3;i++){
 961     Int_t label = lab[i];
 962     if (label>=0 && label<ntracks) {
 963       TParticle *part=(TParticle*)gAlice->GetMCApp()->Particle(label);
 964       if (part->P() < 0.005) {
 965         Int_t m=part->GetFirstMother();
 966         if (m<0) {
 967           continue;
 968         }
 969         if (part->GetStatusCode()>0) {
 970           continue;
 971         }
 972         lab[i]=m;
 973       }
 974     }
 975   }
 976
 977 }
 978
 979 //______________________________________________________________________
 980 void AliITS::SDigitsToDigits(Option_t *opt){
 981   // Standard Summable digits to Digits function.
 982   // Inputs:
 983   //      none.
 984   // Outputs:
 985   //      none.
 986   if (!fDetTypeSim) {
 987     AliError("fDetTypeSim is 0!");
 988     return;
 989   }
 990
 991   const char *all = strstr(opt,"All");
 992   const char *det[3] ={strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
 993                        strstr(opt,"SSD")};
 994
 995   // Reset Fast-OR signals for this event
 996   fDetTypeSim->ResetFOSignals();
 997
 998   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 999   SetDefaults();
1000   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
1001   fDetTypeSim->SDigitsToDigits(opt,(Char_t*)GetName());
1002
1003   // Add random noise to FO signals
1004   if (all || det[0]) { // SPD present
1005     fDetTypeSim->ProcessNoiseForFastOr();
1006   }
1007   // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
1008   if (all || det[0]) { // SPD present
1009     fDetTypeSim->WriteFOSignals();
1010   }
1011 }
1012
1013 //______________________________________________________________________
1014 void AliITS::ResetDigits(){
1015     // Reset number of digits and the digits array for the ITS detector.
1016     // Inputs:
1017     //      none.
1018     // Outputs:
1019     //      none.
1020     if(!fDetTypeSim) {
1021       Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
1022       return;
1023     }
1024
1025     fDetTypeSim->ResetDigits();
1026
1027
1028 }
1029 //______________________________________________________________________
1030 void AliITS::ResetDigits(Int_t branch){
1031     // Reset number of digits and the digits array for this branch.
1032     // Inputs:
1033     //      none.
1034     // Outputs:
1035     //      none.
1036
1037     if(!fDetTypeSim) {
1038       Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
1039       return;
1040     }
1041
1042     fDetTypeSim->ResetDigits(branch);
1043
1044 }
1045 //______________________________________________________________________
1046 void AliITS::AddSumDigit(AliITSpListItem &sdig){
1047     // Adds the a module full of summable digits to the summable digits tree.
1048     // Inputs:
1049     //      AliITSpListItem &sdig   SDigit to be added to SDigits tree.
1050     // Outputs:
1051     //      none.
1052     // Return:
1053     //      none.
1054
1055     if(!fDetTypeSim) {
1056       Error("AddSumDigit","fDetTypeSim is 0!");
1057       return;
1058     }
1059     fDetTypeSim->AddSumDigit(sdig);
1060
1061 }
1062 //______________________________________________________________________
1063 void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch, AliITSdigit *d){
1064     //    Add a simulated digit.
1065     // Inputs:
1066     //      Int_t id        Detector type number.
1067     //      AliITSdigit *d  Digit to be added to the Digits Tree. See
1068     //                      AliITSdigit.h
1069     // Outputs:
1070     //      none.
1071     // Return:
1072     //      none.
1073
1074     if(!fDetTypeSim) {
1075       Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
1076       return;
1077     }
1078     fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,d);
1079
1080 }
1081 //______________________________________________________________________
1082 void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch,Float_t phys,Int_t *digits,Int_t *tracks,
1083                          Int_t *hits,Float_t *charges, Int_t sigexpanded){
1084   //   Add a simulated digit to the list.
1085   // Inputs:
1086   //      Int_t id        Detector type number.
1087   //      Float_t phys    Physics indicator. See AliITSdigits.h
1088   //      Int_t *digits   Integer array containing the digits info. See
1089   //                      AliITSdigit.h
1090   //      Int_t *tracks   Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
1091   //                      containing the track numbers that contributed to
1092   //                      this digit.
1093   //      Int_t *hits     Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
1094   //                      containing the hit numbers, from AliITSmodule, that
1095   //                      contributed to this digit.
1096   //      Float_t *charge Floating point array of the signals contributed
1097   //                      to this digit by each track.
1098   // Outputs:
1099   //      none.
1100   // Return:
1101   //      none.
1102
1103     if(!fDetTypeSim) {
1104       Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
1105       return;
1106     }
1107     fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,phys,digits,tracks,hits,charges,sigexpanded);
1108
1109 }
1110 //______________________________________________________________________
1111 void AliITS::Digits2Raw(){
1112     // convert digits of the current event to raw data
1113
1114   if(!fDetTypeSim) {
1115     Error("Digits2Raw","fDetTypeSim is 0!");
1116     return;
1117   }
1118   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
1119   SetDefaults();
1120   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
1121   fDetTypeSim->GetLoader()->LoadDigits();
1122   TTree* digits = fDetTypeSim->GetLoader()->TreeD();
1123   if (!digits) {
1124       Error("Digits2Raw", "no digits tree");
1125       return;
1126   }
1127   fDetTypeSim->SetTreeAddressD(digits,(Char_t*)GetName());
1128
1129    // Get the FO signals for this event
1130   AliITSFOSignalsSPD* foSignals = NULL;
1131   AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::Instance();
1132   AliITSLoader* itsLoader = (AliITSLoader*) runLoader->GetLoader("ITSLoader");
1133   if (!itsLoader) {
1134     AliError("ITS loader is NULL.");
1135   }
1136    else {
1137       if(!itsLoader->TreeD()) AliError("   !!! No TreeD available !!!");
1138       foSignals = (AliITSFOSignalsSPD*)itsLoader->TreeD()->GetUserInfo()->FindObject("AliITSFOSignalsSPD");
1139       if(!foSignals) AliError("FO signals not retrieved");
1140      }
1141
1142   Bool_t deleteFOsignalsLater = kFALSE;
1143   if (!foSignals) {
1144     AliError("FO signals not available. No FO bits will be written.");
1145     foSignals = new AliITSFOSignalsSPD(); // make a temporary dummy signals object
1146     deleteFOsignalsLater = kTRUE;
1147   }
1148
1149
1150   AliITSDDLModuleMapSDD* ddlsdd=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
1151   Char_t rawSDD=fDetTypeSim->GetSimuParam()->GetSDDRawDataFormat();
1152   AliITSDDLRawData rawWriter;
1153
1154   rawWriter.SetSDDRawFormat(rawSDD);
1155   //Verbose level
1156   // 0: Silent
1157   // 1: cout messages
1158   // 2: txt files with digits
1159   //BE CAREFUL, verbose level 2 MUST be used only for debugging and
1160   //it is highly suggested to use this mode only for debugging digits files
1161   //reasonably small, because otherwise the size of the txt files can reach
1162   //quickly several MB wasting time and disk space.
1163   rawWriter.SetVerbose(0);
1164
1165   //SILICON PIXEL DETECTOR
1166   AliDebug(1,"Formatting raw data for SPD");
1167   rawWriter.RawDataSPD(digits->GetBranch("ITSDigitsSPD"),foSignals);
1168   if(deleteFOsignalsLater) delete foSignals;
1169
1170   //SILICON DRIFT DETECTOR
1171   AliDebug(1,Form("Formatting raw data for SDD - Format code =%d",rawSDD));
1172   rawWriter.RawDataSDD(digits->GetBranch("ITSDigitsSDD"),ddlsdd);
1173
1174   //SILICON STRIP DETECTOR
1175   AliDebug(1,"Formatting raw data for SSD");
1176   rawWriter.RawDataSSD(digits->GetBranch("ITSDigitsSSD"));
1177
1178   fLoader->UnloadDigits();
1179 }
1180 //______________________________________________________________________
1181 AliLoader* AliITS::MakeLoader(const char* topfoldername){
1182     //builds ITSgetter (AliLoader type)
1183     //if detector wants to use castomized getter, it must overload this method
1184
1185     AliDebug(1,Form("Creating AliITSLoader. Top folder is %s.",
1186          topfoldername));
1187     fLoader = new AliITSLoader(GetName(),topfoldername);
1188     return fLoader;
1189 }
1190 //______________________________________________________________________
1191 Bool_t AliITS::Raw2SDigits(AliRawReader* rawReader)
1192 {
1193   //
1194   // Converts RAW data to SDigits
1195   //
1196   // Get TreeS
1197   //
1198     Int_t last   = -1;
1199     Int_t size   = GetITSgeom()->GetIndexMax();
1200     TClonesArray** modA = new TClonesArray*[size];
1201     for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++) modA[mod] = new TClonesArray("AliITSpListItem", 10000);
1202
1203     AliLoader* loader =  (AliRunLoader::Instance())->GetLoader("ITSLoader");
1204     if (!loader){
1205         Error("Open","Can not get ITS loader from Run Loader");
1206         return kFALSE;
1207     }
1208
1209     TTree* tree = 0;
1210     tree = loader->TreeS();
1211     if (!tree){
1212         loader->MakeTree("S");
1213         tree = loader->TreeS();
1214     }
1215     //
1216     // Array for SDigits
1217     //
1218     TClonesArray aSDigits("AliITSpListItem",10000), *itsSDigits=&aSDigits;
1219     Int_t bufsize = 32000;
1220     tree->Branch("ITS", &itsSDigits, bufsize);
1221     Int_t npx = 0;
1222     //
1223     // SPD
1224     //
1225     AliITSsegmentationSPD* segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
1226     if(!segSPD){
1227       AliWarning("Set AliITS defaults");
1228       SetDefaults();
1229       segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
1230     }
1231     npx = segSPD->Npx();
1232     Double_t thr, sigma;
1233
1234     AliITSRawStreamSPD inputSPD(rawReader);
1235     while(1){
1236         Bool_t next  = inputSPD.Next();
1237         if (!next) break;
1238
1239         Int_t module = inputSPD.GetModuleID();
1240         Int_t column = inputSPD.GetColumn();
1241         Int_t row    = inputSPD.GetRow();
1242         Int_t index  = npx * column + row;
1243
1244         if (module >= size) continue;
1245
1246         last = (modA[module])->GetEntries();
1247         TClonesArray& dum = *modA[module];
1248         fDetTypeSim->GetSimuParam()->SPDThresholds(module,thr,sigma);
1249         thr += 1.;
1250         new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, thr);
1251     }
1252     rawReader->Reset();
1253
1254     //
1255     // SDD
1256     //
1257     AliITSsegmentationSDD* segSDD = (AliITSsegmentationSDD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(1);
1258     npx = segSDD->Npx();
1259     Int_t scalef=AliITSsimulationSDD::ScaleFourier(segSDD);
1260     Int_t firstSDD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(3,1,1);
1261     Int_t firstSSD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(5,1,1);
1262
1263     AliITSRawStream* inputSDD=AliITSRawStreamSDD::CreateRawStreamSDD(rawReader);
1264     for(Int_t iMod=firstSDD; iMod<firstSSD; iMod++){
1265       AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)fDetTypeSim->GetCalibrationModel(iMod);
1266       Bool_t isZeroSupp=cal->GetZeroSupp();
1267       if(isZeroSupp){
1268         for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,cal->GetZSLowThreshold(iSid));
1269      }else{
1270         for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,0);
1271       }
1272     }
1273
1274     AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
1275     inputSDD->SetDDLModuleMap(ddlmap);
1276     while(inputSDD->Next()){
1277         if(inputSDD->IsCompletedModule()==kFALSE &&
1278            inputSDD->IsCompletedDDL()==kFALSE){
1279
1280           Int_t module = inputSDD->GetModuleID();
1281           Int_t anode  = inputSDD->GetCoord1()+segSDD->NpzHalf()*inputSDD->GetChannel();
1282           Int_t time   = inputSDD->GetCoord2();
1283           Int_t signal10 = inputSDD->GetSignal();
1284           Int_t index = AliITSpList::GetIndex(anode,time,scalef*npx);
1285
1286           if (module >= size) continue;
1287           last = modA[module]->GetEntries();
1288           TClonesArray& dum = *modA[module];
1289           new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, Double_t(signal10));
1290           ((AliITSpListItem*) dum.At(last))->AddSignalAfterElect(module, index, Double_t(signal10));
1291         }
1292     }
1293     delete inputSDD;
1294     rawReader->Reset();
1295
1296     //
1297     // SSD
1298     //
1299     AliITSsegmentationSSD* segSSD = (AliITSsegmentationSSD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(2);
1300     npx = segSSD->Npx();
1301     AliITSRawStreamSSD inputSSD(rawReader);
1302     while(1){
1303         Bool_t next  = inputSSD.Next();
1304         if (!next) break;
1305
1306         Int_t module  = inputSSD.GetModuleID();
1307         Int_t side    = inputSSD.GetSideFlag();
1308         Int_t strip   = inputSSD.GetStrip();
1309         Int_t signal  = inputSSD.GetSignal();
1310         Int_t index  = npx * side + strip;
1311
1312         if (module >= size) continue;
1313
1314         last = modA[module]->GetEntries();
1315         TClonesArray& dum = *modA[module];
1316         new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, Double_t(signal));
1317     }
1318     rawReader->Reset();
1319      AliITSpListItem* sdig = 0;
1320
1321     for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++)
1322     {
1323         Int_t nsdig =  modA[mod]->GetEntries();
1324         for (Int_t ie = 0; ie < nsdig; ie++) {
1325             sdig = (AliITSpListItem*) (modA[mod]->At(ie));
1326             new (aSDigits[ie]) AliITSpListItem(-1, -1, mod, sdig->GetIndex(), sdig->GetSignal());
1327             Float_t sig = sdig->GetSignalAfterElect();
1328             if (sig > 0.) {
1329                 sdig = (AliITSpListItem*)aSDigits[ie];
1330                 sdig->AddSignalAfterElect(mod, sdig->GetIndex(), Double_t(sig));
1331             }
1332         }
1333
1334         tree->Fill();
1335         aSDigits.Clear();
1336         modA[mod]->Clear();
1337     }
1338     loader->WriteSDigits("OVERWRITE");
1339     delete modA;
1340     return kTRUE;
1341 }
1342
1343
1344 //______________________________________________________________________
1345 void AliITS::UpdateInternalGeometry(){
1346
1347   //reads new geometry from TGeo
1348 //   AliDebug(1,"Delete ITSgeom and create a new one reading TGeo");
1349
1350   AliITSVersion_t version = (AliITSVersion_t)IsVersion();
1351   Int_t minor = 0;
1352   if(version==kvPPRasymmFMD) minor=2;  // default minor version for this geom.
1353   AliITSInitGeometry initgeom;
1354   AliITSgeom* geom = initgeom.CreateAliITSgeom(version,minor);
1355   SetITSgeom(geom);
1356 }
1357 //______________________________________________________________________
1358 AliTriggerDetector* AliITS::CreateTriggerDetector() const {
1359   // create an AliITSTrigger object (and set trigger conditions as input)
1360   return new AliITSTrigger(fDetTypeSim->GetTriggerConditions());
1361 }