ITS/AliITS.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /*
  17 $Log$
  18 Revision 1.41  2001/04/21 15:16:51  barbera
  19 Updated with the new SSD reconstruction code
  20
  21 Revision 1.40  2001/03/17 15:07:06  mariana
  22 Update SDD response parameters
  23
  24 Revision 1.39  2001/03/12 17:45:32  hristov
  25 Changes needed on Sun with CC 5.0
  26
  27 Revision 1.38  2001/03/07 14:04:51  barbera
  28 Some vector dimensions increased to cope with full events
  29
  30 Revision 1.37  2001/03/07 12:36:35  barbera
  31 A change added in the tracking part to manage delta rays
  32
  33 Revision 1.36  2001/03/02 19:44:11  barbera
  34  modified to taking into account new version tracking v1
  35
  36 Revision 1.35  2001/02/28 18:16:46  mariana
  37 Make the code compatible with the new AliRun
  38
  39 Revision 1.34  2001/02/11 15:51:39  mariana
  40 Set protection in MakeBranch
  41
  42 Revision 1.33  2001/02/10 22:26:39  mariana
  43 Move the initialization of the containers for raw clusters in MakeTreeC()
  44
  45 Revision 1.32  2001/02/08 23:55:31  nilsen
  46 Removed fMajor/MinorVersion variables in favor of variables in derived classes.
  47 Set arrays char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"} as const.
  48
  49 Revision 1.31  2001/02/02 23:57:28  nilsen
  50 Added include file that are no londer included in AliITSgeom.h
  51
  52 Revision 1.30  2001/01/30 09:23:13  hristov
  53 Streamers removed (R.Brun)
  54
  55 Revision 1.29  2001/01/26 20:01:09  hristov
  56 Major upgrade of AliRoot code
  57
  58 Revision 1.28  2000/12/18 14:02:00  barbera
  59 new version of the ITS tracking to take into account the new TPC track parametrization
  60
  61 Revision 1.27  2000/12/08 13:49:27  barbera
  62 Hidden declaration in a for loop removed to be compliant with HP-UX compiler
  63
  64 Revision 1.26  2000/11/27 13:12:13  barbera
  65 New version containing the files for tracking
  66
  67 Revision 1.25  2000/11/12 22:38:05  barbera
  68 Added header file for the SPD Bari model
  69
  70 Revision 1.24  2000/10/09 22:18:12  barbera
  71 Bug fixes from MAriana to le AliITStest.C run correctly
  72
  73 Revision 1.23  2000/10/05 20:47:42  nilsen
  74 fixed dependencies of include files. Tryed but failed to get a root automaticly
  75 generates streamer function to work. Modified SetDefaults.
  76
  77 Revision 1.9.2.15  2000/10/04 16:56:40  nilsen
  78 Needed to include stdlib.h
  79
  80 =======
  81 Revision 1.22  2000/10/04 19:45:52  barbera
  82 Corrected by F. Carminati for v3.04
  83
  84 Revision 1.21  2000/10/02 21:28:08  fca
  85 Removal of useless dependecies via forward declarations
  86
  87 Revision 1.20  2000/10/02 16:31:39  barbera
  88 General code clean-up
  89
  90 Revision 1.9.2.14  2000/10/02 15:43:51  barbera
  91 General code clean-up (e.g., printf -> cout)
  92
  93 Revision 1.19  2000/09/22 12:13:25  nilsen
  94 Patches and updates for fixes to this and other routines.
  95
  96 Revision 1.18  2000/07/12 05:32:20  fca
  97 Correcting several syntax problem with static members
  98
  99 Revision 1.17  2000/07/10 16:07:18  fca
 100 Release version of ITS code
 101
 102 Revision 1.9.2.3  2000/02/02 13:42:09  barbera
 103 fixed AliITS.cxx for new AliRun structure. Added ITS hits list to list of hits which will have their track numbers updated
 104
 105 Revision 1.9.2.2  2000/01/23 03:03:13  nilsen
 106 //fixed FillModule. Removed fi(fabs(xl)<dx....
 107
 108 Revision 1.9.2.1  2000/01/12 19:03:32  nilsen
 109 This is the version of the files after the merging done in December 1999.
 110 See the ReadMe110100.txt file for details
 111
 112 Revision 1.9  1999/11/14 14:33:25  fca
 113 Correct problems with distructors and pointers, thanks to I.Hrivnacova
 114
 115 Revision 1.8  1999/09/29 09:24:19  fca
 116 Introduction of the Copyright and cvs Log
 117
 118 */
 119
 120 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 121 //
 122 //      An overview of the basic philosophy of the ITS code development
 123 // and analysis is show in the figure below.
 124 //Begin_Html
 125 /*
 126 <img src="picts/ITS/ITS_Analysis_schema.gif">
 127 </pre>
 128 <br clear=left>
 129 <font size=+2 color=red>
 130 <p>Roberto Barbera is in charge of the ITS Offline code (1999).
 131 <a href="mailto:roberto.barbera@ct.infn.it">Roberto Barbera</a>.
 132 </font>
 133 <pre>
 134 */
 135 //End_Html
 136 //
 137 //  AliITS. Inner Traking System base class.
 138 //  This class contains the base procedures for the Inner Tracking System
 139 //
 140 //Begin_Html
 141 /*
 142 <img src="picts/ITS/AliITS_Class_Diagram.gif">
 143 </pre>
 144 <br clear=left>
 145 <font size=+2 color=red>
 146 <p>This show the class diagram of the different elements that are part of
 147 the AliITS class.
 148 </font>
 149 <pre>
 150 */
 151 //End_Html
 152 //
 153 // Version: 0
 154 // Written by Rene Brun, Federico Carminati, and Roberto Barbera
 155 //
 156 // Version: 1
 157 // Modified and documented by Bjorn S. Nilsen
 158 // July 11 1999
 159 //
 160 // Version: 2
 161 // Modified and documented by A. Bologna
 162 // October 18 1999
 163 //
 164 // AliITS is the general base class for the ITS. Also see AliDetector for
 165 // futher information.
 166 //
 167 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 168 #include <iostream.h>
 169 #include <iomanip.h>
 170 #include <fstream.h>
 171 #include <stdlib.h>
 172 #include <TMath.h>
 173 #include <TRandom.h>
 174 #include <TBranch.h>
 175 #include <TVector.h>
 176 #include <TClonesArray.h>
 177 #include <TROOT.h>
 178 #include <TObjectTable.h>
 179 #include <TFile.h>
 180 #include <TTree.h>
 181 #include <TString.h>
 182 #include <TParticle.h>
 183
 184
 185 #include "AliRun.h"
 186 #include "AliITS.h"
 187 #include "AliITSMap.h"
 188 #include "AliITSDetType.h"
 189 #include "AliITSClusterFinder.h"
 190 //#include "AliITSsimulation.h"
 191 #include "AliITSsimulationSPD.h"
 192 #include "AliITSsimulationSDD.h"
 193 #include "AliITSsimulationSSD.h"
 194 #include "AliITSresponse.h"
 195 #include "AliITSsegmentationSPD.h"
 196 #include "AliITSresponseSPD.h"
 197 #include "AliITSresponseSPDbari.h"
 198 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
 199 #include "AliITSresponseSDD.h"
 200 #include "AliITSsegmentationSSD.h"
 201 #include "AliITSresponseSSD.h"
 202 #include "AliITShit.h"
 203 #include "AliITSgeom.h"
 204 #include "AliITSdigit.h"
 205 #include "AliITSmodule.h"
 206 #include "AliITSRecPoint.h"
 207 #include "AliITSRawCluster.h"
 208 #include "AliMC.h"
 209 #include "stdlib.h"
 210 #include "AliKalmanTrack.h"
 211 #include "AliMagF.h"
 212
 213 #include "AliITStrack.h"
 214 #include "AliITSiotrack.h"
 215 #include "AliITStracking.h"
 216 #include "AliITSRad.h"
 217 #include "../TPC/AliTPC.h"
 218 #include "../TPC/AliTPCParam.h"
 219
 220
 221 ClassImp(AliITS)
 222
 223 //_____________________________________________________________________________
 224 AliITS::AliITS() : AliDetector() {
 225   //
 226   // Default initialiser for ITS
 227   //     The default constructor of the AliITS class. In addition to
 228   // creating the AliITS class it zeros the variables fIshunt (a member
 229   // of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros the pointers
 230   // fITSpoints, fIdSens, and fIdName. The AliDetector default constructor
 231   // is also called.
 232   //
 233
 234
 235   fIshunt     = 0;
 236   fEuclidOut  = 0;
 237
 238   fNDetTypes = kNTYPES;
 239   fIdN        = 0;
 240   fIdName     = 0;
 241   fIdSens     = 0;
 242   fITSmodules = 0;
 243   //
 244   fDetTypes   = 0;
 245   //
 246   fDtype  = 0;
 247   fNdtype = 0;
 248   fCtype  = 0;
 249   fNctype = 0;
 250   fRecPoints = 0;
 251   fNRecPoints = 0;
 252   fTreeC = 0;
 253   //
 254   fITSgeom=0;
 255 }
 256
 257 //_____________________________________________________________________________
 258 AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):AliDetector(name,title){
 259   //
 260   // Default initialiser for ITS
 261   //     The constructor of the AliITS class. In addition to creating the
 262   // AliITS class, it allocates memory for the TClonesArrays fHits and
 263   // fDigits, and for the TObjArray fITSpoints. It also zeros the variables
 264   // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros
 265   // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the ROOT
 266   // macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The variables
 267   // passes with this constructor, const char *name and *title, are used by
 268   // the constructor of AliDetector class. See AliDetector class for a
 269   // description of these parameters and its constructor functions.
 270   //
 271
 272
 273   fHits       = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 274   gAlice->AddHitList(fHits);
 275
 276   fNDetTypes = kNTYPES;
 277
 278   fNdtype = new Int_t[kNTYPES];
 279   fDtype = new TObjArray(kNTYPES);
 280
 281   fNctype = new Int_t[kNTYPES];
 282   fCtype = new TObjArray(kNTYPES);
 283
 284
 285   fRecPoints = 0;
 286   fNRecPoints = 0;
 287
 288   fTreeC = 0;
 289
 290   fITSmodules = 0;
 291
 292   fIshunt     = 0;
 293   fEuclidOut  = 0;
 294   fIdN        = 0;
 295   fIdName     = 0;
 296   fIdSens     = 0;
 297
 298   fDetTypes = new TObjArray(kNTYPES);
 299
 300   Int_t i;
 301   for(i=0;i<kNTYPES;i++) {
 302     (*fDetTypes)[i]=new AliITSDetType();
 303     fNdtype[i]=0;
 304     fNctype[i]=0;
 305    }
 306   //
 307
 308   SetMarkerColor(kRed);
 309
 310   fITSgeom=0;
 311 }
 312 //___________________________________________________________________________
 313 AliITS::AliITS(AliITS &source){
 314   // copy constructor
 315   if(this==&source) return;
 316   Error("AliITS::Copy constructor",
 317         "You are not allowed to make a copy of the AliITS");
 318   exit(1);
 319 }
 320 //____________________________________________________________________________
 321 AliITS& AliITS::operator=(AliITS &source){
 322   // assignment operator
 323   if(this==&source) return *this;
 324   Error("AliITS::operator=",
 325         "You are not allowed to make a copy of the AliITS");
 326   exit(1);
 327   return *this; //fake return
 328 }
 329 //____________________________________________________________________________
 330 void AliITS::ClearModules(){
 331   //clear the modules TObjArray
 332
 333   if(fITSmodules) fITSmodules->Delete();
 334
 335 }
 336 //_____________________________________________________________________________
 337 AliITS::~AliITS(){
 338   //
 339   // Default distructor for ITS
 340   //     The default destructor of the AliITS class. In addition to deleting
 341   // the AliITS class it deletes the memory pointed to by the fHits, fDigits,
 342   // fIdSens, fIdName, and fITSpoints.
 343   //
 344
 345
 346   delete fHits;
 347   delete fDigits;
 348   delete fRecPoints;
 349 //  delete fIdName;        // TObjArray of TObjStrings
 350   if(fIdName!=0) delete[] fIdName;  // Array of TStrings
 351   if(fIdSens!=0) delete[] fIdSens;
 352   if(fITSmodules!=0) {
 353       this->ClearModules();
 354       delete fITSmodules;
 355   }// end if fITSmodules!=0
 356
 357   //
 358   if(fDtype) {
 359     fDtype->Delete();
 360     delete fDtype;
 361   }
 362   delete [] fNdtype;
 363   if (fCtype) {
 364     fCtype->Delete();
 365     delete fCtype;
 366   }
 367   delete [] fNctype;
 368   //
 369
 370   if (fDetTypes) {
 371     fDetTypes->Delete();
 372     delete fDetTypes;
 373   }
 374
 375   if (fTreeC) delete fTreeC;
 376
 377   if (fITSgeom) delete fITSgeom;
 378
 379 }
 380
 381 //___________________________________________
 382 AliITSDetType* AliITS::DetType(Int_t id)
 383 {
 384   //return pointer to id detector type
 385     return ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id]);
 386
 387 }
 388 //___________________________________________
 389 void AliITS::SetClasses(Int_t id, const char *digit, const char *cluster)
 390 {
 391   //set the digit and cluster classes to be used for the id detector type
 392     ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->ClassNames(digit,cluster);
 393
 394 }
 395 //___________________________________________
 396 void AliITS::SetResponseModel(Int_t id, AliITSresponse *response)
 397 {
 398   //set the response model for the id detector type
 399
 400     ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->ResponseModel(response);
 401
 402 }
 403
 404 //___________________________________________
 405 void AliITS::SetSegmentationModel(Int_t id, AliITSsegmentation *seg)
 406 {
 407   //set the segmentation model for the id detector type
 408
 409     ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->SegmentationModel(seg);
 410
 411 }
 412
 413 //___________________________________________
 414 void AliITS::SetSimulationModel(Int_t id, AliITSsimulation *sim)
 415 {
 416   //set the simulation model for the id detector type
 417
 418    ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->SimulationModel(sim);
 419
 420 }
 421 //___________________________________________
 422 void AliITS::SetReconstructionModel(Int_t id, AliITSClusterFinder *reconst)
 423 {
 424   //set the cluster finder model for the id detector type
 425
 426    ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->ReconstructionModel(reconst);
 427
 428 }
 429
 430 //_____________________________________________________________________________
 431 void AliITS::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits){
 432   //
 433   // Add an ITS hit
 434   //     The function to add information to the AliITShit class. See the
 435   // AliITShit class for a full description. This function allocates the
 436   // necessary new space for the hit information and passes the variable
 437   // track, and the pointers *vol and *hits to the AliITShit constructor
 438   // function.
 439   //
 440   TClonesArray &lhits = *fHits;
 441   new(lhits[fNhits++]) AliITShit(fIshunt,track,vol,hits);
 442 }
 443 //_____________________________________________________________________________
 444 void AliITS::AddRealDigit(Int_t id, Int_t *digits)
 445 {
 446   // add a real digit - as coming from data
 447
 448   TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)(*fDtype)[id]);
 449   new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigit(digits);
 450
 451 }
 452 //_____________________________________________________________________________
 453 void AliITS::AddSimDigit(Int_t id, AliITSdigit *d)
 454 {
 455
 456   // add a simulated digit
 457
 458   TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)(*fDtype)[id]);
 459
 460   switch(id)
 461   {
 462   case 0:
 463      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSPD(*((AliITSdigitSPD*)d));
 464      break;
 465   case 1:
 466      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSDD(*((AliITSdigitSDD*)d));
 467      break;
 468   case 2:
 469      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSSD(*((AliITSdigitSSD*)d));
 470      break;
 471   }
 472
 473 }
 474
 475 //_____________________________________________________________________________
 476 void AliITS::AddSimDigit(Int_t id,Float_t phys,Int_t *digits,Int_t *tracks,Int_t *hits,Float_t *charges){
 477
 478   // add a simulated digit to the list
 479
 480   TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)(*fDtype)[id]);
 481   switch(id)
 482   {
 483   case 0:
 484      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSPD(digits,tracks,hits);
 485      break;
 486   case 1:
 487      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSDD(phys,digits,tracks,hits,charges);
 488      break;
 489   case 2:
 490      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSSD(digits,tracks,hits);
 491      break;
 492   }
 493
 494 }
 495
 496 //_____________________________________________________________________________
 497 void AliITS::AddCluster(Int_t id, AliITSRawCluster *c)
 498 {
 499
 500   // add a cluster to the list
 501
 502   TClonesArray &lcl = *((TClonesArray*)(*fCtype)[id]);
 503
 504   switch(id)
 505   {
 506   case 0:
 507      new(lcl[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSPD(*((AliITSRawClusterSPD*)c));
 508      break;
 509   case 1:
 510      new(lcl[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSDD(*((AliITSRawClusterSDD*)c));
 511      break;
 512   case 2:
 513      new(lcl[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSSD(*((AliITSRawClusterSSD*)c));
 514      break;
 515   }
 516
 517 }
 518
 519
 520 //_____________________________________________________________________________
 521 void AliITS::AddRecPoint(const AliITSRecPoint &r)
 522 {
 523   //
 524   // Add a reconstructed space point to the list
 525   //
 526   TClonesArray &lrecp = *fRecPoints;
 527   new(lrecp[fNRecPoints++]) AliITSRecPoint(r);
 528 }
 529
 530
 531 //____________________________________________
 532 void AliITS::ResetDigits()
 533 {
 534     //
 535     // Reset number of digits and the digits array for the ITS detector
 536     //
 537
 538     if (!fDtype) return;
 539
 540     Int_t i;
 541     for (i=0;i<kNTYPES;i++ ) {
 542         if ((*fDtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fDtype)[i])->Clear();
 543         if (fNdtype)  fNdtype[i]=0;
 544     }
 545 }
 546
 547 //____________________________________________
 548 void AliITS::ResetDigits(Int_t i)
 549 {
 550     //
 551     // Reset number of digits and the digits array for this branch
 552     //
 553   if ((*fDtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fDtype)[i])->Clear();
 554   if (fNdtype)  fNdtype[i]=0;
 555 }
 556
 557
 558 //____________________________________________
 559 void AliITS::ResetClusters()
 560 {
 561     //
 562     // Reset number of clusters and the clusters array for ITS
 563     //
 564
 565     Int_t i;
 566     for (i=0;i<kNTYPES;i++ ) {
 567         if ((*fCtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fCtype)[i])->Clear();
 568         if (fNctype)  fNctype[i]=0;
 569     }
 570
 571 }
 572
 573 //____________________________________________
 574 void AliITS::ResetClusters(Int_t i)
 575 {
 576     //
 577     // Reset number of clusters and the clusters array for this branch
 578     //
 579         if ((*fCtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fCtype)[i])->Clear();
 580         if (fNctype)  fNctype[i]=0;
 581
 582 }
 583
 584
 585 //____________________________________________
 586 void AliITS::ResetRecPoints()
 587 {
 588     //
 589     // Reset number of rec points and the rec points array
 590     //
 591     if (fRecPoints) fRecPoints->Clear();
 592     fNRecPoints = 0;
 593
 594 }
 595
 596 //_____________________________________________________________________________
 597 Int_t AliITS::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t ){
 598   //
 599   // Distance from mouse to ITS on the screen. Dummy routine
 600   //     A dummy routine used by the ROOT macro display.C to allow for the
 601   // use of the mouse (pointing device) in the macro. In general this should
 602   // never be called. If it is it returns the number 9999 for any value of
 603   // x and y.
 604   //
 605   return 9999;
 606 }
 607
 608 //_____________________________________________________________________________
 609 void AliITS::Init(){
 610   //
 611   // Initialise ITS after it has been built
 612   //     This routine initializes the AliITS class. It is intended to be called
 613   // from the Init function in AliITSv?. Besides displaying a banner
 614   // indicating that it has been called it initializes the array fIdSens
 615   // and sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes
 616   // Therefore it should be called after a call to CreateGeometry.
 617   //
 618   Int_t i;
 619
 620 //
 621   SetDefaults();
 622 // Array of TStrings
 623   for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = gMC->VolId(fIdName[i]);
 624 //
 625 }
 626
 627 //_____________________________________________________________________________
 628 void AliITS::SetDefaults()
 629 {
 630   // sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes
 631
 632   printf("SetDefaults\n");
 633
 634   AliITSDetType *iDetType;
 635
 636
 637   //SPD
 638
 639   iDetType=DetType(0);
 640   if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
 641     AliITSsegmentationSPD *seg0=new AliITSsegmentationSPD(fITSgeom);
 642     SetSegmentationModel(0,seg0);
 643   }
 644   if (!iDetType->GetResponseModel()) {
 645      SetResponseModel(0,new AliITSresponseSPD());
 646   }
 647   // set digit and raw cluster classes to be used
 648
 649   const char *kData0=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
 650   if (strstr(kData0,"real")) {
 651       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSPD");
 652   } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSPD","AliITSRawClusterSPD");
 653
 654   // SDD                                          //
 655   iDetType=DetType(1);
 656   if (!iDetType->GetResponseModel()) {
 657     SetResponseModel(1,new AliITSresponseSDD());
 658   }
 659   AliITSresponse *resp1=iDetType->GetResponseModel();
 660   if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
 661     AliITSsegmentationSDD *seg1=new AliITSsegmentationSDD(fITSgeom,resp1);
 662     SetSegmentationModel(1,seg1);
 663   }
 664   const char *kData1=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
 665   const char *kopt=iDetType->GetResponseModel()->ZeroSuppOption();
 666   if ((!strstr(kopt,"2D")) && (!strstr(kopt,"1D")) || strstr(kData1,"real") ) {
 667       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSDD");
 668   } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSDD","AliITSRawClusterSDD");
 669
 670   // SSD
 671   iDetType=DetType(2);
 672   if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
 673     AliITSsegmentationSSD *seg2=new AliITSsegmentationSSD(fITSgeom);
 674     SetSegmentationModel(2,seg2);
 675   }
 676   if (!iDetType->GetResponseModel()) {
 677     SetResponseModel(2,new AliITSresponseSSD());
 678   }
 679   const char *kData2=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
 680   if (strstr(kData2,"real")) {
 681       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSSD");
 682   } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSSD","AliITSRawClusterSSD");
 683
 684   if (kNTYPES>3) {
 685     Warning("SetDefaults","Only the three basic detector types are initialised!");
 686   }
 687
 688 }
 689
 690
 691
 692 //_____________________________________________________________________________
 693 void AliITS::SetDefaultSimulation()
 694 {
 695   // to be written
 696
 697 }
 698 //_____________________________________________________________________________
 699 void AliITS::SetDefaultClusterFinders()
 700 {
 701   // to be written
 702
 703 }
 704 //_____________________________________________________________________________
 705
 706 void AliITS::MakeTreeC(Option_t *option)
 707 {
 708   // create a separate tree to store the clusters
 709
 710   cout << "AliITS::MakeTreeC" << endl;
 711
 712      const char *optC = strstr(option,"C");
 713      if (optC && !fTreeC) fTreeC = new TTree("TC","Clusters in ITS");
 714      else return;
 715
 716      Int_t buffersize = 4000;
 717      char branchname[30];
 718
 719      const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 720
 721      char digclass[40];
 722      char clclass[40];
 723
 724      // one branch for Clusters per type of detector
 725      Int_t i;
 726      for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
 727        AliITSDetType *iDetType=DetType(i);
 728        iDetType->GetClassNames(digclass,clclass);
 729        // clusters
 730        (*fCtype)[i] = new TClonesArray(clclass,10000);
 731         if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sClusters%s",GetName(),det[i]);
 732         else  sprintf(branchname,"%sClusters%d",GetName(),i+1);
 733         if (fCtype   && fTreeC) {
 734            TreeC()->Branch(branchname,&((*fCtype)[i]), buffersize);
 735            cout << "Making Branch " << branchname;
 736            cout << " for Clusters of detector type " << i+1 << endl;
 737         }
 738      }
 739
 740 }
 741
 742 //_____________________________________________________________________________
 743 void AliITS::GetTreeC(Int_t event)
 744 {
 745
 746   cout << "AliITS::GetTreeC" << endl;
 747
 748   // get the clusters tree for this event and set the branch address
 749     char treeName[20];
 750     char branchname[30];
 751
 752     const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 753
 754     ResetClusters();
 755     if (fTreeC) {
 756           delete fTreeC;
 757     }
 758
 759     sprintf(treeName,"TreeC%d",event);
 760     fTreeC = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 761
 762     TBranch *branch;
 763     if (fTreeC) {
 764         Int_t i;
 765         for (i=0; i<kNTYPES; i++) {
 766            if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sClusters%s",GetName(),det[i]);
 767            else  sprintf(branchname,"%sClusters%d",GetName(),i+1);
 768            if (fCtype) {
 769                 branch = fTreeC->GetBranch(branchname);
 770                 if (branch) branch->SetAddress(&((*fCtype)[i]));
 771             }
 772         }
 773     } else {
 774         Error("AliITS::GetTreeC",
 775                 "cannot find Clusters Tree for event:%d\n",event);
 776     }
 777
 778 }
 779 //_____________________________________________________________________________
 780 void AliITS::MakeBranch(Option_t* option, char *file)
 781 {
 782   //
 783   // Creates Tree branches for the ITS.
 784   //
 785   //
 786   Int_t buffersize = 4000;
 787   char branchname[30];
 788   sprintf(branchname,"%s",GetName());
 789
 790   AliDetector::MakeBranch(option,file);
 791
 792   const char *cD = strstr(option,"D");
 793   const char *cR = strstr(option,"R");
 794
 795   if (cD) {
 796   //
 797   // one branch for digits per type of detector
 798   //
 799    const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 800
 801    char digclass[40];
 802    char clclass[40];
 803
 804    Int_t i;
 805    for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
 806        AliITSDetType *iDetType=DetType(i);
 807        iDetType->GetClassNames(digclass,clclass);
 808        // digits
 809        if(!((*fDtype)[i])) (*fDtype)[i] = new TClonesArray(digclass,10000);
 810        else ResetDigits(i);
 811    }
 812
 813    for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
 814       if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
 815       else  sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 816       if (fDtype && gAlice->TreeD()) {
 817         gAlice->MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(),
 818                          branchname, &((*fDtype)[i]), buffersize, file);
 819             cout << "Making Branch " << branchname;
 820             cout << " for digits of type "<< i+1 << endl;
 821       }
 822     }
 823   }
 824
 825   if (cR) {
 826   //
 827   // only one branch for rec points for all detector types
 828   //
 829     sprintf(branchname,"%sRecPoints",GetName());
 830
 831     if(!fRecPoints) fRecPoints=new TClonesArray("AliITSRecPoint",10000);
 832
 833     if (fRecPoints && gAlice->TreeR()) {
 834       gAlice->MakeBranchInTree(gAlice->TreeR(),
 835                                branchname, &fRecPoints, buffersize, file) ;
 836       cout << "Making Branch " << branchname;
 837       cout << " for reconstructed space points" << endl;
 838     }
 839   }
 840 }
 841
 842 //___________________________________________
 843 void AliITS::SetTreeAddress()
 844 {
 845
 846   // Set branch address for the Trees.
 847
 848   char branchname[30];
 849   AliDetector::SetTreeAddress();
 850
 851   const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 852
 853   TBranch *branch;
 854   TTree *treeD = gAlice->TreeD();
 855   TTree *treeR = gAlice->TreeR();
 856
 857   Int_t i;
 858   if (treeD) {
 859       for (i=0; i<kNTYPES; i++) {
 860           if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
 861           else  sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 862           if (fDtype) {
 863               branch = treeD->GetBranch(branchname);
 864               if (branch) branch->SetAddress(&((*fDtype)[i]));
 865           }
 866       }
 867   }
 868
 869
 870   if (treeR) {
 871     sprintf(branchname,"%sRecPoints",GetName());
 872       branch = treeR->GetBranch(branchname);
 873       if (branch) branch->SetAddress(&fRecPoints);
 874   }
 875
 876
 877 }
 878
 879 //____________________________________________________________________________
 880 void AliITS::InitModules(Int_t size,Int_t &nmodules){
 881
 882   //initialize the modules array
 883
 884   if(fITSmodules){
 885       fITSmodules->Delete();
 886       delete fITSmodules;
 887   }
 888
 889     Int_t nl,indexMAX,index;
 890
 891     if(size<=0){ // default to using data stored in AliITSgeom
 892         if(fITSgeom==0) {
 893             Error("AliITS::InitModules",
 894                 "in AliITS::InitModule fITSgeom not defined\n");
 895             return;
 896         } // end if fITSgeom==0
 897         nl = fITSgeom->GetNlayers();
 898         indexMAX = fITSgeom->GetModuleIndex(nl,fITSgeom->GetNladders(nl),
 899                                             fITSgeom->GetNdetectors(nl))+1;
 900         nmodules = indexMAX;
 901         fITSmodules = new TObjArray(indexMAX);
 902         for(index=0;index<indexMAX;index++){
 903                 fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 904         } // end for index
 905     }else{
 906         fITSmodules = new TObjArray(size);
 907         for(index=0;index<size;index++) {
 908             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 909         }
 910
 911         nmodules = size;
 912     } // end i size<=0
 913 }
 914
 915 //____________________________________________________________________________
 916 void AliITS::FillModules(Int_t evnt,Int_t bgrev,Int_t nmodules,Option_t *option,Text_t *filename){
 917
 918   // fill the modules with the sorted by module hits; add hits from background
 919   // if option=Add
 920
 921
 922     static TTree *trH1;                 //Tree with background hits
 923     static TClonesArray *fHits2;        //List of hits for one track only
 924
 925     static Bool_t first=kTRUE;
 926     static TFile *file;
 927     const char *addBgr = strstr(option,"Add");
 928
 929
 930     if (addBgr ) {
 931         if(first) {
 932             cout<<"filename "<<filename<<endl;
 933             file=new TFile(filename);
 934             cout<<"I have opened "<<filename<<" file "<<endl;
 935             fHits2     = new TClonesArray("AliITShit",1000  );
 936         }
 937         first=kFALSE;
 938         file->cd();
 939         file->ls();
 940         // Get Hits Tree header from file
 941         if(fHits2) fHits2->Clear();
 942         if(trH1) delete trH1;
 943         trH1=0;
 944
 945         char treeName[20];
 946         sprintf(treeName,"TreeH%d",bgrev);
 947         trH1 = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 948         //printf("TrH1 %p of treename %s for event %d \n",trH1,treeName,bgrev);
 949
 950         if (!trH1) {
 951             Error("AliITS::FillModules",
 952             "cannot find Hits Tree for event:%d\n",bgrev);
 953         }
 954         // Set branch addresses
 955         TBranch *branch;
 956         char branchname[20];
 957         sprintf(branchname,"%s",GetName());
 958         if (trH1 && fHits2) {
 959             branch = trH1->GetBranch(branchname);
 960             if (branch) branch->SetAddress(&fHits2);
 961         }
 962
 963         // test
 964         //Int_t ntracks1 =(Int_t)TrH1->GetEntries();
 965         //printf("background - ntracks1 - %d\n",ntracks1);
 966    }
 967
 968     //Int_t npart = gAlice->GetEvent(evnt);
 969     //if(npart<=0) return;
 970     TClonesArray *itsHits = this->Hits();
 971     Int_t lay,lad,det,index;
 972     AliITShit *itsHit=0;
 973     AliITSmodule *mod=0;
 974
 975     TTree *iTH = gAlice->TreeH();
 976     Int_t ntracks =(Int_t) iTH->GetEntries();
 977
 978     Int_t t,h;
 979     for(t=0; t<ntracks; t++){
 980         gAlice->ResetHits();
 981         iTH->GetEvent(t);
 982         Int_t nhits = itsHits->GetEntriesFast();
 983         //printf("nhits %d\n",nhits);
 984         if (!nhits) continue;
 985         for(h=0; h<nhits; h++){
 986             itsHit = (AliITShit *)itsHits->UncheckedAt(h);
 987             itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
 988             // temporarily index=det-1 !!!
 989             if(fITSgeom) index = fITSgeom->GetModuleIndex(lay,lad,det);
 990             else index=det-1;
 991             //
 992             mod = this->GetModule(index);
 993             mod->AddHit(itsHit,t,h);
 994         } // end loop over hits
 995     } // end loop over tracks
 996
 997     // open the file with background
 998
 999     if (addBgr ) {
1000           Int_t track,i;
1001           ntracks =(Int_t)trH1->GetEntries();
1002             //printf("background - ntracks1 %d\n",ntracks);
1003             //printf("background - Start loop over tracks \n");
1004             //   Loop over tracks
1005
1006             for (track=0; track<ntracks; track++) {
1007
1008                 if (fHits2)       fHits2->Clear();
1009                 trH1->GetEvent(track);
1010                 //   Loop over hits
1011                 for(i=0;i<fHits2->GetEntriesFast();++i) {
1012
1013                     itsHit=(AliITShit*) (*fHits2)[i];
1014                     itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
1015                     // temporarily index=det-1 !!!
1016                     if(fITSgeom) index = fITSgeom->GetModuleIndex(lay,lad,det);
1017                     else index=det-1;
1018                     //
1019                     mod = this->GetModule(index);
1020                     mod->AddHit(itsHit,track,i);
1021                }  // end loop over hits
1022             } // end loop over tracks
1023
1024             TTree *fAli=gAlice->TreeK();
1025             TFile *fileAli=0;
1026
1027             if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
1028             fileAli->cd();
1029
1030     } // end if add
1031
1032     //gObjectTable->Print();
1033
1034 }
1035
1036 //____________________________________________________________________________
1037
1038 void AliITS::SDigits2Digits()
1039 {
1040
1041   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1042
1043   // SPD
1044   AliITSDetType *iDetType;
1045   iDetType=DetType(0);
1046   AliITSsegmentationSPD *seg0=(AliITSsegmentationSPD*)iDetType->GetSegmentationModel();
1047   AliITSresponseSPD *res0 = (AliITSresponseSPD*)iDetType->GetResponseModel();
1048   AliITSsimulationSPD *sim0=new AliITSsimulationSPD(seg0,res0);
1049   SetSimulationModel(0,sim0);
1050   // test
1051   // printf("SPD dimensions %f %f \n",seg0->Dx(),seg0->Dz());
1052   // printf("SPD npixels %d %d \n",seg0->Npz(),seg0->Npx());
1053   // printf("SPD pitches %d %d \n",seg0->Dpz(0),seg0->Dpx(0));
1054   // end test
1055   //
1056   // SDD
1057   //Set response functions
1058   // SDD compression param: 2 fDecrease, 2fTmin, 2fTmax or disable, 2 fTolerance
1059
1060   iDetType=DetType(1);
1061   AliITSresponseSDD *res1 = (AliITSresponseSDD*)iDetType->GetResponseModel();
1062   if (!res1) {
1063     res1=new AliITSresponseSDD();
1064     SetResponseModel(1,res1);
1065   }
1066   Float_t noise, baseline;
1067   res1->GetNoiseParam(noise,baseline);
1068   Float_t noise_after_el =  res1->GetNoiseAfterElectronics();
1069   Float_t fCutAmp = baseline + 2.*noise_after_el;
1070   Int_t cp[8]={0,0,(int)fCutAmp,(int)fCutAmp,0,0,0,0}; //1D
1071   res1->SetCompressParam(cp);
1072   AliITSsegmentationSDD *seg1=(AliITSsegmentationSDD*)iDetType->GetSegmentationModel();
1073   if (!seg1) {
1074     seg1 = new AliITSsegmentationSDD(geom,res1);
1075     SetSegmentationModel(1,seg1);
1076   }
1077   AliITSsimulationSDD *sim1=new AliITSsimulationSDD(seg1,res1);
1078   SetSimulationModel(1,sim1);
1079
1080   // SSD
1081   iDetType=DetType(2);
1082   AliITSsegmentationSSD *seg2=(AliITSsegmentationSSD*)iDetType->GetSegmentationModel();
1083   AliITSresponseSSD *res2 = (AliITSresponseSSD*)iDetType->GetResponseModel();
1084   res2->SetSigmaSpread(3.,2.);
1085   AliITSsimulationSSD *sim2=new AliITSsimulationSSD(seg2,res2);
1086   SetSimulationModel(2,sim2);
1087
1088   cerr<<"Digitizing ITS...\n";
1089
1090   TStopwatch timer;
1091   timer.Start();
1092   HitsToDigits(0,0,-1," ","All"," ");
1093   timer.Stop(); timer.Print();
1094
1095   delete sim0;
1096   delete sim1;
1097   delete sim2;
1098 }
1099
1100
1101 //____________________________________________________________________________
1102 void AliITS::HitsToDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size, Option_t *option, Option_t *opt,Text_t *filename)
1103 {
1104     // keep galice.root for signal and name differently the file for
1105     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
1106
1107    // the condition below will disappear when the geom class will be
1108    // initialised for all versions - for the moment it is only for v5 !
1109    // 7 is the SDD beam test version
1110    Int_t ver = this->IsVersion();
1111    if(ver!=5 && ver!=7) return;
1112
1113    const char *all = strstr(opt,"All");
1114    const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),strstr(opt,"SSD")};
1115    cout<<" 1 AliITS "<<endl;
1116    Int_t nmodules;
1117    InitModules(size,nmodules);
1118    cout<<" 2 AliITS "<<endl;
1119    FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
1120    cout<<" 3 AliITS "<<endl;
1121
1122    //TBranch *branch;
1123    AliITSsimulation* sim;
1124    //TObjArray *branches=gAlice->TreeD()->GetListOfBranches();
1125    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1126
1127    Int_t id,module;
1128    Int_t lay, lad, detect;
1129    Int_t first,last;
1130    for (id=0;id<kNTYPES;id++) {
1131         if (!all && !det[id]) continue;
1132         //branch = (TBranch*)branches->UncheckedAt(id);
1133         AliITSDetType *iDetType=DetType(id);
1134         sim = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
1135
1136         if (!sim) {
1137            Error("HitsToDigits","The simulation class was not instantiated!");
1138            exit(1);
1139            // or SetDefaultSimulation();
1140         }
1141
1142         if(geom) {
1143           first = geom->GetStartDet(id);
1144           last = geom->GetLastDet(id);
1145         } else first=last=0;
1146         cout << "det type " << id << " first, last "<< first << last << endl;
1147         for(module=first;module<=last;module++) {
1148             AliITSmodule *mod = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
1149
1150             geom->GetModuleId(module,lay, lad, detect);
1151             if ( lay == 6 )
1152               ((AliITSsegmentationSSD*)(((AliITSsimulationSSD*)sim)->GetSegmentation()))->SetLayer(6);
1153             if ( lay == 5 )
1154               ((AliITSsegmentationSSD*)(((AliITSsimulationSSD*)sim)->GetSegmentation()))->SetLayer(5);
1155
1156             sim->DigitiseModule(mod,module,evNumber);
1157             // fills all branches - wasted disk space
1158             gAlice->TreeD()->Fill();
1159             ResetDigits();
1160             // try and fill only the branch
1161             //branch->Fill();
1162             //ResetDigits(id);
1163         } // loop over modules
1164    } // loop over detector types
1165
1166    ClearModules();
1167
1168    Int_t nentries=(Int_t)gAlice->TreeD()->GetEntries();
1169    cout << "nentries in TreeD" << nentries << endl;
1170
1171    char hname[30];
1172    sprintf(hname,"TreeD%d",evNumber);
1173    gAlice->TreeD()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
1174    // reset tree
1175    gAlice->TreeD()->Reset();
1176
1177 }
1178
1179
1180 //____________________________________________________________________________
1181 void AliITS::DigitsToRecPoints(Int_t evNumber,Int_t lastentry,Option_t *opt)
1182 {
1183   // cluster finding and reconstruction of space points
1184
1185    // the condition below will disappear when the geom class will be
1186    // initialised for all versions - for the moment it is only for v5 !
1187    // 7 is the SDD beam test version
1188    Int_t ver = this->IsVersion();
1189    if(ver!=5) return;
1190
1191    const char *all = strstr(opt,"All");
1192    const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),strstr(opt,"SSD")};
1193
1194    static Bool_t first=kTRUE;
1195    if (!TreeC() && first) {
1196        MakeTreeC("C");
1197        first=kFALSE;
1198    }
1199
1200    TTree *treeC=TreeC();
1201
1202
1203    //TBranch *branch;
1204    AliITSClusterFinder* rec;
1205
1206    //TObjArray *branches=gAlice->TreeR()->GetListOfBranches();
1207    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1208
1209    Int_t id,module;
1210    for (id=0;id<kNTYPES;id++) {
1211         if (!all && !det[id]) continue;
1212         //branch = (TBranch*)branches->UncheckedAt(id);
1213         AliITSDetType *iDetType=DetType(id);
1214         rec = (AliITSClusterFinder*)iDetType->GetReconstructionModel();
1215         if (!rec) {
1216            Error("DigitsToRecPoints","The cluster finder class was not instantiated!");
1217            exit(1);
1218            // or SetDefaultClusterFinders();
1219         }
1220         TClonesArray *itsDigits  = this->DigitsAddress(id);
1221
1222         Int_t first,last;
1223         if(geom) {
1224           first = geom->GetStartDet(id);
1225           last = geom->GetLastDet(id);
1226         } else first=last=0;
1227         //printf("first last %d %d\n",first,last);
1228         for(module=first;module<=last;module++) {
1229               this->ResetDigits();
1230               if (all) gAlice->TreeD()->GetEvent(lastentry+module);
1231               else gAlice->TreeD()->GetEvent(lastentry+(module-first));
1232               Int_t ndigits = itsDigits->GetEntriesFast();
1233               if (ndigits) rec->FindRawClusters();
1234               gAlice->TreeR()->Fill();
1235               ResetRecPoints();
1236               treeC->Fill();
1237               ResetClusters();
1238               // try and fill only the branch
1239               //branch->Fill();
1240               //ResetRecPoints(id);
1241         } // loop over modules
1242    } // loop over detector types
1243
1244
1245    Int_t nentries=(Int_t)gAlice->TreeR()->GetEntries();
1246    Int_t ncentries=(Int_t)treeC->GetEntries();
1247    cout << " nentries ncentries " << nentries << ncentries <<  endl;
1248
1249    char hname[30];
1250    sprintf(hname,"TreeR%d",evNumber);
1251    gAlice->TreeR()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
1252    // reset tree
1253    gAlice->TreeR()->Reset();
1254
1255    sprintf(hname,"TreeC%d",evNumber);
1256    treeC->Write(hname,TObject::kOverwrite);
1257    treeC->Reset();
1258 }
1259
1260
1261 //____________________________________________________________________________
1262 void AliITS::HitsToFastRecPoints(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
1263 Option_t *option,Option_t *opt,Text_t *filename)
1264 {
1265     // keep galice.root for signal and name differently the file for
1266     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
1267
1268
1269    // the condition below will disappear when the geom class will be
1270    // initialised for all versions - for the moment it is only for v5 !
1271    Int_t ver = this->IsVersion();
1272    if(ver!=5) return;
1273
1274    const char *all = strstr(opt,"All");
1275    const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),strstr(opt,"SSD")};
1276
1277    Int_t nmodules;
1278    InitModules(size,nmodules);
1279    FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
1280
1281
1282    AliITSsimulation* sim;
1283    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1284
1285    TRandom *random=new TRandom[9];
1286    random[0].SetSeed(111);
1287    random[1].SetSeed(222);
1288    random[2].SetSeed(333);
1289    random[3].SetSeed(444);
1290    random[4].SetSeed(555);
1291    random[5].SetSeed(666);
1292    random[6].SetSeed(777);
1293    random[7].SetSeed(888);
1294    random[8].SetSeed(999);
1295
1296
1297    Int_t id,module;
1298    for (id=0;id<kNTYPES;id++) {
1299         if (!all && !det[id]) continue;
1300         AliITSDetType *iDetType=DetType(id);
1301         sim = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
1302         if (!sim) {
1303            Error("HitsToFastPoints","The simulation class was not instantiated!");
1304            exit(1);
1305            // or SetDefaultSimulation();
1306         }
1307         Int_t first = geom->GetStartDet(id);
1308         Int_t last = geom->GetLastDet(id);
1309         for(module=first;module<=last;module++) {
1310             AliITSmodule *mod = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
1311             sim->CreateFastRecPoints(mod,module,random);
1312             gAlice->TreeR()->Fill();
1313             ResetRecPoints();
1314         } // loop over modules
1315    } // loop over detector types
1316
1317
1318    ClearModules();
1319
1320    //Int_t nentries=(Int_t)gAlice->TreeR()->GetEntries();
1321
1322    char hname[30];
1323    sprintf(hname,"TreeR%d",evNumber);
1324    gAlice->TreeR()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
1325    // reset tree
1326    gAlice->TreeR()->Reset();
1327
1328    delete [] random;
1329
1330 }
1331
1332 //________________________________________________________________
1333
1334 AliITStrack  AliITS::Tracking(AliITStrack &track, AliITStrack *reference,TObjArray *fastpoints, Int_t
1335 **vettid, Bool_t flagvert,  AliITSRad *rl  ) {
1336
1337 //Origin  A. Badala' and G.S. Pappalardo:  e-mail Angela.Badala@ct.infn.it, Giuseppe.S.Pappalardo@ct.infn.it
1338
1339
1340   TList *list= new TList();
1341
1342   AliITStrack tr(track);
1343
1344   list->AddLast(&tr);
1345
1346   Double_t Pt=(tr).GetPt();
1347   cout << "\n Pt = " << Pt <<"\n";
1348
1349   AliITStracking obj(list, reference, this, fastpoints,TMath::Abs(Pt),vettid, flagvert, rl);
1350   list->Delete();
1351   delete list;
1352
1353   Int_t itot=-1;
1354   TVector VecTotLabref(18);
1355   Int_t lay, k;
1356   for(lay=5; lay>=0; lay--) {
1357     TVector VecLabref(3);
1358     VecLabref=(*reference).GetLabTrack(lay);
1359     Float_t ClustZ=(*reference).GetZclusterTrack( lay);   //modified il 5-3-2001
1360     for(k=0; k<3; k++) { // {itot++; VecTotLabref(itot)=VecLabref(k);}  // modified 5-3-2002
1361
1362         Int_t lpp=(Int_t)VecLabref(k);
1363         if(lpp>=0) {
1364           TParticle *p=(TParticle*) gAlice->Particle(lpp);
1365           Int_t pcode=p->GetPdgCode();
1366           if(pcode==11) VecLabref(k)=p->GetFirstMother();
1367         }
1368
1369         itot++; VecTotLabref(itot)=VecLabref(k);
1370         if(VecLabref(k)==0. && ClustZ == 0.) VecTotLabref(itot) =-3.;
1371     }
1372   }
1373   Long_t labref;
1374   Int_t freq;
1375   (*reference).Search(VecTotLabref, labref, freq);
1376
1377   if(freq < 5) labref=-labref;
1378   (*reference).SetLabel(labref);
1379
1380   return *reference;
1381
1382 }
1383
1384
1385
1386 //________________________________________________________________
1387
1388
1389
1390 void AliITS::DoTracking(Int_t evNumber, Int_t min_t, Int_t max_t, TFile *file, Bool_t flagvert) {
1391
1392 //   ex macro for tracking ITS
1393
1394   printf("begin DoTracking - file %p\n",file);
1395
1396   //const char *pname="75x40_100x60";  //commentato il 24-4-2001
1397
1398  Int_t imax=200,jmax=450;
1399   AliITSRad *rl = new AliITSRad(imax,jmax);
1400   //cout<<" dopo costruttore AliITSRad\n"; getchar();
1401
1402   struct GoodTrack {
1403     Int_t lab,code;
1404     Float_t px,py,pz,x,y,z,pxg,pyg,pzg,ptg;
1405     Bool_t flag;
1406   };
1407
1408
1409   gAlice->GetEvent(0);
1410
1411   //new
1412   //AliKalmanTrack::SetConvConst(100/0.299792458/0.2/gAlice->Field()->Factor());
1413   AliKalmanTrack *kkprov;
1414   kkprov->SetConvConst(100/0.299792458/0.2/gAlice->Field()->Factor());
1415
1416   /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1417
1418   TFile *cf=TFile::Open("AliTPCclusters.root");
1419   AliTPCParam *digp= (AliTPCParam*)cf->Get("75x40_100x60");
1420   if (!digp) { cerr<<"TPC parameters have not been found !\n"; getchar();}
1421
1422   GoodTrack gt[15000];
1423   Int_t ngood=0;
1424   ifstream in("itsgood_tracks");
1425
1426   cerr<<"Reading itsgood tracks...\n";
1427   while (in>>gt[ngood].lab>>gt[ngood].code
1428           >>gt[ngood].px >>gt[ngood].py>>gt[ngood].pz
1429           >>gt[ngood].x  >>gt[ngood].y >>gt[ngood].z
1430           >>gt[ngood].pxg  >>gt[ngood].pyg >>gt[ngood].pzg
1431           >>gt[ngood].ptg >>gt[ngood].flag) {
1432     ngood++;
1433     cerr<<ngood<<'\r';
1434     if (ngood==15000) {
1435       cerr<<"Too many good tracks !\n";
1436       break;
1437     }
1438   }
1439   if (!in.eof()) cerr<<"Read error (itsgood_tracks) !\n";
1440
1441
1442 // Load tracks
1443   //TFile *tf=TFile::Open("tpctracks.root");
1444   TFile *tf=TFile::Open("AliTPCtracks.root");
1445   if (!tf->IsOpen()) {cerr<<"Can't open AliTPCtracks.root !\n"; return ;}
1446     TObjArray tracks(200000);
1447   //TObjArray tracks(2000);  //nuovo 24-4-2001
1448
1449   TTree *tracktree=(TTree*)tf->Get("TreeT");
1450   TBranch *tbranch=tracktree->GetBranch("tracks");
1451   Int_t nentr=(Int_t)tracktree->GetEntries();
1452   Int_t kk;
1453    AliTPCtrack *iotracktpc=0;
1454   for (kk=0; kk<nentr; kk++) {
1455     iotracktpc=new AliTPCtrack;
1456     tbranch->SetAddress(&iotracktpc);
1457     tracktree->GetEvent(kk);
1458     tracks.AddLast(iotracktpc);
1459   }
1460   tf->Close();
1461
1462
1463   Int_t nt = tracks.GetEntriesFast();
1464   cerr<<"Number of found tracks "<<nt<<endl;
1465
1466   TVector DataOut(9);
1467   Int_t kkk=0;
1468
1469   Double_t ptg=0.,pxg=0.,pyg=0.,pzg=0.;
1470
1471   //////////////////////////////  good tracks definition in TPC  ////////////////////////////////
1472
1473   ofstream out1 ("AliITSTrag.out");
1474   Int_t i;
1475   for (i=0; i<ngood; i++) out1 << gt[i].ptg << "\n";
1476   out1.close();
1477
1478
1479   TVector vec(5);
1480   TTree *TR=gAlice->TreeR();
1481   Int_t nent=(Int_t)TR->GetEntries();
1482   TClonesArray  *recPoints = RecPoints();
1483   Int_t numbpoints;
1484   Int_t totalpoints=0;
1485   Int_t *np = new Int_t[nent];
1486   Int_t **vettid = new Int_t* [nent];
1487   Int_t mod;
1488   for (mod=0; mod<nent; mod++) {
1489     vettid[mod]=0;
1490     this->ResetRecPoints();
1491     //gAlice->TreeR()->GetEvent(mod+1); //first entry in TreeR is empty
1492     gAlice->TreeR()->GetEvent(mod); //first entry in TreeR is empty
1493     numbpoints = recPoints->GetEntries();
1494     totalpoints+=numbpoints;
1495     np[mod] = numbpoints;
1496     cout<<" mod = "<<mod<<"   numbpoints = "<<numbpoints<<"\n"; //getchar();
1497     vettid[mod] = new Int_t[numbpoints];
1498     Int_t ii;
1499     for (ii=0;ii<numbpoints; ii++) *(vettid[mod]+ii)=0;
1500   }
1501
1502    AliTPCtrack *track=0;
1503
1504   if(min_t < 0) {min_t = 0; max_t = nt-1;}
1505
1506 /*
1507   ///////////////////////////////// Definition of vertex end its error ////////////////////////////
1508   ////////////////////////// In the future it will be given by a method ///////////////////////////
1509   Double_t Vx=0.;
1510   Double_t Vy=0.;
1511   Double_t Vz=0.;
1512
1513   Float_t sigmavx=0.0050;      // 50  microns
1514   Float_t sigmavy=0.0050;      // 50  microns
1515   Float_t sigmavz=0.010;       // 100 microns
1516
1517   //Vx+=gRandom->Gaus(0,sigmavx);  Vy+=gRandom->Gaus(0,sigmavy);  Vz+=gRandom->Gaus(0,sigmavz);
1518   TVector vertex(3), ervertex(3)
1519   vertex(0)=Vx; vertex(1)=Vy; vertex(2)=Vz;
1520   ervertex(0)=sigmavx;  ervertex(1)=sigmavy;  ervertex(2)=sigmavz;
1521   /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1522 */
1523
1524   //TDirectory *savedir=gDirectory;
1525
1526   TTree tracktree1("TreeT","Tree with ITS tracks");
1527   AliITSiotrack *iotrack=0;
1528   tracktree1.Branch("ITStracks","AliITSiotrack",&iotrack,32000,0);
1529
1530   ofstream out ("AliITSTra.out");
1531
1532   Int_t j;
1533   for (j=min_t; j<=max_t; j++) {
1534     track=(AliTPCtrack*)tracks.UncheckedAt(j);
1535
1536     Int_t flaglab=0;
1537     if (!track) continue;
1538     ////// elimination of not good tracks ////////////
1539     Int_t ilab=TMath::Abs(track->GetLabel());
1540     Int_t iii;
1541     for (iii=0;iii<ngood;iii++) {
1542          //cout<<" ilab, gt[iii].lab = "<<ilab<<" "<<gt[iii].lab<<"\n"; getchar();
1543       if (ilab==gt[iii].lab) {
1544         flaglab=1;
1545         ptg=gt[iii].ptg;
1546         pxg=gt[iii].pxg;
1547         pyg=gt[iii].pyg;
1548         pzg=gt[iii].pzg;
1549         break;
1550       }
1551     }
1552          //cout<<" j flaglab =  " <<j<<" "<<flaglab<<"\n";  getchar();
1553     if (!flaglab) continue;
1554          //cout<<" j =  " <<j<<"\n";  getchar();
1555   /*
1556     ////// old propagation to the end of TPC //////////////
1557     Double_t xk=76.;
1558     track->PropagateTo(xk);
1559     xk-=0.11;
1560     track->PropagateTo(xk,42.7,2.27); //C
1561     xk-=2.6;
1562     track->PropagateTo(xk,36.2,1.98e-3); //C02
1563     xk-=0.051;
1564     track->PropagateTo(xk,42.7,2.27); //C
1565     ///////////////////////////////////////////////////
1566          */
1567
1568          ////// new propagation to the end of TPC //////////////
1569     Double_t xk=77.415;
1570     track->PropagateTo(xk, 28.94, 1.204e-3);     //Ne
1571          xk -=0.01;
1572     track->PropagateTo(xk, 44.77, 1.71);         //Tedlar
1573          xk -=0.04;
1574     track->PropagateTo(xk, 44.86, 1.45);         //Kevlar
1575          xk -=2.0;
1576     track->PropagateTo(xk, 41.28, 0.029);        //Nomex
1577     xk-=16;
1578     track->PropagateTo(xk,36.2,1.98e-3); //C02
1579          xk -=0.01;
1580     track->PropagateTo(xk, 24.01, 2.7);  //Al
1581          xk -=0.01;
1582     track->PropagateTo(xk, 44.77, 1.71);         //Tedlar
1583          xk -=0.04;
1584     track->PropagateTo(xk, 44.86, 1.45);         //Kevlar
1585          xk -=0.5;
1586     track->PropagateTo(xk, 41.28, 0.029);        //Nomex
1587
1588        ///////////////////////////////////////////////////////////////
1589
1590    ///////////////////////////////////////////////////////////////
1591     AliITStrack trackITS(*track);
1592     AliITStrack result(*track);
1593     AliITStrack primarytrack(*track);
1594
1595 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1596          TVector Vgeant(3);
1597          Vgeant=result.GetVertex();
1598
1599   // Definition of Dv and Zv for vertex constraint
1600      Double_t sigmaDv=0.0050;  Double_t sigmaZv=0.010;
1601     //Double_t sigmaDv=0.0015;  Double_t sigmaZv=0.0015;
1602         Double_t uniform= gRandom->Uniform();
1603         Double_t signdv;
1604         if(uniform<=0.5) signdv=-1.;
1605            else
1606                  signdv=1.;
1607
1608         Double_t Vr=TMath::Sqrt(Vgeant(0)*Vgeant(0)+ Vgeant(1)*Vgeant(1));
1609           Double_t Dv=gRandom->Gaus(signdv*Vr,(Float_t)sigmaDv);
1610     Double_t Zv=gRandom->Gaus(Vgeant(2),(Float_t)sigmaZv);
1611
1612   //cout<<" Dv e Zv = "<<Dv<<" "<<Zv<<"\n";
1613     trackITS.SetDv(Dv);  trackITS.SetZv(Zv);
1614     trackITS.SetsigmaDv(sigmaDv); trackITS.SetsigmaZv(sigmaZv);
1615     result.SetDv(Dv);  result.SetZv(Zv);
1616     result.SetsigmaDv(sigmaDv); result.SetsigmaZv(sigmaZv);
1617     primarytrack.SetDv(Dv);  primarytrack.SetZv(Zv);
1618     primarytrack.SetsigmaDv(sigmaDv); primarytrack.SetsigmaZv(sigmaZv);
1619
1620 /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1621
1622     primarytrack.PrimaryTrack(rl);
1623     TVector  d2=primarytrack.Getd2();
1624     TVector  tgl2=primarytrack.Gettgl2();
1625     TVector  dtgl=primarytrack.Getdtgl();
1626     trackITS.Setd2(d2); trackITS.Settgl2(tgl2);  trackITS.Setdtgl(dtgl);
1627     result.Setd2(d2); result.Settgl2(tgl2);  result.Setdtgl(dtgl);
1628          /*
1629     trackITS.SetVertex(vertex); trackITS.SetErrorVertex(ervertex);
1630     result.SetVertex(vertex);   result.SetErrorVertex(ervertex);
1631     */
1632     Tracking(trackITS,&result,recPoints,vettid, flagvert,rl);
1633
1634     // cout<<" progressive track number = "<<j<<"\r";
1635    // cout<<j<<"\r";
1636     cout<<" progressive track number = "<<j<<"\n";
1637     Long_t labITS=result.GetLabel();
1638     cout << " ITS track label = " << labITS << "\n";
1639     int lab=track->GetLabel();
1640     cout << " TPC track label = " << lab <<"\n";
1641     //result.GetClusters(); getchar();  //to print the cluster matrix
1642
1643 //propagation to vertex
1644
1645     Double_t rbeam=3.;
1646
1647     result.Propagation(rbeam);
1648
1649     TMatrix *cov;
1650          cov=&result.GetCMatrix();
1651     Double_t pt=TMath::Abs(result.GetPt());
1652     Double_t Dr=result.GetD();
1653     Double_t Z=result.GetZ();
1654     Double_t tgl=result.GetTgl();
1655     Double_t C=result.GetC();
1656     Double_t Cy=C/2.;
1657     Double_t Dz=Z-(tgl/Cy)*TMath::ASin(result.arga(rbeam));
1658           Dz-=Vgeant(2);
1659
1660          // cout<<" Dr e dz alla fine = "<<Dr<<" "<<Dz<<"\n"; getchar();
1661     Double_t phi=result.Getphi();
1662     Double_t phivertex = phi - TMath::ASin(result.argA(rbeam));
1663     Double_t duepi=2.*TMath::Pi();
1664     if(phivertex>duepi) phivertex-=duepi;
1665     if(phivertex<0.) phivertex+=duepi;
1666     Double_t Dtot=TMath::Sqrt(Dr*Dr+Dz*Dz);
1667
1668 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1669     Int_t NumofCluster, idmodule,idpoint;
1670     NumofCluster=result.GetNumClust();
1671     if(NumofCluster >=5)  {
1672
1673
1674       AliITSiotrack outtrack;
1675
1676       iotrack=&outtrack;
1677
1678       iotrack->SetStatePhi(phi);
1679       iotrack->SetStateZ(Z);
1680       iotrack->SetStateD(Dr);
1681       iotrack->SetStateTgl(tgl);
1682       iotrack->SetStateC(C);
1683                 Double_t radius=result.Getrtrack();
1684                 iotrack->SetRadius(radius);
1685                 Int_t charge;
1686                 if(C>0.) charge=-1;  else charge=1;
1687                 iotrack->SetCharge(charge);
1688
1689
1690
1691       iotrack->SetCovMatrix(cov);
1692
1693       Double_t px=pt*TMath::Cos(phivertex);
1694       Double_t py=pt*TMath::Sin(phivertex);
1695       Double_t pz=pt*tgl;
1696
1697       Double_t xtrack=Dr*TMath::Sin(phivertex);
1698       Double_t ytrack=Dr*TMath::Cos(phivertex);
1699       Double_t ztrack=Dz+Vgeant(2);
1700
1701
1702       iotrack->SetPx(px);
1703       iotrack->SetPy(py);
1704       iotrack->SetPz(pz);
1705       iotrack->SetX(xtrack);
1706       iotrack->SetY(ytrack);
1707       iotrack->SetZ(ztrack);
1708       iotrack->SetLabel(labITS);
1709
1710       Int_t il;
1711                 for(il=0;il<6; il++){
1712                   iotrack->SetIdPoint(il,result.GetIdPoint(il));
1713                   iotrack->SetIdModule(il,result.GetIdModule(il));
1714                 }
1715       tracktree1.Fill();
1716
1717    //cout<<" labITS = "<<labITS<<"\n";
1718         //cout<<" phi z Dr tgl C = "<<phi<<" "<<Z<<" "<<Dr<<" "<<tgl<<" "<<C<<"\n";  getchar();
1719
1720      DataOut(kkk) = ptg; kkk++; DataOut(kkk)=labITS; kkk++; DataOut(kkk)=lab; kkk++;
1721
1722       for (il=0;il<6;il++) {
1723         idpoint=result.GetIdPoint(il);
1724         idmodule=result.GetIdModule(il);
1725         *(vettid[idmodule]+idpoint)=1;
1726         iotrack->SetIdPoint(il,idpoint);
1727         iotrack->SetIdModule(il,idmodule);
1728       }
1729
1730     //  cout<<"  +++++++++++++  pt e ptg = "<<pt<<" "<<ptg<<"  ++++++++++\n";
1731       Double_t difpt= (pt-ptg)/ptg*100.;
1732       DataOut(kkk)=difpt; kkk++;
1733       Double_t lambdag=TMath::ATan(pzg/ptg);
1734       Double_t   lam=TMath::ATan(tgl);
1735       Double_t diflam = (lam - lambdag)*1000.;
1736       DataOut(kkk) = diflam; kkk++;
1737       Double_t phig=TMath::ATan(pyg/pxg);
1738       Double_t phi=phivertex;
1739       Double_t difphi = (phi - phig)*1000.;
1740       DataOut(kkk)=difphi; kkk++;
1741       DataOut(kkk)=Dtot*1.e4; kkk++;
1742       DataOut(kkk)=Dr*1.e4; kkk++;
1743       DataOut(kkk)=Dz*1.e4; kkk++;
1744       Int_t r;
1745       for (r=0; r<9; r++) { out<<DataOut(r)<<" ";}
1746       out<<"\n";
1747       kkk=0;
1748
1749
1750     } // end if on NumofCluster
1751   //gObjectTable->Print();    // stampa memoria
1752   }  //  end for (int j=min_t; j<=max_t; j++)
1753
1754   out.close();
1755
1756
1757   static Bool_t first=kTRUE;
1758   static TFile *tfile;
1759
1760         if(first) {
1761             tfile=new TFile("itstracks.root","RECREATE");
1762             //cout<<"I have opened itstracks.root file "<<endl;
1763         }
1764         first=kFALSE;
1765         tfile->cd();
1766         tfile->ls();
1767
1768    char hname[30];
1769    sprintf(hname,"TreeT%d",evNumber);
1770
1771   tracktree1.Write(hname);
1772
1773
1774
1775             TTree *fAli=gAlice->TreeK();
1776             TFile *fileAli=0;
1777
1778             if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
1779             fileAli->cd();
1780
1781   ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1782
1783   printf("delete vectors\n");
1784   if(np) delete [] np;
1785   if(vettid) delete [] vettid;
1786
1787 }