PHOS/AliPHOSClusterizerv1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 /* $Log:
  19    1 October 2000. Yuri Kharlov:
  20      AreNeighbours()
  21      PPSD upper layer is considered if number of layers>1
  22
  23    18 October 2000. Yuri Kharlov:
  24      AliPHOSClusterizerv1()
  25      CPV clusterizing parameters added
  26
  27      MakeClusters()
  28      After first PPSD digit remove EMC digits only once
  29 */
  30 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
  31 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  32 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and
  33 //  unfolding of the clusters with several local maxima.
  34 //  results are stored in TreeR#, branches PHOSEmcRP (EMC recPoints),
  35 //  PHOSCpvRP (CPV RecPoints) and AliPHOSClusterizer (Clusterizer with all
  36 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
  37 //  This TTask normally called from Reconstructioner, but as well can be used it in
  38 //  standalone mode:
  39 // root [0] AliPHOSClusterizerv1 * cl = new AliPHOSClusterizerv1("galice.root")
  40 // Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  41 //               //reads gAlice from header file "..."
  42 // root [1] cl->ExecuteTask()
  43 //               //finds RecPoints in all events stored in galice.root
  44 // root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2")
  45 //               //sets another title for Digitis (input) branch
  46 // root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")
  47 //               //sets another title four output branches
  48 // root [4] cl->SetEmcLocalMaxCut(0.03)
  49 //               //set clusterization parameters
  50 // root [5] cl->ExecuteTask("deb all time")
  51 //               //once more finds RecPoints options are
  52 //               // deb - print number of found rec points
  53 //               // deb all - print number of found RecPoints and some their characteristics
  54 //               // time - print benchmarking results
  55
  56 // --- ROOT system ---
  57
  58 #include "TROOT.h"
  59 #include "TFile.h"
  60 #include "TFolder.h"
  61 #include "TMath.h"
  62 #include "TMinuit.h"
  63 #include "TTree.h"
  64 #include "TSystem.h"
  65 #include "TBenchmark.h"
  66
  67 // --- Standard library ---
  68
  69 #include <iostream.h>
  70 #include <iomanip.h>
  71
  72 // --- AliRoot header files ---
  73
  74 #include "AliPHOSClusterizerv1.h"
  75 #include "AliPHOSCpvRecPoint.h"
  76 #include "AliPHOSDigit.h"
  77 #include "AliPHOSDigitizer.h"
  78 #include "AliPHOSEmcRecPoint.h"
  79 #include "AliPHOS.h"
  80 #include "AliPHOSPpsdRecPoint.h"
  81 #include "AliRun.h"
  82
  83 ClassImp(AliPHOSClusterizerv1)
  84
  85 //____________________________________________________________________________
  86   AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1():AliPHOSClusterizer()
  87 {
  88   // default ctor (to be used mainly by Streamer)
  89   SetName("AliPHOSClusterizer");
  90   SetTitle("Version 1") ;
  91
  92   fNumberOfCpvClusters     = 0 ;
  93   fNumberOfEmcClusters     = 0 ;
  94
  95   fCpvClusteringThreshold  = 0.0;
  96   fEmcClusteringThreshold  = 0.2;
  97   fPpsdClusteringThreshold = 0.0000002 ;
  98
  99   fEmcLocMaxCut            = 0.03 ;
 100   fCpvLocMaxCut            = 0.03 ;
 101
 102   fW0                      = 4.5 ;
 103   fW0CPV                   = 4.0 ;
 104
 105   fGeom  = 0 ;
 106
 107   fDigits = 0 ;
 108   fDigitizer = 0 ;
 109   fEmcRecPoints = 0 ;
 110   fCpvRecPoints = 0 ;
 111
 112   fIsInitialized = kFALSE ;
 113
 114 }
 115 //____________________________________________________________________________
 116 AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1(const char* headerFile,const char* digitsFile):AliPHOSClusterizer()
 117 {
 118   SetName("AliPHOSClusterizer");
 119   SetTitle("Version 1") ;
 120
 121   fNumberOfCpvClusters     = 0 ;
 122   fNumberOfEmcClusters     = 0 ;
 123
 124   fCpvClusteringThreshold  = 0.0;
 125   fEmcClusteringThreshold  = 0.2;
 126   fPpsdClusteringThreshold = 0.0000002 ;
 127
 128   fEmcLocMaxCut            = 0.03 ;
 129   fCpvLocMaxCut            = 0.03 ;
 130
 131   fW0                      = 4.5 ;
 132   fW0CPV                   = 4.0 ;
 133
 134   fToUnfold = kTRUE ;
 135
 136   fHeaderFileName = headerFile  ;
 137   fDigitsBranchTitle = digitsFile ;
 138
 139   TFile * file = (TFile*) gROOT->GetFile(fHeaderFileName.Data() ) ;
 140
 141   if(file == 0){
 142     if(fHeaderFileName.Contains("rfio")) // if we read file using HPSS
 143       file =    TFile::Open(fHeaderFileName.Data(),"update") ;
 144     else
 145       file = new TFile(fHeaderFileName.Data(),"update") ;
 146     gAlice = (AliRun *) file->Get("gAlice") ;
 147   }
 148
 149   AliPHOS * phos = (AliPHOS *) gAlice->GetDetector("PHOS") ;
 150   fGeom  = AliPHOSGeometry::GetInstance(phos->GetGeometry()->GetName(),phos->GetGeometry()->GetTitle() );
 151
 152   fDigits = new TClonesArray("AliPHOSDigit",10) ;
 153   fDigitizer = new AliPHOSDigitizer() ;
 154   fEmcRecPoints = new TObjArray(200) ;
 155   fCpvRecPoints = new TObjArray(200) ;
 156
 157   if(!gMinuit) gMinuit = new TMinuit(100) ;
 158
 159   // add Task to //root/Tasks folder
 160   TTask * roottasks = (TTask*)gROOT->GetRootFolder()->FindObject("Tasks") ;
 161   roottasks->Add(this) ;
 162
 163
 164   fIsInitialized = kTRUE ;
 165
 166 }
 167 //____________________________________________________________________________
 168 void AliPHOSClusterizerv1::Exec(Option_t * option){
 169   // Steerign function
 170
 171   if(!fIsInitialized) Init() ;
 172
 173   if(strstr(option,"tim"))
 174     gBenchmark->Start("PHOSClusterizer");
 175
 176   Int_t nEvents = (Int_t) gAlice->TreeE()->GetEntries() ;
 177
 178   for(fEvent = 0;fEvent< nEvents; fEvent++){
 179     if(!ReadDigits())  //reads digits for event fEvent
 180       return;
 181     MakeClusters() ;
 182
 183     if(fToUnfold) MakeUnfolding() ;
 184     WriteRecPoints() ;
 185     if(strstr(option,"deb"))
 186       PrintRecPoints(option) ;
 187   }
 188
 189   if(strstr(option,"tim")){
 190     gBenchmark->Stop("PHOSClusterizer");
 191     cout << "AliPHOSClusterizer:" << endl ;
 192     cout << "  took " << gBenchmark->GetCpuTime("PHOSClusterizer") << " seconds for Clusterizing "
 193          <<  gBenchmark->GetCpuTime("PHOSClusterizer")/nEvents << " seconds per event " << endl ;
 194     cout << endl ;
 195   }
 196
 197
 198 }
 199
 200 //____________________________________________________________________________
 201 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::FindFit(AliPHOSEmcRecPoint * emcRP, int * maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
 202                                     Int_t nPar, Float_t * fitparameters)
 203 {
 204   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima
 205   // the initial values for fitting procedure are set in the positions of local maxima.
 206   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3 electromagnetic showers
 207
 208   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
 209   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
 210   gMinuit->SetFCN(AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;
 211                                          // To set the address of the minimization function
 212
 213   TList * toMinuit = new TList();
 214   toMinuit->AddAt(emcRP,0) ;
 215   toMinuit->AddAt(fDigits,1) ;
 216
 217   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
 218
 219   // filling initial values for fit parameters
 220   AliPHOSDigit * digit ;
 221
 222   Int_t ierflg  = 0;
 223   Int_t index   = 0 ;
 224   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
 225
 226   Int_t iDigit ;
 227
 228
 229   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
 230     digit = (AliPHOSDigit *) maxAt[iDigit];
 231
 232     Int_t relid[4] ;
 233     Float_t x ;
 234     Float_t z ;
 235     fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 236     fGeom->RelPosInModule(relid, x, z) ;
 237
 238     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
 239
 240     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 241     index++ ;
 242     if(ierflg != 0){
 243       cout << "PHOS Unfolding>  Unable to set initial value for fit procedure : x = " << x << endl ;
 244       return kFALSE;
 245     }
 246     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 247     index++ ;
 248     if(ierflg != 0){
 249       cout << "PHOS Unfolding>  Unable to set initial value for fit procedure : z = " << z << endl ;
 250       return kFALSE;
 251     }
 252     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
 253     index++ ;
 254     if(ierflg != 0){
 255       cout << "PHOS Unfolding>  Unable to set initial value for fit procedure : energy = " << energy << endl ;
 256       return kFALSE;
 257     }
 258   }
 259
 260   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ; The number of function call slightly
 261                       //  depends on it.
 262   Double_t p1 = 1.0 ;
 263   Double_t p2 = 0.0 ;
 264
 265   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls
 266   gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient
 267   gMinuit->SetMaxIterations(5);
 268   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
 269
 270   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize
 271
 272   if(ierflg == 4){  // Minimum not found
 273     cout << "PHOS Unfolding>  Fit not converged, cluster abandoned "<< endl ;
 274     return kFALSE ;
 275   }
 276   for(index = 0; index < nPar; index++){
 277     Double_t err ;
 278     Double_t val ;
 279     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
 280     fitparameters[index] = val ;
 281    }
 282
 283   delete toMinuit ;
 284   return kTRUE;
 285
 286 }
 287
 288 //____________________________________________________________________________
 289 void AliPHOSClusterizerv1::Init(){
 290   //Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
 291   if(!fIsInitialized){
 292     if(fHeaderFileName.IsNull())
 293       fHeaderFileName = "galice.root" ;
 294
 295
 296     TFile * file = (TFile*) gROOT->GetFile(fHeaderFileName.Data() ) ;
 297
 298     if(file == 0){
 299       file = new TFile(fHeaderFileName.Data(),"update") ;
 300       gAlice = (AliRun *) file->Get("gAlice") ;
 301     }
 302
 303     AliPHOS * phos = (AliPHOS *) gAlice->GetDetector("PHOS") ;
 304     fGeom  = AliPHOSGeometry::GetInstance(phos->GetGeometry()->GetName(),phos->GetGeometry()->GetTitle() );
 305
 306     fDigits = new TClonesArray("AliPHOSDigit",10) ;
 307     fDigitizer = new AliPHOSDigitizer() ;
 308     fEmcRecPoints = new TObjArray(200) ;
 309     fCpvRecPoints = new TObjArray(200) ;
 310
 311     if(!gMinuit) gMinuit = new TMinuit(100) ;
 312
 313     // add Task to //root/Tasks folder
 314     TTask * roottasks = (TTask*)gROOT->GetRootFolder()->FindObject("Tasks") ;
 315     roottasks->Add(this) ;
 316
 317     fIsInitialized = kTRUE ;
 318   }
 319 }
 320 //____________________________________________________________________________
 321 Int_t AliPHOSClusterizerv1::AreNeighbours(AliPHOSDigit * d1, AliPHOSDigit * d2)const
 322 {
 323   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour but continue searching
 324   //                                       = 1 are neighbour
 325   //                                       = 2 are not neighbour but do not continue searching
 326   // neighbours are defined as digits having at least common vertex
 327   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster
 328   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster
 329
 330   Int_t rv = 0 ;
 331
 332   Int_t relid1[4] ;
 333   fGeom->AbsToRelNumbering(d1->GetId(), relid1) ;
 334
 335   Int_t relid2[4] ;
 336   fGeom->AbsToRelNumbering(d2->GetId(), relid2) ;
 337
 338   if ( (relid1[0] == relid2[0]) && (relid1[1]==relid2[1]) ) { // inside the same PHOS module and the same PPSD Module
 339     Int_t rowdiff = TMath::Abs( relid1[2] - relid2[2] ) ;
 340     Int_t coldiff = TMath::Abs( relid1[3] - relid2[3] ) ;
 341
 342     if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 )){
 343       rv = 1 ;
 344     }
 345     else {
 346       if((relid2[2] > relid1[2]) && (relid2[3] > relid1[3]+1))
 347         rv = 2; //  Difference in row numbers is too large to look further
 348     }
 349
 350   }
 351   else {
 352
 353     if( (relid1[0] < relid2[0]) || (relid1[1] < relid2[1]) )
 354       rv=2 ;
 355
 356   }
 357
 358   //Do NOT clusterize upper PPSD
 359   if( IsInPpsd(d1) && IsInPpsd(d2) &&
 360      relid1[1] > 0                 &&
 361      relid1[1] < fGeom->GetNumberOfPadsPhi()*fGeom->GetNumberOfPadsPhi() ) rv = 2 ;
 362
 363   return rv ;
 364 }
 365
 366
 367 //____________________________________________________________________________
 368 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInEmc(AliPHOSDigit * digit) const
 369 {
 370   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-EMC module
 371
 372   Bool_t rv = kFALSE ;
 373
 374   Int_t relid[4] ;
 375   fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 376
 377   if ( relid[1] == 0  ) rv = kTRUE;
 378
 379   return rv ;
 380 }
 381
 382 //____________________________________________________________________________
 383 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInPpsd(AliPHOSDigit * digit) const
 384 {
 385   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-PPSD module
 386
 387   Bool_t rv = kFALSE ;
 388
 389   Int_t relid[4] ;
 390   fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 391
 392   if ( relid[1] > 0 && relid[0] > fGeom->GetNCPVModules() ) rv = kTRUE;
 393
 394   return rv ;
 395 }
 396
 397 //____________________________________________________________________________
 398 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInCpv(AliPHOSDigit * digit) const
 399 {
 400   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-CPV module
 401
 402   Bool_t rv = kFALSE ;
 403
 404   Int_t relid[4] ;
 405   fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 406
 407   if ( relid[1] > 0 && relid[0] <= fGeom->GetNCPVModules() ) rv = kTRUE;
 408
 409   return rv ;
 410 }
 411 //____________________________________________________________________________
 412 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::ReadDigits(){
 413   //reads digitis with specified title from TreeD
 414
 415   fNumberOfEmcClusters  = 0 ;
 416   fNumberOfCpvClusters  = 0 ;
 417
 418   // Get Digits Tree header from file
 419   gAlice->GetEvent(fEvent) ;
 420   gAlice->SetEvent(fEvent) ;
 421
 422   TTree * treeD = gAlice->TreeD()  ;
 423
 424   if(treeD==0){
 425     char treeName[20];
 426     sprintf(treeName,"TreeD%d",fEvent);
 427     cout << "Error in AliPHOSClusterizerv1 : no "<<treeName << endl  ;
 428     cout << "    Do nothing " << endl ;
 429     return kFALSE ;
 430   }
 431
 432   TBranch * digitsBranch = 0;
 433   TBranch * digitizerBranch = 0;
 434
 435   TObjArray * branches = treeD->GetListOfBranches() ;
 436   Int_t ibranch;
 437   Bool_t phosNotFound = kTRUE ;
 438   Bool_t digitizerNotFound = kTRUE ;
 439
 440   for(ibranch = 0;ibranch <branches->GetEntries();ibranch++){
 441
 442     if(phosNotFound){
 443       digitsBranch=(TBranch *) branches->At(ibranch) ;
 444       if( fDigitsBranchTitle.CompareTo(digitsBranch->GetTitle())==0 )
 445         if( strcmp(digitsBranch->GetName(),"PHOS") == 0)
 446           phosNotFound = kFALSE ;
 447     }
 448
 449     if(digitizerNotFound){
 450       digitizerBranch = (TBranch *) branches->At(ibranch) ;
 451       if( fDigitsBranchTitle.CompareTo(digitizerBranch->GetTitle()) == 0)
 452         if( strcmp(digitizerBranch->GetName(),"AliPHOSDigitizer") == 0)
 453           digitizerNotFound = kFALSE ;
 454     }
 455
 456   }
 457
 458   if(digitizerNotFound || phosNotFound){
 459     cout << "ERROR in AliPHOSClusterizerv1: " << endl ;
 460     cout << "      Can't find Branch with digits or Digitizer "<< endl ; ;
 461     cout << "      Do nothing" <<endl  ;
 462     return kFALSE ;
 463   }
 464
 465   digitsBranch->SetAddress(&fDigits) ;
 466   digitizerBranch->SetAddress(&fDigitizer) ;
 467
 468   digitsBranch->GetEntry(0) ;
 469   digitizerBranch->GetEntry(0) ;
 470
 471   fPedestal = fDigitizer->GetPedestal() ;
 472   fSlope    = fDigitizer->GetSlope() ;
 473   return kTRUE ;
 474 }
 475
 476 //____________________________________________________________________________
 477 void AliPHOSClusterizerv1::WriteRecPoints(){
 478   // checks, if PHOSEmcRP etc. branches with given title already exist,
 479   // exits without writing, otherwise create new branches with given title
 480   // fills and wrights TreeR.
 481
 482   Int_t index ;
 483   //Evaluate poisition, dispersion and other RecPoint properties...
 484   for(index = 0; index < fEmcRecPoints->GetEntries(); index++)
 485     ((AliPHOSEmcRecPoint *)fEmcRecPoints->At(index))->EvalAll(fW0,fDigits) ;
 486
 487   fEmcRecPoints->Sort() ;
 488
 489   for(index = 0; index < fEmcRecPoints->GetEntries(); index++)
 490     ((AliPHOSEmcRecPoint *)fEmcRecPoints->At(index))->SetIndexInList(index) ;
 491
 492   fEmcRecPoints->Expand(fEmcRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 493
 494   //Now the same for CPV
 495   for(index = 0; index < fCpvRecPoints->GetEntries(); index++)
 496     ((AliPHOSRecPoint *)fCpvRecPoints->At(index))->EvalAll(fW0CPV,fDigits)  ;
 497
 498   fCpvRecPoints->Sort() ;
 499
 500   for(index = 0; index < fCpvRecPoints->GetEntries(); index++)
 501     ((AliPHOSRecPoint *)fCpvRecPoints->At(index))->SetIndexInList(index) ;
 502
 503   fCpvRecPoints->Expand(fCpvRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 504
 505   if(gAlice->TreeR()==0)
 506     gAlice->MakeTree("R") ;
 507
 508
 509   //Check, if branches already exist
 510   TBranch * emcBranch = 0;
 511   TBranch * cpvBranch = 0;
 512   TBranch * clusterizerBranch = 0;
 513
 514   TObjArray * branches = gAlice->TreeR()->GetListOfBranches() ;
 515   Int_t ibranch;
 516   Bool_t emcNotFound = kTRUE ;
 517   Bool_t cpvNotFound = kTRUE ;
 518   Bool_t clusterizerNotFound = kTRUE ;
 519
 520   for(ibranch = 0;ibranch <branches->GetEntries();ibranch++){
 521
 522     if(emcNotFound){
 523       emcBranch=(TBranch *) branches->At(ibranch) ;
 524       if( fRecPointsBranchTitle.CompareTo(emcBranch->GetTitle())==0 ){
 525         if( strcmp(emcBranch->GetName(),"PHOSEmcRP") == 0) {
 526           emcNotFound = kFALSE ;
 527         }
 528       }
 529     }
 530     if(cpvNotFound){
 531       cpvBranch=(TBranch *) branches->At(ibranch) ;
 532       if( fRecPointsBranchTitle.CompareTo(cpvBranch->GetTitle())==0 ){
 533         if( strcmp(cpvBranch->GetName(),"PHOSCpvRP") == 0) {
 534           cpvNotFound = kFALSE ;
 535         }
 536       }
 537     }
 538
 539     if(clusterizerNotFound){
 540       clusterizerBranch = (TBranch *) branches->At(ibranch) ;
 541       if( fRecPointsBranchTitle.CompareTo(clusterizerBranch->GetTitle()) == 0){
 542         if( strcmp(clusterizerBranch->GetName(),"AliPHOSClusterizer") == 0) {
 543           clusterizerNotFound = kFALSE ;
 544         }
 545       }
 546     }
 547
 548   }
 549
 550   if(!(clusterizerNotFound && emcNotFound && cpvNotFound)){
 551     cout << "AliPHOSClusterizer error" << endl;
 552     cout << "       Branches PHOSEmcRP, PHOSCpvRP and AliPHOSClusterizer " << endl ;
 553     cout << "       with title '" << fRecPointsBranchTitle.Data() <<"' already exist" << endl ;
 554     cout << "       can not overwrite " << endl ;
 555     return ;
 556   }
 557
 558   //Make branches in TreeR for RecPoints and Clusterizer
 559   char * filename = 0;
 560   if(gSystem->Getenv("CONFIG_SPLIT_FILE")!=0){   //generating file name
 561     filename = new char[strlen(gAlice->GetBaseFile())+20] ;
 562     sprintf(filename,"%s/PHOS.Reco.root",gAlice->GetBaseFile()) ;
 563   }
 564
 565   //Make new branches
 566   TDirectory *cwd = gDirectory;
 567
 568   //First EMC
 569   Int_t bufferSize = 32000 ;
 570   Int_t splitlevel = 0 ;
 571   emcBranch = gAlice->TreeR()->Branch("PHOSEmcRP","TObjArray",&fEmcRecPoints,bufferSize,splitlevel);
 572   emcBranch->SetTitle(fRecPointsBranchTitle.Data());
 573   if (filename) {
 574     emcBranch->SetFile(filename);
 575     TIter next( emcBranch->GetListOfBranches());
 576     TBranch * sb ;
 577     while ((sb=(TBranch*)next())) {
 578       sb->SetFile(filename);
 579     }
 580     cwd->cd();
 581   }
 582
 583   //Now CPV branch
 584   cpvBranch = gAlice->TreeR()->Branch("PHOSCpvRP","TObjArray",&fCpvRecPoints,bufferSize,splitlevel);
 585   cpvBranch->SetTitle(fRecPointsBranchTitle.Data());
 586   if (filename) {
 587     cpvBranch->SetFile(filename);
 588     TIter next( cpvBranch->GetListOfBranches());
 589     TBranch * sb;
 590     while ((sb=(TBranch*)next())) {
 591       sb->SetFile(filename);
 592     }
 593     cwd->cd();
 594   }
 595
 596   //And Finally  clusterizer branch
 597   AliPHOSClusterizerv1 * cl = this ;
 598   clusterizerBranch = gAlice->TreeR()->Branch("AliPHOSClusterizer","AliPHOSClusterizerv1",
 599                                               &cl,bufferSize,splitlevel);
 600   clusterizerBranch->SetTitle(fRecPointsBranchTitle.Data());
 601   if (filename) {
 602     clusterizerBranch->SetFile(filename);
 603     TIter next( clusterizerBranch->GetListOfBranches());
 604     TBranch * sb ;
 605     while ((sb=(TBranch*)next())) {
 606       sb->SetFile(filename);
 607     }
 608     cwd->cd();
 609   }
 610
 611
 612   emcBranch->Fill() ;
 613   cpvBranch->Fill() ;
 614   clusterizerBranch->Fill() ;
 615   gAlice->TreeR()->Write(0,kOverwrite) ;
 616
 617 }
 618
 619 //____________________________________________________________________________
 620 void AliPHOSClusterizerv1::MakeClusters()
 621 {
 622   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
 623   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
 624   fEmcRecPoints->Clear() ;
 625   fCpvRecPoints->Clear() ;
 626
 627
 628   // Clusterization starts
 629   TClonesArray * digits =  (TClonesArray*)fDigits->Clone() ;
 630
 631   TIter nextdigit(digits) ;
 632   AliPHOSDigit * digit ;
 633   Bool_t notremoved = kTRUE ;
 634
 635   while ( (digit = (AliPHOSDigit *)nextdigit()) ) { // scan over the list of digits
 636     AliPHOSRecPoint * clu = 0 ;
 637
 638     TArrayI clusterdigitslist(1000) ;
 639     Int_t index ;
 640
 641     if (( IsInEmc (digit) && Calibrate(digit->GetAmp()) > fEmcClusteringThreshold  ) ||
 642         ( IsInPpsd(digit) && Calibrate(digit->GetAmp()) > fPpsdClusteringThreshold ) ||
 643         ( IsInCpv (digit) && Calibrate(digit->GetAmp()) > fCpvClusteringThreshold  ) ) {
 644
 645       Int_t iDigitInCluster = 0 ;
 646
 647       if  ( IsInEmc(digit) ) {
 648         // start a new EMC RecPoint
 649         if(fNumberOfEmcClusters >= fEmcRecPoints->GetSize()) fEmcRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters+1) ;
 650         fEmcRecPoints->AddAt(new  AliPHOSEmcRecPoint(), fNumberOfEmcClusters) ;
 651         clu = (AliPHOSEmcRecPoint *) fEmcRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters) ;
 652         fNumberOfEmcClusters++ ;
 653         clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp())) ;
 654         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList() ;
 655         iDigitInCluster++ ;
 656         digits->Remove(digit) ;
 657
 658       } else {
 659
 660         // start a new PPSD/CPV cluster
 661         if(fNumberOfCpvClusters >= fCpvRecPoints->GetSize()) fCpvRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters+1);
 662         if(IsInPpsd(digit))
 663           fCpvRecPoints->AddAt(new AliPHOSPpsdRecPoint(),fNumberOfCpvClusters) ;
 664         else
 665           fCpvRecPoints->AddAt(new AliPHOSCpvRecPoint(), fNumberOfCpvClusters) ;
 666         clu =  (AliPHOSPpsdRecPoint *) fCpvRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters)  ;
 667         fNumberOfCpvClusters++ ;
 668
 669         clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp()) ) ;
 670         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList()  ;
 671         iDigitInCluster++ ;
 672         digits->Remove(digit) ;
 673         nextdigit.Reset() ;
 674
 675         // Here we remove resting EMC digits, which cannot make cluster
 676
 677         if( notremoved ) {
 678           while( ( digit = (AliPHOSDigit *)nextdigit() ) ) {
 679             if( IsInEmc(digit) )
 680               digits->Remove(digit) ;
 681             else
 682               break ;
 683           }
 684           notremoved = kFALSE ;
 685         }
 686
 687       } // else
 688
 689       nextdigit.Reset() ;
 690
 691       AliPHOSDigit * digitN ;
 692       index = 0 ;
 693       while (index < iDigitInCluster){ // scan over digits already in cluster
 694         digit =  (AliPHOSDigit*)fDigits->At(clusterdigitslist[index])  ;
 695         index++ ;
 696         while ( (digitN = (AliPHOSDigit *)nextdigit()) ) { // scan over the reduced list of digits
 697           Int_t ineb = AreNeighbours(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!!
 698           switch (ineb ) {
 699           case 0 :   // not a neighbour
 700             break ;
 701           case 1 :   // are neighbours
 702             clu->AddDigit(*digitN, Calibrate( digitN->GetAmp() ) ) ;
 703             clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digitN->GetIndexInList() ;
 704             iDigitInCluster++ ;
 705             digits->Remove(digitN) ;
 706             break ;
 707           case 2 :   // too far from each other
 708             goto endofloop;
 709           } // switch
 710
 711         } // while digitN
 712
 713       endofloop: ;
 714         nextdigit.Reset() ;
 715
 716       } // loop over cluster
 717
 718     } // energy theshold
 719
 720
 721   } // while digit
 722
 723   delete digits ;
 724
 725 }
 726
 727 //____________________________________________________________________________
 728 void AliPHOSClusterizerv1::MakeUnfolding(){
 729   //Unfolds clusters using the shape of ElectroMagnetic shower
 730   // Performs unfolding of all EMC/CPV but NOT ppsd clusters
 731
 732   //Unfold first EMC clusters
 733   if(fNumberOfEmcClusters > 0){
 734
 735     Int_t nModulesToUnfold = fGeom->GetNModules() ;
 736
 737     Int_t numberofNotUnfolded = fNumberOfEmcClusters ;
 738     Int_t index ;
 739     for(index = 0 ; index < numberofNotUnfolded ; index++){
 740
 741       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = (AliPHOSEmcRecPoint *) fEmcRecPoints->At(index) ;
 742       if(emcRecPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
 743         break ;
 744
 745       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
 746       Int_t * maxAt = new Int_t[nMultipl] ;
 747       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
 748       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fEmcLocMaxCut,fDigits) ;
 749
 750       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
 751         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
 752         fEmcRecPoints->Remove(emcRecPoint);
 753         fEmcRecPoints->Compress() ;
 754         index-- ;
 755         fNumberOfEmcClusters -- ;
 756         numberofNotUnfolded-- ;
 757       }
 758
 759       delete[] maxAt ;
 760       delete[] maxAtEnergy ;
 761     }
 762   }
 763   //Unfolding of EMC clusters finished
 764
 765
 766   //Unfold now CPV clusters
 767   if(fNumberOfCpvClusters > 0){
 768
 769     Int_t nModulesToUnfold = fGeom->GetNCPVModules() ;
 770
 771     Int_t numberofCpvNotUnfolded = fNumberOfCpvClusters ;
 772     Int_t index ;
 773     for(index = 0 ; index < numberofCpvNotUnfolded ; index++){
 774
 775       AliPHOSRecPoint * recPoint = (AliPHOSRecPoint *) fCpvRecPoints->At(index) ;
 776
 777       if(recPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
 778         break ;
 779
 780       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = (AliPHOSEmcRecPoint*) recPoint ;
 781
 782       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
 783       Int_t * maxAt = new Int_t[nMultipl] ;
 784       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
 785       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fCpvLocMaxCut,fDigits) ;
 786
 787       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
 788         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
 789         fCpvRecPoints->Remove(emcRecPoint);
 790         fCpvRecPoints->Compress() ;
 791         index-- ;
 792         numberofCpvNotUnfolded-- ;
 793         fNumberOfCpvClusters-- ;
 794       }
 795
 796       delete[] maxAt ;
 797       delete[] maxAtEnergy ;
 798     }
 799   }
 800   //Unfolding of Cpv clusters finished
 801
 802 }
 803
 804 //____________________________________________________________________________
 805 Double_t  AliPHOSClusterizerv1::ShowerShape(Double_t r)
 806 {
 807   // Shape of the shower (see PHOS TDR)
 808   // If you change this function, change also the gradien evaluation  in ChiSquare()
 809
 810   Double_t r4    = r*r*r*r ;
 811   Double_t r295  = TMath::Power(r, 2.95) ;
 812   Double_t shape = TMath::Exp( -r4 * (1. / (2.32 + 0.26 * r4) + 0.0316 / (1 + 0.0652 * r295) ) ) ;
 813   return shape ;
 814 }
 815
 816 //____________________________________________________________________________
 817 void  AliPHOSClusterizerv1::UnfoldCluster(AliPHOSEmcRecPoint * iniEmc,
 818                                                  Int_t nMax,
 819                                                  int * maxAt,
 820                                                  Float_t * maxAtEnergy)
 821 {
 822   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers
 823
 824   Int_t nPar = 3 * nMax ;
 825   Float_t * fitparameters = new Float_t[nPar] ;
 826
 827   Bool_t rv = FindFit(iniEmc, maxAt, maxAtEnergy, nPar, fitparameters) ;
 828   if( !rv ) {
 829     // Fit failed, return and remove cluster
 830     delete[] fitparameters ;
 831     return ;
 832   }
 833
 834   // create ufolded rec points and fill them with new energy lists
 835   // First calculate energy deposited in each sell in accordance with fit (without fluctuations): efit[]
 836   // and later correct this number in acordance with actual energy deposition
 837
 838   Int_t nDigits = iniEmc->GetMultiplicity() ;
 839   Float_t * efit = new Float_t[nDigits] ;
 840   Float_t xDigit,zDigit,distance ;
 841   Float_t xpar,zpar,epar  ;
 842   Int_t relid[4] ;
 843   AliPHOSDigit * digit ;
 844   Int_t * emcDigits = iniEmc->GetDigitsList() ;
 845
 846   Int_t iparam ;
 847   Int_t iDigit ;
 848   for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 849     digit = (AliPHOSDigit*) fDigits->At(emcDigits[iDigit] ) ;
 850     fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 851     fGeom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 852     efit[iDigit] = 0;
 853
 854     iparam = 0 ;
 855     while(iparam < nPar ){
 856       xpar = fitparameters[iparam] ;
 857       zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 858       epar = fitparameters[iparam+2] ;
 859       iparam += 3 ;
 860       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
 861       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
 862       efit[iDigit] += epar * ShowerShape(distance) ;
 863     }
 864   }
 865
 866
 867   // Now create new RecPoints and fill energy lists with efit corrected to fluctuations
 868   // so that energy deposited in each cell is distributed betwin new clusters proportionally
 869   // to its contribution to efit
 870
 871   Float_t * emcEnergies = iniEmc->GetEnergiesList() ;
 872   Float_t ratio ;
 873
 874   iparam = 0 ;
 875   while(iparam < nPar ){
 876     xpar = fitparameters[iparam] ;
 877     zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 878     epar = fitparameters[iparam+2] ;
 879     iparam += 3 ;
 880
 881     AliPHOSEmcRecPoint * emcRP ;
 882
 883     if(iniEmc->IsEmc()){ //create new entries in fEmcRecPoints...
 884
 885       if(fNumberOfEmcClusters >= fEmcRecPoints->GetSize())
 886         fEmcRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters) ;
 887
 888       (*fEmcRecPoints)[fNumberOfEmcClusters] = new AliPHOSEmcRecPoint() ;
 889       emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint *) fEmcRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters);
 890       fNumberOfEmcClusters++ ;
 891     }
 892     else{//create new entries in fCpvRecPoints
 893       if(fNumberOfCpvClusters >= fCpvRecPoints->GetSize())
 894         fCpvRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters) ;
 895
 896       (*fCpvRecPoints)[fNumberOfCpvClusters] = new AliPHOSCpvRecPoint() ;
 897       emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint *) fCpvRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters);
 898       fNumberOfCpvClusters++ ;
 899     }
 900
 901     Float_t eDigit ;
 902     for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 903       digit = (AliPHOSDigit*) fDigits->At( emcDigits[iDigit] ) ;
 904       fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 905       fGeom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 906       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
 907       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
 908       ratio = epar * ShowerShape(distance) / efit[iDigit] ;
 909       eDigit = emcEnergies[iDigit] * ratio ;
 910       emcRP->AddDigit( *digit, eDigit ) ;
 911     }
 912   }
 913
 914   delete[] fitparameters ;
 915   delete[] efit ;
 916
 917 }
 918
 919 //_____________________________________________________________________________
 920 void AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & nPar, Double_t * Grad, Double_t & fret, Double_t * x, Int_t iflag)
 921 {
 922   // Calculates th Chi square for the cluster unfolding minimization
 923   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
 924
 925
 926   TList * toMinuit = (TList*) gMinuit->GetObjectFit() ;
 927
 928   AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint*) toMinuit->At(0)  ;
 929   TClonesArray * digits = (TClonesArray*)toMinuit->At(1)  ;
 930
 931
 932
 933   //  AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint *) gMinuit->GetObjectFit() ; // EmcRecPoint to fit
 934
 935   Int_t * emcDigits     = emcRP->GetDigitsList() ;
 936
 937   Int_t nOfDigits = emcRP->GetDigitsMultiplicity() ;
 938
 939   Float_t * emcEnergies = emcRP->GetEnergiesList() ;
 940
 941   AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGeometry::GetInstance() ;
 942
 943   fret = 0. ;
 944   Int_t iparam ;
 945
 946   if(iflag == 2)
 947     for(iparam = 0 ; iparam < nPar ; iparam++)
 948       Grad[iparam] = 0 ; // Will evaluate gradient
 949
 950   Double_t efit ;
 951
 952   AliPHOSDigit * digit ;
 953   Int_t iDigit ;
 954
 955   for( iDigit = 0 ; iDigit < nOfDigits ; iDigit++) {
 956
 957     digit = (AliPHOSDigit*) digits->At( emcDigits[iDigit] ) ;
 958
 959     Int_t relid[4] ;
 960     Float_t xDigit ;
 961     Float_t zDigit ;
 962
 963     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 964
 965     geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 966
 967      if(iflag == 2){  // calculate gradient
 968        Int_t iParam = 0 ;
 969        efit = 0 ;
 970        while(iParam < nPar ){
 971          Double_t distance = (xDigit - x[iParam]) * (xDigit - x[iParam]) ;
 972          iParam++ ;
 973          distance += (zDigit - x[iParam]) * (zDigit - x[iParam]) ;
 974          distance = TMath::Sqrt( distance ) ;
 975          iParam++ ;
 976          efit += x[iParam] * ShowerShape(distance) ;
 977          iParam++ ;
 978        }
 979        Double_t sum = 2. * (efit - emcEnergies[iDigit]) / emcEnergies[iDigit] ; // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
 980        iParam = 0 ;
 981        while(iParam < nPar ){
 982          Double_t xpar = x[iParam] ;
 983          Double_t zpar = x[iParam+1] ;
 984          Double_t epar = x[iParam+2] ;
 985          Double_t dr = TMath::Sqrt( (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar) );
 986          Double_t shape = sum * ShowerShape(dr) ;
 987          Double_t r4 = dr*dr*dr*dr ;
 988          Double_t r295 = TMath::Power(dr,2.95) ;
 989          Double_t deriv =-4. * dr*dr * ( 2.32 / ( (2.32 + 0.26 * r4) * (2.32 + 0.26 * r4) ) +
 990                                          0.0316 * (1. + 0.0171 * r295) / ( ( 1. + 0.0652 * r295) * (1. + 0.0652 * r295) ) ) ;
 991
 992          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (xpar - xDigit) ;  // Derivative over x
 993          iParam++ ;
 994          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (zpar - zDigit) ;  // Derivative over z
 995          iParam++ ;
 996          Grad[iParam] += shape ;                                  // Derivative over energy
 997          iParam++ ;
 998        }
 999      }
1000      efit = 0;
1001      iparam = 0 ;
1002
1003      while(iparam < nPar ){
1004        Double_t xpar = x[iparam] ;
1005        Double_t zpar = x[iparam+1] ;
1006        Double_t epar = x[iparam+2] ;
1007        iparam += 3 ;
1008        Double_t distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
1009        distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
1010        efit += epar * ShowerShape(distance) ;
1011      }
1012
1013      fret += (efit-emcEnergies[iDigit])*(efit-emcEnergies[iDigit])/emcEnergies[iDigit] ;
1014      // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
1015   }
1016
1017 }
1018
1019 //____________________________________________________________________________
1020 void AliPHOSClusterizerv1::Print(Option_t * option)const
1021 {
1022   if(fIsInitialized){
1023
1024     // Print parameters
1025
1026     cout << "---------------"<< GetName() << " " << GetTitle()<< "-----------" << endl
1027          << "Clusterizing digits from the file: " << fHeaderFileName.Data() << endl
1028          << "                           Branch: " << fDigitsBranchTitle.Data() << endl
1029          << endl
1030          << "                       EMC Clustering threshold = " << fEmcClusteringThreshold << endl
1031          << "                       EMC Local Maximum cut    = " << fEmcLocMaxCut << endl
1032          << "                       EMC Logarothmic weight   = " << fW0 << endl
1033          << endl
1034          << "                       CPV Clustering threshold = " << fCpvClusteringThreshold << endl
1035          << "                       CPV Local Maximum cut    = " << fCpvLocMaxCut << endl
1036        << "                       CPV Logarothmic weight   = " << fW0CPV << endl
1037          << endl
1038          << "                      PPSD  Clustering threshold = " << fPpsdClusteringThreshold << endl;
1039     if(fToUnfold)
1040       cout << " Unfolding on " << endl ;
1041     else
1042       cout << " Unfolding off " << endl ;
1043
1044     cout << "------------------------------------------------------------------" <<endl ;
1045   }
1046   else
1047     cout << " AliPHOSClusterizerv1 not initialized " << endl ;
1048 }
1049 //____________________________________________________________________________
1050 void AliPHOSClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option){
1051   //Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliPHOSClusterizer
1052
1053   cout << "AliPHOSClusterizerv1: " << endl ;
1054   cout << "       Found "<< fEmcRecPoints->GetEntriesFast() << " EMC Rec Points and "
1055            << fCpvRecPoints->GetEntriesFast() << " CPV RecPoints" << endl ;
1056
1057   if(strstr(option,"all")) {
1058     cout << "EMC clusters " << endl ;
1059     cout << "  Index    "
1060          << "  Ene(MeV) "
1061          << "  Multi    "
1062          << "  Module   "
1063          << "    X      "
1064          << "    Y      "
1065          << "    Z      "
1066          << " Lambda 1  "
1067          << " Lambda 2  "
1068          << " MaxEnergy "
1069          << " # of prim "
1070          << " Primaries list "      <<  endl;
1071
1072     Int_t index ;
1073     for (index = 0 ; index < fEmcRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1074       AliPHOSEmcRecPoint * rp = (AliPHOSEmcRecPoint * )fEmcRecPoints->At(index) ;
1075
1076       cout << setw(6) << rp->GetIndexInList() << "     ";
1077       cout << setw(6) << rp->GetEnergy()      << "     ";
1078       cout << setw(6) << rp->GetMultiplicity()<< "     ";
1079       cout << setw(6) << rp->GetPHOSMod()     << "     ";
1080
1081       TVector3  locpos;
1082       rp->GetLocalPosition(locpos);
1083       cout << setw(8) <<  locpos.X()          << "     ";
1084       cout << setw(8) <<  locpos.Y()          << "     ";
1085       cout << setw(8) <<  locpos.Z()          << "     ";
1086
1087       Float_t lambda[2];
1088       rp->GetElipsAxis(lambda);
1089       cout << setw(10)<<  lambda[0]           << "     ";
1090       cout << setw(10)<<  lambda[1]           << "     ";
1091
1092
1093       Int_t * primaries;
1094       Int_t nprimaries;
1095       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
1096       cout << setw(8) <<    primaries         << "     ";
1097
1098       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++)
1099         cout << setw(4)  <<  primaries[iprimary] << " ";
1100       cout << endl;
1101     }
1102     cout << endl ;
1103
1104     //Now plot PCV/PPSD recPoints
1105     cout << "EMC clusters " << endl ;
1106     cout << "  Index    "
1107          << "  Multi    "
1108          << "  Module   "
1109          << "  Layer    "
1110          << "    X      "
1111          << "    Y      "
1112          << "    Z      "
1113          << " # of prim "
1114          << " Primaries list "      <<  endl;
1115
1116     for (index = 0 ; index < fEmcRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1117       AliPHOSRecPoint * rp = (AliPHOSRecPoint * )fCpvRecPoints->At(index) ;
1118       cout << setw(6) << rp->GetIndexInList() << "     ";
1119       cout << setw(6) << rp->GetPHOSMod()     << "     ";
1120
1121       if( (strcmp(rp->ClassName() , "AliPHOSPpsdRecPoint" )) == 0){
1122         AliPHOSPpsdRecPoint * ppsd = (AliPHOSPpsdRecPoint*) rp ;
1123         if(ppsd->GetUp())
1124           cout <<"        CPV     ";
1125         else
1126           cout <<"       PPSD     ";
1127       }
1128       else
1129         cout <<"        CPV     ";
1130
1131       TVector3  locpos;
1132       rp->GetLocalPosition(locpos);
1133       cout << setw(8) <<  locpos.X()          << "     ";
1134       cout << setw(8) <<  locpos.Y()          << "     ";
1135       cout << setw(8) <<  locpos.Z()          << "     ";
1136
1137       Int_t * primaries;
1138       Int_t nprimaries;
1139       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
1140       cout << setw(8) <<    primaries         << "     ";
1141
1142       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++)
1143         cout << setw(4)  <<  primaries[iprimary] << " ";
1144       cout << endl;
1145     }
1146
1147
1148     cout << "-------------------------------------------------"<<endl ;
1149   }
1150 }
1151