MUON/AliMUONClusterSplitterMLEM.cxx

   1 /**************************************************************************
   2 * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3 *                                                                        *
   4 * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5 * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6 *                                                                        *
   7 * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8 * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9 * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10 * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11 * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12 * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13 * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 // $Id$
  17
  18 /// \class AliMUONClusterSplitterMLEM
  19 ///
  20 /// Splitter class for the MLEM algorithm...
  21 ///
  22 /// FIXME: describe it a little bit more here...
  23 ///
  24 /// \author Laurent Aphecetche (for the "new" C++ structure) and
  25 /// Alexander Zinchenko, JINR Dubna, for the hardcore of it ;-)
  26
  27 #include "AliMUONClusterSplitterMLEM.h"
  28
  29 #include "AliMUONCluster.h"
  30 #include "AliMUONPad.h"
  31 #include "AliMUONPad.h"
  32 #include "AliMpStationType.h"
  33 #include "AliMUONConstants.h"
  34 #include "AliMpDEManager.h"
  35 #include "AliMUONMathieson.h"
  36
  37 #include "AliLog.h"
  38
  39 #include <TClonesArray.h>
  40 #include <TH2.h>
  41 #include <TMath.h>
  42 #include <TMatrixD.h>
  43 #include <TObjArray.h>
  44 #include <TROOT.h>
  45 #include <TRandom.h>
  46 #include <Riostream.h>
  47
  48 /// \cond CLASSIMP
  49 ClassImp(AliMUONClusterSplitterMLEM)
  50 /// \endcond
  51
  52 const Double_t AliMUONClusterSplitterMLEM::fgkCouplMin = 1.e-3; // threshold on coupling
  53
  54 //_____________________________________________________________________________
  55 AliMUONClusterSplitterMLEM::AliMUONClusterSplitterMLEM(Int_t detElemId,
  56                                                        TObjArray* fPixArray)
  57 : TObject(),
  58 fPixArray(fPixArray),
  59 fMathieson(0x0),
  60 fDetElemId(detElemId),
  61 fNpar(0),
  62 fQtot(0),
  63 fnCoupled(0),
  64 fDebug(0)
  65 {
  66   /// Constructor
  67
  68   AliMp::StationType stationType = AliMpDEManager::GetStationType(fDetElemId);
  69
  70   Float_t kx3 = AliMUONConstants::SqrtKx3();
  71   Float_t ky3 = AliMUONConstants::SqrtKy3();
  72   Float_t pitch = AliMUONConstants::Pitch();
  73
  74   if ( stationType == AliMp::kStation1 )
  75   {
  76     kx3 = AliMUONConstants::SqrtKx3St1();
  77     ky3 = AliMUONConstants::SqrtKy3St1();
  78     pitch = AliMUONConstants::PitchSt1();
  79   }
  80
  81   fMathieson = new AliMUONMathieson;
  82
  83   fMathieson->SetPitch(pitch);
  84   fMathieson->SetSqrtKx3AndDeriveKx2Kx4(kx3);
  85   fMathieson->SetSqrtKy3AndDeriveKy2Ky4(ky3);
  86
  87 }
  88
  89 //_____________________________________________________________________________
  90 AliMUONClusterSplitterMLEM::~AliMUONClusterSplitterMLEM()
  91 {
  92   /// Destructor
  93
  94   delete fMathieson;
  95 }
  96
  97 //_____________________________________________________________________________
  98 void
  99 AliMUONClusterSplitterMLEM::AddBin(TH2 *mlem,
 100                                    Int_t ic, Int_t jc, Int_t mode,
 101                                    Bool_t *used, TObjArray *pix)
 102 {
 103   /// Add a bin to the cluster
 104
 105   Int_t nx = mlem->GetNbinsX();
 106   Int_t ny = mlem->GetNbinsY();
 107   Double_t cont1, cont = mlem->GetCellContent(jc,ic);
 108   AliMUONPad *pixPtr = 0;
 109
 110   for (Int_t i=TMath::Max(ic-1,1); i<=TMath::Min(ic+1,ny); i++) {
 111     for (Int_t j=TMath::Max(jc-1,1); j<=TMath::Min(jc+1,nx); j++) {
 112       if (i != ic && j != jc) continue;
 113       if (used[(i-1)*nx+j-1]) continue;
 114       cont1 = mlem->GetCellContent(j,i);
 115       if (mode && cont1 > cont) continue;
 116       used[(i-1)*nx+j-1] = kTRUE;
 117       if (cont1 < 0.5) continue;
 118       if (pix) pix->Add(BinToPix(mlem,j,i));
 119       else {
 120         pixPtr = new AliMUONPad (mlem->GetXaxis()->GetBinCenter(j),
 121                                    mlem->GetYaxis()->GetBinCenter(i), 0, 0, cont1);
 122         fPixArray->Add((TObject*)pixPtr);
 123       }
 124       AddBin(mlem, i, j, mode, used, pix); // recursive call
 125     }
 126   }
 127 }
 128
 129 //_____________________________________________________________________________
 130 void
 131 AliMUONClusterSplitterMLEM::AddCluster(Int_t ic, Int_t nclust,
 132                                        TMatrixD& aijcluclu,
 133                                        Bool_t *used, Int_t *clustNumb, Int_t &nCoupled)
 134 {
 135   /// Add a cluster to the group of coupled clusters
 136
 137   for (Int_t i=0; i<nclust; i++) {
 138     if (used[i]) continue;
 139     if (aijcluclu(i,ic) < fgkCouplMin) continue;
 140     used[i] = kTRUE;
 141     clustNumb[nCoupled++] = i;
 142     AddCluster(i, nclust, aijcluclu, used, clustNumb, nCoupled);
 143   }
 144 }
 145
 146 //_____________________________________________________________________________
 147 TObject*
 148 AliMUONClusterSplitterMLEM::BinToPix(TH2 *mlem,
 149                                      Int_t jc, Int_t ic)
 150 {
 151   /// Translate histogram bin to pixel
 152
 153   Double_t yc = mlem->GetYaxis()->GetBinCenter(ic);
 154   Double_t xc = mlem->GetXaxis()->GetBinCenter(jc);
 155
 156   Int_t nPix = fPixArray->GetEntriesFast();
 157   AliMUONPad *pixPtr = NULL;
 158
 159   // Compare pixel and bin positions
 160   for (Int_t i=0; i<nPix; i++) {
 161     pixPtr = (AliMUONPad*) fPixArray->UncheckedAt(i);
 162     if (pixPtr->Charge() < 0.5) continue;
 163     if (TMath::Abs(pixPtr->Coord(0)-xc)<1.e-4 && TMath::Abs(pixPtr->Coord(1)-yc)<1.e-4)
 164     {
 165       return (TObject*) pixPtr;
 166     }
 167   }
 168   AliError(Form(" Something wrong ??? %f %f ", xc, yc));
 169   return NULL;
 170 }
 171
 172 //_____________________________________________________________________________
 173 Float_t
 174 AliMUONClusterSplitterMLEM::ChargeIntegration(Double_t x, Double_t y,
 175                                               const AliMUONPad& pad)
 176 {
 177   /// Compute the Mathieson integral on pad area, assuming the center
 178   /// of the Mathieson is at (x,y)
 179
 180   TVector2 lowerLeft(TVector2(x,y)-pad.Position()-pad.Dimensions());
 181   TVector2 upperRight(lowerLeft + pad.Dimensions()*2.0);
 182
 183         return fMathieson->IntXY(lowerLeft.X(),lowerLeft.Y(),
 184                            upperRight.X(),upperRight.Y());
 185 }
 186
 187 //_____________________________________________________________________________
 188 void
 189 AliMUONClusterSplitterMLEM::Fcn1(const AliMUONCluster& cluster,
 190                                     Int_t & /*fNpar*/, Double_t * /*gin*/,
 191                                     Double_t &f, Double_t *par, Int_t /*iflag*/)
 192 {
 193   /// Fit for one track
 194
 195   Int_t indx, npads=0;
 196   Double_t charge, delta, coef=0, chi2=0, qTot = 0;
 197
 198   for (Int_t j=0; j< cluster.Multiplicity(); ++j)
 199   {
 200     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 201     if ( pad->Status() !=1 || pad->IsSaturated() ) continue;
 202     if ( pad->IsReal() ) npads++; // exclude virtual pads
 203     qTot += pad->Charge(); // c.fXyq[2][j];
 204     charge = 0;
 205     for (Int_t i=fNpar/3; i>=0; --i)
 206     { // sum over tracks
 207       indx = i<2 ? 2*i : 2*i+1;
 208       if (fNpar == 2)
 209       {
 210         coef = 1;
 211       }
 212       else
 213       {
 214         coef = i==fNpar/3 ? par[indx+2] : 1-coef;
 215       }
 216       coef = TMath::Max (coef, 0.);
 217       if ( fNpar == 8 && i < 2)
 218       {
 219         coef = i==1 ? coef*par[indx+2] : coef - par[7];
 220       }
 221       coef = TMath::Max (coef, 0.);
 222       charge += ChargeIntegration(par[indx],par[indx+1],*pad) * coef;
 223     }
 224     charge *= fQtot;
 225     delta = charge - pad->Charge(); //c.fXyq[2][j];
 226     delta *= delta;
 227     delta /= pad->Charge(); //c.fXyq[2][j];
 228     chi2 += delta;
 229   } // for (Int_t j=0;
 230   f = chi2;
 231   Double_t qAver = qTot/npads;
 232   f = chi2/qAver;
 233 }
 234
 235 //_____________________________________________________________________________
 236 Int_t
 237 AliMUONClusterSplitterMLEM::Fit(const AliMUONCluster& cluster,
 238                                 Int_t iSimple, Int_t nfit,
 239                                 Int_t *clustFit, TObjArray **clusters,
 240                                 Double_t *parOk,
 241                                 TObjArray& clusterList)
 242 {
 243   /// Find selected clusters to selected pad charges
 244
 245   //  AliDebug(2,Form("iSimple=%d nfit=%d",iSimple,nfit));
 246
 247   TH2D *mlem = (TH2D*) gROOT->FindObject("mlem");
 248   Double_t xmin = mlem->GetXaxis()->GetXmin() - mlem->GetXaxis()->GetBinWidth(1);
 249   Double_t xmax = mlem->GetXaxis()->GetXmax() + mlem->GetXaxis()->GetBinWidth(1);
 250   Double_t ymin = mlem->GetYaxis()->GetXmin() - mlem->GetYaxis()->GetBinWidth(1);
 251   Double_t ymax = mlem->GetYaxis()->GetXmax() + mlem->GetYaxis()->GetBinWidth(1);
 252   Double_t step[3]={0.01,0.002,0.02}, xPad = 0, yPad = 99999;
 253
 254   // Number of pads to use and number of virtual pads
 255   Int_t npads = 0, nVirtual = 0, nfit0 = nfit;
 256   //cluster.Print("full");
 257   for (Int_t i=0; i<cluster.Multiplicity(); ++i )
 258   {
 259     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(i);
 260     if ( !pad->IsReal() ) ++nVirtual;
 261     if ( pad->Status() !=1 || pad->IsSaturated() ) continue;
 262     if ( pad->IsReal() )
 263     {
 264       ++npads;
 265       if (yPad > 9999)
 266       {
 267         xPad = pad->X();//fXyq[0][i];
 268         yPad = pad->Y();//fXyq[1][i];
 269       }
 270       else
 271       {
 272         if (pad->DY() < pad->DX() ) //fXyq[4][i] < fXyq[3][i])
 273         {
 274           yPad = pad->Y();//fXyq[1][i];
 275         }
 276         else
 277         {
 278           xPad = pad->X();//fXyq[0][i];
 279         }
 280       }
 281     }
 282   }
 283
 284   fNpar = 0;
 285   fQtot = 0;
 286
 287   if (npads < 2) return 0;
 288
 289   // FIXME : AliWarning("Reconnect the following code for hit/track passing ?");
 290
 291   //  Int_t tracks[3] = {-1, -1, -1};
 292
 293   /*
 294    Int_t digit = 0;
 295    AliMUONDigit *mdig = 0;
 296    for (Int_t cath=0; cath<2; cath++) {
 297      for (Int_t i=0; i<fnPads[0]+fnPads[1]; i++) {
 298        if (fPadIJ[0][i] != cath) continue;
 299        if (fPadIJ[1][i] != 1) continue;
 300        if (fXyq[3][i] < 0) continue; // exclude virtual pads
 301        digit = TMath::Nint (fXyq[5][i]);
 302        if (digit >= 0) mdig = fInput->Digit(cath,digit);
 303        else mdig = fInput->Digit(TMath::Even(cath),-digit-1);
 304        //if (!mdig) mdig = fInput->Digit(TMath::Even(cath),digit);
 305        if (!mdig) continue; // protection for cluster display
 306        if (mdig->Hit() >= 0) {
 307          if (tracks[0] < 0) {
 308            tracks[0] = mdig->Hit();
 309            tracks[1] = mdig->Track(0);
 310          } else if (mdig->Track(0) < tracks[1]) {
 311            tracks[0] = mdig->Hit();
 312            tracks[1] = mdig->Track(0);
 313          }
 314        }
 315        if (mdig->Track(1) >= 0 && mdig->Track(1) != tracks[1]) {
 316          if (tracks[2] < 0) tracks[2] = mdig->Track(1);
 317          else tracks[2] = TMath::Min (tracks[2], mdig->Track(1));
 318        }
 319      } // for (Int_t i=0;
 320   } // for (Int_t cath=0;
 321    */
 322
 323   // Get number of pads in X and Y
 324 //  Int_t nInX = 0, nInY;
 325 //  PadsInXandY(cluster,nInX, nInY);
 326   const Int_t kStatusToTest(1);
 327
 328   AliMpIntPair nofPads = cluster.NofPads(kStatusToTest);
 329   Int_t nInX = nofPads.GetFirst();
 330   Int_t nInY = nofPads.GetSecond();
 331
 332   if (fDebug) {
 333     Int_t npadOK = 0;
 334     for (Int_t j = 0; j < cluster.Multiplicity(); ++j) {
 335       AliMUONPad *pad = cluster.Pad(j);
 336       if (pad->Status() == 1 && !pad->IsSaturated()) npadOK++;
 337     }
 338     cout << " Number of pads to fit: " << npadOK << endl;
 339     cout << " nInX and Y: " << nInX << " " << nInY << endl;
 340   }
 341
 342   Int_t nfitMax = 3;
 343   nfitMax = TMath::Min (nfitMax, (npads + 1) / 3);
 344   if (nfitMax > 1) {
 345     if (nInX < 3 && nInY < 3 || nInX == 3 && nInY < 3 || nInX < 3 && nInY == 3) nfitMax = 1; // not enough pads in each direction
 346   }
 347   if (nfit > nfitMax) nfit = nfitMax;
 348
 349   // Take cluster maxima as fitting seeds
 350   TObjArray *pix;
 351   AliMUONPad *pixPtr;
 352   Int_t npxclu;
 353   Double_t cont, cmax = 0, xseed = 0, yseed = 0, errOk[8], qq = 0;
 354   Double_t xyseed[3][2], qseed[3], xyCand[3][2] = {{0},{0}}, sigCand[3][2] = {{0},{0}};
 355
 356   for (Int_t ifit=1; ifit<=nfit0; ifit++)
 357   {
 358     cmax = 0;
 359     pix = clusters[clustFit[ifit-1]];
 360     npxclu = pix->GetEntriesFast();
 361     //qq = 0;
 362     for (Int_t clu=0; clu<npxclu; ++clu)
 363     {
 364       pixPtr = (AliMUONPad*) pix->UncheckedAt(clu);
 365       cont = pixPtr->Charge();
 366       fQtot += cont;
 367       if (cont > cmax)
 368       {
 369         cmax = cont;
 370         xseed = pixPtr->Coord(0);
 371         yseed = pixPtr->Coord(1);
 372       }
 373       qq += cont;
 374       xyCand[0][0] += pixPtr->Coord(0) * cont;
 375       xyCand[0][1] += pixPtr->Coord(1) * cont;
 376       sigCand[0][0] += pixPtr->Coord(0) * pixPtr->Coord(0) * cont;
 377       sigCand[0][1] += pixPtr->Coord(1) * pixPtr->Coord(1) * cont;
 378     }
 379     xyseed[ifit-1][0] = xseed;
 380     xyseed[ifit-1][1] = yseed;
 381     qseed[ifit-1] = cmax;
 382   } // for (Int_t ifit=1;
 383
 384   xyCand[0][0] /= qq; // <x>
 385   xyCand[0][1] /= qq; // <y>
 386   sigCand[0][0] = sigCand[0][0]/qq - xyCand[0][0]*xyCand[0][0]; // <x^2> - <x>^2
 387   sigCand[0][0] = sigCand[0][0] > 0 ? TMath::Sqrt (sigCand[0][0]) : 0;
 388   sigCand[0][1] = sigCand[0][1]/qq - xyCand[0][1]*xyCand[0][1]; // <y^2> - <y>^2
 389   sigCand[0][1] = sigCand[0][1] > 0 ? TMath::Sqrt (sigCand[0][1]) : 0;
 390   if (fDebug) cout << xyCand[0][0] << " " << xyCand[0][1] << " " << sigCand[0][0] << " " << sigCand[0][1] << endl;
 391
 392   Int_t nDof, maxSeed[3];//, nMax = 0;
 393     Double_t fmin, chi2o = 9999, chi2n;
 394
 395     TMath::Sort(nfit0, qseed, maxSeed, kTRUE); // in decreasing order
 396
 397     Double_t *gin = 0, func0, func1, param[8], step0[8];
 398     Double_t param0[2][8]={{0},{0}}, deriv[2][8]={{0},{0}};
 399     Double_t shift[8], stepMax, derMax, parmin[8], parmax[8], func2[2], shift0;
 400     Double_t delta[8], scMax, dder[8], estim, shiftSave = 0;
 401     Int_t min, max, nCall = 0, nLoop, idMax = 0, iestMax = 0, nFail;
 402     Double_t rad, dist[3] = {0};
 403
 404     // Try to fit with one-track hypothesis, then 2-track. If chi2/dof is
 405     // lower, try 3-track (if number of pads is sufficient).
 406     for (Int_t iseed=0; iseed<nfit; iseed++)
 407     {
 408
 409       Int_t memory[8] = {0};
 410       if (iseed)
 411       {
 412         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++)
 413         {
 414           param[j] = parOk[j];
 415         }
 416       } // for bounded params
 417
 418       for (Int_t j=0; j<3; j++)
 419       {
 420         step0[fNpar+j] = shift[fNpar+j] = step[j];
 421       }
 422
 423       if (nfit == 1)
 424       {
 425         param[fNpar] = xyCand[0][0]; // take COG
 426       }
 427       else
 428       {
 429         param[fNpar] = xyseed[maxSeed[iseed]][0];
 430       }
 431       parmin[fNpar] = xmin;
 432       parmax[fNpar++] = xmax;
 433       if (nfit == 1)
 434       {
 435         param[fNpar] = xyCand[0][1]; // take COG
 436       }
 437       else
 438       {
 439         param[fNpar] = xyseed[maxSeed[iseed]][1];
 440       }
 441       parmin[fNpar] = ymin;
 442       parmax[fNpar++] = ymax;
 443       if (fNpar > 2)
 444       {
 445         param[fNpar] = fNpar == 4 ? 0.5 : 0.3;
 446         parmin[fNpar] = 0;
 447         parmax[fNpar++] = 1;
 448       }
 449       if (iseed)
 450       {
 451         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++)
 452         {
 453           param0[1][j] = 0;
 454         }
 455       }
 456
 457       // Try new algorithm
 458       min = nLoop = 1; stepMax = func2[1] = derMax = 999999; nFail = 0;
 459
 460       while (1)
 461       {
 462         max = !min;
 463         Fcn1(cluster,fNpar, gin, func0, param, 1); nCall++;
 464         //cout << " Func: " << func0 << endl;
 465
 466         func2[max] = func0;
 467         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++)
 468         {
 469           param0[max][j] = param[j];
 470           delta[j] = step0[j];
 471           param[j] += delta[j] / 10;
 472           if (j > 0) param[j-1] -= delta[j-1] / 10;
 473           Fcn1(cluster,fNpar, gin, func1, param, 1); nCall++;
 474           deriv[max][j] = (func1 - func0) / delta[j] * 10; // first derivative
 475                                                            //cout << j << " " << deriv[max][j] << endl;
 476           dder[j] = param0[0][j] != param0[1][j] ? (deriv[0][j] - deriv[1][j]) /
 477             (param0[0][j] - param0[1][j]) : 0; // second derivative
 478         }
 479         param[fNpar-1] -= delta[fNpar-1] / 10;
 480         if (nCall > 2000) break;
 481
 482         min = func2[0] < func2[1] ? 0 : 1;
 483         nFail = min == max ? 0 : nFail + 1;
 484
 485         stepMax = derMax = estim = 0;
 486         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++)
 487         {
 488           // Estimated distance to minimum
 489           shift0 = shift[j];
 490           if (nLoop == 1)
 491           {
 492             shift[j] = TMath::Sign (step0[j], -deriv[max][j]); // first step
 493           }
 494           else if (TMath::Abs(deriv[0][j]) < 1.e-3 && TMath::Abs(deriv[1][j]) < 1.e-3)
 495           {
 496             shift[j] = 0;
 497           }
 498           else if (deriv[min][j]*deriv[!min][j] > 0 && TMath::Abs(deriv[min][j]) > TMath::Abs(deriv[!min][j])
 499                    || TMath::Abs(deriv[0][j]-deriv[1][j]) < 1.e-3 || TMath::Abs(dder[j]) < 1.e-6)
 500           {
 501             shift[j] = -TMath::Sign (shift[j], (func2[0]-func2[1]) * (param0[0][j]-param0[1][j]));
 502             if (min == max)
 503             {
 504               if (memory[j] > 1)
 505               {
 506                 shift[j] *= 2;
 507               }
 508               memory[j]++;
 509             }
 510           }
 511           else
 512           {
 513             shift[j] = dder[j] != 0 ? -deriv[min][j] / dder[j] : 0;
 514             memory[j] = 0;
 515           }
 516
 517           if (TMath::Abs(shift[j])/step0[j] > estim)
 518           {
 519             estim = TMath::Abs(shift[j])/step0[j];
 520             iestMax = j;
 521           }
 522
 523           // Too big step
 524           if (TMath::Abs(shift[j])/step0[j] > 10) shift[j] = TMath::Sign(10.,shift[j]) * step0[j]; //
 525
 526           // Failed to improve minimum
 527           if (min != max)
 528           {
 529             memory[j] = 0;
 530             param[j] = param0[min][j];
 531             if (TMath::Abs(shift[j]+shift0) > 0.1*step0[j])
 532             {
 533               shift[j] = (shift[j] + shift0) / 2;
 534             }
 535             else
 536             {
 537               shift[j] /= -2;
 538             }
 539           }
 540
 541           // Too big step
 542           if (TMath::Abs(shift[j]*deriv[min][j]) > func2[min])
 543           {
 544             shift[j] = TMath::Sign (func2[min]/deriv[min][j], shift[j]);
 545           }
 546
 547           // Introduce step relaxation factor
 548           if (memory[j] < 3)
 549           {
 550             scMax = 1 + 4 / TMath::Max(nLoop/2.,1.);
 551             if (TMath::Abs(shift0) > 0 && TMath::Abs(shift[j]/shift0) > scMax)
 552             {
 553               shift[j] = TMath::Sign (shift0*scMax, shift[j]);
 554             }
 555           }
 556           param[j] += shift[j];
 557           //MLEM Check parameter limits 27-12-2004
 558           if (param[j] < parmin[j])
 559           {
 560             shift[j] = parmin[j] - param[j];
 561             param[j] = parmin[j];
 562           }
 563           else if (param[j] > parmax[j])
 564           {
 565             shift[j] = parmax[j] - param[j];
 566             param[j] = parmax[j];
 567           }
 568           //cout << " xxx " << j << " " << shift[j] << " " << param[j] << endl;
 569           stepMax = TMath::Max (stepMax, TMath::Abs(shift[j]/step0[j]));
 570           if (TMath::Abs(deriv[min][j]) > derMax)
 571           {
 572             idMax = j;
 573             derMax = TMath::Abs (deriv[min][j]);
 574           }
 575         } // for (Int_t j=0; j<fNpar;
 576
 577         if (estim < 1 && derMax < 2 || nLoop > 150) break; // minimum was found
 578
 579         nLoop++;
 580
 581         // Check for small step
 582         if (shift[idMax] == 0)
 583         {
 584           shift[idMax] = step0[idMax]/10;
 585           param[idMax] += shift[idMax];
 586           continue;
 587         }
 588
 589         if (!memory[idMax] && derMax > 0.5 && nLoop > 10)
 590         {
 591           if (dder[idMax] != 0 && TMath::Abs(deriv[min][idMax]/dder[idMax]/shift[idMax]) > 10)
 592           {
 593             if (min == max) dder[idMax] = -dder[idMax];
 594             shift[idMax] = -deriv[min][idMax] / dder[idMax] / 10;
 595             param[idMax] += shift[idMax];
 596             stepMax = TMath::Max (stepMax, TMath::Abs(shift[idMax])/step0[idMax]);
 597             if (min == max) shiftSave = shift[idMax];
 598           }
 599           if (nFail > 10)
 600           {
 601             param[idMax] -= shift[idMax];
 602             shift[idMax] = 4 * shiftSave * (gRandom->Rndm(0) - 0.5);
 603             param[idMax] += shift[idMax];
 604           }
 605         }
 606   } // while (1)
 607
 608       fmin = func2[min];
 609
 610       nDof = npads - fNpar + nVirtual;
 611       if (!nDof) nDof++;
 612       chi2n = fmin / nDof;
 613       if (fDebug) cout << " Chi2 " << chi2n << " " << fNpar << endl;
 614
 615       if (chi2n*1.2+1.e-6 > chi2o ) { fNpar -= 3; break; }
 616
 617       // Save parameters and errors
 618
 619       if (nInX == 1) {
 620         // One pad per direction
 621         for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) if (i == 0 || i == 2 || i == 5) param0[min][i] = xPad;
 622       }
 623       if (nInY == 1) {
 624         // One pad per direction
 625         for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) if (i == 1 || i == 3 || i == 6) param0[min][i] = yPad;
 626       }
 627
 628       /*
 629        if (iseed > 0) {
 630          // Find distance to the nearest neighbour
 631          dist[0] = dist[1] = TMath::Sqrt ((param0[min][0]-param0[min][2])*
 632                                           (param0[min][0]-param0[min][2])
 633                                           +(param0[min][1]-param0[min][3])*
 634                                           (param0[min][1]-param0[min][3]));
 635          if (iseed > 1) {
 636            dist[2] = TMath::Sqrt ((param0[min][0]-param0[min][5])*
 637                                   (param0[min][0]-param0[min][5])
 638                                   +(param0[min][1]-param0[min][6])*
 639                                   (param0[min][1]-param0[min][6]));
 640            rad = TMath::Sqrt ((param0[min][2]-param0[min][5])*
 641                               (param0[min][2]-param0[min][5])
 642                               +(param0[min][3]-param0[min][6])*
 643                               (param0[min][3]-param0[min][6]));
 644            if (dist[2] < dist[0]) dist[0] = dist[2];
 645            if (rad < dist[1]) dist[1] = rad;
 646            if (rad < dist[2]) dist[2] = rad;
 647          }
 648          cout << dist[0] << " " << dist[1] << " " << dist[2] << endl;
 649          if (dist[TMath::LocMin(iseed+1,dist)] < 1.) { fNpar -= 3; break; }
 650        }
 651        */
 652
 653       for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) {
 654         parOk[i] = param0[min][i];
 655         //errOk[i] = fmin;
 656         errOk[i] = chi2n;
 657         // Bounded params
 658         parOk[i] = TMath::Max (parOk[i], parmin[i]);
 659         parOk[i] = TMath::Min (parOk[i], parmax[i]);
 660       }
 661
 662       chi2o = chi2n;
 663       if (fmin < 0.1) break; // !!!???
 664     } // for (Int_t iseed=0;
 665
 666     if (fDebug) {
 667       for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) {
 668         if (i == 4 || i == 7) {
 669           if (i == 7 || i == 4 && fNpar < 7) cout << parOk[i] << endl;
 670           else cout << parOk[i] * (1-parOk[7]) << endl;
 671           continue;
 672         }
 673         cout << parOk[i] << " " << errOk[i] << endl;
 674       }
 675     }
 676     nfit = (fNpar + 1) / 3;
 677     dist[0] = dist[1] = dist[2] = 0;
 678
 679     if (nfit > 1) {
 680       // Find distance to the nearest neighbour
 681       dist[0] = dist[1] = TMath::Sqrt ((parOk[0]-parOk[2])*
 682                                        (parOk[0]-parOk[2])
 683                                        +(parOk[1]-parOk[3])*
 684                                        (parOk[1]-parOk[3]));
 685       if (nfit > 2) {
 686         dist[2] = TMath::Sqrt ((parOk[0]-parOk[5])*
 687                                (parOk[0]-parOk[5])
 688                                +(parOk[1]-parOk[6])*
 689                                (parOk[1]-parOk[6]));
 690         rad = TMath::Sqrt ((parOk[2]-parOk[5])*
 691                            (parOk[2]-parOk[5])
 692                            +(parOk[3]-parOk[6])*
 693                            (parOk[3]-parOk[6]));
 694         if (dist[2] < dist[0]) dist[0] = dist[2];
 695         if (rad < dist[1]) dist[1] = rad;
 696         if (rad < dist[2]) dist[2] = rad;
 697       }
 698     }
 699
 700     Int_t indx;
 701
 702     //if (!fDraw) {
 703
 704     Double_t coef = 0;
 705     if (iSimple) fnCoupled = 0;
 706     //for (Int_t j=0; j<nfit; j++) {
 707     for (Int_t j=nfit-1; j>=0; j--) {
 708       indx = j<2 ? j*2 : j*2+1;
 709       if (nfit == 1) coef = 1;
 710       else coef = j==nfit-1 ? parOk[indx+2] : 1-coef;
 711       coef = TMath::Max (coef, 0.);
 712       if (nfit == 3 && j < 2) coef = j==1 ? coef*parOk[indx+2] : coef - parOk[7];
 713       coef = TMath::Max (coef, 0.);
 714
 715       //void AliMUONClusterFinderMLEM::AddRawCluster(Double_t x, Double_t y,
 716       //                                             Double_t qTot, Double_t fmin,
 717       //                                             Int_t nfit, Int_t *tracks,
 718       //                                             Double_t /*sigx*/,
 719       //                                             Double_t /*sigy*/,
 720       //                                             Double_t /*dist*/)
 721
 722       if ( coef*fQtot >= 14 )
 723       {
 724         //AZ AliMUONCluster* cluster1 = new AliMUONCluster();
 725         AliMUONCluster* cluster1 = new AliMUONCluster(cluster);
 726
 727         cluster1->SetCharge(coef*fQtot,coef*fQtot);
 728         cluster1->SetPosition(TVector2(parOk[indx],parOk[indx+1]),TVector2(sigCand[0][0],sigCand[0][1]));
 729         cluster1->SetChi2(dist[TMath::LocMin(nfit,dist)]);
 730
 731         // FIXME: we miss some information in this cluster, as compared to
 732         // the original AddRawCluster code.
 733
 734         AliDebug(2,Form("Adding RawCluster detElemId %4d mult %2d charge %5d (xl,yl)=(%9.6g,%9.6g)",
 735                         fDetElemId,cluster1->Multiplicity(),(Int_t)cluster1->Charge(),
 736                         cluster1->Position().X(),cluster1->Position().Y()));
 737
 738         clusterList.Add(cluster1);
 739       }
 740       //      AddRawCluster (parOk[indx], // double x
 741       //                     parOk[indx+1], // double y
 742       //                     coef*qTot, // double charge
 743       //                     errOk[indx], // double fmin
 744       //                     nfit0+10*nfit+100*nMax+10000*fnCoupled, // int nfit
 745       //                     tracks, // int* tracks
 746       //                     sigCand[0][0], // double sigx
 747       //                     sigCand[0][1], // double sigy
 748       //                     dist[TMath::LocMin(nfit,dist)] // double dist
 749       //                     );
 750     }
 751     return nfit;
 752     }
 753
 754
 755 //_____________________________________________________________________________
 756 void
 757 AliMUONClusterSplitterMLEM::Split(const AliMUONCluster& cluster,
 758                                   TH2 *mlem,
 759                                   Double_t *coef,
 760                                   TObjArray& clusterList)
 761 {
 762   /// The main steering function to work with clusters of pixels in anode
 763   /// plane (find clusters, decouple them from each other, merge them (if
 764   /// necessary), pick up coupled pads, call the fitting function)
 765
 766   Int_t nx = mlem->GetNbinsX();
 767   Int_t ny = mlem->GetNbinsY();
 768   Int_t nPix = fPixArray->GetEntriesFast();
 769
 770   Bool_t *used = new Bool_t[ny*nx];
 771   Double_t cont;
 772   Int_t nclust = 0, indx, indx1;
 773
 774   for (Int_t i=0; i<ny*nx; i++) used[i] = kFALSE;
 775
 776   TObjArray *clusters[200]={0};
 777   TObjArray *pix;
 778
 779   // Find clusters of histogram bins (easier to work in 2-D space)
 780   for (Int_t i=1; i<=ny; i++)
 781   {
 782     for (Int_t j=1; j<=nx; j++)
 783     {
 784       indx = (i-1)*nx + j - 1;
 785       if (used[indx]) continue;
 786       cont = mlem->GetCellContent(j,i);
 787       if (cont < 0.5) continue;
 788       pix = new TObjArray(20);
 789       used[indx] = 1;
 790       pix->Add(BinToPix(mlem,j,i));
 791       AddBin(mlem, i, j, 0, used, pix); // recursive call
 792       if (nclust >= 200) AliFatal(" Too many clusters !!!");
 793       clusters[nclust++] = pix;
 794     } // for (Int_t j=1; j<=nx; j++) {
 795     } // for (Int_t i=1; i<=ny;
 796 //  if (fDebug) cout << nclust << endl;
 797   delete [] used; used = 0;
 798
 799   // Compute couplings between clusters and clusters to pads
 800   Int_t npad = cluster.Multiplicity();
 801
 802   // Exclude pads with overflows
 803   for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 804   {
 805     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 806     if ( pad->IsSaturated() )
 807     {
 808       pad->SetStatus(-5);
 809     }
 810     else
 811     {
 812       pad->SetStatus(0);
 813     }
 814   }
 815
 816   // Compute couplings of clusters to pads
 817   TMatrixD aijclupad(nclust,npad);
 818   aijclupad = 0;
 819   Int_t npxclu;
 820   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; ++iclust)
 821   {
 822     pix = clusters[iclust];
 823     npxclu = pix->GetEntriesFast();
 824     for (Int_t i=0; i<npxclu; ++i)
 825     {
 826       indx = fPixArray->IndexOf(pix->UncheckedAt(i));
 827       for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 828       {
 829         AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 830         if ( pad->Status() < 0 && pad->Status() != -5) continue;
 831         if (coef[j*nPix+indx] < fgkCouplMin) continue;
 832         aijclupad(iclust,j) += coef[j*nPix+indx];
 833       }
 834     }
 835   }
 836
 837   // Compute couplings between clusters
 838   TMatrixD aijcluclu(nclust,nclust);
 839   aijcluclu = 0;
 840   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; ++iclust)
 841   {
 842     for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 843     {
 844       // Exclude overflows
 845       if ( cluster.Pad(j)->Status() < 0) continue;
 846       if (aijclupad(iclust,j) < fgkCouplMin) continue;
 847       for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nclust; iclust1++)
 848       {
 849         if (aijclupad(iclust1,j) < fgkCouplMin) continue;
 850         aijcluclu(iclust,iclust1) +=
 851           TMath::Sqrt (aijclupad(iclust,j)*aijclupad(iclust1,j));
 852       }
 853     }
 854   }
 855   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; ++iclust)
 856   {
 857     for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nclust; ++iclust1)
 858     {
 859       aijcluclu(iclust1,iclust) = aijcluclu(iclust,iclust1);
 860     }
 861   }
 862
 863   // Find groups of coupled clusters
 864   used = new Bool_t[nclust];
 865   for (Int_t i=0; i<nclust; i++) used[i] = kFALSE;
 866   Int_t *clustNumb = new Int_t[nclust];
 867   Int_t nCoupled, nForFit, minGroup[3], clustFit[3], nfit = 0;
 868   Double_t parOk[8];
 869
 870   for (Int_t igroup=0; igroup<nclust; igroup++)
 871   {
 872     if (used[igroup]) continue;
 873     used[igroup] = kTRUE;
 874     clustNumb[0] = igroup;
 875     nCoupled = 1;
 876     // Find group of coupled clusters
 877     AddCluster(igroup, nclust, aijcluclu, used, clustNumb, nCoupled); // recursive
 878
 879     //    if (fDebug) {
 880     //      cout << " nCoupled: " << nCoupled << endl;
 881     //      for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) cout << clustNumb[i] << " "; cout << endl;
 882     //    }
 883
 884     fnCoupled = nCoupled;
 885
 886     while (nCoupled > 0)
 887     {
 888       if (nCoupled < 4)
 889       {
 890         nForFit = nCoupled;
 891         for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) clustFit[i] = clustNumb[i];
 892       }
 893       else
 894       {
 895         // Too many coupled clusters to fit - try to decouple them
 896         // Find the lowest coupling of 1, 2, min(3,nLinks/2) pixels with
 897         // all the others in the group
 898         for (Int_t j=0; j<3; j++) minGroup[j] = -1;
 899         /*Double_t coupl =*/ MinGroupCoupl(nCoupled, clustNumb, aijcluclu, minGroup);
 900
 901         // Flag clusters for fit
 902         nForFit = 0;
 903         while (minGroup[nForFit] >= 0 && nForFit < 3)
 904         {
 905           clustFit[nForFit] = clustNumb[minGroup[nForFit]];
 906           clustNumb[minGroup[nForFit]] -= 999;
 907           nForFit++;
 908         }
 909       } // else
 910
 911       // Select pads for fit.
 912       if (SelectPad(cluster,nCoupled, nForFit, clustNumb, clustFit, aijclupad) < 3 && nCoupled > 1)
 913       {
 914         // Deselect pads
 915         for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 916         {
 917           AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 918           if ( pad->Status()==1 ) pad->SetStatus(0);
 919           if ( pad->Status()==-9) pad->SetStatus(-5);
 920         }
 921         // Merge the failed cluster candidates (with too few pads to fit) with
 922         // the one with the strongest coupling
 923         Merge(cluster,nForFit, nCoupled, clustNumb, clustFit, clusters, aijcluclu, aijclupad);
 924       }
 925       else
 926       {
 927         // Do the fit
 928         nfit = Fit(cluster,0, nForFit, clustFit, clusters, parOk, clusterList);
 929       }
 930
 931       // Subtract the fitted charges from pads with strong coupling and/or
 932       // return pads for further use
 933       UpdatePads(cluster,nfit, parOk);
 934
 935       // Mark used pads
 936       for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 937       {
 938         AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 939         if ( pad->Status()==1 ) pad->SetStatus(-1);
 940         if ( pad->Status()==-9) pad->SetStatus(-5);
 941       }
 942
 943       // Sort the clusters (move to the right the used ones)
 944       Int_t beg = 0, end = nCoupled - 1;
 945       while (beg < end)
 946       {
 947         if (clustNumb[beg] >= 0) { ++beg; continue; }
 948         for (Int_t j=end; j>beg; --j)
 949         {
 950           if (clustNumb[j] < 0) continue;
 951           end = j - 1;
 952           indx = clustNumb[beg];
 953           clustNumb[beg] = clustNumb[j];
 954           clustNumb[j] = indx;
 955           break;
 956         }
 957         ++beg;
 958       }
 959
 960       nCoupled -= nForFit;
 961       if (nCoupled > 3)
 962       {
 963         // Remove couplings of used clusters
 964         for (Int_t iclust=nCoupled; iclust<nCoupled+nForFit;++ iclust)
 965         {
 966           indx = clustNumb[iclust] + 999;
 967           for (Int_t iclust1=0; iclust1<nCoupled; ++iclust1)
 968           {
 969             indx1 = clustNumb[iclust1];
 970             aijcluclu(indx,indx1) = aijcluclu(indx1,indx) = 0;
 971           }
 972         }
 973
 974         // Update the remaining clusters couplings (exclude couplings from
 975         // the used pads)
 976         for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 977         {
 978           AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 979           if ( pad->Status() != -1) continue;
 980           for (Int_t iclust=0; iclust<nCoupled; ++iclust)
 981           {
 982             indx = clustNumb[iclust];
 983             if (aijclupad(indx,j) < fgkCouplMin) continue;
 984             for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nCoupled; ++iclust1)
 985             {
 986               indx1 = clustNumb[iclust1];
 987               if (aijclupad(indx1,j) < fgkCouplMin) continue;
 988               // Check this
 989               aijcluclu(indx,indx1) -=
 990                 TMath::Sqrt (aijclupad(indx,j)*aijclupad(indx1,j));
 991               aijcluclu(indx1,indx) = aijcluclu(indx,indx1);
 992             }
 993           }
 994           pad->SetStatus(-8);
 995         } // for (Int_t j=0; j<npad;
 996       } // if (nCoupled > 3)
 997     } // while (nCoupled > 0)
 998   } // for (Int_t igroup=0; igroup<nclust;
 999
1000   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; iclust++)
1001   {
1002     pix = clusters[iclust];
1003     pix->Clear();
1004     delete pix;
1005     pix = 0;
1006   }
1007   delete [] clustNumb;
1008   clustNumb = 0;
1009   delete [] used;
1010   used = 0;
1011
1012 }
1013
1014 //_____________________________________________________________________________
1015 void
1016 AliMUONClusterSplitterMLEM::Merge(const AliMUONCluster& cluster,
1017                                      Int_t nForFit, Int_t nCoupled,
1018                                      Int_t *clustNumb, Int_t *clustFit,
1019                                      TObjArray **clusters,
1020                                      TMatrixD& aijcluclu, TMatrixD& aijclupad)
1021 {
1022   /// Merge the group of clusters with the one having the strongest coupling with them
1023
1024   Int_t indx, indx1, npxclu, npxclu1, imax=0;
1025   TObjArray *pix, *pix1;
1026   Double_t couplMax;
1027
1028   for (Int_t icl=0; icl<nForFit; ++icl)
1029   {
1030     indx = clustFit[icl];
1031     pix = clusters[indx];
1032     npxclu = pix->GetEntriesFast();
1033     couplMax = -1;
1034     for (Int_t icl1=0; icl1<nCoupled; ++icl1)
1035     {
1036       indx1 = clustNumb[icl1];
1037       if (indx1 < 0) continue;
1038       if ( aijcluclu(indx,indx1) > couplMax)
1039       {
1040         couplMax = aijcluclu(indx,indx1);
1041         imax = indx1;
1042       }
1043     } // for (Int_t icl1=0;
1044       // Add to it
1045     pix1 = clusters[imax];
1046     npxclu1 = pix1->GetEntriesFast();
1047     // Add pixels
1048     for (Int_t i=0; i<npxclu; ++i)
1049     {
1050       pix1->Add(pix->UncheckedAt(i));
1051       pix->RemoveAt(i);
1052     }
1053
1054     //Add cluster-to-cluster couplings
1055     for (Int_t icl1=0; icl1<nCoupled; ++icl1)
1056     {
1057       indx1 = clustNumb[icl1];
1058       if (indx1 < 0 || indx1 == imax) continue;
1059       aijcluclu(indx1,imax) += aijcluclu(indx,indx1);
1060       aijcluclu(imax,indx1) = aijcluclu(indx1,imax);
1061     }
1062     aijcluclu(indx,imax) = aijcluclu(imax,indx) = 0;
1063
1064     //Add cluster-to-pad couplings
1065     for (Int_t j=0; j<cluster.Multiplicity(); ++j)
1066     {
1067       AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1068       if ( pad->Status() < 0 && pad->Status() != -5 ) continue;// exclude used pads
1069         aijclupad(imax,j) += aijclupad(indx,j);
1070         aijclupad(indx,j) = 0;
1071     }
1072   } // for (Int_t icl=0; icl<nForFit;
1073 }
1074
1075
1076 //_____________________________________________________________________________
1077 Double_t
1078 AliMUONClusterSplitterMLEM::MinGroupCoupl(Int_t nCoupled, Int_t *clustNumb,
1079                                           TMatrixD& aijcluclu, Int_t *minGroup)
1080 {
1081   /// Find group of clusters with minimum coupling to all the others
1082
1083   Int_t i123max = TMath::Min(3,nCoupled/2);
1084   Int_t indx, indx1, indx2, indx3, nTot = 0;
1085   Double_t *coupl1 = 0, *coupl2 = 0, *coupl3 = 0;
1086
1087   for (Int_t i123=1; i123<=i123max; i123++) {
1088
1089     if (i123 == 1) {
1090       coupl1 = new Double_t [nCoupled];
1091       for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) coupl1[i] = 0;
1092     }
1093     else if (i123 == 2) {
1094       nTot = nCoupled*nCoupled;
1095       coupl2 = new Double_t [nTot];
1096       for (Int_t i=0; i<nTot; i++) coupl2[i] = 9999;
1097     } else {
1098       nTot = nTot*nCoupled;
1099       coupl3 = new Double_t [nTot];
1100       for (Int_t i=0; i<nTot; i++) coupl3[i] = 9999;
1101     } // else
1102
1103     for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) {
1104       indx1 = clustNumb[i];
1105       for (Int_t j=i+1; j<nCoupled; j++) {
1106         indx2 = clustNumb[j];
1107         if (i123 == 1) {
1108           coupl1[i] += aijcluclu(indx1,indx2);
1109           coupl1[j] += aijcluclu(indx1,indx2);
1110         }
1111         else if (i123 == 2) {
1112           indx = i*nCoupled + j;
1113           coupl2[indx] = coupl1[i] + coupl1[j];
1114           coupl2[indx] -= 2 * (aijcluclu(indx1,indx2));
1115         } else {
1116           for (Int_t k=j+1; k<nCoupled; k++) {
1117             indx3 = clustNumb[k];
1118             indx = i*nCoupled*nCoupled + j*nCoupled + k;
1119             coupl3[indx] = coupl2[i*nCoupled+j] + coupl1[k];
1120             coupl3[indx] -= 2 * (aijcluclu(indx1,indx3)+aijcluclu(indx2,indx3));
1121           }
1122         } // else
1123       } // for (Int_t j=i+1;
1124     } // for (Int_t i=0;
1125   } // for (Int_t i123=1;
1126
1127   // Find minimum coupling
1128   Double_t couplMin = 9999;
1129   Int_t locMin = 0;
1130
1131   for (Int_t i123=1; i123<=i123max; i123++) {
1132     if (i123 == 1) {
1133       locMin = TMath::LocMin(nCoupled, coupl1);
1134       couplMin = coupl1[locMin];
1135       minGroup[0] = locMin;
1136       delete [] coupl1; coupl1 = 0;
1137     }
1138     else if (i123 == 2) {
1139       locMin = TMath::LocMin(nCoupled*nCoupled, coupl2);
1140       if (coupl2[locMin] < couplMin) {
1141         couplMin = coupl2[locMin];
1142         minGroup[0] = locMin/nCoupled;
1143         minGroup[1] = locMin%nCoupled;
1144       }
1145       delete [] coupl2; coupl2 = 0;
1146     } else {
1147       locMin = TMath::LocMin(nTot, coupl3);
1148       if (coupl3[locMin] < couplMin) {
1149         couplMin = coupl3[locMin];
1150         minGroup[0] = locMin/nCoupled/nCoupled;
1151         minGroup[1] = locMin%(nCoupled*nCoupled)/nCoupled;
1152         minGroup[2] = locMin%nCoupled;
1153       }
1154       delete [] coupl3; coupl3 = 0;
1155     } // else
1156   } // for (Int_t i123=1;
1157   return couplMin;
1158 }
1159
1160 //_____________________________________________________________________________
1161 Int_t
1162 AliMUONClusterSplitterMLEM::SelectPad(const AliMUONCluster& cluster,
1163                                           Int_t nCoupled, Int_t nForFit,
1164                                           Int_t *clustNumb, Int_t *clustFit,
1165                                           TMatrixD& aijclupad)
1166 {
1167   /// Select pads for fit. If too many coupled clusters, find pads giving
1168   /// the strongest coupling with the rest of clusters and exclude them from the fit.
1169
1170   Int_t npad = cluster.Multiplicity();
1171   Double_t *padpix = 0;
1172
1173   if (nCoupled > 3)
1174   {
1175     padpix = new Double_t[npad];
1176     for (Int_t i=0; i<npad; i++) padpix[i] = 0;
1177   }
1178
1179   Int_t nOK = 0, indx, indx1;
1180   for (Int_t iclust=0; iclust<nForFit; ++iclust)
1181   {
1182     indx = clustFit[iclust];
1183     for (Int_t j=0; j<npad; j++)
1184     {
1185       if ( aijclupad(indx,j) < fgkCouplMin) continue;
1186       AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1187       if ( pad->Status() == -5 ) pad->SetStatus(-0); // flag overflow
1188       if ( pad->Status() < 0 ) continue; // exclude overflows and used pads
1189       if ( !pad->Status() )
1190       {
1191         pad->SetStatus(1);
1192         ++nOK; // pad to be used in fit
1193       }
1194       if (nCoupled > 3)
1195       {
1196         // Check other clusters
1197         for (Int_t iclust1=0; iclust1<nCoupled; ++iclust1)
1198         {
1199           indx1 = clustNumb[iclust1];
1200           if (indx1 < 0) continue;
1201           if ( aijclupad(indx1,j) < fgkCouplMin ) continue;
1202           padpix[j] += aijclupad(indx1,j);
1203         }
1204       } // if (nCoupled > 3)
1205     } // for (Int_t j=0; j<npad;
1206   } // for (Int_t iclust=0; iclust<nForFit
1207   if (nCoupled < 4) return nOK;
1208
1209   Double_t aaa = 0;
1210   for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
1211   {
1212     if (padpix[j] < fgkCouplMin) continue;
1213     aaa += padpix[j];
1214     cluster.Pad(j)->SetStatus(-1); // exclude pads with strong coupling to the other clusters
1215     nOK--;
1216   }
1217   delete [] padpix;
1218   padpix = 0;
1219   return nOK;
1220 }
1221
1222 //_____________________________________________________________________________
1223 void
1224 AliMUONClusterSplitterMLEM::UpdatePads(const AliMUONCluster& cluster,
1225                                           Int_t /*nfit*/, Double_t *par)
1226 {
1227   /// Subtract the fitted charges from pads with strong coupling
1228
1229   Int_t indx;
1230   Double_t charge, coef=0;
1231
1232   for (Int_t j=0; j<cluster.Multiplicity(); ++j)
1233   {
1234     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1235     if ( pad->Status() != -1 ) continue;
1236     if (fNpar != 0)
1237     {
1238       charge = 0;
1239       for (Int_t i=fNpar/3; i>=0; --i)
1240       {
1241         // sum over tracks
1242         indx = i<2 ? 2*i : 2*i+1;
1243         if (fNpar == 2)
1244         {
1245           coef = 1;
1246         }
1247         else
1248         {
1249           coef = i==fNpar/3 ? par[indx+2] : 1-coef;
1250         }
1251         coef = TMath::Max (coef, 0.);
1252         if (fNpar == 8 && i < 2)
1253         {
1254           coef = i==1 ? coef*par[indx+2] : coef - par[7];
1255         }
1256         coef = TMath::Max (coef, 0.);
1257         charge += ChargeIntegration(par[indx],par[indx+1],*pad) * coef;
1258       }
1259       charge *= fQtot;
1260       pad->SetCharge(pad->Charge()-charge);
1261     } // if (fNpar != 0)
1262
1263     if (pad->Charge() > 6 /*fgkZeroSuppression*/) pad->SetStatus(0);
1264     // return pad for further using // FIXME: remove usage of zerosuppression here
1265
1266   } // for (Int_t j=0;
1267 }
1268
1269