PHOS/AliPHOS.cxx

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  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 /* History of cvs commits:
  17  *
  18  * $Log$
  19  * Revision 1.116  2007/10/10 09:05:10  schutz
  20  * Changing name QualAss to QA
  21  *
  22  * Revision 1.115  2007/08/22 09:20:50  hristov
  23  * Updated QA classes (Yves)
  24  *
  25  * Revision 1.114  2007/08/07 14:12:03  kharlov
  26  * Quality assurance added (Yves Schutz)
  27  *
  28  * Revision 1.113  2007/07/18 16:29:54  policheh
  29  * Raw Sdigits energy converted to GeV.
  30  *
  31  * Revision 1.112  2007/02/25 22:59:13  policheh
  32  * Digits2Raw(): ALTRO buffer and mapping created per each DDL.
  33  *
  34  * Revision 1.111  2007/02/18 15:21:47  kharlov
  35  * Corrections for memory leak in Digits2Raw due to AliAltroMapping
  36  *
  37  * Revision 1.110  2007/02/13 10:52:08  policheh
  38  * Raw2SDigits() implemented
  39  *
  40  * Revision 1.109  2007/02/05 10:43:25  hristov
  41  * Changes for correct initialization of Geant4 (Mihaela)
  42  *
  43  * Revision 1.108  2007/02/01 10:34:47  hristov
  44  * Removing warnings on Solaris x86
  45  *
  46  * Revision 1.107  2007/01/29 16:29:37  kharlov
  47  * Digits2Raw(): special workaround for digits with time out of range
  48  *
  49  * Revision 1.106  2007/01/17 17:28:56  kharlov
  50  * Extract ALTRO sample generation to a separate class AliPHOSPulseGenerator
  51  *
  52  * Revision 1.105  2007/01/12 21:44:29  kharlov
  53  * Simulate and reconstruct two gains simulaneouslsy
  54  */
  55
  56 //_________________________________________________________________________
  57 // Base Class for PHOS description:
  58 //   PHOS consists of a PbWO4 calorimeter (EMCA) and a gazeous charged
  59 //    particles detector (CPV or PPSD).
  60 //   The only provided method here is CreateMaterials,
  61 //    which defines the materials common to all PHOS versions.
  62 //
  63 //*-- Author: Laurent Aphecetche & Yves Schutz (SUBATECH)
  64 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  65
  66
  67 // --- ROOT system ---
  68 class TFile;
  69 #include <TF1.h>
  70 #include <TFolder.h>
  71 #include <TGeoGlobalMagField.h>
  72 #include <TH1F.h>
  73 #include <TRandom.h>
  74 #include <TTree.h>
  75 #include <TVirtualMC.h>
  76
  77 // --- Standard library ---
  78
  79 // --- AliRoot header files ---
  80 #include "AliMagF.h"
  81 #include "AliPHOS.h"
  82 #include "AliPHOSLoader.h"
  83 #include "AliRun.h"
  84 #include "AliPHOSDigitizer.h"
  85 #include "AliPHOSSDigitizer.h"
  86 #include "AliPHOSDigit.h"
  87 #include "AliAltroBuffer.h"
  88 #include "AliAltroMapping.h"
  89 #include "AliCaloAltroMapping.h"
  90 #include "AliLog.h"
  91 #include "AliCDBManager.h"
  92 #include "AliCDBEntry.h"
  93 #include "AliCDBStorage.h"
  94 #include "AliPHOSCalibData.h"
  95 #include "AliPHOSPulseGenerator.h"
  96 #include "AliDAQ.h"
  97 #include "AliPHOSRawFitterv0.h"
  98 #include "AliPHOSCalibData.h"
  99 #include "AliPHOSRawDigiProducer.h"
 100 #include "AliPHOSQAChecker.h"
 101 #include "AliPHOSRecoParam.h"
 102 #include "AliPHOSSimParam.h"
 103
 104 ClassImp(AliPHOS)
 105
 106 //____________________________________________________________________________
 107   AliPHOS:: AliPHOS() : AliDetector(),fgCalibData(0)
 108 {
 109   // Default ctor
 110   fName   = "PHOS" ;
 111
 112 }
 113
 114 //____________________________________________________________________________
 115 AliPHOS::AliPHOS(const char* name, const char* title): AliDetector(name, title),
 116 fgCalibData(0)
 117 {
 118   //   ctor : title is used to identify the layout
 119 }
 120
 121 //____________________________________________________________________________
 122 AliPHOS::~AliPHOS()
 123 {
 124   if(fgCalibData) delete fgCalibData ;
 125 }
 126
 127 //____________________________________________________________________________
 128 AliDigitizer* AliPHOS::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager) const
 129 {
 130   return new AliPHOSDigitizer(manager);
 131 }
 132
 133 //____________________________________________________________________________
 134 void AliPHOS::CreateMaterials()
 135 {
 136   // Definitions of materials to build PHOS and associated tracking media.
 137   // media number in idtmed are 699 to 798.
 138
 139   // --- The PbWO4 crystals ---
 140   Float_t aX[3] = {207.19, 183.85, 16.0} ;
 141   Float_t zX[3] = {82.0, 74.0, 8.0} ;
 142   Float_t wX[3] = {1.0, 1.0, 4.0} ;
 143   Float_t dX = 8.28 ;
 144
 145   AliMixture(0, "PbWO4$", aX, zX, dX, -3, wX) ;
 146
 147
 148   // --- The polysterene scintillator (CH) ---
 149   Float_t aP[2] = {12.011, 1.00794} ;
 150   Float_t zP[2] = {6.0, 1.0} ;
 151   Float_t wP[2] = {1.0, 1.0} ;
 152   Float_t dP = 1.032 ;
 153
 154   AliMixture(1, "Polystyrene$", aP, zP, dP, -2, wP) ;
 155
 156   // --- Aluminium ---
 157   AliMaterial(2, "Al$", 26.98, 13., 2.7, 8.9, 999., 0, 0) ;
 158   // ---         Absorption length is ignored ^
 159
 160  // --- Tyvek (CnH2n) ---
 161   Float_t aT[2] = {12.011, 1.00794} ;
 162   Float_t zT[2] = {6.0, 1.0} ;
 163   Float_t wT[2] = {1.0, 2.0} ;
 164   Float_t dT = 0.331 ;
 165
 166   AliMixture(3, "Tyvek$", aT, zT, dT, -2, wT) ;
 167
 168   // --- Polystyrene foam ---
 169   Float_t aF[2] = {12.011, 1.00794} ;
 170   Float_t zF[2] = {6.0, 1.0} ;
 171   Float_t wF[2] = {1.0, 1.0} ;
 172   Float_t dF = 0.12 ;
 173
 174   AliMixture(4, "Foam$", aF, zF, dF, -2, wF) ;
 175
 176  // --- Titanium ---
 177   Float_t aTIT[3] = {47.88, 26.98, 54.94} ;
 178   Float_t zTIT[3] = {22.0, 13.0, 25.0} ;
 179   Float_t wTIT[3] = {69.0, 6.0, 1.0} ;
 180   Float_t dTIT = 4.5 ;
 181
 182   AliMixture(5, "Titanium$", aTIT, zTIT, dTIT, -3, wTIT);
 183
 184  // --- Silicon ---
 185   AliMaterial(6, "Si$", 28.0855, 14., 2.33, 9.36, 42.3, 0, 0) ;
 186
 187
 188
 189   // --- Foam thermo insulation ---
 190   Float_t aTI[2] = {12.011, 1.00794} ;
 191   Float_t zTI[2] = {6.0, 1.0} ;
 192   Float_t wTI[2] = {1.0, 1.0} ;
 193   Float_t dTI = 0.04 ;
 194
 195   AliMixture(7, "Thermo Insul.$", aTI, zTI, dTI, -2, wTI) ;
 196
 197   // --- Textolith ---
 198   Float_t aTX[4] = {16.0, 28.09, 12.011, 1.00794} ;
 199   Float_t zTX[4] = {8.0, 14.0, 6.0, 1.0} ;
 200   Float_t wTX[4] = {292.0, 68.0, 462.0, 736.0} ;
 201   Float_t dTX    = 1.75 ;
 202
 203   AliMixture(8, "Textolit$", aTX, zTX, dTX, -4, wTX) ;
 204
 205   //--- FR4  ---
 206   Float_t aFR[4] = {16.0, 28.09, 12.011, 1.00794} ;
 207   Float_t zFR[4] = {8.0, 14.0, 6.0, 1.0} ;
 208   Float_t wFR[4] = {292.0, 68.0, 462.0, 736.0} ;
 209   Float_t dFR = 1.8 ;
 210
 211   AliMixture(9, "FR4$", aFR, zFR, dFR, -4, wFR) ;
 212
 213   // --- The Composite Material for  micromegas (so far polyetylene) ---
 214   Float_t aCM[2] = {12.01, 1.} ;
 215   Float_t zCM[2] = {6., 1.} ;
 216   Float_t wCM[2] = {1., 2.} ;
 217   Float_t dCM = 0.935 ;
 218
 219   AliMixture(10, "Compo Mat$", aCM, zCM, dCM, -2, wCM) ;
 220
 221   // --- Copper ---
 222   AliMaterial(11, "Cu$", 63.546, 29, 8.96, 1.43, 14.8, 0, 0) ;
 223
 224   // --- G10 : Printed Circuit material ---
 225   Float_t aG10[4] = { 12., 1., 16., 28.} ;
 226   Float_t zG10[4] = { 6., 1., 8., 14.} ;
 227   Float_t wG10[4] = { .259, .288, .248, .205} ;
 228   Float_t dG10  = 1.7 ;
 229
 230
 231   AliMixture(12, "G10$", aG10, zG10, dG10, -4, wG10);
 232
 233   // --- Lead ---
 234   AliMaterial(13, "Pb$", 207.2, 82, 11.35, 0.56, 0., 0, 0) ;
 235
 236  // --- The gas mixture ---
 237  // Co2
 238   Float_t aCO[2] = {12.0, 16.0} ;
 239   Float_t zCO[2] = {6.0, 8.0} ;
 240   Float_t wCO[2] = {1.0, 2.0} ;
 241   Float_t dCO = 0.001977 ;
 242
 243   AliMixture(14, "CO2$", aCO, zCO, dCO, -2, wCO);
 244
 245  // Ar
 246   Float_t dAr = 0.001782 ;
 247   AliMaterial(15, "Ar$", 39.948, 18.0, dAr, 14.0, 0., 0, 0) ;
 248
 249   // Ar+CO2 Mixture (80% / 20%)
 250   Float_t arContent = 0.80 ;  // Ar-content of the ArCO2-mixture
 251   Float_t aArCO[3]  = {39.948, 12.0, 16.0} ;
 252   Float_t zArCO[3]  = {18.0  ,  6.0,  8.0} ;
 253   Float_t wArCO[3];
 254   wArCO[0] = arContent;
 255   wArCO[1] = (1-arContent)*1;
 256   wArCO[2] = (1-arContent)*2;
 257   Float_t dArCO = arContent*dAr + (1-arContent)*dCO ;
 258   AliMixture(16, "ArCO2$", aArCO, zArCO, dArCO,  -3, wArCO) ;
 259
 260
 261   // --- Stainless steel (let it be pure iron) ---
 262   AliMaterial(17, "Steel$", 55.845, 26, 7.87, 1.76, 0., 0, 0) ;
 263
 264
 265   // --- Fiberglass ---
 266   Float_t aFG[4] = {16.0, 28.09, 12.011, 1.00794} ;
 267   Float_t zFG[4] = {8.0, 14.0, 6.0, 1.0} ;
 268   Float_t wFG[4] = {292.0, 68.0, 462.0, 736.0} ;
 269   Float_t dFG    = 1.9 ;
 270
 271   AliMixture(18, "Fibergla$", aFG, zFG, dFG, -4, wFG) ;
 272
 273   // --- Cables in Air box  ---
 274   // SERVICES
 275
 276   Float_t aCA[4] = { 1.,12.,55.8,63.5 };
 277   Float_t zCA[4] = { 1.,6.,26.,29. };
 278   Float_t wCA[4] = { .014,.086,.42,.48 };
 279   Float_t dCA    = 0.8 ;  //this density is raw estimation, if you know better - correct
 280
 281   AliMixture(19, "Cables  $", aCA, zCA, dCA, -4, wCA) ;
 282
 283
 284   // --- Air ---
 285   Float_t aAir[4]={12.0107,14.0067,15.9994,39.948};
 286   Float_t zAir[4]={6.,7.,8.,18.};
 287   Float_t wAir[4]={0.000124,0.755267,0.231781,0.012827};
 288   Float_t dAir = 1.20479E-3;
 289
 290   AliMixture(99, "Air$", aAir, zAir, dAir, 4, wAir) ;
 291
 292   // DEFINITION OF THE TRACKING MEDIA
 293
 294   // for PHOS: idtmed[699->798] equivalent to fIdtmed[0->100]
 295   Int_t   isxfld = ((AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField())->Integ() ;
 296   Float_t sxmgmx = ((AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField())->Max() ;
 297
 298   // The scintillator of the calorimeter made of PBW04                              -> idtmed[699]
 299   AliMedium(0, "PHOS Xtal    $", 0, 1,
 300             isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 301
 302   // The scintillator of the CPV made of Polystyrene scintillator                   -> idtmed[700]
 303   AliMedium(1, "CPV scint.   $", 1, 1,
 304             isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 305
 306   // Various Aluminium parts made of Al                                             -> idtmed[701]
 307   AliMedium(2, "Al parts     $", 2, 0,
 308              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.001, 0.001, 0, 0) ;
 309
 310   // The Tywek which wraps the calorimeter crystals                                 -> idtmed[702]
 311   AliMedium(3, "Tyvek wrapper$", 3, 0,
 312              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.001, 0.001, 0, 0) ;
 313
 314   // The Polystyrene foam around the calorimeter module                             -> idtmed[703]
 315   AliMedium(4, "Polyst. foam $", 4, 0,
 316              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 317
 318   // The Titanium around the calorimeter crystal                                    -> idtmed[704]
 319   AliMedium(5, "Titan. cover $", 5, 0,
 320              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.0001, 0.0001, 0, 0) ;
 321
 322   // The Silicon of the pin diode to read out the calorimeter crystal               -> idtmed[705]
 323  AliMedium(6, "Si PIN       $", 6, 0,
 324              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.01, 0.01, 0, 0) ;
 325
 326  // The thermo insulating material of the box which contains the calorimeter module -> idtmed[706]
 327   AliMedium(7, "Thermo Insul.$", 7, 0,
 328              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 329
 330   // The Textolit which makes up the box which contains the calorimeter module      -> idtmed[707]
 331   AliMedium(8, "Textolit     $", 8, 0,
 332              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 333
 334   // FR4: The Plastic which makes up the frame of micromegas                        -> idtmed[708]
 335   AliMedium(9, "FR4 $", 9, 0,
 336              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.0001, 0, 0) ;
 337
 338
 339   // The Composite Material for  micromegas                                         -> idtmed[709]
 340   AliMedium(10, "CompoMat   $", 10, 0,
 341              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 342
 343   // Copper                                                                         -> idtmed[710]
 344   AliMedium(11, "Copper     $", 11, 0,
 345              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.0001, 0, 0) ;
 346
 347   // G10: Printed Circuit material                                                  -> idtmed[711]
 348
 349   AliMedium(12, "G10        $", 12, 0,
 350              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.01, 0, 0) ;
 351
 352   // The Lead                                                                       -> idtmed[712]
 353
 354   AliMedium(13, "Lead      $", 13, 0,
 355              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 356
 357   // The gas mixture: ArCo2                                                         -> idtmed[715]
 358
 359   AliMedium(16, "ArCo2      $", 16, 1,
 360              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.01, 0, 0) ;
 361
 362   // Stainless steel                                                                -> idtmed[716]
 363   AliMedium(17, "Steel     $", 17, 0,
 364              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.0001, 0, 0) ;
 365
 366   // Fibergalss                                                                     -> idtmed[717]
 367   AliMedium(18, "Fiberglass$", 18, 0,
 368              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 369
 370   // Cables in air                                                                  -> idtmed[718]
 371   AliMedium(19, "Cables    $", 19, 0,
 372              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 373
 374   // Air                                                                            -> idtmed[798]
 375   AliMedium(99, "Air          $", 99, 0,
 376              isxfld, sxmgmx, 10.0, 1.0, 0.1, 0.1, 10.0, 0, 0) ;
 377 }
 378
 379 //_____________________________________________________________________________
 380 void AliPHOS::Init()
 381 {
 382 }
 383
 384 //____________________________________________________________________________
 385 void AliPHOS::Digits2Raw()
 386 {
 387 // convert digits of the current event to raw data
 388
 389   if(AliPHOSSimParam::GetInstance()->IsEDigitizationOn()){
 390     AliError("Energy digitization should be OFF if use Digits2Raw") ;
 391   }
 392
 393   AliPHOSLoader * loader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(fLoader) ;
 394
 395   // get the digits
 396   loader->LoadDigits();
 397   TClonesArray* digits = loader->Digits() ;
 398
 399   if (!digits) {
 400     AliError(Form("No digits found !"));
 401     return;
 402   }
 403
 404   // get the geometry
 405   AliPHOSGeometry* geom = GetGeometry();
 406   if (!geom) {
 407     AliError(Form("No geometry found !"));
 408     return;
 409   }
 410
 411   // get mapping from OCDB
 412   const TObjArray* maps = AliPHOSRecoParam::GetMappings();
 413   if(!maps) AliFatal("Cannot retrieve ALTRO mappings!!");
 414
 415   // some digitization constants
 416   const Float_t    kThreshold = 1.; // skip digits below 1 ADC channel
 417   const Int_t      kAdcThreshold = 1;  // Lower ADC threshold to write to raw data
 418
 419   Int_t prevDDL = -1;
 420
 421   if(fgCalibData==0)
 422     fgCalibData= new AliPHOSCalibData(-1) ;
 423
 424   // Create a shaper pulse object
 425   AliPHOSPulseGenerator *pulse = new AliPHOSPulseGenerator();
 426
 427   //Set Time step of sample
 428   pulse->SetTimeStep(TMath::Abs(fgCalibData->GetSampleTimeStep())) ;
 429
 430   Int_t *adcValuesLow = new Int_t[pulse->GetRawFormatTimeBins()];
 431   Int_t *adcValuesHigh= new Int_t[pulse->GetRawFormatTimeBins()];
 432
 433   const Int_t maxDDL = 20;
 434   AliAltroBuffer  *buffer[maxDDL];
 435   AliAltroMapping *mapping[maxDDL];
 436
 437   for(Int_t jDDL=0; jDDL<maxDDL; jDDL++) {
 438     buffer[jDDL]=0;
 439     mapping[jDDL]=0;
 440   }
 441
 442   //!!!!for debug!!!
 443   Int_t modMax=-111;
 444   Int_t colMax=-111;
 445   Int_t rowMax=-111;
 446   Float_t eMax=-333;
 447   //!!!for debug!!!
 448
 449   // loop over digits (assume ordered digits)
 450   for (Int_t iDigit = 0; iDigit < digits->GetEntries(); iDigit++) {
 451     AliPHOSDigit* digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>(digits->At(iDigit)) ;
 452
 453     // Skip small energy below treshold
 454     if (digit->GetEnergy() < kThreshold)
 455       continue;
 456
 457     Int_t relId[4];
 458     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relId);
 459     Int_t module = 5-relId[0];
 460
 461     // Begin FIXME
 462     if (relId[1] != 0)
 463       continue;    // ignore digits from CPV
 464     // End FIXME
 465
 466     Int_t row = relId[2]-1;
 467     Int_t col = relId[3]-1;
 468
 469     Int_t iRCU = -111;
 470
 471     //RCU0
 472     if(0<=row&&row<16 && 0<=col&&col<56) iRCU=0;
 473
 474     //RCU1
 475     if(16<=row&&row<32 && 0<=col&&col<56) iRCU=1;
 476
 477     //RCU2
 478     if(32<=row&&row<48 && 0<=col&&col<56) iRCU=2;
 479
 480     //RCU3
 481     if(48<=row&&row<64 && 0<=col&&col<56) iRCU=3;
 482
 483
 484     // PHOS EMCA has 4 DDL per module. Splitting is based on the (row,column) numbers.
 485     // here module already in PHOS online convention: 0<module<4 and inverse order.
 486     Int_t iDDL = 4 * module  + iRCU;
 487
 488     // new DDL
 489     if (iDDL != prevDDL) {
 490       if (buffer[iDDL] == 0) {
 491         // open new file and write dummy header
 492         TString fileName = AliDAQ::DdlFileName("PHOS",iDDL);
 493
 494         mapping[iDDL] = (AliAltroMapping*)maps->At(iDDL);
 495         buffer[iDDL]  = new AliAltroBuffer(fileName.Data(),mapping[iDDL]);
 496         buffer[iDDL]->WriteDataHeader(kTRUE, kFALSE);  //Dummy;
 497       }
 498       prevDDL = iDDL;
 499     }
 500
 501     AliDebug(2,Form("digit E=%.4f GeV, t=%g s, (mod,col,row)=(%d,%d,%d)\n",
 502                     digit->GetEnergy(),digit->GetTimeR(),
 503                     relId[0]-1,relId[3]-1,relId[2]-1));
 504     // if a signal is out of time range, write only trailer
 505     if (digit->GetTimeR() > pulse->GetRawFormatTimeMax()*0.5 ) {
 506       AliDebug(2,"Signal is out of time range.\n");
 507       buffer[iDDL]->FillBuffer(0);
 508       buffer[iDDL]->FillBuffer(pulse->GetRawFormatTimeBins() );  // time bin
 509       buffer[iDDL]->FillBuffer(3);                               // bunch length
 510       buffer[iDDL]->WriteTrailer(3, relId[3]-1, relId[2]-1, 0);  // trailer
 511
 512     // calculate the time response function
 513     } else {
 514       Double_t energy = 0 ;
 515       if (digit->GetId() <= geom->GetNModules() * geom->GetNCristalsInModule()) {
 516         energy=digit->GetEnergy();
 517         if(energy>eMax) {eMax=energy; modMax=relId[0]; colMax=col; rowMax=row;}
 518       }
 519       else {
 520         energy = 0; // CPV raw data format is now know yet
 521       }
 522       pulse->SetAmplitude(energy);
 523       pulse->SetTZero(digit->GetTimeR());
 524       Double_t r =fgCalibData->GetHighLowRatioEmc(relId[0],relId[3],relId[2]) ;
 525       pulse->SetHG2LGRatio(r) ;
 526       pulse->MakeSamples();
 527       pulse->GetSamples(adcValuesHigh, adcValuesLow) ;
 528
 529       buffer[iDDL]->WriteChannel(relId[3]-1, relId[2]-1, 0,
 530                            pulse->GetRawFormatTimeBins(), adcValuesLow , kAdcThreshold);
 531       buffer[iDDL]->WriteChannel(relId[3]-1, relId[2]-1, 1,
 532                            pulse->GetRawFormatTimeBins(), adcValuesHigh, kAdcThreshold);
 533     }
 534   }
 535
 536   // write real header and close last file
 537   for (Int_t iDDL=0; iDDL<maxDDL; iDDL++) {
 538     if (buffer[iDDL]) {
 539       buffer[iDDL]->Flush();
 540       buffer[iDDL]->WriteDataHeader(kFALSE, kFALSE);
 541       delete buffer[iDDL];
 542       //if (mapping[iDDL]) delete mapping[iDDL];
 543     }
 544   }
 545
 546   AliDebug(1,Form("Digit with max. energy:  modMax %d colMax %d rowMax %d  eMax %f\n",
 547          modMax,colMax,rowMax,eMax));
 548
 549   delete pulse;
 550   loader->UnloadDigits();
 551 }
 552
 553 //____________________________________________________________________________
 554 void AliPHOS::Hits2SDigits()
 555 {
 556 // create summable digits
 557
 558   AliPHOSSDigitizer phosDigitizer(fLoader->GetRunLoader()->GetFileName().Data()) ;
 559   phosDigitizer.SetEventRange(0, -1) ; // do all the events
 560
 561   phosDigitizer.ExecuteTask("all") ;
 562 }
 563
 564
 565 //____________________________________________________________________________
 566 AliLoader* AliPHOS::MakeLoader(const char* topfoldername)
 567 {
 568 //different behaviour than standard (singleton getter)
 569 // --> to be discussed and made eventually coherent
 570  fLoader = new AliPHOSLoader(GetName(),topfoldername);
 571  return fLoader;
 572 }
 573
 574 //____________________________________________________________________________
 575 void AliPHOS::SetTreeAddress()
 576 {
 577   // Links Hits in the Tree to Hits array
 578   TBranch *branch;
 579   char branchname[20];
 580   sprintf(branchname,"%s",GetName());
 581   // Branch address for hit tree
 582     TTree *treeH = fLoader->TreeH();
 583   if (treeH) {
 584     branch = treeH->GetBranch(branchname);
 585     if (branch)
 586      {
 587        if (fHits == 0x0) fHits= new TClonesArray("AliPHOSHit",1000);
 588        //AliInfo(Form("<%s> Setting Hits Address",GetName()));
 589        branch->SetAddress(&fHits);
 590      }
 591   }
 592 }
 593
 594 //____________________________________________________________________________
 595 Bool_t AliPHOS::Raw2SDigits(AliRawReader* rawReader)
 596 {
 597
 598   AliPHOSLoader * loader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(fLoader) ;
 599
 600   TTree * tree = 0 ;
 601   tree = loader->TreeS() ;
 602   if ( !tree ) {
 603     loader->MakeTree("S");
 604     tree = loader->TreeS() ;
 605   }
 606
 607   TClonesArray * sdigits = loader->SDigits() ;
 608   if(!sdigits) {
 609     loader->MakeSDigitsArray();
 610     sdigits = loader->SDigits();
 611   }
 612   sdigits->Clear();
 613
 614   const TObjArray* maps = AliPHOSRecoParam::GetMappings();
 615   if(!maps) AliFatal("Cannot retrieve ALTRO mappings!!");
 616
 617   AliAltroMapping *mapping[4];
 618   for(Int_t i = 0; i < 4; i++) {
 619     mapping[i] = (AliAltroMapping*)maps->At(i);
 620   }
 621
 622   AliPHOSRawFitterv0 fitter;
 623
 624   fitter.SubtractPedestals(AliPHOSSimParam::GetInstance()->EMCSubtractPedestals());
 625   fitter.SetAmpOffset(AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetGlobalAltroOffset());
 626   fitter.SetAmpThreshold(AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetGlobalAltroThreshold());
 627
 628   AliPHOSRawDigiProducer pr(rawReader,mapping);
 629   pr.SetSampleQualityCut(AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetEMCSampleQualityCut());
 630   pr.MakeDigits(sdigits,&fitter);
 631
 632   Int_t bufferSize = 32000 ;
 633   // TBranch * sdigitsBranch = tree->Branch("PHOS",&sdigits,bufferSize);
 634   tree->Branch("PHOS",&sdigits,bufferSize);
 635   tree->Fill();
 636
 637   fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
 638   return kTRUE;
 639
 640 }