ITS/AliITS.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /*
  17 $Log$
  18 Revision 1.27  2000/12/08 13:49:27  barbera
  19 Hidden declaration in a for loop removed to be compliant with HP-UX compiler
  20
  21 Revision 1.26  2000/11/27 13:12:13  barbera
  22 New version containing the files for tracking
  23
  24 Revision 1.25  2000/11/12 22:38:05  barbera
  25 Added header file for the SPD Bari model
  26
  27 Revision 1.24  2000/10/09 22:18:12  barbera
  28 Bug fixes from MAriana to le AliITStest.C run correctly
  29
  30 Revision 1.23  2000/10/05 20:47:42  nilsen
  31 fixed dependencies of include files. Tryed but failed to get a root automaticly
  32 generates streamer function to work. Modified SetDefaults.
  33
  34 Revision 1.9.2.15  2000/10/04 16:56:40  nilsen
  35 Needed to include stdlib.h
  36
  37 =======
  38 Revision 1.22  2000/10/04 19:45:52  barbera
  39 Corrected by F. Carminati for v3.04
  40
  41 Revision 1.21  2000/10/02 21:28:08  fca
  42 Removal of useless dependecies via forward declarations
  43
  44 Revision 1.20  2000/10/02 16:31:39  barbera
  45 General code clean-up
  46
  47 Revision 1.9.2.14  2000/10/02 15:43:51  barbera
  48 General code clean-up (e.g., printf -> cout)
  49
  50 Revision 1.19  2000/09/22 12:13:25  nilsen
  51 Patches and updates for fixes to this and other routines.
  52
  53 Revision 1.18  2000/07/12 05:32:20  fca
  54 Correcting several syntax problem with static members
  55
  56 Revision 1.17  2000/07/10 16:07:18  fca
  57 Release version of ITS code
  58
  59 Revision 1.9.2.3  2000/02/02 13:42:09  barbera
  60 fixed AliITS.cxx for new AliRun structure. Added ITS hits list to list of hits which will have their track numbers updated
  61
  62 Revision 1.9.2.2  2000/01/23 03:03:13  nilsen
  63 //fixed FillModule. Removed fi(fabs(xl)<dx....
  64
  65 Revision 1.9.2.1  2000/01/12 19:03:32  nilsen
  66 This is the version of the files after the merging done in December 1999.
  67 See the ReadMe110100.txt file for details
  68
  69 Revision 1.9  1999/11/14 14:33:25  fca
  70 Correct problems with distructors and pointers, thanks to I.Hrivnacova
  71
  72 Revision 1.8  1999/09/29 09:24:19  fca
  73 Introduction of the Copyright and cvs Log
  74
  75 */
  76
  77 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  78 //
  79 //      An overview of the basic philosophy of the ITS code development
  80 // and analysis is show in the figure below.
  81 //Begin_Html
  82 /*
  83 <img src="picts/ITS/ITS_Analysis_schema.gif">
  84 </pre>
  85 <br clear=left>
  86 <font size=+2 color=red>
  87 <p>Roberto Barbera is in charge of the ITS Offline code (1999).
  88 <a href="mailto:roberto.barbera@ct.infn.it">Roberto Barbera</a>.
  89 </font>
  90 <pre>
  91 */
  92 //End_Html
  93 //
  94 //  AliITS. Inner Traking System base class.
  95 //  This class contains the base procedures for the Inner Tracking System
  96 //
  97 //Begin_Html
  98 /*
  99 <img src="picts/ITS/AliITS_Class_Diagram.gif">
 100 </pre>
 101 <br clear=left>
 102 <font size=+2 color=red>
 103 <p>This show the class diagram of the different elements that are part of
 104 the AliITS class.
 105 </font>
 106 <pre>
 107 */
 108 //End_Html
 109 //
 110 // Version: 0
 111 // Written by Rene Brun, Federico Carminati, and Roberto Barbera
 112 //
 113 // Version: 1
 114 // Modified and documented by Bjorn S. Nilsen
 115 // July 11 1999
 116 //
 117 // Version: 2
 118 // Modified and documented by A. Bologna
 119 // October 18 1999
 120 //
 121 // AliITS is the general base class for the ITS. Also see AliDetector for
 122 // futher information.
 123 //
 124 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 125 #include <stdlib.h>
 126 #include <TMath.h>
 127 #include <TRandom.h>
 128 #include <TBranch.h>
 129 #include <TVector.h>
 130 #include <TObjArray.h>
 131 #include <TROOT.h>
 132 #include <TObjectTable.h>
 133 #include <TFile.h>
 134 #include <TTree.h>
 135 #include <TString.h>
 136
 137
 138
 139 #include "AliRun.h"
 140 #include "AliITS.h"
 141 #include "AliITSMap.h"
 142 #include "AliITSDetType.h"
 143 #include "AliITSClusterFinder.h"
 144 #include "AliITSsimulation.h"
 145 #include "AliITSresponse.h"
 146 #include "AliITSsegmentationSPD.h"
 147 #include "AliITSresponseSPD.h"
 148 #include "AliITSresponseSPDbari.h"
 149 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
 150 #include "AliITSresponseSDD.h"
 151 #include "AliITSsegmentationSSD.h"
 152 #include "AliITSresponseSSD.h"
 153 #include "AliITShit.h"
 154 #include "AliITSgeom.h"
 155 #include "AliITSdigit.h"
 156 #include "AliITSmodule.h"
 157 #include "AliITSRecPoint.h"
 158 #include "AliITSRawCluster.h"
 159 #include "AliMC.h"
 160 #include "stdlib.h"
 161
 162 #include "AliITStrack.h"
 163 #include "AliITSiotrack.h"
 164 #include "AliITStracking.h"
 165 #include "../TPC/AliTPC.h"
 166 #include "../TPC/AliTPCParam.h"
 167
 168 const Int_t AliITS::fgkNTYPES=3;
 169
 170 ClassImp(AliITS)
 171
 172 //_____________________________________________________________________________
 173 AliITS::AliITS() : AliDetector() {
 174   //
 175   // Default initialiser for ITS
 176   //     The default constructor of the AliITS class. In addition to
 177   // creating the AliITS class it zeros the variables fIshunt (a member
 178   // of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros the pointers
 179   // fITSpoints, fIdSens, and fIdName. The AliDetector default constructor
 180   // is also called.
 181   //
 182
 183
 184   fIshunt     = 0;
 185   fEuclidOut  = 0;
 186
 187   //fNDetTypes = fgkNTYPES;
 188   fIdN        = 0;
 189   fIdName     = 0;
 190   fIdSens     = 0;
 191   fITSmodules = 0;
 192   //
 193   fDetTypes   = 0;
 194   //
 195   fDtype  = 0;
 196   fNdtype = 0;
 197   fCtype  = 0;
 198   fNctype = 0;
 199   fRecPoints = 0;
 200   fNRecPoints = 0;
 201   fTreeC = 0;
 202   //
 203   fITSgeom=0;
 204 }
 205
 206 //_____________________________________________________________________________
 207 AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):AliDetector(name,title){
 208   //
 209   // Default initialiser for ITS
 210   //     The constructor of the AliITS class. In addition to creating the
 211   // AliITS class, it allocates memory for the TClonesArrays fHits and
 212   // fDigits, and for the TObjArray fITSpoints. It also zeros the variables
 213   // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros
 214   // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the ROOT
 215   // macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The variables
 216   // passes with this constructor, const char *name and *title, are used by
 217   // the constructor of AliDetector class. See AliDetector class for a
 218   // description of these parameters and its constructor functions.
 219   //
 220
 221
 222   fHits       = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 223   gAlice->AddHitList(fHits);
 224
 225   //fNDetTypes = fgkNTYPES;
 226
 227   fNdtype = new Int_t[fgkNTYPES];
 228   fDtype = new TObjArray(fgkNTYPES);
 229
 230   fNctype = new Int_t[fgkNTYPES];
 231   fCtype = new TObjArray(fgkNTYPES);
 232
 233
 234   fRecPoints = 0;
 235   fNRecPoints = 0;
 236
 237   fTreeC = 0;
 238
 239   fITSmodules = 0;
 240
 241   fIshunt     = 0;
 242   fEuclidOut  = 0;
 243   fIdN        = 0;
 244   fIdName     = 0;
 245   fIdSens     = 0;
 246
 247   fDetTypes = new TObjArray(fgkNTYPES);
 248
 249   Int_t i;
 250   for(i=0;i<fgkNTYPES;i++) {
 251     (*fDetTypes)[i]=new AliITSDetType();
 252     fNdtype[i]=0;
 253     fNctype[i]=0;
 254    }
 255   //
 256
 257   SetMarkerColor(kRed);
 258
 259   fITSgeom=0;
 260 }
 261 //___________________________________________________________________________
 262 AliITS::AliITS(AliITS &source){
 263   // copy constructor
 264   if(this==&source) return;
 265   Error("AliITS::Copy constructor",
 266         "You are not allowed to make a copy of the AliITS");
 267   exit(1);
 268 }
 269 //____________________________________________________________________________
 270 AliITS& AliITS::operator=(AliITS &source){
 271   // assignment operator
 272   if(this==&source) return *this;
 273   Error("AliITS::operator=",
 274         "You are not allowed to make a copy of the AliITS");
 275   exit(1);
 276   return *this; //fake return
 277 }
 278 //____________________________________________________________________________
 279 void AliITS::ClearModules(){
 280   //clear the modules TObjArray
 281
 282   if(fITSmodules) fITSmodules->Delete();
 283
 284 }
 285 //_____________________________________________________________________________
 286 AliITS::~AliITS(){
 287   //
 288   // Default distructor for ITS
 289   //     The default destructor of the AliITS class. In addition to deleting
 290   // the AliITS class it deletes the memory pointed to by the fHits, fDigits,
 291   // fIdSens, fIdName, and fITSpoints.
 292   //
 293
 294
 295   delete fHits;
 296   delete fDigits;
 297   delete fRecPoints;
 298 //  delete fIdName;        // TObjArray of TObjStrings
 299   if(fIdName!=0) delete[] fIdName;  // Array of TStrings
 300   if(fIdSens!=0) delete[] fIdSens;
 301   if(fITSmodules!=0) {
 302       this->ClearModules();
 303       delete fITSmodules;
 304   }// end if fITSmodules!=0
 305
 306   //
 307   if(fDtype) {
 308     fDtype->Delete();
 309     delete fDtype;
 310   }
 311   delete [] fNdtype;
 312   if (fCtype) {
 313     fCtype->Delete();
 314     delete fCtype;
 315   }
 316   delete [] fNctype;
 317   //
 318
 319   if (fDetTypes) {
 320     fDetTypes->Delete();
 321     delete fDetTypes;
 322   }
 323
 324   if (fTreeC) delete fTreeC;
 325
 326   if (fITSgeom) delete fITSgeom;
 327
 328 }
 329
 330 //___________________________________________
 331 AliITSDetType* AliITS::DetType(Int_t id)
 332 {
 333   //return pointer to id detector type
 334     return ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id]);
 335
 336 }
 337 //___________________________________________
 338 void AliITS::SetClasses(Int_t id, const char *digit, const char *cluster)
 339 {
 340   //set the digit and cluster classes to be used for the id detector type
 341     ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->ClassNames(digit,cluster);
 342
 343 }
 344 //___________________________________________
 345 void AliITS::SetResponseModel(Int_t id, AliITSresponse *response)
 346 {
 347   //set the response model for the id detector type
 348
 349     ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->ResponseModel(response);
 350
 351 }
 352
 353 //___________________________________________
 354 void AliITS::SetSegmentationModel(Int_t id, AliITSsegmentation *seg)
 355 {
 356   //set the segmentation model for the id detector type
 357
 358     ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->SegmentationModel(seg);
 359
 360 }
 361
 362 //___________________________________________
 363 void AliITS::SetSimulationModel(Int_t id, AliITSsimulation *sim)
 364 {
 365   //set the simulation model for the id detector type
 366
 367    ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->SimulationModel(sim);
 368
 369 }
 370 //___________________________________________
 371 void AliITS::SetReconstructionModel(Int_t id, AliITSClusterFinder *reconst)
 372 {
 373   //set the cluster finder model for the id detector type
 374
 375    ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->ReconstructionModel(reconst);
 376
 377 }
 378
 379 //_____________________________________________________________________________
 380 void AliITS::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits){
 381   //
 382   // Add an ITS hit
 383   //     The function to add information to the AliITShit class. See the
 384   // AliITShit class for a full description. This function allocates the
 385   // necessary new space for the hit information and passes the variable
 386   // track, and the pointers *vol and *hits to the AliITShit constructor
 387   // function.
 388   //
 389   TClonesArray &lhits = *fHits;
 390   new(lhits[fNhits++]) AliITShit(fIshunt,track,vol,hits);
 391 }
 392 //_____________________________________________________________________________
 393 void AliITS::AddRealDigit(Int_t id, Int_t *digits)
 394 {
 395   // add a real digit - as coming from data
 396
 397   TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)(*fDtype)[id]);
 398   new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigit(digits);
 399
 400 }
 401 //_____________________________________________________________________________
 402 void AliITS::AddSimDigit(Int_t id, AliITSdigit *d)
 403 {
 404
 405   // add a simulated digit
 406
 407   TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)(*fDtype)[id]);
 408
 409   switch(id)
 410   {
 411   case 0:
 412      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSPD(*((AliITSdigitSPD*)d));
 413      break;
 414   case 1:
 415      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSDD(*((AliITSdigitSDD*)d));
 416      break;
 417   case 2:
 418      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSSD(*((AliITSdigitSSD*)d));
 419      break;
 420   }
 421
 422 }
 423
 424 //_____________________________________________________________________________
 425 void AliITS::AddSimDigit(Int_t id,Float_t phys,Int_t *digits,Int_t *tracks,Int_t *hits,Float_t *charges){
 426
 427   // add a simulated digit to the list
 428
 429   TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)(*fDtype)[id]);
 430   switch(id)
 431   {
 432   case 0:
 433      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSPD(digits,tracks,hits);
 434      break;
 435   case 1:
 436      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSDD(phys,digits,tracks,hits,charges);
 437      break;
 438   case 2:
 439      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSSD(digits,tracks,hits);
 440      break;
 441   }
 442
 443 }
 444
 445 //_____________________________________________________________________________
 446 void AliITS::AddCluster(Int_t id, AliITSRawCluster *c)
 447 {
 448
 449   // add a cluster to the list
 450
 451   TClonesArray &lcl = *((TClonesArray*)(*fCtype)[id]);
 452
 453   switch(id)
 454   {
 455   case 0:
 456      new(lcl[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSPD(*((AliITSRawClusterSPD*)c));
 457      break;
 458   case 1:
 459      new(lcl[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSDD(*((AliITSRawClusterSDD*)c));
 460      break;
 461   case 2:
 462      new(lcl[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSSD(*((AliITSRawClusterSSD*)c));
 463      break;
 464   }
 465
 466 }
 467
 468
 469 //_____________________________________________________________________________
 470 void AliITS::AddRecPoint(const AliITSRecPoint &r)
 471 {
 472   //
 473   // Add a reconstructed space point to the list
 474   //
 475   TClonesArray &lrecp = *fRecPoints;
 476   new(lrecp[fNRecPoints++]) AliITSRecPoint(r);
 477 }
 478
 479
 480 //____________________________________________
 481 void AliITS::ResetDigits()
 482 {
 483     //
 484     // Reset number of digits and the digits array for the ITS detector
 485     //
 486
 487     if (!fDtype) return;
 488
 489     Int_t i;
 490     for (i=0;i<fgkNTYPES;i++ ) {
 491         if ((*fDtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fDtype)[i])->Clear();
 492         if (fNdtype)  fNdtype[i]=0;
 493     }
 494 }
 495
 496 //____________________________________________
 497 void AliITS::ResetDigits(Int_t i)
 498 {
 499     //
 500     // Reset number of digits and the digits array for this branch
 501     //
 502   if ((*fDtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fDtype)[i])->Clear();
 503   if (fNdtype)  fNdtype[i]=0;
 504 }
 505
 506
 507 //____________________________________________
 508 void AliITS::ResetClusters()
 509 {
 510     //
 511     // Reset number of clusters and the clusters array for ITS
 512     //
 513
 514     Int_t i;
 515     for (i=0;i<fgkNTYPES;i++ ) {
 516         if ((*fCtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fCtype)[i])->Clear();
 517         if (fNctype)  fNctype[i]=0;
 518     }
 519
 520 }
 521
 522 //____________________________________________
 523 void AliITS::ResetClusters(Int_t i)
 524 {
 525     //
 526     // Reset number of clusters and the clusters array for this branch
 527     //
 528         if ((*fCtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fCtype)[i])->Clear();
 529         if (fNctype)  fNctype[i]=0;
 530
 531 }
 532
 533
 534 //____________________________________________
 535 void AliITS::ResetRecPoints()
 536 {
 537     //
 538     // Reset number of rec points and the rec points array
 539     //
 540     if (fRecPoints) fRecPoints->Clear();
 541     fNRecPoints = 0;
 542
 543 }
 544
 545 //_____________________________________________________________________________
 546 Int_t AliITS::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t ){
 547   //
 548   // Distance from mouse to ITS on the screen. Dummy routine
 549   //     A dummy routine used by the ROOT macro display.C to allow for the
 550   // use of the mouse (pointing device) in the macro. In general this should
 551   // never be called. If it is it returns the number 9999 for any value of
 552   // x and y.
 553   //
 554   return 9999;
 555 }
 556
 557 //_____________________________________________________________________________
 558 void AliITS::Init(){
 559   //
 560   // Initialise ITS after it has been built
 561   //     This routine initializes the AliITS class. It is intended to be called
 562   // from the Init function in AliITSv?. Besides displaying a banner
 563   // indicating that it has been called it initializes the array fIdSens
 564   // and sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes
 565   // Therefore it should be called after a call to CreateGeometry.
 566   //
 567   Int_t i;
 568
 569   cout << endl;
 570   for(i=0;i<30;i++) cout << "*";cout << " ITS_INIT ";
 571   for(i=0;i<30;i++) cout << "*";cout << endl;
 572 //
 573   SetDefaults();
 574 // TObjArray of TObjStrings
 575 //  for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = gMC->VolId((fIdName->At(i))->GetName());
 576 // Array of TStrings
 577   for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = gMC->VolId(fIdName[i]);
 578 //
 579   for(i=0;i<70;i++) cout << "*";
 580   cout << endl;
 581 }
 582
 583 //_____________________________________________________________________________
 584 void AliITS::SetDefaults()
 585 {
 586   // sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes
 587
 588   printf("SetDefaults\n");
 589
 590   AliITSDetType *iDetType;
 591
 592
 593   //SPD
 594
 595   iDetType=DetType(0);
 596   if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
 597     AliITSsegmentationSPD *seg0=new AliITSsegmentationSPD(fITSgeom);
 598     SetSegmentationModel(0,seg0);
 599   }
 600   if (!iDetType->GetResponseModel()) {
 601      SetResponseModel(0,new AliITSresponseSPD());
 602   }
 603   // set digit and raw cluster classes to be used
 604
 605   const char *kData0=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
 606   if (strstr(kData0,"real")) {
 607       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSPD");
 608   } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSPD","AliITSRawClusterSPD");
 609
 610   // SDD                                          //
 611   iDetType=DetType(1);
 612   if (!iDetType->GetResponseModel()) {
 613     SetResponseModel(1,new AliITSresponseSDD());
 614   }
 615   AliITSresponse *resp1=iDetType->GetResponseModel();
 616   if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
 617     AliITSsegmentationSDD *seg1=new AliITSsegmentationSDD(fITSgeom,resp1);
 618     SetSegmentationModel(1,seg1);
 619   }
 620   const char *kData1=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
 621   const char *kopt=iDetType->GetResponseModel()->ZeroSuppOption();
 622   if ((!strstr(kopt,"2D")) && (!strstr(kopt,"1D")) || strstr(kData1,"real") ) {
 623       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSDD");
 624   } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSDD","AliITSRawClusterSDD");
 625
 626   // SSD
 627   iDetType=DetType(2);
 628   if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
 629     AliITSsegmentationSSD *seg2=new AliITSsegmentationSSD(fITSgeom);
 630     SetSegmentationModel(2,seg2);
 631   }
 632   if (!iDetType->GetResponseModel()) {
 633     SetResponseModel(2,new AliITSresponseSSD());
 634   }
 635   const char *kData2=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
 636   if (strstr(kData2,"real")) {
 637       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSSD");
 638   } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSSD","AliITSRawClusterSSD");
 639
 640   if (fgkNTYPES>3) {
 641     Warning("SetDefaults","Only the three basic detector types are initialised!");
 642   }
 643
 644 }
 645
 646
 647
 648 //_____________________________________________________________________________
 649 void AliITS::SetDefaultSimulation()
 650 {
 651   // to be written
 652
 653 }
 654 //_____________________________________________________________________________
 655 void AliITS::SetDefaultClusterFinders()
 656 {
 657   // to be written
 658
 659 }
 660 //_____________________________________________________________________________
 661
 662 void AliITS::MakeTreeC(Option_t *option)
 663 {
 664   // create a separate tree to store the clusters
 665
 666   cout << "AliITS::MakeTreeC" << endl;
 667
 668      char *optC = strstr(option,"C");
 669      if (optC && !fTreeC) fTreeC = new TTree("TC","Clusters in ITS");
 670      else return;
 671
 672      Int_t buffersize = 4000;
 673      char branchname[30];
 674
 675      char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 676
 677      // one branch for Clusters per type of detector
 678      Int_t i;
 679      for (i=0; i<fgkNTYPES ;i++) {
 680         if (fgkNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sClusters%s",GetName(),det[i]);
 681         else  sprintf(branchname,"%sClusters%d",GetName(),i+1);
 682         if (fCtype   && fTreeC) {
 683            TreeC()->Branch(branchname,&((*fCtype)[i]), buffersize);
 684            cout << "Making Branch " << branchname;
 685            cout << " for Clusters of detector type " << i+1 << endl;
 686         }
 687      }
 688
 689 }
 690
 691 //_____________________________________________________________________________
 692 void AliITS::GetTreeC(Int_t event)
 693 {
 694
 695   cout << "AliITS::GetTreeC" << endl;
 696
 697   // get the clusters tree for this event and set the branch address
 698     char treeName[20];
 699     char branchname[30];
 700
 701     char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 702
 703     ResetClusters();
 704     if (fTreeC) {
 705           delete fTreeC;
 706     }
 707
 708     sprintf(treeName,"TreeC%d",event);
 709     fTreeC = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 710
 711
 712     TBranch *branch;
 713     if (fTreeC) {
 714         Int_t i;
 715         for (i=0; i<fgkNTYPES; i++) {
 716            if (fgkNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sClusters%s",GetName(),det[i]);
 717            else  sprintf(branchname,"%sClusters%d",GetName(),i+1);
 718            if (fCtype) {
 719                 branch = fTreeC->GetBranch(branchname);
 720                 if (branch) branch->SetAddress(&((*fCtype)[i]));
 721             }
 722         }
 723     } else {
 724         Error("AliITS::GetTreeC",
 725                 "cannot find Clusters Tree for event:%d\n",event);
 726     }
 727
 728 }
 729 //_____________________________________________________________________________
 730 void AliITS::MakeBranch(Option_t* option){
 731   //
 732   // Creates Tree branches for the ITS.
 733   //
 734
 735
 736   Int_t buffersize = 4000;
 737   char branchname[30];
 738   sprintf(branchname,"%s",GetName());
 739
 740   AliDetector::MakeBranch(option);
 741
 742
 743 // one branch for digits per type of detector
 744
 745    char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 746
 747    char digclass[40];
 748    char clclass[40];
 749
 750    Int_t i;
 751    for (i=0; i<fgkNTYPES ;i++) {
 752        AliITSDetType *iDetType=DetType(i);
 753        iDetType->GetClassNames(digclass,clclass);
 754        //printf("i, digclass, recclass %d %s %s\n",i,digclass,clclass);
 755        // digits
 756        (*fDtype)[i] = new TClonesArray(digclass,10000);
 757        // clusters
 758        (*fCtype)[i] = new TClonesArray(clclass,10000);
 759    }
 760
 761
 762   for (i=0; i<fgkNTYPES ;i++) {
 763       if (fgkNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
 764       else  sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 765
 766       if (fDtype   && gAlice->TreeD()) {
 767           gAlice->TreeD()->Branch(branchname,&((*fDtype)[i]), buffersize);
 768           cout << "Making Branch " << branchname;
 769           cout << " for digits of type "<< i+1 << endl;
 770       }
 771   }
 772
 773   // only one branch for rec points for all detector types
 774   sprintf(branchname,"%sRecPoints",GetName());
 775
 776   fRecPoints=new TClonesArray("AliITSRecPoint",10000);
 777
 778   if (fRecPoints && gAlice->TreeR()) {
 779     gAlice->TreeR()->Branch(branchname,&fRecPoints, buffersize);
 780     cout << "Making Branch " << branchname;
 781     cout << " for reconstructed space points" << endl;
 782   }
 783
 784
 785 }
 786
 787 //___________________________________________
 788 void AliITS::SetTreeAddress()
 789 {
 790
 791   // Set branch address for the Trees.
 792
 793   char branchname[30];
 794   AliDetector::SetTreeAddress();
 795
 796   char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 797
 798   TBranch *branch;
 799   TTree *treeD = gAlice->TreeD();
 800   TTree *treeR = gAlice->TreeR();
 801
 802   Int_t i;
 803   if (treeD) {
 804       for (i=0; i<fgkNTYPES; i++) {
 805           if (fgkNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
 806           else  sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 807           if (fDtype) {
 808               branch = treeD->GetBranch(branchname);
 809               if (branch) branch->SetAddress(&((*fDtype)[i]));
 810           }
 811       }
 812   }
 813
 814
 815   if (treeR) {
 816     sprintf(branchname,"%sRecPoints",GetName());
 817     if (fRecPoints) {
 818       branch = treeR->GetBranch(branchname);
 819       if (branch) branch->SetAddress(&fRecPoints);
 820     }
 821   }
 822
 823
 824 }
 825
 826 //____________________________________________________________________________
 827 void AliITS::InitModules(Int_t size,Int_t &nmodules){
 828
 829   //initialize the modules array
 830
 831   if(fITSmodules){
 832       fITSmodules->Delete();
 833       delete fITSmodules;
 834   }
 835
 836     Int_t nl,indexMAX,index;
 837
 838     if(size<=0){ // default to using data stored in AliITSgeom
 839         if(fITSgeom==0) {
 840             Error("AliITS::InitModules",
 841                 "in AliITS::InitModule fITSgeom not defined\n");
 842             return;
 843         } // end if fITSgeom==0
 844         nl = fITSgeom->GetNlayers();
 845         indexMAX = fITSgeom->GetModuleIndex(nl,fITSgeom->GetNladders(nl),
 846                                             fITSgeom->GetNdetectors(nl))+1;
 847         nmodules = indexMAX;
 848         fITSmodules = new TObjArray(indexMAX);
 849         for(index=0;index<indexMAX;index++){
 850                 fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 851         } // end for index
 852     }else{
 853         fITSmodules = new TObjArray(size);
 854         for(index=0;index<size;index++) {
 855             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 856         }
 857
 858         nmodules = size;
 859     } // end i size<=0
 860 }
 861
 862 //____________________________________________________________________________
 863 void AliITS::FillModules(Int_t evnt,Int_t bgrev,Int_t nmodules,Option_t *option,Text_t *filename){
 864
 865   // fill the modules with the sorted by module hits; add hits from background
 866   // if option=Add
 867
 868
 869     static TTree *trH1;                 //Tree with background hits
 870     static TClonesArray *fHits2;        //List of hits for one track only
 871
 872     static Bool_t first=kTRUE;
 873     static TFile *file;
 874     char *addBgr = strstr(option,"Add");
 875
 876
 877     if (addBgr ) {
 878         if(first) {
 879             cout<<"filename "<<filename<<endl;
 880             file=new TFile(filename);
 881             cout<<"I have opened "<<filename<<" file "<<endl;
 882             fHits2     = new TClonesArray("AliITShit",1000  );
 883         }
 884         first=kFALSE;
 885         file->cd();
 886         file->ls();
 887         // Get Hits Tree header from file
 888         if(fHits2) fHits2->Clear();
 889         if(trH1) delete trH1;
 890         trH1=0;
 891
 892         char treeName[20];
 893         sprintf(treeName,"TreeH%d",bgrev);
 894         trH1 = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 895         //printf("TrH1 %p of treename %s for event %d \n",trH1,treeName,bgrev);
 896
 897         if (!trH1) {
 898             Error("AliITS::FillModules",
 899             "cannot find Hits Tree for event:%d\n",bgrev);
 900         }
 901         // Set branch addresses
 902         TBranch *branch;
 903         char branchname[20];
 904         sprintf(branchname,"%s",GetName());
 905         if (trH1 && fHits2) {
 906             branch = trH1->GetBranch(branchname);
 907             if (branch) branch->SetAddress(&fHits2);
 908         }
 909
 910         // test
 911         //Int_t ntracks1 =(Int_t)TrH1->GetEntries();
 912         //printf("background - ntracks1 - %d\n",ntracks1);
 913    }
 914
 915     Int_t npart = gAlice->GetEvent(evnt);
 916     if(npart<=0) return;
 917     TClonesArray *itsHits = this->Hits();
 918     Int_t lay,lad,det,index;
 919     AliITShit *itsHit=0;
 920     AliITSmodule *mod=0;
 921
 922     TTree *iTH = gAlice->TreeH();
 923     Int_t ntracks =(Int_t) iTH->GetEntries();
 924
 925     Int_t t,h;
 926     for(t=0; t<ntracks; t++){
 927         gAlice->ResetHits();
 928         iTH->GetEvent(t);
 929         Int_t nhits = itsHits->GetEntriesFast();
 930         //printf("nhits %d\n",nhits);
 931         if (!nhits) continue;
 932         for(h=0; h<nhits; h++){
 933             itsHit = (AliITShit *)itsHits->UncheckedAt(h);
 934             itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
 935             // temporarily index=det-1 !!!
 936             if(fITSgeom) index = fITSgeom->GetModuleIndex(lay,lad,det);
 937             else index=det-1;
 938             //
 939             mod = this->GetModule(index);
 940             mod->AddHit(itsHit,t,h);
 941         } // end loop over hits
 942     } // end loop over tracks
 943
 944     // open the file with background
 945
 946     if (addBgr ) {
 947           Int_t track,i;
 948           ntracks =(Int_t)trH1->GetEntries();
 949             //printf("background - ntracks1 %d\n",ntracks);
 950             //printf("background - Start loop over tracks \n");
 951             //   Loop over tracks
 952
 953             for (track=0; track<ntracks; track++) {
 954
 955                 if (fHits2)       fHits2->Clear();
 956                 trH1->GetEvent(track);
 957                 //   Loop over hits
 958                 for(i=0;i<fHits2->GetEntriesFast();++i) {
 959
 960                     itsHit=(AliITShit*) (*fHits2)[i];
 961                     itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
 962                     // temporarily index=det-1 !!!
 963                     if(fITSgeom) index = fITSgeom->GetModuleIndex(lay,lad,det);
 964                     else index=det-1;
 965                     //
 966                     mod = this->GetModule(index);
 967                     mod->AddHit(itsHit,track,i);
 968                }  // end loop over hits
 969             } // end loop over tracks
 970
 971             TTree *fAli=gAlice->TreeK();
 972             TFile *fileAli=0;
 973
 974             if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
 975             fileAli->cd();
 976
 977     } // end if add
 978
 979     //gObjectTable->Print();
 980
 981 }
 982
 983
 984 //____________________________________________________________________________
 985 void AliITS::HitsToDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size, Option_t *option, Option_t *opt,Text_t *filename)
 986 {
 987     // keep galice.root for signal and name differently the file for
 988     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 989
 990    // the condition below will disappear when the geom class will be
 991    // initialised for all versions - for the moment it is only for v5 !
 992    // 7 is the SDD beam test version
 993    Int_t ver = this->IsVersion();
 994    if(ver!=5 && ver!=7) return;
 995
 996    char *all = strstr(opt,"All");
 997    char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),strstr(opt,"SSD")};
 998
 999    Int_t nmodules;
1000    InitModules(size,nmodules);
1001    FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
1002
1003    //TBranch *branch;
1004    AliITSsimulation* sim;
1005    //TObjArray *branches=gAlice->TreeD()->GetListOfBranches();
1006    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1007
1008    Int_t id,module;
1009    Int_t first,last;
1010    for (id=0;id<fgkNTYPES;id++) {
1011         if (!all && !det[id]) continue;
1012         //branch = (TBranch*)branches->UncheckedAt(id);
1013         AliITSDetType *iDetType=DetType(id);
1014         sim = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
1015         if (!sim) {
1016            Error("HitsToDigits","The simulation class was not instantiated!");
1017            exit(1);
1018            // or SetDefaultSimulation();
1019         }
1020         if(geom) {
1021           first = geom->GetStartDet(id);
1022           last = geom->GetLastDet(id);
1023         } else first=last=0;
1024         cout << "det type " << id << " first, last "<< first << last << endl;
1025         for(module=first;module<=last;module++) {
1026             AliITSmodule *mod = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
1027             sim->DigitiseModule(mod,module,evNumber);
1028             // fills all branches - wasted disk space
1029             gAlice->TreeD()->Fill();
1030             ResetDigits();
1031             // try and fill only the branch
1032             //branch->Fill();
1033             //ResetDigits(id);
1034         } // loop over modules
1035    } // loop over detector types
1036
1037    ClearModules();
1038
1039    Int_t nentries=(Int_t)gAlice->TreeD()->GetEntries();
1040    cout << "nentries in TreeD" << nentries << endl;
1041
1042    char hname[30];
1043    sprintf(hname,"TreeD%d",evNumber);
1044    gAlice->TreeD()->Write(hname);
1045    // reset tree
1046    gAlice->TreeD()->Reset();
1047
1048 }
1049
1050
1051 //____________________________________________________________________________
1052 void AliITS::DigitsToRecPoints(Int_t evNumber,Int_t lastentry,Option_t *opt)
1053 {
1054   // cluster finding and reconstruction of space points
1055
1056    // the condition below will disappear when the geom class will be
1057    // initialised for all versions - for the moment it is only for v5 !
1058    // 7 is the SDD beam test version
1059    Int_t ver = this->IsVersion();
1060    if(ver!=5 && ver!=7) return;
1061
1062    char *all = strstr(opt,"All");
1063    char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),strstr(opt,"SSD")};
1064
1065    static Bool_t first=kTRUE;
1066    if (first) {
1067        MakeTreeC("C");
1068        first=kFALSE;
1069    }
1070
1071    TTree *iTC=TreeC();
1072
1073    //TBranch *branch;
1074    AliITSClusterFinder* rec;
1075
1076    //TObjArray *branches=gAlice->TreeR()->GetListOfBranches();
1077    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1078
1079    Int_t id,module;
1080    for (id=0;id<fgkNTYPES;id++) {
1081         if (!all && !det[id]) continue;
1082         //branch = (TBranch*)branches->UncheckedAt(id);
1083         AliITSDetType *iDetType=DetType(id);
1084         rec = (AliITSClusterFinder*)iDetType->GetReconstructionModel();
1085         if (!rec) {
1086            Error("DigitsToRecPoints","The cluster finder class was not instantiated!");
1087            exit(1);
1088            // or SetDefaultClusterFinders();
1089         }
1090         TClonesArray *itsDigits  = this->DigitsAddress(id);
1091
1092         Int_t first,last;
1093         if(geom) {
1094           first = geom->GetStartDet(id);
1095           last = geom->GetLastDet(id);
1096         } else first=last=0;
1097         //printf("first last %d %d\n",first,last);
1098         for(module=first;module<=last;module++) {
1099               this->ResetDigits();
1100               if (all) gAlice->TreeD()->GetEvent(lastentry+module);
1101               else gAlice->TreeD()->GetEvent(lastentry+(module-first));
1102               Int_t ndigits = itsDigits->GetEntriesFast();
1103               if (ndigits) rec->FindRawClusters();
1104               gAlice->TreeR()->Fill();
1105               ResetRecPoints();
1106               iTC->Fill();
1107               ResetClusters();
1108               // try and fill only the branch
1109               //branch->Fill();
1110               //ResetRecPoints(id);
1111         } // loop over modules
1112    } // loop over detector types
1113
1114
1115    Int_t nentries=(Int_t)gAlice->TreeR()->GetEntries();
1116    Int_t ncentries=(Int_t)iTC->GetEntries();
1117    cout << " nentries ncentries " << nentries << ncentries <<  endl;
1118
1119    char hname[30];
1120    sprintf(hname,"TreeR%d",evNumber);
1121    gAlice->TreeR()->Write(hname);
1122    // reset tree
1123    gAlice->TreeR()->Reset();
1124
1125    sprintf(hname,"TreeC%d",evNumber);
1126    iTC->Write(hname);
1127    iTC->Reset();
1128 }
1129
1130
1131 //____________________________________________________________________________
1132 void AliITS::HitsToFastRecPoints(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
1133 Option_t *option,Option_t *opt,Text_t *filename)
1134 {
1135     // keep galice.root for signal and name differently the file for
1136     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
1137
1138
1139    // the condition below will disappear when the geom class will be
1140    // initialised for all versions - for the moment it is only for v5 !
1141    Int_t ver = this->IsVersion();
1142    if(ver!=5) return;
1143
1144    char *all = strstr(opt,"All");
1145    char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),strstr(opt,"SSD")};
1146
1147    Int_t nmodules;
1148    InitModules(size,nmodules);
1149    FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
1150
1151
1152    AliITSsimulation* sim;
1153    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1154
1155    TRandom *random=new TRandom[9];
1156    random[0].SetSeed(111);
1157    random[1].SetSeed(222);
1158    random[2].SetSeed(333);
1159    random[3].SetSeed(444);
1160    random[4].SetSeed(555);
1161    random[5].SetSeed(666);
1162    random[6].SetSeed(777);
1163    random[7].SetSeed(888);
1164    random[8].SetSeed(999);
1165
1166
1167    Int_t id,module;
1168    for (id=0;id<fgkNTYPES;id++) {
1169         if (!all && !det[id]) continue;
1170         AliITSDetType *iDetType=DetType(id);
1171         sim = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
1172         if (!sim) {
1173            Error("HitsToFastPoints","The simulation class was not instantiated!");
1174            exit(1);
1175            // or SetDefaultSimulation();
1176         }
1177         Int_t first = geom->GetStartDet(id);
1178         Int_t last = geom->GetLastDet(id);
1179         for(module=first;module<=last;module++) {
1180             AliITSmodule *mod = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
1181             sim->CreateFastRecPoints(mod,module,random);
1182             gAlice->TreeR()->Fill();
1183             ResetRecPoints();
1184         } // loop over modules
1185    } // loop over detector types
1186
1187
1188    ClearModules();
1189
1190    //Int_t nentries=(Int_t)gAlice->TreeR()->GetEntries();
1191
1192    char hname[30];
1193    sprintf(hname,"TreeR%d",evNumber);
1194    gAlice->TreeR()->Write(hname);
1195    // reset tree
1196    gAlice->TreeR()->Reset();
1197
1198    delete [] random;
1199
1200 }
1201
1202
1203 //____________________________________________________________________________
1204 void AliITS::Streamer(TBuffer &R__b){
1205    // Stream an object of class AliITS.
1206
1207    Int_t i;
1208
1209    if (R__b.IsReading()) {
1210       Version_t R__v = R__b.ReadVersion();
1211       if (R__v) {
1212           AliDetector::Streamer(R__b);
1213           R__b >> fIdN;
1214           R__b.ReadArray(fIdSens);
1215           if(fIdName!=0) delete[] fIdName;  // Array of TStrings
1216           fIdName    = new TString[fIdN];
1217           for(i=0;i<fIdN;i++) fIdName[i].Streamer(R__b);
1218           R__b >> fITSgeom;
1219           R__b >> fITSmodules;
1220           R__b >> fEuclidOut;
1221           R__b >> fMajorVersion;
1222           R__b >> fMinorVersion;
1223           R__b >> fDetTypes;
1224           R__b >> fDtype;
1225           delete []fNdtype;
1226           fNdtype = new Int_t[fgkNTYPES];
1227           R__b.ReadFastArray(fNdtype,fgkNTYPES);
1228           R__b >> fCtype;
1229           delete []fNctype;
1230           fNctype = new Int_t[fgkNTYPES];
1231           R__b.ReadFastArray(fNctype,fgkNTYPES);
1232           R__b >> fRecPoints;
1233           R__b >> fNRecPoints;
1234           R__b >> fTreeC;
1235       } // end if R__v
1236    } else { // writing
1237       R__b.WriteVersion(AliITS::IsA());
1238       AliDetector::Streamer(R__b);
1239       R__b << fIdN;
1240       R__b.WriteArray(fIdSens,fIdN);
1241       for(i=0;i<fIdN;i++) fIdName[i].Streamer(R__b);
1242       R__b << fITSgeom;
1243       R__b << fITSmodules;
1244       R__b << fEuclidOut;
1245       R__b << fMajorVersion;
1246       R__b << fMinorVersion;
1247       R__b << fDetTypes;
1248       R__b << fDtype;
1249       R__b.WriteFastArray(fNdtype,fgkNTYPES);
1250       R__b << fCtype;
1251       R__b.WriteFastArray(fNctype,fgkNTYPES);
1252       R__b << fRecPoints;
1253       R__b << fNRecPoints;
1254       R__b << fTreeC;
1255    } // end if
1256
1257 }
1258
1259 //________________________________________________________________
1260
1261 AliITStrack  AliITS::Tracking(AliITStrack &track, AliITStrack *reference,TObjArray *fastpoints, Int_t
1262 **vettid, Bool_t flagvert ) {
1263
1264 //Origin  A. Badala' and G.S. Pappalardo:  e-mail Angela.Badala@ct.infn.it, Giuseppe.S.Pappalardo@ct.infn.it
1265
1266
1267   TList *list= new TList();
1268
1269   AliITStrack tr(track);
1270
1271   list->AddLast(&tr);
1272
1273   Double_t Pt=(tr).GetPt();
1274   //cout << "\n Pt = " << Pt <<"\n";
1275
1276   AliITStracking obj(list, reference, this, fastpoints,TMath::Abs(Pt),vettid, flagvert);
1277   list->Delete();
1278   delete list;
1279
1280   Int_t itot=-1;
1281   TVector VecTotLabref(18);
1282   Int_t lay, k;
1283   for(lay=5; lay>=0; lay--) {
1284     TVector VecLabref(3);
1285     VecLabref=(*reference).GetLabTrack(lay);
1286     for(k=0; k<3; k++) {itot++; VecTotLabref(itot)=VecLabref(k);}
1287   }
1288   Long_t labref;
1289   Int_t freq;
1290   (*reference).Search(VecTotLabref, labref, freq);
1291
1292   if(freq < 5) labref=-labref;
1293   (*reference).SetLabel(labref);
1294
1295   return *reference;
1296
1297 }
1298
1299
1300
1301 //________________________________________________________________
1302
1303
1304
1305 void AliITS::DoTracking(Int_t evNumber, Int_t min_t, Int_t max_t, TFile *file, Bool_t flagvert) {
1306
1307 //   ex macro for tracking ITS
1308
1309   printf("begin DoTracking - file %p\n",file);
1310
1311   const char *pname="75x40_100x60";
1312
1313   struct GoodTrack {
1314     Int_t lab,code;
1315     Float_t px,py,pz,x,y,z,pxg,pyg,pzg,ptg;
1316     Bool_t flag;
1317   };
1318
1319
1320   gAlice->GetEvent(0);
1321
1322   AliTPC *TPC=(AliTPC*)gAlice->GetDetector("TPC");
1323   AliTPCParam *digp = (AliTPCParam*)file->Get(pname);
1324   if (digp!=0) TPC->SetParam(digp);
1325
1326   GoodTrack gt[7000];
1327   Int_t ngood=0;
1328   ifstream in("good_tracks");
1329
1330   cerr<<"Reading good tracks...\n";
1331   while (in>>gt[ngood].lab>>gt[ngood].code
1332           >>gt[ngood].px >>gt[ngood].py>>gt[ngood].pz
1333           >>gt[ngood].x  >>gt[ngood].y >>gt[ngood].z
1334           >>gt[ngood].pxg  >>gt[ngood].pyg >>gt[ngood].pzg
1335           >>gt[ngood].ptg >>gt[ngood].flag) {
1336     ngood++;
1337     cerr<<ngood<<'\r';
1338     if (ngood==7000) {
1339       cerr<<"Too many good tracks !\n";
1340       break;
1341     }
1342   }
1343   if (!in.eof()) cerr<<"Read error (good_tracks) !\n";
1344
1345
1346 // Load tracks
1347   TFile *tf=TFile::Open("tpctracks.root");
1348   if (!tf->IsOpen()) {cerr<<"Can't open tpctracks.root !\n"; return ;}
1349   TObjArray tracks(200000);
1350   TTree *tracktree=(TTree*)tf->Get("TreeT");
1351   TBranch *tbranch=tracktree->GetBranch("tracks");
1352   Int_t nentr=(Int_t)tracktree->GetEntries();
1353   Int_t kk;
1354   for (kk=0; kk<nentr; kk++) {
1355     AliTPCtrack *iotrack=new AliTPCtrack;
1356     tbranch->SetAddress(&iotrack);
1357     tracktree->GetEvent(kk);
1358     tracks.AddLast(iotrack);
1359   }
1360   tf->Close();
1361
1362
1363   Int_t nt = tracks.GetEntriesFast();
1364   cerr<<"Number of found tracks "<<nt<<endl;
1365
1366   TVector DataOut(9);
1367   Int_t kkk=0;
1368
1369   Double_t ptg=0.,pxg=0.,pyg=0.,pzg=0.;
1370
1371   //////////////////////////////  good tracks definition in TPC  ////////////////////////////////
1372
1373   ofstream out1 ("AliITSTrag.out");
1374   Int_t i;
1375   for (i=0; i<ngood; i++) out1 << gt[i].ptg << "\n";
1376   out1.close();
1377
1378
1379   TVector vec(5);
1380   TTree *TR=gAlice->TreeR();
1381   Int_t nent=(Int_t)TR->GetEntries();
1382   TClonesArray  *recPoints = RecPoints();
1383   Int_t numbpoints;
1384   Int_t totalpoints=0;
1385   Int_t *np = new Int_t[nent];
1386   Int_t **vettid = new Int_t* [nent];
1387   Int_t mod;
1388   for (mod=0; mod<nent; mod++) {
1389     vettid[mod]=0;
1390     this->ResetRecPoints();
1391     gAlice->TreeR()->GetEvent(mod+1); //first entry in TreeR is empty
1392     numbpoints = recPoints->GetEntries();
1393     totalpoints+=numbpoints;
1394     np[mod] = numbpoints;
1395   //cout<<" mod = "<<mod<<"   numbpoints = "<<numbpoints<<"\n"; getchar();
1396     vettid[mod] = new Int_t[numbpoints];
1397     Int_t ii;
1398     for (ii=0;ii<numbpoints; ii++) *(vettid[mod]+ii)=0;
1399   }
1400
1401   AliTPCtrack *track;
1402
1403
1404   if(min_t < 0) {min_t = 0; max_t = nt-1;}
1405
1406 /*
1407   ///////////////////////////////// Definition of vertex end its error ////////////////////////////
1408   ////////////////////////// In the future it will be given by a method ///////////////////////////
1409   Double_t Vx=0.;
1410   Double_t Vy=0.;
1411   Double_t Vz=0.;
1412
1413   Float_t sigmavx=0.0050;      // 50  microns
1414   Float_t sigmavy=0.0050;      // 50  microns
1415   Float_t sigmavz=0.010;       // 100 microns
1416
1417   //Vx+=gRandom->Gaus(0,sigmavx);  Vy+=gRandom->Gaus(0,sigmavy);  Vz+=gRandom->Gaus(0,sigmavz);
1418   TVector vertex(3), ervertex(3)
1419   vertex(0)=Vx; vertex(1)=Vy; vertex(2)=Vz;
1420   ervertex(0)=sigmavx;  ervertex(1)=sigmavy;  ervertex(2)=sigmavz;
1421   /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1422 */
1423
1424   //TDirectory *savedir=gDirectory;
1425
1426   TTree tracktree1("TreeT","Tree with ITS tracks");
1427   AliITSiotrack *iotrack=0;
1428   tracktree1.Branch("ITStracks","AliITSiotrack",&iotrack,32000,0);
1429
1430   ofstream out ("AliITSTra.out");
1431
1432   Int_t j;
1433   for (j=min_t; j<=max_t; j++) {
1434     track=(AliTPCtrack*)tracks.UncheckedAt(j);
1435     Int_t flaglab=0;
1436     if (!track) continue;
1437     ////// elimination of not good tracks ////////////
1438     Int_t ilab=TMath::Abs(track->GetLabel());
1439     Int_t iii;
1440     for (iii=0;iii<ngood;iii++) {
1441          //cout<<" ilab, gt[iii].lab = "<<ilab<<" "<<gt[iii].lab<<"\n"; getchar();
1442       if (ilab==gt[iii].lab) {
1443         flaglab=1;
1444         ptg=gt[iii].ptg;
1445         pxg=gt[iii].pxg;
1446         pyg=gt[iii].pyg;
1447         pzg=gt[iii].pzg;
1448         break;
1449       }
1450     }
1451          //cout<<" j flaglab =  " <<j<<" "<<flaglab<<"\n";  getchar();
1452     if (!flaglab) continue;
1453          //cout<<" j =  " <<j<<"\n";  getchar();
1454   /*
1455     ////// old propagation to the end of TPC //////////////
1456     Double_t xk=76.;
1457     track->PropagateTo(xk);
1458     xk-=0.11;
1459     track->PropagateTo(xk,42.7,2.27); //C
1460     xk-=2.6;
1461     track->PropagateTo(xk,36.2,1.98e-3); //C02
1462     xk-=0.051;
1463     track->PropagateTo(xk,42.7,2.27); //C
1464     ///////////////////////////////////////////////////
1465          */
1466
1467          ////// new propagation to the end of TPC //////////////
1468     Double_t xk=77.415;
1469     track->PropagateTo(xk, 28.94, 1.204e-3);     //Ne
1470          xk -=0.01;
1471     track->PropagateTo(xk, 44.77, 1.71);         //Tedlar
1472          xk -=0.04;
1473     track->PropagateTo(xk, 44.86, 1.45);         //Kevlar
1474          xk -=2.0;
1475     track->PropagateTo(xk, 41.28, 0.029);        //Nomex
1476     xk-=16;
1477     track->PropagateTo(xk,36.2,1.98e-3); //C02
1478          xk -=0.01;
1479     track->PropagateTo(xk, 24.01, 2.7);  //Al
1480          xk -=0.01;
1481     track->PropagateTo(xk, 44.77, 1.71);         //Tedlar
1482          xk -=0.04;
1483     track->PropagateTo(xk, 44.86, 1.45);         //Kevlar
1484          xk -=0.5;
1485     track->PropagateTo(xk, 41.28, 0.029);        //Nomex
1486
1487        ///////////////////////////////////////////////////////////////
1488
1489    ///////////////////////////////////////////////////////////////
1490     AliITStrack trackITS(*track);
1491     AliITStrack result(*track);
1492     AliITStrack primarytrack(*track);
1493
1494 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1495          TVector Vgeant(3);
1496          Vgeant=result.GetVertex();
1497
1498   // Definition of Dv and Zv for vertex constraint
1499      Double_t sigmaDv=0.0050;  Double_t sigmaZv=0.010;
1500     //Double_t sigmaDv=0.0015;  Double_t sigmaZv=0.0015;
1501         Double_t uniform= gRandom->Uniform();
1502         Double_t signdv;
1503         if(uniform<=0.5) signdv=-1.;
1504            else
1505                  signdv=1.;
1506
1507         Double_t Vr=TMath::Sqrt(Vgeant(0)*Vgeant(0)+ Vgeant(1)*Vgeant(1));
1508           Double_t Dv=gRandom->Gaus(signdv*Vr,(Float_t)sigmaDv);
1509     Double_t Zv=gRandom->Gaus(Vgeant(2),(Float_t)sigmaZv);
1510
1511   //cout<<" Dv e Zv = "<<Dv<<" "<<Zv<<"\n";
1512     trackITS.SetDv(Dv);  trackITS.SetZv(Zv);
1513     trackITS.SetsigmaDv(sigmaDv); trackITS.SetsigmaZv(sigmaZv);
1514     result.SetDv(Dv);  result.SetZv(Zv);
1515     result.SetsigmaDv(sigmaDv); result.SetsigmaZv(sigmaZv);
1516     primarytrack.SetDv(Dv);  primarytrack.SetZv(Zv);
1517     primarytrack.SetsigmaDv(sigmaDv); primarytrack.SetsigmaZv(sigmaZv);
1518
1519 /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1520
1521     primarytrack.PrimaryTrack();
1522     TVector  d2=primarytrack.Getd2();
1523     TVector  tgl2=primarytrack.Gettgl2();
1524     TVector  dtgl=primarytrack.Getdtgl();
1525     trackITS.Setd2(d2); trackITS.Settgl2(tgl2);  trackITS.Setdtgl(dtgl);
1526     result.Setd2(d2); result.Settgl2(tgl2);  result.Setdtgl(dtgl);
1527          /*
1528     trackITS.SetVertex(vertex); trackITS.SetErrorVertex(ervertex);
1529     result.SetVertex(vertex);   result.SetErrorVertex(ervertex);
1530     */
1531     Tracking(trackITS,&result,recPoints,vettid, flagvert);
1532
1533      cout<<" progressive track number = "<<j<<"\r";
1534    // cout<<j<<"\r";
1535     //cout<<" progressive track number = "<<j<<"\n";
1536     Long_t labITS=result.GetLabel();
1537     //cout << " ITS track label = " << labITS << "\n";
1538     int lab=track->GetLabel();
1539   //  cout << " TPC track label = " << lab <<"\n";
1540     //result.GetClusters(); getchar();  //to print the cluster matrix
1541
1542 //propagation to vertex
1543
1544     Double_t rbeam=3.;
1545
1546     result.Propagation(rbeam);
1547
1548     TMatrix *cov;
1549          cov=&result.GetCMatrix();
1550     Double_t pt=TMath::Abs(result.GetPt());
1551     Double_t Dr=result.GetD();
1552     Double_t Z=result.GetZ();
1553     Double_t tgl=result.GetTgl();
1554     Double_t C=result.GetC();
1555     Double_t Cy=C/2.;
1556     Double_t Dz=Z-(tgl/Cy)*TMath::ASin(result.arga(rbeam));
1557           Dz-=Vgeant(2);
1558
1559          // cout<<" Dr e dz alla fine = "<<Dr<<" "<<Dz<<"\n"; getchar();
1560     Double_t phi=result.Getphi();
1561     Double_t phivertex = phi - TMath::ASin(result.argA(rbeam));
1562     Double_t duepi=2.*TMath::Pi();
1563     if(phivertex>duepi) phivertex-=duepi;
1564     if(phivertex<0.) phivertex+=duepi;
1565     Double_t Dtot=TMath::Sqrt(Dr*Dr+Dz*Dz);
1566
1567 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1568     Int_t NumofCluster, idmodule,idpoint;
1569     NumofCluster=result.GetNumClust();
1570     if(NumofCluster >=5)  {
1571
1572
1573       AliITSiotrack outtrack;
1574
1575       iotrack=&outtrack;
1576
1577       iotrack->SetStatePhi(phi);
1578       iotrack->SetStateZ(Z);
1579       iotrack->SetStateD(Dr);
1580       iotrack->SetStateTgl(tgl);
1581       iotrack->SetStateC(C);
1582                 Double_t radius=result.Getrtrack();
1583                 iotrack->SetRadius(radius);
1584                 Int_t charge;
1585                 if(C>0.) charge=-1;  else charge=1;
1586                 iotrack->SetCharge(charge);
1587
1588
1589
1590       iotrack->SetCovMatrix(cov);
1591
1592       Double_t px=pt*TMath::Cos(phi);
1593       Double_t py=pt*TMath::Sin(phi);
1594       Double_t pz=pt*tgl;
1595
1596       Double_t xtrack=Dr*TMath::Sin(phi);
1597       Double_t ytrack=Dr*TMath::Cos(phi);
1598       Double_t ztrack=Dz+Vgeant(2);
1599
1600
1601       iotrack->SetPx(px);
1602       iotrack->SetPy(py);
1603       iotrack->SetPz(pz);
1604       iotrack->SetX(xtrack);
1605       iotrack->SetY(ytrack);
1606       iotrack->SetZ(ztrack);
1607       iotrack->SetLabel(labITS);
1608
1609       Int_t il;
1610                 for(il=0;il<6; il++){
1611                   iotrack->SetIdPoint(il,result.GetIdPoint(il));
1612                   iotrack->SetIdModule(il,result.GetIdModule(il));
1613                 }
1614       tracktree1.Fill();
1615
1616    //cout<<" labITS = "<<labITS<<"\n";
1617         //cout<<" phi z Dr tgl C = "<<phi<<" "<<Z<<" "<<Dr<<" "<<tgl<<" "<<C<<"\n";  getchar();
1618
1619      DataOut(kkk) = ptg; kkk++; DataOut(kkk)=labITS; kkk++; DataOut(kkk)=lab; kkk++;
1620
1621       for (il=0;il<6;il++) {
1622         idpoint=result.GetIdPoint(il);
1623         idmodule=result.GetIdModule(il);
1624         *(vettid[idmodule]+idpoint)=1;
1625         iotrack->SetIdPoint(il,idpoint);
1626         iotrack->SetIdModule(il,idmodule);
1627       }
1628
1629     //  cout<<"  +++++++++++++  pt e ptg = "<<pt<<" "<<ptg<<"  ++++++++++\n";
1630       Double_t difpt= (pt-ptg)/ptg*100.;
1631       DataOut(kkk)=difpt; kkk++;
1632       Double_t lambdag=TMath::ATan(pzg/ptg);
1633       Double_t   lam=TMath::ATan(tgl);
1634       Double_t diflam = (lam - lambdag)*1000.;
1635       DataOut(kkk) = diflam; kkk++;
1636       Double_t phig=TMath::ATan(pyg/pxg);
1637       Double_t phi=phivertex;
1638       Double_t difphi = (phi - phig)*1000.;
1639       DataOut(kkk)=difphi; kkk++;
1640       DataOut(kkk)=Dtot*1.e4; kkk++;
1641       DataOut(kkk)=Dr*1.e4; kkk++;
1642       DataOut(kkk)=Dz*1.e4; kkk++;
1643       Int_t r;
1644       for (r=0; r<9; r++) { out<<DataOut(r)<<" ";}
1645       out<<"\n";
1646       kkk=0;
1647
1648
1649     } // end if on NumofCluster
1650   //gObjectTable->Print();    // stampa memoria
1651   }  //  end for (int j=min_t; j<=max_t; j++)
1652
1653   out.close();
1654
1655
1656   static Bool_t first=kTRUE;
1657   static TFile *tfile;
1658
1659         if(first) {
1660             tfile=new TFile("itstracks.root","RECREATE");
1661             //cout<<"I have opened itstracks.root file "<<endl;
1662         }
1663         first=kFALSE;
1664         tfile->cd();
1665         tfile->ls();
1666
1667    char hname[30];
1668    sprintf(hname,"TreeT%d",evNumber);
1669
1670   tracktree1.Write(hname);
1671
1672
1673
1674             TTree *fAli=gAlice->TreeK();
1675             TFile *fileAli=0;
1676
1677             if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
1678             fileAli->cd();
1679
1680   ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1681
1682   printf("delete vectors\n");
1683   if(np) delete [] np;
1684   if(vettid) delete [] vettid;
1685
1686 }