]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - MUON/AliMUONCDB.cxx
CID 22679: Out-of-bounds write (OVERRUN_STATIC)
[u/mrichter/AliRoot.git] / MUON / AliMUONCDB.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17  
18 //-----------------------------------------------------------------------------
19 /// \namespace AliMUONCDB
20 ///
21 /// Helper functions to experience the OCDB
22 ///
23 /// They allow to read magnetic field, mapping and recoParam from OCDB
24 ///
25 /// And also to generate dummy (but complete) containers for all the
26 /// calibration data types we have for tracker and trigger, and to write
27 /// them into OCDB.
28 ///
29 /// For more information, please see READMEcalib
30 ///
31 /// \author Laurent Aphecetche
32 //-----------------------------------------------------------------------------
33
34 #include "AliMUONCDB.h"
35
36 #include "AliMUON1DArray.h"
37 #include "AliMUON1DMap.h"
38 #include "AliMUON2DMap.h"
39 #include "AliMUON2DStoreValidator.h"
40 #include "AliMUONCalibParamND.h"
41 #include "AliMUONCalibParamNF.h"
42 #include "AliMUONCalibParamNI.h"
43 #include "AliMUONCalibrationData.h"
44 #include "AliMUONConstants.h"
45 #include "AliMUONGlobalCrateConfig.h"
46 #include "AliMUONLogger.h"
47 #include "AliMUONPadStatusMaker.h"
48 #include "AliMUONPadStatusMapMaker.h"
49 #include "AliMUONRecoParam.h"
50 #include "AliMUONRegionalTriggerConfig.h"
51 #include "AliMUONRejectList.h"
52 #include "AliMUONTrackerData.h"
53 #include "AliMUONTrackerIO.h"
54 #include "AliMUONTriggerEfficiencyCells.h"
55 #include "AliMUONTriggerLut.h"
56 #include "AliMUONVCalibParam.h"
57 #include "AliMUONVCalibParam.h"
58 #include "AliMUONVStore.h"
59
60 #include "AliMpCDB.h"
61 #include "AliMpConstants.h"
62 #include "AliMpDEStore.h"
63 #include "AliMpDDLStore.h"
64 #include "AliMpManuStore.h"
65 #include "AliMpDEManager.h"
66 #include "AliMpDetElement.h"
67 #include "AliMpFiles.h"
68 #include "AliMpDCSNamer.h"
69 #include "AliMpManuIterator.h"
70 #include "AliMpSegmentation.h"
71 #include "AliMpStationType.h"
72 #include "AliMpVSegmentation.h"
73
74 #include "AliCodeTimer.h"
75 #include "AliCDBEntry.h"
76 #include "AliCDBManager.h"
77 #include "AliGRPManager.h"
78 #include "AliDCSValue.h"
79 #include "AliLog.h"
80 #include "AliMpBusPatch.h"
81
82 #include <Riostream.h>
83 #include <TArrayI.h>
84 #include <TClass.h>
85 #include <TFile.h>
86 #include <TH1F.h>
87 #include <TList.h>
88 #include <TMap.h>
89 #include <TObjString.h>
90 #include <TROOT.h>
91 #include <TRandom.h>
92 #include <TStopwatch.h>
93 #include <TSystem.h>
94 #include <TMath.h>
95 #include <TGeoGlobalMagField.h>
96 #include <TClonesArray.h>
97 #include <sstream>
98 #include <set>
99
100 using std::endl;
101 using std::cout;
102 using std::cerr;
103 using std::ostringstream;
104 using std::ifstream;
105
106 namespace
107 {
108   //_____________________________________________________________________________
109 AliMUONVStore* Create2DMap()
110 {
111   return new AliMUON2DMap(true);
112 }
113
114   //_____________________________________________________________________________
115 void getBoundaries(const AliMUONVStore& store, Int_t dim,
116                    Float_t* xmin, Float_t* xmax)
117 {
118   /// Assuming the store contains AliMUONVCalibParam objects, compute the
119   /// limits of the value contained in the VCalibParam, for each of its dimensions
120   /// xmin and xmax must be of dimension dim
121   
122   for ( Int_t i = 0; i < dim; ++i ) 
123   {
124     xmin[i]=1E30;
125     xmax[i]=-1E30;
126   }
127   
128   TIter next(store.CreateIterator());
129   AliMUONVCalibParam* value;
130   
131   while ( ( value = dynamic_cast<AliMUONVCalibParam*>(next() ) ) )
132   {
133     Int_t detElemId = value->ID0();
134     Int_t manuId = value->ID1();
135     
136     const AliMpVSegmentation* seg = 
137       AliMpSegmentation::Instance()->GetMpSegmentationByElectronics(detElemId,manuId);
138         
139     if (!seg) continue;
140     
141     for ( Int_t manuChannel = 0; manuChannel < value->Size(); ++manuChannel )
142     {
143       AliMpPad pad = seg->PadByLocation(manuId,manuChannel,kFALSE);
144       if (!pad.IsValid()) continue;
145       
146       for ( Int_t i = 0; i < dim; ++i ) 
147       {
148         Float_t x0 = value->ValueAsFloat(manuChannel,i);
149       
150         xmin[i] = TMath::Min(xmin[i],x0);
151         xmax[i] = TMath::Max(xmax[i],x0);
152       }
153     }
154   }
155
156   for ( Int_t i = 0; i < dim; ++i ) 
157   {
158     if ( TMath::Abs(xmin[i]-xmax[i]) < 1E-3 ) 
159     {
160       xmin[i] -= 1;
161       xmax[i] += 1;
162     }
163   }
164 }
165
166 //_____________________________________________________________________________
167 Double_t GetRandom(Double_t mean, Double_t sigma, Bool_t mustBePositive)
168 {
169   Double_t x(-1);
170   if ( mustBePositive ) 
171   {
172     while ( x < 0 ) 
173     {
174       x = gRandom->Gaus(mean,sigma);
175     }
176   }
177   else
178   {
179     x = gRandom->Gaus(mean,sigma);
180   }
181   return x;
182 }
183
184 }
185
186 //_____________________________________________________________________________
187 Bool_t AliMUONCDB::CheckOCDB(Bool_t pathOnly)
188 {
189   /// Check that OCDB path and run number are properly set
190   
191   AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
192   
193   // first OCDB path
194   if (!man->IsDefaultStorageSet()) {
195     AliErrorGeneral("AliMUONCDB", "OCDB path must be properly set");
196     return kFALSE;
197   }
198   
199   // then run number if required
200   if (pathOnly) return kTRUE;
201   if (man->GetRun() < 0) {
202     AliErrorGeneral("AliMUONCDB", "Run number must be properly set");
203     return kFALSE;
204   }
205   
206   return kTRUE;
207   
208 }
209
210 //_____________________________________________________________________________
211 Bool_t AliMUONCDB::CheckMapping(Bool_t segmentationOnly)
212 {
213   /// Check that the mapping has been loaded
214   
215   // first the segmentation
216   if (!AliMpSegmentation::Instance(false)) {
217     AliErrorGeneral("AliMUONCDB", "Mapping segmentation must be loaded first");
218     return kFALSE;
219   }
220   
221   // then the others if required
222   if (segmentationOnly) return kTRUE;
223   if (!AliMpDDLStore::Instance(false) || !AliMpDEStore::Instance(false) || !AliMpManuStore::Instance(false)) {
224     AliErrorGeneral("AliMUONCDB", "Full mapping must be loaded first");
225     return kFALSE;
226   }
227   
228   return kTRUE;
229   
230 }
231
232 //_____________________________________________________________________________
233 Bool_t AliMUONCDB::LoadField()
234 {
235   /// Load magnetic field (existing field will be deleted).
236   /// OCDB path and run number are supposed to be set.
237   
238   AliInfoGeneral("AliMUONCDB","Loading field map from GRP...");
239   
240   if (!AliMUONCDB::CheckOCDB()) return kFALSE;
241   
242   AliGRPManager grpMan;
243   
244   // make sure the old field is deleted even if it is locked
245   if(TGeoGlobalMagField::Instance()->IsLocked()) delete TGeoGlobalMagField::Instance();
246   
247   if (!grpMan.ReadGRPEntry() || !grpMan.SetMagField()) {
248     AliErrorGeneral("AliMUONCDB", "failed to load magnetic field from OCDB");
249     return kFALSE;
250   }
251   
252   return kTRUE;
253   
254 }
255
256 //_____________________________________________________________________________
257 Bool_t AliMUONCDB::LoadMapping(Bool_t segmentationOnly)
258 {
259   /// Load mapping (existing mapping will be unloaded).
260   /// OCDB path and run number are supposed to be set.
261   
262   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", "Loading mapping from OCDB...");
263   
264   if (!AliMUONCDB::CheckOCDB()) return kFALSE;
265   
266   // in case it has already been set
267   AliMpCDB::UnloadAll();
268   
269   if (segmentationOnly) {
270     
271     if (!AliMpCDB::LoadMpSegmentation(kTRUE)){
272       AliErrorGeneral("AliMUONCDB", "failed to load segmentation from OCDB");
273       return kFALSE;
274     }
275     
276   } else {
277     
278     if (!AliMpCDB::LoadAll(kTRUE)) {
279       AliErrorGeneral("AliMUONCDB", "failed to load mapping from OCDB");
280       return kFALSE;
281     }
282     
283   }
284   
285   return kTRUE;
286   
287 }
288
289 //_____________________________________________________________________________
290 AliMUONRecoParam* AliMUONCDB::LoadRecoParam()
291 {
292   /// Load and return reconstruction parameters.
293   /// OCDB path is supposed to be set.
294   
295   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", "Loading RecoParam from OCDB...");
296   
297   if (!AliMUONCDB::CheckOCDB()) return 0x0;
298   
299   AliMUONRecoParam* recoParam = 0x0;
300   AliCDBEntry* entry = AliCDBManager::Instance()->Get("MUON/Calib/RecoParam");
301   
302   if(entry) {
303     
304     // load recoParam according OCDB content (single or array)
305     if (!(recoParam = dynamic_cast<AliMUONRecoParam*>(entry->GetObject()))) {
306       
307       TObjArray* recoParamArray = static_cast<TObjArray*>(entry->GetObject());
308 //      recoParamArray->SetOwner(kTRUE); // FIXME: this should be done, but is causing a problem at the end of the reco... investigate why...
309       
310       for(Int_t i = 0; i < recoParamArray->GetEntriesFast(); i++) {
311         recoParam = static_cast<AliMUONRecoParam*>(recoParamArray->UncheckedAt(i));
312         if (recoParam->IsDefault()) break;
313         recoParam = 0x0;
314       }
315       
316     }
317     
318   }
319   
320   if (!recoParam) AliErrorGeneral("AliMUONCDB", "failed to load RecoParam from OCDB");
321   
322   return recoParam;
323   
324 }
325
326 //_____________________________________________________________________________
327 TClonesArray* AliMUONCDB::LoadAlignmentData()
328 {
329   /// Load and return the array of alignment objects.
330   
331   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", "Loading Alignemnt from OCDB...");
332   
333   if (!AliMUONCDB::CheckOCDB()) return 0x0;
334   
335   TClonesArray* alignmentArray = 0x0;
336   AliCDBEntry* entry = AliCDBManager::Instance()->Get("MUON/Align/Data");
337   
338   if (entry) {
339     // load alignement array
340     alignmentArray = dynamic_cast<TClonesArray*>(entry->GetObject());
341   }
342   
343   if (!alignmentArray) { 
344     AliErrorGeneral("AliMUONCDB", "failed to load Alignemnt from OCDB");
345   }  
346   
347   return alignmentArray;
348 }
349
350 //_____________________________________________________________________________
351 AliMUONVStore* 
352 AliMUONCDB::Diff(AliMUONVStore& store1, AliMUONVStore& store2, 
353                  const char* opt)
354 {
355   /// creates a store which contains store1-store2
356   /// if opt="abs" the difference is absolute one,
357   /// if opt="rel" then what is stored is (store1-store2)/store1
358   /// if opt="percent" then what is stored is rel*100
359   ///
360   /// WARNING Works only for stores which holds AliMUONVCalibParam objects
361   
362   TString sopt(opt);
363   sopt.ToUpper();
364   
365   if ( !sopt.Contains("ABS") && !sopt.Contains("REL") && !sopt.Contains("PERCENT") )
366   {
367     AliErrorGeneral("AliMUONCDB", Form("opt %s not supported. Only ABS, REL, PERCENT are",opt));
368     return 0x0;
369   }
370   
371   AliMUONVStore* d = static_cast<AliMUONVStore*>(store1.Clone());
372   
373   TIter next(d->CreateIterator());
374   
375   AliMUONVCalibParam* param;
376   
377   while ( ( param = dynamic_cast<AliMUONVCalibParam*>(next() ) ) )
378   {
379     Int_t detElemId = param->ID0();
380     Int_t manuId = param->ID1();
381     
382     AliMUONVCalibParam* param2 = dynamic_cast<AliMUONVCalibParam*>(store2.FindObject(detElemId,manuId));
383     //FIXME: this might happen. Handle it.
384     if (!param2) 
385     {
386       cerr << "param2 is null : FIXME : this might happen !" << endl;
387       delete d;
388       return 0;
389     }
390     
391     for ( Int_t i = 0; i < param->Size(); ++i )
392     {
393       for ( Int_t j = 0; j < param->Dimension(); ++j )
394       {
395         Float_t value(0);
396         if ( sopt.Contains("ABS") )
397         {
398           value = param->ValueAsFloat(i,j) - param2->ValueAsFloat(i,j);
399         }
400         else if ( sopt.Contains("REL") || sopt.Contains("PERCENT") )
401         {
402           if ( param->ValueAsFloat(i,j) ) 
403           {
404             value = (param->ValueAsFloat(i,j) - param2->ValueAsFloat(i,j))/param->ValueAsFloat(i,j);
405           }
406           else 
407           {
408             continue;
409           }
410           if ( sopt.Contains("PERCENT") ) value *= 100.0;
411         }
412         param->SetValueAsFloat(i,j,value);
413       }      
414     }
415   }
416   return d;
417 }
418
419 //_____________________________________________________________________________
420 TH1** 
421 AliMUONCDB::Plot(const AliMUONVStore& store, const char* name, Int_t nbins)
422 {
423   /// Make histograms of each dimension of the AliMUONVCalibParam
424   /// contained inside store.
425   /// It produces histograms named name_0, name_1, etc...
426   
427   if (!AliMUONCDB::CheckMapping(kTRUE)) return 0x0;
428   
429   TIter next(store.CreateIterator());
430   AliMUONVCalibParam* param;
431   Int_t n(0);
432   const Int_t kNStations = AliMpConstants::NofTrackingChambers()/2;
433   Int_t* nPerStation = new Int_t[kNStations];
434   TH1** h(0x0);
435   
436   for ( Int_t i = 0; i < kNStations; ++i ) nPerStation[i]=0;
437   
438   while ( ( param = static_cast<AliMUONVCalibParam*>(next()) ) )
439   {
440     if (!h)
441     {
442       Int_t dim = param->Dimension();
443       h = new TH1*[dim];
444       Float_t* xmin = new Float_t[dim];
445       Float_t* xmax = new Float_t[dim];
446       getBoundaries(store,dim,xmin,xmax);
447       
448       for ( Int_t i = 0; i < dim; ++i ) 
449       {
450         h[i] = new TH1F(Form("%s_%d",name,i),Form("%s_%d",name,i),
451                             nbins,xmin[i],xmax[i]);
452         AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Created histogram %s",h[i]->GetName()));
453       }
454       delete [] xmin;
455       delete [] xmax;
456     }
457     
458     Int_t detElemId = param->ID0();
459     Int_t manuId = param->ID1();
460     Int_t station = AliMpDEManager::GetChamberId(detElemId)/2;
461     
462     const AliMpVSegmentation* seg = 
463       AliMpSegmentation::Instance()->GetMpSegmentationByElectronics(detElemId,manuId);
464     
465     if (!seg) continue;
466     
467     for ( Int_t manuChannel = 0; manuChannel < param->Size(); ++manuChannel )
468     {
469       AliMpPad pad = seg->PadByLocation(manuId,manuChannel,kFALSE);
470       if (!pad.IsValid()) continue;
471
472       ++n;
473       ++nPerStation[station];
474       
475       for ( Int_t dim = 0; dim < param->Dimension(); ++dim ) 
476       {
477         h[dim]->Fill(param->ValueAsFloat(manuChannel,dim));
478       }
479     }
480   } 
481   
482   for ( Int_t i = 0; i < kNStations; ++i )
483   {
484     AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Station %d %d ",(i+1),nPerStation[i]));
485   }
486
487   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Number of channels = %d",n));
488   
489   delete[] nPerStation;
490   
491   return h;
492 }
493
494 //_____________________________________________________________________________
495 Int_t 
496 AliMUONCDB::MakeHVStore(TMap& aliasMap, Bool_t defaultValues)
497 {
498   /// Create a HV store
499   
500   if (!AliMUONCDB::CheckMapping()) return 0;
501   
502   AliMpDCSNamer hvNamer("TRACKER");
503   
504   TObjArray* aliases = hvNamer.GenerateAliases();
505   
506   Int_t nSwitch(0);
507   Int_t nChannels(0);
508   
509   for ( Int_t i = 0; i < aliases->GetEntries(); ++i ) 
510   {
511     TObjString* alias = static_cast<TObjString*>(aliases->At(i));
512     TString& aliasName = alias->String();
513     if ( aliasName.Contains("sw") ) 
514     {
515       // HV Switch (St345 only)
516       TObjArray* valueSet = new TObjArray;
517       valueSet->SetOwner(kTRUE);
518       
519       Bool_t value = kTRUE;
520       
521       if (!defaultValues)
522       {
523         Float_t r = gRandom->Uniform();
524         if ( r < 0.007 ) value = kFALSE;      
525       } 
526       
527       for ( UInt_t timeStamp = 0; timeStamp < 60*3; timeStamp += 60 )
528       {
529         AliDCSValue* dcsValue = new AliDCSValue(value,timeStamp);
530         valueSet->Add(dcsValue);
531       }
532       aliasMap.Add(new TObjString(*alias),valueSet);
533       ++nSwitch;
534     }
535     else
536     {
537       TObjArray* valueSet = new TObjArray;
538       valueSet->SetOwner(kTRUE);
539       for ( UInt_t timeStamp = 0; timeStamp < 60*15; timeStamp += 120 )
540       {
541         Float_t value = 1500;
542         if (!defaultValues) value = GetRandom(1750,62.5,true);
543         AliDCSValue* dcsValue = new AliDCSValue(value,timeStamp);
544         valueSet->Add(dcsValue);
545       }
546       aliasMap.Add(new TObjString(*alias),valueSet);
547       ++nChannels;
548     }
549   }
550   
551   delete aliases;
552   
553   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("%d HV channels and %d switches",nChannels,nSwitch));
554   
555   return nChannels+nSwitch;
556 }
557
558 //_____________________________________________________________________________
559 Int_t 
560 AliMUONCDB::MakeTriggerDCSStore(TMap& aliasMap, Bool_t defaultValues)
561 {
562   /// Create a Trigger HV and Currents store
563   
564   if (!AliMUONCDB::CheckMapping()) return 0;
565   
566   AliMpDCSNamer triggerDCSNamer("TRIGGER");
567   
568   TObjArray* aliases = triggerDCSNamer.GenerateAliases();
569   
570   Int_t nChannels[2] = {0, 0};
571   
572   for ( Int_t i = 0; i < aliases->GetEntries(); ++i ) 
573   {
574     TObjString* alias = static_cast<TObjString*>(aliases->At(i));
575     TString& aliasName = alias->String();
576
577     TObjArray* valueSet = new TObjArray;
578     valueSet->SetOwner(kTRUE);
579
580     Int_t measureType = triggerDCSNamer.DCSvariableFromDCSAlias(aliasName.Data());
581     if ( measureType < 0 ) {
582       AliErrorGeneralStream("AliMUONCDB") 
583         << "Failed to get DCS variable from an alias (trigger): "
584         << aliasName.Data() << endl;
585       return 0;
586     }
587         
588     for ( UInt_t timeStamp = 0; timeStamp < 60*15; timeStamp += 120 )
589     {
590       Float_t value = 
591         (measureType == AliMpDCSNamer::kDCSI) ? 2. : 8000.;
592       if (!defaultValues) {
593         switch (measureType){
594         case AliMpDCSNamer::kDCSI:
595           value = GetRandom(2.,0.4,true);
596           break;
597         case AliMpDCSNamer::kDCSHV:
598           value = GetRandom(8000.,16.,true);
599           break;
600         }
601       }
602       AliDCSValue* dcsValue = new AliDCSValue(value,timeStamp);
603       valueSet->Add(dcsValue);
604     }
605     aliasMap.Add(new TObjString(*alias),valueSet);
606     ++nChannels[measureType];
607   }
608   
609   delete aliases;
610   
611   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Trigger channels I -> %i   HV -> %i",nChannels[0], nChannels[1]));
612   
613   return nChannels[0] + nChannels[1];
614 }
615
616 //_____________________________________________________________________________
617 Int_t 
618 AliMUONCDB::MakePedestalStore(AliMUONVStore& pedestalStore, Bool_t defaultValues)
619 {
620   /// Create a pedestal store. if defaultValues=true, ped.mean=ped.sigma=1,
621   /// otherwise mean and sigma are from a gaussian (with parameters
622   /// defined below by the kPedestal* constants)
623
624   AliCodeTimerAutoGeneral("",0);
625   
626   if (!AliMUONCDB::CheckMapping()) return 0;
627   
628   Int_t nchannels(0);
629   Int_t nmanus(0);
630   
631   const Int_t kChannels(AliMpConstants::ManuNofChannels());
632   
633   // bending
634   const Float_t kPedestalMeanMeanB(200.);
635   const Float_t kPedestalMeanSigmaB(10.);
636   const Float_t kPedestalSigmaMeanB(1.);
637   const Float_t kPedestalSigmaSigmaB(0.2);
638   
639   // non bending
640   const Float_t kPedestalMeanMeanNB(200.);
641   const Float_t kPedestalMeanSigmaNB(10.);
642   const Float_t kPedestalSigmaMeanNB(1.);
643   const Float_t kPedestalSigmaSigmaNB(0.2);
644   
645   const Float_t kFractionOfDeadManu(0.); // within [0.,1.]
646
647   Int_t detElemId;
648   Int_t manuId;
649     
650   AliMpManuIterator it;
651   
652   while ( it.Next(detElemId,manuId) )
653   {
654     // skip a given fraction of manus
655     if (kFractionOfDeadManu > 0. && gRandom->Uniform() < kFractionOfDeadManu) continue;
656     
657     ++nmanus;
658
659     AliMUONVCalibParam* ped = 
660       new AliMUONCalibParamNF(2,kChannels,detElemId,manuId,AliMUONVCalibParam::InvalidFloatValue());
661
662     AliMpDetElement* de = AliMpDDLStore::Instance()->GetDetElement(detElemId);
663     
664     for ( Int_t manuChannel = 0; manuChannel < kChannels; ++manuChannel )
665     {
666       if ( ! de->IsConnectedChannel(manuId,manuChannel) ) continue;
667       
668       ++nchannels;
669       
670       Float_t meanPedestal;
671       Float_t sigmaPedestal;
672       
673       if ( defaultValues ) 
674       {
675         meanPedestal = 0.0;
676         sigmaPedestal = 1.0;
677       }
678       else
679       {
680         Bool_t positive(kTRUE);
681         meanPedestal = 0.0;
682         
683         if ( manuId & AliMpConstants::ManuMask(AliMp::kNonBendingPlane) ) { // manu in non bending plane
684           
685           while ( meanPedestal == 0.0 ) // avoid strict zero 
686           {
687             meanPedestal = GetRandom(kPedestalMeanMeanNB,kPedestalMeanSigmaNB,positive);
688           }
689           sigmaPedestal = GetRandom(kPedestalSigmaMeanNB,kPedestalSigmaSigmaNB,positive);
690           
691         } else { // manu in bending plane
692           
693           while ( meanPedestal == 0.0 ) // avoid strict zero 
694           {
695             meanPedestal = GetRandom(kPedestalMeanMeanB,kPedestalMeanSigmaB,positive);
696           }
697           sigmaPedestal = GetRandom(kPedestalSigmaMeanB,kPedestalSigmaSigmaB,positive);
698           
699         }
700         
701       }
702       
703       ped->SetValueAsFloat(manuChannel,0,meanPedestal);
704       ped->SetValueAsFloat(manuChannel,1,sigmaPedestal);
705       
706     }
707     Bool_t ok = pedestalStore.Add(ped);
708     if (!ok)
709     {
710       AliErrorGeneral("AliMUONCDB", Form("Could not set DetElemId=%d manuId=%d",detElemId,manuId));
711     }
712   }
713   
714   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("%d Manus and %d channels.",nmanus,nchannels));
715   return nchannels;
716 }
717
718 //_____________________________________________________________________________
719 AliMUONRejectList* 
720 AliMUONCDB::MakeRejectListStore(Bool_t defaultValues)
721 {
722   /// Create a reject list
723   
724   AliCodeTimerAutoGeneral("",0);
725
726   AliMUONRejectList* rl = new AliMUONRejectList;
727   
728   if (!defaultValues)
729   {
730     rl->SetDetectionElementProbability(510);
731     rl->SetDetectionElementProbability(508);
732     return rl;
733   }
734   
735   return rl;
736 }
737
738 //_____________________________________________________________________________
739 Int_t 
740 AliMUONCDB::MakeOccupancyMapStore(AliMUONVStore& occupancyMapStore, Bool_t defaultValues)
741 {
742   /// Create an occupancy map.
743   
744   AliCodeTimerAutoGeneral("",0);
745   
746   if (!AliMUONCDB::CheckMapping()) return 0;
747   
748   Int_t nmanus(0);
749   
750   Int_t detElemId;
751   Int_t manuId;
752   
753   AliMpManuIterator it;
754   
755   Int_t nevents(1000);
756   
757   while ( it.Next(detElemId,manuId) )
758   {
759     ++nmanus;
760     
761     AliMUONVCalibParam* occupancy = new AliMUONCalibParamND(5,1,detElemId,manuId,0);
762     
763     Double_t occ = 0.0;
764
765     AliMpDetElement* de = AliMpDDLStore::Instance()->GetDetElement(detElemId);
766     
767     Int_t numberOfChannelsInManu = de->NofChannelsInManu(manuId);
768     
769     if (!defaultValues) occ = gRandom->Rndm(1);
770
771     Double_t sumn = occ*nevents;
772     
773     occupancy->SetValueAsFloat(0,0,sumn); 
774     occupancy->SetValueAsFloat(0,1,sumn);
775     occupancy->SetValueAsFloat(0,2,sumn);
776     occupancy->SetValueAsInt(0,3,numberOfChannelsInManu);
777     occupancy->SetValueAsInt(0,4,nevents);
778     
779     Bool_t ok = occupancyMapStore.Add(occupancy);
780     if (!ok)
781     {
782       AliErrorGeneral("AliMUONCDB", Form("Could not set DetElemId=%d manuId=%d",detElemId,manuId));
783     }
784   }
785   
786   return nmanus;
787 }
788
789 //_____________________________________________________________________________
790 Int_t
791 AliMUONCDB::MakeCapacitanceStore(AliMUONVStore& capaStore, const char* file)
792 {
793   /// Read the capacitance values from file and append them to the capaStore
794   
795   if (!AliMUONCDB::CheckMapping()) return 0;
796   
797   return AliMUONTrackerIO::ReadCapacitances(file,capaStore);
798 }
799
800 //_____________________________________________________________________________
801 Int_t 
802 AliMUONCDB::MakeCapacitanceStore(AliMUONVStore& capaStore, Bool_t defaultValues)
803 {
804   /// Create a capacitance store. if defaultValues=true, all capa are 1.0,
805   /// otherwise they are from a gaussian with parameters defined in the
806   /// kCapa* constants below.
807
808   AliCodeTimerAutoGeneral("",0);
809   
810   if (!AliMUONCDB::CheckMapping()) return 0;
811   
812   Int_t nchannels(0);
813   Int_t nmanus(0);
814   Int_t nmanusOK(0); // manus for which we got the serial number
815     
816   const Float_t kCapaMean(0.3);
817   const Float_t kCapaSigma(0.1);
818   const Float_t kInjectionGainMean(3);
819   const Float_t kInjectionGainSigma(1);
820
821   Int_t detElemId;
822   Int_t manuId;
823   
824   AliMpManuIterator it;
825   
826   while ( it.Next(detElemId,manuId) )
827   {
828     ++nmanus;
829     
830     AliMpDetElement* de = AliMpDDLStore::Instance()->GetDetElement(detElemId); 
831     Int_t serialNumber = AliMpManuStore::Instance()->GetManuSerial(detElemId, manuId);
832       
833     if ( serialNumber <= 0 ) continue;
834     
835     ++nmanusOK;
836     
837     AliMUONVCalibParam* capa = static_cast<AliMUONVCalibParam*>(capaStore.FindObject(serialNumber));
838     
839     if (!capa)
840     {
841       capa = new AliMUONCalibParamNF(2,AliMpConstants::ManuNofChannels(),serialNumber,0,1.0);
842       Bool_t ok = capaStore.Add(capa);
843       if (!ok)
844       {
845         AliErrorGeneral("AliMUONCDB", Form("Could not set serialNumber=%d manuId=%d",serialNumber,manuId));
846       }      
847     }
848     
849     for ( Int_t manuChannel = 0; manuChannel < capa->Size(); ++manuChannel )
850     {
851       if ( ! de->IsConnectedChannel(manuId,manuChannel) ) continue;
852       
853       ++nchannels;
854       
855       Float_t capaValue;
856       Float_t injectionGain;
857       
858       if ( defaultValues ) 
859       {
860         capaValue = 1.0;
861         injectionGain = 1.0;
862       }
863       else
864       {
865         capaValue = GetRandom(kCapaMean,kCapaSigma,kTRUE);
866         injectionGain = GetRandom(kInjectionGainMean,kInjectionGainSigma,kTRUE);
867       }
868       capa->SetValueAsFloat(manuChannel,0,capaValue);
869       capa->SetValueAsFloat(manuChannel,1,injectionGain);
870     }
871   }
872   
873   Float_t percent = 0;
874   if ( nmanus ) percent = 100*nmanusOK/nmanus;
875   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("%5d manus with serial number (out of %5d manus = %3.0f%%)",
876                nmanusOK,nmanus,percent));
877   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("%5d channels",nchannels));
878   if ( percent < 100 ) 
879   {
880     AliWarningGeneral("AliMUONCDB", "Did not get all serial numbers. capaStore is incomplete !!!!");
881   }
882   return nchannels;
883   
884 }
885
886 //_____________________________________________________________________________
887 Int_t 
888 AliMUONCDB::MakeGainStore(AliMUONVStore& gainStore, Bool_t defaultValues)
889 {  
890   /// Create a gain store. if defaultValues=true, all gains set so that
891   /// charge = (adc-ped)
892   ///
893   /// otherwise parameters are taken from gaussians with parameters 
894   /// defined in the k* constants below.
895   
896   AliCodeTimerAutoGeneral("",0);
897   
898   if (!AliMUONCDB::CheckMapping()) return 0;
899   
900   Int_t nchannels(0);
901   Int_t nmanus(0);
902     
903   const Int_t kSaturation(3000);
904   const Double_t kA0Mean(1.2);
905   const Double_t kA0Sigma(0.1);
906   const Double_t kA1Mean(1E-5);
907   const Double_t kA1Sigma(1E-6);
908   const Double_t kQualMean(0xFF);
909   const Double_t kQualSigma(0x10);
910   const Int_t kThresMean(1600);
911   const Int_t kThresSigma(100);
912   
913   Int_t detElemId;
914   Int_t manuId;
915   
916   AliMpManuIterator it;
917   
918   while ( it.Next(detElemId,manuId) )
919   {
920     ++nmanus;
921
922     AliMUONVCalibParam* gain = 
923       new AliMUONCalibParamNF(5,AliMpConstants::ManuNofChannels(),
924                               detElemId,
925                               manuId,
926                               AliMUONVCalibParam::InvalidFloatValue());
927
928     AliMpDetElement* de = AliMpDDLStore::Instance()->GetDetElement(detElemId);
929
930     for ( Int_t manuChannel = 0; manuChannel < gain->Size(); ++manuChannel )
931     {
932       if ( ! de->IsConnectedChannel(manuId,manuChannel) ) continue;
933       
934       ++nchannels;
935       
936       if ( defaultValues ) 
937       {
938         gain->SetValueAsFloat(manuChannel,0,1.0);
939         gain->SetValueAsFloat(manuChannel,1,0.0);
940         gain->SetValueAsInt(manuChannel,2,4095); 
941         gain->SetValueAsInt(manuChannel,3,1);
942         gain->SetValueAsInt(manuChannel,4,kSaturation);
943       }
944       else
945       {
946         Bool_t positive(kTRUE);
947         gain->SetValueAsFloat(manuChannel,0,GetRandom(kA0Mean,kA0Sigma,positive));
948         gain->SetValueAsFloat(manuChannel,1,GetRandom(kA1Mean,kA1Sigma,!positive));
949         gain->SetValueAsInt(manuChannel,2,(Int_t)TMath::Nint(GetRandom(kThresMean,kThresSigma,positive)));
950         gain->SetValueAsInt(manuChannel,3,(Int_t)TMath::Nint(GetRandom(kQualMean,kQualSigma,positive)));
951         gain->SetValueAsInt(manuChannel,4,kSaturation);        
952       }
953       
954     }
955     Bool_t ok = gainStore.Add(gain);
956     if (!ok)
957     {
958       AliErrorGeneral("AliMUONCDB", Form("Could not set DetElemId=%d manuId=%d",detElemId,manuId));
959     }
960   }
961   
962   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("%d Manus and %d channels.",nmanus,nchannels));
963   return nchannels;
964 }
965
966 //_____________________________________________________________________________
967 Int_t
968 AliMUONCDB::MakeLocalTriggerMaskStore(AliMUONVStore& localBoardMasks)
969 {
970   /// Generate local trigger masks store. All masks are set to FFFF
971   
972   AliCodeTimerAutoGeneral("",0);
973   
974   Int_t ngenerated(0);
975   // Generate fake mask values for all localboards and put that into
976   // one single container (localBoardMasks)
977   for ( Int_t i = 1; i <= AliMpConstants::TotalNofLocalBoards(); ++i )
978   {
979     AliMUONVCalibParam* localBoard = new AliMUONCalibParamNI(1,8,i,0,0);
980     for ( Int_t x = 0; x < 2; ++x )
981     {
982       for ( Int_t y = 0; y < 4; ++y )
983       {
984         Int_t index = x*4+y;
985         localBoard->SetValueAsInt(index,0,0xFFFF);
986         ++ngenerated;
987       }
988     }
989     localBoardMasks.Add(localBoard);
990   }
991   return ngenerated;
992 }
993
994 //_____________________________________________________________________________
995 Int_t
996 AliMUONCDB::MakeRegionalTriggerConfigStore(AliMUONRegionalTriggerConfig& rtm)
997 {
998   /// Make a regional trigger config store. Mask is set to FFFF for each local board (Ch.F.)
999   
1000   AliCodeTimerAutoGeneral("",0);
1001   
1002   if ( ! rtm.ReadData(AliMpFiles::LocalTriggerBoardMapping()) ) {
1003     AliErrorGeneral("AliMUONCDB", "Error when reading from mapping file");
1004     return 0;
1005   }
1006     
1007   return rtm.GetNofTriggerCrates();  
1008 }
1009
1010
1011 //_____________________________________________________________________________
1012 Int_t 
1013 AliMUONCDB::MakeGlobalTriggerConfigStore(AliMUONGlobalCrateConfig& gtm)
1014 {
1015   /// Make a global trigger config store. All masks (disable) set to 0x00 for each Darc board (Ch.F.)
1016   
1017   AliCodeTimerAutoGeneral("",0);
1018   
1019   return gtm.ReadData(AliMpFiles::GlobalTriggerBoardMapping());
1020 }
1021
1022
1023 //_____________________________________________________________________________
1024 AliMUONTriggerLut* 
1025 AliMUONCDB::MakeTriggerLUT(const char* file)
1026 {
1027   /// Make a triggerlut object, from a file.
1028   
1029   AliCodeTimerAutoGeneral("",0);
1030   
1031   AliMUONTriggerLut* lut = new AliMUONTriggerLut;
1032   lut->ReadFromFile(file);
1033   return lut;
1034 }
1035
1036 //_____________________________________________________________________________
1037 AliMUONTriggerEfficiencyCells*
1038 AliMUONCDB::MakeTriggerEfficiency(const char* file)
1039 {
1040   /// Make a trigger efficiency object from a file.
1041   
1042   AliCodeTimerAutoGeneral("",0);
1043   
1044   return new AliMUONTriggerEfficiencyCells(file);
1045 }
1046
1047 //_____________________________________________________________________________
1048 void 
1049 AliMUONCDB::WriteToCDB(const char* calibpath, TObject* object, 
1050                        Int_t startRun, Int_t endRun, 
1051                        const char* filename)
1052 {
1053   /// Write a given object to OCDB
1054   
1055   TString comment(gSystem->ExpandPathName(filename));
1056   
1057   WriteToCDB(object, calibpath, startRun, endRun, comment.Data());
1058 }
1059
1060 //_____________________________________________________________________________
1061 void 
1062 AliMUONCDB::WriteToCDB(const char* calibpath, TObject* object, 
1063                        Int_t startRun, Int_t endRun, Bool_t defaultValues)
1064 {
1065   /// Write a given object to OCDB
1066   
1067   TString comment;
1068   if ( defaultValues ) comment += "Test with default values";
1069   else comment += "Test with random values";
1070   
1071   WriteToCDB(object, calibpath, startRun, endRun, comment.Data());
1072 }
1073
1074 //_____________________________________________________________________________
1075 void
1076 AliMUONCDB::WriteToCDB(TObject* object, const char* calibpath, Int_t startRun, Int_t endRun,
1077                        const char* comment, const char* responsible)
1078 {
1079   /// Write a given object to OCDB
1080   
1081   if (!AliMUONCDB::CheckOCDB(kTRUE)) return;
1082   
1083   AliCDBId id(calibpath,startRun,endRun);
1084   AliCDBMetaData md;
1085   md.SetAliRootVersion(gROOT->GetVersion());
1086   md.SetComment(comment);
1087   md.SetResponsible(responsible);
1088   AliCDBManager::Instance()->Put(object,id,&md);
1089 }
1090
1091 //_____________________________________________________________________________
1092 void
1093 AliMUONCDB::WriteLocalTriggerMasks(Int_t startRun, Int_t endRun)
1094 {  
1095   /// Write local trigger masks to OCDB
1096   
1097   AliMUONVStore* ltm = new AliMUON1DArray(AliMpConstants::TotalNofLocalBoards()+1);
1098   Int_t ngenerated = MakeLocalTriggerMaskStore(*ltm);
1099   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Ngenerated = %d",ngenerated));
1100   if (ngenerated>0)
1101   {
1102     WriteToCDB("MUON/Calib/LocalTriggerBoardMasks",ltm,startRun,endRun,true);
1103   }
1104   delete ltm;
1105 }
1106
1107 //_____________________________________________________________________________
1108 void
1109 AliMUONCDB::WriteRegionalTriggerConfig(Int_t startRun, Int_t endRun)
1110 {  
1111   /// Write regional trigger masks to OCDB
1112   
1113   AliMUONRegionalTriggerConfig* rtm = new AliMUONRegionalTriggerConfig();
1114   Int_t ngenerated = MakeRegionalTriggerConfigStore(*rtm);
1115   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Ngenerated = %d",ngenerated));
1116   if (ngenerated>0)
1117   {
1118     WriteToCDB("MUON/Calib/RegionalTriggerConfig",rtm,startRun,endRun,true);
1119   }
1120   delete rtm;
1121 }
1122
1123
1124 //_____________________________________________________________________________
1125 void
1126 AliMUONCDB::WriteGlobalTriggerConfig(Int_t startRun, Int_t endRun)
1127 {  
1128   /// Write global trigger masks to OCDB
1129   
1130   AliMUONGlobalCrateConfig* gtm = new AliMUONGlobalCrateConfig();
1131
1132   Int_t ngenerated = MakeGlobalTriggerConfigStore(*gtm);
1133   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Ngenerated = %d",ngenerated));
1134   if (ngenerated>0)
1135   {
1136     WriteToCDB("MUON/Calib/GlobalTriggerCrateConfig",gtm,startRun,endRun,true);
1137   }
1138   delete gtm;
1139 }
1140
1141
1142 //_____________________________________________________________________________
1143 void
1144 AliMUONCDB::WriteTriggerLut(Int_t startRun, Int_t endRun)
1145 {  
1146   /// Write trigger LUT to OCDB
1147   
1148   AliMUONTriggerLut* lut = MakeTriggerLUT();
1149   if (lut)
1150   {
1151     WriteToCDB("MUON/Calib/TriggerLut",lut,startRun,endRun,true);
1152   }
1153   delete lut;
1154 }
1155
1156 //_____________________________________________________________________________
1157 void
1158 AliMUONCDB::WriteTriggerEfficiency(Int_t startRun, Int_t endRun)
1159 {  
1160   /// Write trigger efficiency to OCDB
1161   
1162   AliMUONTriggerEfficiencyCells* eff = MakeTriggerEfficiency();
1163   if (eff)
1164   {
1165     WriteToCDB("MUON/Calib/TriggerEfficiency",eff,startRun,endRun,true);
1166   }
1167   delete eff;
1168 }
1169
1170 //_____________________________________________________________________________
1171 void 
1172 AliMUONCDB::WriteHV(Bool_t defaultValues,
1173                     Int_t startRun, Int_t endRun)
1174 {
1175   /// generate HV values (either cste = 1500 V) if defaultValues=true or random
1176   /// if defaultValues=false, see makeHVStore) and
1177   /// store them into CDB located at cdbpath, with a validity period
1178   /// ranging from startRun to endRun
1179   
1180   TMap* hvStore = new TMap;
1181   Int_t ngenerated = MakeHVStore(*hvStore,defaultValues);
1182   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Ngenerated = %d",ngenerated));
1183   if (ngenerated>0)
1184   {
1185     WriteToCDB("MUON/Calib/HV",hvStore,startRun,endRun,defaultValues);
1186   }
1187   delete hvStore;
1188 }
1189
1190 //_____________________________________________________________________________
1191 void 
1192 AliMUONCDB::WriteTriggerDCS(Bool_t defaultValues,
1193                     Int_t startRun, Int_t endRun)
1194 {
1195   /// generate Trigger HV and current values (either const if defaultValues=true or random
1196   /// if defaultValues=false, see makeTriggerDCSStore) and
1197   /// store them into CDB located at cdbpath, with a validity period
1198   /// ranging from startRun to endRun
1199   
1200   TMap* triggerDCSStore = new TMap;
1201   Int_t ngenerated = MakeTriggerDCSStore(*triggerDCSStore,defaultValues);
1202   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Ngenerated = %d",ngenerated));
1203   if (ngenerated>0)
1204   {
1205     WriteToCDB("MUON/Calib/TriggerDCS",triggerDCSStore,startRun,endRun,defaultValues);
1206   }
1207   delete triggerDCSStore;
1208 }
1209
1210 //_____________________________________________________________________________
1211 void 
1212 AliMUONCDB::WritePedestals(Bool_t defaultValues,
1213                            Int_t startRun, Int_t endRun)
1214 {
1215   /// generate pedestal values (either 0 if defaultValues=true or random
1216   /// if defaultValues=false, see makePedestalStore) and
1217   /// store them into CDB located at cdbpath, with a validity period
1218   /// ranging from startRun to endRun
1219   
1220   AliMUONVStore* pedestalStore = Create2DMap();
1221   Int_t ngenerated = MakePedestalStore(*pedestalStore,defaultValues);
1222   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Ngenerated = %d",ngenerated));
1223   WriteToCDB("MUON/Calib/Pedestals",pedestalStore,startRun,endRun,defaultValues);
1224   delete pedestalStore;
1225 }
1226
1227 //_____________________________________________________________________________
1228 void 
1229 AliMUONCDB::WriteOccupancyMap(Bool_t defaultValues,
1230                               Int_t startRun, Int_t endRun)
1231 {
1232   /// generate occupancy map values (either empty one if defaultValues=true, or
1233   /// random one, see MakeOccupancyMapStore) and
1234   /// store them into CDB located at cdbpath, with a validity period
1235   /// ranging from startRun to endRun
1236   
1237   AliMUONVStore* occupancyMapStore = Create2DMap();
1238   Int_t ngenerated = MakeOccupancyMapStore(*occupancyMapStore,defaultValues);
1239   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Ngenerated = %d",ngenerated));
1240   WriteToCDB("MUON/Calib/OccupancyMap",occupancyMapStore,startRun,endRun,defaultValues);
1241   delete occupancyMapStore;
1242 }
1243
1244 //_____________________________________________________________________________
1245 void 
1246 AliMUONCDB::WriteRejectList(Bool_t defaultValues,
1247                               Int_t startRun, Int_t endRun)
1248 {
1249   /// generate reject list values (either empty one if defaultValues=true, or
1250   /// random one, see MakeRejectListStore) and
1251   /// store them into CDB located at cdbpath, with a validity period
1252   /// ranging from startRun to endRun
1253   
1254   AliMUONRejectList* rl = MakeRejectListStore(defaultValues);
1255   WriteToCDB("MUON/Calib/RejectList",rl,startRun,endRun,defaultValues);
1256   delete rl;
1257 }
1258
1259
1260 //_____________________________________________________________________________
1261 void 
1262 AliMUONCDB::WriteGains(Bool_t defaultValues,
1263                        Int_t startRun, Int_t endRun)
1264 {
1265   /// generate gain values (either 1 if defaultValues=true or random
1266   /// if defaultValues=false, see makeGainStore) and
1267   /// store them into CDB located at cdbpath, with a validity period
1268   /// ranging from startRun to endRun
1269   
1270   AliMUONVStore* gainStore = Create2DMap();
1271   Int_t ngenerated = MakeGainStore(*gainStore,defaultValues);
1272   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Ngenerated = %d",ngenerated));  
1273   WriteToCDB("MUON/Calib/Gains",gainStore,startRun,endRun,defaultValues);
1274   delete gainStore;
1275 }
1276
1277 //_____________________________________________________________________________
1278 void 
1279 AliMUONCDB::WriteCapacitances(const char* filename,
1280                               Int_t startRun, Int_t endRun)
1281 {
1282   /// read manu capacitance and injection gain values from file 
1283   /// and store them into CDB located at cdbpath, with a validity period
1284   /// ranging from startRun to endRun
1285   
1286   AliMUONVStore* capaStore = new AliMUON1DMap(16828);
1287   Int_t ngenerated = MakeCapacitanceStore(*capaStore,filename);
1288   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Ngenerated = %d",ngenerated));
1289   if ( ngenerated > 0 ) 
1290   {
1291     WriteToCDB("MUON/Calib/Capacitances",capaStore,startRun,endRun,filename);
1292   }
1293   delete capaStore;
1294 }
1295
1296 //_____________________________________________________________________________
1297 void 
1298 AliMUONCDB::WriteCapacitances(Bool_t defaultValues,
1299                               Int_t startRun, Int_t endRun)
1300 {
1301   /// generate manu capacitance values (either 1 if defaultValues=true or random
1302   /// if defaultValues=false, see makeCapacitanceStore) and
1303   /// store them into CDB located at cdbpath, with a validity period
1304   /// ranging from startRun to endRun
1305   
1306   AliMUONVStore* capaStore = new AliMUON1DMap(16828);
1307   Int_t ngenerated = MakeCapacitanceStore(*capaStore,defaultValues);
1308   AliInfoGeneral("AliMUONCDB", Form("Ngenerated = %d",ngenerated));
1309   WriteToCDB("MUON/Calib/Capacitances",capaStore,startRun,endRun,defaultValues);
1310   delete capaStore;
1311 }
1312
1313 //_____________________________________________________________________________
1314 void
1315 AliMUONCDB::WriteTrigger(Bool_t defaultValues, Int_t startRun, Int_t endRun)
1316 {
1317   /// Writes all Trigger related calibration to CDB
1318   WriteTriggerDCS(defaultValues,startRun,endRun);
1319   WriteLocalTriggerMasks(startRun,endRun);
1320   WriteRegionalTriggerConfig(startRun,endRun);
1321   WriteGlobalTriggerConfig(startRun,endRun);
1322   WriteTriggerLut(startRun,endRun);
1323   WriteTriggerEfficiency(startRun,endRun);
1324 }
1325
1326 //_____________________________________________________________________________
1327 void
1328 AliMUONCDB::WriteConfig(Int_t startRun, Int_t endRun)
1329 {
1330   /// Write complete tracker configuration to OCDB
1331   ostringstream lines;
1332   TIter next(AliMpDDLStore::Instance()->CreateBusPatchIterator());
1333   AliMpBusPatch* bp;
1334   while ( ( bp = static_cast<AliMpBusPatch*>(next()) ) )
1335   {
1336     for (Int_t imanu = 0; imanu < bp->GetNofManus(); ++imanu) 
1337     {
1338       lines << bp->GetId() << " " << bp->GetManuId(imanu) << endl;
1339     }
1340   }
1341   
1342   AliMUON2DMap config(kTRUE);
1343   
1344   AliMUONTrackerIO::DecodeConfig(lines.str().c_str(),config);
1345   
1346   WriteToCDB("MUON/Calib/Config",&config,startRun,endRun,kTRUE);
1347 }
1348
1349 //_____________________________________________________________________________
1350 void
1351 AliMUONCDB::WriteTracker(Bool_t defaultValues, Int_t startRun, Int_t endRun)
1352 {
1353   /// Writes all Tracker related calibration to CDB
1354   WriteHV(defaultValues,startRun,endRun);
1355   WritePedestals(defaultValues,startRun,endRun);
1356   WriteGains(defaultValues,startRun,endRun);
1357   WriteCapacitances(defaultValues,startRun,endRun);
1358   WriteOccupancyMap(defaultValues,startRun,endRun);
1359   WriteRejectList(defaultValues,startRun,endRun);
1360   WriteConfig(startRun,endRun);
1361 }
1362
1363 //_____________________________________________________________________________
1364 void 
1365 AliMUONCDB::ShowCapacitances()
1366 {
1367   /// Show briefly the number of capa values we have in the OCDB,
1368   /// and the list of manu that are actually in the config and for which
1369   /// we miss the capa (if any).
1370   
1371   if (!AliMUONCDB::CheckOCDB()) return;
1372   
1373   AliMUONCDB::LoadMapping();
1374   
1375   if (!AliMUONCDB::CheckMapping()) return;
1376   
1377   AliCDBEntry* e = AliCDBManager::Instance()->Get("MUON/Calib/Config");
1378   
1379   if (!e) return ;
1380   
1381   AliMUONVStore* config = static_cast<AliMUONVStore*>(e->GetObject());
1382   
1383   e = AliCDBManager::Instance()->Get("MUON/Calib/Capacitances");
1384   
1385   if (!e) return;
1386   
1387   AliMUONVStore* capacitances = static_cast<AliMUONVStore*>(e->GetObject());
1388   
1389   AliInfoGeneral("ShowCapacitances",Form("%d capacitances are in OCDB",capacitances->GetSize()));
1390   
1391   TIter nextManu(config->CreateIterator());
1392   AliMUONVCalibParam* param;
1393   
1394   while ( ( param = static_cast<AliMUONVCalibParam*>(nextManu()) ) )
1395   {
1396     Int_t detElemId = param->ID0();
1397     Int_t manuId = param->ID1();
1398     
1399     Int_t serialNumber 
1400     = AliMpManuStore::Instance()->GetManuSerial(detElemId, manuId);
1401     
1402     if (serialNumber<0)
1403     {
1404       AliErrorGeneral("ShowCapacitances",Form("Did not find serial for DE %04d MANUID %04d",detElemId,manuId));
1405     }
1406     else
1407     {
1408       AliMUONVCalibParam* capa = static_cast<AliMUONVCalibParam*>(capacitances->FindObject(serialNumber));
1409       if (!capa)
1410       {
1411         AliErrorGeneral("ShowCapacitances",Form("Did not find capacitance for DE %04d MANUID %04d SERIAL %d",detElemId,manuId,serialNumber));
1412       }
1413     }
1414   }
1415   
1416 }
1417
1418 //_____________________________________________________________________________
1419 void 
1420 AliMUONCDB::ShowConfig(Bool_t withStatusMap)
1421 {  
1422   /// Dumps the current tracker configuration, i.e. number and identity of missing buspatches
1423   /// If statusMap is true, will also take into account the status map to report the number
1424   /// of good channels
1425   
1426   if (!AliMUONCDB::CheckOCDB()) return;
1427   
1428   AliMUONCDB::LoadMapping();
1429   
1430   if (!AliMUONCDB::CheckMapping()) return;
1431   
1432   AliCDBEntry* e = AliCDBManager::Instance()->Get("MUON/Calib/Config");
1433   
1434   if (!e) return ;
1435   
1436   AliMUONVStore* config = static_cast<AliMUONVStore*>(e->GetObject());
1437   
1438   AliMUONPadStatusMapMaker* statusMapMaker(0x0);
1439   AliMUONCalibrationData* cd(0x0);
1440   AliMUONPadStatusMaker* statusMaker(0x0);
1441
1442   if ( withStatusMap ) 
1443   {
1444     cd = new AliMUONCalibrationData(AliCDBManager::Instance()->GetRun());
1445   
1446     statusMaker = new AliMUONPadStatusMaker(*cd);
1447
1448     AliMUONRecoParam* recoParam = AliMUONCDB::LoadRecoParam();
1449   
1450     if (!recoParam)
1451     {
1452       AliErrorGeneral("AliMUONCDB::ShowConfig","Cannot get recoParams from OCDB !");
1453       return;
1454     }
1455     
1456     statusMaker->SetLimits(*recoParam);
1457   
1458     UInt_t mask = recoParam->PadGoodnessMask();
1459
1460     delete recoParam;
1461     
1462     const Bool_t deferredInitialization = kFALSE;
1463   
1464     statusMapMaker = new AliMUONPadStatusMapMaker(*cd,mask,deferredInitialization);
1465   }
1466   
1467   TIter nextManu(config->CreateIterator());
1468   AliMUONVCalibParam* param;
1469   
1470   AliMpExMap buspatches;
1471   
1472   while ( ( param = static_cast<AliMUONVCalibParam*>(nextManu()) ) )
1473   {
1474     Int_t detElemId = param->ID0();
1475     Int_t manuId = param->ID1();
1476     Int_t busPatchId = AliMpDDLStore::Instance()->GetBusPatchId(detElemId,manuId);
1477     if ( buspatches.GetValue(busPatchId) == 0x0 ) 
1478     {      
1479       buspatches.Add(busPatchId,new TObjString(Form("BP%04d",busPatchId)));
1480     }
1481   }
1482
1483   TArrayI removed(buspatches.GetSize());
1484
1485   TIter next(AliMpDDLStore::Instance()->CreateBusPatchIterator());
1486   AliMpBusPatch* bp;
1487   Int_t n(0);
1488   Int_t nok(0);
1489   Int_t nremoved(0);
1490   
1491   // accounting of bus patches first
1492   
1493   while ( ( bp = static_cast<AliMpBusPatch*>(next())))
1494   {
1495     if ( buspatches.GetValue(bp->GetId()) )
1496     {
1497       ++nok;
1498     }
1499     else
1500     {
1501       removed.SetAt(bp->GetId(),nremoved++);
1502     }
1503   }
1504   
1505   // accounting of channels
1506   
1507   AliMpManuIterator it;
1508
1509   Int_t totalNumberOfChannels(0);
1510   Int_t removedChannels(0);
1511   Int_t badChannels(0);
1512   Int_t badAndRemovedChannels(0);
1513   Int_t badOrRemovedChannels(0);
1514   
1515   Int_t detElemId, manuId;
1516   
1517   while ( it.Next(detElemId,manuId) )
1518   {
1519     AliMpDetElement* de = AliMpDDLStore::Instance()->GetDetElement(detElemId);
1520     for ( Int_t i = 0; i < AliMpConstants::ManuNofChannels(); ++i )
1521     {
1522       Int_t busPatchId = AliMpDDLStore::Instance()->GetBusPatchId(detElemId,manuId);
1523       
1524       if ( de->IsConnectedChannel(manuId,i) )
1525       {
1526         ++totalNumberOfChannels;
1527         Bool_t badBusPatch = ( buspatches.GetValue(busPatchId) == 0x0 );
1528         
1529         if ( withStatusMap ) 
1530         {
1531           Bool_t badChannel = ( ( statusMapMaker->StatusMap(detElemId,manuId,i) & AliMUONPadStatusMapMaker::SelfDeadMask() ) != 0);
1532           if ( badChannel ) ++badChannels;
1533           if ( badBusPatch && badChannel ) ++badAndRemovedChannels;
1534           if ( badBusPatch || badChannel ) ++badOrRemovedChannels;          
1535         }
1536       
1537         if ( badBusPatch) ++removedChannels;
1538       }
1539     }
1540   }
1541   
1542   
1543   Int_t* indices = new Int_t[nremoved];
1544   
1545   TMath::Sort(nremoved,removed.GetArray(),indices,kFALSE);
1546   
1547   for ( Int_t i = 0; i < nremoved; ++i ) 
1548   {
1549     Int_t busPatchId = removed[indices[i]];
1550     bp = AliMpDDLStore::Instance()->GetBusPatch(busPatchId);
1551     bp->Print();
1552   }
1553   
1554   delete[] indices;  
1555   
1556   cout << endl;
1557   cout << Form("Bus patches n=%3d nok=%3d nremoved=%3d",n,nok,nremoved) << endl;
1558
1559   cout << Form("Channels n=%6d nremoved=%6d bad=%6d bad and removed=%6d bad or removed=%6d",
1560                totalNumberOfChannels,removedChannels,badChannels,badAndRemovedChannels,badOrRemovedChannels) << endl;
1561   
1562   if (totalNumberOfChannels>0)
1563   {
1564     cout << Form("Percentage of readout channels %5.1f %%",removedChannels*100.0/totalNumberOfChannels) << endl;
1565     if ( withStatusMap )
1566     {
1567       cout << Form("Percentage of non useable channels (bad or removed) %5.1f %%",
1568                    badOrRemovedChannels*100.0/totalNumberOfChannels) << endl;
1569     }
1570   }
1571   
1572   
1573   delete statusMapMaker;
1574   delete cd;
1575   delete statusMaker;  
1576 }
1577
1578 //______________________________________________________________________________
1579 void AliMUONCDB::ReadIntegers(const char* filename, std::vector<int>& integers)
1580 {
1581   /// Read integers from filename, where integers are either
1582   /// separated by "," or by return carriage
1583   ifstream in(gSystem->ExpandPathName(filename));
1584   int i;
1585   
1586   std::set<int> runset;
1587   
1588   char line[10000];
1589   
1590   in.getline(line,10000,'\n');
1591   
1592   TString sline(line);
1593   
1594   if (sline.Contains(","))
1595   {
1596     TObjArray* a = sline.Tokenize(",");
1597     TIter next(a);
1598     TObjString* s;
1599     while ( ( s = static_cast<TObjString*>(next()) ) )
1600     {
1601       runset.insert(s->String().Atoi());
1602     }
1603     delete a;
1604   }
1605   else
1606   {
1607     runset.insert(sline.Atoi());
1608     
1609     while ( in >> i )
1610     {
1611       runset.insert(i);
1612     }
1613   }
1614   
1615   for ( std::set<int>::const_iterator it = runset.begin(); it != runset.end(); ++it ) 
1616   {
1617     integers.push_back((*it)); 
1618   }
1619   
1620   std::sort(integers.begin(),integers.end());
1621 }
1622
1623 //______________________________________________________________________________
1624 void AliMUONCDB::ShowFaultyBusPatches(const char* runlist, double occLimit,
1625                                       const char* outputBaseName,
1626                                       const char* ocdbPath)
1627 {
1628   /// Shows the list of bus patches above a given occupancy limit,
1629   /// for each run in the runlist
1630   
1631   AliLog::GetRootLogger()->SetGlobalLogLevel(AliLog::kError);
1632   
1633   //  AliLog::SetPrintType(AliLog::kInfo,kFALSE);
1634   //  AliLog::SetPrintType(AliLog::kWarning,kFALSE);
1635   //  gErrorIgnoreLevel=kError; // to avoid all the TAlienFile::Open messages...
1636   
1637   AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
1638   
1639   man->SetDefaultStorage(ocdbPath);
1640   
1641   Bool_t first(kTRUE);
1642   
1643   std::vector<int> runnumbers;
1644   
1645   ReadIntegers(runlist,runnumbers);
1646   
1647   AliMUON2DMap bpValues(kFALSE);
1648   
1649   std::ofstream outfile(Form("%s.txt",outputBaseName));
1650   
1651   for ( unsigned int i = 0 ; i < runnumbers.size(); ++i )
1652   {
1653     int runNumber = runnumbers[i];
1654     
1655     man->SetRun(runNumber);
1656     
1657     if ( first ) 
1658     {
1659       AliMpCDB::LoadAll();  
1660       first = kFALSE;
1661     }
1662     
1663     AliCDBEntry* e = man->Get("MUON/Calib/OccupancyMap",runNumber);
1664     
1665     if (!e)
1666     {
1667       AliErrorGeneral("AliMUONCDB::ShowFaultyBusPatches",
1668                       Form("Could not get OccupancyMap for run %09d",runNumber));
1669       continue;
1670     }
1671     
1672     AliMUONVStore* occmap = static_cast<AliMUONVStore*>(e->GetObject());
1673     
1674     AliMUONTrackerData td("occ","occ",*occmap);
1675     
1676     TIter nextBP(AliMpDDLStore::Instance()->CreateBusPatchIterator());
1677     AliMpBusPatch* bp;
1678     std::set<int> buspatches;
1679     Double_t sumn = 1000.0;
1680     
1681     while ( ( bp = static_cast<AliMpBusPatch*>(nextBP()) ) )
1682     {      
1683       Double_t occ = td.BusPatch(bp->GetId(),2);
1684       
1685       if (occ>occLimit) 
1686       {
1687         buspatches.insert(bp->GetId());
1688         
1689         AliMUONVCalibParam* param = static_cast<AliMUONVCalibParam*>(bpValues.FindObject(bp->GetId()));
1690         
1691         if (!param)
1692         {
1693           param = new AliMUONCalibParamND(5, 1, bp->GetId(), 0);
1694           bpValues.Add(param);
1695           
1696           Int_t detElemId = AliMpDDLStore::Instance()->GetDEfromBus(bp->GetId());
1697           AliMpDetElement* de = AliMpDDLStore::Instance()->GetDetElement(detElemId);
1698           
1699           Int_t nchannels(0);
1700           
1701           for ( Int_t imanu = 0; imanu < bp->GetNofManus(); ++imanu ) 
1702           {
1703             Int_t manuId = bp->GetManuId(imanu);
1704             nchannels += de->NofChannelsInManu(manuId);
1705           }
1706           
1707           param->SetValueAsDouble(0,2,sumn);
1708           param->SetValueAsDouble(0,3,nchannels);
1709           param->SetValueAsDouble(0,4,1);          
1710         }
1711         
1712         Double_t sumw = sumn*(param->ValueAsDouble(0)/sumn+1.0/runnumbers.size());
1713         Double_t sumw2 = 0.0; //(sumn-1)*ey*ey+sumw*sumw/sumn;
1714         
1715         param->SetValueAsDouble(0,0,sumw);
1716         param->SetValueAsDouble(0,1,sumw2);
1717         
1718       }
1719     }
1720     
1721     outfile << Form("RUN %09d",runNumber);
1722     
1723     for ( std::set<int>::const_iterator bit = buspatches.begin(); bit != buspatches.end(); ++bit )
1724     {
1725       outfile << Form(" %4d",*bit);
1726     }
1727     outfile << endl;
1728   }
1729   
1730   outfile.close();
1731   
1732   const char* name = "BPfailureRate";
1733   
1734   AliMUONTrackerData* mpData = new AliMUONTrackerData(name,name,bpValues,2);
1735   mpData->SetDimensionName(0,name);
1736   
1737   TFile f(Form("%s.root",outputBaseName),"recreate");
1738   mpData->Write();
1739   f.Close();
1740   
1741   cout << Form("Results are in %s.txt and %s.root",outputBaseName,outputBaseName) << endl;
1742   
1743   gSystem->Exec(Form("cat %s.txt",outputBaseName));
1744   
1745 }
1746
1747 //______________________________________________________________________________
1748 void AliMUONCDB::CheckHV(Int_t runNumber, Int_t verbose)
1749 {
1750   /// Check the HV values in OCDB for a given run
1751   
1752   TList messages;
1753   messages.SetOwner(kTRUE);
1754   
1755   Bool_t patched(kTRUE);
1756   
1757   if (!AliCDBManager::Instance()->IsDefaultStorageSet())
1758   {
1759     AliCDBManager::Instance()->SetDefaultStorage("raw://");
1760   }
1761
1762   AliCDBManager::Instance()->SetRun(runNumber);
1763
1764   LoadMapping();
1765   
1766   AliMUONCalibrationData::CreateHV(runNumber,0,patched,&messages);
1767   
1768   AliMUONCalibrationData cd(runNumber,true);
1769   
1770   AliMUONPadStatusMaker statusMaker(cd);
1771   
1772   AliMUONRecoParam* rp = AliMUONCDB::LoadRecoParam();
1773   
1774   if (!rp)
1775   {
1776     AliErrorGeneral("AliMUONCDB::CheckHV","Could not get RecoParam !!!");
1777     return;
1778   }
1779   
1780   statusMaker.SetLimits(*rp);
1781   
1782   TIter next(&messages);
1783   TObjString* s;
1784   AliMpDCSNamer hvNamer("TRACKER");
1785   AliMUONLogger log;
1786   
1787   while ( ( s = static_cast<TObjString*>(next()) ) )
1788   {
1789     TObjArray* a = s->String().Tokenize(":");
1790     
1791     TString name(static_cast<TObjString*>(a->At(0))->String());
1792     
1793     if ( name.Contains("sw") || name.Contains("SUMMARY") ) {delete a; continue;}
1794     
1795     Int_t index = hvNamer.DCSIndexFromDCSAlias(name.Data());
1796     
1797     Int_t detElemId = hvNamer.DetElemIdFromDCSAlias(name.Data());
1798     
1799     AliMpDetElement* de = AliMpDDLStore::Instance()->GetDetElement(detElemId);
1800     
1801     if (!de)
1802     {
1803       AliErrorGeneral("AliMUONCDB::CheckHV",Form("Could not get detElemId from dcsAlias %s",name.Data()));
1804       delete a;
1805       continue;
1806     }
1807     
1808     Int_t manuId;
1809     
1810     if ( index >= 0 )
1811     {
1812       const AliMpArrayI* array = de->ManusForHV(index);
1813       manuId = array->GetValue(0);
1814     }
1815     else
1816       
1817     {
1818       AliMpBusPatch* bp = AliMpDDLStore::Instance()->GetBusPatch(de->GetBusPatchId(0));
1819       
1820       manuId = bp->GetManuId(0);
1821     }
1822     
1823     Int_t status = statusMaker.HVStatus(detElemId,manuId);
1824     
1825     log.Log(AliMUONPadStatusMaker::AsString(status).Data());
1826     
1827     s->String() += Form(" (DE %4d) ",detElemId);
1828     s->String() += AliMUONPadStatusMaker::AsString(status).Data();
1829     
1830     delete a;
1831   }    
1832   
1833   TIter nextMessage(&messages);
1834   TObjString* msg;
1835   
1836   while ( ( msg = static_cast<TObjString*>(nextMessage()) ) )
1837   {
1838     if ( verbose > 0 || msg->String().Contains("SUMMARY") )
1839     {
1840       AliInfoGeneral("AliMUONCDB::CheckHV",Form("RUN %09d HVchannel %s",runNumber,msg->String().Data()));
1841     }
1842   }
1843   
1844   TString lmsg;
1845   Int_t occurance;
1846   TString totalLog;
1847   
1848   while (log.Next(lmsg,occurance))
1849   {
1850     totalLog += Form("%s(%d)",lmsg.Data(),occurance);
1851     totalLog += " | ";
1852   }
1853
1854   AliInfoGeneral("AliMUONCDB::CheckHV",Form("RUN %09d %s",runNumber,totalLog.Data()));
1855
1856   // one last loop to get the list of problematic HV channels
1857   nextMessage.Reset();
1858   
1859   while ( ( msg = static_cast<TObjString*>(nextMessage()) ) )
1860   {
1861     if ( msg->String().Contains("HV ") )
1862     {
1863       AliInfoGeneral("AliMUONCDB::CheckHV",Form("     Problem at %s",msg->String().Data()));      
1864     }
1865   }
1866    
1867   AliCDBManager::Instance()->ClearCache();
1868 }
1869
1870