ITS/AliITS.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18
  19 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  20 //
  21 //      An overview of the basic philosophy of the ITS code development
  22 // and analysis is show in the figure below.
  23 //Begin_Html
  24 /*
  25 <img src="picts/ITS/ITS_Analysis_schema.gif">
  26 </pre>
  27 <br clear=left>
  28 <font size=+2 color=red>
  29 <p>Roberto Barbera is in charge of the ITS Offline code (1999).
  30 <a href="mailto:roberto.barbera@ct.infn.it">Roberto Barbera</a>.
  31 </font>
  32 <pre>
  33 */
  34 //End_Html
  35 //
  36 //  AliITS. Inner Traking System base class.
  37 //  This class contains the base procedures for the Inner Tracking System
  38 //
  39 //Begin_Html
  40 /*
  41 <img src="picts/ITS/AliITS_Class_Diagram.gif">
  42 </pre>
  43 <br clear=left>
  44 <font size=+2 color=red>
  45 <p>This show the class diagram of the different elements that are part of
  46 the AliITS class.
  47 </font>
  48 <pre>
  49 */
  50 //End_Html
  51 //
  52 // Version: 0
  53 // Written by Rene Brun, Federico Carminati, and Roberto Barbera
  54 //
  55 // Version: 1
  56 // Modified and documented by Bjorn S. Nilsen
  57 // July 11 1999
  58 //
  59 // Version: 2
  60 // Modified and documented by A. Bologna
  61 // October 18 1999
  62 //
  63 // AliITS is the general base class for the ITS. Also see AliDetector for
  64 // futher information.
  65 //
  66 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  67
  68 #include <Riostream.h>
  69 #include <stdlib.h>
  70
  71 #include <TBranch.h>
  72 #include <TClonesArray.h>
  73 #include <TFile.h>
  74 #include <TMath.h>
  75 #include <TObjectTable.h>
  76 #include <TROOT.h>
  77 #include <TRandom.h>
  78 #include <TString.h>
  79 #include <TTree.h>
  80 #include <TVector.h>
  81 #include <TVirtualMC.h>
  82
  83 #include "AliConfig.h"
  84 #include "AliHeader.h"
  85 #include "AliITS.h"
  86 #include "AliITSClusterFinderSDD.h"
  87 #include "AliITSClusterFinderSPD.h"
  88 #include "AliITSClusterFinderSSD.h"
  89 #include "AliITSDetType.h"
  90 #include "AliITSLoader.h"
  91 #include "AliITSRawClusterSPD.h"
  92 #include "AliITSRawClusterSDD.h"
  93 #include "AliITSRawClusterSSD.h"
  94 #include "AliITSRecPoint.h"
  95 #include "AliITSdigit.h"
  96 #include "AliITSgeom.h"
  97 #include "AliITShit.h"
  98 #include "AliITSmodule.h"
  99 #include "AliITSpList.h"
 100 #include "AliITSresponseSDD.h"
 101 #include "AliITSresponseSPD.h"
 102 #include "AliITSresponseSSD.h"
 103 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
 104 #include "AliITSsegmentationSPD.h"
 105 #include "AliITSsegmentationSSD.h"
 106 #include "AliITSsimulationSDD.h"
 107 #include "AliITSsimulationSPD.h"
 108 #include "AliITSsimulationSSD.h"
 109 #include "AliMC.h"
 110 #include "AliITSDigitizer.h"
 111
 112 ClassImp(AliITS)
 113
 114 //______________________________________________________________________
 115 AliITS::AliITS() : AliDetector() {
 116     // Default initializer for ITS
 117     //      The default constructor of the AliITS class. In addition to
 118     // creating the AliITS class it zeros the variables fIshunt (a member
 119     // of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros the pointers
 120     // fITSpoints, fIdSens, and fIdName. The AliDetector default constructor
 121     // is also called.
 122     // Inputs:
 123     //      none.
 124     // Outputs:
 125     //      none.
 126     // Return:
 127     //      Blank ITS class.
 128
 129     fIshunt     = 0;   // not zeroed in AliDetector.
 130
 131     // AliITS variables.
 132     fEuclidOut  = 0;
 133     fITSgeom    = 0;
 134     fITSmodules = 0;
 135     fOpt        = "All";
 136 //    SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 137
 138     fIdN        = 0;
 139     fIdName     = 0;
 140     fIdSens     = 0;
 141
 142     fNDetTypes  = kNTYPES;
 143     fDetTypes   = 0;
 144
 145     fSDigits    = 0;
 146     fNSDigits   = 0;
 147
 148     fNdtype     = 0;
 149     fDtype      = 0;
 150
 151     fCtype      = 0;
 152     fNctype     = 0;
 153
 154     fRecPoints  = 0;
 155     fNRecPoints = 0;
 156
 157     SetMarkerColor(kRed);
 158 }
 159 //______________________________________________________________________
 160 AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):AliDetector(name,title){
 161     //     The standard Constructor for the ITS class. In addition to
 162     // creating the AliITS class, it allocates memory for the TClonesArrays
 163     // fHits, fSDigits, fDigits, fITSpoints, and the TObjArray of fCtype
 164     // (clusters). It also zeros the variables
 165     // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros
 166     // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
 167     // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
 168     // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
 169     // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
 170     // class for a description of these parameters and its constructor
 171     // functions.
 172     // Inputs:
 173     //      const char *name      Detector name. Should always be "ITS"
 174     //      const char *title     Detector title.
 175     // Outputs:
 176     //      none.
 177     // Return:
 178     //      An ITS class.
 179
 180     fIshunt     = 0;  // not zeroed in AliDetector
 181     fHits       = new TClonesArray("AliITShit", 1560);//not done in AliDetector
 182     gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);  // Not done in AliDetector.
 183
 184     fEuclidOut  = 0;
 185     fITSgeom    = 0;
 186     fITSmodules = 0;
 187     SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 188
 189     fIdN        = 0;
 190     fIdName     = 0;
 191     fIdSens     = 0;
 192
 193     fNDetTypes  = kNTYPES;
 194     fDetTypes   = new TObjArray(fNDetTypes);
 195
 196     fSDigits    = new TClonesArray("AliITSpListItem",1000);
 197     fNSDigits   = 0;
 198
 199     fNdtype     = new Int_t[fNDetTypes];
 200     fDtype      = new TObjArray(fNDetTypes);
 201
 202     fCtype      = new TObjArray(fNDetTypes);
 203     fNctype     = new Int_t[fNDetTypes];
 204
 205     fRecPoints  = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
 206     fNRecPoints = 0;
 207
 208     Int_t i;
 209     for(i=0;i<fNDetTypes;i++) {
 210         fDetTypes->AddAt(new AliITSDetType(),i);
 211         fNdtype[i] = 0;
 212         fNctype[i] = 0;
 213     } // end for i
 214
 215     SetMarkerColor(kRed);
 216
 217 }
 218 //______________________________________________________________________
 219 AliITS::~AliITS(){
 220     // Default destructor for ITS.
 221     //     The default destructor of the AliITS class. In addition to deleting
 222     // the AliITS class it deletes the memory pointed to by the fHits, fDigits,
 223     // fSDigits, fCtype, fITSmodules, fITSgeom, fRecPoints, fIdSens, fIdName,
 224     // fITSpoints, fDetType and it's contents.
 225     // Inputs:
 226     //      none.
 227     // Outputs:
 228     //      none.
 229     // Return:
 230     //      none.
 231
 232     if (fHits) {
 233       fHits->Delete();
 234       delete fHits;
 235       fHits=0;
 236     }
 237     if (fSDigits) {
 238       fSDigits->Delete();
 239       delete fSDigits;
 240       fSDigits=0;
 241     }
 242     if (fDigits) {
 243       fDigits->Delete();
 244       delete fDigits;
 245       fDigits=0;
 246     }
 247     if (fRecPoints) {
 248       fRecPoints->Delete();
 249       delete fRecPoints;
 250       fRecPoints=0;
 251     }
 252     delete[] fIdName;  // Array of TStrings
 253     delete[] fIdSens;
 254     if(fITSmodules) {
 255         this->ClearModules();
 256         delete fITSmodules;
 257         fITSmodules = 0;
 258     }// end if fITSmodules!=0
 259
 260     if(fDtype) {
 261         fDtype->Delete();
 262         delete fDtype;
 263     } // end if fDtype
 264     delete [] fNdtype;
 265     if (fCtype) {
 266         fCtype->Delete();
 267         delete fCtype;
 268         fCtype = 0;
 269     } // end if fCtype
 270     delete [] fNctype;
 271
 272     if (fDetTypes) {
 273         fDetTypes->Delete();
 274         delete fDetTypes;
 275         fDetTypes = 0;
 276     } // end if fDetTypes
 277
 278
 279     if (fITSgeom) delete fITSgeom;
 280 }
 281 //______________________________________________________________________
 282 AliITS::AliITS(const AliITS &source) : AliDetector(source){
 283     // Copy constructor. This is a function which is not allowed to be
 284     // done to the ITS. It exits with an error.
 285     // Inputs:
 286     //      AliITS &source  An AliITS class.
 287     // Outputs:
 288     //      none.
 289     // Return:
 290     //      none.
 291
 292     if(this==&source) return;
 293     Error("Copy constructor",
 294           "You are not allowed to make a copy of the AliITS");
 295     exit(1);
 296 }
 297 //______________________________________________________________________
 298 AliITS& AliITS::operator=(AliITS &source){
 299     // Assignment operator. This is a function which is not allowed to be
 300     // done to the ITS. It exits with an error.
 301     // Inputs:
 302     //      AliITS &source  An AliITS class.
 303     // Outputs:
 304     //      none.
 305     // Return:
 306     //      none.
 307
 308     if(this==&source) return *this;
 309     Error("operator=","You are not allowed to make a copy of the AliITS");
 310     exit(1);
 311     return *this; //fake return
 312 }
 313 //______________________________________________________________________
 314 Int_t AliITS::DistancetoPrimitive(Int_t,Int_t) const{
 315     // Distance from mouse to ITS on the screen. Dummy routine
 316     //     A dummy routine used by the ROOT macro display.C to allow for the
 317     // use of the mouse (pointing device) in the macro. In general this should
 318     // never be called. If it is it returns the number 9999 for any value of
 319     // x and y.
 320     // Inputs:
 321     //      Int_t     Dummy screen coordinate.
 322     //      Int_t     Dummy screen coordinate.
 323     // Outputs:
 324     //      none.
 325     // Return:
 326     //      Int_t     Dummy = 9999 distance to ITS.
 327
 328     return 9999;
 329 }
 330 //______________________________________________________________________
 331 void AliITS::Init(){
 332     // Initializer ITS after it has been built
 333     //     This routine initializes the AliITS class. It is intended to be
 334     // called from the Init function in AliITSv?. Besides displaying a banner
 335     // indicating that it has been called it initializes the array fIdSens
 336     // and sets the default segmentation, response, digit and raw cluster
 337     // classes therefore it should be called after a call to CreateGeometry.
 338     // Inputs:
 339     //      none.
 340     // Outputs:
 341     //      none.
 342     // Return:
 343     //      none.
 344     Int_t i;
 345
 346     SetDefaults();
 347     // Array of TStrings
 348     for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = gMC->VolId(fIdName[i]);
 349 }
 350 //______________________________________________________________________
 351 void AliITS::SetDefaults(){
 352     // sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes.
 353     // Inputs:
 354     //      none.
 355     // Outputs:
 356     //      none.
 357     // Return:
 358     //      none.
 359
 360     if(fDebug) printf("%s: SetDefaults\n",ClassName());
 361
 362     AliITSDetType *iDetType;
 363
 364     //SPD
 365     iDetType=DetType(0);
 366     if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
 367         AliITSsegmentationSPD *seg0=new AliITSsegmentationSPD(fITSgeom);
 368         SetSegmentationModel(0,seg0);
 369     } // end if
 370     if (!iDetType->GetResponseModel()) {
 371         SetResponseModel(0,new AliITSresponseSPD());
 372     } // end if
 373     // set digit and raw cluster classes to be used
 374
 375     const char *kData0=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
 376     if (strstr(kData0,"real")) {
 377         iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSPD");
 378     } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSPD","AliITSRawClusterSPD");
 379
 380     // SDD
 381     iDetType=DetType(1);
 382     if (!iDetType->GetResponseModel()) {
 383         SetResponseModel(1,new AliITSresponseSDD("simulated"));
 384     } // end if
 385     AliITSresponse *resp1=iDetType->GetResponseModel();
 386     if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
 387         AliITSsegmentationSDD *seg1=new AliITSsegmentationSDD(fITSgeom,resp1);
 388         SetSegmentationModel(1,seg1);
 389     } // end if
 390     const char *kData1=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
 391     const char *kopt=iDetType->GetResponseModel()->ZeroSuppOption();
 392     if((!strstr(kopt,"2D"))&&(!strstr(kopt,"1D")) || strstr(kData1,"real") ){
 393         iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSDD");
 394     } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSDD","AliITSRawClusterSDD");
 395
 396     // SSD
 397     iDetType=DetType(2);
 398     if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
 399         AliITSsegmentationSSD *seg2=new AliITSsegmentationSSD(fITSgeom);
 400         SetSegmentationModel(2,seg2);
 401     } // end if
 402     if (!iDetType->GetResponseModel()) {
 403         SetResponseModel(2,new AliITSresponseSSD("simulated"));
 404     } // end if
 405     const char *kData2=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
 406     if (strstr(kData2,"real")) {
 407         iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSSD");
 408     } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSSD","AliITSRawClusterSSD");
 409
 410     if (kNTYPES>3) {
 411         Warning("SetDefaults",
 412                 "Only the three basic detector types are initialized!");
 413     }  // end if
 414 }
 415 //______________________________________________________________________
 416 void AliITS::SetDefaultSimulation(){
 417     // sets the default simulation.
 418     // Inputs:
 419     //      none.
 420     // Outputs:
 421     //      none.
 422     // Return:
 423     //      none.
 424
 425     AliITSDetType *iDetType;
 426     AliITSsimulation *sim;
 427     iDetType=DetType(0);
 428     sim = iDetType->GetSimulationModel();
 429     if (!sim) {
 430         AliITSsegmentation *seg0=
 431             (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel();
 432         AliITSresponse *res0 = (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel();
 433         AliITSsimulationSPD *sim0=new AliITSsimulationSPD(seg0,res0);
 434         SetSimulationModel(0,sim0);
 435     }else{ // simulation exists, make sure it is set up properly.
 436         ((AliITSsimulationSPD*)sim)->Init(
 437             (AliITSsegmentationSPD*) iDetType->GetSegmentationModel(),
 438             (AliITSresponseSPD*) iDetType->GetResponseModel());
 439 //        if(sim->GetResponseModel()==0) sim->SetResponseModel(
 440 //            (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel());
 441 //        if(sim->GetSegmentationModel()==0) sim->SetSegmentationModel(
 442 //            (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel());
 443     } // end if
 444     iDetType=DetType(1);
 445     sim = iDetType->GetSimulationModel();
 446     if (!sim) {
 447         AliITSsegmentation *seg1=
 448             (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel();
 449         AliITSresponse *res1 = (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel();
 450         AliITSsimulationSDD *sim1=new AliITSsimulationSDD(seg1,res1);
 451         SetSimulationModel(1,sim1);
 452     }else{ // simulation exists, make sure it is set up properly.
 453         ((AliITSsimulationSDD*)sim)->Init(
 454             (AliITSsegmentationSDD*) iDetType->GetSegmentationModel(),
 455             (AliITSresponseSDD*) iDetType->GetResponseModel());
 456 //        if(sim->GetResponseModel()==0) sim->SetResponseModel(
 457 //            (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel());
 458 //        if(sim->GetSegmentationModel()==0) sim->SetSegmentationModel(
 459 //            (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel());
 460     } //end if
 461     iDetType=DetType(2);
 462     sim = iDetType->GetSimulationModel();
 463     if (!sim) {
 464         AliITSsegmentation *seg2=
 465             (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel();
 466         AliITSresponse *res2 = (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel();
 467         AliITSsimulationSSD *sim2=new AliITSsimulationSSD(seg2,res2);
 468         SetSimulationModel(2,sim2);
 469     }else{ // simulation exists, make sure it is set up properly.
 470         ((AliITSsimulationSSD*)sim)->Init(
 471             (AliITSsegmentationSSD*) iDetType->GetSegmentationModel(),
 472             (AliITSresponseSSD*) iDetType->GetResponseModel());
 473 //        if(sim->GetResponseModel()==0) sim->SetResponseModel(
 474 //            (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel());
 475 //        if(sim->GetSegmentationModel()==0) sim->SetSegmentationModel(
 476 //            (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel());
 477     } // end if
 478 }
 479 //______________________________________________________________________
 480 void AliITS::SetDefaultClusterFinders(){
 481     // Sets the default cluster finders. Used in finding RecPoints.
 482     // Inputs:
 483     //      none.
 484     // Outputs:
 485     //      none.
 486     // Return:
 487     //      none.
 488
 489     MakeTreeC();
 490     AliITSDetType *iDetType;
 491
 492     // SPD
 493     iDetType=DetType(0);
 494     if (!iDetType->GetReconstructionModel()) {
 495         AliITSsegmentation *seg0 =
 496             (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel();
 497         TClonesArray *dig0=DigitsAddress(0);
 498         TClonesArray *recp0=ClustersAddress(0);
 499         AliITSClusterFinderSPD *rec0 = new AliITSClusterFinderSPD(seg0,dig0,
 500                                                                   recp0);
 501         SetReconstructionModel(0,rec0);
 502     } // end if
 503
 504     // SDD
 505     iDetType=DetType(1);
 506     if (!iDetType->GetReconstructionModel()) {
 507         AliITSsegmentation *seg1 =
 508             (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel();
 509         AliITSresponse *res1 = (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel();
 510         TClonesArray *dig1=DigitsAddress(1);
 511         TClonesArray *recp1=ClustersAddress(1);
 512         AliITSClusterFinderSDD *rec1 =
 513             new AliITSClusterFinderSDD(seg1,res1,dig1,recp1);
 514       SetReconstructionModel(1,rec1);
 515     } // end if
 516
 517     // SSD
 518     iDetType=DetType(2);
 519     if (!iDetType->GetReconstructionModel()) {
 520         AliITSsegmentation *seg2=
 521             (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel();
 522         TClonesArray *dig2=DigitsAddress(2);
 523         AliITSClusterFinderSSD *rec2= new AliITSClusterFinderSSD(seg2,dig2);
 524         SetReconstructionModel(2,rec2);
 525     } // end if
 526 }
 527 //______________________________________________________________________
 528 void AliITS::MakeBranch(Option_t* option){
 529     // Creates Tree branches for the ITS.
 530     // Inputs:
 531     //      Option_t *option    String of Tree types S,D, and/or R.
 532     //      const char *file    String of the file name where these branches
 533     //                          are to be stored. If blank then these branches
 534     //                          are written to the same tree as the Hits were
 535     //                          read from.
 536     // Outputs:
 537     //      none.
 538     // Return:
 539     //      none.
 540     Bool_t cH = (strstr(option,"H")!=0);
 541     Bool_t cS = (strstr(option,"S")!=0);
 542     Bool_t cD = (strstr(option,"D")!=0);
 543     Bool_t cR = (strstr(option,"R")!=0);
 544     Bool_t cRF = (strstr(option,"RF")!=0);
 545
 546     if(cRF)cR = kFALSE;
 547     if(cH && (fHits == 0x0)) fHits  = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 548
 549     AliDetector::MakeBranch(option);
 550
 551     if(cS) MakeBranchS(0);
 552     if(cD) MakeBranchD(0);
 553     if(cR) MakeBranchR(0);
 554     if(cRF) MakeBranchRF(0);
 555 }
 556 //______________________________________________________________________
 557 void AliITS::SetTreeAddress(){
 558     // Set branch address for the Trees.
 559     // Inputs:
 560     //      none.
 561     // Outputs:
 562     //      none.
 563     // Return:
 564     //      none.
 565     TTree *treeS = fLoader->TreeS();
 566     TTree *treeD = fLoader->TreeD();
 567     TTree *treeR = fLoader->TreeR();
 568     if (fLoader->TreeH() && (fHits == 0x0)) fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 569
 570     AliDetector::SetTreeAddress();
 571
 572     SetTreeAddressS(treeS);
 573     SetTreeAddressD(treeD);
 574     SetTreeAddressR(treeR);
 575 }
 576 //______________________________________________________________________
 577 AliITSDetType* AliITS::DetType(Int_t id){
 578     // Return pointer to id detector type.
 579     // Inputs:
 580     //      Int_t id   detector id number.
 581     // Outputs:
 582     //      none.
 583     // Return:
 584     //      returned, a pointer to a AliITSDetType.
 585
 586     return ((AliITSDetType*) fDetTypes->At(id));
 587 }
 588 //______________________________________________________________________
 589 void AliITS::SetResponseModel(Int_t id, AliITSresponse *response){
 590     // Set the response model for the id detector type.
 591     // Inputs:
 592     //      Int_t id        detector id number.
 593     //      AliITSresponse* a pointer containing an instance of AliITSresponse
 594     //                      to be stored/owned b y AliITSDetType.
 595     // Outputs:
 596     //      none.
 597     // Return:
 598     //      none.
 599
 600     ((AliITSDetType*) fDetTypes->At(id))->ResponseModel(response);
 601 }
 602 //______________________________________________________________________
 603 void AliITS::SetSegmentationModel(Int_t id, AliITSsegmentation *seg){
 604     // Set the segmentation model for the id detector type.
 605     // Inputs:
 606     //      Int_t id            detector id number.
 607     //      AliITSsegmentation* a pointer containing an instance of
 608     //                          AliITSsegmentation to be stored/owned b y
 609     //                          AliITSDetType.
 610     // Outputs:
 611     //      none.
 612     // Return:
 613     //      none.
 614
 615     ((AliITSDetType*) fDetTypes->At(id))->SegmentationModel(seg);
 616 }
 617 //______________________________________________________________________
 618 void AliITS::SetSimulationModel(Int_t id, AliITSsimulation *sim){
 619     // Set the simulation model for the id detector type.
 620     // Inputs:
 621     //      Int_t id        detector id number.
 622     //      AliITSresponse* a pointer containing an instance of AliITSresponse
 623     //                      to be stored/owned b y AliITSDetType.
 624     // Outputs:
 625     //      none.
 626     // Return:
 627     //      none.
 628
 629    ((AliITSDetType*) fDetTypes->At(id))->SimulationModel(sim);
 630
 631 }
 632 //______________________________________________________________________
 633 void AliITS::SetReconstructionModel(Int_t id, AliITSClusterFinder *reconst){
 634     // Set the cluster finder model for the id detector type.
 635     // Inputs:
 636     //      Int_t id             detector id number.
 637     //      AliITSClusterFinder* a pointer containing an instance of
 638     //                           AliITSClusterFinder to be stored/owned b y
 639     //                           AliITSDetType.
 640     // Outputs:
 641     //      none.
 642     // Return:
 643     //      none.
 644
 645     ((AliITSDetType*) fDetTypes->At(id))->ReconstructionModel(reconst);
 646 }
 647 //______________________________________________________________________
 648 void AliITS::SetClasses(Int_t id, const char *digit, const char *cluster){
 649     // Set the digit and cluster classes name to be used for the id detector
 650     // type.
 651     // Inputs:
 652     //      Int_t id            detector id number.
 653     //      const char *digit   Digit class name for detector id.
 654     //      const char *cluster Cluster class name for detector id.
 655     // Outputs:
 656     //      none.
 657     // Return:
 658     //      none.
 659
 660     ((AliITSDetType*) fDetTypes->At(id))->ClassNames(digit,cluster);
 661 }
 662 //______________________________________________________________________
 663 void AliITS::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits){
 664     // Add an ITS hit
 665     //     The function to add information to the AliITShit class. See the
 666     // AliITShit class for a full description. This function allocates the
 667     // necessary new space for the hit information and passes the variable
 668     // track, and the pointers *vol and *hits to the AliITShit constructor
 669     // function.
 670     // Inputs:
 671     //      Int_t   track   Track number which produced this hit.
 672     //      Int_t   *vol    Array of Integer Hit information. See AliITShit.h
 673     //      Float_t *hits   Array of Floating Hit information.  see AliITShit.h
 674     // Outputs:
 675     //      none.
 676     // Return:
 677     //      none.
 678
 679     TClonesArray &lhits = *fHits;
 680     new(lhits[fNhits++]) AliITShit(fIshunt,track,vol,hits);
 681 }
 682 //______________________________________________________________________
 683 void AliITS::InitModules(Int_t size,Int_t &nmodules){
 684     // Initialize the modules array.
 685     // Inputs:
 686     //      Int_t size  Size of array of the number of modules to be
 687     //                  created. If size <=0 then the number of modules
 688     //                  is gotten from AliITSgeom class kept in fITSgeom.
 689     // Outputs:
 690     //      Int_t &nmodules The number of modules existing.
 691     // Return:
 692     //      none.
 693
 694     if(fITSmodules){
 695         fITSmodules->Delete();
 696         delete fITSmodules;
 697     } // end fir fITSmoudles
 698
 699     Int_t nl,indexMAX,index;
 700
 701     if(size<=0){ // default to using data stored in AliITSgeom
 702         if(fITSgeom==0) {
 703             Error("InitModules","fITSgeom not defined");
 704             return;
 705         } // end if fITSgeom==0
 706         nl = fITSgeom->GetNlayers();
 707         indexMAX = fITSgeom->GetModuleIndex(nl,fITSgeom->GetNladders(nl),
 708                                             fITSgeom->GetNdetectors(nl))+1;
 709         nmodules = indexMAX;
 710         fITSmodules = new TObjArray(indexMAX);
 711         for(index=0;index<indexMAX;index++){
 712             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 713         } // end for index
 714     }else{
 715         fITSmodules = new TObjArray(size);
 716         for(index=0;index<size;index++) {
 717             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 718         } // end for index
 719
 720         nmodules = size;
 721     } // end i size<=0
 722 }
 723 //______________________________________________________________________
 724 void AliITS::FillModules(Int_t evnt,Int_t bgrev,Int_t nmodules,
 725                          Option_t *option,Text_t *filename){
 726     // fill the modules with the sorted by module hits; add hits from
 727     // background if option=Add.
 728     // Inputs:
 729     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 730     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 731     //      Int_t nmodules   Not used.
 732     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
 733     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 734     //                       background hits are considered.
 735     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
 736     // Outputs:
 737     //      none.
 738     // Return:
 739     //      none.
 740     static TTree *trH1;                 //Tree with background hits
 741     static Bool_t first=kTRUE;
 742     static TFile *file;
 743     const char *addBgr = strstr(option,"Add");
 744
 745     evnt = nmodules; // Dummy use of variables to remove warnings
 746     if (addBgr ) {
 747         if(first) {
 748             file=new TFile(filename);
 749         } // end if first
 750         first=kFALSE;
 751         file->cd();
 752         file->ls();
 753         // Get Hits Tree header from file
 754         if(trH1) delete trH1;
 755         trH1=0;
 756
 757         char treeName[20];
 758         sprintf(treeName,"TreeH%d",bgrev);
 759         trH1 = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 760         if (!trH1) {
 761             Error("FillModules","cannot find Hits Tree for event:%d",bgrev);
 762         } // end if !trH1
 763         // Set branch addresses
 764     } // end if addBgr
 765
 766     FillModules(fLoader->TreeH(),0); // fill from this file's tree.
 767
 768     if (addBgr ) {
 769         FillModules(trH1,10000000); // Default mask 10M.
 770         TTree *fAli=fLoader->GetRunLoader()->TreeK();
 771         TFile *fileAli=0;
 772         if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
 773         fileAli->cd();
 774     } // end if add
 775 }
 776 //______________________________________________________________________
 777 void AliITS::FillModules(TTree *treeH, Int_t mask) {
 778     // fill the modules with the sorted by module hits;
 779     // can be called many times to do a merging
 780     // Inputs:
 781     //      TTree *treeH  The tree containing the hits to be copied into
 782     //                    the modules.
 783     //      Int_t mask    The track number mask to indecate which file
 784     //                    this hits came from.
 785     // Outputs:
 786     //      none.
 787     // Return:
 788     //      none.
 789
 790     if (treeH == 0x0)
 791      {
 792        Error("FillModules","Tree is NULL");
 793      }
 794     Int_t lay,lad,det,index;
 795     AliITShit *itsHit=0;
 796     AliITSmodule *mod=0;
 797     char branchname[20];
 798     sprintf(branchname,"%s",GetName());
 799     TBranch *branch = treeH->GetBranch(branchname);
 800     if (!branch) {
 801         Error("FillModules","%s branch in TreeH not found",branchname);
 802         return;
 803     } // end if !branch
 804     branch->SetAddress(&fHits);
 805     Int_t nTracks =(Int_t) treeH->GetEntries();
 806     Int_t iPrimTrack,h;
 807     for(iPrimTrack=0; iPrimTrack<nTracks; iPrimTrack++){
 808         ResetHits();
 809         Int_t nBytes = treeH->GetEvent(iPrimTrack);
 810         if (nBytes <= 0) continue;
 811         Int_t nHits = fHits->GetEntriesFast();
 812         for(h=0; h<nHits; h++){
 813             itsHit = (AliITShit *)fHits->UncheckedAt(h);
 814             itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
 815             if (fITSgeom) {
 816                 index = fITSgeom->GetModuleIndex(lay,lad,det);
 817             } else {
 818                 index=det-1; // This should not be used.
 819             } // end if [You must have fITSgeom for this to work!]
 820             mod = GetModule(index);
 821             itsHit->SetTrack(itsHit->GetTrack()+mask); // Set track mask.
 822             mod->AddHit(itsHit,iPrimTrack,h);
 823         } // end loop over hits
 824     } // end loop over tracks
 825 }
 826 //______________________________________________________________________
 827 void AliITS::ClearModules(){
 828     // Clear the modules TObjArray.
 829     // Inputs:
 830     //      none.
 831     // Outputs:
 832     //      none.
 833
 834     if(fITSmodules) fITSmodules->Delete();
 835 }
 836 //______________________________________________________________________
 837 void AliITS::MakeBranchS(const char *fl){
 838     // Creates Tree Branch for the ITS summable digits.
 839     // Inputs:
 840     //      cont char *fl  File name where SDigits branch is to be written
 841     //                     to. If blank it write the SDigits to the same
 842     //                     file in which the Hits were found.
 843     // Outputs:
 844     //      none.
 845     // Return:
 846     //      none.
 847     Int_t buffersize = 4000;
 848     char branchname[30];
 849
 850     // only one branch for SDigits.
 851     sprintf(branchname,"%s",GetName());
 852
 853
 854     if(fLoader->TreeS()){
 855         if (fSDigits == 0x0)  fSDigits  = new TClonesArray("AliITSpListItem",1000);
 856         MakeBranchInTree(fLoader->TreeS(),branchname,&fSDigits,buffersize,fl);
 857     } // end if
 858 }
 859 //______________________________________________________________________
 860 void AliITS::SetTreeAddressS(TTree *treeS){
 861     // Set branch address for the ITS summable digits Trees.
 862     // Inputs:
 863     //      TTree *treeS   Tree containing the SDigits.
 864     // Outputs:
 865     //      none.
 866     // Return:
 867     //      none.
 868     char branchname[30];
 869
 870     if(!treeS) return;
 871     if (fSDigits == 0x0)  fSDigits = new TClonesArray("AliITSpListItem",1000);
 872     TBranch *branch;
 873     sprintf(branchname,"%s",GetName());
 874     branch = treeS->GetBranch(branchname);
 875     if (branch) branch->SetAddress(&fSDigits);
 876 }
 877 //______________________________________________________________________
 878 void AliITS::MakeBranchInTreeD(TTree *treeD,const char *file){
 879     // Creates Tree branches for the ITS.
 880     // Inputs:
 881     //      TTree     *treeD Pointer to the Digits Tree.
 882     //      cont char *file  File name where Digits branch is to be written
 883     //                       to. If blank it write the SDigits to the same
 884     //                       file in which the Hits were found.
 885     // Outputs:
 886     //      none.
 887     // Return:
 888     //      none.
 889     Int_t buffersize = 4000;
 890     char branchname[30];
 891
 892     sprintf(branchname,"%s",GetName());
 893     // one branch for digits per type of detector
 894     const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 895     char digclass[40];
 896     char clclass[40];
 897     Int_t i;
 898     for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
 899         DetType(i)->GetClassNames(digclass,clclass);
 900         // digits
 901         if (fDtype == 0x0) fDtype = new TObjArray(fNDetTypes);
 902         if(!(fDtype->At(i))) fDtype->AddAt(new TClonesArray(digclass,1000),i);
 903         else ResetDigits(i);
 904     } // end for i
 905     for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
 906         if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
 907         else  sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 908         if (fDtype && treeD) {
 909             MakeBranchInTree(treeD, branchname, &((*fDtype)[i]),buffersize,file);
 910         } // end if
 911     } // end for i
 912 }
 913 //______________________________________________________________________
 914 void AliITS::SetTreeAddressD(TTree *treeD){
 915     // Set branch address for the Trees.
 916     // Inputs:
 917     //      TTree *treeD   Tree containing the Digits.
 918     // Outputs:
 919     //      none.
 920     // Return:
 921     //      none.
 922     char branchname[30];
 923     const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 924     TBranch *branch;
 925     char digclass[40];
 926     char clclass[40];
 927     Int_t i;
 928
 929     if(!treeD) return;
 930     for (i=0; i<kNTYPES; i++) {
 931         DetType(i)->GetClassNames(digclass,clclass);
 932         // digits
 933         if (fDtype == 0x0) fDtype = new TObjArray(fNDetTypes);
 934         if(!(fDtype->At(i))) fDtype->AddAt(new TClonesArray(digclass,1000),i);
 935         else ResetDigits(i);
 936         if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
 937         else  sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 938         if (fDtype) {
 939             branch = treeD->GetBranch(branchname);
 940             if (branch) branch->SetAddress(&((*fDtype)[i]));
 941         } // end if fDtype
 942     } // end for i
 943 }
 944 //______________________________________________________________________
 945 void AliITS::Hits2SDigits(){
 946     // Standard Hits to summable Digits function.
 947     // Inputs:
 948     //      none.
 949     // Outputs:
 950     //      none.
 951
 952 //    return; // Using Hits in place of the larger sDigits.
 953     fLoader->LoadHits("read");
 954     fLoader->LoadSDigits("recreate");
 955     AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
 956
 957     for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
 958     // Do the Hits to Digits operation. Use Standard input values.
 959     // Event number from file, no background hit merging , use size from
 960     // AliITSgeom class, option="All", input from this file only.
 961       rl->GetEvent(iEvent);
 962       if (!fLoader->TreeS()) fLoader->MakeTree("S");
 963       MakeBranch("S");
 964       SetTreeAddress();
 965       HitsToSDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
 966     }
 967
 968     fLoader->UnloadHits();
 969     fLoader->UnloadSDigits();
 970 }
 971 //______________________________________________________________________
 972 void AliITS::Hits2PreDigits(){
 973     // Standard Hits to summable Digits function.
 974     // Inputs:
 975     //      none.
 976     // Outputs:
 977     //      none.
 978
 979     AliHeader *header=fLoader->GetRunLoader()->GetHeader(); // Get event number from this file.
 980     // Do the Hits to Digits operation. Use Standard input values.
 981     // Event number from file, no background hit merging , use size from
 982     // AliITSgeom class, option="All", input from this file only.
 983     HitsToPreDigits(header->GetEvent(),0,-1," ",fOpt," ");
 984 }
 985 //______________________________________________________________________
 986 AliDigitizer* AliITS::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager) const
 987 {
 988   return new AliITSDigitizer(manager);
 989 }
 990 //______________________________________________________________________
 991 void AliITS::SDigitsToDigits(Option_t *opt){
 992     // Standard Summable digits to Digits function.
 993     // Inputs:
 994     //      none.
 995     // Outputs:
 996     //      none.
 997     char name[20] = {0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0};
 998
 999     if(!GetITSgeom()) return; // need transformations to do digitization.
1000     AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1001
1002     const char *all = strstr(opt,"All");
1003     const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
1004                           strstr(opt,"SSD")};
1005     if( !det[0] && !det[1] && !det[2] ) all = "All";
1006     else all = 0;
1007     static Bool_t setDef=kTRUE;
1008     if (setDef) SetDefaultSimulation();
1009     setDef=kFALSE;
1010
1011     AliITSsimulation *sim      = 0;
1012     AliITSDetType    *iDetType = 0;
1013     TTree            *trees    = fLoader->TreeS();
1014     if( !(trees && this->GetSDigits()) ){
1015         Error("SDigits2Digits","Error: No trees or SDigits. Returning.");
1016         return;
1017     } // end if
1018     sprintf( name, "%s", this->GetName() );
1019     TBranch *brchSDigits = trees->GetBranch( name );
1020
1021     Int_t id,module;
1022     for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
1023         id       = geom->GetModuleType(module);
1024         if (!all && !det[id]) continue;
1025         iDetType = DetType(id);
1026         sim      = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
1027         if (!sim) {
1028             Error("SDigit2Digits",
1029                   "The simulation class was not instanciated!");
1030             exit(1);
1031         } // end if !sim
1032         sim->InitSimulationModule(module,gAlice->GetEvNumber());
1033 //
1034         // add summable digits to module
1035         this->GetSDigits()->Clear();
1036         brchSDigits->GetEvent(module);
1037         sim->AddSDigitsToModule(GetSDigits(),0);
1038 //
1039         // Digitise current module sum(SDigits)->Digits
1040         sim->FinishSDigitiseModule();
1041
1042         // fills all branches - wasted disk space
1043         fLoader->TreeD()->Fill();
1044         this->ResetDigits();
1045     } // end for module
1046
1047     fLoader->TreeD()->GetEntries();
1048
1049     fLoader->TreeD()->AutoSave();
1050     // reset tree
1051     fLoader->TreeD()->Reset();
1052
1053 }
1054 //______________________________________________________________________
1055 void AliITS::Hits2Digits(){
1056     // Standard Hits to Digits function.
1057     // Inputs:
1058     //      none.
1059     // Outputs:
1060     //      none.
1061
1062     fLoader->LoadHits("read");
1063     fLoader->LoadDigits("recreate");
1064     AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
1065
1066     for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
1067     // Do the Hits to Digits operation. Use Standard input values.
1068     // Event number from file, no background hit merging , use size from
1069     // AliITSgeom class, option="All", input from this file only.
1070       rl->GetEvent(iEvent);
1071       if (!fLoader->TreeD()) fLoader->MakeTree("D");
1072       MakeBranch("D");
1073       SetTreeAddress();
1074       HitsToDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
1075     }
1076
1077     fLoader->UnloadHits();
1078     fLoader->UnloadDigits();
1079 }
1080 //______________________________________________________________________
1081 void AliITS::HitsToSDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
1082                           Option_t *option, Option_t *opt,Text_t *filename){
1083     // keep galice.root for signal and name differently the file for
1084     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
1085     // the condition below will disappear when the geom class will be
1086     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
1087     // 7 is the SDD beam test version. Dummy routine. Hits are ITS's Summable
1088     // Digits.
1089     // Inputs:
1090     //      Int_t evnt       Event to be processed.
1091     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
1092     //      Int_t nmodules   Not used.
1093     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
1094     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
1095     //                       background hits are considered.
1096     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
1097     // Outputs:
1098     //      none.
1099     // Return:
1100     //      none.
1101 //    return; // using Hits instead of the larger sdigits.
1102
1103     HitsToPreDigits(evNumber,bgrev,size,option,opt,filename);
1104 }
1105 //______________________________________________________________________
1106 void AliITS::HitsToPreDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
1107                           Option_t *option, Option_t *opt,Text_t *filename){
1108     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for
1109     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
1110     // the condition below will disappear when the geom class will be
1111     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
1112     // 7 is the SDD beam test version.
1113     // Inputs:
1114     //      Int_t evnt       Event to be processed.
1115     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
1116     //      Int_t nmodules   Not used.
1117     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
1118     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
1119     //                       background hits are considered.
1120     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
1121     // Outputs:
1122     //      none.
1123     // Return:
1124     //      none.
1125
1126     if(!GetITSgeom()) return; // need transformations to do digitization.
1127     AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1128
1129     const char *all = strstr(opt,"All");
1130     const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
1131                           strstr(opt,"SSD")};
1132     static Bool_t setDef=kTRUE;
1133     if (setDef) SetDefaultSimulation();
1134     setDef=kFALSE;
1135
1136     Int_t nmodules;
1137     InitModules(size,nmodules);
1138     FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
1139
1140     AliITSsimulation *sim      = 0;
1141     AliITSDetType    *iDetType = 0;
1142     AliITSmodule     *mod      = 0;
1143     Int_t id,module;
1144     for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
1145         id       = geom->GetModuleType(module);
1146         if (!all && !det[id]) continue;
1147         iDetType = DetType(id);
1148         sim      = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
1149         if (!sim) {
1150             Error("HitsToSDigits",
1151                   "The simulation class was not instanciated!");
1152             exit(1);
1153         } // end if !sim
1154         mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
1155         sim->SDigitiseModule(mod,module,evNumber);
1156         // fills all branches - wasted disk space
1157         fLoader->TreeS()->Fill();
1158         ResetSDigits();
1159     } // end for module
1160
1161     ClearModules();
1162
1163     fLoader->TreeS()->GetEntries();
1164     fLoader->TreeS()->AutoSave();
1165     fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
1166     // reset tree
1167     fLoader->TreeS()->Reset();
1168 }
1169 //______________________________________________________________________
1170 void AliITS::HitsToDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
1171                           Option_t *option, Option_t *opt,Text_t *filename){
1172     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for
1173     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
1174     // the condition below will disappear when the geom class will be
1175     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
1176     // 7 is the SDD beam test version.
1177     // Inputs:
1178     //      Int_t evnt       Event to be processed.
1179     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
1180     //      Int_t nmodules   Not used.
1181     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
1182     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
1183     //                       background hits are considered.
1184     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
1185     // Outputs:
1186     //      none.
1187     // Return:
1188     //      none.
1189
1190     if(!GetITSgeom()) return; // need transformations to do digitization.
1191     AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1192
1193     const char *all = strstr(opt,"All");
1194     const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
1195                           strstr(opt,"SSD")};
1196     static Bool_t setDef=kTRUE;
1197     if (setDef) SetDefaultSimulation();
1198     setDef=kFALSE;
1199
1200     Int_t nmodules;
1201     InitModules(size,nmodules);
1202     FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
1203
1204     AliITSsimulation *sim      = 0;
1205     AliITSDetType    *iDetType = 0;
1206     AliITSmodule     *mod      = 0;
1207     Int_t id,module;
1208     for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
1209         id       = geom->GetModuleType(module);
1210         if (!all && !det[id]) continue;
1211         iDetType = DetType(id);
1212         sim      = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
1213         if (!sim) {
1214             Error("HitsToDigits",
1215                   "The simulation class was not instanciated!");
1216             exit(1);
1217         } // end if !sim
1218         mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
1219         sim->DigitiseModule(mod,module,evNumber);
1220         // fills all branches - wasted disk space
1221         fLoader->TreeD()->Fill();
1222         ResetDigits();
1223     } // end for module
1224
1225     ClearModules();
1226
1227     fLoader->TreeD()->GetEntries();
1228     fLoader->TreeD()->AutoSave();
1229     // reset tree
1230     fLoader->TreeD()->Reset();
1231 }
1232 //______________________________________________________________________
1233 void AliITS::ResetSDigits(){
1234     // Reset the Summable Digits array.
1235     // Inputs:
1236     //      none.
1237     // Outputs:
1238     //      none.
1239
1240     if (fSDigits) fSDigits->Clear();
1241     fNSDigits = 0;
1242 }
1243 //______________________________________________________________________
1244 void AliITS::ResetDigits(){
1245     // Reset number of digits and the digits array for the ITS detector.
1246     // Inputs:
1247     //      none.
1248     // Outputs:
1249     //      none.
1250
1251     if (!fDtype) return;
1252
1253     Int_t i;
1254     for (i=0;i<kNTYPES;i++ ) {
1255         if (fDtype->At(i))    ((TClonesArray*)fDtype->At(i))->Clear();
1256         if (fNdtype)  fNdtype[i]=0;
1257     } // end for i
1258 }
1259 //______________________________________________________________________
1260 void AliITS::ResetDigits(Int_t i){
1261     // Reset number of digits and the digits array for this branch.
1262     // Inputs:
1263     //      none.
1264     // Outputs:
1265     //      none.
1266
1267     if (fDtype->At(i))    ((TClonesArray*)fDtype->At(i))->Clear();
1268     if (fNdtype)  fNdtype[i]=0;
1269 }
1270 //______________________________________________________________________
1271 void AliITS::AddSumDigit(AliITSpListItem &sdig){
1272     // Adds the a module full of summable digits to the summable digits tree.
1273     // Inputs:
1274     //      AliITSpListItem &sdig   SDigit to be added to SDigits tree.
1275     // Outputs:
1276     //      none.
1277     // Return:
1278     //      none.
1279
1280     TClonesArray &lsdig = *fSDigits;
1281     new(lsdig[fNSDigits++]) AliITSpListItem(sdig);
1282 }
1283 //______________________________________________________________________
1284 void AliITS::AddRealDigit(Int_t id, Int_t *digits){
1285     //   Add a real digit - as coming from data.
1286     // Inputs:
1287     //      Int_t id        Detector type number.
1288     //      Int_t *digits   Integer array containing the digits info. See
1289     //                      AliITSdigit.h
1290     // Outputs:
1291     //      none.
1292     // Return:
1293     //      none.
1294
1295     TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)fDtype->At(id));
1296     new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigit(digits);
1297 }
1298 //______________________________________________________________________
1299 void AliITS::AddSimDigit(Int_t id, AliITSdigit *d){
1300     //    Add a simulated digit.
1301     // Inputs:
1302     //      Int_t id        Detector type number.
1303     //      AliITSdigit *d  Digit to be added to the Digits Tree. See
1304     //                      AliITSdigit.h
1305     // Outputs:
1306     //      none.
1307     // Return:
1308     //      none.
1309
1310     TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)fDtype->At(id));
1311
1312     switch(id){
1313     case 0:
1314         new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSPD(*((AliITSdigitSPD*)d));
1315         break;
1316     case 1:
1317         new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSDD(*((AliITSdigitSDD*)d));
1318         break;
1319     case 2:
1320         new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSSD(*((AliITSdigitSSD*)d));
1321         break;
1322     } // end switch id
1323 }
1324 //______________________________________________________________________
1325 void AliITS::AddSimDigit(Int_t id,Float_t phys,Int_t *digits,Int_t *tracks,
1326                          Int_t *hits,Float_t *charges){
1327     //   Add a simulated digit to the list.
1328     // Inputs:
1329     //      Int_t id        Detector type number.
1330     //      Float_t phys    Physics indicator. See AliITSdigits.h
1331     //      Int_t *digits   Integer array containing the digits info. See
1332     //                      AliITSdigit.h
1333     //      Int_t *tracks   Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
1334     //                      containing the track numbers that contributed to
1335     //                      this digit.
1336     //      Int_t *hits     Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
1337     //                      containing the hit numbers, from AliITSmodule, that
1338     //                      contributed to this digit.
1339     //      Float_t *charge Floating point array of the signals contributed
1340     //                      to this digit by each track.
1341     // Outputs:
1342     //      none.
1343     // Return:
1344     //      none.
1345
1346     TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)fDtype->At(id));
1347     switch(id){
1348     case 0:
1349         new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSPD(digits,tracks,hits);
1350         break;
1351     case 1:
1352         new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSDD(phys,digits,tracks,
1353                                                    hits,charges);
1354         break;
1355     case 2:
1356         new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSSD(digits,tracks,hits);
1357         break;
1358     } // end switch id
1359 }
1360 //______________________________________________________________________
1361 void AliITS::MakeTreeC(Option_t *option){
1362   //   Create a separate tree to store the clusters.
1363   // Inputs:
1364   //      Option_t *option  string which must contain "C" otherwise
1365   //                        no Cluster Tree is created.
1366   // Outputs:
1367   //      none.
1368   // Return:
1369   //      none.
1370
1371   AliITSLoader *pITSLoader = (AliITSLoader*)fLoader;
1372
1373   if (pITSLoader == 0x0) {
1374     Error("MakeTreeC","fLoader == 0x0 option=%s",option);
1375     return;
1376   }
1377   if (pITSLoader->TreeC() == 0x0) pITSLoader->MakeTree("C");
1378   MakeBranchC();
1379 }
1380
1381 void AliITS::MakeBranchC()
1382 {
1383 //Makes barnches in treeC
1384   AliITSLoader *pITSLoader = (AliITSLoader*)fLoader;
1385   if (pITSLoader == 0x0)
1386    {
1387     Error("MakeTreeC","fLoader == 0x0");
1388     return;
1389    }
1390   TTree * lTC = pITSLoader->TreeC();
1391   if (lTC == 0x0)
1392    {
1393      Error("MakeTreeC","Can not get TreeC from Loader");
1394      return;
1395    }
1396
1397   Int_t buffersize = 4000;
1398   char branchname[30];
1399   const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
1400   char digclass[40];
1401   char clclass[40];
1402
1403     // one branch for Clusters per type of detector
1404   Int_t i;
1405   for (i=0; i<kNTYPES ;i++)
1406     {
1407         AliITSDetType *iDetType=DetType(i);
1408         iDetType->GetClassNames(digclass,clclass);
1409         // clusters
1410         if (fCtype == 0x0) fCtype  = new TObjArray(fNDetTypes);
1411         if(!ClustersAddress(i))
1412          {
1413           fCtype->AddAt(new TClonesArray(clclass,1000),i);
1414          }
1415         if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sClusters%s",GetName(),det[i]);
1416         else  sprintf(branchname,"%sClusters%d",GetName(),i+1);
1417         if (fCtype  && lTC)
1418          {
1419            if (lTC->GetBranch(branchname))
1420             {
1421               Warning("MakeBranchC","Branch %s alread exists in TreeC",branchname);
1422             }
1423            else
1424             {
1425               Info("MakeBranchC","Creating branch %s in TreeC",branchname);
1426               lTC->Branch(branchname,&((*fCtype)[i]), buffersize);
1427             }
1428          } // end if fCtype && lTC
1429   } // end for i
1430 }
1431
1432 //______________________________________________________________________
1433 void AliITS::GetTreeC(Int_t event){
1434   //    Get the clusters tree for this event and set the branch address.
1435   // Inputs:
1436   //      Int_t event    Event number for the cluster tree.
1437   // Outputs:
1438   //      none.
1439   // Return:
1440   //      none.
1441   char branchname[30];
1442   const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
1443
1444   AliITSLoader *pITSLoader = (AliITSLoader*)fLoader;
1445   TTree * lTC = pITSLoader->TreeC();
1446
1447   ResetClusters();
1448   if (lTC) {
1449     pITSLoader->CleanRawClusters();
1450   } // end if TreeC()
1451
1452
1453   TBranch *branch;
1454
1455   if (lTC) {
1456     Int_t i;
1457         char digclass[40];
1458         char clclass[40];
1459         for (i=0; i<kNTYPES; i++) {
1460       AliITSDetType *iDetType=DetType(i);
1461       iDetType->GetClassNames(digclass,clclass);
1462       // clusters
1463       if (fCtype == 0x0) fCtype  = new TObjArray(fNDetTypes);
1464       if(!fCtype->At(i)) fCtype->AddAt(new TClonesArray(clclass,1000),i);
1465       if(kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sClusters%s",GetName(),det[i]);
1466       else  sprintf(branchname,"%sClusters%d",GetName(),i+1);
1467       if (fCtype) {
1468                 branch = lTC->GetBranch(branchname);
1469         if (branch) branch->SetAddress(&((*fCtype)[i]));
1470       } // end if fCtype
1471         } // end for i
1472   } else {
1473         Error("GetTreeC","cannot find Clusters Tree for event:%d",event);
1474   } // end if lTC
1475 }
1476 //______________________________________________________________________
1477 void AliITS::AddCluster(Int_t id, AliITSRawCluster *c){
1478     //   Add a cluster to the list.
1479     // Inputs:
1480     //      Int_t id             Detector type number.
1481     //      AliITSRawCluster *c  Cluster class to be added to the tree of
1482     //                           clusters.
1483     // Outputs:
1484     //      none.
1485     // Return:
1486     //      none.
1487
1488     TClonesArray &lc = *((TClonesArray*)fCtype->At(id));
1489
1490     switch(id){
1491     case 0:
1492         new(lc[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSPD(*((AliITSRawClusterSPD*)c));
1493         break;
1494     case 1:
1495         new(lc[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSDD(*((AliITSRawClusterSDD*)c));
1496         break;
1497     case 2:
1498         new(lc[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSSD(*((AliITSRawClusterSSD*)c));
1499         break;
1500     } // end switch id
1501 }
1502 //______________________________________________________________________
1503 void AliITS::ResetClusters(){
1504     // Reset number of clusters and the clusters array for ITS.
1505     // Inputs:
1506     //      none.
1507     // Outputs:
1508     //      none.
1509
1510     Int_t i;
1511     for (i=0;i<kNTYPES;i++ ) ResetClusters(i);
1512 }
1513 //______________________________________________________________________
1514 void AliITS::ResetClusters(Int_t i){
1515     //    Reset number of clusters and the clusters array for this branch.
1516     // Inputs:
1517     //      Int_t i        Detector type number.
1518     // Outputs:
1519     //      none.
1520     // Return:
1521     //      none.
1522
1523     if (fCtype->At(i))    ((TClonesArray*)fCtype->At(i))->Clear();
1524     if (fNctype)  fNctype[i]=0;
1525 }
1526 //______________________________________________________________________
1527 void AliITS::MakeBranchR(const char *file, Option_t *opt){
1528     // Creates Tree branches for the ITS Reconstructed points.
1529     // Inputs:
1530     //      cont char *file  File name where RecPoints branch is to be written
1531     //                       to. If blank it write the SDigits to the same
1532     //                       file in which the Hits were found.
1533     // Outputs:
1534     //      none.
1535     // Return:
1536     //      none.
1537     Int_t buffsz = 4000;
1538     char branchname[30];
1539
1540     // only one branch for rec points for all detector types
1541     Bool_t oFast= (strstr(opt,"Fast")!=0);
1542     if(oFast){
1543       sprintf(branchname,"%sRecPointsF",GetName());
1544     } else {
1545       sprintf(branchname,"%sRecPoints",GetName());
1546     }
1547
1548
1549     if(!fRecPoints)fRecPoints = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
1550     if (fLoader->TreeR()) {
1551         if (fRecPoints == 0x0) fRecPoints = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
1552         MakeBranchInTree(fLoader->TreeR(),branchname,&fRecPoints,buffsz,file);
1553     } // end if
1554 }
1555 //______________________________________________________________________
1556 void AliITS::SetTreeAddressR(TTree *treeR){
1557     // Set branch address for the Reconstructed points Trees.
1558     // Inputs:
1559     //      TTree *treeR   Tree containing the RecPoints.
1560     // Outputs:
1561     //      none.
1562     // Return:
1563     //      none.
1564     char branchname[30];
1565
1566     if(!treeR) return;
1567     if (fRecPoints == 0x0) fRecPoints = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
1568     TBranch *branch;
1569     sprintf(branchname,"%sRecPoints",GetName());
1570     branch = treeR->GetBranch(branchname);
1571     if (branch) {
1572       branch->SetAddress(&fRecPoints);
1573     }
1574     else {
1575       sprintf(branchname,"%sRecPointsF",GetName());
1576       branch = treeR->GetBranch(branchname);
1577       if (branch) {
1578         branch->SetAddress(&fRecPoints);
1579       }
1580     }
1581 }
1582 //______________________________________________________________________
1583 void AliITS::AddRecPoint(const AliITSRecPoint &r){
1584     // Add a reconstructed space point to the list
1585     // Inputs:
1586     //      const AliITSRecPoint &r RecPoint class to be added to the tree
1587     //                              of reconstructed points TreeR.
1588     // Outputs:
1589     //      none.
1590     // Return:
1591     //      none.
1592
1593     TClonesArray &lrecp = *fRecPoints;
1594     new(lrecp[fNRecPoints++]) AliITSRecPoint(r);
1595 }
1596 //______________________________________________________________________
1597 void AliITS::HitsToFastRecPoints(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
1598                                   Option_t *opt0,Option_t *opt1,Text_t *flnm){
1599     // keep galice.root for signal and name differently the file for
1600     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
1601     // the condition below will disappear when the geom class will be
1602     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
1603     // Inputs:
1604     //      Int_t evnt       Event to be processed.
1605     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
1606     //      Int_t size       Size used by InitModules. See InitModules.
1607     //      Option_t *opt0   Option passed to FillModules. See FillModules.
1608     //      Option_t *opt1   String indicating if merging hits or not. To
1609     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
1610     //                       background hits are considered.
1611     //      Test_t *flnm     File name containing the background hits..
1612     // Outputs:
1613     //      none.
1614     // Return:
1615     //      none.
1616
1617     if(!GetITSgeom()) return;
1618     AliITSLoader *pITSloader = (AliITSLoader*)fLoader;
1619     AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1620
1621     const char *all = strstr(opt1,"All");
1622     const char *det[3] ={strstr(opt1,"SPD"),strstr(opt1,"SDD"),
1623                          strstr(opt1,"SSD")};
1624     Int_t nmodules;
1625     InitModules(size,nmodules);
1626     FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,opt0,flnm);
1627
1628     AliITSsimulation *sim      = 0;
1629     AliITSDetType    *iDetType = 0;
1630     AliITSmodule     *mod      = 0;
1631     Int_t id,module;
1632
1633     //m.b. : this change is nothing but a nice way to make sure
1634     //the CPU goes up !
1635
1636     cout<<"HitsToFastRecPoints: N mod = "<<geom->GetIndexMax()<<endl;
1637
1638     for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++)
1639      {
1640         id       = geom->GetModuleType(module);
1641         if (!all && !det[id]) continue;
1642         iDetType = DetType(id);
1643         sim      = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
1644         if (!sim)
1645          {
1646            Error("HitsToFastPoints","The simulation class was not instanciated!");
1647            exit(1);
1648          } // end if !sim
1649         mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
1650         sim->CreateFastRecPoints(mod,module,gRandom);
1651         cout<<module<<"\r";fflush(0);
1652         //gAlice->TreeR()->Fill();
1653         TTree *lTR = pITSloader->TreeR();
1654         TBranch *br=lTR->GetBranch("ITSRecPointsF");
1655         br->Fill();
1656         ResetRecPoints();
1657     } // end for module
1658
1659     ClearModules();
1660
1661     fLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
1662 }
1663 //______________________________________________________________________
1664 void AliITS::Digits2Reco(){
1665     // Find clusters and reconstruct space points.
1666     // Inputs:
1667     //      none.
1668     // Outputs:
1669     //      none.
1670
1671     AliHeader *header=fLoader->GetRunLoader()->GetHeader();
1672     // to Digits to RecPoints for event in file, all digits in file, and
1673     // all ITS detectors.
1674     DigitsToRecPoints(header->GetEvent(),0,fOpt);
1675 }
1676 //______________________________________________________________________
1677 void AliITS::DigitsToRecPoints(Int_t evNumber,Int_t lastentry,Option_t *opt){
1678   // cluster finding and reconstruction of space points
1679   // the condition below will disappear when the geom class will be
1680   // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
1681   // 7 is the SDD beam test version
1682   // Inputs:
1683   //      Int_t evNumber   Event number to be processed.
1684   //      Int_t lastentry  Offset for module when not all of the modules
1685   //                       are processed.
1686   //      Option_t *opt    String indicating which ITS sub-detectors should
1687   //                       be processed. If ="All" then all of the ITS
1688   //                       sub detectors are processed.
1689   // Outputs:
1690   //      none.
1691   // Return:
1692   //      none.
1693
1694   if(!GetITSgeom()) return;
1695   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1696
1697   const char *all = strstr(opt,"All");
1698   const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
1699                         strstr(opt,"SSD")};
1700   static Bool_t setRec=kTRUE;
1701   if (setRec) SetDefaultClusterFinders();
1702   setRec=kFALSE;
1703
1704   AliITSLoader *pITSloader = (AliITSLoader*)fLoader;
1705   TTree *treeC=pITSloader->TreeC();
1706   AliITSClusterFinder *rec     = 0;
1707   AliITSDetType      *iDetType = 0;
1708   Int_t id,module,first=0;
1709   for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
1710       id       = geom->GetModuleType(module);
1711       if (!all && !det[id]) continue;
1712       if(det[id]) first = geom->GetStartDet(id);
1713       iDetType = DetType(id);
1714       rec = (AliITSClusterFinder*)iDetType->GetReconstructionModel();
1715       TClonesArray *itsDigits  = this->DigitsAddress(id);
1716       if (!rec) {
1717           Error("DigitsToRecPoints",
1718                 "The reconstruction class was not instanciated! event=%d",
1719                 evNumber);
1720           exit(1);
1721       } // end if !rec
1722       this->ResetDigits();
1723       TTree *lTD = pITSloader->TreeD();
1724       if (all) {
1725           lTD->GetEvent(lastentry+module);
1726       }else {
1727           lTD->GetEvent(lastentry+(module-first));
1728       }
1729       Int_t ndigits = itsDigits->GetEntriesFast();
1730       if (ndigits) rec->FindRawClusters(module);
1731       pITSloader->TreeR()->Fill();
1732       ResetRecPoints();
1733       treeC->Fill();
1734       ResetClusters();
1735   } // end for module
1736
1737
1738   pITSloader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
1739   pITSloader->WriteRawClusters("OVERWRITE");
1740 }
1741 //______________________________________________________________________
1742 void AliITS::ResetRecPoints(){
1743     // Reset number of rec points and the rec points array.
1744     // Inputs:
1745     //      none.
1746     // Outputs:
1747     //      none.
1748
1749     if (fRecPoints) fRecPoints->Clear();
1750     fNRecPoints = 0;
1751 }
1752 //______________________________________________________________________
1753 AliLoader* AliITS::MakeLoader(const char* topfoldername)
1754 {
1755   //builds ITSgetter (AliLoader type)
1756   //if detector wants to use castomized getter, it must overload this method
1757
1758   Info("MakeLoader","Creating AliITSLoader. Top folder is %s.",topfoldername);
1759   fLoader = new AliITSLoader(GetName(),topfoldername);
1760   return fLoader;
1761 }
1762
1763