]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - ITS/AliITSClusterFinderV2SDD.cxx
Replace AliITSgeom with AliITSgeomTGeo. Possibility to select the event to be displa...
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSClusterFinderV2SDD.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-2003, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
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12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$*/
17
18 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
19 //            Implementation of the ITS clusterer V2 class                //
20 //                                                                        //
21 //          Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch            //
22 //                                                                        //
23 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
24
25
26
27 #include <TClonesArray.h>
28 #include "AliITSClusterFinderV2SDD.h"
29 #include "AliITSRecPoint.h"
30 #include "AliITSDetTypeRec.h"
31 #include "AliRawReader.h"
32 #include "AliITSRawStreamSDD.h"
33 #include "AliITSCalibrationSDD.h"
34 #include "AliITSDetTypeRec.h"
35 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
36 #include "AliITSdigitSDD.h"
37 #include "AliITSgeomTGeo.h"
38 ClassImp(AliITSClusterFinderV2SDD)
39
40 AliITSClusterFinderV2SDD::AliITSClusterFinderV2SDD(AliITSDetTypeRec* dettyp):AliITSClusterFinderV2(dettyp)
41 {
42
43   //Default constructor
44
45 }
46  
47
48 void AliITSClusterFinderV2SDD::FindRawClusters(Int_t mod){
49
50   //Find clusters V2
51   SetModule(mod);
52   FindClustersSDD(fDigits);
53
54 }
55
56 void AliITSClusterFinderV2SDD::FindClustersSDD(TClonesArray *digits) {
57   //------------------------------------------------------------
58   // Actual SDD cluster finder
59   //------------------------------------------------------------
60   Int_t nAnodes = GetSeg()->NpzHalf();
61   Int_t nzBins = nAnodes+2;
62   Int_t nTimeBins = GetSeg()->Npx();
63   Int_t nxBins = nTimeBins+2;
64   const Int_t kMaxBin=nzBins*nxBins;
65
66   AliBin *bins[2];
67   bins[0]=new AliBin[kMaxBin];
68   bins[1]=new AliBin[kMaxBin];
69   AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(fModule);
70   if(cal==0){
71     AliError(Form("Calibration object not present for SDD module %d\n",fModule));
72     return;
73   }
74   AliITSresponseSDD* res  = (AliITSresponseSDD*)cal->GetResponse();
75   const char *option=res->ZeroSuppOption();
76   AliITSdigitSDD *d=0;
77   Int_t i, ndigits=digits->GetEntriesFast();
78   for (i=0; i<ndigits; i++) {
79      d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(i);
80      Int_t ian=d->GetCoord1();
81      Int_t itb=d->GetCoord2();
82      Int_t iSide=0;
83      if (ian >= nAnodes) iSide=1;    
84      Float_t gain=cal->GetChannelGain(ian);
85      Float_t charge=d->GetSignal();
86      if(strstr(option,"ZS")) charge+=(Float_t)cal->GetZSLowThreshold(iSide);
87      Float_t baseline = cal->GetBaseline(ian);
88      if(charge>baseline) charge-=baseline;
89      else charge=0;
90
91      if(gain>0.){ // Bad channels have gain=0.
92        charge/=gain;
93        if(charge<cal->GetThresholdAnode(ian)) continue;
94        Int_t q=(Int_t)(charge+0.5);
95        Int_t y=itb+1;   
96        Int_t z=ian+1;   
97        if (z <= nAnodes){
98          bins[0][y*nzBins+z].SetQ(q);
99          bins[0][y*nzBins+z].SetMask(1);
100          bins[0][y*nzBins+z].SetIndex(i);
101        } else {
102          z-=nAnodes;
103          bins[1][y*nzBins+z].SetQ(q);
104          bins[1][y*nzBins+z].SetMask(1);
105          bins[1][y*nzBins+z].SetIndex(i);
106        }
107      }
108   }
109   
110   FindClustersSDD(bins, kMaxBin, nzBins, digits);
111
112   delete[] bins[0];
113   delete[] bins[1];
114
115 }
116
117 void AliITSClusterFinderV2SDD::
118 FindClustersSDD(AliBin* bins[2], Int_t nMaxBin, Int_t nzBins, 
119                 TClonesArray *digits, TClonesArray *clusters) {
120   //------------------------------------------------------------
121   // Actual SDD cluster finder
122   //------------------------------------------------------------
123
124   const TGeoHMatrix *mT2L=AliITSgeomTGeo::GetTracking2LocalMatrix(fModule);
125   AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(fModule);
126   if(cal==0){
127     AliError(Form("Calibration object not present for SDD module %d\n",fModule));
128     return;
129   }
130   Int_t ncl=0; 
131   TClonesArray &cl=*clusters;
132   for (Int_t s=0; s<2; s++)
133     for (Int_t i=0; i<nMaxBin; i++) {
134       NoiseSuppress(i,s,nzBins,bins[s],cal);
135       if (bins[s][i].IsUsed()) continue;
136       Int_t idx[32]; UInt_t msk[32]; Int_t npeaks=0;
137       FindPeaks(i, nzBins, bins[s], idx, msk, npeaks);
138
139       if (npeaks>30) continue;
140       if (npeaks==0) continue;
141
142       Int_t k,l;
143       for (k=0; k<npeaks-1; k++){//mark adjacent peaks
144         if (idx[k] < 0) continue; //this peak is already removed
145         for (l=k+1; l<npeaks; l++) {
146           if (idx[l] < 0) continue; //this peak is already removed
147           Int_t ki=idx[k]/nzBins, kj=idx[k] - ki*nzBins;
148           Int_t li=idx[l]/nzBins, lj=idx[l] - li*nzBins;
149           Int_t di=TMath::Abs(ki - li);
150           Int_t dj=TMath::Abs(kj - lj);
151           if (di>1 || dj>1) continue;
152           if (bins[s][idx[k]].GetQ() > bins[s][idx[l]].GetQ()) {
153             msk[l]=msk[k];
154             idx[l]*=-1;
155           } else {
156             msk[k]=msk[l];
157             idx[k]*=-1;
158             break;
159           } 
160         }
161       }
162
163       for (k=0; k<npeaks; k++) {
164         MarkPeak(TMath::Abs(idx[k]), nzBins, bins[s], msk[k]);
165       }
166         
167       for (k=0; k<npeaks; k++) {
168         if (idx[k] < 0) continue; //removed peak
169         AliITSRecPoint c;
170         MakeCluster(idx[k], nzBins, bins[s], msk[k], c);
171         //mi change
172         Int_t milab[10];
173         for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++){
174           milab[ilab]=-2;
175         }
176         Int_t maxi=0,mini=0,maxj=0,minj=0;
177         //AliBin *bmax=&bins[s][idx[k]];
178         //Float_t max = TMath::Max(TMath::Abs(bmax->GetQ())/5.,3.);
179         
180         for (Int_t di=-2; di<=2;di++){
181           for (Int_t dj=-3;dj<=3;dj++){
182             Int_t index = idx[k]+di+dj*nzBins;
183             if (index<0) continue;
184             if (index>=nMaxBin) continue;
185             AliBin *b=&bins[s][index];
186             Int_t nAnode=index%nzBins-1;
187             Int_t adcSignal=b->GetQ();
188             if(adcSignal>cal->GetThresholdAnode(nAnode)){
189               if (di>maxi) maxi=di;
190               if (di<mini) mini=di;
191               if (dj>maxj) maxj=dj;
192               if (dj<minj) minj=dj;
193             }
194             //
195             if(digits) {
196               if (TMath::Abs(di)<2&&TMath::Abs(dj)<2){
197                 AliITSdigitSDD* d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(b->GetIndex());
198                 for (Int_t itrack=0;itrack<10;itrack++){
199                   Int_t track = (d->GetTracks())[itrack];
200                   if (track>=0) {
201                     AddLabel(milab, track); 
202                   }
203                 }
204               }
205             }
206           }
207         }
208
209
210         Float_t y=c.GetY(),z=c.GetZ(), q=c.GetQ();       
211         y/=q; z/=q;
212         Float_t zAnode=z-0.5;  // to have anode in range 0.-255. and centered on the mid of the pitch
213         Float_t timebin=y-0.5;  // to have time bin in range 0.-255. amd centered on the mid of the bin
214         if(s==1) zAnode += GetSeg()->NpzHalf();  // right side has anodes from 256. to 511.
215         Float_t zdet = GetSeg()->GetLocalZFromAnode(zAnode);
216         Float_t driftTime = GetSeg()->GetDriftTimeFromTb(timebin) - cal->GetTimeOffset();
217         Float_t driftPathMicron = cal->GetDriftPath(driftTime,zAnode);
218         const Double_t kMicronTocm = 1.0e-4; 
219         Float_t xdet=(driftPathMicron-GetSeg()->Dx())*kMicronTocm; // xdet is negative
220         if (s==0) xdet=-xdet; // left side has positive local x
221         
222         Float_t corrx=0, corrz=0;
223         cal->GetCorrections(zdet,xdet,corrz,corrx,GetSeg());
224         zdet+=corrz;
225         xdet+=corrx;
226
227         Double_t loc[3]={xdet,0.,zdet},trk[3]={0.,0.,0.};
228         mT2L->MasterToLocal(loc,trk);
229         y=trk[1];
230         z=trk[2]; 
231
232         q/=cal->GetADC2keV();  //to have MPV 1 MIP = 86.4 KeV
233         Float_t hit[5] = {y, z, 0.0030*0.0030, 0.0020*0.0020, q};
234         Int_t  info[3] = {maxj-minj+1, maxi-mini+1, fNlayer[fModule]};
235         if (digits) {     
236           //       AliBin *b=&bins[s][idx[k]];
237           //       AliITSdigitSDD* d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(b->GetIndex());
238           {
239             //Int_t lab[3];
240             //lab[0]=(d->GetTracks())[0];
241             //lab[1]=(d->GetTracks())[1];
242             //lab[2]=(d->GetTracks())[2];
243             //CheckLabels(lab);
244             CheckLabels2(milab); 
245           }
246         }
247         milab[3]=fNdet[fModule];
248
249         AliITSRecPoint cc(milab,hit,info);
250         cc.SetType(npeaks);
251         if(clusters) new (cl[ncl]) AliITSRecPoint(cc); 
252         else {
253           fDetTypeRec->AddRecPoint(cc);
254         }
255         ncl++;
256       }
257     }
258   
259 }
260 //______________________________________________________________________
261 void AliITSClusterFinderV2SDD::RawdataToClusters(AliRawReader* rawReader,TClonesArray** clusters){
262     //------------------------------------------------------------
263   // This function creates ITS clusters from raw data
264   //------------------------------------------------------------
265   rawReader->Reset();
266   AliITSRawStreamSDD inputSDD(rawReader);
267   AliITSDDLModuleMapSDD *ddlmap=(AliITSDDLModuleMapSDD*)fDetTypeRec->GetDDLModuleMapSDD();
268   inputSDD.SetDDLModuleMap(ddlmap);
269   FindClustersSDD(&inputSDD,clusters);
270
271 }
272
273 void AliITSClusterFinderV2SDD::FindClustersSDD(AliITSRawStream* input, 
274                                         TClonesArray** clusters) 
275 {
276   //------------------------------------------------------------
277   // Actual SDD cluster finder for raw data
278   //------------------------------------------------------------
279   Int_t nClustersSDD = 0;
280   Int_t nAnodes = GetSeg()->NpzHalf();
281   Int_t nzBins = nAnodes+2;
282   Int_t nTimeBins = GetSeg()->Npx();
283   Int_t nxBins = nTimeBins+2;
284   const Int_t kMaxBin=nzBins*nxBins;
285   AliBin *bins[2];
286   AliBin *ddlbins[kHybridsPerDDL]; // 12 modules (=24 hybrids) of 1 DDL read "in parallel"
287   for(Int_t iHyb=0;iHyb<kHybridsPerDDL;iHyb++) ddlbins[iHyb]=new AliBin[kMaxBin];
288   // read raw data input stream
289   while (input->Next()) {
290     Int_t iModule = input->GetModuleID();
291     if(iModule<0){
292       AliWarning(Form("Invalid SDD module number %d\n", iModule));
293       continue;
294     }
295
296     Int_t iCarlos =((AliITSRawStreamSDD*)input)->GetCarlosId();
297     Int_t iSide = ((AliITSRawStreamSDD*)input)->GetChannel();
298     Int_t iHybrid=iCarlos*2+iSide;
299     if (input->IsCompletedModule()) {
300       // when all data from a module was read, search for clusters
301       if(iCarlos<0){
302         AliWarning(Form("Invalid SDD carlos number %d on module %d\n", iCarlos,iModule));
303         continue;
304       }
305       clusters[iModule] = new TClonesArray("AliITSRecPoint");
306       fModule = iModule;
307       bins[0]=ddlbins[iCarlos*2];   // first hybrid of the completed module
308       bins[1]=ddlbins[iCarlos*2+1]; // second hybrid of the completed module
309       FindClustersSDD(bins, kMaxBin, nzBins, NULL, clusters[iModule]);
310       Int_t nClusters = clusters[iModule]->GetEntriesFast();
311       nClustersSDD += nClusters;
312       for(Int_t iBin=0;iBin<kMaxBin; iBin++){
313         ddlbins[iCarlos*2][iBin].Reset();
314         ddlbins[iCarlos*2+1][iBin].Reset();
315       }
316     }else{
317     // fill the current digit into the bins array
318       if(iHybrid<0 || iHybrid>=kHybridsPerDDL){ 
319         AliWarning(Form("Invalid SDD hybrid number %d on module %d\n", iHybrid,iModule));
320         continue;
321       }
322       AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(iModule);    
323       if(cal==0){
324         AliError(Form("Calibration object not present for SDD module %d\n",iModule));
325         continue;
326       }
327       AliITSresponseSDD* res  = (AliITSresponseSDD*)cal->GetResponse();
328       const char *option=res->ZeroSuppOption();
329       Float_t charge=input->GetSignal();
330       Int_t chan=input->GetCoord1()+nAnodes*iSide;
331       Float_t gain=cal->GetChannelGain(chan);
332       if(strstr(option,"ZS")) charge+=(Float_t)cal->GetZSLowThreshold(iSide);
333       Float_t baseline = cal->GetBaseline(chan);
334       if(charge>baseline) charge-=baseline;
335       else charge=0;
336       if(gain>0.){ // Bad channels have gain=0
337         charge/=gain;
338         if(charge>=cal->GetThresholdAnode(chan)) {
339           Int_t q=(Int_t)(charge+0.5);
340           Int_t iz = input->GetCoord1();
341           Int_t itb = input->GetCoord2();
342           Int_t index = (itb+1) * nzBins + (iz+1);
343           if(index<kMaxBin){
344             ddlbins[iHybrid][index].SetQ(q);
345             ddlbins[iHybrid][index].SetMask(1);
346             ddlbins[iHybrid][index].SetIndex(index);
347           }else{
348             AliWarning(Form("Invalid SDD cell: Anode=%d   TimeBin=%d",iz,itb));   
349           }
350         }
351       }
352     }
353   }
354   for(Int_t iHyb=0;iHyb<kHybridsPerDDL;iHyb++) delete [] ddlbins[iHyb];
355   Info("FindClustersSDD", "found clusters in ITS SDD: %d", nClustersSDD);
356 }
357
358 //______________________________________________________________________
359 void AliITSClusterFinderV2SDD::NoiseSuppress(Int_t k, Int_t sid,Int_t nzBins, AliBin* bins, AliITSCalibrationSDD* cal) const {
360   // applies zero suppression using the measured noise of each anode
361   // threshold values from ALICE-INT-1999-28 V10
362   Float_t factL=2.2; 
363   Float_t factH=4.0;
364   //
365
366   Int_t iAn=(k%nzBins)-1;
367   if(iAn<0 || iAn>255) return;
368   if(sid==1) iAn+=256;
369   Int_t nLow=0, nHigh=0;
370   Float_t noise=cal->GetNoiseAfterElectronics(iAn);
371   Float_t noisem1=noise;
372   if(iAn>1) noisem1=cal->GetNoiseAfterElectronics(iAn-1);
373   Float_t noisep1=noise;
374   if(iAn<511) noisep1=cal->GetNoiseAfterElectronics(iAn+1);
375   Float_t tL=noise*factL;
376   Float_t tH=noise*factH;
377   Float_t tLp1=noisep1*factL;
378   Float_t tHp1=noisep1*factH;
379   Float_t tLm1=noisem1*factL;
380   Float_t tHm1=noisem1*factH;
381   Float_t cC=bins[k].GetQ();
382   if(cC<=tL){
383     bins[k].SetQ(0);
384     bins[k].SetMask(0xFFFFFFFE);
385     return;
386   }
387   nLow++; // cC is greater than tL
388   if(cC>tH) nHigh++;
389   Int_t sS=bins[k-1].GetQ();
390   if(sS>tLm1) nLow++;
391   if(sS>tHm1) nHigh++;
392   Int_t nN=bins[k+1].GetQ();
393   if(nN>tLp1) nLow++;
394   if(nN>tHp1) nHigh++;
395   Int_t eE=bins[k-nzBins].GetQ();
396   if(eE>tL) nLow++;
397   if(eE>tH) nHigh++;
398   Int_t wW=bins[k+nzBins].GetQ();
399   if(wW>tL) nLow++;
400   if(wW>tH) nHigh++;
401   if(nLow<3 || nHigh<1){
402     bins[k].SetQ(0);
403     bins[k].SetMask(0xFFFFFFFE);
404   }
405 }
406
407
408