PHOS/AliPHOSClusterizerv1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 /* History of cvs commits:
  19  *
  20  * $Log$
  21  * Revision 1.92  2006/04/29 20:26:46  hristov
  22  * Separate EMC and CPV calibration (Yu.Kharlov)
  23  *
  24  * Revision 1.91  2006/04/22 10:30:17  hristov
  25  * Add fEnergy to AliPHOSDigit and operate with EMC amplitude in energy units (Yu.Kharlov)
  26  *
  27  * Revision 1.90  2006/04/11 15:22:59  hristov
  28  * run number in query set to -1: forces AliCDBManager to use its run number (A.Colla)
  29  *
  30  * Revision 1.89  2006/03/13 14:05:42  kharlov
  31  * Calibration objects for EMC and CPV
  32  *
  33  * Revision 1.88  2006/01/11 08:54:52  hristov
  34  * Additional protection in case no calibration entry was found
  35  *
  36  * Revision 1.87  2005/11/22 08:46:43  kharlov
  37  * Updated to new CDB (Boris Polichtchouk)
  38  *
  39  * Revision 1.86  2005/11/14 21:52:43  hristov
  40  * Coding conventions
  41  *
  42  * Revision 1.85  2005/09/27 16:08:08  hristov
  43  * New version of CDB storage framework (A.Colla)
  44  *
  45  * Revision 1.84  2005/09/21 10:02:47  kharlov
  46  * Reading calibration from CDB (Boris Polichtchouk)
  47  *
  48  * Revision 1.82  2005/09/02 15:43:13  kharlov
  49  * Add comments in GetCalibrationParameters and Calibrate
  50  *
  51  * Revision 1.81  2005/09/02 14:32:07  kharlov
  52  * Calibration of raw data
  53  *
  54  * Revision 1.80  2005/08/24 15:31:36  kharlov
  55  * Setting raw digits flag
  56  *
  57  * Revision 1.79  2005/07/25 15:53:53  kharlov
  58  * Read raw data
  59  *
  60  * Revision 1.78  2005/05/28 14:19:04  schutz
  61  * Compilation warnings fixed by T.P.
  62  *
  63  */
  64
  65 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
  66 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  67 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and
  68 //  unfolds the clusters having several local maxima.
  69 //  Results are stored in TreeR#, branches PHOSEmcRP (EMC recPoints),
  70 //  PHOSCpvRP (CPV RecPoints) and AliPHOSClusterizer (Clusterizer with all
  71 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
  72 //  This TTask is normally called from Reconstructioner, but can as well be used in
  73 //  standalone mode.
  74 // Use Case:
  75 //  root [0] AliPHOSClusterizerv1 * cl = new AliPHOSClusterizerv1("galice.root", "recpointsname", "digitsname")
  76 //  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  77 //               // reads gAlice from header file "galice.root", uses digits stored in the branch names "digitsname" (default = "Default")
  78 //               // and saves recpoints in branch named "recpointsname" (default = "digitsname")
  79 //  root [1] cl->ExecuteTask()
  80 //               //finds RecPoints in all events stored in galice.root
  81 //  root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2")
  82 //               //sets another title for Digitis (input) branch
  83 //  root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")
  84 //               //sets another title four output branches
  85 //  root [4] cl->SetEmcLocalMaxCut(0.03)
  86 //               //set clusterization parameters
  87 //  root [5] cl->ExecuteTask("deb all time")
  88 //               //once more finds RecPoints options are
  89 //               // deb - print number of found rec points
  90 //               // deb all - print number of found RecPoints and some their characteristics
  91 //               // time - print benchmarking results
  92
  93 // --- ROOT system ---
  94
  95 #include "TMath.h"
  96 #include "TMinuit.h"
  97 #include "TTree.h"
  98 #include "TBenchmark.h"
  99
 100 // --- Standard library ---
 101
 102 // --- AliRoot header files ---
 103 #include "AliLog.h"
 104 #include "AliPHOSGetter.h"
 105 #include "AliPHOSGeometry.h"
 106 #include "AliPHOSClusterizerv1.h"
 107 #include "AliPHOSEmcRecPoint.h"
 108 #include "AliPHOSCpvRecPoint.h"
 109 #include "AliPHOSDigit.h"
 110 #include "AliPHOSDigitizer.h"
 111 #include "AliPHOSCalibrationDB.h"
 112 #include "AliCDBManager.h"
 113 #include "AliCDBStorage.h"
 114 #include "AliCDBEntry.h"
 115
 116 ClassImp(AliPHOSClusterizerv1)
 117
 118 //____________________________________________________________________________
 119   AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1() : AliPHOSClusterizer()
 120 {
 121   // default ctor (to be used mainly by Streamer)
 122
 123   InitParameters() ;
 124   fDefaultInit = kTRUE ;
 125 }
 126
 127 //____________________________________________________________________________
 128 AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1(const TString alirunFileName, const TString eventFolderName)
 129 :AliPHOSClusterizer(alirunFileName, eventFolderName)
 130 {
 131   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
 132
 133   InitParameters() ;
 134   Init() ;
 135   fDefaultInit = kFALSE ;
 136 }
 137
 138 //____________________________________________________________________________
 139   AliPHOSClusterizerv1::~AliPHOSClusterizerv1()
 140 {
 141   // dtor
 142
 143 }
 144 //____________________________________________________________________________
 145 const TString AliPHOSClusterizerv1::BranchName() const
 146 {
 147   return GetName();
 148 }
 149
 150 //____________________________________________________________________________
 151 Float_t  AliPHOSClusterizerv1::CalibrateEMC(Float_t amp, Int_t absId)
 152 {
 153   // Convert EMC measured amplitude into real energy.
 154   // Calibration parameters are taken from calibration data base for raw data,
 155   // or from digitizer parameters for simulated data.
 156
 157   if(fCalibData){
 158     Int_t relId[4];
 159     AliPHOSGetter *gime = AliPHOSGetter::Instance();
 160     gime->PHOSGeometry()->AbsToRelNumbering(absId,relId) ;
 161     Int_t   module = relId[0];
 162     Int_t   column = relId[3];
 163     Int_t   row    = relId[2];
 164     if(absId <= fEmcCrystals) { // this is EMC
 165       fADCchanelEmc   = fCalibData->GetADCchannelEmc (module,column,row);
 166       return amp*fADCchanelEmc ;
 167     }
 168   }
 169   else{ //simulation
 170     if(absId <= fEmcCrystals) // this is EMC
 171       return fADCpedestalEmc + amp*fADCchanelEmc ;
 172   }
 173   return 0;
 174 }
 175
 176 //____________________________________________________________________________
 177 Float_t  AliPHOSClusterizerv1::CalibrateCPV(Int_t amp, Int_t absId)
 178 {
 179   // Convert digitized CPV amplitude into charge.
 180   // Calibration parameters are taken from calibration data base for raw data,
 181   // or from digitizer parameters for simulated data.
 182
 183   if(fCalibData){
 184     Int_t relId[4];
 185     AliPHOSGetter *gime = AliPHOSGetter::Instance();
 186     gime->PHOSGeometry()->AbsToRelNumbering(absId,relId) ;
 187     Int_t   module = relId[0];
 188     Int_t   column = relId[3];
 189     Int_t   row    = relId[2];
 190     if(absId > fEmcCrystals) { // this is CPV
 191       fADCchanelCpv   = fCalibData->GetADCchannelCpv (module,column,row);
 192       fADCpedestalCpv = fCalibData->GetADCpedestalCpv(module,column,row);
 193       return fADCpedestalCpv + amp*fADCchanelCpv ;
 194     }
 195   }
 196   else{ //simulation
 197     if(absId > fEmcCrystals) // this is CPV
 198       return fADCpedestalCpv+ amp*fADCchanelCpv ;
 199   }
 200   return 0;
 201 }
 202
 203 //____________________________________________________________________________
 204 void AliPHOSClusterizerv1::Exec(Option_t *option)
 205 {
 206   // Steering method to perform clusterization for events
 207   // in the range from fFirstEvent to fLastEvent.
 208   // This range is optionally set by SetEventRange().
 209   // if fLastEvent=-1 (by default), then process events until the end.
 210
 211   if(strstr(option,"tim"))
 212     gBenchmark->Start("PHOSClusterizer");
 213
 214   if(strstr(option,"print")) {
 215     Print() ;
 216     return ;
 217   }
 218
 219   GetCalibrationParameters() ;
 220
 221   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance() ;
 222   if (fRawReader == 0)
 223     gime->SetRawDigits(kFALSE);
 224   else
 225     gime->SetRawDigits(kTRUE);
 226
 227   if (fLastEvent == -1)
 228     fLastEvent = gime->MaxEvent() - 1 ;
 229   else
 230     fLastEvent = TMath::Min(fFirstEvent, gime->MaxEvent()); // one event at the time
 231   Int_t nEvents   = fLastEvent - fFirstEvent + 1;
 232
 233   Int_t ievent ;
 234   for (ievent = fFirstEvent; ievent <= fLastEvent; ievent++) {
 235     if (fRawReader == 0)
 236       gime->Event(ievent    ,"D"); // Read digits from simulated data
 237     else {
 238       gime->Event(fRawReader,"W",fIsOldRCUFormat); // Read digits from raw data
 239     }
 240     fNumberOfEmcClusters  = fNumberOfCpvClusters  = 0 ;
 241
 242     MakeClusters() ;
 243
 244     if(fToUnfold)
 245       MakeUnfolding() ;
 246
 247     WriteRecPoints();
 248
 249     if(strstr(option,"deb"))
 250       PrintRecPoints(option) ;
 251
 252     //increment the total number of recpoints per run
 253     fRecPointsInRun += gime->EmcRecPoints()->GetEntriesFast() ;
 254     fRecPointsInRun += gime->CpvRecPoints()->GetEntriesFast() ;
 255     if (fRawReader != 0) {
 256       AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(gime->PhosLoader()->GetTitle());
 257       Int_t iEvent = ievent;
 258       rl->SetEventNumber(++iEvent);
 259     }
 260   }
 261
 262   if(fWrite) //do not unload in "on flight" mode
 263     Unload();
 264
 265   if(strstr(option,"tim")){
 266     gBenchmark->Stop("PHOSClusterizer");
 267     AliInfo(Form("took %f seconds for Clusterizing %f seconds per event \n",
 268          gBenchmark->GetCpuTime("PHOSClusterizer"),
 269          gBenchmark->GetCpuTime("PHOSClusterizer")/nEvents )) ;
 270   }
 271 }
 272
 273 //____________________________________________________________________________
 274 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::FindFit(AliPHOSEmcRecPoint * emcRP, AliPHOSDigit ** maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
 275                                     Int_t nPar, Float_t * fitparameters) const
 276 {
 277   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima
 278   // The initial values for fitting procedure are set equal to the positions of local maxima.
 279   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3 electromagnetic showers
 280
 281
 282   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
 283   TClonesArray * digits = gime->Digits();
 284
 285
 286   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
 287   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
 288   gMinuit->SetFCN(AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;
 289                                          // To set the address of the minimization function
 290
 291   TList * toMinuit = new TList();
 292   toMinuit->AddAt(emcRP,0) ;
 293   toMinuit->AddAt(digits,1) ;
 294
 295   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
 296
 297   // filling initial values for fit parameters
 298   AliPHOSDigit * digit ;
 299
 300   Int_t ierflg  = 0;
 301   Int_t index   = 0 ;
 302   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
 303
 304   Int_t iDigit ;
 305
 306   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
 307
 308   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
 309     digit = maxAt[iDigit];
 310
 311     Int_t relid[4] ;
 312     Float_t x = 0.;
 313     Float_t z = 0.;
 314     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 315     geom->RelPosInModule(relid, x, z) ;
 316
 317     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
 318
 319     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 320     index++ ;
 321     if(ierflg != 0){
 322       Warning("FindFit", "PHOS Unfolding unable to set initial value for fit procedure : x = %f\n", x ) ;
 323       return kFALSE;
 324     }
 325     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 326     index++ ;
 327     if(ierflg != 0){
 328        Warning("FindFit", "PHOS Unfolding unable to set initial value for fit procedure : z =%f\n", z ) ;
 329       return kFALSE;
 330     }
 331     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
 332     index++ ;
 333     if(ierflg != 0){
 334       Warning("FindFit", "PHOS Unfolding unable to set initial value for fit procedure : energy = %f\n", energy ) ;
 335       return kFALSE;
 336     }
 337   }
 338
 339   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ; The number of function call slightly
 340                       //  depends on it.
 341   Double_t p1 = 1.0 ;
 342   Double_t p2 = 0.0 ;
 343
 344   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls
 345   gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient
 346   gMinuit->SetMaxIterations(5);
 347   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
 348
 349   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize
 350
 351   if(ierflg == 4){  // Minimum not found
 352     Warning("FindFit", "PHOS Unfolding fit not converged, cluster abandoned\n" );
 353     return kFALSE ;
 354   }
 355   for(index = 0; index < nPar; index++){
 356     Double_t err ;
 357     Double_t val ;
 358     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
 359     fitparameters[index] = val ;
 360    }
 361
 362   delete toMinuit ;
 363   return kTRUE;
 364
 365 }
 366
 367 //____________________________________________________________________________
 368 void AliPHOSClusterizerv1::GetCalibrationParameters()
 369 {
 370   // Set calibration parameters:
 371   // if calibration database exists, they are read from database,
 372   // otherwise, they are taken from digitizer.
 373   //
 374   // It is a user responsilibity to open CDB before reconstruction, for example:
 375   // AliCDBStorage* storage = AliCDBManager::Instance()->GetStorage("local://CalibDB");
 376
 377   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
 378   // fCalibData = new AliPHOSCalibData(gAlice->GetRunNumber()); //original
 379
 380   fCalibData = new AliPHOSCalibData(-1); //use AliCDBManager's run number
 381
 382   if(!fCalibData)
 383     {
 384       if ( !gime->Digitizer() )
 385         gime->LoadDigitizer();
 386       AliPHOSDigitizer * dig = gime->Digitizer();
 387       fADCchanelEmc   = dig->GetEMCchannel() ;
 388       fADCpedestalEmc = dig->GetEMCpedestal();
 389
 390       fADCchanelCpv   = dig->GetCPVchannel() ;
 391       fADCpedestalCpv = dig->GetCPVpedestal() ;
 392     }
 393 }
 394
 395 //____________________________________________________________________________
 396 void AliPHOSClusterizerv1::Init()
 397 {
 398   // Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
 399   // Attach the Clusterizer task to the list of PHOS tasks
 400
 401   AliPHOSGetter* gime = AliPHOSGetter::Instance() ;
 402   if(!gime)
 403     gime = AliPHOSGetter::Instance(GetTitle(), fEventFolderName.Data());
 404
 405   AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry();
 406   if (!geom) {
 407     AliError("Could not find PHOS geometry! Loading the default one !");
 408     geom = AliPHOSGeometry::GetInstance("IHEP","");
 409   }
 410
 411   fEmcCrystals = geom->GetNModules() *  geom->GetNCristalsInModule() ;
 412
 413   if(!gMinuit)
 414     gMinuit = new TMinuit(100);
 415
 416   if ( !gime->Clusterizer() ) {
 417     gime->PostClusterizer(this);
 418   }
 419 }
 420
 421 //____________________________________________________________________________
 422 void AliPHOSClusterizerv1::InitParameters()
 423 {
 424
 425   fNumberOfCpvClusters     = 0 ;
 426   fNumberOfEmcClusters     = 0 ;
 427
 428   fCpvClusteringThreshold  = 0.0;
 429   fEmcClusteringThreshold  = 0.2;
 430
 431   fEmcLocMaxCut            = 0.03 ;
 432   fCpvLocMaxCut            = 0.03 ;
 433
 434   fEmcMinE                 = 0.01 ;
 435   fCpvMinE                 = 0.0  ;
 436
 437   fW0                      = 4.5 ;
 438   fW0CPV                   = 4.0 ;
 439
 440   fEmcTimeGate             = 1.e-8 ;
 441
 442   fToUnfold                = kTRUE ;
 443
 444   fRecPointsInRun          = 0 ;
 445
 446   fWrite                   = kTRUE ;
 447
 448   fCalibData               = 0 ;
 449
 450   SetEventRange(0,-1) ;
 451
 452   fIsOldRCUFormat          = kFALSE;
 453 }
 454
 455 //____________________________________________________________________________
 456 Int_t AliPHOSClusterizerv1::AreNeighbours(AliPHOSDigit * d1, AliPHOSDigit * d2)const
 457 {
 458   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour but continue searching
 459   //                                       = 1 are neighbour
 460   //                                       = 2 are not neighbour but do not continue searching
 461   // neighbours are defined as digits having at least a common vertex
 462   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster
 463   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster
 464
 465   AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::Instance()->PHOSGeometry() ;
 466
 467   Int_t rv = 0 ;
 468
 469   Int_t relid1[4] ;
 470   geom->AbsToRelNumbering(d1->GetId(), relid1) ;
 471
 472   Int_t relid2[4] ;
 473   geom->AbsToRelNumbering(d2->GetId(), relid2) ;
 474
 475   if ( (relid1[0] == relid2[0]) && (relid1[1]==relid2[1]) ) { // inside the same PHOS module
 476     Int_t rowdiff = TMath::Abs( relid1[2] - relid2[2] ) ;
 477     Int_t coldiff = TMath::Abs( relid1[3] - relid2[3] ) ;
 478
 479     if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 )){
 480       if((relid1[1] != 0) || (TMath::Abs(d1->GetTime() - d2->GetTime() ) < fEmcTimeGate))
 481       rv = 1 ;
 482     }
 483     else {
 484       if((relid2[2] > relid1[2]) && (relid2[3] > relid1[3]+1))
 485         rv = 2; //  Difference in row numbers is too large to look further
 486     }
 487
 488   }
 489   else {
 490
 491     if( (relid1[0] < relid2[0]) || (relid1[1] != relid2[1]) )
 492       rv=2 ;
 493
 494   }
 495
 496   return rv ;
 497 }
 498 //____________________________________________________________________________
 499 void AliPHOSClusterizerv1::CleanDigits(TClonesArray * digits)
 500 {
 501   // Remove digits with amplitudes below threshold
 502
 503   for(Int_t i=0; i<digits->GetEntriesFast(); i++){
 504     AliPHOSDigit * digit = static_cast<AliPHOSDigit*>(digits->At(i)) ;
 505     if ( (IsInEmc(digit) && CalibrateEMC(digit->GetEnergy(),digit->GetId()) < fEmcMinE) ||
 506          (IsInCpv(digit) && CalibrateCPV(digit->GetAmp()   ,digit->GetId()) < fCpvMinE) )
 507       digits->RemoveAt(i) ;
 508   }
 509   digits->Compress() ;
 510   for (Int_t i = 0 ; i < digits->GetEntriesFast() ; i++) {
 511     AliPHOSDigit *digit = static_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At(i) ) ;
 512     digit->SetIndexInList(i) ;
 513   }
 514
 515 }
 516 //____________________________________________________________________________
 517 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInEmc(AliPHOSDigit * digit) const
 518 {
 519   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-EMC module
 520
 521   Bool_t rv = kFALSE ;
 522   AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::Instance()->PHOSGeometry() ;
 523
 524   Int_t nEMC = geom->GetNModules()*geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();
 525
 526   if(digit->GetId() <= nEMC )   rv = kTRUE;
 527
 528   return rv ;
 529 }
 530
 531 //____________________________________________________________________________
 532 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInCpv(AliPHOSDigit * digit) const
 533 {
 534   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-CPV module
 535
 536   Bool_t rv = kFALSE ;
 537
 538   AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::Instance()->PHOSGeometry() ;
 539
 540   Int_t nEMC = geom->GetNModules()*geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();
 541
 542   if(digit->GetId() > nEMC )   rv = kTRUE;
 543
 544   return rv ;
 545 }
 546
 547 //____________________________________________________________________________
 548 void AliPHOSClusterizerv1::Unload()
 549 {
 550   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance() ;
 551   gime->PhosLoader()->UnloadDigits() ;
 552   gime->PhosLoader()->UnloadRecPoints() ;
 553 }
 554
 555 //____________________________________________________________________________
 556 void AliPHOSClusterizerv1::WriteRecPoints()
 557 {
 558
 559   // Creates new branches with given title
 560   // fills and writes into TreeR.
 561
 562   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
 563
 564   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ;
 565   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ;
 566   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 567
 568
 569   Int_t index ;
 570   //Evaluate position, dispersion and other RecPoint properties..
 571   Int_t nEmc = emcRecPoints->GetEntriesFast();
 572   for(index = 0; index < nEmc; index++){
 573     AliPHOSEmcRecPoint * rp = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( emcRecPoints->At(index) );
 574     rp->Purify(fEmcMinE) ;
 575     if(rp->GetMultiplicity()>0.) //If this RP is not empty
 576       rp->EvalAll(fW0,digits) ;
 577     else{
 578       emcRecPoints->RemoveAt(index) ;
 579       delete rp ;
 580     }
 581   }
 582   emcRecPoints->Compress() ;
 583   emcRecPoints->Sort() ;
 584   //  emcRecPoints->Expand(emcRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 585   for(index = 0; index < emcRecPoints->GetEntries(); index++){
 586     dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( emcRecPoints->At(index) )->SetIndexInList(index) ;
 587   }
 588
 589   //Now the same for CPV
 590   for(index = 0; index < cpvRecPoints->GetEntries(); index++){
 591     AliPHOSCpvRecPoint * rp = dynamic_cast<AliPHOSCpvRecPoint *>( cpvRecPoints->At(index) );
 592     rp->EvalAll(fW0CPV,digits) ;
 593   }
 594   cpvRecPoints->Sort() ;
 595
 596   for(index = 0; index < cpvRecPoints->GetEntries(); index++)
 597     dynamic_cast<AliPHOSCpvRecPoint *>( cpvRecPoints->At(index) )->SetIndexInList(index) ;
 598
 599   cpvRecPoints->Expand(cpvRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 600
 601   if(fWrite){ //We write TreeR
 602     TTree * treeR = gime->TreeR();
 603
 604     Int_t bufferSize = 32000 ;
 605     Int_t splitlevel = 0 ;
 606
 607     //First EMC
 608     TBranch * emcBranch = treeR->Branch("PHOSEmcRP","TObjArray",&emcRecPoints,bufferSize,splitlevel);
 609     emcBranch->SetTitle(BranchName());
 610
 611     //Now CPV branch
 612     TBranch * cpvBranch = treeR->Branch("PHOSCpvRP","TObjArray",&cpvRecPoints,bufferSize,splitlevel);
 613     cpvBranch->SetTitle(BranchName());
 614
 615     emcBranch        ->Fill() ;
 616     cpvBranch        ->Fill() ;
 617
 618     gime->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 619     gime->WriteClusterizer("OVERWRITE");
 620   }
 621 }
 622
 623 //____________________________________________________________________________
 624 void AliPHOSClusterizerv1::MakeClusters()
 625 {
 626   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
 627   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
 628
 629
 630   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
 631
 632   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ;
 633   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ;
 634
 635   emcRecPoints->Delete() ;
 636   cpvRecPoints->Delete() ;
 637
 638   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 639
 640   //Remove digits below threshold
 641   CleanDigits(digits) ;
 642
 643   TClonesArray * digitsC =  static_cast<TClonesArray*>( digits->Clone() ) ;
 644
 645   // Clusterization starts
 646
 647   TIter nextdigit(digitsC) ;
 648   AliPHOSDigit * digit ;
 649   Bool_t notremoved = kTRUE ;
 650
 651   while ( (digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>( nextdigit()) ) ) { // scan over the list of digitsC
 652
 653
 654     AliPHOSRecPoint * clu = 0 ;
 655
 656     TArrayI clusterdigitslist(1500) ;
 657     Int_t index ;
 658
 659     if (( IsInEmc (digit) &&
 660           CalibrateEMC(digit->GetEnergy(),digit->GetId()) > fEmcClusteringThreshold ) ||
 661         ( IsInCpv (digit) &&
 662           CalibrateCPV(digit->GetAmp()   ,digit->GetId()) > fCpvClusteringThreshold ) ) {
 663       Int_t iDigitInCluster = 0 ;
 664
 665       if  ( IsInEmc(digit) ) {
 666         // start a new EMC RecPoint
 667         if(fNumberOfEmcClusters >= emcRecPoints->GetSize())
 668           emcRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters+1) ;
 669
 670         emcRecPoints->AddAt(new  AliPHOSEmcRecPoint(""), fNumberOfEmcClusters) ;
 671         clu = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( emcRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters) ) ;
 672         fNumberOfEmcClusters++ ;
 673         clu->AddDigit(*digit, CalibrateEMC(digit->GetEnergy(),digit->GetId())) ;
 674         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList() ;
 675         iDigitInCluster++ ;
 676         digitsC->Remove(digit) ;
 677
 678       } else {
 679
 680         // start a new CPV cluster
 681         if(fNumberOfCpvClusters >= cpvRecPoints->GetSize())
 682           cpvRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters+1);
 683
 684         cpvRecPoints->AddAt(new AliPHOSCpvRecPoint(""), fNumberOfCpvClusters) ;
 685
 686         clu =  dynamic_cast<AliPHOSCpvRecPoint *>( cpvRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters) ) ;
 687         fNumberOfCpvClusters++ ;
 688         clu->AddDigit(*digit, CalibrateCPV(digit->GetAmp(),digit->GetId()) ) ;
 689         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList()  ;
 690         iDigitInCluster++ ;
 691         digitsC->Remove(digit) ;
 692         nextdigit.Reset() ;
 693
 694         // Here we remove remaining EMC digits, which cannot make a cluster
 695
 696         if( notremoved ) {
 697           while( ( digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>( nextdigit() ) ) ) {
 698             if( IsInEmc(digit) )
 699               digitsC->Remove(digit) ;
 700             else
 701               break ;
 702           }
 703           notremoved = kFALSE ;
 704         }
 705
 706       } // else
 707
 708       nextdigit.Reset() ;
 709
 710       AliPHOSDigit * digitN ;
 711       index = 0 ;
 712       while (index < iDigitInCluster){ // scan over digits already in cluster
 713         digit =  dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At(clusterdigitslist[index]) )  ;
 714         index++ ;
 715         while ( (digitN = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>( nextdigit() ) ) ) { // scan over the reduced list of digits
 716           Int_t ineb = AreNeighbours(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!!
 717           switch (ineb ) {
 718           case 0 :   // not a neighbour
 719             break ;
 720           case 1 :   // are neighbours
 721             if (IsInEmc (digitN))
 722               clu->AddDigit(*digitN, CalibrateEMC( digitN->GetEnergy(), digitN->GetId() ) );
 723             else
 724               clu->AddDigit(*digitN, CalibrateCPV( digitN->GetAmp()   , digitN->GetId() ) );
 725
 726             clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digitN->GetIndexInList() ;
 727             iDigitInCluster++ ;
 728             digitsC->Remove(digitN) ;
 729             break ;
 730           case 2 :   // too far from each other
 731             goto endofloop;
 732           } // switch
 733
 734         } // while digitN
 735
 736       endofloop: ;
 737         nextdigit.Reset() ;
 738
 739       } // loop over cluster
 740
 741     } // energy theshold
 742
 743
 744   } // while digit
 745
 746   delete digitsC ;
 747
 748 }
 749
 750 //____________________________________________________________________________
 751 void AliPHOSClusterizerv1::MakeUnfolding()
 752 {
 753   // Unfolds clusters using the shape of an ElectroMagnetic shower
 754   // Performs unfolding of all EMC/CPV clusters
 755
 756   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
 757
 758   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
 759
 760   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ;
 761   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ;
 762   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 763
 764   // Unfold first EMC clusters
 765   if(fNumberOfEmcClusters > 0){
 766
 767     Int_t nModulesToUnfold = geom->GetNModules() ;
 768
 769     Int_t numberofNotUnfolded = fNumberOfEmcClusters ;
 770     Int_t index ;
 771     for(index = 0 ; index < numberofNotUnfolded ; index++){
 772
 773       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( emcRecPoints->At(index) ) ;
 774       if(emcRecPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
 775         break ;
 776
 777       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
 778       AliPHOSDigit ** maxAt = new AliPHOSDigit*[nMultipl] ;
 779       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
 780       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fEmcLocMaxCut,digits) ;
 781
 782       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
 783         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
 784         emcRecPoints->Remove(emcRecPoint);
 785         emcRecPoints->Compress() ;
 786         index-- ;
 787         fNumberOfEmcClusters -- ;
 788         numberofNotUnfolded-- ;
 789       }
 790       else{
 791         emcRecPoint->SetNExMax(1) ; //Only one local maximum
 792       }
 793
 794       delete[] maxAt ;
 795       delete[] maxAtEnergy ;
 796     }
 797   }
 798   // Unfolding of EMC clusters finished
 799
 800
 801   // Unfold now CPV clusters
 802   if(fNumberOfCpvClusters > 0){
 803
 804     Int_t nModulesToUnfold = geom->GetNModules() ;
 805
 806     Int_t numberofCpvNotUnfolded = fNumberOfCpvClusters ;
 807     Int_t index ;
 808     for(index = 0 ; index < numberofCpvNotUnfolded ; index++){
 809
 810       AliPHOSRecPoint * recPoint = dynamic_cast<AliPHOSRecPoint *>( cpvRecPoints->At(index) ) ;
 811
 812       if(recPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
 813         break ;
 814
 815       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint*>(recPoint) ;
 816
 817       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
 818       AliPHOSDigit ** maxAt = new AliPHOSDigit*[nMultipl] ;
 819       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
 820       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fCpvLocMaxCut,digits) ;
 821
 822       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
 823         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
 824         cpvRecPoints->Remove(emcRecPoint);
 825         cpvRecPoints->Compress() ;
 826         index-- ;
 827         numberofCpvNotUnfolded-- ;
 828         fNumberOfCpvClusters-- ;
 829       }
 830
 831       delete[] maxAt ;
 832       delete[] maxAtEnergy ;
 833     }
 834   }
 835   //Unfolding of Cpv clusters finished
 836
 837 }
 838
 839 //____________________________________________________________________________
 840 Double_t  AliPHOSClusterizerv1::ShowerShape(Double_t r)
 841 {
 842   // Shape of the shower (see PHOS TDR)
 843   // If you change this function, change also the gradient evaluation in ChiSquare()
 844
 845   Double_t r4    = r*r*r*r ;
 846   Double_t r295  = TMath::Power(r, 2.95) ;
 847   Double_t shape = TMath::Exp( -r4 * (1. / (2.32 + 0.26 * r4) + 0.0316 / (1 + 0.0652 * r295) ) ) ;
 848   return shape ;
 849 }
 850
 851 //____________________________________________________________________________
 852 void  AliPHOSClusterizerv1::UnfoldCluster(AliPHOSEmcRecPoint * iniEmc,
 853                                           Int_t nMax,
 854                                           AliPHOSDigit ** maxAt,
 855                                           Float_t * maxAtEnergy)
 856 {
 857   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers
 858
 859   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
 860
 861   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
 862
 863   const TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 864   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ;
 865   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ;
 866
 867   Int_t nPar = 3 * nMax ;
 868   Float_t * fitparameters = new Float_t[nPar] ;
 869
 870   Bool_t rv = FindFit(iniEmc, maxAt, maxAtEnergy, nPar, fitparameters) ;
 871   if( !rv ) {
 872     // Fit failed, return and remove cluster
 873     iniEmc->SetNExMax(-1) ;
 874     delete[] fitparameters ;
 875     return ;
 876   }
 877
 878   // create ufolded rec points and fill them with new energy lists
 879   // First calculate energy deposited in each sell in accordance with fit (without fluctuations): efit[]
 880   // and later correct this number in acordance with actual energy deposition
 881
 882   Int_t nDigits = iniEmc->GetMultiplicity() ;
 883   Float_t * efit = new Float_t[nDigits] ;
 884   Float_t xDigit=0.,zDigit=0.,distance=0. ;
 885   Float_t xpar=0.,zpar=0.,epar=0.  ;
 886   Int_t relid[4] ;
 887   AliPHOSDigit * digit = 0 ;
 888   Int_t * emcDigits = iniEmc->GetDigitsList() ;
 889
 890   Int_t iparam ;
 891   Int_t iDigit ;
 892   for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 893     digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At(emcDigits[iDigit] ) ) ;
 894     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 895     geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 896     efit[iDigit] = 0;
 897
 898     iparam = 0 ;
 899     while(iparam < nPar ){
 900       xpar = fitparameters[iparam] ;
 901       zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 902       epar = fitparameters[iparam+2] ;
 903       iparam += 3 ;
 904       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
 905       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
 906       efit[iDigit] += epar * ShowerShape(distance) ;
 907     }
 908   }
 909
 910
 911   // Now create new RecPoints and fill energy lists with efit corrected to fluctuations
 912   // so that energy deposited in each cell is distributed betwin new clusters proportionally
 913   // to its contribution to efit
 914
 915   Float_t * emcEnergies = iniEmc->GetEnergiesList() ;
 916   Float_t ratio ;
 917
 918   iparam = 0 ;
 919   while(iparam < nPar ){
 920     xpar = fitparameters[iparam] ;
 921     zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 922     epar = fitparameters[iparam+2] ;
 923     iparam += 3 ;
 924
 925     AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = 0 ;
 926
 927     if(iniEmc->IsEmc()){ //create new entries in fEmcRecPoints...
 928
 929       if(fNumberOfEmcClusters >= emcRecPoints->GetSize())
 930         emcRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters) ;
 931
 932       (*emcRecPoints)[fNumberOfEmcClusters] = new AliPHOSEmcRecPoint("") ;
 933       emcRP = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( emcRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters) ) ;
 934       fNumberOfEmcClusters++ ;
 935       emcRP->SetNExMax((Int_t)nPar/3) ;
 936     }
 937     else{//create new entries in fCpvRecPoints
 938       if(fNumberOfCpvClusters >= cpvRecPoints->GetSize())
 939         cpvRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters) ;
 940
 941       (*cpvRecPoints)[fNumberOfCpvClusters] = new AliPHOSCpvRecPoint("") ;
 942       emcRP = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( cpvRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters) ) ;
 943       fNumberOfCpvClusters++ ;
 944     }
 945
 946     Float_t eDigit ;
 947     for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 948       digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At( emcDigits[iDigit] ) ) ;
 949       geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 950       geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 951       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
 952       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
 953       ratio = epar * ShowerShape(distance) / efit[iDigit] ;
 954       eDigit = emcEnergies[iDigit] * ratio ;
 955       emcRP->AddDigit( *digit, eDigit ) ;
 956     }
 957   }
 958
 959   delete[] fitparameters ;
 960   delete[] efit ;
 961
 962 }
 963
 964 //_____________________________________________________________________________
 965 void AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & nPar, Double_t * Grad, Double_t & fret, Double_t * x, Int_t iflag)
 966 {
 967   // Calculates the Chi square for the cluster unfolding minimization
 968   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
 969
 970   TList * toMinuit = dynamic_cast<TList*>( gMinuit->GetObjectFit() ) ;
 971
 972   AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint*>( toMinuit->At(0) )  ;
 973   TClonesArray * digits = dynamic_cast<TClonesArray*>( toMinuit->At(1) )  ;
 974
 975
 976
 977   //  AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( gMinuit->GetObjectFit() ) ; // EmcRecPoint to fit
 978
 979   Int_t * emcDigits     = emcRP->GetDigitsList() ;
 980
 981   Int_t nOdigits = emcRP->GetDigitsMultiplicity() ;
 982
 983   Float_t * emcEnergies = emcRP->GetEnergiesList() ;
 984
 985   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::Instance()->PHOSGeometry() ;
 986   fret = 0. ;
 987   Int_t iparam ;
 988
 989   if(iflag == 2)
 990     for(iparam = 0 ; iparam < nPar ; iparam++)
 991       Grad[iparam] = 0 ; // Will evaluate gradient
 992
 993   Double_t efit ;
 994
 995   AliPHOSDigit * digit ;
 996   Int_t iDigit ;
 997
 998   for( iDigit = 0 ; iDigit < nOdigits ; iDigit++) {
 999
1000     digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At( emcDigits[iDigit] ) );
1001
1002     Int_t relid[4] ;
1003     Float_t xDigit ;
1004     Float_t zDigit ;
1005
1006     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
1007
1008     geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
1009
1010      if(iflag == 2){  // calculate gradient
1011        Int_t iParam = 0 ;
1012        efit = 0 ;
1013        while(iParam < nPar ){
1014          Double_t distance = (xDigit - x[iParam]) * (xDigit - x[iParam]) ;
1015          iParam++ ;
1016          distance += (zDigit - x[iParam]) * (zDigit - x[iParam]) ;
1017          distance = TMath::Sqrt( distance ) ;
1018          iParam++ ;
1019          efit += x[iParam] * ShowerShape(distance) ;
1020          iParam++ ;
1021        }
1022        Double_t sum = 2. * (efit - emcEnergies[iDigit]) / emcEnergies[iDigit] ; // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
1023        iParam = 0 ;
1024        while(iParam < nPar ){
1025          Double_t xpar = x[iParam] ;
1026          Double_t zpar = x[iParam+1] ;
1027          Double_t epar = x[iParam+2] ;
1028          Double_t dr = TMath::Sqrt( (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar) );
1029          Double_t shape = sum * ShowerShape(dr) ;
1030          Double_t r4 = dr*dr*dr*dr ;
1031          Double_t r295 = TMath::Power(dr,2.95) ;
1032          Double_t deriv =-4. * dr*dr * ( 2.32 / ( (2.32 + 0.26 * r4) * (2.32 + 0.26 * r4) ) +
1033                                          0.0316 * (1. + 0.0171 * r295) / ( ( 1. + 0.0652 * r295) * (1. + 0.0652 * r295) ) ) ;
1034
1035          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (xpar - xDigit) ;  // Derivative over x
1036          iParam++ ;
1037          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (zpar - zDigit) ;  // Derivative over z
1038          iParam++ ;
1039          Grad[iParam] += shape ;                                  // Derivative over energy
1040          iParam++ ;
1041        }
1042      }
1043      efit = 0;
1044      iparam = 0 ;
1045
1046      while(iparam < nPar ){
1047        Double_t xpar = x[iparam] ;
1048        Double_t zpar = x[iparam+1] ;
1049        Double_t epar = x[iparam+2] ;
1050        iparam += 3 ;
1051        Double_t distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
1052        distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
1053        efit += epar * ShowerShape(distance) ;
1054      }
1055
1056      fret += (efit-emcEnergies[iDigit])*(efit-emcEnergies[iDigit])/emcEnergies[iDigit] ;
1057      // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
1058   }
1059
1060 }
1061
1062 //____________________________________________________________________________
1063 void AliPHOSClusterizerv1::Print(const Option_t *)const
1064 {
1065   // Print clusterizer parameters
1066
1067   TString message ;
1068   TString taskName(GetName()) ;
1069   taskName.ReplaceAll(Version(), "") ;
1070
1071   if( strcmp(GetName(), "") !=0 ) {
1072     // Print parameters
1073     message  = "\n--------------- %s %s -----------\n" ;
1074     message += "Clusterizing digits from the file: %s\n" ;
1075     message += "                           Branch: %s\n" ;
1076     message += "                       EMC Clustering threshold = %f\n" ;
1077     message += "                       EMC Local Maximum cut    = %f\n" ;
1078     message += "                       EMC Logarothmic weight   = %f\n" ;
1079     message += "                       CPV Clustering threshold = %f\n" ;
1080     message += "                       CPV Local Maximum cut    = %f\n" ;
1081     message += "                       CPV Logarothmic weight   = %f\n" ;
1082     if(fToUnfold)
1083       message += " Unfolding on\n" ;
1084     else
1085       message += " Unfolding off\n" ;
1086
1087     message += "------------------------------------------------------------------" ;
1088   }
1089   else
1090     message = " AliPHOSClusterizerv1 not initialized " ;
1091
1092   AliInfo(Form("%s, %s %s %s %s %s %s %s %s %s %s", message.Data(),
1093        taskName.Data(),
1094        GetTitle(),
1095        taskName.Data(),
1096        GetName(),
1097        fEmcClusteringThreshold,
1098        fEmcLocMaxCut,
1099        fW0,
1100        fCpvClusteringThreshold,
1101        fCpvLocMaxCut,
1102        fW0CPV )) ;
1103 }
1104
1105
1106 //____________________________________________________________________________
1107 void AliPHOSClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
1108 {
1109   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliPHOSClusterizer
1110
1111   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
1112
1113   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ;
1114   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ;
1115
1116   AliInfo(Form("\nevent %d \n    Found %d EMC RecPoints and %d CPV RecPoints",
1117                gAlice->GetEvNumber(),
1118                emcRecPoints->GetEntriesFast(),
1119                cpvRecPoints->GetEntriesFast() ))  ;
1120
1121   fRecPointsInRun +=  emcRecPoints->GetEntriesFast() ;
1122   fRecPointsInRun +=  cpvRecPoints->GetEntriesFast() ;
1123
1124
1125   if(strstr(option,"all")) {
1126     printf("\n EMC clusters \n") ;
1127     printf("Index    Ene(MeV) Multi Module     X    Y   Z    Lambdas_1  Lambda_2  # of prim  Primaries list\n") ;
1128     Int_t index ;
1129     for (index = 0 ; index < emcRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1130       AliPHOSEmcRecPoint * rp = (AliPHOSEmcRecPoint * )emcRecPoints->At(index) ;
1131       TVector3  locpos;
1132       rp->GetLocalPosition(locpos);
1133       Float_t lambda[2];
1134       rp->GetElipsAxis(lambda);
1135       Int_t * primaries;
1136       Int_t nprimaries;
1137       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
1138       printf("\n%6d  %8.2f  %3d     %2d     %4.1f   %4.1f   %4.1f   %4f  %4f    %2d     : ",
1139               rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetMultiplicity(), rp->GetPHOSMod(),
1140               locpos.X(), locpos.Y(), locpos.Z(), lambda[0], lambda[1], nprimaries) ;
1141
1142       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++) {
1143         printf("%d ", primaries[iprimary] ) ;
1144       }
1145       printf("\n") ;
1146     }
1147
1148     //Now plot CPV recPoints
1149     printf("\n CPV clusters \n") ;
1150     printf("Index    Ene(MeV) Module     X     Y    Z  \n") ;
1151     for (index = 0 ; index < cpvRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1152       AliPHOSCpvRecPoint * rp = (AliPHOSCpvRecPoint * )cpvRecPoints->At(index) ;
1153
1154       TVector3  locpos;
1155       rp->GetLocalPosition(locpos);
1156
1157       printf("\n%6d  %8.2f  %2d     %4.1f    %4.1f %4.1f \n",
1158              rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetPHOSMod(),
1159              locpos.X(), locpos.Y(), locpos.Z()) ;
1160     }
1161   }
1162 }
1163