ITS/UPGRADE/AliITSUTrackerGlo.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /*
  17   TO CHECK
  18   GetBz usage
  19
  20  */
  21
  22 //-------------------------------------------------------------------------
  23 //  Implementation of the ITS Upgrade tracker mother class.
  24 //-------------------------------------------------------------------------
  25 #include <TTree.h>
  26 #include <Riostream.h>
  27 #include <TMath.h>
  28 #include <TFile.h>
  29
  30 #include "AliITSUTrackerGlo.h"
  31 #include "AliESDEvent.h"
  32 #include "AliESDtrack.h"
  33 #include "AliITSURecoDet.h"
  34 #include "AliITSURecoSens.h"
  35 #include "AliITSUReconstructor.h"
  36 #include "AliITSReconstructor.h"
  37 #include "AliITSUSeed.h"
  38 #include "AliITSUClusterPix.h"
  39 #include "AliITSUGeomTGeo.h"
  40 #include "AliCodeTimer.h"
  41 #include "AliRefArray.h"
  42 using namespace AliITSUAux;
  43 using namespace TMath;
  44
  45 //----------------- tmp stuff -----------------
  46
  47 ClassImp(AliITSUTrackerGlo)
  48
  49 const Double_t AliITSUTrackerGlo::fgkToler =  1e-6;// tolerance for layer on-surface check
  50
  51
  52 //_________________________________________________________________________
  53 AliITSUTrackerGlo::AliITSUTrackerGlo(AliITSUReconstructor* rec)
  54 :  fReconstructor(rec)
  55   ,fITS(0)
  56   ,fMatLUT(0)
  57   ,fCurrESDtrack(0)
  58   ,fCurrESDtrMClb(kDummyLabel)
  59   ,fCurrMass(kPionMass)
  60   ,fCountProlongationTrials(0)
  61   ,fCountITSin(0)
  62   ,fCountITSout(0)
  63   ,fCountITSrefit(0)
  64   ,fNTracksESD(0)
  65   ,fHypStore(100)
  66   ,fLayerMaxCandidates(1000)
  67   ,fLayerCandidates(0)
  68   ,fNBranchesAdded(0)
  69   ,fNCandidatesAdded(0)
  70   ,fCurrHyp(0)
  71   ,fWorkHyp(0)
  72   ,fSeedsPool("AliITSUSeed",0)
  73   ,fFreeSeedsID(0)
  74   ,fESDIndex(0)
  75   ,fNFreeSeeds(0)
  76   ,fLastSeedID(0)
  77   ,fNLrActive(0)
  78   ,fDefTrackConds(0)
  79   ,fCurrTrackCond(0)
  80   ,fCurrActLrID(-1)
  81   ,fCurrLayer(0)
  82   ,fTrackPhaseID(-1)
  83   ,fCurrPassID(-1)
  84   ,fUseMatLUT(kFALSE)
  85 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
  86   ,fCHistoArrCorr(0)
  87   ,fCHistoArrFake(0)
  88 #endif
  89 {
  90   // Default constructor
  91   if (rec) Init(rec);
  92 }
  93
  94 //_________________________________________________________________________
  95 AliITSUTrackerGlo::~AliITSUTrackerGlo()
  96 {
  97  // Default destructor
  98  //
  99   delete[] fLayerCandidates;
 100   if (fWorkHyp) fWorkHyp->SetTPCSeed(0); // this hypothesis does not own the seed
 101   delete fWorkHyp;
 102   delete fMatLUT;
 103   //
 104 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
 105   if (fCHistoArrCorr || fCHistoArrFake) {
 106     TFile* ctrOut = TFile::Open("itsuControlHistos.root","recreate");
 107     ctrOut->cd();
 108     AliInfo("Storing control histos");
 109     //    ctrOut->WriteObject(fCHistoArr,"controlH","kSingleKey");
 110     if (fCHistoArrCorr) {
 111       fCHistoArrCorr->Write();
 112       delete fCHistoArrCorr;
 113     }
 114     if (fCHistoArrFake) {
 115       fCHistoArrFake->Write();
 116       delete fCHistoArrFake;
 117     }
 118     ctrOut->Close();
 119     delete ctrOut;
 120     fCHistoArrCorr = 0;
 121     fCHistoArrFake = 0;
 122   }
 123 #endif
 124   //
 125 }
 126
 127 //_________________________________________________________________________
 128 void AliITSUTrackerGlo::Init(AliITSUReconstructor* rec)
 129 {
 130   // init with external reconstructor
 131   //
 132   fITS = rec->GetITSInterface();
 133   fNLrActive = fITS->GetNLayersActive();
 134   fWorkHyp = new AliITSUTrackHyp(fNLrActive);
 135   // create material lookup table
 136   const int kNTest = 1000;
 137   const double kStepsPerCM=5;
 138   fMatLUT  = new AliITSUMatLUT(fITS->GetRMin(),fITS->GetRMax(),Nint(kStepsPerCM*(fITS->GetRMax()-fITS->GetRMin())));
 139   double zmn = 1e6;
 140   for (int ilr=fITS->GetNLayers();ilr--;) {
 141     AliITSURecoLayer* lr = fITS->GetLayer(ilr);
 142     if (zmn>Abs(lr->GetZMin())) zmn = Abs(lr->GetZMin());
 143     if (zmn>Abs(lr->GetZMax())) zmn = Abs(lr->GetZMax());
 144   }
 145   fMatLUT->FillData(kNTest,-zmn,zmn);
 146   //
 147   if (fLayerMaxCandidates<1) fLayerMaxCandidates = 1000;
 148   fLayerCandidates = new AliITSUSeed*[fLayerMaxCandidates];
 149   fSeedsPool.ExpandCreateFast(1000); // RS TOCHECK
 150   fFreeSeedsID.Set(1000);
 151   fESDIndex.Set(1000);
 152   //
 153 }
 154
 155 //_________________________________________________________________________
 156 void AliITSUTrackerGlo::CreateDefaultTrackCond()
 157 {
 158   // creates default tracking conditions to be used when recoparam does not provide them
 159
 160   AliITSUTrackCond* cond = new AliITSUTrackCond();
 161   //
 162   cond->SetNLayers(fNLrActive);
 163   cond->AddNewCondition(fNLrActive);
 164   cond->AddGroupPattern( 0xffff, fNLrActive ); // require all layers hit
 165   cond->Init();
 166   //
 167   fDefTrackConds.AddLast(cond);
 168   //
 169   AliInfo("Created conditions: ");
 170   for (int i=0;i<fDefTrackConds.GetEntriesFast();i++) fDefTrackConds[i]->Print();
 171   //
 172 }
 173
 174
 175 //_________________________________________________________________________
 176 Int_t AliITSUTrackerGlo::Clusters2Tracks(AliESDEvent *esdEv)
 177 {
 178   //
 179   AliCodeTimerAuto("",0);
 180   SetTrackingPhase(kClus2Tracks);
 181   //
 182 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
 183   if (!fCHistoArrCorr) fCHistoArrCorr = BookControlHistos("Corr");
 184   if (!fCHistoArrFake) fCHistoArrFake = BookControlHistos("Fake");
 185 #endif
 186   static int evID = 0;
 187   static TArrayF esdTrPt(fESDIndex.GetSize());
 188   //
 189   TObjArray *trackConds = 0;
 190   //
 191   fCountProlongationTrials = 0;
 192   fCountITSin = 0;
 193   fCountITSout = 0;
 194   fCountITSrefit = 0;
 195   //
 196   ResetSeedsPool();
 197   fNTracksESD = esdEv->GetNumberOfTracks();
 198   AliInfo(Form("Will try to find prolongations for %d tracks",fNTracksESD));
 199   int nTrackCond = AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetNTrackingConditions();
 200   fUseMatLUT = AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetUseMatLUT(fTrackPhaseID);
 201   if (nTrackCond<1) {
 202     if (!fDefTrackConds.GetEntriesFast()) {
 203       AliInfo("No tracking conditions found in recoparams, creating default one requesting all layers hit");
 204       CreateDefaultTrackCond();
 205     }
 206     trackConds = &fDefTrackConds;
 207     nTrackCond = trackConds->GetEntriesFast();
 208   }
 209   else trackConds = AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetTrackingConditions();
 210   //
 211   static Bool_t first = kTRUE;
 212   if (first) {
 213     AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->Print();
 214     first = kFALSE;
 215   }
 216   fHypStore.Delete();
 217   if (fHypStore.GetSize()<fNTracksESD) fHypStore.Expand(fNTracksESD+100);
 218   //
 219   fITS->ProcessClusters();
 220   //
 221 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
 222   FlagSplitClusters(); // tmp RS
 223 #endif
 224   //
 225   // the tracks will be reconstructed in decreasing pt order, sort them
 226   if (fESDIndex.GetSize()<fNTracksESD) {
 227     fESDIndex.Set(fNTracksESD+200);
 228     esdTrPt.Set(fNTracksESD+200);
 229   }
 230   int* esdTrackIndex = fESDIndex.GetArray();
 231   float* trPt = esdTrPt.GetArray();
 232   for (int itr=fNTracksESD;itr--;) {
 233     AliESDtrack* esdTr = esdEv->GetTrack(itr);
 234     esdTr->SetStatus(AliESDtrack::kITSupg);   // Flag all tracks as participating in the ITSup reco
 235     trPt[itr] = esdTr->Pt();
 236   }
 237   Sort(fNTracksESD,trPt,esdTrackIndex,kTRUE);
 238   //
 239   for (int icnd=0;icnd<nTrackCond;icnd++) {
 240     fCurrPassID = icnd;
 241     fCurrTrackCond = (AliITSUTrackCond*)trackConds->UncheckedAt(icnd);
 242     if (!fCurrTrackCond->IsInitDone()) fCurrTrackCond->Init();
 243     // select ESD tracks to propagate
 244     for (int itr=0;itr<fNTracksESD;itr++) {
 245       int trID = esdTrackIndex[itr];
 246       fCurrESDtrack = esdEv->GetTrack(trID);
 247       fCurrESDtrMClb = fCurrESDtrack->GetLabel();
 248       //
 249
 250       if (!NeedToProlong(fCurrESDtrack,trID)) continue;  // are we interested in this track?
 251       /*
 252         // if specific tracks should be checked, create a global array int wtc[] = {evITS*10000+trID, ...};
 253       Bool_t dbg = kFALSE;
 254       int nwtc = sizeof(wtc)/sizeof(int);
 255
 256       for (int k=0;k<nwtc;k++) {
 257         if (wtc[k]==evID*10000+trID) {
 258           dbg = kTRUE;
 259           printf("At esdTr: %d MC: %d\n",wtc[k],fCurrESDtrMClb);
 260           break;
 261         }
 262       }
 263       AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",dbg ? 10:0);
 264       */
 265 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 266       AliDebug(1,Form("Processing track %d(esd%d) | M=%.3f Pt=%.3f | MCLabel: %d",itr,trID,fCurrESDtrack->GetMass(kTRUE),fCurrESDtrack->Pt(),fCurrESDtrMClb));//RS
 267 #endif
 268       FindTrack(fCurrESDtrack, trID);
 269     }
 270     //
 271 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 272     if (AliDebugLevelClass()>+2) {
 273       AliInfo(Form("SeedsPool: %d, BookedUpTo: %d, free: %d",fSeedsPool.GetSize(),fSeedsPool.GetEntriesFast(),fNFreeSeeds));
 274       fHypStore.Print();
 275     }
 276 #endif
 277     FinalizeHypotheses();
 278 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
 279     CheckClusterUsage(); //!!RS
 280 #endif
 281     //
 282     //AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",0);     // in case wtc array was defined, uncomment this
 283   }
 284   //
 285   AliInfo(Form("%d ITSin for %d tried TPC seeds out of %d ESD tracks\n",fCountITSin,fCountProlongationTrials,fNTracksESD));
 286   evID++;
 287   return 0;
 288 }
 289
 290 //_________________________________________________________________________
 291 Int_t AliITSUTrackerGlo::PropagateBack(AliESDEvent *esdEv)
 292 {
 293   //
 294   // Do outward fits in ITS
 295   AliCodeTimerAuto("",0);
 296   //
 297   SetTrackingPhase(kPropBack);
 298   fNTracksESD = esdEv->GetNumberOfTracks();
 299   fUseMatLUT = AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetUseMatLUT(fTrackPhaseID);
 300 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 301   AliDebug(1,Form("Will propagate back %d tracks",fNTracksESD));
 302 #endif
 303   //
 304   double bz0 = GetBz();
 305   Double_t xyzTrk[3],xyzVtx[3]={GetX(),GetY(),GetZ()};
 306   AliITSUTrackHyp dummyTr;
 307   const double kWatchStep=10.; // for larger steps watch arc vs segment difference
 308   Double_t times[AliPID::kSPECIES];
 309   //
 310   for (int itr=0;itr<fNTracksESD;itr++) {
 311     fCurrESDtrack = esdEv->GetTrack(itr);
 312     fCurrESDtrMClb = fCurrESDtrack->GetLabel();
 313     // Start time integral and add distance from current position to vertex
 314     if (fCurrESDtrack->IsOn(AliESDtrack::kITSout)) continue; // already done
 315     //
 316     fCurrESDtrack->GetXYZ(xyzTrk);
 317     Double_t dst = 0.;     // set initial track lenght, tof
 318     {
 319       double dxs = xyzTrk[0] - xyzVtx[0];
 320       double dys = xyzTrk[1] - xyzVtx[1];
 321       //      double dzs = xyzTrk[2] - xyzVtx[2];
 322       // RS: for large segment steps d use approximation of cicrular arc s by
 323       // s = 2R*asin(d/2R) = d/p asin(p) \approx d/p (p + 1/6 p^3) = d (1+1/6 p^2)
 324       // where R is the track radius, p = d/2R = 2C*d (C is the abs curvature)
 325       // Hence s^2/d^2 = (1+1/6 p^2)^2
 326       dst = dxs*dxs + dys*dys;
 327       if (dst > kWatchStep*kWatchStep) { // correct circular part for arc/segment factor
 328         double crv = Abs(fCurrESDtrack->GetC(bz0));
 329         double fcarc = 1.+crv*crv*dst/6.;
 330         dst *= fcarc*fcarc;
 331       }
 332       // RS: temporary hack since we don't have SPD vertex:
 333       //      dst += dzs*dzs;
 334       dst *= 1+fCurrESDtrack->GetTgl()*fCurrESDtrack->GetTgl();
 335       dst = Sqrt(dst);
 336     }
 337     //
 338     fCurrESDtrack->SetStatus(AliESDtrack::kTIME);
 339     //
 340     if (!fCurrESDtrack->IsOn(AliESDtrack::kITSin)) { // case of tracks w/o ITS prolongation: just set the time integration
 341       dummyTr.AliExternalTrackParam::operator=(*fCurrESDtrack);
 342       dummyTr.StartTimeIntegral();
 343       dummyTr.AddTimeStep(dst);
 344       dummyTr.GetIntegratedTimes(times);
 345       fCurrESDtrack->SetIntegratedTimes(times);
 346       fCurrESDtrack->SetIntegratedLength(dummyTr.GetIntegratedLength());
 347       continue;
 348     }
 349     //
 350     fCurrHyp = GetTrackHyp(itr);
 351     fCurrMass = fCurrHyp->GetMass();
 352     fCurrHyp->StartTimeIntegral();
 353     fCurrHyp->AddTimeStep(dst);
 354     fCurrHyp->ResetCovariance(10000);
 355     int nclFit = 0;
 356     double chi2 = RefitTrack(fCurrHyp,fITS->GetRMax(),nclFit);
 357     if (chi2>0) { // propagate to exit from the ITS/TPC screen
 358       int ndf = nclFit*2-5;
 359       if (ndf>0) chi2 /= ndf;
 360       fCurrHyp->SetChi2(chi2);
 361       UpdateESDTrack(fCurrHyp,AliESDtrack::kITSout);
 362     }
 363     else {
 364 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 365       AliDebug(2,Form("Refit Failed for track %d | ESDtrack#%d (MClb:%d)",itr,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
 366 #endif
 367       //fCurrHyp->AliExternalTrackParam::Print();
 368       //fCurrHyp->GetWinner()->Print();
 369     }
 370     //
 371   }
 372   //
 373   AliInfo(Form("%d ITSout in %d ITSin tracks for %d tried TPC seeds out of %d ESD tracks\n",
 374                fCountITSout,fCountITSin,fCountProlongationTrials,fNTracksESD));
 375   //
 376   return 0;
 377 }
 378
 379 //_________________________________________________________________________
 380 Int_t AliITSUTrackerGlo::RefitInward(AliESDEvent *esdEv)
 381 {
 382   //
 383   // refit the tracks inward, using current cov.matrix
 384   AliCodeTimerAuto("",0);
 385   //
 386   SetTrackingPhase(kRefitInw);
 387   fUseMatLUT = AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetUseMatLUT(fTrackPhaseID);
 388   fNTracksESD = esdEv->GetNumberOfTracks();
 389   //  AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",10);
 390
 391   AliDebug(1,Form("Will refit inward %d tracks",fNTracksESD));
 392   //  Bool_t uselogMS = AliExternalTrackParam::GetUseLogTermMS();
 393   //  AliExternalTrackParam::SetUseLogTermMS(kTRUE);
 394   //
 395   for (int itr=0;itr<fNTracksESD;itr++) {
 396     fCurrESDtrack = esdEv->GetTrack(itr);
 397     fCurrESDtrMClb = fCurrESDtrack->GetLabel();
 398     // Start time integral and add distance from current position to vertex
 399     UInt_t trStat = fCurrESDtrack->GetStatus();
 400     if ( !(trStat & AliESDtrack::kITSout) ) continue;
 401     if (   trStat & AliESDtrack::kITSrefit ) continue; // already done
 402     if (  (trStat & AliESDtrack::kTPCout) && !(trStat & AliESDtrack::kTPCrefit) ) continue;
 403     //
 404     fCurrHyp  = GetTrackHyp(itr);
 405     fCurrMass = fCurrHyp->GetMass();
 406     *fCurrHyp = *fCurrESDtrack;  // fetch current ESDtrack kinematics
 407     //
 408     int nclFit = 0;
 409     //    fCurrHyp->ResetCovariance(1000); // in case we want to do SA refit
 410     double chi2 = RefitTrack(fCurrHyp,fITS->GetRMin(),nclFit);
 411     if (chi2>0) { // propagate up to inside radius of the beam pipe
 412       int ndf = nclFit*2-5;
 413       if (ndf>0) chi2 /= ndf;
 414       fCurrHyp->SetChi2(chi2);
 415       UpdateESDTrack(fCurrHyp,AliESDtrack::kITSrefit);
 416     }
 417     else {
 418 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 419       AliDebug(2,Form("Refit Failed for track %d |ESDtrack#%d (MClb:%d)",itr,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
 420 #endif
 421     }
 422   }
 423   //  AliExternalTrackParam::SetUseLogTermMS(uselogMS);
 424   //
 425   AliInfo(Form("%d ITSrefit in %d ITSout in %d ITSin tracks for %d tried TPC seeds out of %d ESD tracks\n",
 426                fCountITSrefit,fCountITSout,fCountITSin,fCountProlongationTrials,fNTracksESD));
 427   //
 428   //  AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",0);
 429   return 0;
 430 }
 431
 432 //_________________________________________________________________________
 433 Int_t AliITSUTrackerGlo::LoadClusters(TTree * treeRP)
 434 {
 435   // read from tree (if pointer provided) or directly from the ITS reco interface
 436   //
 437   return fReconstructor->LoadClusters(treeRP);
 438 }
 439
 440 //_________________________________________________________________________
 441 void AliITSUTrackerGlo::UnloadClusters()
 442 {
 443   //
 444   // To be implemented
 445   //
 446
 447   Info("UnloadClusters","To be implemented");
 448 }
 449 //_________________________________________________________________________
 450 AliCluster * AliITSUTrackerGlo::GetCluster(Int_t /*index*/) const
 451 {
 452   //
 453   // To be implemented
 454   //
 455
 456   Info("GetCluster","To be implemented");
 457   return 0x0;
 458 }
 459
 460 //_________________________________________________________________________
 461 Bool_t AliITSUTrackerGlo::NeedToProlong(AliESDtrack* esdTr, Int_t esdID)
 462 {
 463   // do we need to match this track to ITS?
 464   //
 465   static double bz = GetBz();
 466   //
 467   // is it already prolonged
 468   if (esdTr->IsOn(AliESDtrack::kITSin)) return kFALSE;
 469   AliITSUTrackHyp* hyp = GetTrackHyp(esdID); // in case there is unfinished hypothesis from prev.pass, clean it
 470   if (hyp) {
 471     CleanHypothesis(hyp);
 472     if (hyp->GetSkip()) return kFALSE; // need to skip this
 473     return kTRUE;
 474   }
 475   //
 476   if (!esdTr->IsOn(AliESDtrack::kTPCin) ||
 477       esdTr->IsOn(AliESDtrack::kTPCout) ||
 478       esdTr->IsOn(AliESDtrack::kITSin)  ||
 479       esdTr->GetKinkIndex(0)>0) return kFALSE;
 480   //
 481   if (esdTr->Pt()<AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetMinPtForProlongation()) return kFALSE;
 482   //
 483   float dtz[2];
 484   esdTr->GetDZ(GetX(),GetY(),GetZ(),bz,dtz);
 485   // if track is not V0 candidata but has large offset wrt IP, reject it. RS TOCHECK
 486   if ( !(esdTr->GetV0Index(0)>0 && dtz[0]>AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxDforV0dghtrForProlongation())
 487        && (Abs(dtz[0])>AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxDForProlongation() ||
 488            Abs(dtz[1])>AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxDZForProlongation())) return kFALSE;
 489   //
 490   //  if (esdTr->Pt()<3) return kFALSE;//RS
 491   return kTRUE;
 492 }
 493
 494 //_________________________________________________________________________
 495 void AliITSUTrackerGlo::FindTrack(AliESDtrack* esdTr, Int_t esdID)
 496 {
 497   // find prolongaion candidates finding for single seed
 498   //
 499   AliITSUSeed seedUC;  // copy of the seed from the upper layer
 500   AliITSUSeed seedT;   // transient seed between the seedUC and new prolongation hypothesis
 501   //
 502   //  AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",10);
 503   AliITSUTrackHyp* hypTr = InitHypothesis(esdTr,esdID);  // initialize prolongations hypotheses tree
 504   if (!hypTr || hypTr->GetSkip()) return;
 505   //
 506   double bz = GetBz();
 507   fCurrHyp = fWorkHyp;
 508   fCurrHyp->InitFrom(hypTr);
 509   //
 510   AliITSURecoSens *hitSens[AliITSURecoSens::kNNeighbors+1];
 511   //
 512   int ilaUp = fNLrActive;     // previous active layer really checked (some may be excluded!)
 513   //
 514   for (int ila=fNLrActive;ila--;ilaUp=fCurrActLrID) {
 515     if (fCurrTrackCond->IsLayerExcluded(ila)) continue;
 516     fCurrActLrID = ila;
 517     fCurrLayer = fITS->GetLayerActive(ila);
 518     Bool_t noClSharing = fCurrTrackCond->GetClSharing(ila)==0;
 519     //
 520     // for the outermost layer the seed is created from the ESD track
 521     int nSeedsUp = (ilaUp==fNLrActive) ? 1 : fCurrHyp->GetNSeeds(ilaUp);
 522     int maxNBranches   = fCurrTrackCond->GetMaxBranches(ila);
 523     int maxNCandidates = fCurrTrackCond->GetMaxCandidates(ila);
 524     //
 525     for (int isd=0;isd<nSeedsUp;isd++) {
 526       AliITSUSeed* seedU;
 527       if (ilaUp==fNLrActive) {
 528         seedU = 0;
 529         seedUC.InitFromSeed(fCurrHyp->GetTPCSeed()); // init with TPC seed from ref.R
 530       }
 531       else {
 532         seedU = fCurrHyp->GetSeed(ilaUp,isd);  // seed on prev.active layer to prolong
 533         if (seedU->IsKilled()) continue;
 534         seedUC = *seedU;                       // its copy will be prolonged
 535         seedUC.SetParent(seedU);
 536       }
 537       seedUC.ResetFMatrix();                    // reset the matrix for propagation to next layer
 538       // go till next active layer
 539 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 540       AliDebug(2,Form("working on Lr:%d Seed:%d of %d for esdID=%d (MClb:%d) | pT=%.3f",ila,isd,nSeedsUp,esdID,fCurrESDtrMClb,seedUC.Pt()));
 541 #endif
 542       if (!TransportToLayer(&seedUC, fITS->GetLrIDActive(ilaUp), fITS->GetLrIDActive(ila)) ) { // external seed already prolonged
 543         //
 544 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 545         AliDebug(2,Form("Transport failed | esdID=%d (MClb:%d)",esdID,fCurrESDtrMClb));
 546 #endif
 547         // Check if the seed satisfies to track definition
 548         if (NeedToKill(&seedUC,kTransportFailed) && seedU) KillSeed(seedU,kTRUE);
 549         continue; // RS TODO: decide what to do with tracks stopped on higher layers w/o killing
 550       }
 551       if (!GetRoadWidth(&seedUC, ila)) { // failed to find road width on the layer
 552         if (NeedToKill(&seedUC,kRWCheckFailed) && seedU) KillSeed(seedU,kTRUE);
 553         continue;
 554       }
 555       /*
 556       //RS toremove
 557       int mcquest = -1;
 558       if (!seedUC.ContainsFake() && AliDebugLevelClass()>2) {
 559         mcquest = fCurrESDtrMClb;
 560         seedUC.Print("etp");
 561         printf("FSParams: "); for (int ip=0;ip<kNTrImpData;ip++) printf("%+e ",fTrImpData[ip]); printf("\n");
 562       }
 563       //
 564       int nsens = fCurrLayer->FindSensors(&fTrImpData[kTrPhi0], hitSens, mcquest);  // find detectors which may be hit by the track
 565       */
 566       int nsens = fCurrLayer->FindSensors(&fTrImpData[kTrPhi0], hitSens);  // find detectors which may be hit by the track
 567 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 568       AliDebug(2,Form("Will check %d sensors on lr:%d | esdID=%d (MClb:%d)",nsens,ila,esdID,fCurrESDtrMClb));
 569 #endif
 570       //
 571       seedUC.SetLr(ila);
 572       //
 573       for (int isn=nsens;isn--;) {
 574         AliITSURecoSens* sens = hitSens[isn];
 575         int ncl = sens->GetNClusters();
 576         if (!ncl) continue;
 577         seedT = seedUC;
 578         //
 579         // We need to propagate the seed to sensor on fCurrLayer staying in the frame of the sensor from prev.layer,
 580         // since the transport matrix should be defined in this frame.
 581         double xs; // X in the TF of current seed, corresponding to intersection with sensor plane
 582         if (!seedT.GetTrackingXAtXAlpha(sens->GetXTF(),sens->GetPhiTF(),bz, xs)) {
 583 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 584           if (AliDebugLevelClass()>2) {
 585             printf("Failed on GetTrackingXAtXAlpha: X=%.4f alp=%.3f\n",sens->GetXTF(),sens->GetPhiTF());
 586             seedT.Print("etp");
 587           }
 588 #endif
 589           continue;
 590         }
 591         if (xs<seedT.GetX()) {
 592           if (!PropagateSeed(&seedT,xs,fCurrMass)) continue;
 593         }
 594         else { // some low precision tracks may hit the sensor plane outside of the layer radius
 595 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 596           if (AliDebugLevelClass()>2) {
 597             if (!seedT.ContainsFake()) {
 598               printf("WRONG PROP on L%d, sens%d of %d: %.4f > %.4f\n",ila,isn,nsens,xs,seedT.GetX());
 599               sens->Print();
 600               seedT.Print("etp");
 601             }
 602           }
 603 #endif
 604           if (!seedT.PropagateParamOnlyTo(xs,bz)) continue;
 605         }
 606         //      if (!seedT.PropagateToX(xs,bz)) continue;
 607         //      if (!seedT.Rotate(sens->GetPhiTF())) continue;
 608         if (!seedT.RotateToAlpha(sens->GetPhiTF())) continue;
 609         //
 610         int clID0 = sens->GetFirstClusterId();
 611         for (int icl=ncl;icl--;) { // don't change the order, clusters are sorted
 612           //AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",10);
 613           int clID = clID0 + icl;
 614           if (noClSharing && fCurrLayer->GetCluster(clID)->IsClusterUsed()) continue;
 615           int res = CheckCluster(&seedT,ila,clID0+icl);
 616           //AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo", 0);
 617           //
 618           if (res==kStopSearchOnSensor) break;     // stop looking on this sensor
 619           if (res==kClusterNotMatching) continue;  // cluster does not match
 620           // cluster is matching and it was added to the hypotheses tree
 621         }
 622       }
 623       // cluster search is done. Do we need to have a version of this seed skipping current layer
 624       if (!NeedToKill(&seedUC,kMissingCluster)) {
 625         AliITSUSeed* seedSkp = NewSeedFromPool(&seedUC);
 626         if (nsens) { // to do: make penalty to account for probability to miss the cluster for good reason
 627           double penalty = -fCurrTrackCond->GetMissPenalty(ila);
 628           seedSkp->SetChi2Cl(penalty);
 629         }
 630         if (seedSkp->GetChi2GloNrm()>fCurrTrackCond->GetMaxChi2GloNrm(ila)) {
 631           MarkSeedFree(seedSkp);
 632         }
 633         else AddSeedBranch(seedSkp);
 634       }
 635       // transfer the new branches of the seed to the hypothesis container
 636       if (fNBranchesAdded) ValidateAllowedBranches(maxNBranches);
 637       //
 638     }
 639     if (fNCandidatesAdded) ValidateAllowedCandidates(ila,maxNCandidates);
 640     //    ((TObjArray*)fCurrHyp->GetLayerSeeds(ila))->Sort();
 641 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 642     if (AliDebugLevelClass()>2) { //RS
 643       printf(">>> All hypotheses on lr %d: \n",ila);
 644       for (int ih=0;ih<fCurrHyp->GetNSeeds(ila);ih++) {printf(" #%3d ",ih); fCurrHyp->GetSeed(ila,ih)->Print();}
 645     }
 646 #endif
 647     //
 648     /*
 649     for (int ih=0;ih<fCurrHyp->GetNSeeds(ila);ih++) {
 650       if (ila!=0) continue;
 651       double vecL[5] = {0};
 652       double matL[15] = {0};
 653       AliITSUSeed* sp = fCurrHyp->GetSeed(ila,ih);
 654       while(sp->GetParent()) {
 655         sp->Smooth(vecL,matL);
 656         if (sp->GetLayerID()>=fNLrActive-1) break;
 657         sp = (AliITSUSeed*)sp->GetParent();
 658       }
 659       */
 660   }
 661   //
 662   SaveReducedHypothesesTree(hypTr);
 663 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 664   if (AliDebugLevelClass()>1) {
 665     printf("\nSaved hypotheses for esdTrack %d (MCLab:%d)\n",esdID,fCurrESDtrMClb);
 666     hypTr->Print("l");
 667   }
 668 #endif
 669   fCurrHyp = 0;
 670   //  AliLog::SetClassDebugLevel("AliITSUTrackerGlo",0);
 671   //
 672 }
 673
 674 //_________________________________________________________________________
 675 AliITSUTrackHyp* AliITSUTrackerGlo::InitHypothesis(AliESDtrack *esdTr, Int_t esdID)
 676 {
 677   // init prolongaion candidates finding for single seed
 678   AliITSUTrackHyp* hyp = GetTrackHyp(esdID);
 679   if (hyp) return hyp;
 680   //
 681   fCountProlongationTrials++;
 682   //
 683   fCurrMass = esdTr->GetMass();
 684   if (fCurrMass<kPionMass*0.9) fCurrMass = kPionMass; // don't trust to mu, e identification from TPCin
 685   //
 686   hyp = new AliITSUTrackHyp(fNLrActive);
 687   hyp->SetESDTrack(esdTr);
 688   hyp->SetUniqueID(esdID);
 689   hyp->SetMass(fCurrMass);
 690   hyp->SetTPCSeed( new AliExternalTrackParam(*esdTr) );
 691   SetTrackHyp(hyp,esdID);
 692   Bool_t lut = fUseMatLUT; // for propagation from TPC use TGeo material budget always
 693   fUseMatLUT = kFALSE;
 694   if (!TransportToLayer(hyp->GetTPCSeed(),fITS->GetNLayers(), fITS->GetLrIDActive(fNLrActive-1), fITS->GetRITSTPCRef())) hyp->SetSkip(); // propagate to outer R of ITS
 695   fUseMatLUT = lut;
 696   //
 697   return hyp;
 698   // TO DO
 699 }
 700
 701 //_________________________________________________________________________
 702 Bool_t AliITSUTrackerGlo::TransportToLayer(AliITSUSeed* seed, Int_t lFrom, Int_t lTo, Double_t rLim)
 703 {
 704   // transport seed from layerFrom to the entrance (along the direction of the track) of layerTo or to rLim (if>0), wathever is closer
 705   //
 706   //
 707   if (lTo==lFrom) AliFatal(Form("was called with lFrom=%d lTo=%d",lFrom,lTo));
 708   //
 709   int dir = lTo > lFrom ? 1:-1;
 710   AliITSURecoLayer* lrFr = fITS->GetLayer(lFrom); // this can be 0 when extrapolation from TPC to ITS is requested
 711   Bool_t checkFirst = kTRUE;
 712   Bool_t limReached = kFALSE;
 713   while(lFrom!=lTo) {
 714     if (lrFr) {
 715       if (!GoToExitFromLayer(seed,lrFr,dir,checkFirst)) return kFALSE; // go till the end of current layer
 716       checkFirst = kFALSE;
 717     }
 718     AliITSURecoLayer* lrTo =  fITS->GetLayer( (lFrom+=dir) );
 719     if (!lrTo) AliFatal(Form("Layer %d does not exist",lFrom));
 720     //
 721     // go the entrance of the layer, assuming no materials in between
 722     double xToGo = lrTo->GetR(-dir);
 723     if (rLim>0) {
 724       if (dir>0) {
 725         if (rLim<xToGo) {xToGo = rLim; limReached = kTRUE;}
 726       }
 727       else {
 728         if (rLim>xToGo) {xToGo = rLim; limReached = kTRUE;}
 729       }
 730     }
 731     //    double xts = xToGo;
 732     if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) {
 733       //printf("FailHere1: %f %f %d\n",xts,xToGo,dir);
 734       //seed->Print("etp");
 735       //
 736       return kFALSE;
 737     }
 738 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 739     AliDebug(2,Form("go in dir=%d to R=%.4f(X:%.4f)",dir,lrTo->GetR(-dir), xToGo));
 740 #endif
 741     if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass,100, kFALSE )) {
 742       //printf("FailHere2: %f %f %d\n",xts,xToGo,dir);
 743       //seed->Print("etp");
 744       return kFALSE;
 745     }
 746     lrFr = lrTo;
 747     if (limReached) break;
 748   }
 749   return kTRUE;
 750   //
 751 }
 752
 753 //_________________________________________________________________________
 754 Bool_t AliITSUTrackerGlo::TransportToLayer(AliExternalTrackParam* seed, Int_t lFrom, Int_t lTo, Double_t rLim)
 755 {
 756   // transport track from layerFrom to the entrance of layerTo or to rLim (if>0), wathever is closer
 757   //
 758   if (lTo==lFrom) AliFatal(Form("was called with lFrom=%d lTo=%d",lFrom,lTo));
 759   //
 760   int dir = lTo > lFrom ? 1:-1;
 761   AliITSURecoLayer* lrFr = fITS->GetLayer(lFrom); // this can be 0 when extrapolation from TPC to ITS is requested
 762   Bool_t checkFirst = kTRUE;
 763   Bool_t limReached = kFALSE;
 764   while(lFrom!=lTo) {
 765     if (lrFr) {
 766       if (!GoToExitFromLayer(seed,lrFr,dir,checkFirst)) return kFALSE; // go till the end of current layer
 767       checkFirst = kFALSE;
 768     }
 769     AliITSURecoLayer* lrTo =  fITS->GetLayer( (lFrom+=dir) );
 770     if (!lrTo) AliFatal(Form("Layer %d does not exist",lFrom));
 771     //
 772     // go the entrance of the layer, assuming no materials in between
 773     double xToGo = lrTo->GetR(-dir);
 774     if (rLim>0) {
 775       if (dir>0) {
 776         if (rLim<xToGo) {xToGo = rLim; limReached = kTRUE;}
 777       }
 778       else {
 779         if (rLim>xToGo) {xToGo = rLim; limReached = kTRUE;}
 780       }
 781     }
 782     //    double xts = xToGo;
 783     if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) {
 784       //      printf("FailHere1: %f %f %d\n",xts,xToGo,dir);
 785       //      seed->Print("etp");
 786       return kFALSE;
 787     }
 788 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 789     AliDebug(2,Form("go in dir=%d to R=%.4f(X:%.4f)",dir,lrTo->GetR(-dir), xToGo));
 790 #endif
 791     if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass,100, kFALSE )) {
 792       //printf("FailHere2: %f %f %d\n",xts,xToGo,dir);
 793       //seed->Print("etp");
 794       return kFALSE;
 795     }
 796     lrFr = lrTo;
 797     if (limReached) break;
 798   }
 799   return kTRUE;
 800   //
 801 }
 802
 803 //_________________________________________________________________________
 804 Bool_t AliITSUTrackerGlo::TransportToLayerX(AliExternalTrackParam* seed, Int_t lFrom, Int_t lTo, Double_t xStop)
 805 {
 806   // transport track from layerFrom to the entrance of layerTo but do not pass control parameter X
 807   //
 808   if (lTo==lFrom) AliFatal(Form("was called with lFrom=%d lTo=%d",lFrom,lTo));
 809   //
 810   int dir = lTo > lFrom ? 1:-1;
 811   AliITSURecoLayer* lrFr = fITS->GetLayer(lFrom); // this can be 0 when extrapolation from TPC to ITS is requested
 812   Bool_t checkFirst = kTRUE;
 813   while(lFrom!=lTo) {
 814     if (lrFr) {
 815       if (!GoToExitFromLayer(seed,lrFr,dir,checkFirst)) return kFALSE; // go till the end of current layer
 816       checkFirst = kFALSE;
 817     }
 818     AliITSURecoLayer* lrTo =  fITS->GetLayer( (lFrom+=dir) );
 819     if (!lrTo) AliFatal(Form("Layer %d does not exist",lFrom));
 820     //
 821     // go the entrance of the layer, assuming no materials in between
 822     double xToGo = lrTo->GetR(-dir); // R of the entrance to layer
 823     //
 824     //    double xts = xToGo;
 825     if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) {
 826       //      printf("FailHere1: %f %f %d\n",xts,xToGo,dir);
 827       //      seed->Print("etp");
 828       return kFALSE;
 829     }
 830     if ( (dir>0&&xToGo>xStop) || (dir<0&&xToGo<xStop) ) xToGo = xStop;
 831     //
 832 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 833     AliDebug(2,Form("go in dir=%d to R=%.4f(X:%.4f)",dir,lrTo->GetR(-dir), xToGo));
 834 #endif
 835     if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass,100, kFALSE )) {
 836       //printf("FailHere2: %f %f %d\n",xts,xToGo,dir);
 837       //seed->Print("etp");
 838       return kFALSE;
 839     }
 840     lrFr = lrTo;
 841   }
 842   return kTRUE;
 843   //
 844 }
 845
 846 //_________________________________________________________________________
 847 Bool_t AliITSUTrackerGlo::GoToExitFromLayer(AliITSUSeed* seed, AliITSURecoLayer* lr, Int_t dir, Bool_t check)
 848 {
 849   // go to the exit from lr in direction dir, applying material corrections in steps specific for this layer
 850   // If check is requested, do this only provided the track has not exited the layer already
 851   double xToGo = lr->GetR(dir);
 852   if (check) { // do we need to track till the surface of the current layer ?
 853     double curR2 = seed->GetX()*seed->GetX() + seed->GetY()*seed->GetY(); // current radius
 854 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 855     AliDebug(3,Form(" dir:%d Cur: %e Tgt: %e",dir,Sqrt(curR2),xToGo));
 856 #endif
 857     if      (dir>0) { if (curR2-xToGo*xToGo>-fgkToler) return kTRUE; } // on the surface or outside of the layer
 858     else if (dir<0) { if (xToGo*xToGo-curR2>-fgkToler) return kTRUE; } // on the surface or outside of the layer
 859   }
 860   if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) return kFALSE;
 861   // go via layer to its boundary, applying material correction.
 862   if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass, lr->GetMaxStep())) return kFALSE;
 863   //
 864   return kTRUE;
 865   //
 866 }
 867
 868 //_________________________________________________________________________
 869 Bool_t AliITSUTrackerGlo::GoToExitFromLayer(AliExternalTrackParam* seed, AliITSURecoLayer* lr, Int_t dir, Bool_t check)
 870 {
 871   // go to the exit from lr in direction dir, applying material corrections in steps specific for this layer
 872   // If check is requested, do this only provided the track has not exited the layer already
 873   double xToGo = lr->GetR(dir);
 874   if (check) { // do we need to track till the surface of the current layer ?
 875     double curR2 = seed->GetX()*seed->GetX() + seed->GetY()*seed->GetY(); // current radius
 876     if      (dir>0) { if (curR2-xToGo*xToGo>-fgkToler) return kTRUE; } // on the surface or outside of the layer
 877     else if (dir<0) { if (xToGo*xToGo-curR2>-fgkToler) return kTRUE; } // on the surface or outside of the layer
 878   }
 879 #ifdef _ITSU_DEBUG_
 880   AliDebug(2,Form(" dir=%d : from R=%.4f -> R=%.4f",dir,Sqrt(seed->GetX()*seed->GetX() + seed->GetY()*seed->GetY()), xToGo));
 881 #endif
 882   if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) return kFALSE;
 883   // go via layer to its boundary, applying material correction.
 884   if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass, lr->GetMaxStep())) return kFALSE;
 885   //
 886   return kTRUE;
 887   //
 888 }
 889
 890
 891 //_________________________________________________________________________
 892 Bool_t AliITSUTrackerGlo::GoToEntranceToLayer(AliITSUSeed* seed, AliITSURecoLayer* lr, Int_t dir, Bool_t check)
 893 {
 894   // go to the entrance of lr in direction dir, w/o applying material corrections.
 895   // If check is requested, do this only provided the track did not reach the layer already
 896   double xToGo = lr->GetR(-dir);
 897   if (check) { // do we need to track till the surface of the current layer ?
 898     double curR2 = seed->GetX()*seed->GetX() + seed->GetY()*seed->GetY(); // current radius
 899     if      (dir>0) { if (curR2-xToGo*xToGo>-fgkToler) return kTRUE; } // already passed
 900     else if (dir<0) { if (xToGo*xToGo-curR2>-fgkToler) return kTRUE; } // already passed
 901   }
 902   if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) return kFALSE;
 903   // go via layer to its boundary, applying material correction.
 904   if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass, 100, kFALSE)) return kFALSE;
 905   return kTRUE;
 906   //
 907 }
 908
 909 //_________________________________________________________________________
 910 Bool_t AliITSUTrackerGlo::GoToEntranceToLayer(AliExternalTrackParam* seed, AliITSURecoLayer* lr, Int_t dir, Bool_t check)
 911 {
 912   // go to the entrance of lr in direction dir, w/o applying material corrections.
 913   // If check is requested, do this only provided the track did not reach the layer already
 914   double xToGo = lr->GetR(-dir);
 915   if (check) { // do we need to track till the surface of the current layer ?
 916     double curR2 = seed->GetX()*seed->GetX() + seed->GetY()*seed->GetY(); // current radius
 917     if      (dir>0) { if (curR2-xToGo*xToGo>-fgkToler) return kTRUE; } // already passed
 918     else if (dir<0) { if (xToGo*xToGo-curR2>-fgkToler) return kTRUE; } // already passed
 919   }
 920   if (!seed->GetXatLabR(xToGo,xToGo,GetBz(),dir)) return kFALSE;
 921   // go via layer to its boundary, applying material correction.
 922   if (!PropagateSeed(seed,xToGo,fCurrMass, 100, kFALSE)) return kFALSE;
 923   return kTRUE;
 924   //
 925 }
 926
 927 //_________________________________________________________________________
 928 Bool_t AliITSUTrackerGlo::GetRoadWidth(AliITSUSeed* seed, int ilrA)
 929 {
 930   // calculate road width in terms of phi and z for the track which MUST be on the external radius of the layer
 931   // as well as some aux info
 932   double bz = GetBz();
 933   AliITSURecoLayer* lrA = fITS->GetLayerActive(ilrA);
 934   seed->GetXYZ(&fTrImpData[kTrXIn]);    // lab position at the entrance from above
 935   static AliExternalTrackParam sc;   // seed copy for manipulations
 936   sc = *seed;
 937   //
 938   fTrImpData[kTrPhiIn] = ATan2(fTrImpData[kTrYIn],fTrImpData[kTrXIn]);
 939   if (!sc.Rotate(fTrImpData[kTrPhiIn])) return kFALSE; // go to the frame of the entry point into the layer
 940   double dr  = lrA->GetDR();                              // approximate X dist at the inner radius
 941   if (!sc.GetXYZAt(sc.GetX()-dr, bz, fTrImpData + kTrXOut)) {
 942     // special case: track does not reach inner radius, might be tangential
 943     double r = sc.GetD(0,0,bz);
 944     double x;
 945     if (!sc.GetXatLabR(r,x,bz,-1)) return kFALSE;
 946     dr = Abs(sc.GetX() - x);
 947     if (!sc.GetXYZAt(x, bz, fTrImpData + kTrXOut)) return kFALSE;
 948   }
 949   //
 950   fTrImpData[kTrPhiOut] = ATan2(fTrImpData[kTrYOut],fTrImpData[kTrXOut]);
 951   double sgy = sc.GetSigmaY2() + dr*dr*sc.GetSigmaSnp2() + AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaY2(ilrA);
 952   double sgz = sc.GetSigmaZ2() + dr*dr*sc.GetSigmaTgl2() + AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaZ2(ilrA);
 953   sgy = Sqrt(sgy)*fCurrTrackCond->GetNSigmaRoadY(ilrA);
 954   sgz = Sqrt(sgz)*fCurrTrackCond->GetNSigmaRoadZ(ilrA);
 955   double dphi0 = 0.5*Abs(fTrImpData[kTrPhiOut]-fTrImpData[kTrPhiIn]);
 956   double phi0  = 0.5*(fTrImpData[kTrPhiOut]+fTrImpData[kTrPhiIn]);
 957   if ( dphi0>(0.5*Pi()) ) {
 958     // special case of angles around pi
 959     dphi0 = Abs(phi0);
 960     phi0  += Pi();
 961   }
 962
 963   fTrImpData[kTrPhi0] = phi0;
 964   fTrImpData[kTrZ0]   = 0.5*(fTrImpData[kTrZOut]+fTrImpData[kTrZIn]);
 965   dphi0 += sgy/lrA->GetR();
 966   fTrImpData[kTrDPhi] =  dphi0<PiOver2() ? dphi0 : PiOver2();
 967   fTrImpData[kTrDZ]   = 0.5*Abs(fTrImpData[kTrZOut]-fTrImpData[kTrZIn])   + sgz;
 968   //
 969   return kTRUE;
 970 }
 971
 972 //________________________________________
 973 void AliITSUTrackerGlo::ResetSeedsPool()
 974 {
 975   // mark all seeds in the pool as unused
 976   AliDebug(-1,Form("CurrentSize: %d, BookedUpTo: %d, free: %d",fSeedsPool.GetSize(),fSeedsPool.GetEntriesFast(),fNFreeSeeds));
 977   fNFreeSeeds = 0;
 978   fSeedsPool.Clear(); // seeds don't allocate memory
 979 }
 980
 981
 982 //________________________________________
 983 void AliITSUTrackerGlo::MarkSeedFree(AliITSUSeed *sd)
 984 {
 985   // account that this seed is "deleted"
 986   int id = sd->GetPoolID();
 987   if (id<0) {
 988     AliError(Form("Freeing of seed %p NOT from the pool is requested",sd));
 989     return;
 990   }
 991   //  AliInfo(Form("%d %p",id, seed));
 992   fSeedsPool.RemoveAt(id);
 993   if (fFreeSeedsID.GetSize()<=fNFreeSeeds) fFreeSeedsID.Set( 2*fNFreeSeeds + 100 );
 994   fFreeSeedsID.GetArray()[fNFreeSeeds++] = id;
 995 }
 996
 997 //_________________________________________________________________________
 998 Int_t AliITSUTrackerGlo::CheckCluster(AliITSUSeed* track, Int_t lr, Int_t clID)
 999 {
1000   // Check if the cluster (in tracking frame!) is matching to track.
1001   // The track must be already propagated to sensor tracking frame.
1002   // Returns:  kStopSearchOnSensor if the search on given sensor should be stopped,
1003   //           kClusterMatching    if the cluster is matching
1004   //           kClusterMatching    otherwise
1005   //
1006   const double kTolerX = 5e-4;
1007   //  AliCluster *cl = fITS->GetLayerActive(lr)->GetCluster(clID);
1008   AliCluster *cl = fCurrLayer->GetCluster(clID);
1009   //
1010   Bool_t goodCl = kFALSE;
1011   int currLabel = Abs(fCurrESDtrMClb);
1012   //
1013   if (cl->GetLabel(0)>=0) {
1014     for (int i=0;i<3;i++) if (cl->GetLabel(i)>=0 && cl->GetLabel(i)==currLabel) {goodCl = kTRUE; break;}
1015   }
1016   //
1017   if (TMath::Abs(cl->GetX())>kTolerX) { // if due to the misalingment X is large, propagate track only
1018     if (!track->PropagateParamOnlyTo(track->GetX()+cl->GetX(),GetBz())) {
1019       //
1020 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1021       if (AliDebugLevelClass()>2 && goodCl && !track->ContainsFake()) {
1022         AliDebug(2,Form("Lost good cl on L:%d failed propagation. |ESDtrack#%d (MClb:%d)",lr,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
1023         track->Print("etp");
1024         cl->Print();
1025       }
1026 #endif
1027       return kStopSearchOnSensor; // propagation failed, seedT is intact
1028     }
1029   }
1030   double dy = cl->GetY()-track->GetY();
1031   double dz = cl->GetZ()-track->GetZ();
1032   //
1033   double dy2 = dy*dy;
1034   double tol2 = (track->GetSigmaY2() + AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaY2(lr))*
1035     fCurrTrackCond->GetNSigmaRoadY(lr)*fCurrTrackCond->GetNSigmaRoadY(lr); // RS TOOPTIMIZE
1036   if (dy2>tol2) {                          // the clusters are sorted in Z(col) then in Y(row).
1037     //
1038 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1039     if (AliDebugLevelClass()>2 && goodCl &&  !track->ContainsFake()) {
1040       AliDebug(2,Form("Lost good cl: dy2=%e > tol2=%e |ESDtrack#%d (MClb:%d)",dy2,tol2,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
1041       track->Print("etp");
1042       cl->Print();
1043       PrintSeedClusters(track);
1044     }
1045 #endif
1046     // clusters are sorted in increasing Y and the loop goes from last (highers Y) to 1st.
1047     // if the track has too large y for this cluster (dy<0) it will be so for all other clusters of the sensor
1048     if (dy<0) return kStopSearchOnSensor;  // No chance that other cluster of this sensor will match (all Y's will be even larger)
1049     else      return kClusterNotMatching;   // Other clusters may match
1050   }
1051   double dz2 = dz*dz;
1052   tol2 = (track->GetSigmaZ2() + AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaZ2(lr))*
1053     fCurrTrackCond->GetNSigmaRoadZ(lr)*fCurrTrackCond->GetNSigmaRoadZ(lr); // RS TOOPTIMIZE
1054   if (dz2>tol2) {
1055 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1056     if (AliDebugLevelClass()>2 && goodCl &&  !track->ContainsFake()) {
1057       AliDebug(2,Form("Lost good cl on L:%d : dz2=%e > tol2=%e |ESDtrack#%d (MClb:%d)",lr,dz2,tol2,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
1058       track->Print("etp");
1059       cl->Print();
1060       PrintSeedClusters(track);
1061     }
1062 #endif
1063     return kClusterNotMatching; // Other clusters may match
1064   }
1065   //
1066   // check chi2
1067   Double_t p[2]={cl->GetY(), cl->GetZ()};
1068   Double_t cov[3]={cl->GetSigmaY2(), cl->GetSigmaYZ(), cl->GetSigmaZ2()};
1069   double chi2 = track->GetPredictedChi2(p,cov);
1070   //
1071   if (chi2>fCurrTrackCond->GetMaxTr2ClChi2(lr)) {
1072 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1073     if (AliDebugLevelClass()>2 && goodCl &&  !track->ContainsFake()) {
1074       AliDebug(2,Form("Lost good cl on L:%d : Chi2=%e > Chi2Max=%e |dy: %+.3e dz: %+.3e |ESDtrack#%d (MClb:%d)\n",
1075                       lr,chi2,fCurrTrackCond->GetMaxTr2ClChi2(lr),dy,dz,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
1076       track->Print("etp");
1077       cl->Print("");
1078       PrintSeedClusters(track);
1079     }
1080 #endif
1081     return kClusterNotMatching;
1082   }
1083   //
1084   track = NewSeedFromPool(track);  // input track will be reused, use its clone for updates
1085   if (!track->Update()) {
1086 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1087     if (AliDebugLevelClass()>2 && goodCl &&  !track->ContainsFake()) {
1088       AliDebug(2,Form("Lost good cluster on L:%d : failed to update",lr));
1089       track->Print("etp");
1090       cl->Print("");
1091       PrintSeedClusters(track);
1092     }
1093 #endif
1094     MarkSeedFree(track);
1095     return kClusterNotMatching;
1096   }
1097   track->SetChi2Cl(chi2);
1098   track->SetLrClusterID(lr,clID);
1099   //
1100   if (track->GetChi2GloNrm()>fCurrTrackCond->GetMaxChi2GloNrm(lr)) {
1101 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1102     if (AliDebugLevelClass()>2 && goodCl &&  !track->ContainsFake()) {
1103       AliDebug(2,Form("Lost good cl on L:%d : Chi2Glo=%e > Chi2Max=%e |dy: %+.3e dz: %+.3e |ESDtrack#%d (MClb:%d)\n",
1104                       lr,track->GetChi2GloNrm(),fCurrTrackCond->GetMaxChi2GloNrm(lr),dy,dz,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb));
1105       track->Print("etp");
1106       cl->Print("");
1107       PrintSeedClusters(track);
1108     }
1109 #endif
1110     MarkSeedFree(track);
1111     return kClusterNotMatching;
1112   }
1113   //  cl->IncreaseClusterUsage(); // do this only for winners
1114   //
1115   track->SetFake(!goodCl);
1116   //
1117 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1118   AliDebug(2,Form("AddCl(%d) Cl%d lr:%d: dY:%+8.4f dZ:%+8.4f (MC: %5d %5d %5d) |Chi2=%f(%c)| ",
1119                goodCl,clID,lr,dy,dz2,cl->GetLabel(0),cl->GetLabel(1),cl->GetLabel(2), chi2, track->IsFake() ? '-':'+'));
1120 #endif
1121   //
1122   AddSeedBranch(track);
1123   //
1124   return kClusterMatching;
1125 }
1126
1127 //_________________________________________________________________________
1128 Bool_t AliITSUTrackerGlo::NeedToKill(AliITSUSeed *seed, Int_t flag)
1129 {
1130   // check if the seed should not be discarded
1131   const UShort_t kMask = 0xffff;
1132   if (flag==kMissingCluster) {
1133     int lastChecked = seed->GetLayerID();
1134     UShort_t patt = seed->GetHitsPattern();
1135     if (lastChecked) patt |= (~(kMask<<lastChecked))&fCurrTrackCond->GetAllowedLayers(); // not all layers were checked, complete unchecked ones by potential hits
1136     Bool_t seedOK = fCurrTrackCond->CheckPattern(patt);
1137     return !seedOK;
1138   }
1139   return kTRUE;
1140 }
1141
1142 //______________________________________________________________________________
1143 Bool_t AliITSUTrackerGlo::PropagateSeed(AliITSUSeed *seed, Double_t xToGo, Double_t mass, Double_t maxStep, Bool_t matCorr)
1144 {
1145   // propagate seed to given x applying material correction if requested
1146   const Double_t kEpsilon = 1e-5;
1147   Double_t xpos     = seed->GetX();
1148   Int_t dir         = (xpos<xToGo) ? 1:-1;
1149   Double_t xyz0[3],xyz1[3];
1150   //
1151   Bool_t updTime = dir>0 && seed->IsStartedTimeIntegral();
1152   if (matCorr || updTime) seed->GetXYZ(xyz1);   //starting global position
1153   while ( (xToGo-xpos)*dir > kEpsilon){
1154     Double_t step = dir*TMath::Min(TMath::Abs(xToGo-xpos), maxStep);
1155     Double_t x    = xpos+step;
1156     Double_t bz=GetBz();   // getting the local Bz
1157     if (!seed->PropagateToX(x,bz)) return kFALSE;
1158     double ds = 0;
1159     if (matCorr || updTime) {
1160       xyz0[0]=xyz1[0]; // global pos at the beginning of step
1161       xyz0[1]=xyz1[1];
1162       xyz0[2]=xyz1[2];
1163       seed->GetXYZ(xyz1);    //  // global pos at the end of step
1164       if (matCorr) {
1165         Double_t xrho,xx0;
1166         ds = GetMaterialBudget(xyz0,xyz1,xx0,xrho);
1167         if (dir>0) xrho = -xrho; // outward should be negative
1168         if (!seed->ApplyMaterialCorrection(xx0,xrho,mass,kFALSE)) {AliInfo("Fail2"); seed->Print("etp"); return kFALSE;}
1169       }
1170        else { // matCorr is not requested but time integral is
1171         double d0 = xyz1[0]-xyz0[0];
1172         double d1 = xyz1[1]-xyz0[1];
1173         double d2 = xyz1[2]-xyz0[2];
1174         ds = TMath::Sqrt(d0*d0+d1*d1+d2*d2);
1175       }
1176     }
1177     if (updTime) seed->AddTimeStep(ds);
1178     xpos = seed->GetX();
1179   }
1180   return kTRUE;
1181 }
1182
1183 //______________________________________________________________________________
1184 Bool_t AliITSUTrackerGlo::PropagateSeed(AliExternalTrackParam *seed, Double_t xToGo, Double_t mass, Double_t maxStep, Bool_t matCorr)
1185 {
1186   // propagate seed to given x applying material correction if requested
1187   const Double_t kEpsilon = 1e-5;
1188   Double_t xpos     = seed->GetX();
1189   Int_t dir         = (xpos<xToGo) ? 1:-1;
1190   Double_t xyz0[3],xyz1[3];
1191   //
1192 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1193   if (AliDebugLevelClass()>1) {
1194     AliDebug(2,Form("Before Propagate to X=%f with M=%.3f MaxStep=%.4f MatCorr=%d",xToGo,mass,maxStep,matCorr));
1195     seed->AliExternalTrackParam::Print();
1196   }
1197 #endif
1198   Bool_t updTime = dir>0 && seed->IsStartedTimeIntegral();
1199   if (matCorr || updTime) seed->GetXYZ(xyz1);   //starting global position
1200   while ( (xToGo-xpos)*dir > kEpsilon){
1201     Double_t step = dir*TMath::Min(TMath::Abs(xToGo-xpos), maxStep);
1202     Double_t x    = xpos+step;
1203     Double_t bz=GetBz();   // getting the local Bz
1204     if (!seed->PropagateTo(x,bz))  return kFALSE;
1205     double ds = 0;
1206     if (matCorr || updTime) {
1207       xyz0[0]=xyz1[0]; // global pos at the beginning of step
1208       xyz0[1]=xyz1[1];
1209       xyz0[2]=xyz1[2];
1210       seed->GetXYZ(xyz1);    //  // global pos at the end of step
1211       //
1212       if (matCorr) {
1213         Double_t xrho,xx0;
1214         ds = GetMaterialBudget(xyz0,xyz1,xx0,xrho);
1215         if (dir>0) xrho = -xrho; // outward should be negative
1216         if (!seed->CorrectForMeanMaterial(xx0,xrho,mass)) return kFALSE;
1217       }
1218       else { // matCorr is not requested but time integral is
1219         double d0 = xyz1[0]-xyz0[0];
1220         double d1 = xyz1[1]-xyz0[1];
1221         double d2 = xyz1[2]-xyz0[2];
1222         ds = TMath::Sqrt(d0*d0+d1*d1+d2*d2);
1223       }
1224     }
1225     if (updTime) seed->AddTimeStep(ds);
1226     //
1227     xpos = seed->GetX();
1228   }
1229 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1230   if (AliDebugLevelClass()>1) {
1231     AliDebug(2,Form("After Propagate to X=%f",xToGo));
1232     seed->AliExternalTrackParam::Print();
1233   }
1234 #endif
1235   return kTRUE;
1236 }
1237
1238 //______________________________________________________________________________
1239 Bool_t AliITSUTrackerGlo::FinalizeHypothesis(AliITSUTrackHyp* hyp)
1240 {
1241   // finalize single TPC track hypothesis
1242   if (!hyp || hyp->GetESDTrack()->IsOn(AliESDtrack::kITSin)) return kFALSE;
1243   AliITSUSeed* winner = 0;
1244   fCurrHyp = hyp;
1245   fCurrMass = hyp->GetMass();
1246   if (!(winner=hyp->DefineWinner(fCurrTrackCond->GetActiveLrInner()))) return kFALSE;
1247   CookMCLabel(hyp);
1248   //
1249 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_  // fill tuning histos
1250   TObjArray* dest = hyp->GetLabel()>=0 ? fCHistoArrCorr : fCHistoArrFake;
1251   if (dest) {
1252     AliITSUSeed* sd = winner;
1253     double htrPt = hyp->Pt();
1254     do {
1255       int clID,lrID;
1256       if ( (clID=sd->GetLrCluster(lrID))<0 ) continue;
1257       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHChi2Nrm     ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetChi2GloNrm());
1258       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHBestInBranch,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetOrdBranch());
1259       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHBestInCand  ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetOrdCand());
1260       //
1261       if (dest==fCHistoArrFake && !sd->IsFake()) continue; // for the fake seeds fill only fake clusters part
1262       //
1263       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHResY        ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetResidY());
1264       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHResZ        ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetResidZ());
1265       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHResYP       ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetPullY());
1266       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHResZP       ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetPullZ());
1267       ((TH2*)dest->At( GetHistoID(lrID,kHChi2Cl      ,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,sd->GetChi2Cl());
1268       //
1269     } while((sd=(AliITSUSeed*)sd->GetParent()));
1270     //
1271     ((TH2*)dest->At( GetHistoID(-1,kHChiMatch,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,winner->GetChi2ITSTPC());
1272     ((TH2*)dest->At( GetHistoID(-1,kHChiITSSA,fCurrPassID) ))->Fill(htrPt,winner->GetChi2ITSSA());
1273   }
1274   //
1275 #endif
1276   //
1277   CheckClusterSharingConflicts(hyp);
1278   return hyp->GetWinner();  // winner might change of disappear after resolving conflicts
1279   //
1280 }
1281
1282 //______________________________________________________________________________
1283 void AliITSUTrackerGlo::FinalizeHypotheses()
1284 {
1285   // select winner for each hypothesis, remove cl. sharing conflicts
1286   AliCodeTimerAuto("",0);
1287   //
1288   int* esdTrackIndex = fESDIndex.GetArray();
1289   for (int ih=0;ih<fNTracksESD;ih++) FinalizeHypothesis(GetTrackHyp(esdTrackIndex[ih])); // finlize in decreasing pt order
1290   //
1291   for (int ih=fNTracksESD;ih--;) UpdateESDTrack(GetTrackHyp(esdTrackIndex[ih]),AliESDtrack::kITSin);
1292   //
1293 }
1294
1295 //______________________________________________________________________________
1296 void AliITSUTrackerGlo::CheckClusterSharingConflicts(AliITSUTrackHyp* hyp)
1297 {
1298   // remove eventual cluster sharing conflicts
1299   AliITSUSeed* winner = 0;
1300   if (!(winner=hyp->GetWinner())) return;
1301   UShort_t idH = (UShort_t)hyp->GetUniqueID()+1;
1302   int lrID,clID;
1303   int inLr = fCurrTrackCond->GetActiveLrInner();
1304   AliITSUSeed* winSD=winner;
1305   do {
1306     if ( (clID=winSD->GetLrCluster(lrID))<0 ) continue;
1307     AliITSUClusterPix* cl = (AliITSUClusterPix*)fITS->GetLayerActive(lrID)->GetCluster(clID);
1308     Int_t refID = cl->GetRecoInfo();                // was it already referred by some track (with refID-1 if >0)
1309     if (!refID) {cl->SetRecoInfo(idH); continue;}   // if not, refer from track to cluster
1310     if (refID==idH) continue;                          // ignore reference to itself
1311     // the cluster is already used by other track, need to resolve the conflict
1312     AliITSUTrackHyp* hypC = GetTrackHyp(refID-1);   // competitor
1313     //    printf("Ref to %d (%p) from %d Cl %d %d\n",refID-1,hypC, idH-1,clID,lrID);
1314     AliITSUSeed* winnerC = hypC->GetWinner();
1315     if (!winnerC) {
1316       printf("Missing winner, ERROR\n");
1317       continue;
1318     }
1319     //
1320 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1321     if (AliDebugLevelClass()>1) { //------------------------ DEBUG -------------------
1322       AliInfo(Form("Shared cl#%4d on Lr:%d: Hyp%3d/Q:%6.3f vs Hyp%3d/Q:%6.3f",
1323                    clID,lrID,idH-1,winner->GetQualityVar(),refID-1,winnerC->GetQualityVar()));
1324       // dump winner of hyp
1325       printf("#%4d Pt:%.3f Chi:%6.3f/%6.3f/%6.3f Ncl:%d MCits%+5d MCtpc:%+5d |",
1326              idH-1,winner->Pt(),winner->GetChi2GloNrm(),winner->GetChi2ITSTPC(),winner->GetChi2ITSSA(),
1327              winner->GetNLayersHit(),hyp->GetITSLabel(),hyp->GetESDTrack()->GetTPCLabel());
1328       int prevL=-1;
1329       AliITSUSeed* sd = winner;
1330       do {
1331         int lrs;
1332         int clIDt = sd->GetLrCluster(lrs);
1333         if (clIDt<0) continue;
1334         while( lrs>++prevL ) printf("%4s        ","----");
1335         printf("%4d (%5.1f)",clIDt,sd->GetChi2Cl());
1336       } while ((sd=(AliITSUSeed*)sd->GetParent()));
1337       printf("|\n");
1338       // dump winner of hypC
1339       printf("#%4d Pt:%.3f Chi:%6.3f/%6.3f/%6.3f Ncl:%d MCits%+5d MCtpc:%+5d |",
1340              refID-1,winnerC->Pt(),winnerC->GetChi2GloNrm(),winnerC->GetChi2ITSTPC(),winnerC->GetChi2ITSSA(),
1341              winnerC->GetNLayersHit(),hypC->GetITSLabel(),hypC->GetESDTrack()->GetTPCLabel());
1342       prevL=-1;
1343       sd = winnerC;
1344       do {
1345         int lrs;
1346         int clIDt = sd->GetLrCluster(lrs);
1347         if (clIDt<0) continue;
1348         while( lrs>++prevL ) printf("%4s        ","----");
1349         printf("%4d (%5.1f)",clIDt,sd->GetChi2Cl());
1350       } while ((sd=(AliITSUSeed*)sd->GetParent()));
1351       printf("|\n");
1352     }  //-------------------------------------------------- DEBUG -------------------
1353 #endif
1354     //
1355     if (winner->GetQualityVar()<winnerC->GetQualityVar()) { // current tracks is better then competitor track
1356       FlagSeedClusters(winnerC,kFALSE,refID); // unflag cluster usage by loser
1357       cl->SetRecoInfo(idH);
1358       //
1359       //if ( hypC->GetLabel()>=0) AliInfo(Form("KILLING CORRECT: %d",refID-1));
1360       winnerC->Kill();
1361       if (hypC->DefineWinner(inLr)) {             // find new winner instead of suppressed candidate
1362         CookMCLabel(hypC);
1363         CheckClusterSharingConflicts(hypC);   // and check its sharing conflicts again
1364         if (winner->IsKilled()) break;        // the current winner might have been killed during check of new winner of hypC!
1365       }
1366     }
1367     else { // competitor hypC is better than the hyp
1368       FlagSeedClusters(winner,kFALSE,idH); // unflag cluster usage by loser
1369       winner->Kill();
1370       //if ( hyp->GetLabel()>=0) AliInfo(Form("KILLING CORRECT: %d",idH-1));
1371       if (hyp->DefineWinner(inLr)) {
1372         CookMCLabel(hyp);
1373         CheckClusterSharingConflicts(hyp);
1374       }
1375       break;
1376     }
1377     //
1378   } while ((winSD=(AliITSUSeed*)winSD->GetParent()));
1379   //
1380   return;
1381 }
1382
1383 //______________________________________________________________________________
1384 void AliITSUTrackerGlo::UpdateESDTrack(AliITSUTrackHyp* hyp,Int_t flag)
1385 {
1386   // update ESD track with current best hypothesis
1387   if (!hyp) return;
1388   AliESDtrack* esdTr = hyp->GetESDTrack();
1389   if (!esdTr || esdTr->IsOn(flag)) return;
1390   AliITSUSeed* win = hyp->GetWinner();
1391   if (!win || win->IsKilled()) return;
1392   double chiSav;
1393   //
1394   switch (flag) {
1395   case AliESDtrack::kITSin:
1396     esdTr->UpdateTrackParams(hyp,flag); // update kinematics
1397     fCountITSin++;
1398     // set fakes cluster info
1399     {
1400       UShort_t clfake = 0;
1401       Int_t    clSplit = 0;
1402       AliITSUSeed* sd = win;
1403       int ip=0;
1404       do {
1405         int lr, clID = sd->GetLrCluster(lr);
1406         if (sd->IsFake()) clfake |= 0x1<<lr;
1407         if (clID>=0) {
1408           esdTr->SetITSModuleIndex(ip++, sd->GetLrClusterID());
1409           AliITSUClusterPix *cl = (AliITSUClusterPix*)fITS->GetLayerActive(lr)->GetCluster(clID);
1410 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
1411           if (cl->IsSplit()) clSplit |= 0x1<<lr;
1412 #endif
1413         }
1414       } while ((sd=(AliITSUSeed*)sd->GetParent()));
1415       //
1416       // RS: Temporary set special flag for tracks from the afterburner
1417       if (fCurrPassID>0) clfake |= 0x1<<7;
1418       //
1419       esdTr->SetITSSharedMap(clfake);
1420       esdTr->SetITSModuleIndex(10,clSplit);
1421     }
1422     // TEMPORARY: store iteration id
1423     esdTr->SetITSModuleIndex(11,fCurrPassID);
1424     break;
1425     //
1426   case AliESDtrack::kITSout:
1427     // here the stored chi2 will correspond to backward ITS-SA fit
1428     esdTr->UpdateTrackParams(hyp,flag); // update kinematics
1429     fCountITSout++;
1430     // TODO: avoid setting friend
1431     break;
1432     //
1433   case AliESDtrack::kITSrefit:
1434
1435     // at the moment fill as a chi2 the TPC-ITS matching chi2
1436     chiSav = hyp->GetChi2();
1437     hyp->SetChi2(win->GetChi2ITSTPC());
1438     esdTr->UpdateTrackParams(hyp,flag); // update kinematics
1439     hyp->SetChi2(chiSav);
1440     fCountITSrefit++;
1441     // TODO: avoid setting cluster info
1442     break;
1443   default:
1444     AliFatal(Form("Unknown flag %d",flag));
1445   }
1446   //
1447   esdTr->SetITSLabel(hyp->GetITSLabel());
1448   // transfer module indices
1449   // TODO
1450 }
1451
1452 //______________________________________________________________________________
1453 Double_t AliITSUTrackerGlo::RefitTrack(AliITSUTrackHyp* trc, Double_t rDest, Int_t &nclFit, Int_t stopCond)
1454 {
1455   // refit track till radius rDest. The cluster,mass info is taken from fCurrHyp (and its winner seed)
1456   // if stopCond<0 : propagate till last cluster then stop
1457   // if stopCond==0: propagate till last cluster then try to go till limiting rDest, don't mind if fail
1458   // if stopCond>0 : rDest must be reached
1459   //
1460   double rCurr = Sqrt(trc->GetX()*trc->GetX() + trc->GetY()*trc->GetY());
1461   int dir,lrStart,lrStop;
1462   //
1463   dir = rCurr<rDest ? 1 : -1;
1464   lrStart = fITS->FindFirstLayerID(rCurr,dir);
1465   lrStop  = fITS->FindLastLayerID(rDest,dir); // lr id before which we have to stop
1466   //
1467 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1468   if (AliDebugLevelClass()>2) {
1469     printf("Refit %d: Lr:%d (%f) -> Lr:%d (%f)\n",dir,lrStart,rCurr, lrStop,rDest);
1470     printf("Before refit: "); trc->Print();
1471   }
1472 #endif
1473   if (lrStop<0 || lrStart<0) AliFatal(Form("Failed to find start(%d) or last(%d) layers. Track from %.3f to %.3f",lrStart,lrStop,rCurr,rDest));
1474   //
1475   Int_t clInfo[2*AliITSUAux::kMaxLayers];
1476   Int_t nCl = fCurrHyp->FetchClusterInfo(clInfo);
1477   fCurrMass = fCurrHyp->GetMass();
1478   AliITSUTrackHyp tmpTr(*(AliKalmanTrack*)trc);
1479   double chi2 = 0;
1480   int iclLr[2],nclLr;
1481   nclFit = 0;
1482   //
1483   int lrStop1 = lrStop+dir;
1484   for (int ilr=lrStart;ilr!=lrStop1;ilr+=dir) {
1485     AliITSURecoLayer* lr = fITS->GetLayer(ilr);
1486     if ( dir*(rCurr-lr->GetR(dir))>0) continue; // this layer is already passed
1487     int ilrA2,ilrA = lr->GetActiveID();
1488     // passive layer or active w/o hits will be traversed on the way to next cluster
1489     if (!lr->IsActive() || clInfo[ilrA2=(ilrA<<1)]<0) continue;
1490     //
1491     // select the order in which possible 2 clusters (in case of the overlap) will be traversed and fitted
1492     nclLr=0;
1493     if (dir>0) { // clusters are stored in increasing radius order
1494       iclLr[nclLr++]=clInfo[ilrA2++];
1495       if (clInfo[ilrA2]>=0) iclLr[nclLr++]=clInfo[ilrA2];
1496     }
1497     else {
1498       if ( clInfo[ilrA2+1]>=0 ) iclLr[nclLr++]=clInfo[ilrA2+1];
1499       iclLr[nclLr++]=clInfo[ilrA2];
1500     }
1501     //
1502     Bool_t transportedToLayer = kFALSE;
1503     for (int icl=0;icl<nclLr;icl++) {
1504       AliITSUClusterPix* clus =  (AliITSUClusterPix*)lr->GetCluster(iclLr[icl]);
1505       AliITSURecoSens* sens = lr->GetSensorFromID(clus->GetVolumeId());
1506       if (!tmpTr.Rotate(sens->GetPhiTF())) {
1507 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1508         AliESDtrack* trESD = fCurrHyp->GetESDTrack();
1509         AliDebug(2,Form("Failed on rotate to %f | ESDtrack#%d (MClb:%d)",sens->GetPhiTF(),trESD->GetID(),trESD->GetTPCLabel()));
1510 #endif
1511         return -1;
1512       }
1513       //
1514       double xClus = sens->GetXTF()+clus->GetX();
1515       if (!transportedToLayer) {
1516         if (ilr!=lrStart && !TransportToLayerX(&tmpTr,lrStart,ilr,xClus)) {
1517 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1518           AliESDtrack* trESD = fCurrHyp->GetESDTrack();
1519           AliDebug(2,Form("Failed to transport %d -> %d | ESDtrack#%d (MClb:%d)\n",lrStart,ilr,trESD->GetID(),trESD->GetTPCLabel()));
1520 #endif
1521           return -1; // go to the entrance to the layer
1522         }
1523         lrStart = ilr;
1524         transportedToLayer = kTRUE;
1525       }
1526       //
1527 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1528       if (AliDebugLevelClass()>1) {
1529         AliDebug(2,Form("Propagate to cl:%d on lr %d Need to go %.4f -> %.4f",icl,ilrA,tmpTr.GetX(),xClus));
1530       }
1531 #endif
1532       //
1533       if (!PropagateSeed(&tmpTr,xClus,fCurrMass)) {
1534 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1535         AliESDtrack* trESD = fCurrHyp->GetESDTrack();
1536         AliDebug(2,Form("Failed on propagate to %f (dir=%d) | ESDtrack#%d (MClb:%d)",xClus,dir,trESD->GetID(),trESD->GetTPCLabel()));
1537 #endif
1538         return -1;
1539       }
1540       //
1541       Double_t p[2]={clus->GetY(), clus->GetZ()};
1542       Double_t cov[3]={clus->GetSigmaY2(), clus->GetSigmaYZ(), clus->GetSigmaZ2()};
1543       double chi2cl = tmpTr.GetPredictedChi2(p,cov);
1544       chi2 += chi2cl;
1545       //
1546 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
1547       TObjArray* dest = trc->GetLabel()>=0 ? fCHistoArrCorr : fCHistoArrFake;
1548       if (dest && fTrackPhaseID>kClus2Tracks) {
1549         //
1550         double htrPt = tmpTr.Pt();
1551         double dy = p[0]-tmpTr.GetY();
1552         double dz = p[1]-tmpTr.GetZ();
1553         ((TH2*)dest->At( GetHistoID(ilrA,kHResY,0,fTrackPhaseID) ))->Fill(htrPt,dy);
1554         ((TH2*)dest->At( GetHistoID(ilrA,kHResZ,0,fTrackPhaseID) ))->Fill(htrPt,dz);
1555         double errY = tmpTr.GetSigmaY2();
1556         double errZ = tmpTr.GetSigmaZ2();
1557         if (errY>0) ((TH2*)dest->At( GetHistoID(ilrA,kHResYP,0,fTrackPhaseID) ))->Fill(htrPt,dy/Sqrt(errY));
1558         if (errZ>0) ((TH2*)dest->At( GetHistoID(ilrA,kHResZP,0,fTrackPhaseID) ))->Fill(htrPt,dz/Sqrt(errZ));
1559         ((TH2*)dest->At( GetHistoID(ilrA,kHChi2Cl,0,fTrackPhaseID) ))->Fill(htrPt,chi2cl);
1560       }
1561 #endif
1562       //
1563       if ( !tmpTr.Update(p,cov) ) {
1564 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1565         AliESDtrack* trESD = fCurrHyp->GetESDTrack();
1566         AliDebug(2,Form("Failed on Update | ESDtrack#%d (MClb:%d)",trESD->GetID(),trESD->GetTPCLabel()));
1567 #endif
1568         return -1;
1569       }
1570 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1571       if (AliDebugLevelClass()>1) {
1572         printf("AfterRefit: "); tmpTr.Print();
1573       }
1574 #endif
1575       if (++nclFit==nCl && stopCond<0) {
1576         *trc = (AliKalmanTrack&)tmpTr;
1577         return chi2; // it was requested to not propagate after last update
1578       }
1579     }
1580     //
1581   }
1582   // All clusters were succesfully fitted. Even if the track does not reach rDest, this is enough to validate it.
1583   // Still, try to go as close as possible to rDest.
1584   //
1585   if (lrStart!=lrStop) {
1586     if (!TransportToLayer(&tmpTr,lrStart,lrStop)) {
1587 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1588       AliDebug(1,Form("Failed on TransportToLayer %d->%d | ESDtrack#%d (MClb:%d), X=%f",lrStart,lrStop,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb,tmpTr.GetX()));
1589 #endif
1590       return (stopCond>0) ? -chi2 : chi2; // rDest was obligatory
1591     }
1592     if (!GoToExitFromLayer(&tmpTr,fITS->GetLayer(lrStop),dir)) {
1593 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1594       AliDebug(1,Form("Failed on GoToExitFromLayer %d | ESDtrack#%d (MClb:%d), X=%f",lrStop,fCurrESDtrack->GetID(),fCurrESDtrMClb,tmpTr.GetX()));
1595 #endif
1596       return (stopCond>0) ? -chi2 : chi2; // rDest was obligatory
1597     }
1598   }
1599   // go to the destination radius. Note that here we don't select direction to avoid precision problems
1600   if (!tmpTr.GetXatLabR(rDest,rDest,GetBz(),0) || !PropagateSeed(&tmpTr,rDest,fCurrMass, 100, kFALSE)) {
1601     return (stopCond>0) ? -chi2 : chi2; // rDest was obligatory
1602   }
1603   *trc = (AliKalmanTrack&)tmpTr;
1604 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1605   if (AliDebugLevelClass()>2) {
1606     printf("After refit (now at lr %d): ",lrStop); trc->Print();
1607   }
1608 #endif
1609   return chi2;
1610 }
1611
1612 //__________________________________________________________________
1613 void AliITSUTrackerGlo::CookMCLabel(AliITSUTrackHyp* hyp)
1614 {
1615   // build MC label
1616   //
1617   const int kMaxLbPerCl = 3;
1618   int lbID[kMaxLayers*6],lbStat[kMaxLayers*6];
1619   Int_t lr,nLab=0,nCl=0;
1620   AliITSUSeed *seed = hyp->GetWinner();
1621   while(seed) {
1622     int clID = seed->GetLrCluster(lr);
1623     if (clID>=0) {
1624       AliCluster *cl = fITS->GetLayerActive(lr)->GetCluster(clID);
1625       nCl++;
1626       for (int imc=0;imc<kMaxLbPerCl;imc++) { // labels within single cluster
1627         int trLb = cl->GetLabel(imc);
1628         if (trLb<0) break;
1629         // search this mc track in already accounted ones
1630         int iLab;
1631         for (iLab=0;iLab<nLab;iLab++) if (lbID[iLab]==trLb) break;
1632         if (iLab<nLab) lbStat[iLab]++;
1633         else {
1634           lbID[nLab] = trLb;
1635           lbStat[nLab++] = 1;
1636         }
1637       } // loop over given cluster's labels
1638     }
1639     seed = (AliITSUSeed*)seed->GetParent();
1640   } // loop over clusters
1641   //
1642   AliESDtrack* esdTr = hyp->GetESDTrack();
1643   int tpcLab = esdTr ? Abs(esdTr->GetTPCLabel()) : -kDummyLabel;
1644   if (nCl && nLab) {
1645     int maxLab=0,nTPCok=0;
1646     for (int ilb=nLab;ilb--;) {
1647       int st = lbStat[ilb];
1648       if (lbStat[maxLab]<st) maxLab=ilb;
1649       if (tpcLab==lbID[ilb]) nTPCok += st;
1650     }
1651     hyp->SetFakeRatio(1.-float(nTPCok)/nCl);
1652     hyp->SetLabel( nTPCok==nCl ? tpcLab : -tpcLab);
1653     hyp->SetITSLabel( lbStat[maxLab]==nCl ? lbID[maxLab] : -lbID[maxLab]); // winner label
1654     return;
1655   }
1656   //
1657   hyp->SetFakeRatio(-1.);
1658   hyp->SetLabel( -tpcLab );
1659   hyp->SetITSLabel( kDummyLabel );
1660 }
1661
1662 //__________________________________________________________________
1663 Bool_t AliITSUTrackerGlo::AddSeedBranch(AliITSUSeed* seed)
1664 {
1665   // add new prolongation branch for the seed to temporary array. The seeds are sorted according to Compare f-n
1666   if (fNCandidatesAdded+fNBranchesAdded>=fLayerMaxCandidates ) {
1667     AliInfo(Form("Number of candidates at layer %d for current seed reached %d, increasing buffer",fCurrActLrID,fLayerMaxCandidates));
1668     fLayerMaxCandidates = 2*(fLayerMaxCandidates+1);
1669     AliITSUSeed** tmpArr = fLayerCandidates;
1670     fLayerCandidates = new AliITSUSeed*[fLayerMaxCandidates];
1671     memcpy(fLayerCandidates,tmpArr,(fNCandidatesAdded+fNBranchesAdded)*sizeof(AliITSUSeed*));
1672     delete tmpArr; // delete only array, not objects
1673   }
1674   AliITSUSeed** branches = &fLayerCandidates[fNCandidatesAdded]; // note: fNCandidatesAdded is incremented after adding all branches of current seed
1675   int slot=fNBranchesAdded++;
1676   for (int slotF=slot;slotF--;) { // slotF is always slot-1
1677     AliITSUSeed* si = branches[slotF];
1678     if (si->Compare(seed)<0) break; // found the last seed with better quality
1679     // otherwise, shift the worse seed to the next slot
1680     branches[slot] = si;
1681     slot = slotF; // slot should be slotF+1
1682   }
1683   // if needed, move worse seeds
1684   branches[slot] = seed;
1685   return kTRUE;
1686   //
1687 }
1688
1689 //__________________________________________________________________
1690 void AliITSUTrackerGlo::ValidateAllowedBranches(Int_t acceptMax)
1691 {
1692   // keep allowed number of branches for current seed and disable extras
1693   AliCodeTimerAuto("",0);
1694   int nb = Min(fNBranchesAdded,acceptMax);
1695   //  if (nb<fNBranchesAdded) printf("ValidateAllowedBranches: %d of %d (%d) on lr %d\n",nb,fNBranchesAdded,fNCandidatesAdded,ilr);
1696   // disable unused branches
1697   AliITSUSeed** branches = &fLayerCandidates[fNCandidatesAdded];
1698   //
1699 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
1700   for (int ib=0;ib<fNBranchesAdded;ib++) branches[ib]->SetOrdBranch(ib);
1701 #endif
1702   //
1703   for (int ib=nb;ib<fNBranchesAdded;ib++) MarkSeedFree(branches[ib]);
1704   fNCandidatesAdded += nb; // update total candidates counter
1705   fNBranchesAdded = 0; // reset branches counter
1706   //
1707 }
1708
1709 //__________________________________________________________________
1710 void AliITSUTrackerGlo::ValidateAllowedCandidates(Int_t ilr, Int_t acceptMax)
1711 {
1712   // transfer allowed number of branches to hypothesis container
1713   //
1714   AliCodeTimerAuto("",0);
1715   // sort candidates in increasing order of chi2
1716   static int lastSize = 0;
1717   static int *index = 0;
1718   static float *chi2 = 0;
1719   if (fLayerMaxCandidates>lastSize) {
1720     lastSize = fLayerMaxCandidates;
1721     delete[] index;
1722     delete[] chi2;
1723     index = new int[lastSize];
1724     chi2  = new float[lastSize];
1725   }
1726   for (int i=fNCandidatesAdded;i--;) chi2[i] = fLayerCandidates[i]->GetChi2GloNrm();
1727   Sort(fNCandidatesAdded,chi2,index,kFALSE);
1728   //
1729   int nacc=0,nb=0;
1730   if (ilr>fCurrTrackCond->GetActiveLrInner()) { // just take 1st acceptMax candidates
1731     nb = Min(fNCandidatesAdded,acceptMax);
1732     for (int ib=0;ib<nb;ib++) AddProlongationHypothesis(fLayerCandidates[index[ib]],ilr);
1733   }
1734   else { // for innermost layer test ITS SA backward chi2 and matching to TPC
1735     AliITSUSeed* wn0 = fCurrHyp->GetWinner(); // in principle, should be NULL
1736     for (nb=0;nb<fNCandidatesAdded;nb++) {
1737       AliITSUSeed* sd = fLayerCandidates[index[nb]];
1738       fCurrHyp->SetWinner(sd);
1739       if (!CheckBackwardMatching(sd)) MarkSeedFree(sd); // discard bad backward tracks
1740       else {
1741         AddProlongationHypothesis(sd,ilr);
1742         if (++nacc==acceptMax) {nb++; break;} // the rest will be discarded
1743       }
1744     }
1745     fCurrHyp->SetWinner(wn0); // restore original winner (NULL?)
1746   }
1747   // disable unused candidates
1748   for (int ib=nb;ib<fNCandidatesAdded;ib++) MarkSeedFree(fLayerCandidates[index[ib]]);
1749   fNCandidatesAdded = 0; // reset candidates counter
1750   //
1751 }
1752
1753 //__________________________________________________________________
1754 Bool_t AliITSUTrackerGlo::CheckBackwardMatching(AliITSUSeed* seed)
1755 {
1756   // check seed backward propagation chi2 and matching to TPC
1757   double bz0 = GetBz();
1758   double rDest = fITS->GetRITSTPCRef(); // reference radius for comparison
1759   AliITSUTrackHyp trback;
1760   trback.AliExternalTrackParam::operator=(*seed);
1761   trback.ResetCovariance(10000);
1762   int nclFit = 0;
1763   double chi2sa = RefitTrack(&trback,rDest,nclFit,1);
1764   if (chi2sa<0) return kFALSE;
1765   int ndf = nclFit*2-5;
1766   if (ndf>0) chi2sa /= ndf;
1767   if (chi2sa>fCurrTrackCond->GetMaxITSSAChi2(nclFit)) return kFALSE;
1768   //
1769   // relate to TPC track at outer layer
1770   AliExternalTrackParam* tpcSeed = fCurrHyp->GetTPCSeed();
1771   if (!trback.Rotate(tpcSeed->GetAlpha()) || !trback.PropagateParamOnlyTo(tpcSeed->GetX(),bz0)) {
1772 #ifdef _ITSU_DEBUG_
1773     if (AliDebugLevelClass()>+1 && !seed->ContainsFake()) {
1774       AliInfo(Form("Failed to propagate seed to TPC track @ X:%.3f Alpha:%.3f",tpcSeed->GetX(),tpcSeed->GetAlpha()));
1775       seed->Print("etp");
1776       trback.Print();
1777     }
1778 #endif
1779     return kFALSE;
1780   }
1781   double chi2Match = trback.GetPredictedChi2(tpcSeed)/5;
1782   if (chi2Match>fCurrTrackCond->GetMaxITSTPCMatchChi2()) return kFALSE;
1783   //
1784   seed->SetChi2ITSSA(chi2sa);
1785   seed->SetChi2ITSTPC(chi2Match);
1786   return kTRUE;
1787 }
1788
1789 //__________________________________________________________________
1790 void AliITSUTrackerGlo::SaveReducedHypothesesTree(AliITSUTrackHyp* dest)
1791 {
1792   // remove those hypothesis seeds which dont lead to candidates at final layer
1793   //
1794   // 1st, flag the seeds to save
1795   int lr0 = fCurrTrackCond->GetActiveLrInner();
1796   for (int isd=0;isd<fCurrHyp->GetNSeeds(lr0);isd++) {
1797     AliITSUSeed* seed = fCurrHyp->RemoveSeed(lr0,isd);
1798     if (!seed) continue;
1799     seed->FlagTree(AliITSUSeed::kSave);
1800     dest->AddSeed(seed,lr0);
1801   }
1802   for (int ilr=0;ilr<fNLrActive;ilr++) {
1803     int nsd = fCurrHyp->GetNSeeds(ilr);
1804     for (int isd=0;isd<nsd;isd++) {
1805       AliITSUSeed* seed = fCurrHyp->RemoveSeed(ilr,isd);
1806       if (!seed) continue; // already discarded or saved
1807       if (seed->IsSaved()) dest->AddSeed(seed,ilr);
1808       else MarkSeedFree(seed);
1809     }
1810   }
1811   //
1812   //  AliInfo(Form("SeedsPool: %d, BookedUpTo: %d, free: %d",fSeedsPool.GetSize(),fSeedsPool.GetEntriesFast(),fNFreeSeeds));
1813 }
1814
1815 //__________________________________________________________________
1816 void AliITSUTrackerGlo::CleanHypothesis(AliITSUTrackHyp* hyp)
1817 {
1818   // clean hypothesis
1819   hyp->SetWinner(0);
1820   for (int ilr=0;ilr<fNLrActive;ilr++) {
1821     int nsd = hyp->GetNSeeds(ilr);
1822     for (int isd=0;isd<nsd;isd++) {
1823       AliITSUSeed* seed = hyp->RemoveSeed(ilr,isd);
1824       if (!seed) continue; // already discarded or saved
1825       MarkSeedFree(seed);
1826     }
1827   }
1828 }
1829
1830 //__________________________________________________________________
1831 void AliITSUTrackerGlo::FlagSplitClusters()
1832 {
1833   // set special bit on split clusters using MC info
1834   for (int ilr=fNLrActive;ilr--;) {
1835     int nsplit=0;
1836     AliITSURecoLayer* lr = fITS->GetLayerActive(ilr);
1837     for (int isn=lr->GetNSensors();isn--;) {
1838       AliITSURecoSens* sens = lr->GetSensor(isn);
1839       int nCl = sens->GetNClusters();
1840       if (!nCl) continue;
1841       int cl0 = sens->GetFirstClusterId();
1842       for (int icl=nCl;icl--;) {
1843         AliITSUClusterPix *cl = (AliITSUClusterPix*)lr->GetCluster(cl0+icl);
1844         for (int icl1=icl;icl1--;) {
1845           AliITSUClusterPix *cl1 = (AliITSUClusterPix*)lr->GetCluster(cl0+icl1);
1846           if (cl->HasCommonTrack(cl1)) {
1847             if (!cl->IsSplit())  nsplit++;
1848             if (!cl1->IsSplit()) nsplit++;
1849             cl->SetSplit();
1850             cl1->SetSplit();
1851           }
1852         }
1853       }
1854     }
1855     AliInfo(Form("%4d out of %4d clusters are split",nsplit,lr->GetNClusters()));
1856   }
1857   //
1858 }
1859
1860 //__________________________________________________________________
1861 Bool_t AliITSUTrackerGlo::ContainsSplitCluster(const AliITSUSeed* seed, Int_t maxSize)
1862 {
1863   // check if the seed contains split cluster with size < maxSize
1864   int lrID,clID;
1865   if ( (clID=seed->GetLrCluster(lrID))>=0 ) {
1866     AliITSUClusterPix* cl = (AliITSUClusterPix*)fITS->GetLayerActive(lrID)->GetCluster(clID);
1867     if (cl->IsSplit() && cl->GetNPix()<maxSize ) return kTRUE;
1868   }
1869   return seed->GetParent() ? ContainsSplitCluster((AliITSUSeed*)seed->GetParent(),maxSize) : kFALSE;
1870   //
1871 }
1872
1873 //__________________________________________________________________
1874 void AliITSUTrackerGlo::PrintSeedClusters(const AliITSUSeed* seed, Option_t* option)
1875 {
1876   // print seeds clusters
1877   int lrID,clID;
1878   if ( (clID=seed->GetLrCluster(lrID))>=0 ) {
1879     AliITSUClusterPix* cl = (AliITSUClusterPix*)fITS->GetLayerActive(lrID)->GetCluster(clID);
1880     cl->Print(option);
1881   }
1882   if (seed->GetParent()) PrintSeedClusters((AliITSUSeed*)seed->GetParent(), option);
1883   //
1884 }
1885
1886 //__________________________________________________________________
1887 void AliITSUTrackerGlo::FlagSeedClusters(const AliITSUSeed* seed, Bool_t flg, UShort_t ref)
1888 {
1889   // mark used clusters
1890   int lrID,clID;
1891   while (seed) {
1892     if ( (clID=seed->GetLrCluster(lrID))>=0 ) {
1893       AliITSUClusterPix* cl = (AliITSUClusterPix*)fITS->GetLayerActive(lrID)->GetCluster(clID);
1894       if (ref) { // do we need to set or delete cluster->track ref?
1895         if (flg) {
1896           if (!cl->GetRecoInfo()) cl->SetRecoInfo(ref);  // set ref only if cluster already does not refer to other track, inc.counter
1897         }
1898         else {
1899           if (cl->GetRecoInfo()==ref) cl->SetRecoInfo(0); // unset reference only if it refers to ref, decrease counter
1900         }
1901       }
1902     }
1903     seed = (AliITSUSeed*)seed->GetParent();
1904   }
1905   //
1906 }
1907
1908 //__________________________________________________________________
1909 void AliITSUTrackerGlo::CheckClusterUsage()
1910 {
1911   // check cluster usage info
1912   printf("ClusterUsage at pass %d\n",fCurrPassID);
1913   for (int ilr=0;ilr<fNLrActive;ilr++) {
1914     AliITSURecoLayer* lr = fITS->GetLayerActive(ilr);
1915     int ncl = lr->GetNClusters();
1916     int nclUsed = 0;
1917     int nclUs0CntShr1 = 0;
1918     int nclUs1Cnt0 = 0;
1919     int nclUs1Shr1 = 0;
1920     int nclUseL = 0;
1921     for (int icl=0;icl<ncl;icl++) {
1922       AliITSUClusterPix *cl = (AliITSUClusterPix*)lr->GetCluster(icl);
1923       int usc = cl->GetClUsage();
1924       if (usc<1) {
1925         if (cl->IsClusterUsed() || cl->IsClusterShared()) {
1926           nclUs0CntShr1++;
1927           printf("Lr%d Cl%4d: UseCnt=0 but UseFlg=%d UseShr=%d\n",ilr,icl,cl->IsClusterUsed(),cl->IsClusterShared());
1928         }
1929         continue;
1930       }
1931       nclUsed++;
1932       if (!cl->IsClusterUsed()) {
1933         nclUs1Cnt0++;
1934         printf("Lr%d Cl%4d: UseCnt=%d but UseFlg=%d UseShr=%d\n",ilr,icl,usc, cl->IsClusterUsed(),cl->IsClusterShared());
1935       }
1936       if (cl->IsClusterShared()) {
1937         nclUs1Shr1++;
1938         printf("Lr%d Cl%4d: UseCnt=%d but UseFlg=%d UseShr=%d\n",ilr,icl,usc, cl->IsClusterUsed(),cl->IsClusterShared());
1939       }
1940       if (usc>1) {
1941         nclUseL++;
1942         printf("Lr%d Cl%4d: UseCnt=%d!! but UseFlg=%d UseShr=%d\n",ilr,icl,usc, cl->IsClusterUsed(),cl->IsClusterShared());
1943       }
1944     }
1945     printf("ClUsage Lr%d: Ncl=%5d Nusd=%5d (%5.2f) Use0CS1:%4d Use1C0:%4d Use1S1:%4d UseL:%d\n",
1946            ilr,ncl,nclUsed,ncl? float(nclUsed)/ncl : 0, nclUs0CntShr1,nclUs1Cnt0,nclUs1Shr1,nclUseL);
1947   }
1948 }
1949
1950
1951 #ifdef  _ITSU_TUNING_MODE_
1952 //__________________________________________________________________
1953 TObjArray* AliITSUTrackerGlo::BookControlHistos(const char* pref)
1954 {
1955   // book special control histos
1956   TString prefS = pref;
1957   prefS.ToLower();
1958   TObjArray* dest = new TObjArray;
1959   dest->SetOwner(kTRUE);
1960   //
1961   const int kNResDef=7;
1962   const double kResDef[kNResDef]={0.05,0.05,0.3, 0.05,1,0.5,1.5};
1963   const double ptMax=10;
1964   const double plMax=10;
1965   const double chiMax=100;
1966   const int nptbins=50;
1967   const int nresbins=400;
1968   const int nplbins=50;
1969   const int nchbins=200;
1970   const int maxBr  = 15;
1971   const int maxCand = 200;
1972   TString ttl;
1973   for (int phase=0;phase<kNTrackingPhases;phase++) {
1974     for (int pass=0;pass<AliITSUReconstructor::GetRecoParam()->GetNTrackingConditions();pass++) {
1975       //
1976       for (int ilr=0;ilr<fNLrActive;ilr++) {
1977         //
1978         // ----------------- These are histos to be filled in Cluster2Tracks of each pass.
1979         // PropagateBack and RefitInward will be stored among the histos of 1st pass
1980         if (pass>0 && phase!=kClus2Tracks) continue;
1981         //
1982         double mxdf = ilr>=kNResDef ? kResDef[kNResDef-1] : kResDef[ilr];
1983         ttl = Form("Pass%d_S%d_residY%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
1984         TH2F* hdy = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax,nresbins,-mxdf,mxdf);
1985         dest->AddAtAndExpand(hdy,GetHistoID(ilr,kHResY,pass,phase));
1986         hdy->SetDirectory(0);
1987         //
1988         ttl = Form("Pass%d_S%d_residYPull%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
1989         TH2F* hdyp = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax,nplbins,-plMax,plMax);
1990         dest->AddAtAndExpand(hdyp,GetHistoID(ilr,kHResYP,pass,phase));
1991         hdyp->SetDirectory(0);
1992         //
1993         ttl = Form("Pass%d_S%d_residZ%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
1994         TH2F* hdz = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax,nresbins,-mxdf,mxdf);
1995         dest->AddAtAndExpand(hdz,GetHistoID(ilr,kHResZ,pass,phase));
1996         hdz->SetDirectory(0);
1997         //
1998         ttl = Form("Pass%d_S%d_residZPull%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
1999         TH2F* hdzp = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax,nplbins,-plMax,plMax);
2000         hdzp->SetDirectory(0);
2001         dest->AddAtAndExpand(hdzp,GetHistoID(ilr,kHResZP,pass,phase));
2002         //
2003         ttl = Form("Pass%d_S%d_chi2Cl%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
2004         TH2F* hchi = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax, nchbins,0.,chiMax);
2005         hchi->SetDirectory(0);
2006         dest->AddAtAndExpand(hchi,GetHistoID(ilr,kHChi2Cl,pass,phase));
2007         //
2008         // ------------------- These histos are filled for Clusters2Tracks only
2009         if (phase!=kClus2Tracks) continue;
2010         //
2011         ttl = Form("Pass%d_S%d_chi2Nrm%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
2012         TH2F* hchiN = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax, nchbins,0.,chiMax);
2013         hchiN->SetDirectory(0);
2014         dest->AddAtAndExpand(hchiN,GetHistoID(ilr,kHChi2Nrm,pass,phase));
2015         //
2016         ttl = Form("Pass%d_S%d_bestInBranch%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
2017         TH2* hnbr = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax, maxBr,-0.5,maxBr-0.5);
2018         hnbr->SetDirectory(0);
2019         dest->AddAtAndExpand(hnbr,GetHistoID(ilr,kHBestInBranch,pass,phase));
2020         //
2021         ttl = Form("Pass%d_S%d_bestInCands%d_%s",pass,phase,ilr,pref);
2022         TH2* hncn = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax, maxCand,-0.5,maxCand-0.5);
2023         hncn->SetDirectory(0);
2024         dest->AddAtAndExpand(hncn,GetHistoID(ilr,kHBestInCand,pass,phase));
2025         //
2026       } // loop over layers
2027       //
2028       // these are special histos, filled not per layer but in the end of track fit in Clusters2Tracks in EVERY pass
2029       //
2030       if (phase==kClus2Tracks) {
2031         TH2* hchiMatch = 0;
2032         ttl = Form("Pass%d_Chi2Match_%s",pass,pref);
2033         hchiMatch = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax, nchbins,0.,chiMax);
2034         hchiMatch->SetDirectory(0);
2035         dest->AddAtAndExpand(hchiMatch,GetHistoID(-1,kHChiMatch,pass,phase));
2036         //
2037         TH2* hchiSA = 0;
2038         ttl = Form("Pass%d_Chi2ITSSA_%s",pass,pref);
2039         hchiSA = new TH2F(ttl.Data(),ttl.Data(),nptbins,0,ptMax, nchbins/2,0.,chiMax/2);
2040         hchiSA->SetDirectory(0);
2041         dest->AddAtAndExpand(hchiSA,GetHistoID(-1,kHChiITSSA,pass,phase));
2042         //
2043       }
2044     } // loop over tracking passes
2045   }// loop over tracking phases
2046   //
2047   return dest;
2048 }
2049
2050 //__________________________________________________________________
2051 Int_t AliITSUTrackerGlo::GetHistoID(Int_t lr, Int_t hid, Int_t pass, Int_t phase)
2052 {
2053   // get id for the requested histo
2054   if (lr<0) lr=-1;
2055   lr++;
2056   return pass*kHistosPass + phase*kHistosPhase + lr*kMaxHID + hid;
2057   //
2058 }
2059
2060 #endif