ITS/UPGRADE/AliITSUTrackerGlo.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /*
  17   TO CHECK
  18   GetBz usage
  19
  20  */
  21
  22 //-------------------------------------------------------------------------
  23 //  Implementation of the ITS Upgrade tracker mother class.
  24 //-------------------------------------------------------------------------
  25 #include <TTree.h>
  26 #include <Riostream.h>
  27 #include <TMath.h>
  28 #include <TFile.h>
  29
  30 #include "AliITSUTrackerGlo.h"
  31 #include "AliESDEvent.h"
  32 #include "AliESDtrack.h"
  33 #include "AliITSURecoDet.h"
  34 #include "AliITSURecoSens.h"
  35 #include "AliITSUReconstructor.h"
  36 #include "AliITSReconstructor.h"
  37 #include "AliITSUSeed.h"
  38 #include "AliITSUClusterPix.h"
  39 #include "AliITSUGeomTGeo.h"
  40 #include "AliCodeTimer.h"
  41 #include "AliRefArray.h"
  42 using namespace AliITSUAux;
  43 using namespace TMath;
  44
  45 //----------------- tmp stuff -----------------
  46
  47 ClassImp(AliITSUTrackerGlo)
  48
  49 const Double_t AliITSUTrackerGlo::fgkToler =  1e-6;// tolerance for layer on-surface check
  50
  51
  52 //_________________________________________________________________________
  53 AliITSUTrackerGlo::AliITSUTrackerGlo(AliITSUReconstructor* rec)
  54 :  fReconstructor(rec)
  55   ,fITS(0)
  56   ,fMatLUT(0)
  57   ,fCurrESDtrack(0)
  58   ,fCurrESDtrMClb(kDummyLabel)
  59   ,fCurrMass(kPionMass)
  60   ,fCountProlongationTrials(0)
  61   ,fCountITSin(0)
  62   ,fCountITSout(0)
  63   ,fCountITSrefit(0)
  64   ,fNTracksESD(0)
  65   ,fHypStore(100)
  66   ,fLayerMaxCandidates(1000)
  67   ,fLayerCandidates(0)
  68   ,fNBranchesAdded(0)
  69   ,fNCandidatesAdded(0)
  70   ,fCurrHyp(0)
  71   ,fWorkHyp(0)
  72   ,fSeedsPool("AliITSUSeed",0)
  73   ,fFreeSeedsID(0)
  74   ,fESDIndex(0)
  75   ,fNFreeSeeds(0)
  76   ,fLastSeedID(0)
  77   ,fNLrActive(0)
  78   ,fDefTrackConds(0)
  79   ,fCurrTrackCond(0)
  80   ,fCurrActLrID(-1)
  81   ,fCurrLayer(0)
  82   ,fTrackPhaseID(-1)
  83   ,fCurrPassID(-1)
  84   ,fUseMatLUT(kFALSE)
  85 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
  86   ,fCHistoArrCorr(0)
  87   ,fCHistoArrFake(0)
  88 #endif
  89 {
  90   // Default constructor
  91   if (rec) Init(rec);
  92 }
  93
  94 //_________________________________________________________________________
  95 AliITSUTrackerGlo::~AliITSUTrackerGlo()
  96 {
  97  // Default destructor
  98  //
  99   delete[] fLayerCandidates;
 100   if (fWorkHyp) fWorkHyp->SetTPCSeed(0); // this hypothesis does not own the seed
 101   delete fWorkHyp;
 102   delete fMatLUT;
 103   //
 104 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
 105   if (fCHistoArrCorr || fCHistoArrFake) {
 106     TFile* ctrOut = TFile::Open("itsuControlHistos.root","recreate");
 107     ctrOut->cd();
 108     AliInfo("Storing control histos");
 109     //    ctrOut->WriteObject(fCHistoArr,"controlH","kSingleKey");
 110     if (fCHistoArrCorr) {
 111       fCHistoArrCorr->Write();
 112       delete fCHistoArrCorr;
 113     }
 114     if (fCHistoArrFake) {
 115       fCHistoArrFake->Write();
 116       delete fCHistoArrFake;
 117     }
 118     ctrOut->Close();
 119     delete ctrOut;
 120     fCHistoArrCorr = 0;
 121     fCHistoArrFake = 0;
 122   }
 123 #endif
 124   //
 125 }
 126
 127 //_________________________________________________________________________
 128 void AliITSUTrackerGlo::Init(AliITSUReconstructor* rec)
 129 {
 130   // init with external reconstructor
 131   //
 132   fITS = rec->GetITSInterface();
 133   fNLrActive = fITS->GetNLayersActive();
 134   fWorkHyp = new AliITSUTrackHyp(fNLrActive);
 135   // create material lookup table
 136   const int kNTest = 1000;
 137   const double kStepsPerCM=5;
 138   fMatLUT  = new AliITSUMatLUT(fITS->GetRMin(),fITS->GetRMax(),Nint(kStepsPerCM*(fITS->GetRMax()-fITS->GetRMin())));
 139   double zmn = 1e6;
 140   for (int ilr=fITS->GetNLayers();ilr--;) {
 141     AliITSURecoLayer* lr = fITS->GetLayer(ilr);
 142     if (zmn>Abs(lr->GetZMin())) zmn = Abs(lr->GetZMin());
 143     if (zmn>Abs(lr->GetZMax())) zmn = Abs(lr->GetZMax());
 144   }
 145   fMatLUT->FillData(kNTest,-zmn,zmn);
 146   //
 147   if (fLayerMaxCandidates<1) fLayerMaxCandidates = 1000;
 148   fLayerCandidates = new AliITSUSeed*[fLayerMaxCandidates];
 149   fSeedsPool.ExpandCreateFast(1000); // RS TOCHECK
 150   fFreeSeedsID.Set(1000);
 151   fESDIndex.Set(1000);
 152   //
 153 }
 154
 155 //_________________________________________________________________________
 156 void AliITSUTrackerGlo::CreateDefaultTrackCond()
 157 {
 158   // creates default tracking conditions to be used when recoparam does not provide them
 159
 160   AliITSUTrackCond* cond = new AliITSUTrackCond();
 161   //
 162   cond->SetNLayers(fNLrActive);
 163   cond->AddNewCondition(fNLrActive);
 164   cond->AddGroupPattern( 0xffff, fNLrActive ); // require all layers hit
 165   cond->Init();
 166   //
 167   fDefTrackConds.AddLast(cond);
 168   //
 169   AliInfo("Created conditions: ");
 170   for (int i=0;i<fDefTrackConds.GetEntriesFast();i++) fDefTrackConds[i]->Print();
 171   //
 172 }
 173
 174
 175 //_________________________________________________________________________
 176 Int_t AliITSUTrackerGlo::Clusters2Tracks(AliESDEvent *esdEv)
 177 {
 178   //
 179   AliCodeTimerAuto("",0);
 180   SetTrackingPhase(kClus2Tracks);
 181   //
 182 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
 183   if (!fCHistoArrCorr) fCHistoArrCorr = BookControlHistos("Corr");
 184   if (!fCHistoArrFake) fCHistoArrFake = BookControlHistos("Fake");
 185 #endif
 186   static int evID = 0;
 187   static TArrayF esdTrPt(fESDIndex.GetSize());
 188   //
 189   TObjArray *trackConds = 0;
 190   //
 191   fCountProlongationTrials = 0;
 192   fCountITSin = 0;
 193   fCountITSout = 0;
 194   fCountITSrefit = 0;
 195   //
 196   ResetSeedsPool();
 197   fNTracksESD = esdEv->GetNumberOfTracks();
 198   AliInfo(Form("Will try to find prolongations for %d tracks",fNTracksESD));
 199   int nTrackCond = AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetNTrackingConditions();
 200   fUseMatLUT = AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetUseMatLUT(fTrackPhaseID);
 201   if (nTrackCond<1) {
 202     if (!fDefTrackConds.GetEntriesFast()) {
 203       AliInfo("No tracking conditions found in recoparams, creating default one requesting all layers hit");
 204       CreateDefaultTrackCond();
 205     }
 206     trackConds = &fDefTrackConds;
 207     nTrackCond = trackConds->GetEntriesFast();
 208   }
 209   else trackConds = AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetTrackingConditions();
 210   //
 211   static Bool_t first = kTRUE;
 212   if (first) {
 213     AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->Print();
 214     first = kFALSE;
 215   }
 216   fHypStore.Delete();
 217   if (fHypStore.GetSize()<fNTracksESD) fHypStore.Expand(fNTracksESD+100);
 218   //
 219   fITS->ProcessClusters();
 220   //
 221 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
 222   FlagSplitClusters(); // tmp RS
 223 #endif
 224   //
 225   // the tracks will be reconstructed in decreasing pt order, sort them
 226   if (fESDIndex.GetSize()<fNTracksESD) {
 227     fESDIndex.Set(fNTracksESD+200);
 228     esdTrPt.Set(fNTracksESD+200);
 229   }
 230   int* esdTrackIndex = fESDIndex.GetArray();
 231   float* trPt = esdTrPt.GetArray();
 232   for (int itr=fNTracksESD;itr--;) {
 233     AliESDtrack* esdTr = esdEv->GetTrack(itr);
 234     esdTr->SetStatus(AliESDtrack::kITSupg);   // Flag all tracks as participating in the ITSup reco
 235     trPt[itr] = esdTr->Pt();
 236   }
 237   Sort(fNTracksESD,trPt,esdTrackIndex,kTRUE);
 238   //
 239   for (int icnd=0;icnd<nTrackCond;icnd++) {
 240     fCurrPassID = icnd;
 241     fCurrTrackCond = (AliITSUTrackCond*)trackConds->UncheckedAt(icnd);
 242     if (!fCurrTrackCond->IsInitDone()) fCurrTrackCond->Init();
 243     // select ESD tracks to propagate
 244     for (int itr=0;itr<fNTracksESD;itr++) {
 245       int trID = esdTrackIndex[itr];
 246       fCurrESDtrack = esdEv->GetTrack(trID);
 247       fCurrESDtrMClb = fCurrESDtrack->GetLabel();
 248       //
 249
 250       if (!NeedToProlong(fCurrESDtrack,trID)) continue;  // are we interested in this track?
 251       /*
 252         // if specific tracks should be checked, create a global array int wtc[] = {evITS*10000+trID, ...};
 253       Bool_t dbg = kFALSE;
 254       int nwtc = sizeof(wtc)/sizeof(int);
 255
 256       for (int k=0;k<nwtc;k++) {
 257         if (wtc[k]==evID*10000+trID) {
 258           dbg = kTRUE;
 259           printf("At esdTr: %d MC: %d\n",wtc[k],fCurrESDtrMClb);
 260           break;
 261         }
 262       }
 263       AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",dbg ? 10:0);
 264       */
 265 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 266       AliDebug(1,Form("Processing track %d(esd%d) | M=%.3f Pt=%.3f | MCLabel: %d",itr,trID,fCurrESDtrack->GetMassForTracking(kTRUE),fCurrESDtrack->Pt(),fCurrESDtrMClb));//RS
 267 #endif
 268       FindTrack(fCurrESDtrack, trID);
 269     }
 270     //
 271 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 272     if (AliDebugLevelClass()>+2) {
 273       AliInfo(Form("SeedsPool: %d, BookedUpTo: %d, free: %d",fSeedsPool.GetSize(),fSeedsPool.GetEntriesFast(),fNFreeSeeds));
 274       fHypStore.Print();
 275     }
 276 #endif
 277     FinalizeHypotheses();
 278 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
 279     CheckClusterUsage(); //!!RS
 280 #endif
 281     //
 282     //AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",0);     // in case wtc array was defined, uncomment this
 283   }
 284   //
 285   AliInfo(Form("%d ITSin for %d tried TPC seeds out of %d ESD tracks\n",fCountITSin,fCountProlongationTrials,fNTracksESD));
 286   evID++;
 287   return 0;
 288 }
 289
 290 //_________________________________________________________________________
 291 Int_t AliITSUTrackerGlo::PropagateBack(AliESDEvent *esdEv)
 292 {
 293   //
 294   // Do outward fits in ITS
 295   AliCodeTimerAuto("",0);
 296   //
 297   SetTrackingPhase(kPropBack);
 298   fNTracksESD = esdEv->GetNumberOfTracks();
 299   fUseMatLUT = AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetUseMatLUT(fTrackPhaseID);
 300 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 301   AliDebug(1,Form("Will propagate back %d tracks",fNTracksESD));
 302 #endif
 303   //
 304   double bz0 = GetBz();
 305   Double_t xyzTrk[3],xyzVtx[3]={GetX(),GetY(),GetZ()};
 306   AliITSUTrackHyp dummyTr;
 307   const double kWatchStep=10.; // for larger steps watch arc vs segment difference
 308   Double_t times[AliPID::kSPECIESC];
 309   //
 310   for (int itr=0;itr<fNTracksESD;itr++) {
 311     fCurrESDtrack = esdEv->GetTrack(itr);
 312     fCurrESDtrMClb = fCurrESDtrack->GetLabel();
 313     // Start time integral and add distance from current position to vertex
 314     if (fCurrESDtrack->IsOn(AliESDtrack::kITSout)) continue; // already done
 315     //
 316     fCurrESDtrack->GetXYZ(xyzTrk);
 317     Double_t dst = 0.;     // set initial track lenght, tof
 318     {
 319       double dxs = xyzTrk[0] - xyzVtx[0];
 320       double dys = xyzTrk[1] - xyzVtx[1];
 321       //      double dzs = xyzTrk[2] - xyzVtx[2];
 322       // RS: for large segment steps d use approximation of cicrular arc s by
 323       // s = 2R*asin(d/2R) = d/p asin(p) \approx d/p (p + 1/6 p^3) = d (1+1/6 p^2)
 324       // where R is the track radius, p = d/2R = 2C*d (C is the abs curvature)
 325       // Hence s^2/d^2 = (1+1/6 p^2)^2
 326       dst = dxs*dxs + dys*dys;
 327       if (dst > kWatchStep*kWatchStep) { // correct circular part for arc/segment factor
 328         double crv = Abs(fCurrESDtrack->GetC(bz0));
 329         double fcarc = 1.+crv*crv*dst/6.;
 330         dst *= fcarc*fcarc;
 331       }
 332       // RS: temporary hack since we don't have SPD vertex:
 333       //      dst += dzs*dzs;
 334       dst *= 1+fCurrESDtrack->GetTgl()*fCurrESDtrack->GetTgl();
 335       dst = Sqrt(dst);
 336     }
 337     //
 338     fCurrESDtrack->SetStatus(AliESDtrack::kTIME);
 339     //
 340     if (!fCurrESDtrack->IsOn(AliESDtrack::kITSin)) { // case of tracks w/o ITS prolongation: just set the time integration
 341       dummyTr.AliExternalTrackParam::operator=(*fCurrESDtrack);
 342       dummyTr.StartTimeIntegral();
 343       dummyTr.AddTimeStep(dst);
 344       dummyTr.GetIntegratedTimes(times,AliPID::kSPECIESC);
 345       fCurrESDtrack->SetIntegratedTimes(times);
 346       fCurrESDtrack->SetIntegratedLength(dummyTr.GetIntegratedLength());
 347       continue;
 348     }
 349     //
 350     fCurrHyp = GetTrackHyp(itr);
 351     fCurrMass = fCurrHyp->GetMass();
 352     fCurrHyp->StartTimeIntegral();
 353     fCurrHyp->AddTimeStep(dst);
 354     fCurrHyp->ResetCovariance(10000);
 355     int nclFit = 0;
 356     double chi2 = RefitTrack(fCurrHyp,fITS->GetRMax(),nclFit);
 357     if (chi2>0) { // propagate to exit from the ITS/TPC screen
 358       int ndf = nclFit*2-5;
 359       if (ndf>0) chi2 /= ndf;
 360       fCurrHyp->SetChi2(chi2);
 361       UpdateESDTrack(fCurrHyp,AliESDtrack::kITSout);
 362     }
 363     else {
 364 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 365       AliDebug(2,Form("Refit Failed for track %d | ESDtrack#%d (MClb:%d)",itr,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
 366 #endif
 367       //fCurrHyp->AliExternalTrackParam::Print();
 368       //fCurrHyp->GetWinner()->Print();
 369     }
 370     //
 371   }
 372   //
 373   AliInfo(Form("%d ITSout in %d ITSin tracks for %d tried TPC seeds out of %d ESD tracks\n",
 374                fCountITSout,fCountITSin,fCountProlongationTrials,fNTracksESD));
 375   //
 376   return 0;
 377 }
 378
 379 //_________________________________________________________________________
 380 Int_t AliITSUTrackerGlo::RefitInward(AliESDEvent *esdEv)
 381 {
 382   //
 383   // refit the tracks inward, using current cov.matrix
 384   AliCodeTimerAuto("",0);
 385   //
 386   SetTrackingPhase(kRefitInw);
 387   fUseMatLUT = AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetUseMatLUT(fTrackPhaseID);
 388   fNTracksESD = esdEv->GetNumberOfTracks();
 389   //  AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",10);
 390
 391   AliDebug(1,Form("Will refit inward %d tracks",fNTracksESD));
 392   //  Bool_t uselogMS = AliExternalTrackParam::GetUseLogTermMS();
 393   //  AliExternalTrackParam::SetUseLogTermMS(kTRUE);
 394   //
 395   for (int itr=0;itr<fNTracksESD;itr++) {
 396     fCurrESDtrack = esdEv->GetTrack(itr);
 397     fCurrESDtrMClb = fCurrESDtrack->GetLabel();
 398     // Start time integral and add distance from current position to vertex
 399     UInt_t trStat = fCurrESDtrack->GetStatus();
 400     if ( !(trStat & AliESDtrack::kITSout) ) continue;
 401     if (   trStat & AliESDtrack::kITSrefit ) continue; // already done
 402     if (  (trStat & AliESDtrack::kTPCout) && !(trStat & AliESDtrack::kTPCrefit) ) continue;
 403     //
 404     fCurrHyp  = GetTrackHyp(itr);
 405     fCurrMass = fCurrHyp->GetMass();
 406     *fCurrHyp = *fCurrESDtrack;  // fetch current ESDtrack kinematics
 407     //
 408     int nclFit = 0;
 409     //    fCurrHyp->ResetCovariance(1000); // in case we want to do SA refit
 410     double chi2 = RefitTrack(fCurrHyp,fITS->GetRMin(),nclFit);
 411     if (chi2>0) { // propagate up to inside radius of the beam pipe
 412       int ndf = nclFit*2-5;
 413       if (ndf>0) chi2 /= ndf;
 414       fCurrHyp->SetChi2(chi2);
 415       UpdateESDTrack(fCurrHyp,AliESDtrack::kITSrefit);
 416     }
 417     else {
 418 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 419       AliDebug(2,Form("Refit Failed for track %d |ESDtrack#%d (MClb:%d)",itr,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
 420 #endif
 421     }
 422   }
 423   //  AliExternalTrackParam::SetUseLogTermMS(uselogMS);
 424   //
 425   AliInfo(Form("%d ITSrefit in %d ITSout in %d ITSin tracks for %d tried TPC seeds out of %d ESD tracks\n",
 426                fCountITSrefit,fCountITSout,fCountITSin,fCountProlongationTrials,fNTracksESD));
 427   //
 428   //  AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",0);
 429   return 0;
 430 }
 431
 432 //_________________________________________________________________________
 433 Int_t AliITSUTrackerGlo::LoadClusters(TTree * treeRP)
 434 {
 435   // read from tree (if pointer provided) or directly from the ITS reco interface
 436   //
 437   return fReconstructor->LoadClusters(treeRP);
 438 }
 439
 440 //_________________________________________________________________________
 441 void AliITSUTrackerGlo::UnloadClusters()
 442 {
 443   //
 444   // To be implemented
 445   //
 446
 447   Info("UnloadClusters","To be implemented");
 448 }
 449 //_________________________________________________________________________
 450 AliCluster * AliITSUTrackerGlo::GetCluster(Int_t /*index*/) const
 451 {
 452   //
 453   // To be implemented
 454   //
 455
 456   Info("GetCluster","To be implemented");
 457   return 0x0;
 458 }
 459
 460 //_________________________________________________________________________
 461 Bool_t AliITSUTrackerGlo::NeedToProlong(AliESDtrack* esdTr, Int_t esdID)
 462 {
 463   // do we need to match this track to ITS?
 464   //
 465   static double bz = GetBz();
 466   //
 467   // is it already prolonged
 468   if (esdTr->IsOn(AliESDtrack::kITSin)) return kFALSE;
 469   AliITSUTrackHyp* hyp = GetTrackHyp(esdID); // in case there is unfinished hypothesis from prev.pass, clean it
 470   if (hyp) {
 471     CleanHypothesis(hyp);
 472     if (hyp->GetSkip()) return kFALSE; // need to skip this
 473     return kTRUE;
 474   }
 475   //
 476   if (!esdTr->IsOn(AliESDtrack::kTPCin) ||
 477       esdTr->IsOn(AliESDtrack::kTPCout) ||
 478       esdTr->IsOn(AliESDtrack::kITSin)  ||
 479       esdTr->GetKinkIndex(0)>0) return kFALSE;
 480   //
 481   if (esdTr->Pt()<AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetMinPtForProlongation()) return kFALSE;
 482   //
 483   float dtz[2];
 484   esdTr->GetDZ(GetX(),GetY(),GetZ(),bz,dtz);
 485   // if track is not V0 candidata but has large offset wrt IP, reject it. RS TOCHECK
 486   if ( !(esdTr->GetV0Index(0)>0 && dtz[0]>AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxDforV0dghtrForProlongation())
 487        && (Abs(dtz[0])>AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxDForProlongation() ||
 488            Abs(dtz[1])>AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxDZForProlongation())) return kFALSE;
 489   //
 490   //  if (esdTr->Pt()<3) return kFALSE;//RS
 491   return kTRUE;
 492 }
 493
 494 //_________________________________________________________________________
 495 void AliITSUTrackerGlo::FindTrack(AliESDtrack* esdTr, Int_t esdID)
 496 {
 497   // find prolongaion candidates finding for single seed
 498   //
 499   AliITSUSeed seedUC;  // copy of the seed from the upper layer
 500   AliITSUSeed seedT;   // transient seed between the seedUC and new prolongation hypothesis
 501   //
 502   //  AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",10);
 503   AliITSUTrackHyp* hypTr = InitHypothesis(esdTr,esdID);  // initialize prolongations hypotheses tree
 504   if (!hypTr || hypTr->GetSkip()) return;
 505   //
 506   double bz = GetBz();
 507   fCurrHyp = fWorkHyp;
 508   fCurrHyp->InitFrom(hypTr);
 509   //
 510   AliITSURecoSens *hitSens[AliITSURecoLayer::kMaxSensMatching];
 511   //
 512   int ilaUp = fNLrActive;     // previous active layer really checked (some may be excluded!)
 513   //
 514   for (int ila=fNLrActive;ila--;ilaUp=fCurrActLrID) {
 515     if (fCurrTrackCond->IsLayerExcluded(ila)) continue;
 516     fCurrActLrID = ila;
 517     fCurrLayer = fITS->GetLayerActive(ila);
 518     Bool_t noClSharing = fCurrTrackCond->GetClSharing(ila)==0;
 519     //
 520     // for the outermost layer the seed is created from the ESD track
 521     int nSeedsUp = (ilaUp==fNLrActive) ? 1 : fCurrHyp->GetNSeeds(ilaUp);
 522     int maxNBranches   = fCurrTrackCond->GetMaxBranches(ila);
 523     int maxNCandidates = fCurrTrackCond->GetMaxCandidates(ila);
 524     //
 525     for (int isd=0;isd<nSeedsUp;isd++) {
 526       AliITSUSeed* seedU;
 527       if (ilaUp==fNLrActive) {
 528         seedU = 0;
 529         seedUC.InitFromSeed(fCurrHyp->GetTPCSeed()); // init with TPC seed from ref.R
 530       }
 531       else {
 532         seedU = fCurrHyp->GetSeed(ilaUp,isd);  // seed on prev.active layer to prolong
 533         if (seedU->IsKilled()) continue;
 534         seedUC = *seedU;                       // its copy will be prolonged
 535         seedUC.SetParent(seedU);
 536       }
 537       seedUC.ResetFMatrix();                    // reset the matrix for propagation to next layer
 538       // go till next active layer
 539 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 540       AliDebug(2,Form("working on Lr:%d Seed:%d of %d for esdID=%d (MClb:%d) | pT=%.3f",ila,isd,nSeedsUp,esdID,fCurrESDtrMClb,seedUC.Pt()));
 541 #endif
 542       if (!TransportToLayer(&seedUC, fITS->GetLrIDActive(ilaUp), fITS->GetLrIDActive(ila)) ) { // external seed already prolonged
 543         //
 544 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 545         AliDebug(2,Form("Transport failed | esdID=%d (MClb:%d)",esdID,fCurrESDtrMClb));
 546 #endif
 547         // Check if the seed satisfies to track definition
 548         if (NeedToKill(&seedUC,kTransportFailed) && seedU) KillSeed(seedU,kTRUE);
 549         continue; // RS TODO: decide what to do with tracks stopped on higher layers w/o killing
 550       }
 551       if (!GetRoadWidth(&seedUC, ila)) { // failed to find road width on the layer
 552         if (NeedToKill(&seedUC,kRWCheckFailed) && seedU) KillSeed(seedU,kTRUE);
 553         continue;
 554       }
 555       /*
 556       //RS toremove
 557       int mcquest = -1;
 558       if (!seedUC.ContainsFake() && AliDebugLevelClass()>2) {
 559         mcquest = fCurrESDtrMClb;
 560         seedUC.Print("etp");
 561         printf("FSParams: "); for (int ip=0;ip<kNTrImpData;ip++) printf("%+e ",fTrImpData[ip]); printf("\n");
 562       }
 563       //
 564       int nsens = fCurrLayer->FindSensors(&fTrImpData[kTrPhi0], hitSens, mcquest);  // find detectors which may be hit by the track
 565       */
 566       int nsens = fCurrLayer->FindSensors(&fTrImpData[kTrPhi0], hitSens);  // find detectors which may be hit by the track
 567 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 568       AliDebug(2,Form("Will check %d sensors on lr:%d | esdID=%d (MClb:%d)",nsens,ila,esdID,fCurrESDtrMClb));
 569 #endif
 570       //
 571       seedUC.SetLr(ila);
 572       //
 573       for (int isn=nsens;isn--;) {
 574         AliITSURecoSens* sens = hitSens[isn];
 575         int ncl = sens->GetNClusters();
 576         if (!ncl) continue;
 577         seedT = seedUC;
 578         //
 579         // We need to propagate the seed to sensor on fCurrLayer staying in the frame of the sensor from prev.layer,
 580         // since the transport matrix should be defined in this frame.
 581         double xs; // X in the TF of current seed, corresponding to intersection with sensor plane
 582         if (!seedT.GetTrackingXAtXAlpha(sens->GetXTF(),sens->GetPhiTF(),bz, xs)) {
 583 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 584           if (AliDebugLevelClass()>2) {
 585             printf("Failed on GetTrackingXAtXAlpha: X=%.4f alp=%.3f\n",sens->GetXTF(),sens->GetPhiTF());
 586             seedT.Print("etp");
 587           }
 588 #endif
 589           continue;
 590         }
 591         if (xs<seedT.GetX()) {
 592           if (!PropagateSeed(&seedT,xs,fCurrMass)) continue;
 593         }
 594         else { // some low precision tracks may hit the sensor plane outside of the layer radius
 595 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 596           if (AliDebugLevelClass()>2) {
 597             if (!seedT.ContainsFake()) {
 598               printf("WRONG PROP on L%d, sens%d of %d: %.4f > %.4f\n",ila,isn,nsens,xs,seedT.GetX());
 599               sens->Print();
 600               seedT.Print("etp");
 601             }
 602           }
 603 #endif
 604           if (!seedT.PropagateParamOnlyTo(xs,bz)) continue;
 605         }
 606         //      if (!seedT.PropagateToX(xs,bz)) continue;
 607         //      if (!seedT.Rotate(sens->GetPhiTF())) continue;
 608         if (!seedT.RotateToAlpha(sens->GetPhiTF())) continue;
 609         //
 610         int clID0 = sens->GetFirstClusterId();
 611         for (int icl=ncl;icl--;) { // don't change the order, clusters are sorted
 612           //AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",10);
 613           int clID = clID0 + icl;
 614           if (noClSharing && fCurrLayer->GetCluster(clID)->IsClusterUsed()) continue;
 615           int res = CheckCluster(&seedT,ila,clID0+icl);
 616           //AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo", 0);
 617           //
 618           if (res==kStopSearchOnSensor) break;     // stop looking on this sensor
 619           if (res==kClusterNotMatching) continue;  // cluster does not match
 620           // cluster is matching and it was added to the hypotheses tree
 621         }
 622       }
 623       // cluster search is done. Do we need to have a version of this seed skipping current layer
 624       if (!NeedToKill(&seedUC,kMissingCluster)) {
 625         AliITSUSeed* seedSkp = NewSeedFromPool(&seedUC);
 626         if (nsens) { // to do: make penalty to account for probability to miss the cluster for good reason
 627           double penalty = -fCurrTrackCond->GetMissPenalty(ila);
 628           seedSkp->SetChi2Cl(penalty);
 629         }
 630         if (seedSkp->GetChi2GloNrm()>fCurrTrackCond->GetMaxChi2GloNrm(ila)) {
 631           MarkSeedFree(seedSkp);
 632         }
 633         else AddSeedBranch(seedSkp);
 634       }
 635       // transfer the new branches of the seed to the hypothesis container
 636       if (fNBranchesAdded) ValidateAllowedBranches(maxNBranches);
 637       //
 638     }
 639     if (fNCandidatesAdded) ValidateAllowedCandidates(ila,maxNCandidates);
 640     //    ((TObjArray*)fCurrHyp->GetLayerSeeds(ila))->Sort();
 641 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 642     if (AliDebugLevelClass()>2) { //RS
 643       printf(">>> All hypotheses on lr %d: \n",ila);
 644       for (int ih=0;ih<fCurrHyp->GetNSeeds(ila);ih++) {printf(" #%3d ",ih); fCurrHyp->GetSeed(ila,ih)->Print();}
 645     }
 646 #endif
 647     //
 648     /*
 649     for (int ih=0;ih<fCurrHyp->GetNSeeds(ila);ih++) {
 650       if (ila!=0) continue;
 651       double vecL[5] = {0};
 652       double matL[15] = {0};
 653       AliITSUSeed* sp = fCurrHyp->GetSeed(ila,ih);
 654       while(sp->GetParent()) {
 655         sp->Smooth(vecL,matL);
 656         if (sp->GetLayerID()>=fNLrActive-1) break;
 657         sp = (AliITSUSeed*)sp->GetParent();
 658       }
 659       */
 660   }
 661   //
 662   SaveReducedHypothesesTree(hypTr);
 663 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 664   if (AliDebugLevelClass()>1) {
 665     printf("\nSaved hypotheses for esdTrack %d (MCLab:%d)\n",esdID,fCurrESDtrMClb);
 666     hypTr->Print("l");
 667   }
 668 #endif
 669   fCurrHyp = 0;
 670   //  AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",0);
 671   //
 672 }
 673
 674 //_________________________________________________________________________
 675 AliITSUTrackHyp* AliITSUTrackerGlo::InitHypothesis(AliESDtrack *esdTr, Int_t esdID)
 676 {
 677   // init prolongaion candidates finding for single seed
 678   AliITSUTrackHyp* hyp = GetTrackHyp(esdID);
 679   if (hyp) return hyp;
 680   //
 681   fCountProlongationTrials++;
 682   //
 683   fCurrMass = esdTr->GetMassForTracking();
 684   //
 685   hyp = new AliITSUTrackHyp(fNLrActive);
 686   hyp->SetESDTrack(esdTr);
 687   hyp->SetUniqueID(esdID);
 688   hyp->SetMass(fCurrMass);
 689   hyp->SetTPCSeed( new AliExternalTrackParam(*esdTr) );
 690   SetTrackHyp(hyp,esdID);
 691   Bool_t lut = fUseMatLUT; // for propagation from TPC use TGeo material budget always
 692   fUseMatLUT = kFALSE;
 693   if (!TransportToLayer(hyp->GetTPCSeed(),fITS->GetNLayers(), fITS->GetLrIDActive(fNLrActive-1), fITS->GetRITSTPCRef())) hyp->SetSkip(); // propagate to outer R of ITS
 694   fUseMatLUT = lut;
 695   //
 696   return hyp;
 697   // TO DO
 698 }
 699
 700 //_________________________________________________________________________
 701 Bool_t AliITSUTrackerGlo::TransportToLayer(AliITSUSeed* seed, Int_t lFrom, Int_t lTo, Double_t rLim)
 702 {
 703   // transport seed from layerFrom to the entrance (along the direction of the track) of layerTo or to rLim (if>0), wathever is closer
 704   //
 705   //
 706   if (lTo==lFrom) AliFatal(Form("was called with lFrom=%d lTo=%d",lFrom,lTo));
 707   //
 708   int dir = lTo > lFrom ? 1:-1;
 709   AliITSURecoLayer* lrFr = fITS->GetLayer(lFrom); // this can be 0 when extrapolation from TPC to ITS is requested
 710   Bool_t checkFirst = kTRUE;
 711   Bool_t limReached = kFALSE;
 712   while(lFrom!=lTo) {
 713     if (lrFr) {
 714       if (!GoToExitFromLayer(seed,lrFr,dir,checkFirst)) return kFALSE; // go till the end of current layer
 715       checkFirst = kFALSE;
 716     }
 717     AliITSURecoLayer* lrTo =  fITS->GetLayer( (lFrom+=dir) );
 718     if (!lrTo) AliFatal(Form("Layer %d does not exist",lFrom));
 719     //
 720     // go the entrance of the layer, assuming no materials in between
 721     double xToGo = lrTo->GetR(-dir);
 722     if (rLim>0) {
 723       if (dir>0) {
 724         if (rLim<xToGo) {xToGo = rLim; limReached = kTRUE;}
 725       }
 726       else {
 727         if (rLim>xToGo) {xToGo = rLim; limReached = kTRUE;}
 728       }
 729     }
 730     //    double xts = xToGo;
 731     if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) {
 732       //printf("FailHere1: %f %f %d\n",xts,xToGo,dir);
 733       //seed->Print("etp");
 734       //
 735       return kFALSE;
 736     }
 737 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 738     AliDebug(2,Form("go in dir=%d to R=%.4f(X:%.4f)",dir,lrTo->GetR(-dir), xToGo));
 739 #endif
 740     if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass,100, kFALSE )) {
 741       //printf("FailHere2: %f %f %d\n",xts,xToGo,dir);
 742       //seed->Print("etp");
 743       return kFALSE;
 744     }
 745     lrFr = lrTo;
 746     if (limReached) break;
 747   }
 748   return kTRUE;
 749   //
 750 }
 751
 752 //_________________________________________________________________________
 753 Bool_t AliITSUTrackerGlo::TransportToLayer(AliExternalTrackParam* seed, Int_t lFrom, Int_t lTo, Double_t rLim)
 754 {
 755   // transport track from layerFrom to the entrance of layerTo or to rLim (if>0), wathever is closer
 756   //
 757   if (lTo==lFrom) AliFatal(Form("was called with lFrom=%d lTo=%d",lFrom,lTo));
 758   //
 759   int dir = lTo > lFrom ? 1:-1;
 760   AliITSURecoLayer* lrFr = fITS->GetLayer(lFrom); // this can be 0 when extrapolation from TPC to ITS is requested
 761   Bool_t checkFirst = kTRUE;
 762   Bool_t limReached = kFALSE;
 763   while(lFrom!=lTo) {
 764     if (lrFr) {
 765       if (!GoToExitFromLayer(seed,lrFr,dir,checkFirst)) return kFALSE; // go till the end of current layer
 766       checkFirst = kFALSE;
 767     }
 768     AliITSURecoLayer* lrTo =  fITS->GetLayer( (lFrom+=dir) );
 769     if (!lrTo) AliFatal(Form("Layer %d does not exist",lFrom));
 770     //
 771     // go the entrance of the layer, assuming no materials in between
 772     double xToGo = lrTo->GetR(-dir);
 773     if (rLim>0) {
 774       if (dir>0) {
 775         if (rLim<xToGo) {xToGo = rLim; limReached = kTRUE;}
 776       }
 777       else {
 778         if (rLim>xToGo) {xToGo = rLim; limReached = kTRUE;}
 779       }
 780     }
 781     //    double xts = xToGo;
 782     if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) {
 783       //      printf("FailHere1: %f %f %d\n",xts,xToGo,dir);
 784       //      seed->Print("etp");
 785       return kFALSE;
 786     }
 787 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 788     AliDebug(2,Form("go in dir=%d to R=%.4f(X:%.4f)",dir,lrTo->GetR(-dir), xToGo));
 789 #endif
 790     if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass,100, kFALSE )) {
 791       //printf("FailHere2: %f %f %d\n",xts,xToGo,dir);
 792       //seed->Print("etp");
 793       return kFALSE;
 794     }
 795     lrFr = lrTo;
 796     if (limReached) break;
 797   }
 798   return kTRUE;
 799   //
 800 }
 801
 802 //_________________________________________________________________________
 803 Bool_t AliITSUTrackerGlo::TransportToLayerX(AliExternalTrackParam* seed, Int_t lFrom, Int_t lTo, Double_t xStop)
 804 {
 805   // transport track from layerFrom to the entrance of layerTo but do not pass control parameter X
 806   //
 807   if (lTo==lFrom) AliFatal(Form("was called with lFrom=%d lTo=%d",lFrom,lTo));
 808   //
 809   int dir = lTo > lFrom ? 1:-1;
 810   AliITSURecoLayer* lrFr = fITS->GetLayer(lFrom); // this can be 0 when extrapolation from TPC to ITS is requested
 811   Bool_t checkFirst = kTRUE;
 812   while(lFrom!=lTo) {
 813     if (lrFr) {
 814       if (!GoToExitFromLayer(seed,lrFr,dir,checkFirst)) return kFALSE; // go till the end of current layer
 815       checkFirst = kFALSE;
 816     }
 817     AliITSURecoLayer* lrTo =  fITS->GetLayer( (lFrom+=dir) );
 818     if (!lrTo) AliFatal(Form("Layer %d does not exist",lFrom));
 819     //
 820     // go the entrance of the layer, assuming no materials in between
 821     double xToGo = lrTo->GetR(-dir); // R of the entrance to layer
 822     //
 823     //    double xts = xToGo;
 824     if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) {
 825       //      printf("FailHere1: %f %f %d\n",xts,xToGo,dir);
 826       //      seed->Print("etp");
 827       return kFALSE;
 828     }
 829     if ( (dir>0&&xToGo>xStop) || (dir<0&&xToGo<xStop) ) xToGo = xStop;
 830     //
 831 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 832     AliDebug(2,Form("go in dir=%d to R=%.4f(X:%.4f)",dir,lrTo->GetR(-dir), xToGo));
 833 #endif
 834     if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass,100, kFALSE )) {
 835       //printf("FailHere2: %f %f %d\n",xts,xToGo,dir);
 836       //seed->Print("etp");
 837       return kFALSE;
 838     }
 839     lrFr = lrTo;
 840   }
 841   return kTRUE;
 842   //
 843 }
 844
 845 //_________________________________________________________________________
 846 Bool_t AliITSUTrackerGlo::GoToExitFromLayer(AliITSUSeed* seed, AliITSURecoLayer* lr, Int_t dir, Bool_t check)
 847 {
 848   // go to the exit from lr in direction dir, applying material corrections in steps specific for this layer
 849   // If check is requested, do this only provided the track has not exited the layer already
 850   double xToGo = lr->GetR(dir);
 851   if (check) { // do we need to track till the surface of the current layer ?
 852     double curR2 = seed->GetX()*seed->GetX() + seed->GetY()*seed->GetY(); // current radius
 853 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 854     AliDebug(3,Form(" dir:%d Cur: %e Tgt: %e",dir,Sqrt(curR2),xToGo));
 855 #endif
 856     if      (dir>0) { if (curR2-xToGo*xToGo>-fgkToler) return kTRUE; } // on the surface or outside of the layer
 857     else if (dir<0) { if (xToGo*xToGo-curR2>-fgkToler) return kTRUE; } // on the surface or outside of the layer
 858   }
 859   if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) return kFALSE;
 860   // go via layer to its boundary, applying material correction.
 861   if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass, lr->GetMaxStep())) return kFALSE;
 862   //
 863   return kTRUE;
 864   //
 865 }
 866
 867 //_________________________________________________________________________
 868 Bool_t AliITSUTrackerGlo::GoToExitFromLayer(AliExternalTrackParam* seed, AliITSURecoLayer* lr, Int_t dir, Bool_t check)
 869 {
 870   // go to the exit from lr in direction dir, applying material corrections in steps specific for this layer
 871   // If check is requested, do this only provided the track has not exited the layer already
 872   double xToGo = lr->GetR(dir);
 873   if (check) { // do we need to track till the surface of the current layer ?
 874     double curR2 = seed->GetX()*seed->GetX() + seed->GetY()*seed->GetY(); // current radius
 875     if      (dir>0) { if (curR2-xToGo*xToGo>-fgkToler) return kTRUE; } // on the surface or outside of the layer
 876     else if (dir<0) { if (xToGo*xToGo-curR2>-fgkToler) return kTRUE; } // on the surface or outside of the layer
 877   }
 878 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 879   AliDebug(2,Form(" dir=%d : from R=%.4f -> R=%.4f",dir,Sqrt(seed->GetX()*seed->GetX() + seed->GetY()*seed->GetY()), xToGo));
 880 #endif
 881   if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) return kFALSE;
 882   // go via layer to its boundary, applying material correction.
 883   if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass, lr->GetMaxStep())) return kFALSE;
 884   //
 885   return kTRUE;
 886   //
 887 }
 888
 889
 890 //_________________________________________________________________________
 891 Bool_t AliITSUTrackerGlo::GoToEntranceToLayer(AliITSUSeed* seed, AliITSURecoLayer* lr, Int_t dir, Bool_t check)
 892 {
 893   // go to the entrance of lr in direction dir, w/o applying material corrections.
 894   // If check is requested, do this only provided the track did not reach the layer already
 895   double xToGo = lr->GetR(-dir);
 896   if (check) { // do we need to track till the surface of the current layer ?
 897     double curR2 = seed->GetX()*seed->GetX() + seed->GetY()*seed->GetY(); // current radius
 898     if      (dir>0) { if (curR2-xToGo*xToGo>-fgkToler) return kTRUE; } // already passed
 899     else if (dir<0) { if (xToGo*xToGo-curR2>-fgkToler) return kTRUE; } // already passed
 900   }
 901   if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) return kFALSE;
 902   // go via layer to its boundary, applying material correction.
 903   if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass, 100, kFALSE)) return kFALSE;
 904   return kTRUE;
 905   //
 906 }
 907
 908 //_________________________________________________________________________
 909 Bool_t AliITSUTrackerGlo::GoToEntranceToLayer(AliExternalTrackParam* seed, AliITSURecoLayer* lr, Int_t dir, Bool_t check)
 910 {
 911   // go to the entrance of lr in direction dir, w/o applying material corrections.
 912   // If check is requested, do this only provided the track did not reach the layer already
 913   double xToGo = lr->GetR(-dir);
 914   if (check) { // do we need to track till the surface of the current layer ?
 915     double curR2 = seed->GetX()*seed->GetX() + seed->GetY()*seed->GetY(); // current radius
 916     if      (dir>0) { if (curR2-xToGo*xToGo>-fgkToler) return kTRUE; } // already passed
 917     else if (dir<0) { if (xToGo*xToGo-curR2>-fgkToler) return kTRUE; } // already passed
 918   }
 919   if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) return kFALSE;
 920   // go via layer to its boundary, applying material correction.
 921   if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass, 100, kFALSE)) return kFALSE;
 922   return kTRUE;
 923   //
 924 }
 925
 926 //_________________________________________________________________________
 927 Bool_t AliITSUTrackerGlo::GetRoadWidth(AliITSUSeed* seed, int ilrA)
 928 {
 929   // calculate road width in terms of phi and z for the track which MUST be on the external radius of the layer
 930   // as well as some aux info
 931   double bz = GetBz();
 932   AliITSURecoLayer* lrA = fITS->GetLayerActive(ilrA);
 933   seed->GetXYZ(&fTrImpData[kTrXIn]);    // lab position at the entrance from above
 934   static AliExternalTrackParam sc;   // seed copy for manipulations
 935   sc = *seed;
 936   //
 937   fTrImpData[kTrPhiIn] = ATan2(fTrImpData[kTrYIn],fTrImpData[kTrXIn]);
 938   if (!sc.Rotate(fTrImpData[kTrPhiIn])) return kFALSE; // go to the frame of the entry point into the layer
 939   BringTo02Pi(fTrImpData[kTrPhiIn]);
 940   double dr  = lrA->GetDR();                              // approximate X dist at the inner radius
 941   if (!sc.GetXYZAt(sc.GetX()-dr, bz, fTrImpData + kTrXOut)) {
 942     // special case: track does not reach inner radius, might be tangential
 943     double r = sc.GetD(0,0,bz);
 944     double x;
 945     if (!sc.GetXatLabR(r,x,bz,-1)) return kFALSE;
 946     dr = Abs(sc.GetX() - x);
 947     if (!sc.GetXYZAt(x, bz, fTrImpData + kTrXOut)) return kFALSE;
 948   }
 949   //
 950   fTrImpData[kTrPhiOut] = ATan2(fTrImpData[kTrYOut],fTrImpData[kTrXOut]);
 951   BringTo02Pi(fTrImpData[kTrPhiOut]);
 952   double sgy = sc.GetSigmaY2() + dr*dr*sc.GetSigmaSnp2() + AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaY2(ilrA);
 953   double sgz = sc.GetSigmaZ2() + dr*dr*sc.GetSigmaTgl2() + AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaZ2(ilrA);
 954   sgy = Sqrt(sgy)*fCurrTrackCond->GetNSigmaRoadY(ilrA);
 955   sgz = Sqrt(sgz)*fCurrTrackCond->GetNSigmaRoadZ(ilrA);
 956   double phi0  = MeanPhiSmall(fTrImpData[kTrPhiOut],fTrImpData[kTrPhiIn]);
 957   double dphi0 = DeltaPhiSmall(fTrImpData[kTrPhiOut],fTrImpData[kTrPhiIn]);
 958   //
 959   fTrImpData[kTrPhi0] = phi0;
 960   fTrImpData[kTrZ0]   = 0.5*(fTrImpData[kTrZOut]+fTrImpData[kTrZIn]);
 961   dphi0 += sgy/lrA->GetR();
 962   fTrImpData[kTrDPhi] =  dphi0<PiOver2() ? dphi0 : PiOver2();
 963   fTrImpData[kTrDZ]   = 0.5*Abs(fTrImpData[kTrZOut]-fTrImpData[kTrZIn])   + sgz;
 964   //
 965   return kTRUE;
 966 }
 967
 968 //________________________________________
 969 void AliITSUTrackerGlo::ResetSeedsPool()
 970 {
 971   // mark all seeds in the pool as unused
 972   AliDebug(-1,Form("CurrentSize: %d, BookedUpTo: %d, free: %d",fSeedsPool.GetSize(),fSeedsPool.GetEntriesFast(),fNFreeSeeds));
 973   fNFreeSeeds = 0;
 974   fSeedsPool.Clear(); // seeds don't allocate memory
 975 }
 976
 977
 978 //________________________________________
 979 void AliITSUTrackerGlo::MarkSeedFree(AliITSUSeed *sd)
 980 {
 981   // account that this seed is "deleted"
 982   int id = sd->GetPoolID();
 983   if (id<0) {
 984     AliError(Form("Freeing of seed %p NOT from the pool is requested",sd));
 985     return;
 986   }
 987   //  AliInfo(Form("%d %p",id, seed));
 988   fSeedsPool.RemoveAt(id);
 989   if (fFreeSeedsID.GetSize()<=fNFreeSeeds) fFreeSeedsID.Set( 2*fNFreeSeeds + 100 );
 990   fFreeSeedsID.GetArray()[fNFreeSeeds++] = id;
 991 }
 992
 993 //_________________________________________________________________________
 994 Int_t AliITSUTrackerGlo::CheckCluster(AliITSUSeed* track, Int_t lr, Int_t clID)
 995 {
 996   // Check if the cluster (in tracking frame!) is matching to track.
 997   // The track must be already propagated to sensor tracking frame.
 998   // Returns:  kStopSearchOnSensor if the search on given sensor should be stopped,
 999   //           kClusterMatching    if the cluster is matching
1000   //           kClusterMatching    otherwise
1001   //
1002   const double kTolerX = 5e-4;
1003   //  AliCluster *cl = fITS->GetLayerActive(lr)->GetCluster(clID);
1004   AliCluster *cl = fCurrLayer->GetCluster(clID);
1005   //
1006   Bool_t goodCl = kFALSE;
1007   int currLabel = Abs(fCurrESDtrMClb);
1008   //
1009   if (cl->GetLabel(0)>=0) {
1010     for (int i=0;i<3;i++) if (cl->GetLabel(i)>=0 && cl->GetLabel(i)==currLabel) {goodCl = kTRUE; break;}
1011   }
1012   //
1013   if (TMath::Abs(cl->GetX())>kTolerX) { // if due to the misalingment X is large, propagate track only
1014     if (!track->PropagateParamOnlyTo(track->GetX()+cl->GetX(),GetBz())) {
1015       //
1016 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1017       if (AliDebugLevelClass()>2 && goodCl && !track->ContainsFake()) {
1018         AliDebug(2,Form("Lost good cl on L:%d failed propagation. |ESDtrack#%d (MClb:%d)",lr,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
1019         track->Print("etp");
1020         cl->Print();
1021       }
1022 #endif
1023       return kStopSearchOnSensor; // propagation failed, seedT is intact
1024     }
1025   }
1026   double dy = cl->GetY()-track->GetY();
1027   double dz = cl->GetZ()-track->GetZ();
1028   //
1029   double dy2 = dy*dy;
1030   double tol2 = (track->GetSigmaY2() + AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaY2(lr))*
1031     fCurrTrackCond->GetNSigmaRoadY(lr)*fCurrTrackCond->GetNSigmaRoadY(lr); // RS TOOPTIMIZE
1032   if (dy2>tol2) {                          // the clusters are sorted in Z(col) then in Y(row).
1033     //
1034 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1035     if (AliDebugLevelClass()>2 && goodCl &&  !track->ContainsFake()) {
1036       AliDebug(2,Form("Lost good cl: dy2=%e > tol2=%e |ESDtrack#%d (MClb:%d)",dy2,tol2,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
1037       track->Print("etp");
1038       cl->Print();
1039       PrintSeedClusters(track);
1040     }
1041 #endif
1042     // clusters are sorted in increasing Y and the loop goes from last (highers Y) to 1st.
1043     // if the track has too large y for this cluster (dy<0) it will be so for all other clusters of the sensor
1044     if (dy<0) return kStopSearchOnSensor;  // No chance that other cluster of this sensor will match (all Y's will be even larger)
1045     else      return kClusterNotMatching;   // Other clusters may match
1046   }
1047   double dz2 = dz*dz;
1048   tol2 = (track->GetSigmaZ2() + AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaZ2(lr))*
1049     fCurrTrackCond->GetNSigmaRoadZ(lr)*fCurrTrackCond->GetNSigmaRoadZ(lr); // RS TOOPTIMIZE
1050   if (dz2>tol2) {
1051 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1052     if (AliDebugLevelClass()>2 && goodCl &&  !track->ContainsFake()) {
1053       AliDebug(2,Form("Lost good cl on L:%d : dz2=%e > tol2=%e |ESDtrack#%d (MClb:%d)",lr,dz2,tol2,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
1054       track->Print("etp");
1055       cl->Print();
1056       PrintSeedClusters(track);
1057     }
1058 #endif
1059     return kClusterNotMatching; // Other clusters may match
1060   }
1061   //
1062   // check chi2
1063   Double_t p[2]={cl->GetY(), cl->GetZ()};
1064   Double_t cov[3]={cl->GetSigmaY2(), cl->GetSigmaYZ(), cl->GetSigmaZ2()};
1065   double chi2 = track->GetPredictedChi2(p,cov);
1066   //
1067   if (chi2>fCurrTrackCond->GetMaxTr2ClChi2(lr)) {
1068 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1069     if (AliDebugLevelClass()>2 && goodCl &&  !track->ContainsFake()) {
1070       AliDebug(2,Form("Lost good cl on L:%d : Chi2=%e > Chi2Max=%e |dy: %+.3e dz: %+.3e |ESDtrack#%d (MClb:%d)\n",
1071                       lr,chi2,fCurrTrackCond->GetMaxTr2ClChi2(lr),dy,dz,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
1072       track->Print("etp");
1073       cl->Print("");
1074       PrintSeedClusters(track);
1075     }
1076 #endif
1077     return kClusterNotMatching;
1078   }
1079   //
1080   track = NewSeedFromPool(track);  // input track will be reused, use its clone for updates
1081   if (!track->Update()) {
1082 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1083     if (AliDebugLevelClass()>2 && goodCl &&  !track->ContainsFake()) {
1084       AliDebug(2,Form("Lost good cluster on L:%d : failed to update",lr));
1085       track->Print("etp");
1086       cl->Print("");
1087       PrintSeedClusters(track);
1088     }
1089 #endif
1090     MarkSeedFree(track);
1091     return kClusterNotMatching;
1092   }
1093   track->SetChi2Cl(chi2);
1094   track->SetLrClusterID(lr,clID);
1095   //
1096   if (track->GetChi2GloNrm()>fCurrTrackCond->GetMaxChi2GloNrm(lr)) {
1097 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1098     if (AliDebugLevelClass()>2 && goodCl &&  !track->ContainsFake()) {
1099       AliDebug(2,Form("Lost good cl on L:%d : Chi2Glo=%e > Chi2Max=%e |dy: %+.3e dz: %+.3e |ESDtrack#%d (MClb:%d)\n",
1100                       lr,track->GetChi2GloNrm(),fCurrTrackCond->GetMaxChi2GloNrm(lr),dy,dz,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
1101       track->Print("etp");
1102       cl->Print("");
1103       PrintSeedClusters(track);
1104     }
1105 #endif
1106     MarkSeedFree(track);
1107     return kClusterNotMatching;
1108   }
1109   //  cl->IncreaseClusterUsage(); // do this only for winners
1110   //
1111   track->SetFake(!goodCl);
1112   //
1113 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1114   AliDebug(2,Form("AddCl(%d) Cl%d lr:%d: dY:%+8.4f dZ:%+8.4f (MC: %5d %5d %5d) |Chi2=%f(%c)| ",
1115                goodCl,clID,lr,dy,dz2,cl->GetLabel(0),cl->GetLabel(1),cl->GetLabel(2), chi2, track->IsFake() ? '-':'+'));
1116 #endif
1117   //
1118   AddSeedBranch(track);
1119   //
1120   return kClusterMatching;
1121 }
1122
1123 //_________________________________________________________________________
1124 Bool_t AliITSUTrackerGlo::NeedToKill(AliITSUSeed *seed, Int_t flag)
1125 {
1126   // check if the seed should not be discarded
1127   const UShort_t kMask = 0xffff;
1128   if (flag==kMissingCluster) {
1129     int lastChecked = seed->GetLayerID();
1130     UShort_t patt = seed->GetHitsPattern();
1131     if (lastChecked) patt |= (~(kMask<<lastChecked))&fCurrTrackCond->GetAllowedLayers(); // not all layers were checked, complete unchecked ones by potential hits
1132     Bool_t seedOK = fCurrTrackCond->CheckPattern(patt);
1133     return !seedOK;
1134   }
1135   return kTRUE;
1136 }
1137
1138 //______________________________________________________________________________
1139 Bool_t AliITSUTrackerGlo::PropagateSeed(AliITSUSeed *seed, Double_t xToGo, Double_t mass, Double_t maxStep, Bool_t matCorr)
1140 {
1141   // propagate seed to given x applying material correction if requested
1142   const Double_t kEpsilon = 1e-5;
1143   Double_t xpos     = seed->GetX();
1144   Int_t dir         = (xpos<xToGo) ? 1:-1;
1145   Double_t xyz0[3],xyz1[3];
1146   //
1147   Bool_t updTime = dir>0 && seed->IsStartedTimeIntegral();
1148   if (matCorr || updTime) seed->GetXYZ(xyz1);   //starting global position
1149   while ( (xToGo-xpos)*dir > kEpsilon){
1150     Double_t step = dir*TMath::Min(TMath::Abs(xToGo-xpos), maxStep);
1151     Double_t x    = xpos+step;
1152     Double_t bz=GetBz();   // getting the local Bz
1153     if (!seed->PropagateToX(x,bz)) return kFALSE;
1154     double ds = 0;
1155     if (matCorr || updTime) {
1156       xyz0[0]=xyz1[0]; // global pos at the beginning of step
1157       xyz0[1]=xyz1[1];
1158       xyz0[2]=xyz1[2];
1159       seed->GetXYZ(xyz1);    //  // global pos at the end of step
1160       if (matCorr) {
1161         Double_t xrho,xx0;
1162         ds = GetMaterialBudget(xyz0,xyz1,xx0,xrho);
1163         if (dir>0) xrho = -xrho; // outward should be negative
1164         if (!seed->ApplyMaterialCorrection(xx0,xrho,mass,kFALSE)) {AliInfo("Fail2"); seed->Print("etp"); return kFALSE;}
1165       }
1166        else { // matCorr is not requested but time integral is
1167         double d0 = xyz1[0]-xyz0[0];
1168         double d1 = xyz1[1]-xyz0[1];
1169         double d2 = xyz1[2]-xyz0[2];
1170         ds = TMath::Sqrt(d0*d0+d1*d1+d2*d2);
1171       }
1172     }
1173     if (updTime) seed->AddTimeStep(ds);
1174     xpos = seed->GetX();
1175   }
1176   return kTRUE;
1177 }
1178
1179 //______________________________________________________________________________
1180 Bool_t AliITSUTrackerGlo::PropagateSeed(AliExternalTrackParam *seed, Double_t xToGo, Double_t mass, Double_t maxStep, Bool_t matCorr)
1181 {
1182   // propagate seed to given x applying material correction if requested
1183   const Double_t kEpsilon = 1e-5;
1184   Double_t xpos     = seed->GetX();
1185   Int_t dir         = (xpos<xToGo) ? 1:-1;
1186   Double_t xyz0[3],xyz1[3];
1187   //
1188 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1189   if (AliDebugLevelClass()>1) {
1190     AliDebug(2,Form("Before Propagate to X=%f with M=%.3f MaxStep=%.4f MatCorr=%d",xToGo,mass,maxStep,matCorr));
1191     seed->AliExternalTrackParam::Print();
1192   }
1193 #endif
1194   Bool_t updTime = dir>0 && seed->IsStartedTimeIntegral();
1195   if (matCorr || updTime) seed->GetXYZ(xyz1);   //starting global position
1196   while ( (xToGo-xpos)*dir > kEpsilon){
1197     Double_t step = dir*TMath::Min(TMath::Abs(xToGo-xpos), maxStep);
1198     Double_t x    = xpos+step;
1199     Double_t bz=GetBz();   // getting the local Bz
1200     if (!seed->PropagateTo(x,bz))  return kFALSE;
1201     double ds = 0;
1202     if (matCorr || updTime) {
1203       xyz0[0]=xyz1[0]; // global pos at the beginning of step
1204       xyz0[1]=xyz1[1];
1205       xyz0[2]=xyz1[2];
1206       seed->GetXYZ(xyz1);    //  // global pos at the end of step
1207       //
1208       if (matCorr) {
1209         Double_t xrho,xx0;
1210         ds = GetMaterialBudget(xyz0,xyz1,xx0,xrho);
1211         if (dir>0) xrho = -xrho; // outward should be negative
1212         if (!seed->CorrectForMeanMaterial(xx0,xrho,mass)) return kFALSE;
1213       }
1214       else { // matCorr is not requested but time integral is
1215         double d0 = xyz1[0]-xyz0[0];
1216         double d1 = xyz1[1]-xyz0[1];
1217         double d2 = xyz1[2]-xyz0[2];
1218         ds = TMath::Sqrt(d0*d0+d1*d1+d2*d2);
1219       }
1220     }
1221     if (updTime) seed->AddTimeStep(ds);
1222     //
1223     xpos = seed->GetX();
1224   }
1225 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1226   if (AliDebugLevelClass()>1) {
1227     AliDebug(2,Form("After Propagate to X=%f",xToGo));
1228     seed->AliExternalTrackParam::Print();
1229   }
1230 #endif
1231   return kTRUE;
1232 }
1233
1234 //______________________________________________________________________________
1235 Bool_t AliITSUTrackerGlo::FinalizeHypothesis(AliITSUTrackHyp* hyp)
1236 {
1237   // finalize single TPC track hypothesis
1238   if (!hyp || hyp->GetESDTrack()->IsOn(AliESDtrack::kITSin)) return kFALSE;
1239   AliITSUSeed* winner = 0;
1240   fCurrHyp = hyp;
1241   fCurrMass = hyp->GetMass();
1242   if (!(winner=hyp->DefineWinner(fCurrTrackCond->GetActiveLrInner()))) return kFALSE;
1243   CookMCLabel(hyp);
1244   //
1245 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_  // fill tuning histos
1246   TObjArray* dest = hyp->GetLabel()>=0 ? fCHistoArrCorr : fCHistoArrFake;
1247   if (dest) {
1248     AliITSUSeed* sd = winner;
1249     double htrPt = hyp->Pt();
1250     do {
1251       int clID,lrID;
1252       if ( (clID=sd->GetLrCluster(lrID))<0 ) continue;
1253       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHChi2Nrm     ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetChi2GloNrm());
1254       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHBestInBranch,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetOrdBranch());
1255       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHBestInCand  ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetOrdCand());
1256       //
1257       if (dest==fCHistoArrFake && !sd->IsFake()) continue; // for the fake seeds fill only fake clusters part
1258       //
1259       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHResY        ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetResidY());
1260       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHResZ        ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetResidZ());
1261       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHResYP       ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetPullY());
1262       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHResZP       ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetPullZ());
1263       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHChi2Cl      ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetChi2Cl());
1264       //
1265     } while((sd=(AliITSUSeed*)sd->GetParent()));
1266     //
1267     ((TH2*)dest->At( GetHistoID(-1,kHChiMatch,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,winner->GetChi2ITSTPC());
1268     ((TH2*)dest->At( GetHistoID(-1,kHChiITSSA,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,winner->GetChi2ITSSA());
1269   }
1270   //
1271 #endif
1272   //
1273   CheckClusterSharingConflicts(hyp);
1274   return hyp->GetWinner();  // winner might change of disappear after resolving conflicts
1275   //
1276 }
1277
1278 //______________________________________________________________________________
1279 void AliITSUTrackerGlo::FinalizeHypotheses()
1280 {
1281   // select winner for each hypothesis, remove cl. sharing conflicts
1282   AliCodeTimerAuto("",0);
1283   //
1284   int* esdTrackIndex = fESDIndex.GetArray();
1285   for (int ih=0;ih<fNTracksESD;ih++) FinalizeHypothesis(GetTrackHyp(esdTrackIndex[ih])); // finlize in decreasing pt order
1286   //
1287   for (int ih=fNTracksESD;ih--;) UpdateESDTrack(GetTrackHyp(esdTrackIndex[ih]),AliESDtrack::kITSin);
1288   //
1289 }
1290
1291 //______________________________________________________________________________
1292 void AliITSUTrackerGlo::CheckClusterSharingConflicts(AliITSUTrackHyp* hyp)
1293 {
1294   // remove eventual cluster sharing conflicts
1295   AliITSUSeed* winner = 0;
1296   if (!(winner=hyp->GetWinner())) return;
1297   UShort_t idH = (UShort_t)hyp->GetUniqueID()+1;
1298   int lrID,clID;
1299   int inLr = fCurrTrackCond->GetActiveLrInner();
1300   AliITSUSeed* winSD=winner;
1301   do {
1302     if ( (clID=winSD->GetLrCluster(lrID))<0 ) continue;
1303     AliITSUClusterPix* cl = (AliITSUClusterPix*)fITS->GetLayerActive(lrID)->GetCluster(clID);
1304     Int_t refID = cl->GetRecoInfo();                // was it already referred by some track (with refID-1 if >0)
1305     if (!refID) {cl->SetRecoInfo(idH); continue;}   // if not, refer from track to cluster
1306     if (refID==idH) continue;                          // ignore reference to itself
1307     // the cluster is already used by other track, need to resolve the conflict
1308     AliITSUTrackHyp* hypC = GetTrackHyp(refID-1);   // competitor
1309     //    printf("Ref to %d (%p) from %d Cl %d %d\n",refID-1,hypC, idH-1,clID,lrID);
1310     AliITSUSeed* winnerC = hypC->GetWinner();
1311     if (!winnerC) {
1312       printf("Missing winner, ERROR\n");
1313       continue;
1314     }
1315     //
1316 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1317     if (AliDebugLevelClass()>1) { //------------------------ DEBUG -------------------
1318       AliInfo(Form("Shared cl#%4d on Lr:%d: Hyp%3d/Q:%6.3f vs Hyp%3d/Q:%6.3f",
1319                    clID,lrID,idH-1,winner->GetQualityVar(),refID-1,winnerC->GetQualityVar()));
1320       // dump winner of hyp
1321       printf("#%4d Pt:%.3f Chi:%6.3f/%6.3f/%6.3f Ncl:%d MCits%+5d MCtpc:%+5d |",
1322              idH-1,winner->Pt(),winner->GetChi2GloNrm(),winner->GetChi2ITSTPC(),winner->GetChi2ITSSA(),
1323              winner->GetNLayersHit(),hyp->GetITSLabel(),hyp->GetESDTrack()->GetTPCLabel());
1324       int prevL=-1;
1325       AliITSUSeed* sd = winner;
1326       do {
1327         int lrs;
1328         int clIDt = sd->GetLrCluster(lrs);
1329         if (clIDt<0) continue;
1330         while( lrs>++prevL ) printf("%4s        ","----");
1331         printf("%4d (%5.1f)",clIDt,sd->GetChi2Cl());
1332       } while ((sd=(AliITSUSeed*)sd->GetParent()));
1333       printf("|\n");
1334       // dump winner of hypC
1335       printf("#%4d Pt:%.3f Chi:%6.3f/%6.3f/%6.3f Ncl:%d MCits%+5d MCtpc:%+5d |",
1336              refID-1,winnerC->Pt(),winnerC->GetChi2GloNrm(),winnerC->GetChi2ITSTPC(),winnerC->GetChi2ITSSA(),
1337              winnerC->GetNLayersHit(),hypC->GetITSLabel(),hypC->GetESDTrack()->GetTPCLabel());
1338       prevL=-1;
1339       sd = winnerC;
1340       do {
1341         int lrs;
1342         int clIDt = sd->GetLrCluster(lrs);
1343         if (clIDt<0) continue;
1344         while( lrs>++prevL ) printf("%4s        ","----");
1345         printf("%4d (%5.1f)",clIDt,sd->GetChi2Cl());
1346       } while ((sd=(AliITSUSeed*)sd->GetParent()));
1347       printf("|\n");
1348     }  //-------------------------------------------------- DEBUG -------------------
1349 #endif
1350     //
1351     if (winner->GetQualityVar()<winnerC->GetQualityVar()) { // current tracks is better then competitor track
1352       FlagSeedClusters(winnerC,kFALSE,refID); // unflag cluster usage by loser
1353       cl->SetRecoInfo(idH);
1354       //
1355       //if ( hypC->GetLabel()>=0) AliInfo(Form("KILLING CORRECT: %d",refID-1));
1356       winnerC->Kill();
1357       if (hypC->DefineWinner(inLr)) {             // find new winner instead of suppressed candidate
1358         CookMCLabel(hypC);
1359         CheckClusterSharingConflicts(hypC);   // and check its sharing conflicts again
1360         if (winner->IsKilled()) break;        // the current winner might have been killed during check of new winner of hypC!
1361       }
1362     }
1363     else { // competitor hypC is better than the hyp
1364       FlagSeedClusters(winner,kFALSE,idH); // unflag cluster usage by loser
1365       winner->Kill();
1366       //if ( hyp->GetLabel()>=0) AliInfo(Form("KILLING CORRECT: %d",idH-1));
1367       if (hyp->DefineWinner(inLr)) {
1368         CookMCLabel(hyp);
1369         CheckClusterSharingConflicts(hyp);
1370       }
1371       break;
1372     }
1373     //
1374   } while ((winSD=(AliITSUSeed*)winSD->GetParent()));
1375   //
1376   return;
1377 }
1378
1379 //______________________________________________________________________________
1380 void AliITSUTrackerGlo::UpdateESDTrack(AliITSUTrackHyp* hyp,Int_t flag)
1381 {
1382   // update ESD track with current best hypothesis
1383   if (!hyp) return;
1384   AliESDtrack* esdTr = hyp->GetESDTrack();
1385   if (!esdTr || esdTr->IsOn(flag)) return;
1386   AliITSUSeed* win = hyp->GetWinner();
1387   if (!win || win->IsKilled()) return;
1388   double chiSav;
1389   //
1390   switch (flag) {
1391   case AliESDtrack::kITSin:
1392     esdTr->UpdateTrackParams(hyp,flag); // update kinematics
1393     fCountITSin++;
1394     // set fakes cluster info
1395     {
1396       UShort_t clfake = 0;
1397       Int_t    clSplit = 0;
1398       AliITSUSeed* sd = win;
1399       int ip=0;
1400       do {
1401         int lr, clID = sd->GetLrCluster(lr);
1402         if (sd->IsFake()) clfake |= 0x1<<lr;
1403         if (clID>=0) {
1404           esdTr->SetITSModuleIndex(ip++, sd->GetLrClusterID());
1405           AliITSUClusterPix *cl = (AliITSUClusterPix*)fITS->GetLayerActive(lr)->GetCluster(clID);
1406 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
1407           if (cl->IsSplit()) clSplit |= 0x1<<lr;
1408 #endif
1409         }
1410       } while ((sd=(AliITSUSeed*)sd->GetParent()));
1411       //
1412       // RS: Temporary set special flag for tracks from the afterburner
1413       if (fCurrPassID>0) clfake |= 0x1<<7;
1414       //
1415       esdTr->SetITSSharedMap(clfake);
1416       esdTr->SetITSModuleIndex(10,clSplit);
1417     }
1418     // TEMPORARY: store iteration id
1419     esdTr->SetITSModuleIndex(11,fCurrPassID);
1420     break;
1421     //
1422   case AliESDtrack::kITSout:
1423     // here the stored chi2 will correspond to backward ITS-SA fit
1424     esdTr->UpdateTrackParams(hyp,flag); // update kinematics
1425     fCountITSout++;
1426     // TODO: avoid setting friend
1427     break;
1428     //
1429   case AliESDtrack::kITSrefit:
1430
1431     // at the moment fill as a chi2 the TPC-ITS matching chi2
1432     chiSav = hyp->GetChi2();
1433     hyp->SetChi2(win->GetChi2ITSTPC());
1434     esdTr->UpdateTrackParams(hyp,flag); // update kinematics
1435     hyp->SetChi2(chiSav);
1436     fCountITSrefit++;
1437     // TODO: avoid setting cluster info
1438     break;
1439   default:
1440     AliFatal(Form("Unknown flag %d",flag));
1441   }
1442   //
1443   esdTr->SetITSLabel(hyp->GetITSLabel());
1444   // transfer chip indices
1445   // TODO
1446 }
1447
1448 //______________________________________________________________________________
1449 Double_t AliITSUTrackerGlo::RefitTrack(AliITSUTrackHyp* trc, Double_t rDest, Int_t &nclFit, Int_t stopCond)
1450 {
1451   // refit track till radius rDest. The cluster,mass info is taken from fCurrHyp (and its winner seed)
1452   // if stopCond<0 : propagate till last cluster then stop
1453   // if stopCond==0: propagate till last cluster then try to go till limiting rDest, don't mind if fail
1454   // if stopCond>0 : rDest must be reached
1455   //
1456   double rCurr = Sqrt(trc->GetX()*trc->GetX() + trc->GetY()*trc->GetY());
1457   int dir,lrStart,lrStop;
1458   //
1459   dir = rCurr<rDest ? 1 : -1;
1460   lrStart = fITS->FindFirstLayerID(rCurr,dir);
1461   lrStop  = fITS->FindLastLayerID(rDest,dir); // lr id before which we have to stop
1462   //
1463 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1464   if (AliDebugLevelClass()>2) {
1465     printf("Refit %d: Lr:%d (%f) -> Lr:%d (%f)\n",dir,lrStart,rCurr, lrStop,rDest);
1466     printf("Before refit: "); trc->Print();
1467   }
1468 #endif
1469   if (lrStop<0 || lrStart<0) AliFatal(Form("Failed to find start(%d) or last(%d) layers. Track from %.3f to %.3f",lrStart,lrStop,rCurr,rDest));
1470   //
1471   Int_t clInfo[2*AliITSUAux::kMaxLayers];
1472   Int_t nCl = fCurrHyp->FetchClusterInfo(clInfo);
1473   fCurrMass = fCurrHyp->GetMass();
1474   AliITSUTrackHyp tmpTr(*(AliKalmanTrack*)trc);
1475   double chi2 = 0;
1476   int iclLr[2],nclLr;
1477   nclFit = 0;
1478   //
1479   int lrStop1 = lrStop+dir;
1480   for (int ilr=lrStart;ilr!=lrStop1;ilr+=dir) {
1481     AliITSURecoLayer* lr = fITS->GetLayer(ilr);
1482     if ( dir*(rCurr-lr->GetR(dir))>0) continue; // this layer is already passed
1483     int ilrA2,ilrA = lr->GetActiveID();
1484     // passive layer or active w/o hits will be traversed on the way to next cluster
1485     if (!lr->IsActive() || clInfo[ilrA2=(ilrA<<1)]<0) continue;
1486     //
1487     // select the order in which possible 2 clusters (in case of the overlap) will be traversed and fitted
1488     nclLr=0;
1489     if (dir>0) { // clusters are stored in increasing radius order
1490       iclLr[nclLr++]=clInfo[ilrA2++];
1491       if (clInfo[ilrA2]>=0) iclLr[nclLr++]=clInfo[ilrA2];
1492     }
1493     else {
1494       if ( clInfo[ilrA2+1]>=0 ) iclLr[nclLr++]=clInfo[ilrA2+1];
1495       iclLr[nclLr++]=clInfo[ilrA2];
1496     }
1497     //
1498     Bool_t transportedToLayer = kFALSE;
1499     for (int icl=0;icl<nclLr;icl++) {
1500       AliITSUClusterPix* clus =  (AliITSUClusterPix*)lr->GetCluster(iclLr[icl]);
1501       AliITSURecoSens* sens = lr->GetSensorFromID(clus->GetVolumeId());
1502       if (!tmpTr.Rotate(sens->GetPhiTF())) {
1503 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1504         AliESDtrack* trESD = fCurrHyp->GetESDTrack();
1505         AliDebug(2,Form("Failed on rotate to %f | ESDtrack#%d (MClb:%d)",sens->GetPhiTF(),trESD->GetID(),trESD->GetTPCLabel()));
1506 #endif
1507         return -1;
1508       }
1509       //
1510       double xClus = sens->GetXTF()+clus->GetX();
1511       if (!transportedToLayer) {
1512         if (ilr!=lrStart && !TransportToLayerX(&tmpTr,lrStart,ilr,xClus)) {
1513 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1514           AliESDtrack* trESD = fCurrHyp->GetESDTrack();
1515           AliDebug(2,Form("Failed to transport %d -> %d | ESDtrack#%d (MClb:%d)\n",lrStart,ilr,trESD->GetID(),trESD->GetTPCLabel()));
1516 #endif
1517           return -1; // go to the entrance to the layer
1518         }
1519         lrStart = ilr;
1520         transportedToLayer = kTRUE;
1521       }
1522       //
1523 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1524       if (AliDebugLevelClass()>1) {
1525         AliDebug(2,Form("Propagate to cl:%d on lr %d Need to go %.4f -> %.4f",icl,ilrA,tmpTr.GetX(),xClus));
1526       }
1527 #endif
1528       //
1529       if (!PropagateSeed(&tmpTr,xClus,fCurrMass)) {
1530 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1531         AliESDtrack* trESD = fCurrHyp->GetESDTrack();
1532         AliDebug(2,Form("Failed on propagate to %f (dir=%d) | ESDtrack#%d (MClb:%d)",xClus,dir,trESD->GetID(),trESD->GetTPCLabel()));
1533 #endif
1534         return -1;
1535       }
1536       //
1537       Double_t p[2]={clus->GetY(), clus->GetZ()};
1538       Double_t cov[3]={clus->GetSigmaY2(), clus->GetSigmaYZ(), clus->GetSigmaZ2()};
1539       double chi2cl = tmpTr.GetPredictedChi2(p,cov);
1540       chi2 += chi2cl;
1541       //
1542 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
1543       TObjArray* dest = trc->GetLabel()>=0 ? fCHistoArrCorr : fCHistoArrFake;
1544       if (dest && fTrackPhaseID>kClus2Tracks) {
1545         //
1546         double htrPt = tmpTr.Pt();
1547         double dy = p[0]-tmpTr.GetY();
1548         double dz = p[1]-tmpTr.GetZ();
1549         ((TH2*)dest->At( GetHistoID(ilrA,kHResY,0,fTrackPhaseID) ))->Fill(htrPt,dy);
1550         ((TH2*)dest->At( GetHistoID(ilrA,kHResZ,0,fTrackPhaseID) ))->Fill(htrPt,dz);
1551         double errY = tmpTr.GetSigmaY2();
1552         double errZ = tmpTr.GetSigmaZ2();
1553         if (errY>0) ((TH2*)dest->At( GetHistoID(ilrA,kHResYP,0,fTrackPhaseID) ))->Fill(htrPt,dy/Sqrt(errY));
1554         if (errZ>0) ((TH2*)dest->At( GetHistoID(ilrA,kHResZP,0,fTrackPhaseID) ))->Fill(htrPt,dz/Sqrt(errZ));
1555         ((TH2*)dest->At( GetHistoID(ilrA,kHChi2Cl,0,fTrackPhaseID) ))->Fill(htrPt,chi2cl);
1556       }
1557 #endif
1558       //
1559       if ( !tmpTr.Update(p,cov) ) {
1560 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1561         AliESDtrack* trESD = fCurrHyp->GetESDTrack();
1562         AliDebug(2,Form("Failed on Update | ESDtrack#%d (MClb:%d)",trESD->GetID(),trESD->GetTPCLabel()));
1563 #endif
1564         return -1;
1565       }
1566 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1567       if (AliDebugLevelClass()>1) {
1568         printf("AfterRefit: "); tmpTr.Print();
1569       }
1570 #endif
1571       if (++nclFit==nCl && stopCond<0) {
1572         *trc = (AliKalmanTrack&)tmpTr;
1573         return chi2; // it was requested to not propagate after last update
1574       }
1575     }
1576     //
1577   }
1578   // All clusters were succesfully fitted. Even if the track does not reach rDest, this is enough to validate it.
1579   // Still, try to go as close as possible to rDest.
1580   //
1581   if (lrStart!=lrStop) {
1582     if (!TransportToLayer(&tmpTr,lrStart,lrStop)) {
1583 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1584       AliDebug(1,Form("Failed on TransportToLayer %d->%d | ESDtrack#%d (MClb:%d), X=%f",lrStart,lrStop,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb,tmpTr.GetX()));
1585 #endif
1586       return (stopCond>0) ? -chi2 : chi2; // rDest was obligatory
1587     }
1588     if (!GoToExitFromLayer(&tmpTr,fITS->GetLayer(lrStop),dir)) {
1589 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1590       AliDebug(1,Form("Failed on GoToExitFromLayer %d | ESDtrack#%d (MClb:%d), X=%f",lrStop,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb,tmpTr.GetX()));
1591 #endif
1592       return (stopCond>0) ? -chi2 : chi2; // rDest was obligatory
1593     }
1594   }
1595   // go to the destination radius. Note that here we don't select direction to avoid precision problems
1596   if (!tmpTr.GetXatLabR(rDest,rDest,GetBz(),0) || !PropagateSeed(&tmpTr,rDest,fCurrMass, 100, kFALSE)) {
1597     return (stopCond>0) ? -chi2 : chi2; // rDest was obligatory
1598   }
1599   *trc = (AliKalmanTrack&)tmpTr;
1600 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1601   if (AliDebugLevelClass()>2) {
1602     printf("After refit (now at lr %d): ",lrStop); trc->Print();
1603   }
1604 #endif
1605   return chi2;
1606 }
1607
1608 //__________________________________________________________________
1609 void AliITSUTrackerGlo::CookMCLabel(AliITSUTrackHyp* hyp)
1610 {
1611   // build MC label
1612   //
1613   const int kMaxLbPerCl = 3;
1614   int lbID[kMaxLayers*6],lbStat[kMaxLayers*6];
1615   Int_t lr,nLab=0,nCl=0;
1616   AliITSUSeed *seed = hyp->GetWinner();
1617   while(seed) {
1618     int clID = seed->GetLrCluster(lr);
1619     if (clID>=0) {
1620       AliCluster *cl = fITS->GetLayerActive(lr)->GetCluster(clID);
1621       nCl++;
1622       for (int imc=0;imc<kMaxLbPerCl;imc++) { // labels within single cluster
1623         int trLb = cl->GetLabel(imc);
1624         if (trLb<0) break;
1625         // search this mc track in already accounted ones
1626         int iLab;
1627         for (iLab=0;iLab<nLab;iLab++) if (lbID[iLab]==trLb) break;
1628         if (iLab<nLab) lbStat[iLab]++;
1629         else {
1630           lbID[nLab] = trLb;
1631           lbStat[nLab++] = 1;
1632         }
1633       } // loop over given cluster's labels
1634     }
1635     seed = (AliITSUSeed*)seed->GetParent();
1636   } // loop over clusters
1637   //
1638   AliESDtrack* esdTr = hyp->GetESDTrack();
1639   int tpcLab = esdTr ? Abs(esdTr->GetTPCLabel()) : -kDummyLabel;
1640   if (nCl && nLab) {
1641     int maxLab=0,nTPCok=0;
1642     for (int ilb=nLab;ilb--;) {
1643       int st = lbStat[ilb];
1644       if (lbStat[maxLab]<st) maxLab=ilb;
1645       if (tpcLab==lbID[ilb]) nTPCok += st;
1646     }
1647     hyp->SetFakeRatio(1.-float(nTPCok)/nCl);
1648     hyp->SetLabel( nTPCok==nCl ? tpcLab : -tpcLab);
1649     hyp->SetITSLabel( lbStat[maxLab]==nCl ? lbID[maxLab] : -lbID[maxLab]); // winner label
1650     return;
1651   }
1652   //
1653   hyp->SetFakeRatio(-1.);
1654   hyp->SetLabel( -tpcLab );
1655   hyp->SetITSLabel( kDummyLabel );
1656 }
1657
1658 //__________________________________________________________________
1659 Bool_t AliITSUTrackerGlo::AddSeedBranch(AliITSUSeed* seed)
1660 {
1661   // add new prolongation branch for the seed to temporary array. The seeds are sorted according to Compare f-n
1662   if (fNCandidatesAdded+fNBranchesAdded>=fLayerMaxCandidates ) {
1663     AliInfo(Form("Number of candidates at layer %d for current seed reached %d, increasing buffer",fCurrActLrID,fLayerMaxCandidates));
1664     fLayerMaxCandidates = 2*(fLayerMaxCandidates+1);
1665     AliITSUSeed** tmpArr = fLayerCandidates;
1666     fLayerCandidates = new AliITSUSeed*[fLayerMaxCandidates];
1667     memcpy(fLayerCandidates,tmpArr,(fNCandidatesAdded+fNBranchesAdded)*sizeof(AliITSUSeed*));
1668     delete tmpArr; // delete only array, not objects
1669   }
1670   AliITSUSeed** branches = &fLayerCandidates[fNCandidatesAdded]; // note: fNCandidatesAdded is incremented after adding all branches of current seed
1671   int slot=fNBranchesAdded++;
1672   for (int slotF=slot;slotF--;) { // slotF is always slot-1
1673     AliITSUSeed* si = branches[slotF];
1674     if (si->Compare(seed)<0) break; // found the last seed with better quality
1675     // otherwise, shift the worse seed to the next slot
1676     branches[slot] = si;
1677     slot = slotF; // slot should be slotF+1
1678   }
1679   // if needed, move worse seeds
1680   branches[slot] = seed;
1681   return kTRUE;
1682   //
1683 }
1684
1685 //__________________________________________________________________
1686 void AliITSUTrackerGlo::ValidateAllowedBranches(Int_t acceptMax)
1687 {
1688   // keep allowed number of branches for current seed and disable extras
1689   AliCodeTimerAuto("",0);
1690   int nb = Min(fNBranchesAdded,acceptMax);
1691   //  if (nb<fNBranchesAdded) printf("ValidateAllowedBranches: %d of %d (%d) on lr %d\n",nb,fNBranchesAdded,fNCandidatesAdded,ilr);
1692   // disable unused branches
1693   AliITSUSeed** branches = &fLayerCandidates[fNCandidatesAdded];
1694   //
1695 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
1696   for (int ib=0;ib<fNBranchesAdded;ib++) branches[ib]->SetOrdBranch(ib);
1697 #endif
1698   //
1699   for (int ib=nb;ib<fNBranchesAdded;ib++) MarkSeedFree(branches[ib]);
1700   fNCandidatesAdded += nb; // update total candidates counter
1701   fNBranchesAdded = 0; // reset branches counter
1702   //
1703 }
1704
1705 //__________________________________________________________________
1706 void AliITSUTrackerGlo::ValidateAllowedCandidates(Int_t ilr, Int_t acceptMax)
1707 {
1708   // transfer allowed number of branches to hypothesis container
1709   //
1710   AliCodeTimerAuto("",0);
1711   // sort candidates in increasing order of chi2
1712   static int lastSize = 0;
1713   static int *index = 0;
1714   static float *chi2 = 0;
1715   if (fLayerMaxCandidates>lastSize) {
1716     lastSize = fLayerMaxCandidates;
1717     delete[] index;
1718     delete[] chi2;
1719     index = new int[lastSize];
1720     chi2  = new float[lastSize];
1721   }
1722   for (int i=fNCandidatesAdded;i--;) chi2[i] = fLayerCandidates[i]->GetChi2GloNrm();
1723   Sort(fNCandidatesAdded,chi2,index,kFALSE);
1724   //
1725   int nacc=0,nb=0;
1726   if (ilr>fCurrTrackCond->GetActiveLrInner()) { // just take 1st acceptMax candidates
1727     nb = Min(fNCandidatesAdded,acceptMax);
1728     for (int ib=0;ib<nb;ib++) AddProlongationHypothesis(fLayerCandidates[index[ib]],ilr);
1729   }
1730   else { // for innermost layer test ITS SA backward chi2 and matching to TPC
1731     AliITSUSeed* wn0 = fCurrHyp->GetWinner(); // in principle, should be NULL
1732     for (nb=0;nb<fNCandidatesAdded;nb++) {
1733       AliITSUSeed* sd = fLayerCandidates[index[nb]];
1734       fCurrHyp->SetWinner(sd);
1735       if (!CheckBackwardMatching(sd)) MarkSeedFree(sd); // discard bad backward tracks
1736       else {
1737         AddProlongationHypothesis(sd,ilr);
1738         if (++nacc==acceptMax) {nb++; break;} // the rest will be discarded
1739       }
1740     }
1741     fCurrHyp->SetWinner(wn0); // restore original winner (NULL?)
1742   }
1743   // disable unused candidates
1744   for (int ib=nb;ib<fNCandidatesAdded;ib++) MarkSeedFree(fLayerCandidates[index[ib]]);
1745   fNCandidatesAdded = 0; // reset candidates counter
1746   //
1747 }
1748
1749 //__________________________________________________________________
1750 Bool_t AliITSUTrackerGlo::CheckBackwardMatching(AliITSUSeed* seed)
1751 {
1752   // check seed backward propagation chi2 and matching to TPC
1753   double bz0 = GetBz();
1754   double rDest = fITS->GetRITSTPCRef(); // reference radius for comparison
1755   AliITSUTrackHyp trback;
1756   trback.AliExternalTrackParam::operator=(*seed);
1757   trback.ResetCovariance(10000);
1758   int nclFit = 0;
1759   double chi2sa = RefitTrack(&trback,rDest,nclFit,1);
1760   if (chi2sa<0) return kFALSE;
1761   int ndf = nclFit*2-5;
1762   if (ndf>0) chi2sa /= ndf;
1763   if (chi2sa>fCurrTrackCond->GetMaxITSSAChi2(nclFit)) return kFALSE;
1764   //
1765   // relate to TPC track at outer layer
1766   AliExternalTrackParam* tpcSeed = fCurrHyp->GetTPCSeed();
1767   if (!trback.Rotate(tpcSeed->GetAlpha()) || !trback.PropagateParamOnlyTo(tpcSeed->GetX(),bz0)) {
1768 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1769     if (AliDebugLevelClass()>+1 && !seed->ContainsFake()) {
1770       AliInfo(Form("Failed to propagate seed to TPC track @ X:%.3f Alpha:%.3f",tpcSeed->GetX(),tpcSeed->GetAlpha()));
1771       seed->Print("etp");
1772       trback.Print();
1773     }
1774 #endif
1775     return kFALSE;
1776   }
1777   double chi2Match = trback.GetPredictedChi2(tpcSeed)/5;
1778   if (chi2Match>fCurrTrackCond->GetMaxITSTPCMatchChi2()) return kFALSE;
1779   //
1780   seed->SetChi2ITSSA(chi2sa);
1781   seed->SetChi2ITSTPC(chi2Match);
1782   return kTRUE;
1783 }
1784
1785 //__________________________________________________________________
1786 void AliITSUTrackerGlo::SaveReducedHypothesesTree(AliITSUTrackHyp* dest)
1787 {
1788   // remove those hypothesis seeds which dont lead to candidates at final layer
1789   //
1790   // 1st, flag the seeds to save
1791   int lr0 = fCurrTrackCond->GetActiveLrInner();
1792   for (int isd=0;isd<fCurrHyp->GetNSeeds(lr0);isd++) {
1793     AliITSUSeed* seed = fCurrHyp->RemoveSeed(lr0,isd);
1794     if (!seed) continue;
1795     seed->FlagTree(AliITSUSeed::kSave);
1796     dest->AddSeed(seed,lr0);
1797   }
1798   for (int ilr=0;ilr<fNLrActive;ilr++) {
1799     int nsd = fCurrHyp->GetNSeeds(ilr);
1800     for (int isd=0;isd<nsd;isd++) {
1801       AliITSUSeed* seed = fCurrHyp->RemoveSeed(ilr,isd);
1802       if (!seed) continue; // already discarded or saved
1803       if (seed->IsSaved()) dest->AddSeed(seed,ilr);
1804       else MarkSeedFree(seed);
1805     }
1806   }
1807   //
1808   //  AliInfo(Form("SeedsPool: %d, BookedUpTo: %d, free: %d",fSeedsPool.GetSize(),fSeedsPool.GetEntriesFast(),fNFreeSeeds));
1809 }
1810
1811 //__________________________________________________________________
1812 void AliITSUTrackerGlo::CleanHypothesis(AliITSUTrackHyp* hyp)
1813 {
1814   // clean hypothesis
1815   hyp->SetWinner(0);
1816   for (int ilr=0;ilr<fNLrActive;ilr++) {
1817     int nsd = hyp->GetNSeeds(ilr);
1818     for (int isd=0;isd<nsd;isd++) {
1819       AliITSUSeed* seed = hyp->RemoveSeed(ilr,isd);
1820       if (!seed) continue; // already discarded or saved
1821       MarkSeedFree(seed);
1822     }
1823   }
1824 }
1825
1826 //__________________________________________________________________
1827 void AliITSUTrackerGlo::FlagSplitClusters()
1828 {
1829   // set special bit on split clusters using MC info
1830   for (int ilr=fNLrActive;ilr--;) {
1831     int nsplit=0;
1832     AliITSURecoLayer* lr = fITS->GetLayerActive(ilr);
1833     for (int isn=lr->GetNSensors();isn--;) {
1834       AliITSURecoSens* sens = lr->GetSensor(isn);
1835       int nCl = sens->GetNClusters();
1836       if (!nCl) continue;
1837       int cl0 = sens->GetFirstClusterId();
1838       for (int icl=nCl;icl--;) {
1839         AliITSUClusterPix *cl = (AliITSUClusterPix*)lr->GetCluster(cl0+icl);
1840         for (int icl1=icl;icl1--;) {
1841           AliITSUClusterPix *cl1 = (AliITSUClusterPix*)lr->GetCluster(cl0+icl1);
1842           if (cl->HasCommonTrack(cl1)) {
1843             if (!cl->IsSplit())  nsplit++;
1844             if (!cl1->IsSplit()) nsplit++;
1845             cl->SetSplit();
1846             cl1->SetSplit();
1847           }
1848         }
1849       }
1850     }
1851     AliInfo(Form("%4d out of %4d clusters are split",nsplit,lr->GetNClusters()));
1852   }
1853   //
1854 }
1855
1856 //__________________________________________________________________
1857 Bool_t AliITSUTrackerGlo::ContainsSplitCluster(const AliITSUSeed* seed, Int_t maxSize)
1858 {
1859   // check if the seed contains split cluster with size < maxSize
1860   int lrID,clID;
1861   if ( (clID=seed->GetLrCluster(lrID))>=0 ) {
1862     AliITSUClusterPix* cl = (AliITSUClusterPix*)fITS->GetLayerActive(lrID)->GetCluster(clID);
1863     if (cl->IsSplit() && cl->GetNPix()<maxSize ) return kTRUE;
1864   }
1865   return seed->GetParent() ? ContainsSplitCluster((AliITSUSeed*)seed->GetParent(),maxSize) : kFALSE;
1866   //
1867 }
1868
1869 //__________________________________________________________________
1870 void AliITSUTrackerGlo::PrintSeedClusters(const AliITSUSeed* seed, Option_t* option)
1871 {
1872   // print seeds clusters
1873   int lrID,clID;
1874   if ( (clID=seed->GetLrCluster(lrID))>=0 ) {
1875     AliITSUClusterPix* cl = (AliITSUClusterPix*)fITS->GetLayerActive(lrID)->GetCluster(clID);
1876     cl->Print(option);
1877   }
1878   if (seed->GetParent()) PrintSeedClusters((AliITSUSeed*)seed->GetParent(), option);
1879   //
1880 }
1881
1882 //__________________________________________________________________
1883 void AliITSUTrackerGlo::FlagSeedClusters(const AliITSUSeed* seed, Bool_t flg, UShort_t ref)
1884 {
1885   // mark used clusters
1886   int lrID,clID;
1887   while (seed) {
1888     if ( (clID=seed->GetLrCluster(lrID))>=0 ) {
1889       AliITSUClusterPix* cl = (AliITSUClusterPix*)fITS->GetLayerActive(lrID)->GetCluster(clID);
1890       if (ref) { // do we need to set or delete cluster->track ref?
1891         if (flg) {
1892           if (!cl->GetRecoInfo()) cl->SetRecoInfo(ref);  // set ref only if cluster already does not refer to other track, inc.counter
1893         }
1894         else {
1895           if (cl->GetRecoInfo()==ref) cl->SetRecoInfo(0); // unset reference only if it refers to ref, decrease counter
1896         }
1897       }
1898     }
1899     seed = (AliITSUSeed*)seed->GetParent();
1900   }
1901   //
1902 }
1903
1904 //__________________________________________________________________
1905 void AliITSUTrackerGlo::CheckClusterUsage()
1906 {
1907   // check cluster usage info
1908   printf("ClusterUsage at pass %d\n",fCurrPassID);
1909   for (int ilr=0;ilr<fNLrActive;ilr++) {
1910     AliITSURecoLayer* lr = fITS->GetLayerActive(ilr);
1911     int ncl = lr->GetNClusters();
1912     int nclUsed = 0;
1913     int nclUs0CntShr1 = 0;
1914     int nclUs1Cnt0 = 0;
1915     int nclUs1Shr1 = 0;
1916     int nclUseL = 0;
1917     for (int icl=0;icl<ncl;icl++) {
1918       AliITSUClusterPix *cl = (AliITSUClusterPix*)lr->GetCluster(icl);
1919       int usc = cl->GetClUsage();
1920       if (usc<1) {
1921         if (cl->IsClusterUsed() || cl->IsClusterShared()) {
1922           nclUs0CntShr1++;
1923           printf("Lr%d Cl%4d: UseCnt=0 but UseFlg=%d UseShr=%d\n",ilr,icl,cl->IsClusterUsed(),cl->IsClusterShared());
1924         }
1925         continue;
1926       }
1927       nclUsed++;
1928       if (!cl->IsClusterUsed()) {
1929         nclUs1Cnt0++;
1930         printf("Lr%d Cl%4d: UseCnt=%d but UseFlg=%d UseShr=%d\n",ilr,icl,usc, cl->IsClusterUsed(),cl->IsClusterShared());
1931       }
1932       if (cl->IsClusterShared()) {
1933         nclUs1Shr1++;
1934         printf("Lr%d Cl%4d: UseCnt=%d but UseFlg=%d UseShr=%d\n",ilr,icl,usc, cl->IsClusterUsed(),cl->IsClusterShared());
1935       }
1936       if (usc>1) {
1937         nclUseL++;
1938         printf("Lr%d Cl%4d: UseCnt=%d!! but UseFlg=%d UseShr=%d\n",ilr,icl,usc, cl->IsClusterUsed(),cl->IsClusterShared());
1939       }
1940     }
1941     printf("ClUsage Lr%d: Ncl=%5d Nusd=%5d (%5.2f) Use0CS1:%4d Use1C0:%4d Use1S1:%4d UseL:%d\n",
1942            ilr,ncl,nclUsed,ncl? float(nclUsed)/ncl : 0, nclUs0CntShr1,nclUs1Cnt0,nclUs1Shr1,nclUseL);
1943   }
1944 }
1945
1946
1947 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
1948 //__________________________________________________________________
1949 TObjArray* AliITSUTrackerGlo::BookControlHistos(const char* pref)
1950 {
1951   // book special control histos
1952   TString prefS = pref;
1953   prefS.ToLower();
1954   TObjArray* dest = new TObjArray;
1955   dest->SetOwner(kTRUE);
1956   //
1957   const int kNResDef=7;
1958   const double kResDef[kNResDef]={0.05,0.05,0.3, 0.05,1,0.5,1.5};
1959   const double ptMax=10;
1960   const double plMax=10;
1961   const double chiMax=100;
1962   const int nptbins=50;
1963   const int nresbins=400;
1964   const int nplbins=50;
1965   const int nchbins=200;
1966   const int maxBr  = 15;
1967   const int maxCand = 200;
1968   TString ttl;
1969   for (int phase=0;phase<kNTrackingPhases;phase++) {
1970     for (int pass=0;pass<AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetNTrackingConditions();pass++) {
1971       //
1972       for (int ilr=0;ilr<fNLrActive;ilr++) {
1973         //
1974         // ----------------- These are histos to be filled in Cluster2Tracks of each pass.
1975         // PropagateBack and RefitInward will be stored among the histos of 1st pass
1976         if (pass>0 && phase!=kClus2Tracks) continue;
1977         //
1978         double mxdf = ilr>=kNResDef ? kResDef[kNResDef-1] : kResDef[ilr];
1979         ttl = Form("Pass%d_S%d_residY%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
1980         TH2F* hdy = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax,nresbins,-mxdf,mxdf);
1981         dest->AddAtAndExpand(hdy,GetHistoID(ilr,kHResY,pass,phase));
1982         hdy->SetDirectory(0);
1983         //
1984         ttl = Form("Pass%d_S%d_residYPull%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
1985         TH2F* hdyp = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax,nplbins,-plMax,plMax);
1986         dest->AddAtAndExpand(hdyp,GetHistoID(ilr,kHResYP,pass,phase));
1987         hdyp->SetDirectory(0);
1988         //
1989         ttl = Form("Pass%d_S%d_residZ%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
1990         TH2F* hdz = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax,nresbins,-mxdf,mxdf);
1991         dest->AddAtAndExpand(hdz,GetHistoID(ilr,kHResZ,pass,phase));
1992         hdz->SetDirectory(0);
1993         //
1994         ttl = Form("Pass%d_S%d_residZPull%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
1995         TH2F* hdzp = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax,nplbins,-plMax,plMax);
1996         hdzp->SetDirectory(0);
1997         dest->AddAtAndExpand(hdzp,GetHistoID(ilr,kHResZP,pass,phase));
1998         //
1999         ttl = Form("Pass%d_S%d_chi2Cl%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
2000         TH2F* hchi = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax, nchbins,0.,chiMax);
2001         hchi->SetDirectory(0);
2002         dest->AddAtAndExpand(hchi,GetHistoID(ilr,kHChi2Cl,pass,phase));
2003         //
2004         // ------------------- These histos are filled for Clusters2Tracks only
2005         if (phase!=kClus2Tracks) continue;
2006         //
2007         ttl = Form("Pass%d_S%d_chi2Nrm%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
2008         TH2F* hchiN = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax, nchbins,0.,chiMax);
2009         hchiN->SetDirectory(0);
2010         dest->AddAtAndExpand(hchiN,GetHistoID(ilr,kHChi2Nrm,pass,phase));
2011         //
2012         ttl = Form("Pass%d_S%d_bestInBranch%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
2013         TH2* hnbr = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax, maxBr,-0.5,maxBr-0.5);
2014         hnbr->SetDirectory(0);
2015         dest->AddAtAndExpand(hnbr,GetHistoID(ilr,kHBestInBranch,pass,phase));
2016         //
2017         ttl = Form("Pass%d_S%d_bestInCands%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
2018         TH2* hncn = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax, maxCand,-0.5,maxCand-0.5);
2019         hncn->SetDirectory(0);
2020         dest->AddAtAndExpand(hncn,GetHistoID(ilr,kHBestInCand,pass,phase));
2021         //
2022       } // loop over layers
2023       //
2024       // these are special histos, filled not per layer but in the end of track fit in Clusters2Tracks in EVERY pass
2025       //
2026       if (phase==kClus2Tracks) {
2027         TH2* hchiMatch = 0;
2028         ttl = Form("Pass%d_Chi2Match_%s",pass,pref);
2029         hchiMatch = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax, nchbins,0.,chiMax);
2030         hchiMatch->SetDirectory(0);
2031         dest->AddAtAndExpand(hchiMatch,GetHistoID(-1,kHChiMatch,pass,phase));
2032         //
2033         TH2* hchiSA = 0;
2034         ttl = Form("Pass%d_Chi2ITSSA_%s",pass,pref);
2035         hchiSA = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax, nchbins/2,0.,chiMax/2);
2036         hchiSA->SetDirectory(0);
2037         dest->AddAtAndExpand(hchiSA,GetHistoID(-1,kHChiITSSA,pass,phase));
2038         //
2039       }
2040     } // loop over tracking passes
2041   }// loop over tracking phases
2042   //
2043   return dest;
2044 }
2045
2046 //__________________________________________________________________
2047 Int_t AliITSUTrackerGlo::GetHistoID(Int_t lr, Int_t hid, Int_t pass, Int_t phase)
2048 {
2049   // get id for the requested histo
2050   if (lr<0) lr=-1;
2051   lr++;
2052   return pass*kHistosPass + phase*kHistosPhase + lr*kMaxHID + hid;
2053   //
2054 }
2055
2056 #endif